張娟層 趙 陽 劉永康
(1太原市公安局刑偵支隊 山西 太原 030000;2沈陽市公安局皇姑分局 遼寧 沈陽 110036)
山西太原地區(qū)漢族人群20個S T R基因座遺傳多態(tài)性調(diào)查
張娟層1趙 陽2劉永康1
(1太原市公安局刑偵支隊 山西 太原 030000;2沈陽市公安局皇姑分局 遼寧 沈陽 110036)
應用Power Plex21 System擴增體系對952例山西太原地區(qū)漢族人群20個S T R基因座進行基因分型檢測,以期獲得更為客觀的基礎數(shù)據(jù),為法醫(yī)學應用提供參考。
漢族STR遺傳多態(tài)性 山西
1.1 樣本
952例山西太原地區(qū)漢族人群健康無關個體濾紙血痕(男性768例,女性184例),均來自實驗室日常積累。
1.2 復合擴增及產(chǎn)物檢測
用BSD600-DUET打孔機(BSD Robotics公司,澳大利亞)按直徑1.2mm取樣,按照Power Plex21System試劑盒說明書,采用10μL擴增體系在9700型擴增儀(美國AB公司)上進行擴增,9947A和ddH2O分別作為陽性對照和陰性對照,擴增產(chǎn)物應用美國ABI3500XL型遺傳分析儀進行檢測,利用GeneMapperIDX1.3軟件進行數(shù)據(jù)分析。
1.3 統(tǒng)計分析
按文獻方法[1]應用Modified-Powerstates軟件計算期望值雜合度(He)、非父排除率(PE)、匹配概率(Pm)、個人識別能力(DP)、多態(tài)性信息量(PIC)及累計個體識別率、累計非父排除率,并用精確檢驗法[2-3]進行Hardy-Weinberg平衡檢驗。
用χ2檢驗的方法驗證群體采樣的可靠性,并用PowerStats分析軟件處理本實驗數(shù)據(jù),得到20個STR基因座的各遺傳學指標。
本實驗樣本的20個STR基因座等位基因頻率分布如表1所示。各檢測指標均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。20個STR基因座分別得到了7~25個等位基因,19~114個基因分型,等位基因頻率介于0.0005~0.5320之間。
本實驗的各遺傳學指標如表2所示。按照參照文獻[4]的計算方法得到20個STR基因座的累計非父排除率(CPE)及累計個體識別率(TDP)分別可達到0.999999996和0.99999999999999999999999899。
隨著我國人口基數(shù)的增加,司法實踐中對基礎數(shù)據(jù)的基因座數(shù)目及其遺傳多態(tài)性的要求越來越高。我們有必要對現(xiàn)有資源進行最大限度的更新。本次調(diào)查通過對952例無血緣關系的太原漢族群體進行了20個STR基因座的遺傳多態(tài)性檢驗,共檢出248個等位基因和1025個基因型。經(jīng)χ2檢驗,結(jié)果20個基因座均P>0.05,證明基因型分布符合Hard-Weinberg平衡定律。同時,本實驗彌補了太原地區(qū)漢族人群常染色體STR基因座基本信息的空白,并且較大的樣本數(shù)量能夠客觀反映本地區(qū)漢族人群的基因特點。
通過對本次調(diào)查的20個STR基因座多態(tài)性統(tǒng)計分析,太原地區(qū)漢族群體累計個體識別率為0.99999999999999999999999899,累計非父排除率為0.999999996,遠高于以往其他地區(qū)關于漢族人群STR基因座數(shù)據(jù)的文獻報道,[5]說明這20個STR基因座聯(lián)合應用具有高識別能力,對太原漢族群體有較高的法醫(yī)學應用價值。本文所統(tǒng)計的數(shù)據(jù)可用于太原漢族群體的親子鑒定和個體識別及遺傳學分析。
本次調(diào)查客觀反映出太原地區(qū)漢族人群具有更多的遺傳多態(tài)性,在個體識別和親緣鑒定中應用價值更高;實驗結(jié)果表明,群體遺傳學基礎數(shù)據(jù)的調(diào)查應當盡量加大樣本量,以獲得該群體中盡可能全的等位基因分型,為實際應用提供更加準確、全面的數(shù)據(jù)。
本次檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn)少量稀有基因,科學地展現(xiàn)出某些基因座具有更強的地區(qū)多態(tài)性,豐富了DNA技術研究科學數(shù)據(jù)。
表1 太原地區(qū)漢族人群PowerPlex21System試劑盒20個STR基因座等位基因頻率(n=945)
表2 太原地區(qū)漢族群體PowerPlex21System試劑盒20個STR基因座的各遺傳學指標(n=945)
[1]趙方,伍新堯,蔡貴慶,等.Mo d i f i e d-P o w e r s t a t e s軟件在法醫(yī)生物統(tǒng)計中的應用[J].中國法醫(yī)學雜志,2003,18(5):297-298.
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(責任編輯:于 萍)
DF795.2
A
2095-7939(2015)04-0072-02
20105-09-08
張娟層(1973-),女,山西太原人,山西省太原市公安局刑偵支隊主檢法醫(yī)師,學士,主要從事法醫(yī)物證與法醫(yī)臨床檢驗研究。