信號肽
- 信號肽優(yōu)化提高葡萄糖氧化酶在畢赤酵母中的表達(dá)量
是釀酒酵母α 信號肽（α mature factor）[17]。分泌信號由2 部分組成，一部分是19 個氨基酸的N-末端信號序列，指導(dǎo)易位進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)（endoplasmic reticulum，ER）；另一部分是66 個氨基酸的蛋白區(qū)，介導(dǎo)受體依賴性包裝進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)衍生的COP Ⅱ轉(zhuǎn)運(yùn)囊泡[18-19]，重組蛋白通過ER 腔中的Kex 2 蛋白酶去除α 因子信號序列。α 因子信號肽在畢赤酵母中能有效分泌多種異源蛋白質(zhì)，但不同蛋白的表達(dá)水平差異較大，因此，人們
中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報 2023年2期2023-05-17
- 信號肽篩選和核糖體結(jié)合位點(diǎn)優(yōu)化的組合策略提高角蛋白酶在枯草芽孢桿菌中的胞外表達(dá)
問題之一。通過信號肽篩選增強(qiáng)分泌能力是提升異源蛋白胞外表達(dá)量的常用策略。WATANABE等[10]通過對谷氨酸棒桿菌CorynebacteriumglutamicumR全基因組系統(tǒng)篩選，得到405條信號肽序列，其中11條信號肽能夠表達(dá)嗜熱脂肪地?zé)嵫挎邨U菌Geobacillusstearothermophilus來源的α-淀粉酶，表達(dá)量相比常見的棒狀細(xì)菌分泌蛋白PS2增加了50～150倍不等；GUO等[11]在解淀粉芽孢桿Bacillusamylolique
食品與發(fā)酵工業(yè) 2023年4期2023-03-07
- 小腸結(jié)腸炎耶爾森菌非特異性核酸酶培養(yǎng)條件優(yōu)化
想宿主[7]。信號肽(signal peptide,SP)作為一種重要的蛋白分泌調(diào)控元件，是一段存在于前體蛋白N-端的短肽鏈，其功能在于引導(dǎo)和調(diào)節(jié)前體蛋白的折疊，在蛋白轉(zhuǎn)移和分泌過程中發(fā)揮極其重要的作用[8]。B.subtilis缺乏外膜結(jié)構(gòu)，分泌蛋白會轉(zhuǎn)運(yùn)到胞外培養(yǎng)基中，保證分泌蛋白的正確定位和轉(zhuǎn)移則由信號肽來完成[9]。鑒于Nucyep在E.coli表達(dá)系統(tǒng)中重組表達(dá)后提取復(fù)雜的問題，本研究擬采用B.subtilis表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行Nucyep的分泌表達(dá)，
生物學(xué)雜志 2022年6期2022-12-18
- 杜邦嗜熱菌脂肪酶在黑曲霉中的異源表達(dá)
察TDL2自帶信號肽和pCAMBIA0380質(zhì)粒信號肽對脂肪酶TDL2表達(dá)的影響，為其應(yīng)用奠定基礎(chǔ).1 材料與方法1.1 材料1.1.1 菌種和質(zhì)粒 以A.nigerCICC 2213作為黑曲霉表達(dá)宿主菌，購自中國工業(yè)微生物菌種保藏管理中心，E.coliDH5α用于質(zhì)粒的構(gòu)建，攜帶一個輔助 Ti 質(zhì)粒的根瘤農(nóng)桿菌AgrobacteriumtumefaciensAGL-1用于介導(dǎo)黑曲霉轉(zhuǎn)化；黑曲霉表達(dá)實(shí)驗(yàn)所用質(zhì)粒為pCAMBIA0380[8],含有黑曲霉的β
江西師范大學(xué)學(xué)報（自然科學(xué)版） 2022年5期2022-12-17
- 信號肽篩選優(yōu)化提高耐熱α-環(huán)糊精酶在枯草芽胞桿菌中的表達(dá)
分泌表達(dá)依賴于信號肽的引導(dǎo)，主要有兩個途徑：Sec途徑和Tat途徑。對于同一種外源蛋白質(zhì)，不同信號肽的引導(dǎo)分泌效率相差較大，兩者之間存在適配性[12]?？莶菅堪麠U菌信號肽由N端正電荷區(qū)（1～5個帶正電氨基酸）、H段疏水區(qū)（7～15疏水性氨基酸）及C端信號肽酶識別區(qū)（3～7個親水性氨基酸）組成。研究表明信號肽N端正電荷數(shù)、H端疏水性會影響目的蛋白在枯草芽胞桿菌中的分泌途徑（Sec、Tat途徑），從而影響目的蛋白的分泌效率。因此針對特定的蛋白質(zhì)需要選擇合適的信
福建農(nóng)業(yè)學(xué)報 2022年3期2022-05-24
- 樹生黃單胞桿菌脂蛋白生物信息學(xué)分析
用.具有脂蛋白信號肽的蛋白作為分泌蛋白中的一類，參與錨定蛋白的正確定位、修飾和轉(zhuǎn)運(yùn)過程，從而對維持細(xì)胞膜的穩(wěn)定性、細(xì)胞分裂、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和營養(yǎng)獲取等生理功能具有非常重要的作用[6].原核生物脂蛋白最早在大腸桿菌(Escherichiacoli)中被發(fā)現(xiàn)[7].研究發(fā)現(xiàn)，脂蛋白前體在胞質(zhì)中合成，可以通過Sec分泌途徑以未折疊形式穿過胞質(zhì)膜，也可通過雙精氨酸轉(zhuǎn)位TAT途徑或SecA突變體以折疊形式穿過胞質(zhì)膜[8].前人對黃單胞菌中脂蛋白的研究主要集中在相關(guān)蛋白的表
- 中華絨螯蟹微孢子蟲全基因組分泌蛋白的預(yù)測分析
對蛋白序列進(jìn)行信號肽預(yù)測，篩去其中N端無信號肽的蛋白質(zhì)[11-12]；MitoProt程序預(yù)測線粒體蛋白[15]；TargetP程序?qū)Ψ蔷€粒體蛋白進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測，篩選定位于胞外的分泌型蛋白[16]；Kohgpi程序去除可能具有GPI錨定修飾的蛋白質(zhì)[17]，得到中華絨螯蟹微孢子蟲的分泌蛋白集合。1.3 分泌蛋白序列特征的分析根據(jù)分泌蛋白的信號肽預(yù)測結(jié)果，統(tǒng)計信號肽以及完整分泌蛋白序列的長度及氨基酸組成，提取信號肽剪切位點(diǎn)前后各3個氨基酸殘基，通過Web
水產(chǎn)科學(xué) 2022年2期2022-03-20
- 基于信號肽的β-葡萄糖苷酶的分泌表達(dá)
宿主細(xì)胞，使用信號肽OprI、OsmY、PelB、OmpA將納豆芽孢桿菌的β-葡萄糖苷酶基因bglH錨定到大腸桿菌BL21（DE3）外膜和周質(zhì)上。然后使用啟動子T7、Trc、LacUV5誘導(dǎo)表達(dá)Ⅱ型分泌途徑的SecB伴侶蛋白，進(jìn)而實(shí)現(xiàn)全細(xì)胞催化糖苷型底物水解。本研究通過表征不同細(xì)胞定位的β-葡萄糖苷酶活性，發(fā)現(xiàn)信號肽PelB分泌效果明顯高于其他信號肽，LacUV5啟動子與SecB伴侶蛋白組合表達(dá)bglH的重組菌株全細(xì)胞催化酶活性最高。此外，添加甘氨酸至質(zhì)量
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報 2022年1期2022-03-16
- 蛋白質(zhì)分選的共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)途徑*
成一小段后，在信號肽的指導(dǎo)下邊合成邊轉(zhuǎn)運(yùn)到粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)，經(jīng)過加工最終分選到溶酶體、液泡等細(xì)胞結(jié)構(gòu)，有的分泌至胞外。人教版普通高中生物學(xué)必修1（2019 版）進(jìn)一步明確了分泌蛋白的起始合成是在游離的核糖體上，通過共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)途徑分泌到細(xì)胞外，糾正了舊教材中的“最初是在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的核糖體中由氨基酸合成肽鏈”。本文將詳細(xì)闡述該途徑。1 共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制的探究史20世紀(jì)60年代，喬治·帕拉德（George Palade）發(fā)現(xiàn)細(xì)胞質(zhì)中的游離核糖體產(chǎn)生非分泌蛋白，而附著在內(nèi)質(zhì)
生物學(xué)通報 2021年1期2021-11-01
- 基于信號肽策略提高外源蛋白在枯草芽孢桿菌中的表達(dá)
源蛋白N末端的信號肽來完成，它可以正確的將外源蛋白導(dǎo)向分泌裝置，在蛋白分泌過程中起著不可替代的作用［2，4］。目前，只有少數(shù)外源蛋白在枯草芽孢桿菌表達(dá)系統(tǒng)中實(shí)現(xiàn)了高效表達(dá)，但還有大多數(shù)外源蛋白的分泌和表達(dá)效果不理想。其中枯草芽孢桿菌信號肽的氨基酸組成、類型和分泌途徑均會對外源蛋白分泌的效率產(chǎn)生影響，合適的信號肽是保證外源蛋白在枯草芽孢桿菌高效表達(dá)的關(guān)鍵因素之一。基于信號肽的策略提高外源蛋白的分泌量是切實(shí)可行的，并且往往會取得意想不到的效果［5-6］。雖然科
生物技術(shù)通報 2021年6期2021-08-11
- 對Deinococcus actinosclerus RM菌株分泌蛋白的預(yù)測
編碼序列的N端信號肽預(yù)測分析、篩選，通過在線程序：SignalP-4.1完成；蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位預(yù)測分析通過網(wǎng)站：http：//www.cbs.dtu.dk/services/TargetP-1.1/index.php完成.蛋白質(zhì)的跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測分析通過網(wǎng)站：http：//www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/完成.2 結(jié)果與分析2.1 RM菌株的基因組測序結(jié)果通過SPAdes對二代測序數(shù)據(jù)進(jìn)行拼裝后，獲得RM菌株測序全長為4 013
韶關(guān)學(xué)院學(xué)報 2021年6期2021-07-23
- 基于全基因組序列的黃單胞菌分泌蛋白質(zhì)預(yù)測及其特征分析
菌;全基因組;信號肽;生物信息學(xué)中圖分類號： S435.1 文獻(xiàn)標(biāo)識碼： A 文章編號： 1000-4440（2021）01-0053-07Prediction and characteristic analysis of Xanthomonas campestris secretory protein based on whole genome sequenceQIN Yue1， ZHU You-peng1， HAN Chang-zhi1，2（1.Col
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報 2021年1期2021-03-25
- 枯草芽孢桿菌信號肽依賴分泌表達(dá)系統(tǒng)研究進(jìn)展
枯草芽孢桿菌信號肽依賴分泌胞外蛋白途徑在外源基因的克隆表達(dá)過程中，重組蛋白一般以3種形式表達(dá)，包括細(xì)胞外的分泌表達(dá)、細(xì)胞內(nèi)的可溶性表達(dá)和在細(xì)胞內(nèi)形成不溶性的胞涵體?？莶菅挎邨U菌為格蘭氏陽性菌，只有一層細(xì)胞膜，蛋白可直接分泌至胞外而不形成胞涵體，其表達(dá)產(chǎn)物多數(shù)具有天然構(gòu)象和生物活性，產(chǎn)物較易純化，極大地方便了外源蛋白的下游加工和酶活測定，經(jīng)枯草芽孢桿菌分泌的很多外源蛋白質(zhì)已經(jīng)應(yīng)用于益生菌、酶制劑等工業(yè)生產(chǎn)領(lǐng)域[10]，占有很大的市場份額。根據(jù)SubtiLi
隴東學(xué)院學(xué)報 2021年2期2021-03-11
- 可可毛色二孢全基因組分泌蛋白的預(yù)測及分析
因組序列，利用信號肽預(yù)測軟件SignalP v5.0、跨膜結(jié)構(gòu)分析軟件TMHMM v2.0、細(xì)胞器定位分析軟件ProtComp v9.0、GPI錨定預(yù)測軟件big-PI Fungal Predictor和亞細(xì)胞器定位分析軟件TargetP v2.0生物信息學(xué)軟件對該菌中的典型分泌蛋白進(jìn)行篩選。對分泌蛋白N端信號肽的長度、氨基酸使用頻率及其切割位點(diǎn)進(jìn)行統(tǒng)計分析。依據(jù)蛋白序列的同源性，應(yīng)用BLASTP程序?qū)Ψ置诮M蛋白進(jìn)行功能注釋分析，預(yù)測其生物學(xué)功能。采用蔗糖
中國農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年24期2021-01-04
- 白假絲酵母菌(Candida albicans)WO-1分泌蛋白質(zhì)組的生物信息學(xué)分析
的N端是否存在信號肽和酶切位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測分析;TMHMM server v 2.0軟件(http:∥www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)和 Phobius軟件(http:∥phobius.sbc.su.se/)預(yù)測蛋白質(zhì)序列跨膜區(qū)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和數(shù)量;TargetP 1.1軟件(http:∥www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/)預(yù)測靶標(biāo)肽段在亞細(xì)胞器的定位,確定是否為穿膜信號肽;Big-PI Fungal P
沈陽師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版) 2020年5期2020-12-04
- 蝦肝腸胞蟲全基因組分泌蛋白的預(yù)測分析*
LS)，蛋白質(zhì)信號肽預(yù)測軟件SignalP-4.0(Petersen et al, 2011)，蛋白質(zhì)GPI 錨定位點(diǎn)預(yù)測軟件Kohgpi-1.5(Fankhauser et al, 2005)，蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測軟件TargetP-1.1(Emanuelsson et al, 2000)和WoLF PSORT(Horton et al,2007)，真核生物分泌蛋白預(yù)測程序 EuSecPred2.0(https://silkpathdb.swu.edu.
漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展 2020年6期2020-11-03
- 信號肽序列對A型流感病毒H1N1 HA蛋白表達(dá)的影響
胞質(zhì)中合成的，信號肽(signal peptide, SP)是位于新合成蛋白質(zhì)N端的一段的序列[3]，可以指導(dǎo)蛋白質(zhì)在胞質(zhì)的正確轉(zhuǎn)移。在信號肽的引導(dǎo)下，新生蛋白質(zhì)向內(nèi)質(zhì)網(wǎng)轉(zhuǎn)移，當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)進(jìn)入合適的位置后，信號肽序列被切除[4]。然后蛋白質(zhì)被接著加工轉(zhuǎn)移，最終到達(dá)合適的場所發(fā)揮功能。HA是一個跨膜蛋白，在其N端含有信號肽序列[5-6]。本研究在含F(xiàn)lag標(biāo)簽真核載體N端和C端分別引入H1N1分離株(A/Puerto Rico/8/34)的 HA 序列，構(gòu)建帶有
畜牧與獸醫(yī) 2020年8期2020-08-12
- 不同信號肽對人鼠嵌合CMV-IgM分泌表達(dá)的影響
白質(zhì)前體N端的信號肽與信號肽識別因子結(jié)合，在信號肽識別因子的幫助下進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)進(jìn)行下一步的修飾，合適的信號肽有助于重組蛋白表達(dá)量的提高[7-10]。本研究在已報道的基礎(chǔ)上[11-14]，通過RLM-RACE技術(shù)釣取雜交瘤細(xì)胞基因序列，與人源Fc段進(jìn)行拼接，構(gòu)建人鼠嵌合CMV-IgM表達(dá)載體，并通過PCR方法將5種不同的分泌型信號肽 (SigA–SigE) 代替 CMV-IgM 自身信號肽(SigF)，利用CHO作為宿主細(xì)胞進(jìn)行體外表達(dá)。對純化后的 CMV-I
生物工程學(xué)報 2020年6期2020-07-31
- 16種微生物蛋白酶的生物信息學(xué)分析
、腸桿菌屬具有信號肽，其余蛋白酶氨基酸序列不具有信號肽的特點(diǎn)?？梢酝茰y出蛋白酶為非分泌性蛋白;只有綠膿桿菌和豬鏈球菌有跨膜結(jié)構(gòu)，剩下其余幾種微生物均沒有跨膜結(jié)構(gòu)。具有2個蛋白功能域，分別為Peptidase S8 familyi、Fn3_5like domain。關(guān)鍵詞：微生物;蛋白酶;序列分析;生物信息學(xué);理化性質(zhì);蛋白結(jié)構(gòu);信號肽中圖分類號： S188+.3文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號：1002-1302（2020）04-0065-08收稿日期：2018-
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年4期2020-04-16
- 遺傳算法背景下人工信號肽優(yōu)化設(shè)計探討
洋摘要：為提高信號肽以及識別信號肽拼接精度，在結(jié)構(gòu)融合度特征的基礎(chǔ)上，構(gòu)建氨基酸綜合替代矩陣和馬爾科夫轉(zhuǎn)移矩陣，對不分泌/極低分泌的信號肽序列進(jìn)行人工調(diào)整和優(yōu)化設(shè)計。結(jié)果表明：通過尋找信號肽中不同位置氨基酸的偏向性選取趨勢，能夠確定影響蛋白質(zhì)分泌水平的關(guān)鍵氨基酸，提高了外源蛋白質(zhì)高分泌表達(dá)信號肽拼接準(zhǔn)確度。關(guān)鍵詞：信號肽;馬爾科夫轉(zhuǎn)移矩陣;特征向量;人工優(yōu)化序列;遺傳算法0 引言隨著科研水平的提高，發(fā)現(xiàn)信號肽對于蛋白質(zhì)的定位有著非常重要的作用，使得信號肽的
荊楚理工學(xué)院學(xué)報 2020年6期2020-04-06
- 大腸桿菌分泌表達(dá)裂解性多糖單加氧酶發(fā)酵條件的優(yōu)化
。因此，不同的信號肽被廣泛用于將外源蛋白輸出到大腸桿菌胞質(zhì)空間或者直接分泌到胞外培養(yǎng)基中[26, 28]。如來源于蘇云金芽孢桿菌的BtLPMO10A利用載體自身信號肽實(shí)現(xiàn)了在大腸桿菌胞內(nèi)的可溶性表達(dá)[29]；來源于粘質(zhì)沙雷氏菌的CBP21(LPMO10)通過不同的信號肽嘗試，最終實(shí)現(xiàn)了在大腸桿菌的胞外表達(dá)[30]。但是目前利用大腸桿菌分泌表達(dá)真菌來源LPMO的相關(guān)研究較少。實(shí)現(xiàn)重組蛋白在大腸桿菌中的胞外表達(dá)，可以簡化下游處理工藝，因此酶的胞外表達(dá)可以降低工
食品與發(fā)酵工業(yè) 2020年5期2020-03-28
- Pyrococcus yayanosii L-天冬酰胺酶在枯草芽孢桿菌中分泌途徑的鑒定及其分泌能力的提高
蛋白質(zhì)是否依賴信號肽，可以分為信號肽依賴的分泌途徑和不依賴于信號肽的分泌途徑。枯草芽孢桿菌中依賴信號肽分泌的途徑又分為以下4種[7]：Sec分泌途徑（General secretion pathway），原核微生物中主要的蛋白質(zhì)分泌途徑，該類信號肽的最典型特征是C端氨基酸序列為Ala-X-Ala（X代表任何氨基酸），由Ⅰ型信號肽酶切割；Tat分泌途徑（Twin-arginine translocation pathway），其特征在于N端含有雙精氨酸（RR
食品與生物技術(shù)學(xué)報 2020年11期2020-03-22
- 畢赤酵母引導(dǎo)外源蛋白分泌的信號肽研究進(jìn)展
-factor信號肽1.1 α-factor信號肽結(jié)構(gòu)和功能當(dāng)前畢赤酵母系統(tǒng)中應(yīng)用最廣也最為成功的信號肽是釀酒酵母的α-factor信號肽，因而它的結(jié)構(gòu)和功能也得到了較為詳細(xì)的研究。α-factor信號肽是酵母α細(xì)胞分泌的交配信息素（mating factor 1，MF1）N端一段α交配因子前導(dǎo)肽，其編碼基因位于釀酒酵母的染色體XV1上[10]。α-factor信號肽由86個氨基酸殘基組成，實(shí)則包含前肽（Pre-sequence）和前導(dǎo)區(qū)（Pro-regi
生物技術(shù)通訊 2020年6期2020-03-10
- 一株高效降解羽毛廢棄物菌株的篩選及表達(dá)條件優(yōu)化
礎(chǔ)上，通過篩選信號肽來提高角蛋白酶基因在枯草芽孢桿菌中的表達(dá)，旨為探索信號肽與靶蛋白表達(dá)效率之間的關(guān)系研究奠定基礎(chǔ)，同時有助于實(shí)現(xiàn)重組角蛋白酶的工業(yè)化生產(chǎn)。1 材料與方法1.1 材料1.1.1 土樣 來自新疆、河南、內(nèi)蒙古、河北、山東地區(qū)的羊圈或豬圈的土壤。羽毛：來自寧夏好水川養(yǎng)殖有限公司。菌株與質(zhì)粒：B.subtilisWB600和質(zhì)粒pWB980均由本實(shí)驗(yàn)室保存。試劑與培養(yǎng)基：DNA限制性內(nèi)切酶、DNA聚合酶、DNA連接酶，購自TaKaRa公司；質(zhì)粒提
生物技術(shù)通報 2019年9期2019-09-18
- 構(gòu)建表達(dá)Flag-GPI的重組乙型肝炎病毒載體
C端各含有一個信號肽，N端信號肽的作用是將蛋白質(zhì)帶到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(endoplasmic reticulum，ER)內(nèi)腔進(jìn)行加工；C端信號肽又被稱為GPI添加信號肽，其作用是用來替換預(yù)先在ER內(nèi)合成的GPI，使GPI通過特定的化學(xué)鍵連接在蛋白質(zhì)的C端[22-24]?；贖BV載體5c3c和GPI的特性，本研究設(shè)想在5c3c載體中插入外源基因，該基因編碼帶有N端分泌信號肽和C端GPI添加信號肽的Flag標(biāo)簽，通過構(gòu)建表達(dá)Flag-GPI的重組HBV，使Flag標(biāo)簽
微生物與感染 2019年4期2019-08-30
- 刺齒報春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶基因的鑒定及序列分析
基因序列分析;信號肽中圖分類號： S184文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號：1002-1302（2019）08-0056-04肌醇半乳糖苷合成酶（galactinol synthase，簡稱GolS）是糖基轉(zhuǎn)移酶家族的一個亞家族，能催化半乳糖和肌醇反應(yīng)合成肌醇半乳糖苷，為棉子糖系列寡糖的合成提供半乳糖基。棉子糖系列寡糖（raffinose family oligosaccharides，簡稱RFOs）主要包括棉子糖、水蘇糖、毛蕊草糖等，是高等植物中重要的可溶性小分
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年8期2019-08-20
- DrwH類信號肽序列對其抗氧化功能的影響
個氨基酸組成的信號肽序列，完整野生型dWHy1蛋白在大腸桿菌中異源表達(dá)，其存活率高于只含有空載體的對照菌株；而缺失信號肽的截短蛋白dWHy1ΔSP能顯著增強(qiáng)宿主細(xì)胞耐受冷凍脅迫的能力［10］。本研究前期對來源于耐輻射異常球菌的DrwH核心結(jié)構(gòu)域蛋白Dr-WHy在大腸桿菌中的抗逆功能進(jìn)行初步研究，其在大腸桿菌中表達(dá)能夠增強(qiáng)宿主的氧化脅迫抗性。此外，氧化脅迫（H2O2）條件下，Dr-WHy蛋白對蘋果酸脫氫酶（MDH）和乳酸脫氫酶（LDH）的酶活性有保護(hù)作用［5
生物技術(shù)通報 2019年5期2019-06-04
- 嗜熱內(nèi)切葡聚糖酶(E1)植物亞細(xì)胞定位表達(dá)載體的構(gòu)建及驗(yàn)證
不同亞細(xì)胞定位信號肽的ImpactVectors載體連接，構(gòu)建成E1-IV1.1～E1-IV1.5系列載體，其中載體編號1.1表示不含有信號肽，1.2表示通過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分泌的胞外信號肽，1.3表示內(nèi)質(zhì)網(wǎng)滯留信號肽，1.4表示葉綠體信號肽，1.5表示線粒體信號肽。利用PCR技術(shù)將上述載體中信號肽-E1基因序列擴(kuò)增。根據(jù)載體序列設(shè)計的PCR擴(kuò)增引物分別為：正向擴(kuò)增引物(1.1S)5′-GTCCATTCCTCCTAAGTATCTAGAA-3′，反向擴(kuò)增引物(1.1A
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報 2018年6期2019-01-04
- 極端嗜熱酸性α-淀粉酶PFA在枯草芽孢桿菌中的高效分泌表達(dá)
于枯草芽孢桿菌信號肽的引導(dǎo)，并且信號肽與外源蛋白質(zhì)之間存在適配性[15]。因此針對特定的蛋白質(zhì)需要選擇合適的信號肽來實(shí)現(xiàn)有效的分泌表達(dá)。來源于極端嗜熱古生菌（Pyrococcus furiosus）的極端嗜熱酸性α-淀粉酶PFA是目前已知的熱穩(wěn)定性最好的α-淀粉酶。PFA的最適反應(yīng)溫度高達(dá)100 ℃，最適反應(yīng)pH值為5.0，在未補(bǔ)加Ca2＋的條件下于98 ℃的半衰期長達(dá)13 h，并且其熱穩(wěn)定性和高溫活性均不依賴于Ca2＋[16-17]。鑒于PFA的優(yōu)良酶學(xué)
食品科學(xué) 2018年18期2018-10-08
- 基于外泌蛋白質(zhì)組的釀酒酵母信號肽元件的分析及鑒定
的前體通常含有信號肽，翻譯后首先被定向地轉(zhuǎn)運(yùn)到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)；另一類不含有信號肽的胞質(zhì)蛋白如糖代謝酶、伴侶蛋白和翻譯起始因子等也可以經(jīng)過非經(jīng)典的 ER-Golgi 非依賴分泌途徑分泌到胞外，其外泌的分子機(jī)制還沒有闡明[3]。許多外泌蛋白和胞內(nèi)膜蛋白在合成時都依賴于其 N-端的信號肽功能元件，細(xì)胞內(nèi)膜定位的蛋白盡管也經(jīng)過ER-Golgi 途徑轉(zhuǎn)運(yùn)，但是其信號肽的下游和分子內(nèi)部存在穿膜肽或 C-膜定位信號（如核定位信號肽）控制蛋白的亞細(xì)胞轉(zhuǎn)位[4]。分泌型的信號肽含有
中國醫(yī)藥生物技術(shù) 2018年4期2018-08-15
- 煙草β—1，3—葡聚糖酶的生物學(xué)分析
酶的理化特性、信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)的組成成分。[結(jié)果]NtBGl-2的分子量最大（40 390.76 Dk），NtBGl-3的分子量最小（37 722.64 Dk）；NtBGl-1和NtBGl-2的等電點(diǎn)小于7.0，而NtBGl-3的等電點(diǎn)大于7.0；NtBGl-1和NtBGl-2屬于不穩(wěn)定蛋白，NtBGl-3屬于穩(wěn)定性蛋白，且耐熱性大于NtBGl-1和NtBGl-2；NtBGl-1和NtBGl-2的優(yōu)勢氨基酸為甘氨酸和絲氨酸，NtBGl-3的為天冬酰氨和丙氨
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年17期2018-05-14
- 信號肽對溶血素在大腸桿菌中跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)的影響
核糖體上進(jìn)行。信號肽（Signal peptide）是蛋白質(zhì)的一個片段，能夠引導(dǎo)核糖體并定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上，并將不斷合成的肽鏈穿過通道，隨后信號肽被切割下來，完整的蛋白被釋放進(jìn)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔后被轉(zhuǎn)運(yùn)到胞外[1]。研究發(fā)現(xiàn)，一般情況下，新生蛋白通常在位于其N端信號肽的指引下到達(dá)細(xì)胞特定區(qū)域，并由其介導(dǎo)完成跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)[2]。豬鏈球菌屬于鏈球菌屬，現(xiàn)在公認(rèn)的血清型有33個， 其 中2型（Streptococcus suis type 2，SS2）最為常見，也最重要[3]。大
中國動物檢疫 2018年3期2018-03-09
- 整體優(yōu)化的信號肽和人溶菌酶基因在畢赤酵母的高效表達(dá)
外源蛋白可通過信號肽引導(dǎo)分泌至胞外等諸多優(yōu)點(diǎn)，是表達(dá)真核細(xì)胞來源蛋白質(zhì)的理想系統(tǒng)之一。在將外源基因轉(zhuǎn)入畢赤酵母前，研究者會根據(jù)畢赤酵母密碼子偏愛性對外源基因序列進(jìn)行優(yōu)化設(shè)計。劉真英等[20]對柞蠶溶菌酶基因進(jìn)行密碼子優(yōu)化后，其在畢赤酵母中表達(dá)量可達(dá)2.4 g/L，且純化后的柞蠶溶菌酶比酶活力達(dá)到23 970 U/mg。Zhou等[18]對人源溶菌酶基因進(jìn)行優(yōu)化，并轉(zhuǎn)入畢赤酵母(P.pastorisSMD1168)進(jìn)行表達(dá)，發(fā)酵上清液中人源溶菌酶蛋白濃度為3
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報 2018年1期2018-03-07
- 全基因組預(yù)測褐環(huán)乳牛肝菌的分泌蛋白
基酸大小分布、信號肽長度、信號肽切割位點(diǎn)等進(jìn)行分析，明確該菌分泌蛋白的氨基酸長度集中于51～450 aa，信號肽長度以17～21 aa的序列最為集中，其信號肽切割位點(diǎn)均屬于A-X-A類型。通過上述生物信息學(xué)分析方法有效地實(shí)現(xiàn)了褐環(huán)乳牛肝菌分泌蛋白的預(yù)測，分泌蛋白的信號肽切割位點(diǎn)類型與其他已經(jīng)報道的致病疫霉、粗糙脈孢霉、禾谷炭疽菌等分泌蛋白信號肽切割位點(diǎn)一致。研究結(jié)果為進(jìn)一步解析分泌蛋白在該菌為宿主植物提供營養(yǎng)過程中發(fā)揮的作用機(jī)制提供重要的理論支持。關(guān)鍵詞：
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年23期2018-01-29
- 信號肽對木聚糖酶在馬克斯克魯維酵母中分泌表達(dá)的影響
200438)信號肽對木聚糖酶在馬克斯克魯維酵母中分泌表達(dá)的影響吳 玥1，周峻崗1,2，呂 紅1,2(1. 復(fù)旦大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院 遺傳工程國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，上海 200438；2. 上海工業(yè)菌株工程技術(shù)研究中心，上海200438)馬克斯克魯維酵母(Kluyveromycesmarxianus)是一種新型的非常規(guī)酵母，具有生長快、分泌能力強(qiáng)、安全性高等優(yōu)勢．在酵母表達(dá)系統(tǒng)中，分泌信號肽不僅介導(dǎo)了外源蛋白沿著正確途徑分泌到胞外，也在蛋白質(zhì)翻譯后加工等方面發(fā)揮了
復(fù)旦學(xué)報（自然科學(xué)版） 2017年4期2017-12-14
- 動物雙歧桿菌AD011表面脂蛋白的全基因組預(yù)測和功能分析
中表面脂蛋白和信號肽進(jìn)行預(yù)測，同時采用COG 功能數(shù)據(jù)庫對預(yù)測的脂蛋白進(jìn)行功能注釋和聚類分析。[結(jié)果]對動物雙歧桿菌AD011基因組1 518個蛋白的表面脂蛋白預(yù)測，結(jié)果表明，19個蛋白具有脂蛋白信號肽。功能分析顯示，該菌株19個脂蛋白中有3個蛋白沒有功能注釋，16個蛋白有功能注釋，其中10個蛋白參與氨基酸代謝與轉(zhuǎn)運(yùn)、3個蛋白參與碳水化合物代謝與轉(zhuǎn)運(yùn)，3個蛋白參與無機(jī)鹽離子代謝與轉(zhuǎn)運(yùn)。[結(jié)論]動物雙歧桿菌AD011表面脂蛋白參與的功能主要與營養(yǎng)物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)和
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年11期2017-05-30
- 青春雙歧桿菌ATCC15703 I型Sec途徑分泌蛋白的預(yù)測和功能分析
pase I）信號肽酶識別的I型Sec途徑分泌蛋白，分泌蛋白的信號肽長度最大的有54個氨基酸，最小的有11個氨基酸。I 型Sec途徑分泌蛋白的功能分析結(jié)果顯示，分泌蛋白主要參與碳水化合物代謝與轉(zhuǎn)運(yùn)，氨基酸代謝與轉(zhuǎn)運(yùn)，復(fù)制、重組和修復(fù)，以及無機(jī)離子代謝和轉(zhuǎn)運(yùn)。[結(jié)論]青春雙歧桿菌I型Sec途徑分泌蛋白的預(yù)測和功能分析為了解該菌胞外蛋白的分泌機(jī)制提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞青春雙歧桿菌；基因組；分泌蛋白；Sec分泌途徑；信號肽中圖分類號R151.3文獻(xiàn)標(biāo)識碼A文章編
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年12期2017-05-30
- 談信號肽及蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運(yùn)
轉(zhuǎn)運(yùn)的過程中，信號肽起著十分重要的作用。本文就信號肽的結(jié)構(gòu)和功能，蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運(yùn)類型與途徑等方面進(jìn)行詳細(xì)分析，闡述了信號肽對蛋白質(zhì)的定位重要作用，探究信號肽的研究在生物蛋白質(zhì)、醫(yī)療、制藥等方面的應(yīng)用情況，以及對信號肽研究的未來展望?！娟P(guān)鍵詞】 信號肽 蛋白質(zhì) 分選轉(zhuǎn)運(yùn) 實(shí)際應(yīng)用1 信號肽與蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運(yùn)1.1 信號肽的結(jié)構(gòu)與功能信號肽引導(dǎo)并定位蛋白質(zhì)新生肽鏈，類似于一段具有特定的“條形碼”，位于蛋白質(zhì)的N端氨基酸序列，一般由20左右個氨基酸殘基組成，包括疏
今日健康 2016年7期2017-04-12
- 運(yùn)用計算機(jī)軟件預(yù)測木質(zhì)部寄生屬信號肽
測木質(zhì)部寄生屬信號肽張志超1，黃 勇2，徐可成1，宋 紅1，楊俊譽(yù)1，張 彧1，黃 瓊1，3，*(1.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 教育部生物多樣性與病蟲害控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，云南 昆明 650201； 2.云南省醫(yī)療器械檢驗(yàn)所，云南 昆明 650034； 3.云南生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，云南 昆明 650201)利用已經(jīng)公布的木質(zhì)部寄生屬(Xylellafastidiosa)2 766個基因組數(shù)據(jù)信息，運(yùn)用在線計算機(jī)預(yù)測軟件，分析了木質(zhì)部寄生屬(Xylellafa
浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報 2017年3期2017-04-08
- 全基因組預(yù)測枯草芽孢桿菌BEST195的分泌蛋白
的氨基酸分布、信號肽長度大小、信號肽切割位點(diǎn)等性質(zhì)進(jìn)行分析。結(jié)果表明：枯草芽孢桿菌含有分泌蛋白102個，其氨基酸長度、信號肽長度與植物病原菌不同；信號肽切割位點(diǎn)屬于A-X-A類型，與其他已經(jīng)報道的植物病原真菌、細(xì)菌以及卵菌中分泌蛋白信號肽切割位點(diǎn)一致。通過上述生物信息學(xué)分析方法有效地實(shí)現(xiàn)了枯草芽孢桿菌BEST195分泌蛋白的預(yù)測，分泌蛋白的信號肽切割位點(diǎn)具有物種保守型特點(diǎn)。枯草芽孢桿菌；分泌蛋白；信號肽；預(yù)測枯草芽孢桿菌BEST195 (Bacilluss
西南林業(yè)大學(xué)學(xué)報 2016年6期2016-12-15
- 煙草野火病菌Pseudomonas syringae pv. tabaci yuexi-1信號肽預(yù)測及分析
yuexi-1信號肽預(yù)測及分析王鐵霖，李晶，楊玉文，趙廷昌中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所，植物病蟲害生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，北京 100193利用SignalP 4.0、 LipoP 1.0 及TMHMM v2.0對煙草野火病菌Pseudomonas syringaepv.tabaciyuexi-1菌株基因組中信號肽的數(shù)量、長度和氨基酸組成進(jìn)行了預(yù)測及分類。結(jié)果確定其中432個ORFs (Open reading frame) 所編碼的N 端有信號肽序列，占全
中國煙草學(xué)報 2016年1期2016-11-16
- 土壤宏基因組中芽孢桿菌信號肽的克隆及分析
因組中芽孢桿菌信號肽的克隆及分析唐國鑫1，2，陳寧1*（1.天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院，天津300457；2.中國科學(xué)院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所，天津300308）從土壤宏基因組中篩選獲得在芽孢桿菌中高效分泌重組蛋白的信號肽。通過數(shù)據(jù)分析，將預(yù)測到的信號肽DNA片段與蛋白酶基因融合，在枯草芽孢桿菌（Bacillus subtilis）WB800和地衣芽孢桿菌（Bacillus licheniformis）DL6中表達(dá)，進(jìn)行胞外蛋白酶酶活測定。篩選得到25個可能
中國釀造 2016年6期2016-10-14
- 分散泛菌蔗糖異構(gòu)酶在大腸桿菌中的表達(dá)及發(fā)酵優(yōu)化
量，研究了不同信號肽及發(fā)酵條件對蔗糖異構(gòu)酶在大腸桿菌中重組表達(dá)的影響。將攜帶天然信號肽的蔗糖異構(gòu)酶基因優(yōu)化后，轉(zhuǎn)入大腸桿菌Escherichia coli BL21 （DE3） 構(gòu)建重組表達(dá)菌株——ORI菌株，搖瓶發(fā)酵總酶活和胞外酶活分別為85 U/mL、65 U/mL。從天然信號肽開始第22位氨基酸作為成熟蛋白的起始，連接PelB或OmpA信號肽構(gòu)建P22和O22菌株，其中P22菌株發(fā)酵總酶活提高至138 U/mL，是ORI菌株總酶活的1.6倍；而O22
生物工程學(xué)報 2016年8期2016-09-13
- 真核細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的定位
外的精準(zhǔn)定位與信號肽和囊泡密切相關(guān)。1.1 “信號肽”假說 20世紀(jì)70年代初，洛克菲勒大學(xué)布洛貝爾(Gūnter Blobel)博士提出 “信號肽假說”,以解釋蛋白質(zhì)如何從核糖體合成后到達(dá)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)，并在隨后的20多年的工作中證實(shí)了假說的正確性和普遍性。什么是信號肽？一般認(rèn)為是新合成多肽鏈中用于指導(dǎo)蛋白質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)移的N-末端氨基酸序列。信號肽通常由16～36個氨基酸組成，一般位于N端(有時不一定在N端)，對蛋白質(zhì)的靶向轉(zhuǎn)運(yùn)有決定作用。信號肽假說的內(nèi)容包括：①蛋
生物學(xué)教學(xué) 2016年7期2016-08-20
- 煙草合子時期特異表達(dá)基因的克隆與分析
含有1段疏水性信號肽，但在其他物種中沒有發(fā)現(xiàn)同類蛋白。NtZE583-綠色熒光蛋白（NtZE583-GFP）融合蛋白亞細(xì)胞定位顯示，該蛋白可能存在于液泡中。利用染色體步移技術(shù)獲得該基因5′端上游3 866 bp的側(cè)翼序列（啟動子和5′UTR），經(jīng)檢測發(fā)現(xiàn)，具有較強(qiáng)的啟動子活性。研究結(jié)果為進(jìn)一步研究該基因在煙草早期胚胎發(fā)生中的功能奠定了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：煙草；合子；液泡；基因克??；信號肽中圖分類號： S572.01；Q785文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號：1002-1
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年5期2016-07-23
- 中溫α-淀粉酶基因在枯草芽孢桿菌中的高效表達(dá)及其發(fā)酵條件優(yōu)化
研究了啟動子和信號肽對外源蛋白表達(dá)分泌的影響。分別選取了4種啟動子以及8種信號肽來進(jìn)行篩選，結(jié)果表明，啟動子PAprE的強(qiáng)度最高，信號肽SPnprE的分泌效率最好。針對重組菌株1A751Q31進(jìn)行系統(tǒng)的發(fā)酵優(yōu)化，在72 h發(fā)酵液中α-淀粉酶酶活達(dá)到380 U/mL。在7.5 L發(fā)酵罐中進(jìn)行放大實(shí)驗(yàn)，發(fā)酵液中α-淀粉酶酶活最高達(dá)到853 U/mL。以上研究表明，α-淀粉酶適合在枯草芽孢桿菌中進(jìn)行表達(dá)，同時表明枯草芽孢桿菌是良好的異源蛋白表達(dá)系統(tǒng)。關(guān)鍵詞枯草芽
食品與發(fā)酵工業(yè) 2016年4期2016-05-24
- 信號肽對Bacillus subtilis表達(dá)環(huán)糊精葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶的影響
14122）?信號肽對Bacillus subtilis表達(dá)環(huán)糊精葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶的影響毛婷1，2，李江華*1，2，劉龍1，2，堵國成1，2，陳堅1，2 （1．江南大學(xué)，工業(yè)生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，江蘇無錫214122；2.江南大學(xué)生物工程學(xué)院，江蘇無錫214122）摘要：將來源于作者所在實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建保存E.coli pET-20b（+）/CGT△E-CBMAmy的CGT△ECBMAmy基因插入6種含有不同信號肽（estA、bpr、vpr、yncM、yvgO
食品與生物技術(shù)學(xué)報 2016年2期2016-05-23
- 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的蛋白質(zhì)合成功能
(氨基末端)的信號肽，指導(dǎo)蛋白質(zhì)由核糖體轉(zhuǎn)至內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上合成，并因此獲得1999年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎。2.1 信號肽 在成熟mRNA5′端起始密碼(AUG)之后，有一組編碼特殊氨基酸序列的密碼子，稱為信號密碼，由信號密碼翻譯出的肽鏈，叫做信號肽。信號肽為高度疏水氨基酸組成的肽鏈，一般由13～26個氨基酸組成，是新生肽鏈上的一段特殊的氨基酸序列，可引導(dǎo)蛋白跨膜或分泌到胞外。信號肽的位置大多位于新生肽的N-端，少數(shù)位于多肽鏈的中部。信號肽一般可分為：親水區(qū)、疏水
生物學(xué)教學(xué) 2016年2期2016-04-10
- 希金斯刺盤孢全基因組候選效應(yīng)分子的預(yù)測
孢；效應(yīng)分子；信號肽；十字花科植物炭疽?。簧镄畔W(xué)中圖分類號 S436.34 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 AAbstract Colletotrichum higginsianum Sacc. is one of the important phytopathogenic fungi worldwide， and often causes severe anthracnose disease on a wide range of cruciferous plants，
熱帶作物學(xué)報 2015年6期2015-05-30
- 樹鼩全基因組分泌蛋白的預(yù)測分析
蛋白質(zhì)序列進(jìn)行信號肽預(yù)測，最后利用TargetP、PSORT和WoLF PSORT對具有信號肽的蛋白質(zhì)進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測，篩選定位于細(xì)胞膜外的蛋白質(zhì)。以上所有程序的運(yùn)行及結(jié)果的處理通過EuSecPred 2.0在線流程完成[8]。篩選得到的分泌蛋白合集包括含有信號肽的經(jīng)典型分泌(classical secreted protein，CSP)以及無信號肽的非經(jīng)典型分泌蛋白(non-classical secreted protein，NCSP)兩種[17]。
中國比較醫(yī)學(xué)雜志 2014年4期2014-08-14
- 褐色喜熱裂孢菌Thermobifida fusca產(chǎn)麥芽糖α-淀粉酶基因的克隆表達(dá)及酶學(xué)性質(zhì)研究
引物分別擴(kuò)增含信號肽和去除信號肽的T.fuscaα-淀粉酶基因。為便于基因與載體的連接，在上下游分別加入Nco I和Eco R I的酶切位點(diǎn)（帶下劃線），同時為方便后期的過鎳柱純化目的蛋白，設(shè)計引物時在表達(dá)的目的蛋白基因前端加上6個組氨酸尾巴序列，并委托鼎安生物公司合成。其中，引物Sense1和Antisense擴(kuò)增的是含信號肽的T.fuscaα-淀粉酶基因，而引物Sense2和Antisense擴(kuò)增的是去除信號肽的T.fuscaα-淀粉酶基因。1.2.2
食品工業(yè)科技 2013年24期2013-02-21
- 信號肽與分泌通路在畢赤酵母表達(dá)異源蛋白中的作用機(jī)制
）研究認(rèn)為，除信號肽外，分泌通路在外源蛋白高效分泌過程中起關(guān)鍵作用，因此成為突破蛋白質(zhì)分泌瓶頸的焦點(diǎn)。本文就畢赤酵母信號肽關(guān)聯(lián)的分泌機(jī)制、結(jié)構(gòu)特征和蛋白分泌通路改造等方面的研究進(jìn)展作一綜述。1 信號肽牽引的外源蛋白分泌通路假說Gunter Blobel于20世紀(jì)70年代提出信號肽假說，認(rèn)為蛋白質(zhì)合成在核糖體上進(jìn)行，信號肽作為蛋白質(zhì)的一個片段引導(dǎo)核糖體定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)通道上，并牽引合成的多肽穿過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)通道，隨后信號肽被肽酶切除，蛋白質(zhì)被釋放到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔，由轉(zhuǎn)運(yùn)小泡
中國飼料 2013年1期2013-01-25
- 禽類MHCⅡ類分子β鏈信號肽保守性分析
CⅡ類分子β鏈信號肽保守性分析宗文明1,葉 紅2（1.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)，安徽 合肥 230036；2.安徽省醫(yī)學(xué)科學(xué)研究院，安徽 合肥 230061）Ⅱ類主要組織相容性復(fù)合物（major histocompatibility complex，MHC）的β鏈顯示極為豐富的多態(tài)性.為了分析禽類MHCⅡ類分子β鏈信號肽是否呈現(xiàn)出多態(tài)性的分子生物學(xué)特征，利用NCBI網(wǎng)站查找到原雞等五種禽類編碼MHCⅡ類分子β鏈的mRNA，再用DNAStar軟件轉(zhuǎn)譯成氨基酸序列，然后用
赤峰學(xué)院學(xué)報·自然科學(xué)版 2012年15期2012-10-16
- 信號肽編碼序列庫的構(gòu)建及耐熱乳糖酶的分泌
214122）信號肽編碼序列庫的構(gòu)建及耐熱乳糖酶的分泌夏 雨 弓紫豐 成玉梁 趙 瑩 孫 震（江南大學(xué)食品學(xué)院，江蘇 無錫 214122）為了實(shí)現(xiàn)來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌的β－半乳糖苷酶在枯草芽孢桿菌中的分泌表達(dá)，建立一種較簡便的方法篩選能夠分泌該酶的信號肽，即針對11種信號肽構(gòu)建信號肽編碼序列庫，采用隨機(jī)篩選方法得到合適的信號肽，構(gòu)建相應(yīng)的分泌表達(dá)載體和重組表達(dá)菌株。結(jié)果表明，通過信號肽隨機(jī)篩選方法獲得的枯草芽孢桿菌中性蛋白酶NprE信號肽能夠有效引導(dǎo)該酶
食品與機(jī)械 2011年6期2011-12-28
- 細(xì)菌一種“新的分泌機(jī)制”初探
到達(dá)周質(zhì)時會被信號肽酶剪切掉［2］。I型是 Sec非依賴途徑。與II型和IV型分泌途徑相比較，I型和III型分泌不依賴于Sec系統(tǒng)，所以不需要分泌蛋白的氨基端加工。I型和III型途徑的蛋白質(zhì)分泌是一個連續(xù)的過程，不存在明顯的周質(zhì)中間體［3－4］。重組蛋白在大腸桿菌胞周質(zhì)中分泌表達(dá)應(yīng)屬于II型分泌機(jī)制［2］，在重組蛋白的氨基端通常融合一段信號肽基因，當(dāng)翻譯完成后，這條信號肽就會被大腸桿菌胞質(zhì)中的信號肽酶切除，這是一條傳統(tǒng)的分子生物學(xué)基本原理。但是，本文在構(gòu)建
中國獸藥雜志 2011年3期2011-05-29
- 斑馬魚成纖維細(xì)胞生長因子(FGFs)信號肽的預(yù)測分析
都具有一個N端信號肽,屬于典型的分泌型生長因子,可被細(xì)胞分泌到胞外,以自分泌或者旁分泌形式發(fā)揮調(diào)控作用[4]。因此,研究FGF成員的信號肽結(jié)構(gòu)對于研究其在生物體內(nèi)的分泌途徑,可以揭示它在胚胎發(fā)育、組織形成與修復(fù)、炎癥、血栓形成、腫瘤發(fā)生等生理及病理過程中的作用途徑。本文利用分析準(zhǔn)確率較高的Signal P3.0[5]、TMHMM 2.0、Big.PI-Predictor和 Target P1.01四種軟件對斑馬魚FGF中分泌型蛋白的信號肽進(jìn)行預(yù)測,并對其信
中國獸醫(yī)雜志 2010年6期2010-11-22
- 一種表征蛋白質(zhì)可分泌性的結(jié)構(gòu)融合度特征
22選擇適宜的信號肽是實(shí)現(xiàn)外源蛋白高效分泌表達(dá)的一個重要因素。本研究利用生物信息學(xué)方法分析信號肽與外源蛋白之間的相容程度，將其定義為結(jié)構(gòu)融合度，并從數(shù)學(xué)角度分析拼接信號肽與目的蛋白鄰近殘基之間的相互作用，提出了信號肽拼接區(qū)域與目標(biāo)蛋白之間的數(shù)學(xué)模型，利用該模型進(jìn)行結(jié)構(gòu)融合度特征提取，以此來表征外源蛋白質(zhì)的可分泌性。模擬結(jié)果顯示結(jié)構(gòu)融合度特征能有效區(qū)分枯草芽胞桿菌宿主的可分泌和不可分泌蛋白。研究結(jié)果有助于信號肽的選擇，對目的蛋白分泌表達(dá)的優(yōu)化具有一定的指導(dǎo)意
生物工程學(xué)報 2010年5期2010-10-11
- 歐文氏桿菌CXJZ95-198甘露聚糖酶基因N端缺失表達(dá)
比說明缺失了的信號肽序列對酶活或者酶的分泌能力有負(fù)面影響，pF2和pF3透明圈大小無明顯差異說明N端信號肽后10個AA對該酶的活性無影響，可刪除。pF4和pF3比較說明pF4多刪除的10個AA對該酶的活性有非常重要的影響。2.4 重組子表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE分析分別挑取pF1-pF4四種菌的陽性克隆子的單菌落，在5 mL含有終濃度為50 μg/mL卡那霉素的LB培養(yǎng)基中37℃，180 r/min震蕩培養(yǎng)6 h，再將活化菌按2%的比例接種100 mL含有
湖南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2010年11期2010-07-09