唐秀英,萬建林,王會民
(江西省農(nóng)業(yè)科學院 超級水稻研究發(fā)展中心,江西 南昌 330200)
隨著全球氣候持續(xù)變暖、土壤持續(xù)惡化,逆境脅迫越來越成為制約水稻生長發(fā)育、影響水稻產(chǎn)量和質(zhì)量的關(guān)鍵因素,如干旱、高溫、高鹽堿、病蟲害等。水稻感受這些逆境脅迫信號后通過調(diào)節(jié)細胞內(nèi)相關(guān)基因的表達水平及其表達產(chǎn)物的活性,進而調(diào)整自身的生理狀態(tài)或形態(tài)來適應(yīng)不利環(huán)境[1]。蛋白質(zhì)是基因表達的產(chǎn)物,是生物功能的直接體現(xiàn)者。通過對水稻抗逆性相關(guān)的蛋白質(zhì)組進行研究,發(fā)現(xiàn)與水稻抗逆性相關(guān)的關(guān)鍵蛋白質(zhì),以闡明水稻響應(yīng)逆境脅迫的分子機理,為水稻抗逆性育種奠定基礎(chǔ)。
近年來,隨著多個物種基因組測序的相繼完成,研究者們逐漸意識到,僅僅完成基因組的測序并不能闡明生物的功能,于是研究重心由結(jié)構(gòu)基因組學轉(zhuǎn)向功能基因組學。蛋白質(zhì)組學是功能基因組學的重要研究方法之一,它是一門研究細胞、組織和體液中的所有蛋白質(zhì)的表達水平、蛋白質(zhì)功能以及蛋白質(zhì)之間相互作用的學科[2]。
差異蛋白質(zhì)組學是蛋白質(zhì)組學普遍采用的策略之一,主要是篩選和鑒定不同狀態(tài)下各樣本間特異表達的蛋白質(zhì),并獲取這些關(guān)鍵蛋白質(zhì)的功能,從而揭示生物機體對外界環(huán)境變化產(chǎn)生反應(yīng)的機制[3]。差異蛋白質(zhì)組學研究包括3 大技術(shù):①雙向電泳技術(shù),用于分離樣品蛋白質(zhì);②質(zhì)譜分析技術(shù),用于鑒定差異表達的蛋白質(zhì);③生物信息學技術(shù),用于分析蛋白質(zhì)功能。由于差異蛋白質(zhì)組學研究重在找出關(guān)鍵的差異蛋白,并不要求捕獲全部蛋白,所以在技術(shù)上具有更高的可實現(xiàn)性和廣泛的應(yīng)用前景[4]。
一些非生物逆境脅迫因子,如干旱、洪澇、高溫、低溫、高鹽堿、重金屬等對水稻的生長發(fā)育產(chǎn)生嚴重的影響,當感受到這些脅迫信號后,為了適應(yīng)外界環(huán)境,水稻體內(nèi)部分蛋白質(zhì)發(fā)生差異表達,對這些差異表達的蛋白質(zhì)進行研究,以闡明水稻響應(yīng)非生物逆境脅迫的分子機制。
土壤中的鹽濃度過高,水稻生長發(fā)育會受到抑制,嚴重者將出現(xiàn)死亡。在鹽脅迫條件下,水稻體內(nèi)蛋白質(zhì)組表達水平發(fā)生變化,并通過滲透調(diào)節(jié)方式維持植株體內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定[5]。水稻的耐鹽機制非常復(fù)雜,它是由許多耐鹽基因和若干信號分子組成的網(wǎng)絡(luò)通過相互協(xié)調(diào)來發(fā)揮作用的。蛋白質(zhì)組學的發(fā)展為分離和鑒定更多的鹽脅迫相關(guān)蛋白及進一步研究水稻抗鹽脅迫的分子機制提供有力保障。
Nam 等[6]用150 mmol/L NaCl 對野生型和OSRK1 轉(zhuǎn)基因水稻進行處理,提取根部蛋白進行雙向電泳和質(zhì)譜分析,發(fā)現(xiàn)在野生型水稻中有52 個響應(yīng)鹽脅迫的蛋白質(zhì)點表達發(fā)生明顯變化,其中主要為一些與能量代謝、氨基酸代謝、丙酮醛解毒、氧化還原調(diào)節(jié)以及蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換相關(guān)的蛋白質(zhì)在鹽脅迫下表達量上調(diào),而與GA(赤霉素)誘導(dǎo)根系生長的酶(如二磷酸果糖酶、甲基丙二酸半醛脫氫酶)表達下調(diào);相反,在OSRK1 轉(zhuǎn)基因水稻中僅僅只有幾種蛋白質(zhì)表達發(fā)生變化。可以看出,OSRK1 轉(zhuǎn)基因水稻對鹽脅迫逆境反應(yīng)較野生型不顯著。
白宇杰[7]對雜交水稻汕優(yōu)10 號和兩優(yōu)培九的早期幼苗(10 d 苗齡)分別進行鹽脅迫響應(yīng)蛋白的研究,發(fā)現(xiàn)經(jīng)鹽脅迫處理后的汕優(yōu)10 號和兩優(yōu)培九的葉片中分別有25 個和40 個蛋白質(zhì)點明顯表達上調(diào),其中有15 個點在兩個品種中均上調(diào)表達。對其中6 個點進行質(zhì)譜鑒定,有2 個蛋白質(zhì)得到鑒定,分別為磷酸丙酮酸水合酶和核酮糖1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶。在根中,鹽脅迫處理后的汕優(yōu)10 號中有96 個點表達上調(diào),73 個點表達下調(diào),而兩優(yōu)培九中有68 個點表達上調(diào),85 個點表達下調(diào)。選擇其中11個蛋白點進行質(zhì)譜鑒定,有8 個得到鑒定,分別為類甜蛋白、zeamatin 蛋白、球蛋白2S、幾丁質(zhì)酶、糖苷水解酶、乙二醛酶、谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶、抗壞血酸過氧化物酶。這些表達差異的蛋白質(zhì)與汕優(yōu)10 號和兩優(yōu)培九的耐鹽能力不同密切相關(guān)。
劉釗等[8]采用蛋白質(zhì)組策略,用免疫印跡調(diào)查了5 個PP2Ac 類磷酸酶蛋白質(zhì)在水稻苗期鹽脅迫條件下的表達,發(fā)現(xiàn)在耐鹽水稻品種蘭勝中,OsPP2Ac-4 的表達上調(diào),在鹽敏感的水稻品種9311 中,Os-PP2Ac-2、OsPP2Ac-3 和OsPP2Ac-5 的表達也發(fā)生了上調(diào),但PP2Ac-4 的表達下調(diào)。比較2 個品種間OsPP2Ac 蛋白質(zhì)的表達,發(fā)現(xiàn)在正常生長條件下,PP2Ac 蛋白質(zhì)的表達沒有顯著區(qū)別且基本保持恒定,其表達變化僅發(fā)生在鹽脅迫條件下。因此,水稻PP2Ac 家族蛋白質(zhì)的表達受鹽脅迫的誘導(dǎo)。以上研究可以看出,在鹽脅迫條件下,與逆境脅迫相關(guān)的蛋白質(zhì)(如氧化還原酶、水解酶等)表達量發(fā)生了變化,對這些差異表達的蛋白質(zhì)進行研究,有助于闡明水稻響應(yīng)鹽脅迫反應(yīng)的分子機理。
溫度脅迫是水稻重要的非生物逆境脅迫之一,對水稻的生長發(fā)育、產(chǎn)量和品質(zhì)等都會產(chǎn)生重要影響。高溫會加速水稻的生長和發(fā)育進程而縮短生育期,導(dǎo)致水稻各個性狀的生長、發(fā)育和分化的時間也相應(yīng)的縮短而不利于這些性狀的正常形成[9]。低溫冷害會對水稻造成生理損傷,導(dǎo)致水稻生長緩慢、發(fā)育不良,最終造成產(chǎn)量減少、品質(zhì)下降。水稻接受到這些不利溫度的信號后,通過信號傳導(dǎo)途徑,調(diào)節(jié)細胞內(nèi)溫度脅迫蛋白的表達,以適應(yīng)和對抗不良環(huán)境[10]。Hashimoto 和Komatsu[11]將水稻幼苗置于5 ℃中處理48 h 后,水稻的劍葉、葉鞘和根系中與逆境脅迫相關(guān)的蛋白質(zhì)表達量增加,而與防衛(wèi)相關(guān)的蛋白質(zhì)表達量減少。
楊輝[12]用轉(zhuǎn)LeERF2 基因水稻、野生型水稻幼苗分別在正常溫度和低溫條件下處理,經(jīng)雙向電泳分離,共得到179 個響應(yīng)低溫脅迫應(yīng)答的蛋白質(zhì)點,其中146 個差異表達的蛋白質(zhì)點得到質(zhì)譜鑒定。在低溫處理下,轉(zhuǎn)LeERF2 基因水稻與野生型水稻比較發(fā)現(xiàn),地上部分有7 個差異蛋白點,其中4 個蛋白點只在轉(zhuǎn)LeERF2 基因水稻中表達,2 個蛋白點表達下調(diào),1 個蛋白點只在野生型水稻中表達;地下部分有22 個差異蛋白點,其中6 個蛋白點只在轉(zhuǎn)LeERF2 基因水稻中表達,3 個蛋白點表達量上調(diào),4 個蛋白點表達量下調(diào),9 個蛋白點只在野生型水稻種表達??梢酝茰y這些差異表達的蛋白質(zhì)與轉(zhuǎn)LeERF2 基因水稻的耐低溫性能密切相關(guān)。
Jagadish 等[13]分別將處于開花期的Moroberekan、IR64 和N22(耐熱性能高的水稻品種)置于38 ℃的高溫條件下處理6 h,并設(shè)置一個對照組(即置于29 ℃的正常溫度下處理6 h),然后分別收集小穗用于提取蛋白。經(jīng)雙向電泳分離,共得到46 個明顯表達的差異蛋白質(zhì)點;經(jīng)質(zhì)譜分析,13 個蛋白質(zhì)點得到鑒定,其中,在N22 中,冷熱休克蛋白的表達量明顯上調(diào),這種蛋白有助于提高植物的耐熱能力。
周偉輝等[14]研究了高溫對水稻苗期或抽穗期的影響,結(jié)果表明,高溫使光合作用相關(guān)蛋白、能量類蛋白、代謝類蛋白表達量下降,抗逆相關(guān)蛋白表達量上升,并首次發(fā)現(xiàn)抗逆相關(guān)蛋白2-cys 過氧化物酶BAS1 的表達量在高溫脅迫下上升。這些與溫度脅迫差異表達蛋白質(zhì)的發(fā)現(xiàn)為今后選育抗高溫或低溫水稻品種提供科學依據(jù)。
當水稻發(fā)生干旱或者水澇時,細胞通過感知和傳導(dǎo)干旱或水澇脅迫信號,關(guān)閉和啟動某些基因表達,誘導(dǎo)產(chǎn)生與干旱或水澇脅迫相關(guān)的蛋白質(zhì),從而引起一系列形態(tài)、生理和生化上的反應(yīng),如氣孔關(guān)閉、葉片卷曲、植株衰老和根系活力下降。
商奇[15]研究了PEG6000 模擬干旱對中早3 號、汕優(yōu)63 和矮仔占的蛋白質(zhì)組的影響,結(jié)果表明,PEG6000 模擬干旱脅迫對矮仔占葉片中的蛋白質(zhì)的表達僅有抑制作用,未見誘導(dǎo)作用;對汕優(yōu)63 葉片中的蛋白質(zhì)表達既有抑制作用,也有誘導(dǎo)作用;對中旱3 號葉片中蛋白質(zhì)的表達僅有誘導(dǎo)作用,未見抑制作用。這說明中早3 號、汕優(yōu)63 和矮仔占的抗旱性能不一致。
Salekdeh 等[16]研究了粳稻CT9993 和秈稻IR62266 在干旱脅迫以及恢復(fù)灌溉后的葉片蛋白質(zhì)組,發(fā)現(xiàn)干旱脅迫下有42 個蛋白質(zhì)表達量發(fā)生變化,16 個蛋白質(zhì)功能得到鑒定,其中首次獲得4 種新的與干旱脅迫相關(guān)的蛋白質(zhì),這為研究水稻響應(yīng)干旱脅迫提供了有價值的參考。
Ali 和Komatsu[17]對2 周齡的水稻幼苗進行干旱處理2~6 d 后提取葉鞘蛋白質(zhì)進行雙手電泳和質(zhì)譜鑒定,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在葉鞘中有10 個蛋白質(zhì)表達上調(diào),2 個蛋白質(zhì)點表達下調(diào),這些應(yīng)答干旱脅迫的蛋白質(zhì)與水稻的光合作用、呼吸代謝、細胞結(jié)構(gòu)、植物防御以及信號傳導(dǎo)等相關(guān)。對干旱脅迫相關(guān)蛋白質(zhì)進行研究,為選育抗旱品種奠定基礎(chǔ)。
水稻在生長發(fā)育進程中若缺乏正常所需要的養(yǎng)分,會影響植株體內(nèi)的各種生理代謝過程,從而引起營養(yǎng)器官和生殖器官的發(fā)育不正常,并表現(xiàn)出特有的生理病態(tài)反應(yīng)[18],如植株提前衰老、結(jié)實率偏低、空秕粒增加。
謝金水等[19]研究了養(yǎng)分脅迫對水稻威優(yōu)916 功能葉片的影響,發(fā)現(xiàn)34 個差異表達蛋白質(zhì),其中26個蛋白質(zhì)功能得到鑒定,包括11 個參與光合作用蛋白質(zhì),4 個參與呼吸作用蛋白質(zhì),10 個參與抗氧化及信號蛋白質(zhì)和1 個未知功能蛋白質(zhì)。分析結(jié)果表明,養(yǎng)分脅迫下,水稻葉片光合作用及呼吸作用顯著下降;清除活性氧類蛋白質(zhì)表達量下調(diào),活性氧生產(chǎn)蛋白質(zhì)及脅迫信號傳導(dǎo)蛋白質(zhì)表達量上調(diào),水稻抗性減弱,葉片中活性氧積累,水稻衰老加劇。
邵彩虹等[20]研究了養(yǎng)分脅迫對雜交水稻威優(yōu)916 生育后期根系衰老影響的蛋白質(zhì)組學,獲得了23 個發(fā)生差異表達的蛋白質(zhì),經(jīng)質(zhì)譜分析,17 個蛋白質(zhì)功能得到鑒定,包括2 個呼吸代謝相關(guān)蛋白質(zhì)、7個根系生長發(fā)育相關(guān)蛋白質(zhì)、6 個逆境相關(guān)蛋白質(zhì)及2 個未知功能蛋白質(zhì)。這些差異表達的蛋白質(zhì)為揭示水稻后期根系衰老的分子機理提供理論依據(jù)。
Kim 等[21]對水稻品種BG90-2 在低氮條件下葉片蛋白質(zhì)組學進行了研究,41 個蛋白質(zhì)得到鑒定,其中大部分與光合作用、能量代謝和氧化應(yīng)激反應(yīng)有關(guān),此外還發(fā)現(xiàn)一些參與防御、鐵離子平衡等相關(guān)的蛋白質(zhì)。以上研究表明,在養(yǎng)分脅迫下,水稻中與光合作用、呼吸作用以及與逆境相關(guān)的蛋白質(zhì)的表達量發(fā)生變化,這為研究水稻響應(yīng)養(yǎng)分脅迫的分子機理提供理論依據(jù)。
在作物生產(chǎn)上,重金屬脅迫會導(dǎo)致作物種子萌發(fā)率偏低、株高偏矮、根系偏短、葉綠素含量偏低,從而影響作物的產(chǎn)量[22]。植株感應(yīng)到高濃度的重金屬信號后體內(nèi)各種抗氧化酶的活性受到抑制[23],使植株體內(nèi)產(chǎn)生過量的活性氧自由基,從而發(fā)生一系列生理生化反應(yīng);當重金屬超過一定濃度的時候,還會引起DNA 和蛋白質(zhì)交聯(lián),造成DNA 損傷和蛋白質(zhì)水解[24]。印莉萍等[25]對缺鐵誘導(dǎo)的水稻根蛋白質(zhì)組進行了分析,發(fā)現(xiàn)了23 個差異蛋白質(zhì),其中缺鐵誘導(dǎo)加強的有4 個,減弱的有2 個,特異的有7 個。
肖清鐵等[26]應(yīng)用蛋白質(zhì)組學方法分析了抗鎘品種PI312777 和鎘敏感品種IR24 葉片對鎘脅迫響應(yīng)的蛋白質(zhì)差異表達。結(jié)果顯示,鎘脅迫下PI312777 葉片中共檢測到31 個差異表達蛋白點,其中24個得到質(zhì)譜鑒定;IR24 葉片中共檢測到19 個差異表達蛋白點,其中15 個得到鑒定。此外,在PI312777葉片中熱激蛋白、谷胱甘肽還原酶、蛋白酶體α 亞基6 型、果糖1,6-二磷酸醛縮酶、硫氧還蛋白和DNA重組修復(fù)蛋白均上調(diào)表達;IR24 葉片中熱激蛋白、谷胱甘肽還原酶、蛋白酶體α 亞基6 型的表達無顯著差異,果糖1,6-二磷酸醛縮酶和硫氧還蛋白下調(diào)表達,而DNA 重組修復(fù)蛋白在IR24 葉片中沒有表達。這說明PI312777 比IR24 具有更強的鎘抗性與這些差異表達的蛋白質(zhì)密切相關(guān)。此研究為培育低鎘水稻新品種提供理論依據(jù)。
Zhang 等[27]從蛋白質(zhì)組學方面研究了銅脅迫對水稻發(fā)芽后胚的影響,經(jīng)雙向電泳和質(zhì)譜分析,在銅脅迫下,16 種差異表達蛋白質(zhì)得到鑒定,其中有13 種蛋白質(zhì)表達量上調(diào),包括金屬硫因蛋白、膜相關(guān)蛋白、壁相關(guān)蛋白激酶、病程相關(guān)蛋白以及結(jié)合蛋白Rab2;3 種蛋白質(zhì)表達量下調(diào),包括細胞色素P450、硫氧還蛋白和GTP 酶。在這些差異表達的蛋白質(zhì)中,金屬硫因蛋白和細胞色素P450 是第一次報道與植物響應(yīng)銅脅迫相關(guān)的蛋白質(zhì),這為進一步了解植物抗銅脅迫的分子機理提供了可能。
光脅迫是影響作物光合潛能和產(chǎn)量的重要因素之一,強/弱光脅迫影響光合系統(tǒng),抑制光合潛能,最終導(dǎo)致產(chǎn)量和品質(zhì)下降[28-29]。Yang 等[30]對處于黑暗生長兩周齡水稻幼苗的去黃化過程中蛋白質(zhì)組變化情況進行研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有52 個蛋白質(zhì)點發(fā)生了差異表達,其中51 個得到鑒定,大部分蛋白質(zhì)參與了光合作用、光合碳同化、葉綠素合成、抗氧化和解毒作用。
植株遭遇機械損傷脅迫時(如動物啃食),體內(nèi)能夠產(chǎn)生特異的抗性蛋白以實現(xiàn)自我防御[31]。Shen[32]等首次對水稻葉鞘響應(yīng)機械損傷后的蛋白質(zhì)組進行研究,結(jié)果表明葉鞘受損后抑制鈣網(wǎng)蛋白、組蛋白H1、血紅蛋白和過氧化物酶的表達,而誘導(dǎo)胰蛋白酶抑制劑、蛋白激酶、鈣調(diào)蛋白、核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶小亞基和甘露糖結(jié)合植物凝集素的表達,其中有4 種蛋白質(zhì)被證實與植物機械損傷相關(guān)。
臭氧脅迫影響植物葉片對光能的利用,降低光合速率,減少光合產(chǎn)物[33]。水稻為適應(yīng)臭氧脅迫環(huán)境,調(diào)節(jié)基因表達水平和表達產(chǎn)物,啟動防御保護機制。Sawada 等[34]對3 個水稻品種(Kirara 397、越光、Takanari)的旗葉應(yīng)答臭氧損傷后的蛋白質(zhì)組進行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與光合作用和糖酵解相關(guān)的蛋白質(zhì)在Kirara 397 中表達量下調(diào),而在越光水稻中表達量上調(diào),在Takanari 表達量變化不明顯。這說明3個品種對臭氧的敏感性不一致。
水稻在生長發(fā)育過程中除了受到干旱、高溫、鹽堿等非生物逆境脅迫外,還會受來自到動物、微生物、病菌等生物逆境脅迫,當水稻遭受生物因子侵害時,將通過改變自身體內(nèi)蛋白質(zhì)的表達和活性來完成對這些信號的感應(yīng)、傳遞以及發(fā)生相應(yīng)的生物學效應(yīng)來適應(yīng)外界生物的侵害[35]。
病害嚴重影響水稻的產(chǎn)量,目前,最有效的控病方法就是研究致病機理,培育抗病品種。張曉婷等[36]對水稻感病品種武育粳3 號和抗病品種KT95-418 感染水稻條紋病毒前后的葉片進行蛋白質(zhì)組學分析,結(jié)果顯示,RSV 基因組編碼的病毒特異蛋白在武育粳3 號中的表達量明顯高于KT95-418,此外,與光合作用、細胞氧化還原和離子平衡以及蛋白的合成、轉(zhuǎn)運、翻譯后修飾等相關(guān)蛋白發(fā)生了差異表達。這些差異表達的蛋白質(zhì)可能與水稻抗、感病的作用相關(guān)。
陳賢[37]以抗病品種疣粒野生稻和感病品種日本晴為研究材料,分析了疣粒野生稻懸浮細胞在白葉枯病脅迫24 h 的外分泌蛋白質(zhì)組變化,發(fā)現(xiàn)有25 個蛋白質(zhì)只在疣粒野生稻中合成,它們分別為抗病蛋白、防御蛋白、細胞加固蛋白、活性氧代謝蛋白、多糖代謝蛋白、蛋白修飾蛋白以及參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的蛋白,這些蛋白在疣粒野生稻抗病過程中具有重要作用,該實驗結(jié)果為進一步研究水稻抗白葉枯病機制奠定了基礎(chǔ)。
陳芳育等[38]運用蛋白質(zhì)組學分析高抗水稻品種“佳輻占”受細菌性條斑病病原菌侵染2 d 后的葉片蛋白質(zhì)組變化,發(fā)現(xiàn)有38 個蛋白質(zhì)發(fā)生差異表達,其中33 個蛋白質(zhì)得到鑒定,這些蛋白質(zhì)分別參與了信號識別、信號傳遞、抗氧化、糖代謝、細胞壁加固、植保素合成等抗病生理反應(yīng)。對水稻病害脅迫蛋白質(zhì)進行研究為進一步解釋水稻對病害的抗性機理及相關(guān)抗病基因的克隆提供了依據(jù)。
褐飛虱是水稻主要害蟲之一,受害植株葉子變枯、莖下部變黑腐爛,且被褐飛虱刺破的傷口易發(fā)生菌核病和紋枯病,嚴重影響水稻的產(chǎn)量。Sangha 等[39]使用蛋白質(zhì)組學方法研究了水稻品種IR64 野生型和近等基因突變型被褐飛虱危害的響應(yīng)時發(fā)現(xiàn),在野生型水稻中有65 種蛋白質(zhì)發(fā)生了差異表達,52種蛋白質(zhì)得到質(zhì)譜鑒定。經(jīng)過分析,有22 種蛋白質(zhì)與水稻品種的抗性相關(guān),在易感突變體中10 個蛋白質(zhì)點的表達量發(fā)生了變化,在抗性突變體中有12 個蛋白質(zhì)點發(fā)生了差異表達,這12 個蛋白質(zhì)包括類核糖核酸酶、乙二醛酶Ⅰ、EFTu1 蛋白因子和鹽脅迫根蛋白。其中,類核糖核酸酶在抗性突變體中大量表達,在IR64 中表達量沒有發(fā)生變化,但在易感突變體中表達量下調(diào)。這些在抗性突變體中表達差異的蛋白質(zhì)可以提高對褐飛虱的抗性。
蛋白質(zhì)組學作為一種工具、方法,正越來越廣泛的被研究者們采用,然而由于一些技術(shù)尚未成熟(如無法分離極性pH 值的蛋白質(zhì)、無法檢測到極微量的蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫難以完善等),給研究帶來了困難,所以要繼續(xù)發(fā)展、完善蛋白質(zhì)組學技術(shù),只有等這些技術(shù)得到真正的發(fā)展、成熟,才能為蛋白質(zhì)組學服務(wù),為水稻育種服務(wù)。
差異蛋白質(zhì)組學作為蛋白質(zhì)組學的策略之一,也正廣泛的應(yīng)用于水稻相關(guān)性狀的研究,如水稻的抗逆性、雄性/雌性不育性[40]、種子耐貯藏性[41]等,尤其是對水稻的抗逆性研究較為廣泛。目前,研究者們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)和鑒定了一大批與水稻抗逆性相關(guān)的蛋白質(zhì),并且取得了許多成果,但距完全解析這些蛋白質(zhì)還有很大的距離,因為水稻響應(yīng)逆境脅迫的過程是一個復(fù)雜的信號網(wǎng)絡(luò)體系,涉及到一系列復(fù)雜信號分子傳遞(誘導(dǎo)或者阻遏相關(guān)蛋白質(zhì)合成)、蛋白質(zhì)翻譯后修飾(使蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能更加完善)等,所以水稻抗逆性研究的下一步工作重點將是進行蛋白質(zhì)翻譯后修飾、蛋白質(zhì)與信號分子之間的相互作用等方面的研究[42]。
生物體是由基因、蛋白質(zhì)、RNA、生物小分子等組成的一個與外部環(huán)境密切相關(guān)的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),只有把這個網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)作為一個整體、系統(tǒng)來研究,才能解釋生物體整體的行為。用蛋白質(zhì)組學的方法來研究水稻的抗逆性還遠遠不夠,必須把基因組學、蛋白質(zhì)組學、轉(zhuǎn)錄組學以及代謝組學等學科交叉結(jié)合起來研究,才能真正揭示水稻的抗逆性機理,為水稻的抗逆性育種提供強有力的支撐。
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