王霞,楊健,楊文林,熊春萍(廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院,廣州500;廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院)
dlx基因在中國首例ADULT綜合征患者發(fā)病中的作用
王霞1,楊健2,楊文林2,熊春萍1
(1廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院,廣州510120;2廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院)
摘要:目的探討dlx基因與ADULT綜合征發(fā)生的關(guān)系。方法對(duì)中國首例ADULT綜合征患者及其4代家系共17例成員的dlx基因家族進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測序,觀察ADULT綜合征家系中dlx基因家族成員的遺傳學(xué)改變。結(jié)果在患者及其父系家族5例成員(包括患者父親)的dlx3基因第2內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)1個(gè)相同的單核苷酸多態(tài)性(cSNP)位點(diǎn)cSNP(A/G) rs760088,而母系家族成員未發(fā)現(xiàn)cSNP(A/G) rs760088,父系cSNP(A/G) rs760088發(fā)生率高于母系(P=0.034)。結(jié)論ADULT綜合征的發(fā)病可能與dlx3基因有關(guān),而且患者與其父系家族成員可能存在更多的遺傳相關(guān)性。
關(guān)鍵詞:遺傳性疾病,先天性; ADULT綜合征; dlx基因;單核苷酸多態(tài)性
ADULT綜合征是一種典型的外胚層發(fā)育異常綜合征,屬于常染色體顯性遺傳[1,2]。2010年我們發(fā)現(xiàn)了國內(nèi)首例ADULT綜合征家系,并觀察到ADULT綜合征患者p63基因的第8外顯子發(fā)生了錯(cuò)義突變(R298Q)[3~6]。ADULT綜合征的臨床表現(xiàn)有四肢發(fā)育畸形、神經(jīng)性皮炎改變(包括指趾剝脫性皮炎)、皮膚干燥、乳腺和乳頭發(fā)育不全或缺失、缺指(趾)畸形和并指癥、指(趾)甲發(fā)育異常、淚管閉鎖、少汗、牙齒發(fā)育不全等癥狀。由于p63基因在胚胎發(fā)育(特別是在四肢和其他外胚層衍生器官的發(fā)育)中起著重要作用。近年來研究發(fā)現(xiàn),dlx基因家族和p63基因在調(diào)控外胚層發(fā)育中可能歸屬于相同的信號(hào)傳導(dǎo)通路。dlx基因家族包括6個(gè)成員,并分為3組(dlx1/dlx2、dlx3/dlx4、dlx5/dlx6),該基因家族在哺乳動(dòng)物的外胚層(包括表皮、肢體、生殖器、腮腺、牙齒和毛發(fā)等)發(fā)育、神經(jīng)發(fā)育、紅細(xì)胞的生成及胎盤的發(fā)育中都起著重要的作用。新的研究證實(shí)p63基因的異構(gòu)體TAp63調(diào)控dlx基因家族中的dlx3基因的表達(dá)。ΔNp63轉(zhuǎn)錄調(diào)控dlx5/dlx6基因,而p63基因的錯(cuò)義突變與dlx5/dlx6部分功能的缺失可導(dǎo)致嚴(yán)重的肢體發(fā)育畸形[9]。以上研究提示p63可能通過調(diào)控dlx基因的表達(dá)在外胚層發(fā)育不良中發(fā)揮重要作用[7~9]。2011年11月~2013年6月,我們?cè)谇捌谘芯康幕A(chǔ)上,進(jìn)一步探討我國首例ADULT綜合征家系中dlx基因的遺傳學(xué)改變及dlx基因與ADULT綜合征發(fā)生的關(guān)系。
1.1臨床資料以中國首例ADULT綜合征患者及其4代家系(見圖1)成員共17例為觀察組,男10例、女7例,年齡18~72歲,中位年齡36歲。ADULT綜合征患者為女性,29歲。主要臨床表現(xiàn):毛發(fā)稀少,唇系帶和舌下系帶發(fā)育不良,右手并指,顏面部大量雀斑,少汗,汗毛稀少,溢淚,左眼淚道閉鎖、右眼淚道狹窄,牙齒發(fā)育不全;符合ADULT綜合征的臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)[10]?;颊呒捌涔霉?、姐姐乳腺和乳頭發(fā)育不良,患者及其父系家族成員軀干部位長有散在小片萎縮斑,男性較明顯。患者母系家族成員未發(fā)現(xiàn)與ADULT綜合征相關(guān)的體征。另取正常人30例為對(duì)照組,男14例、女36例,年齡16~75歲,中位年齡41.5歲;個(gè)體之間無血緣關(guān)系。各研究對(duì)象及其家屬對(duì)本研究均知情同意。
1.2dlx基因檢測檢測材料包括人外周血DNA提取試劑盒(MACHEREY-NAGEL,Germany)、PCR擴(kuò)增試劑(Promega,USA)、引物序列設(shè)計(jì)(PrimerPrimer5.0)、引物合成(上海生工生物工程技術(shù)有限公司)、瓊脂糖(GENE,USA)、6×Loading Buffer(寶生物工程有限公司)、溴化乙錠(儲(chǔ)存液10 mg/mL、工作液0.5 mg/mL,廣州威佳生物技術(shù)公司)、DNA Marker(2 000 bp,寶生物工程有限公司)、SYBR Green熒光染料等(GENE,USA)、PCR產(chǎn)物回收純化試劑盒及質(zhì)粒抽提試劑盒(QIAGEN,Germany)。具體檢測方法如下:①人外周血DNA的提取:采用人外周血DNA提取試劑盒,嚴(yán)格按照說明書操作。提取的DNA分裝5個(gè)1.5 mL EP管,-20℃保存。②引物設(shè)計(jì):根據(jù)Zhou等[11]方法原理,應(yīng)用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)引物并委托上海英駿生物技術(shù)有限公司合成。dlx3基因引物序列:第1外顯子的上游引物為: 3'-ACGGTGAACCCCTACACCTA-5',下游引物為: 3'-TCTTGGGCTTCCCATTCACC-5';第2外顯子的上游引物為: 3'-TCCTTCGATCGCAAGCTCAG-5',下游引物為: 3'-TGGTGGTAGGTGTAGGGGTT-5';第3外顯子的上游引物為: 3'-TACCTACGGAGCCTCCTACC-5',下游引物為: 3'-ACTCAGGTTCTGTGCGTGAT-5'。③PCR擴(kuò)增:取人外周血DNA 95℃變性5 min,95℃30 s,根據(jù)1~3外顯子選擇不同退火溫度,30 s,72℃1 min,35個(gè)循環(huán);延伸72℃5 min,擴(kuò)增產(chǎn)物4℃保存。④PCR產(chǎn)物電泳、判定:取瓊脂糖0.6 g加入40 mL 0.5×TBE液中,微波爐加熱2 min,冷卻至50℃左右,加入1.5% EB液1.5 mL,膠倒置膠槽中。分別取PCR產(chǎn)物5 μL、6×Loading Buffer 0.5 μL,混勻,加樣于1.5%瓊脂糖凝膠的加樣孔中。室溫下恒壓(120 V)電泳30 min。然后置于紫外反射投影儀上檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。在紫外線燈下切取PCR目的條帶裝入1.5 mL EP管;每10 mg膠加入10 μL Membrance Binding Solution混勻,水浴50~65℃,使膠完全融化,其間不?;靹?收集管插入SV柱,把樣品加到SV柱上,室溫1 min;16 000 g離心1 min,倒掉收集管剩余液體;加入700 μL Membrance Wash Solution,16 000 g離心1 min,倒掉收集管中液體;加入500 μL Membrance Wash Solution,16 000 g離心5 min;倒掉收集管中液體,離心1 min;把SV柱放入1.5 mL EP管內(nèi); 在SV柱中央加入50 μL Nuclease-Free Water,室溫1 min,16 000 g離心1 min;回收產(chǎn)物,-20℃保存。確認(rèn)目的片段后,將切膠回收,PCR產(chǎn)物送往英駿生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測序,分析突變位點(diǎn)。
1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法采用SPSS19.0統(tǒng)計(jì)軟件。父系與母系之間單核苷酸多態(tài)性(cSNP)位點(diǎn)發(fā)生率比較采用χ2檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
觀察組中患者及其父系家族5例成員(Ⅱ: 1,3,4,Ⅲ: 8,11)的dlx3基因第2內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)1個(gè)相同的cSNP位點(diǎn)cSNP(A/G) rs760088,而母系成員未發(fā)現(xiàn)該cSNP(A/G) rs760088;父系家族與母系家族cSNP(A/G) rs760088發(fā)生率比較有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.034)。對(duì)照組中未發(fā)現(xiàn)該cSNP (A/G) rs760088。兩組rs760088測序見圖2。
ADULT綜合征由Propping等[2]在1993年首次報(bào)告并命名,其主要臨床表現(xiàn)有四肢發(fā)育畸形、神經(jīng)性皮炎改變(包括指趾剝脫性皮炎)、皮膚干燥、乳腺和乳頭發(fā)育不全或缺失、缺指(趾)畸形和并指癥、指(趾)甲發(fā)育異常、淚管閉鎖、少汗、牙齒發(fā)育不全等癥狀[5]。p63基因在胚胎發(fā)育(特別是在四肢和其他外胚層衍生器官的發(fā)育)中起重要作用[6]。dlx基因家族包括6個(gè)成員,并分為3組(dlx1/dlx2、dlx3/dlx4、dlx5/dlx6),該基因家族在哺乳動(dòng)物的外胚層(包括表皮、肢體、生殖器、腮腺、牙齒和毛發(fā)等)發(fā)育、神經(jīng)發(fā)育、紅細(xì)胞生成及胎盤發(fā)育中都起著重要作用[7]。研究證實(shí)p63基因的異構(gòu)體TAp63調(diào)控dlx基因家族中dlx3基因表達(dá)[8]。ΔNp63轉(zhuǎn)錄調(diào)控dlx5/dlx6基因,而p63基因的錯(cuò)義突變與dlx5/dlx6部分功能的缺失可導(dǎo)致嚴(yán)重的肢體發(fā)育畸形[9]。dlx基因家族是一類重要的調(diào)控外胚間充質(zhì)細(xì)胞分化的轉(zhuǎn)錄因子,具有決定細(xì)胞命運(yùn),維持組織發(fā)育的功能[12]。dlx基因在各種發(fā)育位置均有表達(dá),特別是在上皮間充質(zhì)細(xì)胞相互作用的區(qū)域(鰓弓、胚芽、前腦、聽囊、嗅囊、牙、毛囊)。Fujimoto等[13]發(fā)現(xiàn)dlx3基因、p63基因與外胚層發(fā)育不良有直接的相關(guān)性。尤其是毛囊、牙齒、表皮等的發(fā)育與dlx3基因關(guān)系更為密切。
在基因組DNA中,任何堿基均有可能發(fā)生變異,因此SNP既有可能在基因序列內(nèi),也有可能在基因以外的非編碼序列上。總的來說,位于編碼區(qū)內(nèi)的cSNP比較少,其變異率僅為周圍序列的1/5,在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義,因此cSNP的研究更受關(guān)注[14]。大多數(shù)疾病屬于由遺傳因素與環(huán)境因素共同作用所致的復(fù)雜疾病。SNP在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)方面,不僅可用于尋找致病基因,還可用于診斷疾病,尤其是單基因遺傳病[15]。尋找和研究SNP已成為人類基因組計(jì)劃的主要內(nèi)容和目標(biāo)。發(fā)現(xiàn)這些與常見疾病相關(guān)的DNA序列上的多態(tài)位點(diǎn),是了解引起人類疾病復(fù)雜原因最重要的途徑之一。
本研究DNA產(chǎn)物測序分析結(jié)果顯示患者及其父系家族5名成員的dlx3基因第2內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)1個(gè)cSNP(A/G) rs760088,而母系成員未發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)。因此認(rèn)為該例ADULT綜合征患者的發(fā)病與父系家族有更多的遺傳學(xué)相關(guān)性。
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(收稿日期2014-12-25)
基金項(xiàng)目:廣州醫(yī)科大學(xué)科研基金課題(2011A10)。
文章編號(hào):1002-266X(2015)21-0032-03
文獻(xiàn)標(biāo)志碼:B
中圖分類號(hào):R596
doi:10.3969/j.issn.1002-266X.2015.21.012