夏利寧,南海辰,底麗娜
(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,新疆 烏魯木齊830052)
腸桿菌科細(xì)菌對(duì)喹諾酮類藥物耐藥性日益加重,以往喹諾酮類的耐藥研究多集中在染色體介導(dǎo)的靶位改變、膜通透性降低、外排泵亢進(jìn)機(jī)制,質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮類耐藥鮮見(jiàn)報(bào)道。近年來(lái)出現(xiàn)一種質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮耐藥(plasmid-mediated-quinoloneresistance,PMQR)因子,是一種新的喹諾酮耐藥機(jī)制。到目前為止發(fā)現(xiàn)3大類(qnr,aac(6′)-Ib-cr和qepA或oqxAB)由質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮耐藥類型。這些由質(zhì)粒介導(dǎo)的耐藥基因可以在菌間進(jìn)行水平傳播,使其他細(xì)菌獲得新的遺傳物質(zhì)而主動(dòng)產(chǎn)生耐藥性,加大細(xì)菌耐藥性傳播的風(fēng)險(xiǎn)。本文就新出現(xiàn)的喹諾酮耐藥機(jī)制綜述如下。
1998年在美國(guó)阿拉巴馬州伯明翰醫(yī)學(xué)研究中心,Martínez-Martínez等首次報(bào)道從一株肺炎克雷伯氏菌中獲得一個(gè)可轉(zhuǎn)移喹諾酮類耐藥性的質(zhì)粒pMG252,他們將質(zhì)粒攜帶的引起對(duì)喹諾酮類藥物耐藥的基因命名為qnr(Quinolone resistance,后來(lái)被命名為qnrA)。研究發(fā)現(xiàn)qnr基因可在不同細(xì)菌中迅速水平傳播,它的存在還能加速細(xì)菌的染色體促旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶的喹諾酮耐藥決定區(qū)(Quinolones resistance determining region,QRDR)的位點(diǎn)突變,使得含有qnr的菌株更加容易對(duì)喹諾酮藥物產(chǎn)生更嚴(yán)重的耐藥[1]。而且qnr基因常與其他多種耐藥基因共同整合,限制了臨床治療相關(guān)細(xì)菌感染時(shí)選藥或聯(lián)合用藥的范圍。
qnr基因的新進(jìn)展 隨著新的qnr基因的發(fā)現(xiàn),世界各地學(xué)者在人、動(dòng)物及環(huán)境中發(fā)現(xiàn)不同的基因亞型種類,目前已知的qnrS有4個(gè)亞型,qnrB有23個(gè)亞型,qnrA有6個(gè)亞型[2],2010年,周明明等人在海藻希瓦菌中發(fā)現(xiàn)一種新的qnrA7基因亞型[3],2013年邵宜波等發(fā)現(xiàn)了qnrB24新亞型[4],2013年楊曉燕等人首次從銅綠假單胞菌中發(fā)現(xiàn)qnrA1基因[5],2013年Adachi等人首次在水生環(huán)境中檢測(cè)出qnrS1[6],2012年Mokracka等人在歐洲首次檢測(cè)出qnrD[7],隨著人們的重視,可能以后將有更多的亞型被發(fā)現(xiàn)。
2006年,哈佛醫(yī)學(xué)院的Hooper等在研究qnrA介導(dǎo)的喹諾酮類耐藥性時(shí)發(fā)現(xiàn)有些含qnrA的接合子對(duì)環(huán)丙沙星的MIC值為1mg/L,較其他結(jié)合子高4倍,進(jìn)一步通過(guò)基因敲除試驗(yàn),證實(shí)這種較高水平的耐藥性是由與qnrA位于同一質(zhì)粒上的氨基糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶的變異基因aac(6′)-Ib-cr編碼的滅活酶引起的。aac(6′)-Ib基因?qū)儆赼ac(aminoglycoside acetyltransferase,編碼乙酰轉(zhuǎn)移酶)基因,能使細(xì)菌對(duì)卡那霉素、阿米卡星和妥布霉素氨基糖苷類藥物產(chǎn)生耐藥。而aac(6′)-Ib存在cr變異后,即可產(chǎn)生一種新的喹諾酮耐藥機(jī)制[8]。氨基糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶介導(dǎo)的喹諾酮類耐藥機(jī)制的發(fā)現(xiàn)意義重大,它推翻了以往常理認(rèn)為喹諾酮類為全合成藥物不會(huì)被滅活酶水解的觀點(diǎn),且首次發(fā)現(xiàn)細(xì)菌產(chǎn)生的滅活酶可同時(shí)作用于兩種不相關(guān)的抗菌藥物。自2006年首次發(fā)現(xiàn)aac(6′)-Ib-cr基因以來(lái),林居純等從2003-2010年間中國(guó)多省的部分養(yǎng)殖場(chǎng)食品動(dòng)物源沙門菌中檢測(cè)出aac(6′)-Ib-cr基因[9],迄今有美國(guó)、斯洛文尼亞、阿根廷、丹麥、法國(guó)、英國(guó)、中國(guó)、埃及和西班牙等10多個(gè)國(guó)家報(bào)道了該基因的流行情況。是目前進(jìn)行PMQR因子檢測(cè)研究中檢出率最高的基因,既可以位于染色體上,又可以位于質(zhì)粒上,是危害最嚴(yán)重的耐藥基因,2012年Ruiz E在染色體上亦檢測(cè)出該基因[10]。
傳統(tǒng)認(rèn)為在革蘭陰性菌中,多數(shù)喹諾酮耐藥外排基因是屬于介導(dǎo)多藥轉(zhuǎn)運(yùn)的RND(resistancenodulation-cell division)泵出系統(tǒng)家族。編碼該系統(tǒng)的基因多數(shù)為內(nèi)源性,且位于染色體上。目前,發(fā)現(xiàn)兩種新的質(zhì)粒介導(dǎo)喹諾酮外排轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng),分別是OqxAB和QepA。
3.1 OqxAB外排系統(tǒng) 2003年Sorensen等從豬糞分離的大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)能夠介導(dǎo)耐喹乙醇藥物的質(zhì)粒pOLA52。之后的深入研究發(fā)現(xiàn)其耐藥機(jī)制為質(zhì)粒上編碼的一個(gè)多藥外排泵,稱之為OqxAB。它屬于RND外排系統(tǒng)家族。除了介導(dǎo)對(duì)喹乙醇的耐藥外,還介導(dǎo)對(duì)其他藥物如氯霉素的耐藥。在acrA基因缺失的大腸桿菌中,pOLA52能夠使該菌對(duì)萘啶酸和環(huán)丙沙星的MIC提高8倍到16倍。Hansen等對(duì)丹麥和瑞士1995年至1998年間556株年代大腸桿菌進(jìn)行OqxAB檢測(cè),檢出OqxA。Kim等從人源性的大腸桿菌中檢出質(zhì)粒介導(dǎo)的OqxAB基因,并在肺炎克雷伯氏菌的染色體中檢出OqxAB基因,并發(fā)現(xiàn)該基因不同表達(dá)水平會(huì)導(dǎo)致細(xì)菌對(duì)喹乙醇的耐藥性存在差異,2012年Literak I在歐洲檢測(cè)越冬雜食的白嘴鴉糞便亦檢測(cè)出該基因,說(shuō)明動(dòng)物糞便可能造成耐藥的傳播[11]。
3.2 QepA外排系統(tǒng) 2007年日本學(xué)者Yamane在日本兵庫(kù)縣從人源大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)攜帶新型外排蛋白QepA(quinolone efflux protein A,QepA)的質(zhì)粒pHPA。這個(gè)質(zhì)粒介導(dǎo)氨基糖苷類、氟喹諾酮類和廣譜的β-內(nèi)酰胺類藥物的耐藥。QepA由511個(gè)氨基酸構(gòu)成,為質(zhì)子依賴型外排蛋白,由14個(gè)跨膜片段組成,屬于主要易化超家族(major facilitator superfamily,MFS)。同年法國(guó)學(xué)者也發(fā)現(xiàn)qepA基因,他們發(fā)現(xiàn)菌株ECO1540與受體菌相比,包含質(zhì)粒p IP1206的接合子對(duì)親水性喹諾酮類藥物(如環(huán)丙沙星和諾氟沙星)的耐藥水平高10倍,而對(duì)疏水性喹諾酮類藥物的MIC差異不大;當(dāng)有泵抑制劑存在時(shí),接合子對(duì)環(huán)丙沙星或諾氟沙星的耐藥水平迅速降低。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)質(zhì)粒上的qepA基因介導(dǎo)了上述變化。在發(fā)現(xiàn)qepA基因后,2008年法國(guó)學(xué)者又發(fā)現(xiàn)了和QepA蛋白相比有兩個(gè)氨基酸改變的變異體,命名為QepA2,它同QepA(后來(lái)重命名為QepA1)一樣能夠介導(dǎo)對(duì)喹諾酮類藥物的耐藥。
目前,對(duì)qepA基因的檢出報(bào)道不多,但近期的研究表明,該基因正在全世界范圍內(nèi)開(kāi)始流行,2012年HassanW M在埃及首次檢測(cè)出qepA[12]。目前研究表明,qepA基因在人和動(dòng)物來(lái)源的菌株中均有存在,通過(guò)食物鏈,人類很可能獲得此種耐藥基因。盡管qepA的流行率目前較低,考慮到ISCR3C的存在和質(zhì)粒的聯(lián)合選擇及共同轉(zhuǎn)移的可能性,必須對(duì)這些多藥耐藥細(xì)菌進(jìn)行更多的監(jiān)控,并謹(jǐn)慎的使用抗生素。
這些(qnr基因,氨基糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶的變異基因(aac(6′)-Ib-cr)和喹諾酮外排蛋白QepA或OqxAB),由質(zhì)粒介導(dǎo)的耐藥因子主要分布在腸桿菌科細(xì)菌中,尤其是肺炎克雷伯氏菌和大腸桿菌。
目前,全球很多地區(qū)在腸桿菌中都檢出PMQR因子。細(xì)菌攜帶PMQR因子會(huì)導(dǎo)致喹諾酮類藥物在臨床治療失敗,或必須加大劑量才能發(fā)揮藥效,其結(jié)果使細(xì)菌進(jìn)一步對(duì)喹諾酮類藥物完全耐藥。此外,可能導(dǎo)致喹諾酮類藥物的替代品失效,相關(guān)新基因的出現(xiàn)可能會(huì)在未來(lái)幾年內(nèi)陸續(xù)被檢出,就如aac(6')-Ib基因一樣,最初介導(dǎo)細(xì)菌對(duì)氨基糖苷類藥物耐藥,但發(fā)生-cr變異后,同時(shí)對(duì)喹諾酮類藥物也耐藥。提示在目前這種人醫(yī)和動(dòng)物臨床抗菌藥物選擇性壓力下,還應(yīng)當(dāng)考慮現(xiàn)存耐藥基因的進(jìn)化趨勢(shì)。變異的氨基糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶的出現(xiàn),讓我們重新認(rèn)識(shí)到了微生物頑強(qiáng)的適應(yīng)能力。
[1]劉寧,胡龍華,張楠.質(zhì)粒介導(dǎo)的耐氟喹諾酮類藥物基因的研究[J].中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志,2013,25(8):925-927.
[2]朱恒乾,彭斌,廖曉萍.質(zhì)粒介導(dǎo)喹諾酮類耐藥機(jī)制研究進(jìn)展[J].中國(guó)畜牧獸醫(yī),2010,37(10):81-86.
[3]周明明,屠鴻翔,周鐵麗,等.海藻希瓦菌中發(fā)現(xiàn)一種新的qnrA7基因亞型[J].中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志,2010,30(7).
[4]邵宜波,沈繼錄,李旭新.質(zhì)粒介導(dǎo)喹諾酮類耐藥基因qnrB24的克隆表達(dá)[J].中國(guó)感染與化療雜志,2013,13(2):124-127.
[5]楊曉燕,張永標(biāo),梁彩倩,等.質(zhì)粒介導(dǎo)銅綠假單胞菌對(duì)喹諾酮類耐藥機(jī)制的研究[J].2013,23(11):2524-2526.
[6]Adachi F,Yamamoto A,Takakura K,et al.Occurrence of fluoroquinolones and fluoroquinolone-resistance genes in the aquatic environment[J].Sci Total Environ,2013,444:508-514.
[7]Mokracka J,Gruszczyńska B,Kaznowski A.Integrons,β-lactamase and qnr genes in multidrug resistant clinical isolates of Proteus mirabilis and P[J].Vulgaris APMIS,2012,120(12):950-958.
[8] Ruiz J,Pons M J,Gomes C.Transferablemechanisms of quinolone resistance[J].Int JAntimicrob Agents,2012,40(3):196-203.
[9]林居純,覃春紅,賴婧,等.食品動(dòng)物源沙門氏菌質(zhì)粒介導(dǎo)喹諾酮類耐藥基因的檢測(cè)與分析[J].畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào),2012,43(5):803-809.
[10]Ruiz E,Sáenz Y,Zarazaga M,et al.qnr,aac(6')-Ib-cr and qepA genes in Escherichia coli and Klebsiella spp.:genetic environments and plasmid and chromosomal location[J].J Antimicrob Chemother,2012,67(4):886-897.
[11]Literak I,Micudova M,Tausova D,et al.Plasmid-mediated quinolone resistance genes in fecal bacteria from rooks commonly wintering throughout Europe[J].Microb Drug Resist,2012,18(6):567-573.
[12]Hassan W M,Hashim A,Domany R.Plasmid mediated quinolone resistance determinants qnr,aac(6')-Ib-cr,and qepA in ESBLproducing Escherichia coli clinical isolates from Egypt[J].Indian J Med Microbiol,2012,30(4):442-447.