李培培 ,謝禮,薛進(jìn),3,羊健,李靜,嚴(yán)成其,張恒木,陳劍平
1.浙江師范大學(xué) 生化學(xué)院,浙江 金華 321000;2.浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 省部共建國家重點實驗室培育基地,農(nóng)業(yè)部植物保護(hù)與生物技術(shù)重點實驗室,浙江省植物病毒重點實驗室,浙江 杭州 310021;3.植物疾病控制與利用湖南省高校重點實驗室,植物病蟲害生物學(xué)與防控湖南省重點實驗室,湖南農(nóng)業(yè)大學(xué),湖南 長沙 410128
肌動蛋白是真核生物中普遍存在的一種結(jié)構(gòu)蛋白,具有高度的保守性[1]。植物肌動蛋白是一種單一的多肽鏈球狀蛋白,由375~377 個氨基酸殘基組成,其相對分子質(zhì)量約為42×103[2]。根據(jù)肌動蛋白等電點的不同,可將其分為3類:α-肌動蛋白主要分布于各種肌肉細(xì)胞中,β-肌動蛋白與γ-肌動蛋白主要分布于肌細(xì)胞和非肌細(xì)胞中。β-肌動蛋白與γ-肌動蛋白是不同類型的細(xì)胞中最為豐富的蛋白質(zhì),一方面在維持和調(diào)節(jié)細(xì)胞基質(zhì)的結(jié)構(gòu)中起關(guān)鍵作用;另一方面,它們還是非肌肉細(xì)胞化學(xué)信號傳導(dǎo)系統(tǒng)的重要組成部分,并與肌動蛋白結(jié)合蛋白共同參與細(xì)胞的各種生理活動,如易位及細(xì)胞形態(tài)的改變[3]。
β-肌動蛋白是主要的細(xì)胞骨架蛋白,在真核細(xì)胞中有至關(guān)重要的作用[4]。該蛋白高度保守,并常被用作“內(nèi)參基因”[5]。β-肌動蛋白以螺旋的方式聚合成肌動蛋白絲(或微絲),構(gòu)成真核細(xì)胞三維網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)骨架,為細(xì)胞提供機械支持并決定細(xì)胞的形態(tài)。此外,β-肌動蛋白還參與許多細(xì)胞生理過程,包括細(xì)胞黏附、細(xì)胞遷移或移動、細(xì)胞分裂、胞質(zhì)分裂、胞吞/胞吐作用、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、mRNA 定位和轉(zhuǎn)錄等[6]。近期的研究表明,β-肌動蛋白可以通過與熱激蛋白90相互作用來調(diào)節(jié)血小板一氧化氮合酶3 的活性[7]。有報道β-肌動蛋白與病毒的增殖和裝配有關(guān),當(dāng)β-肌動蛋白受到細(xì)胞松弛素D(一種肌動蛋白聚合抑制劑)的干擾時,傳染性支氣管炎病毒粒子的裝配和出芽會被阻斷[8]。用肌動蛋白抑制劑處理細(xì)胞時,可以在滲透部位看到細(xì)胞的防御反應(yīng),如細(xì)胞質(zhì)聚集、核運動、形成乳突及過敏性細(xì)胞死亡[9-12]。Song 等[13]的研究表明,肌動蛋白細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu)及肌動蛋白結(jié)合蛋白在由小麥條銹菌引起的小麥條銹病的防御反應(yīng)中有重要作用。
以植物肌動蛋白為主形成的動態(tài)微絲骨架系統(tǒng)已成為植物細(xì)胞生物學(xué)研究領(lǐng)域的熱點之一[9]。有關(guān)植物肌動蛋白基因家族的研究比較透徹的是擬南芥(Arabidopsis thaliana)。擬南芥的肌動蛋白家族包含10 個肌動蛋白基因(actin genes,ACT),其中8個編碼的功能蛋白ACT1/3/4/11/12 與生殖生長相關(guān),ACT2/7/8 與營養(yǎng)生長相關(guān),另外2 個(ACT5與ACT9)有可能是假基因[14]。在水稻中已克隆出很多肌動蛋白基因,但有關(guān)其功能與定位的研究報道還很少。我們克隆了一個水稻β-肌動蛋白基因,并利用膠體金免疫電鏡技術(shù)對β-肌動蛋白在水稻細(xì)胞內(nèi)的分布情況進(jìn)行了詳細(xì)觀察和描述,為進(jìn)一步研究肌動蛋白的功能提供亞細(xì)胞定位的依據(jù),同時也為維管束細(xì)胞學(xué)的研究提供基礎(chǔ)。
日本晴水稻(Oryza sativaL.ssp.japonicacv.Nipponbare)樣品采自浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院試驗大田內(nèi);大腸桿菌Trans1-T1 感受態(tài)細(xì)胞、克隆載體pEASY-T5 Zero Cloning Vector 均購自北京全式金生物技術(shù)有限公司(TransGen Biotech);TRIzol 試劑、SuperScriptⅢReverse Transcriptase 試劑盒均為Invitrogen 公司產(chǎn)品;RNase 抑制劑、dNTP Mix、ExTaqDNA 聚合酶、限制性內(nèi)切酶等購自TaKaRa 公司;凝膠純化試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒均為Promega公司產(chǎn)品;肌動蛋白鼠單抗購自Agrisera 公司,該抗體針對擬南芥肌動蛋白制備,經(jīng)公司驗證其對水稻肌動蛋白呈陽性反應(yīng);膠體金二抗(10 nm 羊抗鼠的IgG 抗體)購自Sigma 公司;克隆肌動蛋白特異引物與oligo-dT 通用引物均由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成;其他生化試劑均為國產(chǎn)分析純以上產(chǎn)品。
用TRIzol 法提取水稻葉片組織的總RNA[15]。采用Invitrogen 公司的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA。取總RNA 2 μg、oligo-dT 1 μL、10 mmol/L dNTP Mix 1 μL,用DEPC 水補足13 μL,65℃變性5 min 后,置冰上至少1 min,隨后加入5×第一鏈緩沖液4.0 μL、0.1 mol/L DTT 1 μL、40 U/μL RNA 酶抑制劑1 μL、SuperscriptⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶1 μL,組成20 μL 體系,42℃反應(yīng)10 min,55℃反應(yīng)1 h,70℃處理15 min,將制備好的cDNA置于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
取cDNA 2 μL、20 μmol/L 上游引物Actin-F(5'-ATGGCTGATTCTGAGGATATTCA-3')與下游引物Actin-R(5'-TTAGAAGCATTTTCTATGTACAAT G-3')各0.6 μL、10×EXTaq緩沖液5 μL、2.5 mmol/L dNTP Mix 4 μL、5 U/μL ExTaqDNA 聚合酶0.5 μL,加ddH2O 補足50 μL 體系,然后運行以下PCR 程序:94℃5 min,94℃30 s,60℃40 s,72℃90 s,35 個循環(huán),循環(huán)結(jié)束后繼續(xù)反應(yīng)10 min。用1%瓊脂糖凝膠電泳(1×TAE 電泳緩沖液、180 V 電壓)檢測PCR擴增產(chǎn)物,并對目的基因片段進(jìn)行切膠回收并純化。將純化的目的基因片段通過T-A克隆的方法連接到pEASY-T5 Zero 克隆載體上,然后轉(zhuǎn)化大腸桿菌Tran1-T1 感受態(tài)細(xì)胞,PCR 篩選陽性克隆,提取質(zhì)粒后進(jìn)行測序分析。
取新鮮水稻葉片,避開葉脈將其切成1 mm×3 mm 的小片,用0.1 mol/L 哌 嗪-1,4-二乙磺 酸(PIPES,pH7.0)配制的4%多聚甲醛于4℃抽真空固定2 h,經(jīng)0.1 mol/L PIPES(pH7.0)緩沖液洗滌3 次后,在4℃條件下依次用30%、50%乙醇脫水,-20℃條件下依次用50%、70%、90%、100%、100%、100%乙醇脫水,-20℃條件下依次用30%、70%的用乙醇配置的K4M 包埋劑各滲透3 h,100%純K4M 包埋劑充分滲透6 h后將樣品浸入K4M 包埋劑,置-20℃冰箱中紫外照射聚合72 h,常溫紫外聚合48 h,得到聚合完畢的包埋塊。將樣品包埋塊在Leica UC6 型切片機上切片,厚度70~90 nm,收集于鎳網(wǎng)上進(jìn)行免疫膠體金標(biāo)記。
將帶有切片的鎳網(wǎng)用BL 封閉液(PBS 緩沖液配置,含1%的BSA、0.02%的PEG20000)于28℃封閉30 min,去離子水漂洗3 次;一抗孵育采用BL 封閉液1∶50 稀釋的肌動蛋白抗體,28℃孵育3 h;去離子水漂洗3 次;二抗孵育采用BL 封閉液1∶100 稀釋的羊抗鼠膠體金(直徑10 nm),28℃孵育2 h;去離子水洗滌3 次,晾干。采用未免疫的血清作為一抗孵育的陰性對照。帶有樣品切片的鎳網(wǎng)經(jīng)醋酸雙氧鈾(C4H6O6U·2H2O)和檸檬酸鉛(C6H5O7Pb)染液雙染色各15 min 后,用H7650 型透射電鏡(日立公司)觀察,加速電壓為80 kV,采用Gatan830 型CCD 相機(美國Gatan公司)照相。
以cDNA 為模板,用特異引物Actin-F/Actin-R進(jìn)行PCR 擴增,瓊脂糖凝膠電泳顯示擴增片段與預(yù)期1134 bp 大小一致(圖1)。將所得片段回收純化后,連接至pEASY-T5 Zero 載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌Trans1-T1,挑取若干單克隆進(jìn)行PCR 擴增鑒定,電泳檢測發(fā)現(xiàn)1~3 號與預(yù)期大小一致為陽性克?。▓D2),對陽性克隆提取質(zhì)粒,測序獲得水稻肌動蛋白基因序列,命名為OsActin。
為了進(jìn)一步研究克隆得到的OsActin與水稻、擬南芥肌動蛋白基因家族的進(jìn)化關(guān)系,在GenBank 數(shù)據(jù)庫中下載了部分?jǐn)M南芥與水稻肌動蛋白的氨基酸序列,利用BioEdit 與MEGA 軟件對其進(jìn)行比對分析并構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖3)。氨基酸序列分析發(fā)現(xiàn),OsActin 與OsRAc1(GenBank 登錄號:X15865)、擬南芥ACT11(GenBank 登錄號:U27981)的同源性分別高達(dá)98%與97%。從圖3 可以看出,OsActin 和擬南芥與生殖生長相關(guān)的肌動蛋白ACT1、ACT3、ACT4、ACT11、ACT12 聚集成簇,推測該基因可能也參與調(diào)節(jié)水稻的生殖生長。
圖1 OsActin目的基因的PCR擴增
圖2 pEASY-T5 Zero-OsActin克隆的PCR鑒定
由于葉肉細(xì)胞等細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)較多,也可能會干擾觀察,因此我們選用液泡較多細(xì)胞質(zhì)較少的維管束薄壁細(xì)胞作為研究對象。利用膠體金免疫電鏡定位技術(shù)對水稻維管束薄壁細(xì)胞(parenchyma cells of vascular bundle)中的肌動蛋白進(jìn)行定位研究,發(fā)現(xiàn)在細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)中均有大量特異性膠體金顆粒標(biāo)記,而在液泡中及細(xì)胞壁上都沒有觀測到特異性膠體金顆粒標(biāo)記(圖4)。
高等植物細(xì)胞都含有一個復(fù)雜的細(xì)胞結(jié)構(gòu)骨架,該結(jié)構(gòu)是由具有高度動態(tài)性和嚴(yán)密調(diào)節(jié)作用的微絲組成的三維網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)。細(xì)胞定位及一些生理生化研究表明肌動蛋白是植物細(xì)胞骨架的基本組成部分,在植物的生長、發(fā)育以及對逆境脅迫的響應(yīng)中起重要作用[16-18]。例如由肌動蛋白與肌球蛋白相互作用組成的肌動球蛋白系統(tǒng)驅(qū)動著細(xì)胞質(zhì)流動,還參與了細(xì)胞的有絲分裂、細(xì)胞器運動、頂端生長、對重力的感應(yīng)、細(xì)胞形狀的控制及葉綠體的流動等。因此,對于肌動蛋白的研究具有重要意義。
圖3 基于水稻與擬南芥肌動蛋白氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹
圖4 肌動蛋白在水稻維管束薄壁細(xì)胞中的定位
在本研究中,我們克隆得到水稻的一個β-肌動蛋白基因,分子進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)該基因編碼的蛋白與水稻OsRAc1 及擬南芥ACT11 的氨基酸同源性分別為98%和97%。擬南芥ACT11 及與其同源的ACT1、ACT3、ACT4 和ACT12 在花粉中均有表達(dá),因此將它們指定為生殖型肌動蛋白。不同的是,ACT11 在幼小組織、花器官原基、新生花蕾、胚珠及成熟的花粉中優(yōu)先表達(dá),并且是惟一在胚乳和胚發(fā)育過程中顯著表達(dá)的肌動蛋白,它在生殖器官中獨特的表達(dá)模式表明,ACT11 對于擬南芥的生殖發(fā)育是必不可少的[19]。OsActin 與擬南芥的ACT11 高度同源,暗示其對水稻的生殖發(fā)育也具有重要的作用。對OsActin的亞細(xì)胞定位研究發(fā)現(xiàn),該蛋白在水稻薄壁細(xì)胞的細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)中均有分布,為進(jìn)一步研究該基因在水稻生長發(fā)育過程中的作用及其超分子結(jié)構(gòu)提供了依據(jù)。
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