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基因語(yǔ)言多了兩個(gè)字母

2015-04-28 04:48岑少宇
中學(xué)科技 2015年1期
關(guān)鍵詞:候選者堿基字母

岑少宇

地球上的生命雖然千差萬(wàn)別,但歸根結(jié)底都是由基因(DNA)書(shū)寫(xiě)出來(lái)的。別看基因這門(mén)“語(yǔ)言”用處這么大,其實(shí)只有4個(gè)“字母”,即A、T、C、G四種堿基。幾十億年來(lái),似乎還沒(méi)有什么生物對(duì)這套語(yǔ)言提出“異議”,但人類顯然有自己的想法——2014年5月,科學(xué)家真的造出了新“字母”,更奇妙的是,它們還與原來(lái)的“語(yǔ)言”部分兼容,能在活細(xì)胞中復(fù)制。只靠四種堿基就能創(chuàng)造出如此斑斕的生物世界,新堿基將帶給我們無(wú)窮的想象空間。

怎樣的“字母”才算新

早在20世紀(jì)60年代,已經(jīng)有科學(xué)家在思考:生命能否用其他“字母”書(shū)寫(xiě)?如果能夠創(chuàng)造出新的基因“字母”,能否創(chuàng)造新的生命形式?但直到1989年,人類才獲得實(shí)質(zhì)性突破。瑞士聯(lián)邦技術(shù)中心的斯蒂芬·本納將特殊形式的C和G堿基(iso-C、iso-G)加入DNA。這些堿基被研究者稱為“滑稽字母”,但結(jié)果毫不滑稽,相當(dāng)振奮人心——它們?cè)谠嚬苤心茏晕覐?fù)制,并能轉(zhuǎn)錄成RNA,合成蛋白質(zhì)。

不過(guò),這些“滑稽字母”畢竟還只是像“普通字母”一樣發(fā)揮作用,長(zhǎng)得也差不多,就像寫(xiě)T時(shí)出個(gè)頭,寫(xiě)G時(shí)在豎筆上加道短橫,離科學(xué)家夢(mèng)寐以求的全新“字母”還差得很遠(yuǎn)。

近些年,還有不少關(guān)于基因新“字母”的報(bào)道。有的確實(shí)是人工合成的新堿基,但和原有的語(yǔ)言系統(tǒng)不兼容,壓根兒不能復(fù)制,毫無(wú)作用。有的則是生物體內(nèi)天然存在的,從“普通”堿基修飾而來(lái),類似“滑稽字母”,從嚴(yán)格意義上講,都不是真正的“新堿基”。

這怎么能讓科學(xué)家們滿足呢?美國(guó)斯克利普斯研究所的化學(xué)家弗洛伊德·羅姆斯伯格暗自立下目標(biāo):一定要制造能在原有系統(tǒng)中發(fā)揮作用的、全新的堿基。“如果英語(yǔ)只有四個(gè)字母,也許你有三個(gè)輔音和一個(gè)元音,也許可以寫(xiě)幾個(gè)詞,用它講幾個(gè)粗糙的故事。但如果多幾個(gè)字母,你就能寫(xiě)更多東西,儲(chǔ)存更多的信息,就能寫(xiě)更有意思的詞,更大的詞,更復(fù)雜的詞,更微妙的詞,更好的故事?!彼f(shuō),“如果我們給生命以使用更多字母的能力,我們對(duì)它的理解會(huì)深入很多?!?/p>

15年的“笨功夫”

羅姆斯伯格一干就是15年。他和同事所用的方法也很簡(jiǎn)單,就是先根據(jù)現(xiàn)有堿基的樣子,合成候選的新“字母”,然后再根據(jù)各種條件篩選??茖W(xué)家們合成的300個(gè)候選者中,有些是堿基,有些甚至連堿基都不是,只是在結(jié)構(gòu)上相似。

篩選的第一步,是測(cè)試這些新“字母”能否在舊系統(tǒng)里發(fā)揮作用。具體來(lái)說(shuō),基因“語(yǔ)言”系統(tǒng)的一個(gè)基本功能就是“抄寫(xiě)”——生命的遺傳離不開(kāi)DNA的復(fù)制,有專門(mén)的蛋白質(zhì)(DNA聚合酶)負(fù)責(zé)“抄寫(xiě)”工作??茖W(xué)家們?cè)诖蠹s300個(gè)候選者中,篩選出了60種能被DNA聚合酶識(shí)別的新“字母”。

篩選的第二步,是要看新“字母”之間能否配對(duì)。A與T、C與G的配對(duì)是DNA堿基的重要特性,在“抄寫(xiě)”基因時(shí),正是利用了這一點(diǎn)。DNA具有雙鏈結(jié)構(gòu),“抄寫(xiě)”時(shí)把它一分為二,一條上如果有A,另一條上對(duì)應(yīng)的位置必定是T,這樣我們就有兩條字母不同,但一一對(duì)應(yīng)、表達(dá)的意思完全相同的DNA單鏈。只要再根據(jù)配對(duì)原則“抄”一遍,就能把兩條單鏈補(bǔ)充為兩條完整的DNA。

60個(gè)候選者過(guò)了第一關(guān),它們彼此之間(包括與自己)能形成3600種可能的配對(duì)組合。科學(xué)家通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬和實(shí)際試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)被稱為d5SICS和dNaM的候選者很有希望,將其命名為X和Y。

更大的挑戰(zhàn)在于“體內(nèi)實(shí)驗(yàn)”,如果不能把帶有新“字母”的DNA送進(jìn)現(xiàn)有生物體內(nèi),并讓其穩(wěn)定存在,那么這項(xiàng)研究的意義就會(huì)大打折扣。科學(xué)家先在移植目標(biāo)大腸桿菌上安插“臥底”——某種微藻蛋白,有了它,新DNA就能暢通無(wú)阻地進(jìn)入大腸桿菌體內(nèi)。

含有一對(duì)新“字母”的DNA順利進(jìn)入大腸桿菌后,科學(xué)家開(kāi)始給它們喂含有新“字母”的堿基大餐,當(dāng)大腸桿菌成長(zhǎng)并復(fù)制時(shí),新堿基也跟著DNA一起復(fù)制。數(shù)據(jù)顯示,新堿基至少?gòu)?fù)制了24輪,并維持了近一周時(shí)間。當(dāng)新堿基斷糧后,大腸桿菌便用天然堿基替代了它們。

這顯示新技術(shù)具有極高的安全性。即使有細(xì)菌逃逸到自然環(huán)境中,因?yàn)闆](méi)有新堿基“食物”,所以注定死去或改用天然堿基。

科學(xué)家的一小步,人類的一大步

科學(xué)家研究新堿基并非只是為了興趣和對(duì)生命的理解,也是為了“懸壺濟(jì)世”——新藥不會(huì)從天上掉下來(lái)。新堿基的引入可以修飾生物的DNA,再利用這些生物的“肉體”,合成自然界沒(méi)有而人工方法又不易合成、提純的藥品。

開(kāi)發(fā)新“字母”的斯克利普斯研究所已經(jīng)成立了一家公司,嘗試用這一新技術(shù)研發(fā)新的抗生素、疫苗和其他產(chǎn)品。不過(guò),距離實(shí)際應(yīng)用還有相當(dāng)?shù)木嚯x,畢竟DNA復(fù)制只是第一步,還要能被“翻譯”系統(tǒng)識(shí)別,合成蛋白質(zhì),這仍是巨大的難題。

新堿基還可能提升DNA計(jì)算機(jī)的性能。科學(xué)家一直希望利用DNA的特殊性質(zhì)制造DNA儲(chǔ)存器或計(jì)算機(jī)。新增加兩個(gè)字母,DNA計(jì)算機(jī)就有望從4進(jìn)制升格為6進(jìn)制,存儲(chǔ)能力和運(yùn)算能力將得到空前提升。不過(guò),DNA計(jì)算機(jī)本身仍是個(gè)“傳說(shuō)”,相對(duì)于現(xiàn)有計(jì)算機(jī)而言,可能存在讀寫(xiě)速度慢、穩(wěn)定性差等問(wèn)題。

雖然上述應(yīng)用的前景并不明朗,但科學(xué)家的新研究仍具有非凡意義,幾十億年未發(fā)生什么改變的生命系統(tǒng)出現(xiàn)了新變化,人類由此翻開(kāi)了進(jìn)化史的新一頁(yè)。

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