戚武林,胡江江,曹玲玲,趙輔昆,張世馥
(浙江理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院蛋白質(zhì)組學(xué)與分子酶學(xué)研究室,浙江杭州310018)
多糖生物合成域1蛋白(polysaccharide biosynthesis domain-containing 1,PBDC1)含有198個(gè)氨基酸,分子質(zhì)量約為22.2 ku。在丁酸鈉(sodium butyrate,SB)[1-2]誘導(dǎo)小鼠紅白血病(murine erythroleukemia,MEL)細(xì)胞[3]分化的差異蛋白質(zhì)組中,發(fā)現(xiàn)了PBDC1蛋白含量在細(xì)胞紅系分化過程中逐漸下調(diào)。由此推測,PBDC1蛋白可能與誘導(dǎo)的MEL細(xì)胞分化有關(guān)。鎳柱親和層析的原理是利用蛋白質(zhì)表面的組氨酸能與Ni2+發(fā)生特殊的相互作用,能夠吸附富含組氨酸的蛋白質(zhì),從而達(dá)到分離純化的目的。本實(shí)驗(yàn)擬通過原核表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)含有6×His標(biāo)簽的PBDC1融合蛋白,通過鎳離子親和柱純化得到PBDC1融合蛋白,并免疫新西蘭大白兔制備其多克隆抗體,為研究PBDC1蛋白在紅系分化中的功能提供有利工具。
大腸桿菌E.coli BL21(DE3)和pET-28a(+)質(zhì)粒(本研究室保存);MEL細(xì)胞(上海生命科學(xué)研究院);DMEM培養(yǎng)基和胎牛血清(Gibco公司);質(zhì)粒提取試劑盒、DNA膠回收試劑盒(Qiagen公司);DNA聚合酶、T4 DNA連接酶、EcoRⅠ和 XhoⅠ(Takara公司);異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)、弗氏完全佐劑與不完全佐劑(Sigma公司);Trizol試劑(Invitrogen公司);反轉(zhuǎn)錄試劑盒(Fermentas公司);鎳離子親和層析介質(zhì)(上海生工生物工程公司);其他試劑均為分析純;引物合成、DNA測序(上海桑尼生物科技有限公司);質(zhì)譜鑒定(本研究室完成);免疫用新西蘭大白兔為普通級,體質(zhì)量約2.5 kg,雄性,來源于浙江省實(shí)驗(yàn)動物中心[合格證號SCXK(浙)2009-0039]。
MEL細(xì)胞在含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基中培養(yǎng)至對數(shù)增殖期,收集細(xì)胞,提取RNA[4],反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA。根據(jù)PBDC1基因序列,設(shè)計(jì)上游引物:5'-CGGAATTCATGGATGCTGCCGGCGA-3'(下劃線部分為EcoRⅠ酶切位點(diǎn)),下游引物:5'-CCGC TCGAGCTACTTTTCTCCTTCTCTGTTGGCTC-3'(下劃線部分為XhoⅠ酶切位點(diǎn))。以cDNA為模板,PCR擴(kuò)增PBDC1基因。PCR反應(yīng)條件為:94℃變性30 s,57 ℃ 退火 30 s,68 ℃ 延伸 1 min,共 30 個(gè)循環(huán);再68℃延伸10 min。瓊脂糖凝膠電泳回收PBDC1基因片段。
將pET-28a(+)質(zhì)粒與PBDC1基因分別用EcoRⅠ/XhoⅠ雙酶切,將回收的基因片段與載體通過T4 DNA連接酶進(jìn)行連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞后篩選克隆,對重組質(zhì)粒進(jìn)行PCR鑒定、EcoRⅠ/XhoⅠ雙酶切鑒定以及測序分析。
將篩選到的含陽性克隆的BL21(DE3)菌株接種到4 mL含50 mg/L Kan的LB培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜;再將培養(yǎng)物按1∶100的比例接種至400 mL含Kan的LB培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)4 h,使培養(yǎng)液的A600值達(dá)到0.5~0.7,加入IPTG至終濃度為1 mmol/L,37℃繼續(xù)振蕩培養(yǎng)4 h,最后離心收集菌體。
將收集得到的菌體重懸于裂解緩沖液(50 mmol/L NaH2PO4,0.3 mol/L NaCl,10 mmol/L 咪 唑,pH 8.0)中,冰浴并超聲波破碎后,離心收集上清,上樣于鎳離子親和層析柱,用洗滌緩沖液(50 mmol/L NaH2PO4,0.3 mol/L NaCl,40 mmol/L 咪 唑,pH 8.0)洗柱,除去非特異結(jié)合的蛋白質(zhì),最后用洗脫緩沖 液 (50 mmol/L NaH2PO4,0.3 mol/L NaCl,100 mmol/L咪唑,pH 8.0)洗脫,收集目的蛋白溶液,并通過SDS-PAGE來檢測純化結(jié)果。
將純化得到的PBDC1蛋白通過脫鹽、濃縮用于免疫兔,首次免疫500μg蛋白,之后每隔7 d加強(qiáng)免疫1次,抗原量減半,頸部皮下多點(diǎn)注射,共加強(qiáng)免疫3次。首次免疫用弗氏完全佐劑乳化,加強(qiáng)免疫用弗氏不完全佐劑乳化。末次免疫7 d后頸動脈取血,收集血清。
用純化的PBDC1蛋白進(jìn)行SDS-PAGE電泳,蛋白電轉(zhuǎn)至PVDF膜,5%脫脂奶粉中室溫封閉2 h,然后用上述制備的多克隆抗體(TBST稀釋,稀釋度為1∶10 000)4℃孵育過夜。TBST洗膜,以辣根過氧化物酶標(biāo)記的羊抗兔IgG室溫孵育2 h,最后用化學(xué)發(fā)光法顯色。
以cDNA為模板,PCR擴(kuò)增出1條600 bp左右的條帶(圖1),與預(yù)期基因片段長度一致。
PCR鑒定和雙酶切鑒定結(jié)果顯示均在約600 bp處可見一條帶,大小與預(yù)期相符(圖2),經(jīng)DNA測序證明序列完全正確。陽性克隆命名為BL21/pET-28a(+)-PBDC1。
圖2 重組質(zhì)粒的PCR鑒定及雙酶切鑒定Fig 2 Identification of recombinant plasmid by PCR and enzyme digestion
BL21/pET-28a(+)-PBDC1經(jīng)IPTG誘導(dǎo),在約27 ku處存在大量表達(dá)的蛋白,與預(yù)期大小相符。PBDC1蛋白在大腸埃希菌中為可溶性表達(dá)(圖3)。
純化得到的PBDC1融合蛋白純度較高,其相對分子質(zhì)量約為27 ku(圖4),進(jìn)一步通過質(zhì)譜鑒定證實(shí)該蛋白確實(shí)是PBDC1蛋白。
Western blot結(jié)果表明在25 ku和35 ku之間存在特異性條帶,表明制備得到的抗PBDC1蛋白的抗體能與PBDC1蛋白發(fā)生免疫印跡反應(yīng)(圖5)。
圖3 PBDC1蛋白的融合表達(dá)及可溶性分析Fig 3 Expression of PBDC1 fusion protein and its soluble analysis
圖4 SDS-PAGE檢測純化的PBDC1融合蛋白Fig 4 Identification of purified PBDC1 fusion protein by SDS-PAGE
圖5 多克隆抗體的Western blot鑒定Fig 5 Identification of polyclonal antibody by Western blot
PBDC1是一個(gè)新發(fā)現(xiàn)的蛋白。目前,有關(guān)它的特性及功能尚不了解。在丁酸鈉誘導(dǎo)MEL細(xì)胞紅系分化的差異蛋白質(zhì)組中,發(fā)現(xiàn)PBDC1蛋白含量在細(xì)胞分化過程中逐漸下調(diào)。由此推測PBDC1蛋白參與了紅系分化過程,可能是紅系分化的一個(gè)潛在的調(diào)控因子。然而,目前還沒有商品化的PBDC1抗體。為了研究它在MEL細(xì)胞分化中的功能,本研究擬將PBDC1基因片段插入pET-28a(+)載體,轉(zhuǎn)入大腸埃希菌BL21(DE3)經(jīng)IPTG誘導(dǎo),表達(dá)出大量、可溶的PBDC1融合蛋白。通過鎳離子親和層析柱分離純化得到含His標(biāo)簽的重組蛋白。PBDC1蛋白免疫新西蘭大白兔制備了抗PBDC1蛋白的多克隆抗體,為后續(xù)深入研究相關(guān)蛋白功能提供實(shí)驗(yàn)材料。
[1]Santini V,Gozzini A,Scappini B,et al.Searching for the magic bullet against cancer:the butyrate saga[J].Leuk Lymphoma,2001,42:275 -289.
[2]Grebenova D,Kuzelova K,Pluskalova M,et al.The proteomic study of sodium butyrate antiproliferative/cytodifferentiation effects on K562 cells[J].Blood Cells Mol Dis,2006,37:210-217.
[3]Friend C.Leukemia of adult mice caused by a transmissible agent[J].Ann N Y Acad Sci,1957,68:522 -532.
[4]J.薩姆布魯克,D.W.拉塞爾.分子克隆實(shí)驗(yàn)指南[M].3版,北京:科學(xué)出版社,2002:518-522.