文晶亮,李啟紅,李俊平,劉 丹,李 嶺,楊承槐,李慧姣,夏業(yè)才
(中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所,北京100081)
gE蛋白是皰疹病毒家族中較為重要的糖蛋白之一,由位于US區(qū)的US8基因編碼。據(jù)報(bào)道皰疹病毒gE基因是皰疹病毒從視網(wǎng)膜、嗅覺(jué)上皮細(xì)胞、三叉神經(jīng)節(jié)侵入中樞神經(jīng)組織所必須的毒力基因,對(duì)皰疹病毒在體內(nèi)毒力表達(dá)、侵襲神經(jīng)核沿著神經(jīng)傳遞起著決定性的作用,另外還能促進(jìn)病毒在細(xì)胞之間擴(kuò)散[1-4]。 目前對(duì)人皰疹病毒、偽狂犬病毒、牛皰疹病毒等皰疹病毒糖蛋白gE基因及其編碼蛋白已有大量研究[5-7],而對(duì)鴨瘟病毒 gE基因及其編碼蛋白尚未有深入的報(bào)道。因此,本研究PCR擴(kuò)增了DEV的gE基因完整開(kāi)放閱讀框(gE)和去信號(hào)肽的gE基因(gE’),分別克隆至真核表達(dá)載體pCDNA3.1,轉(zhuǎn)染 vero細(xì)胞,并應(yīng)用 RT-PCR 和間接免疫熒光檢測(cè)gE、gE’蛋白在vero細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄、表達(dá),旨在探討gE蛋白在真核細(xì)胞中的表達(dá),為gE蛋白的功能研究、鴨瘟抗體檢測(cè)奠定基礎(chǔ),為深入了解鴨瘟病毒感染的發(fā)病機(jī)理提供科學(xué)數(shù)據(jù)。
1.1 材料
1.1.1 病毒與細(xì)胞 鴨腸炎病毒AV1221株,由中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所菌種保藏中心提供;vero細(xì)胞,由本實(shí)驗(yàn)室保存;E.coli DH5α感受態(tài)細(xì)胞,購(gòu)于天根生化科技有限公司。
1.1.2 主要試劑 真核表達(dá)載體 pCDNA3.1,由本實(shí)驗(yàn)室保存;pMD18-T載體、Ex Taq DNA聚合酶、dNTPs、EcoRⅠ、XhoⅠ、MarkerⅣ、T4 DNA 連接酶,均購(gòu)自大連寶生物工程有限公司;Lipofectamine 2000,購(gòu)自 Invitrogen 公司;OPTI-MEM?I培養(yǎng)液,購(gòu)自gibco?公司;FITC標(biāo)記的兔抗雞熒光二抗,購(gòu)自美國(guó)sigma-aldrich公司;DMEM高糖細(xì)胞培養(yǎng)液、TBD標(biāo)準(zhǔn)胎牛血清購(gòu)于賽墨飛世爾生物化學(xué)制品有限公司。
1.1.3 試劑盒 高純度質(zhì)粒小提中量試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購(gòu)于天根生化科技有限公司。
1.1.4 血清 雞抗DEV陽(yáng)性血清,由本實(shí)驗(yàn)室制備;TBD標(biāo)準(zhǔn)胎牛血清,購(gòu)于賽墨飛世爾生物化學(xué)制品有限公司。
1.2 方法
1.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)已發(fā)表的基因組序列,設(shè)計(jì)擴(kuò)增鴨腸炎病毒AV1221株的gE基因完整ORF序列(gE)和去信號(hào)肽的gE基因(gE’)引物,由invitrogen公司合成。
針對(duì)gE的引物:
P1: 5’ -AAGAATTC ATGATGGTTACTTTTAT-3’,下劃線部分為酶切位點(diǎn)EcoR I;
P2:5’-AACTCGAGTCAGATGCGGAAACTAGA-3’,下劃線部分為酶切位點(diǎn)Xho I;
針對(duì)gE’的引物:
P11: 5’-AAGAATTCGACTATCATCAAGTGATT-3’,下劃線部分為酶切位點(diǎn)EcoR I;
P22: 5’-AACTCGAGTCAGATGCGGAAACTAGA-3’,下劃線部分為酶切位點(diǎn)Xho I;
1.2.2 DNA 模板提取 按參考文獻(xiàn)[8]進(jìn)行。
1.2.3 gE基因的克隆 PCR反應(yīng)體系:病毒DNA 2 μL,dNTPs 2 μL,上游引物 P11 μL,下游引物 P21 μL,10×Ex Taq buffer 2.5 μL,Ex Taq DNA 聚合酶0.125 μL,ddH2O 16.375 μL,總體積 25 μL。
反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性40 s,46.2 ℃退火 40 s,72 ℃ 延伸 1 min 30 s,30 個(gè)循環(huán)后,72℃延伸10 min。反應(yīng)結(jié)束后,取3 μL PCR產(chǎn)物進(jìn)行0.8%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。
1.2.4 去信號(hào)肽 gE 基因(gE’)序列的克隆 PCR
反應(yīng)體系:病毒 DNA 2 μL,dNTPs 2 μL,上游引物P111 μL,下游引物 P221 μL,10 ×Ex Taq buffer 2.5 μL,Ex Taq DNA 聚 合 酶 0.125 μL, ddH2O 16.375 μL,總體積 25 μL。
反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性40 s,47℃退火1 min,72℃延伸1 min 30 s,30個(gè)循環(huán)后,72℃延伸10 min。 反應(yīng)結(jié)束后,取3 μL PCR產(chǎn)物進(jìn)行0.8%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。
1.2.5 gE基因測(cè)序及序列分析 PCR產(chǎn)物用膠回收試劑盒回收后,分別連接到pMD18-T載體,轉(zhuǎn)化DH5α,獲得重組質(zhì)粒 pMD18T-gE、pMD18T- gE’。將酶切及PCR鑒定正確的重組質(zhì)粒pMD18T-gE、pMD18T-gE’送Invitrogen公司測(cè)序,并用生物信息學(xué)軟件對(duì)測(cè)序正確的gE基因進(jìn)行分析,預(yù)測(cè)gE基因編碼蛋白的功能。
1.2.6 真核表達(dá)載體的構(gòu)建 gE基因測(cè)序正確后,用限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ和XhoⅠ分別雙酶切克隆質(zhì)粒 pMD18-gE、pMD18-gE’和載體 pCDNA3.1。回收、純化雙酶切g(shù)E、gE’基因和pCDNA3.1線性質(zhì)粒,并用T4 DNA連接酶使雙酶切g(shù)E、gE’基因分別與 pCDNA3.1線性質(zhì)粒連接,轉(zhuǎn)化 E.coli DH5α 感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽(yáng)性克隆,提取質(zhì)粒pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’,進(jìn)行酶切及 PCR 鑒定。
1.2.7 重組表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染vero細(xì)胞 在轉(zhuǎn)染前20 h,消化vero細(xì)胞,轉(zhuǎn)入6孔細(xì)胞板,每孔6×105個(gè)細(xì)胞,待細(xì)胞鋪板密度在75%時(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)染。
Lipofectamine 2000/DNA復(fù)合物的制備:分別將 0.8 μg pCDNA3.1- gE、pCDNA3.1- gE’質(zhì)粒分別稀釋于不含血清和抗生素的opti-DMEM中,使混合液的終體積均為 50 μL,室溫孵育 5 min;2 μL Lipofectamine 2000分別稀釋于不含血清和抗生素的opti-DMEM中,使混合液的終體積均為50 μL,輕輕混勻,室溫孵育5 min;將50 μL Lipofectamine 2000稀釋液分別滴加到50 μL質(zhì)粒稀釋液中,邊加邊混勻;室溫孵育20 min。
轉(zhuǎn)染 vero細(xì)胞:分別將 100 μL Lipofectamine 2000/DNA復(fù)合物加入到6孔板中,輕輕搖動(dòng)使其均勻混合,置37℃培養(yǎng)4 h,棄去上清,加入10%胎牛血清的M199培養(yǎng)基,置37℃培養(yǎng)24 h后,用1%胎牛血清的M199培養(yǎng)基換液,置37℃培養(yǎng)24 h。
1.2.8 mRNA檢測(cè) 參照試劑盒操作說(shuō)明,提取轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞總RNA,將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,參照Invitrogen M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶的說(shuō)明書(shū)操作:模板RNA 5 μL,反轉(zhuǎn)錄引物 1 μL,dNTP(10 mmol/L)1 μL,DEPC 水補(bǔ)加至 12 μL,100℃ 水浴 5 min,馬上冰淬滅 1 min;短暫離心后加入 5×buffer 4 μL,DTT(0.1mol/L)2 μL,RNA 酶抑制劑 1 μL,輕輕混勻后 50℃水浴5 min;加入 M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶1 μL,50 ℃水浴 50 min;70 ℃水浴15 min,冰淬滅;加入1 μL RNaseH,馬上進(jìn)行PCR反應(yīng)。PCR反應(yīng)參照 1.2.3 和 1.2.4。
1.2.9 表達(dá)產(chǎn)物的檢測(cè) 應(yīng)用間接免疫熒光法檢測(cè)表達(dá)蛋白,方法如下:取出6孔細(xì)胞板,用pH為7.2的PBST溶液漂洗細(xì)胞1次,加入0.5 mL預(yù)冷的甲醇溶液,固定15 min;棄去甲醇溶液,室溫放置2~5 min自然晾干;用PBST洗1次;加入100倍稀釋的雞抗DEV陽(yáng)性血清,37℃孵育1 h,棄去DEV陽(yáng)性血清,每孔用含0.05%吐溫-20的PBST洗3次后,用PBST液洗2次;加500倍稀釋的兔抗雞熒光抗體,37℃溫箱中避光孵育1 h,每孔用含0.05%吐溫-20的PBST洗3次后,用PBST洗2次,在熒光顯微鏡下觀察并照相。
2.1 gE基因的 PCR擴(kuò)增 分別以 gE基因的P1/P2為引物、gE’基因的 P11/P22為引物,病毒 DNA為模板PCR擴(kuò)增gE、gE’基因,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳分析,可見(jiàn)約1400 bp的DNA片段,與預(yù)期片段大小相符(圖1)。
圖1 gE和gE’基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2 gE及gE’基因的克隆及酶切鑒定 回收純化后的gE、gE’PCR產(chǎn)物與pMD18-T連接,分別構(gòu)建克隆質(zhì)粒 pMD18T-gE、pMD18T-gE’,酶切、PCR 結(jié)果說(shuō)明所克隆序列與目的片段大小相近(圖2、圖 3)。
圖2 重組質(zhì)粒pMD18T-gE酶切及PCR鑒定結(jié)果
圖3 重組質(zhì)粒pMD18T-gE’酶切及PCR鑒定結(jié)果
2.3 gE基因序列分析及編碼蛋白的功能預(yù)測(cè)
2.3.1 同源性分析結(jié)果 用NCBI網(wǎng)站的在線程序BLASTN對(duì)鴨瘟AV1221株gE基因序列與國(guó)內(nèi)分離強(qiáng)毒 CHv 株 (GenBank:EU071044.1)、 國(guó) 內(nèi) 疫 苗 株(GenBank:EU082088.2)和德國(guó)分離強(qiáng)毒 2085 株(GenBank:JF999965.1)基因序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明:鴨瘟AV1221株gE基因序列與國(guó)內(nèi)分離強(qiáng)毒CHv株、國(guó)內(nèi)疫苗株同源性均為100%,與德國(guó)分離強(qiáng)毒2085株同源性為99%,143位堿基變異(T-C),導(dǎo)致第48位氨基酸由蘇氨酸(T)變成了異亮氨酸(I),此外,412位(G-A)和1351位(C-T)堿基同義突變。
2.3.2 信號(hào)肽預(yù)測(cè)結(jié)果 用CBS網(wǎng)站的在線程序SignalP4.1對(duì)gE氨基酸序列進(jìn)行信號(hào)肽預(yù)測(cè),結(jié)果顯示:gE蛋白序列中預(yù)測(cè)到的C值、S值或Y值都大于臨界值,推測(cè)gE蛋白第1~22位氨基酸為信號(hào)肽(圖4)。
2.3.3 跨膜區(qū)的預(yù)測(cè)結(jié)果 本研究利用 TMHMM 2.0預(yù)測(cè)鴨瘟AV1221株gE蛋白的跨膜區(qū),其結(jié)果顯示:gE蛋白在397~419位氨基酸有一個(gè)跨膜區(qū),1~396位氨基酸位于胞膜外(胞外區(qū)),420~490位氨基酸位于胞膜內(nèi)(胞質(zhì)區(qū))(圖5)。
圖4 gE氨基酸序列推倒肽鏈信號(hào)肽預(yù)測(cè)結(jié)果
圖5 gE氨基酸序列推倒肽鏈跨膜區(qū)預(yù)測(cè)結(jié)果
2.4 真核表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定 重組質(zhì)粒pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’經(jīng) EcoRⅠ及 XhoⅠ雙酶切后分別得到約1400 bp和5400 bp的條帶,PCR鑒定結(jié)果也獲得了約1400 bp的條帶,說(shuō)明成功構(gòu)建了重組真核表達(dá)質(zhì)粒 pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’(圖 6)。
圖6 重組質(zhì)粒 pcDNA3.1-gE、pcDNA3.1-gE’酶切及PCR鑒定結(jié)果
2.5 PCR 鑒定轉(zhuǎn)染結(jié)果 提取 pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’轉(zhuǎn)染后的 vero 細(xì)胞總 RNA,并以提取的細(xì)胞總RNA為模板,分別以gE基因的P1/P2、gE’基因的 P11/P22為引物進(jìn)行 RT-PCR 擴(kuò)增,得到了相應(yīng)大小DNA片段(圖7),而以提取的空載體pCDNA3.1轉(zhuǎn)染的 vero細(xì)胞總 RNA為模板RT-PCR擴(kuò)增后則未見(jiàn)相應(yīng)條帶,從轉(zhuǎn)錄水平上說(shuō)明gE和gE’基因均在vero細(xì)胞獲得表達(dá)。
圖7 pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’和 pCDNA3.1轉(zhuǎn)染vero細(xì)胞RT-PCR結(jié)果
2.6 表達(dá)產(chǎn)物的免疫熒光鑒定 轉(zhuǎn)染48h后,經(jīng)用熒光顯微鏡觀察,只有重組質(zhì)粒pCDNA3.1-gE’轉(zhuǎn)染的 vero細(xì)胞可見(jiàn)綠色熒光(圖 8 A),而pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1 轉(zhuǎn)染的 vero 細(xì)胞中未見(jiàn)明顯熒光(圖8B,C),結(jié)果表明gE’基因在vero細(xì)胞中獲得了正確表達(dá),具有免疫原性,能與抗體結(jié)合。
圖8 真核表達(dá)載體轉(zhuǎn)染vero細(xì)胞后間接免疫熒光檢測(cè)結(jié)果
本研究結(jié)果表明,鴨腸炎病毒AV1221株 gE基因完整的開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)為1473 bp,共編碼490個(gè)氨基酸,其中第1~22位氨基酸為信號(hào)肽序列。其基因序列與國(guó)內(nèi)分離強(qiáng)毒CHv株[9]、國(guó)內(nèi)疫苗株[10]和德國(guó)分離強(qiáng)毒 2085 株[11]均具有較高同源性,說(shuō)明鴨腸炎病毒AV1221株gE比較保守。而軟件TMHMM 2.0預(yù)測(cè)表明gE蛋白是典型的囊膜糖蛋白,包括較長(zhǎng)的胞外區(qū)(396個(gè)氨基酸)、跨膜區(qū)(23個(gè)氨基酸)和胞質(zhì)區(qū)(71個(gè)氨基酸),這與常華[12]結(jié)果一致。
皰疹病毒gE蛋白表達(dá)載體的構(gòu)建及表達(dá)是其功能研究的重要方面,Zhu等[13]將VZV gE構(gòu)建在真核表達(dá)質(zhì)粒pSVK3上,轉(zhuǎn)染COS-7細(xì)胞,用間接免疫熒光方法檢測(cè)到VZV gE蛋白在COS-7細(xì)胞中表達(dá)并定位于COS-7細(xì)胞的高爾基體。常華[12]利用間接免疫熒光方法檢測(cè)到DEV gE蛋白可在感染鴨胚成纖維細(xì)胞的胞漿中表達(dá)。在本研究中,含信號(hào)肽的表達(dá)載體pCDNA3.1-gE在vero細(xì)胞內(nèi)完成了轉(zhuǎn)錄過(guò)程,但卻未能在vero細(xì)胞內(nèi)檢測(cè)到熒光,與上述研究結(jié)果并不一致,推測(cè)可能與所用毒株、宿主細(xì)胞不同以及存在信號(hào)肽有關(guān)。因此又構(gòu)建了去信號(hào)肽的真核表達(dá)載體pCDNA3.1-gE’,轉(zhuǎn)染vero細(xì)胞后完成了轉(zhuǎn)錄過(guò)程,并進(jìn)行了表達(dá),證實(shí)gE自身所具有的信號(hào)肽序列可以有效誘導(dǎo)gE蛋白分泌到細(xì)胞外,與軟件TMHMM 2.0預(yù)測(cè)結(jié)果一致。實(shí)驗(yàn)表明,在真核表達(dá)體系中,信號(hào)肽的有無(wú)對(duì)gE蛋白的表達(dá)具有顯著的影響。
本研究通過(guò)酶切和PCR方法證實(shí),成功構(gòu)建了真核表達(dá)質(zhì)粒 pCDNA3.1-gE 和 pCDNA3.1-gE’,并在轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平上檢測(cè)了pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’在 vero細(xì)胞中的表達(dá),下一步將通過(guò)G418抗生素篩選穩(wěn)定表達(dá)gE的vero細(xì)胞系,為gE蛋白的體外表達(dá)、功能研究、鴨瘟抗體檢測(cè)試劑盒的開(kāi)發(fā)奠定了基礎(chǔ)。
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