聶利珍,于肖夏,李國婧,鞠天華,孫瑞芬,崔闊澍,于 卓*
(1 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學,呼和浩特010019;2 赤峰天澤生物科技有限公司,內(nèi)蒙古赤峰025457;3 內(nèi)蒙古農(nóng)牧業(yè)科學院 生物技術(shù)研究中心,呼和浩特010031)
馬鈴薯(Solanumtuberosum)是一種糧、菜及工業(yè)原料等多種用途的經(jīng)濟作物,是世界上僅次于小麥、水稻、玉米的四大糧食作物之一。內(nèi)蒙古是中國馬鈴薯的種薯和商品薯重要產(chǎn)地之一[1],但干旱缺水一直是馬鈴薯生產(chǎn)的主要限制因子,特別是內(nèi)蒙古中西部地區(qū)幾乎連年干旱,使得馬鈴薯產(chǎn)量低下,嚴重影響著當?shù)剞r(nóng)民的經(jīng)濟收入。因此培育抗旱、高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)的馬鈴薯新品種實屬必要。利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)開展農(nóng)作物育種是農(nóng)業(yè)科技的發(fā)展方向和必然趨勢[2]。國外Yeo等[3]從酵母中克隆出海藻糖-6-磷酸合成酶基因(TPSI),通過農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)入馬鈴薯中,獲得的轉(zhuǎn)基因馬鈴薯抗旱能力明顯提高。國內(nèi)姜麗麗等[4]將來自耐旱物種厚葉旋蒴苣苔(Boeacrassifolfia)的藍銅蛋白類似基因BcBCPI導入馬鈴薯,經(jīng)干旱處理后發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因馬鈴薯植株的抗旱能力顯著提高;張寧[5]從菠菜中克隆甜菜堿醛脫氫酶(BADH)基因,轉(zhuǎn)化馬鈴薯獲得了轉(zhuǎn)基因植株,對其進行干旱和NaCl脅迫處理研究顯示,轉(zhuǎn)基因馬鈴薯的抗旱耐鹽能力均顯著提高。
CDPKs(calcium-dependent protein kinases,也稱CPKs)是一類依賴鈣離子而不依賴鈣調(diào)素的蛋白激酶,其廣泛存在于植物、藻類和部分原生生物中[6-8]。在植物體內(nèi)CDPKs是主要的初級鈣離子感受器之一,并受生物和非生物脅迫誘導激活,在植物參與非生物脅迫反應、光周期調(diào)節(jié)和激素信號轉(zhuǎn)導中具有非常重要的作用[9]。CDPKs首先在豌豆中發(fā)現(xiàn)[10],它與細胞Ca2+信號傳遞有密切關(guān)系,是植物中研究較多、了解較清楚的一類蛋白激酶。Sheen等[11]利用效應基因和報告基因共表達的方法,研究發(fā)現(xiàn)在玉米原生質(zhì)體中轉(zhuǎn)化AtCDPK1和AtCDPK1a能激活受干旱和高鹽脅迫誘導的啟動子,去除AtCDPK1激酶區(qū)的突變體對干旱和鹽脅迫以及ABA 刺激沒有反應;過表達AtCDPK1 的擬南芥在低溫、高鹽和ABA 脅迫下,其耐受能力明顯比野生型強[12];擬南芥T-DNA 插入突變體cdpk1對干旱脅迫比野生型擬南芥敏感,過表達AtCDPK1擬南芥可提高其對干旱脅迫的耐受能力[13]。從冰葉日中(Mesembryanrhemumcrystallinum)花中分離得到的McCPK1能響應鹽害和脫水的脅迫作用[14]。AtCPK23敲除突變體提高了對干旱和鹽脅迫的耐受性,而過表達AtCPK23 的擬南芥對干旱和鹽脅迫更敏感[15]。這些結(jié)果都證實CDPKs參與了逆境信息的傳遞。
本試驗擬從擬南芥中克隆抗旱基因AtCD-PK1,構(gòu)建植物表達載體pCHF3-CDPK,并利用農(nóng)桿菌介導法將AtCDPK1基因?qū)肽壳皟?nèi)蒙古地區(qū)種植較多的抗旱性較弱的馬鈴薯品種‘費烏瑞它’(Favorita)基因組,通過PCR 檢測AtCDPK1基因在馬鈴薯的基因組中的整合情況,并用RT-PCR 檢測AtCDPK1在馬鈴薯中的表達情況,旨在為選育抗旱性強的轉(zhuǎn)基因馬鈴薯新品種奠定基礎(chǔ)。
轉(zhuǎn)基因受體材料為馬鈴薯品種‘費烏瑞它’(Favorita),由本課題提供。野生型擬南芥(Arabidopsisthaliana)Columbia 生 態(tài) 型(Col-0)種 子 及pCHF3植物表達載體由內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學李國婧教授饋贈。農(nóng)桿菌LBA4404由本課題組保存。
將馬鈴薯無菌苗在無菌條件下剪成1.5cm 小段,每節(jié)莖段帶1~2個腋芽,接種于MS培養(yǎng)基,在光強2 000勒克斯(lx)、光照時間16h/d、溫度(22±2)℃條件下進行擴繁培養(yǎng)。無菌苗生長約14d時,在無菌條件下加入微型薯誘導培養(yǎng)基(MS液體培養(yǎng)基+8%蔗糖+4.0 mg/L 6-BA+0.02 mg/L NAA+500mg/L CCC),使其在黑暗條件下生長,大約30d左右長出微型薯。
根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中At1g18890基因序列,利用Primer 3和VectorNTI 11.0軟件,設(shè)計帶有KpnⅠ與XbaⅠ雙酶切位點的特異性引物CDPK1-P5(GAACCCGGGATGGGTAACTGTAACGCCTG)和CDPK1-P3(GCCTCTAGATTAAACAGGAACAGTTTGTC);以野生型擬南芥基因組DNA 為模板進行PCR 擴增,擴增片段總長度為2 269bp,反應程序為:98℃預變性3min,98℃變性30s,53℃退火30s,72℃延伸3min,30個循環(huán),72℃延伸5min。對PCR 產(chǎn)物經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳,利用DNA 純化回收試劑盒(TaKaRa)膠回收。回收產(chǎn)物進行加核苷酸A 反應,DNA 片段利用T4DNA 連接酶(NEB)與pMD18-T Vector(TaKaRa)連接。用熱激法將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌Trans1-T1,經(jīng)藍白斑篩選、PCR 和酶切鑒定,鑒定正確后送上海生工有限公司測序,測序正確的保種備用。
經(jīng)測序正確的含有AtCDPK1 基因的T-CDPK1重組載體,用KpnⅠ與XbaⅠ雙酶切,回收目的基因片段。再將植物表達載體pCHF3用KpnⅠ(NEB)與XbaⅠ(NEB)雙酶切,回收大片段。將二者回收的目的片段進行連接轉(zhuǎn)化大腸桿菌Trans1-T1,PCR 和酶切鑒定重組載體,陽性克隆提取質(zhì)粒,采用凍融法導入農(nóng)桿菌LBA4404,經(jīng)PCR 鑒定正確后保種,構(gòu)建成植物表達載體pCHF3-CDPK1。
1.5.1 重組菌株的培養(yǎng)與活化 從-80℃冰箱取出保存的含有pCHF3-CDPK1載體的菌種,在相應抗生素平板上劃線。挑取農(nóng)桿菌單菌落接種到5 mL LB液體培養(yǎng)基(抗生素Rif 30mg/L,Spect 100 mg/L,Str 25mg/L)中,28℃條件下震蕩培養(yǎng)16~20h,取1mL接種到50mL LB 液體培養(yǎng)基中(加抗生素同上),繼續(xù)震蕩培養(yǎng)到OD600為0.5~0.8。將其轉(zhuǎn)至50mL離心管,5 000r/min離心10min,棄上清,菌體用MS培養(yǎng)基重懸。
1.5.2 馬鈴薯轉(zhuǎn)化方法 選擇直徑在2cm 左右的微型薯,去掉芽眼和薯皮,切成2 mm 厚的薯片,放入農(nóng)桿菌重懸液中浸泡10min,期間不斷搖動菌液使其充分接觸,取出后用無菌濾紙吸去薯片表面菌液,轉(zhuǎn)入篩選出的分化培養(yǎng)基(MS+2 mg/L ZT+0.5mg/L 6-BA+1 mg/L IAA+0.2 mg/L GA3)上,于28℃黑暗下共培養(yǎng)2d,使農(nóng)桿菌的T-DNA有效轉(zhuǎn)移。共培養(yǎng)后將薯片轉(zhuǎn)移到附加50 mg/L Kan+300 mg/L Cef的分化培養(yǎng)基上,在(22±2)℃、2 000lx連續(xù)光照條件下誘導芽分化。每隔15 d更換1次培養(yǎng)基,并淘汰褐化和死亡的薯片。待抗性芽長至1.0~1.5cm 時,切下轉(zhuǎn)入附加50 mg/L Kan 和200 mg/L Cef的MS 培養(yǎng)基上,在(22±2)℃、2 000lx連續(xù)光照下誘導生根,獲得完整抗性植株。
剪取生根培養(yǎng)基上生長至10cm 左右的馬鈴薯幼苗葉片提取DNA,以CDPK-RT-F/R 為引物,以含有該基因的質(zhì)粒為陽性對照,非轉(zhuǎn)基因馬鈴薯‘費烏瑞它’無菌苗的基因組DNA 為陰性對照,對轉(zhuǎn)基因植株進行PCR 鑒定。采用TRIzol(Invitroge)試劑提取轉(zhuǎn)基因馬鈴薯植株葉片總RNA,用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA 質(zhì)量,選出條帶完整且清晰的RNA,去除DNA 后,采用cDNA 合成試劑盒(天根)進行轉(zhuǎn)基因植株的RT-PCR 檢測。RT-PCR的 引 物CDPK-RT-F(CCTGTGTAAGGCCAGACTCAA)和CDPK-RT-R(ATAATAACTCCGGCACTCCAC),擴增片段跨AtCDPK1基因1個內(nèi)含子,擴增cDNA 片段長度為742bp,擴增基因組DNA 的片段為875bp。馬鈴薯內(nèi)參基因引物為EF-1α-F(CTCAAGAAGGTAGGATACAAC)和EF-1α-R(GAAGAGCTTCGTGGTGCAT)。
圖1 AtCDPK1基因克隆及陽性克隆的鑒定Fig.1 Cloning of AtCDPK1and identification of plasmids recombinant
以擬南芥基因組DNA 為模板,用特異引物CDPK1-P5/P3進行擴增期。結(jié)果顯示,擴增產(chǎn)物大小與預期片段一致,長度為2 269bp(圖1,A)。將目的產(chǎn)物回收后進行加核苷酸A 反應,獲得回收片段末端帶有堿基A,利于目的片段與T 載體連接,將純化回收的目的片段連接到pMD18-T 克隆載體上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌Trans1-T1,從轉(zhuǎn)化的平板上挑取白色克隆進行菌落PCR,經(jīng)檢測擴增出大小約為875bp的條帶(圖1,B)。對陽性克隆進行菌液培養(yǎng)提取質(zhì)粒DNA,然后做PCR 和酶切鑒定,酶切后獲得長度為2 269bp 的條帶(圖1,C)。對質(zhì)粒進行PCR 鑒定表明,引物CDPK1-P5/P3 和CDPK-RTF/R 分別擴增出2 269bp和875bp的條帶(圖1,C)。陽性克隆測序結(jié)果利用DNAStar軟件分析,其DNA 序列與已知基因序列(At1g18890)完全相同(圖2)。這表明擬南芥AtCDPK1基因全長克隆成功。
重組載體T-CDPK1 和植物表達載體pCHF3分別用KpnⅠ與XbaⅠ雙酶切(圖3,A),回收目的片段后用T4DNA 連接酶(NEB)將目的基因片段與植物表達載體片段連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌Trans1-T1,然后進行菌落PCR 鑒定,隨機挑選6個單菌落進行PCR,結(jié)果顯示,每一個單菌落都能擴增出1條875bp的條帶(圖3,B)。隨機選PCR 鑒定正確的2 個菌落提取質(zhì)粒進行相應位點的雙酶切,結(jié)果顯示,2個質(zhì)粒都獲得一條約2 269bp的條帶(圖3,C)。PCR 產(chǎn)物和酶切產(chǎn)物的目的條帶與預期結(jié)果一致,這表明植物表達載體pCHF3-CDPK1是CaMV 35S 啟動子驅(qū)動AtCDPK1 基因的植物表達載體(圖3,D)。將構(gòu)建好的植物表達載體采用凍融法轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌LBA4404菌株中用于轉(zhuǎn)化馬鈴薯。
AtCDPK1基因農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化馬鈴薯,結(jié)果(圖4)表明,無菌苗經(jīng)過暗培養(yǎng)后,形成微型薯(圖4,A),微型薯去皮和芽眼后切成2mm 左右的薄片,薯片經(jīng)共培養(yǎng)和誘導培養(yǎng)后長出再生芽(圖4,B),將芽進行生根培養(yǎng)后長成完整植株(圖4,C、D)。
對獲得的50株抗性再生植株進行PCR 檢測,提取抗性植株葉片的基因組DNA,利用AtCDPK1基因特異引物CDPK-RT-F/R 進行PCR。檢測結(jié)果顯示,在檢測的50個植株中有36株呈陽性,這些陽性轉(zhuǎn)基因植株能擴增出約875bp的目的條帶,部分檢測的電泳結(jié)果見圖5,非轉(zhuǎn)基因植株沒有相應的條帶,這表明AtCDPK1基因可能被成功導入馬鈴薯基因組中。
為驗證PCR 鑒定為陽性的轉(zhuǎn)基因馬鈴薯中AtCDPK1基因轉(zhuǎn)錄水平,隨機挑選9個T0代轉(zhuǎn)基因株系,利用AtCDPK1的特異引物CDPK-RT-F/R,以馬鈴薯的看家基因StEF-1α作為內(nèi)參基因,進行RT-PCR 鑒定,檢測AtCDPK1在轉(zhuǎn)基因馬鈴薯中的表達。從圖6 可以看出,AtCDPK1 基因在轉(zhuǎn)基因馬鈴薯中都有一定量的表達,且各個株系的表達量也不同。其中1、2、3和10表達量較高,6和12表達量較低,4、5和13表達量中等。這表明AtCDPK1基因在轉(zhuǎn)基因馬鈴薯中得到了正常表達。
圖2 AtCDPK 1基因測序的DNA 序列Fig.2 AtCDPK 1DNA sequencing
圖3 構(gòu)建植物表達載體pCHF3-CDPK1Fig.3 Construction of AtCDPK1expression vector
圖4 形成抗性再生植株Fig.4 Resistant regenerated plants
圖5 再生植株的PCR 檢測Fig.5 PCR detection of regenerated plants
圖6 T0 代轉(zhuǎn)基因馬鈴薯AtCDPK1表達RT-PCR分析Fig.6 RT-PCR analysis of AtCDPK1expression in transgenic plants of S.tuberosum
全球面臨水資源日益短缺的境況,由干旱造成的農(nóng)作物減產(chǎn)并因此帶來的經(jīng)濟損失逐漸加劇。與傳統(tǒng)的抗逆育種工作相比,基因工程育種以其特有的優(yōu)勢,如不受種屬間的限制、周期短、效率高等特點,正得到越來越廣泛的關(guān)注。干旱等非生物脅迫嚴重影響植物的生長發(fā)育[16],而植物在生長過程中有很多基因參與了植物響應逆境脅迫的過程[17-18],其中也包括CDPKs[19-20]。CDPKs是一類依賴鈣離子而不依賴鈣調(diào)素的蛋白激酶,它的酶活性是由Ca2+直接激活,不需要外源的CaM 激活。CDPKs與細胞Ca2+信號進一步傳遞有密切關(guān)系,是植物中與逆境信號傳遞關(guān)系最密切的蛋白之一。其種類也較多,目前已知的擬南芥基因組至少能編碼34種不同亞型的CDPKs[21-22]。有研究[23-25]表明CDPKs介導了非生物脅迫的信號傳遞,在不同植物中都觀察到非生物逆境可誘導不同CDPKs轉(zhuǎn)錄活性和激酶活性的升高。我們前期研究[26]表明,AtCDPK1基因受干旱、高鹽等逆境脅迫誘導表達,并在擬南芥抗非生物脅迫介導的信號轉(zhuǎn)導中具有正向調(diào)節(jié)作用。因此,推測擬南芥對干旱等非生物脅迫的抗性與AtCDPK1的表達有一定的正相關(guān)性。本試驗以野生型擬南芥為供體材料克隆了AtCDPK1基因,并以抗旱性弱的馬鈴薯品種‘費烏瑞它’為基因受體材料進行了遺傳轉(zhuǎn)化研究,在獲得的轉(zhuǎn)基因植株中AtCDPK1基因能正常轉(zhuǎn)錄表達,這在RNA 水平上證實了目的基因在轉(zhuǎn)基因馬鈴薯中正常表達,但轉(zhuǎn)基因馬鈴薯對干旱等逆境脅迫的抗性如何還有待進一步研究驗證。
馬鈴薯的遺傳轉(zhuǎn)化外植體常用葉片、莖段和薯塊。本試驗選用了脫毒試管微型薯薯片,觀察發(fā)現(xiàn)因其不經(jīng)過愈傷組織分化可直接由胚性細胞誘導產(chǎn)生再生植株,使得農(nóng)桿菌侵染后易于轉(zhuǎn)化。另外,脫毒試管微型薯薯片的污染率低,操作過程相對簡單,可明顯縮短植株再生時間,是馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化研究的首選外植體材料。研究發(fā)現(xiàn)AtCDPK1基因在轉(zhuǎn)基因馬鈴薯的各株系中表達量有所不同,這可能是由于不同株系轉(zhuǎn)入基因的拷貝數(shù)不同,也可能是實驗操作誤差造成,此有待于利用Southern 雜交和qRT-PCR 進一步驗證。
[1]LIU L(劉 玲).內(nèi)蒙古馬鈴薯產(chǎn)業(yè)化問題研究[D].呼和浩特:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學,2003.
[2]SUN G F(孫國鳳),MA X(馬 鑫).Development status and prospect of agricultural biotechnology[J].AgriculturalOutlook(農(nóng)業(yè)展望),2010,(11):56-59(in Chinese).
[3]YEO E T,KWON H B,HAN S E,etal.Genetic engineering of drought-resistant potato plants by introduction of the trehalose-6-phosphate synthase(TPS1)gene fromSaccharomycescerevisiae[J].MolecularCells,2000,10(3):263-268.
[4]JIANG L L(姜麗麗),DI H(邸 宏),LIN ZH P(林忠平),etal.Agrobacterium-mediated transformation of potato with drought resistance geneBcBCP[J].ChinaVegetables(中國蔬菜),2009,(2):7-11(in Chinese).
[5]張 寧.應用甜菜堿醛脫氫酶基因工程提高馬鈴薯抗逆性的研究[D].蘭州:甘肅農(nóng)業(yè)大學,2004.
[6]ROBERTS D M,HARMON A C.Calcium-modulated proteins:targets of intracellular calcium signals in higher plants[J].AnnualReviewofPhysiolPlantMolecularBiology,1992,43:375-414.
[7]HRABAK E M.Plant Protein Kinases:Calcium-dependent protein kinases and their relatives[M]//KREIS M,WALKER J C.Advances in Botanical Sciences.New York:Academic Press,2000:185-223.
[8]HARMON A C,GRIBSKOV M,GUBRUM E,etal.The CDPK superfamily of protein kinases[J].NewPhytologist,2001,151:175-183.
[9]HARPER J F,BRETON G,HARMON A C.Decoding Ca2+signals through plant protein kinases[J].AnnualReviewofPlantBiology,2004,55:263-288.
[10]HETHERINGTON A,TREWAVAS A.Calcium-dependent protein kinase in pea shoot membranes[J].FEBSLetters,1982,145(1):67-71.
[11]SHEEN J.Ca2+-dependent protein kinases and stress signal transduction in plants[J].Science,1996,274:1 900-1 902.
[12]盧慧星.擬南芥AtCDPK1參與非生物脅迫響應和ABA 信號途徑的證據(jù)[D].呼和浩特:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學,2009.
[13]ZOU J J,WEI F J,WANG C,etal.Arabidopsiscalcium-dependent protein kinase CPK10functions in abscisic acid and Ca2+-mediated stomatal regulation in response to drought stress[J].PlantPhysiology,2010,154:1 232-1 243.
[14]PATHARKAR O R,CUSHMAN J C.A stress-induced calcium-dependent protein kinase fromMesembryanthemumcrystallinumphosphorylates a two-component pseudoresponse regulator[J].PlantJournal,2000,24(5):679-691.
[15]MA S Y,WU W H.AtCPK23functions inArabidopsisresponses to drought and salt stresses[J].PlantMolecularBiology,2007,65(4):511-518.
[16]XIONG L,SCHUMAKER K S,ZHU J K.Cell signaling during cold,drought,and salt stress[J].PlantCell,2002,14:S165-S183.
[17]ZHU J K,HASEGAWA P M,BRESSAN R A,etal.Molecular aspects of osmotic stress in plants[J].CriticalReviewsinPlantSciences,1997,16(3):253-277.
[18]HASEGAWA P M,BRESSAN R A,ZHU J K,etal.Plant cellular and molecular responses to high salinity[J].AnnualReviewofPlant PhysiologyandPlantMolecularBiology,2000,51:463-499.
[19]LI A L,ZHU Y F,TAN X M,etal.Evolutionary and functional study of theCDPKgene family in wheat(TriticumaestivumL.)[J].PlantMolecularBiology,2008,66(4):429-443.
[20]SAIJO Y,HATA S,KYOZUKA J K,etal.Over-expession of a single Ca2+-dependent protein kinase confers both cold and salt/drought tolerance on rice plants[J].PlantJorrnal,2000,23(3):319-327.
[21]CHENG S H,WILMANN M R,CHEN H C,etal.Calcium signaling through protein kinases.TheArabidopsiscalcium-dependent protein kinase gene family[J].PlantPhysiol.,2002,129:469-485.
[22]ALICE C H,MICHAEL G,HARPER J F.CDPKs-a kinase for ever Ca2+signal[J].TrendsinPlantScience,2000,5(4):154-159.
[23]ZHANG M,LIANG S,LU Y T.Cloning and functional characterization ofNtCPK4,a new tobacco calcium-dependent protein kinase[J].BiochBiophysActa,2005,1 729(3):174-185.
[24]YOON G M,CHO H S,HA H J,etal.Characterization ofNtCDPK1,a calcium-dependent protein kinase gene inNicotianatabacum,and the activity of its encoded protein[J].PlantMolecularBiology,1999,39(5):991-1 001.
[25]SHAO J,HARMON A C.In vivo phosphorylation of a recombinant peptide substrate of CDPK suggests involvement of CDPK in plant stress responses[J].PlantMolecularBiology,2003,53(5):691-700.
[26]聶利珍.擬南芥AtCDPK1在響應丁香假單胞菌和非生物脅迫中的功能分析[D].呼和浩特:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學,2008.