張 霞,張 樺,張富春
(1 新疆農(nóng)業(yè)大學 農(nóng)學院,烏魯木齊830052;2 新疆大學 生命科學與技術(shù)學院,新疆生物資源與基因工程重點實驗室,烏魯木齊
830046)
甘油醛-3-磷酸脫氫酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase;GAPDH)為糖酵解關(guān)鍵酶之一[1]。在哺乳動物細胞中,GAPDH 除了參與糖酵解途徑外,還參與多種非代謝類生物過程,包括轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、DNA 修復、信號傳導、自噬和凋亡[2-5]。最近研究表明H2O2或脫落酸(ABA)處理會抑制擬南芥(Arabidopsis thaliana)GAPDH(AtGAPDH)作為甘油醛-3-磷酸脫氫酶的酶活性,這種失活的GAPDH 蛋白會提高磷脂酸(PA)的含量,后者可以作為信號分子參與對干旱或ROS 等脅迫產(chǎn)生應答[6]。在眾多植物中,如匍匐翦股穎(Agrostis stolonifera)、擬南芥、水稻(Oryza sativa)、小麥(Triticum aestivum)、黃瓜(Cucumis sativus)、番茄(Solanum chilense)等,GAPDH 均被鑒定為鹽脅迫誘導蛋白[7];前期工作中,通過藜科(Chenopodiaceae)鹽穗木(Halostachyscaspica)鹽脅迫下抑制差減文庫獲得鹽脅迫相關(guān)基因,其中包括甘油醛-3-磷酸脫氫酶(HcGAPDH,GenBank Accession No.Hs586460)[8],表明GAPDH 參與植物鹽脅迫應答在植物界是一個普遍現(xiàn)象。此外,在植物中,碳水化合物的水平將植物外界環(huán)境狀況與細胞內(nèi)的發(fā)育進程聯(lián)系在一起[9-10]。而GAPDH 作為糖酵解途徑中的酶,在動物細胞中能夠精準感受到細胞內(nèi)碳水化合物的水平[1]。Zheng等[3]推斷GAPDH 可能作為一種信號分子,通過細胞質(zhì)到細胞核的亞細胞定位的改變,將人源細胞質(zhì)中氧化狀態(tài)(或是新陳代謝狀態(tài))與一些相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄聯(lián)系在一起。雖然蛋白質(zhì)學和瞬時表達綠色熒光蛋白融合蛋白的研究表明擬南芥GAPDH 蛋 白 在 脅 迫 中 定 位 于 細 胞 核 中[11-13]。但GAPDH 是否在生物界(包括植物和動物)中具有相同生理功能還有待進一步探討。
鹽穗木為多汁半灌木、荒漠主要組成植物之一,鹽穗木群系為塔里木河中下游區(qū)域耐鹽性最強的植物種群[14]。其隸屬的藜科包含世界上大多數(shù)鹽生植物種類[15],故鹽穗木是一種典型的鹽生植物。目前對于大多數(shù)鹽生植物的研究還處于起步階段,多集中在轉(zhuǎn)錄本、抑制差減文庫、或蛋白文庫等大規(guī)模批 量基因 篩 選 層 面[8,16,17],對 于 單 個 基 因 或 蛋 白 的功能研究較少。為了研究HcGAPDH 在鹽穗木鹽脅迫應答中的作用,首先通過RACE 技術(shù)獲得Hc-GAPDH 全長cDNA 序列,并借用實時定量PCR檢測了HcGAPDH 在鹽穗木逆境脅迫中的轉(zhuǎn)錄水平,同時借助轉(zhuǎn)基因和激光共聚焦顯微鏡技術(shù)檢測不同生理狀態(tài)下HcGAPDH 的亞細胞定位。本研究為深入探討HcGAPDH 在鹽穗木鹽脅迫應答中的作用機理奠定了一定基礎(chǔ)。
擬南芥(Col生態(tài)型)生長在22 ℃、16h光照/8 h黑暗、60%濕度培養(yǎng)箱中。鹽穗木種子采自新疆北沙窩鹽堿地,手工去掉種子外殼,篩凈,進行濕種子滅菌(75%乙醇表面消毒1min,0.1%升汞消毒8 min,無菌水沖洗7遍以上)。用滴管將處理好的鹽穗木種子點在MS固體培養(yǎng)基中,用封口膜封緊;4℃3d后,于培養(yǎng)箱中培養(yǎng)4周用于后續(xù)實驗,期間采用變溫培養(yǎng)(正常光照,28 ℃16h;無光照,16 ℃8h)。4 周大的幼苗分別在150 mmol/L NaCl和100μmol/L ABA 的平皿中放置0、3、6、12和24h,用液氮將鹽穗木幼苗收集,置-80 ℃待用。
采用植物總RNA 提取試劑盒(Tiangen)提取鹽穗木全株總RNA,置于-80 ℃冰箱保存。按PrimeScript RT-PCR試劑盒(TaKaRa)的操作指南進行cDNA 合成。實時定量PCR 由Rotor-Gene 7500實時定量PCR 儀(Corbett Research,澳大利亞)完成。選擇鹽穗木actin 基因作為內(nèi)參基因,鹽穗木BURP家族的脫水脅迫蛋白22(HcRd22)作為脅迫處理鹽穗木的標記基因[18],采用SYBRRrogen I real-time PCR 體系(invitrogen)進行。反應程序為:95 ℃預變性30s;95 ℃變性5s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸30s,共40個循環(huán)。在ABI 7500 熒光定量PCR 儀上進行擴增。使用2-ΔΔCt方法[19]計算相對表達量。3個重復。
根據(jù)鹽穗木鹽脅迫下抑制差減文庫中分離獲得HcGAPDH 基因的表達標簽(EST)片段[8],利用SMARTer RACE5’/3’Kit(invitrogen)試劑盒,通過RACE技術(shù),進一步克隆獲得HcGAPDH 基因全長cDNA 序列。將兩端帶有EcoRⅠ和BamHⅠ酶切位點HcGAPDH 基因的開放閱讀框(ORF)片段連接至pEGAD 雙元載體,最終產(chǎn)生HcGAPDHGFP 融合片段。將測序正確的載體轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌GV3101,并通過真空滲透法轉(zhuǎn)化擬南芥[20]。所獲得種子在含有50μg/mL Basta的培養(yǎng)基上進行篩選,最終獲得pEGAD/HcGAPDH 轉(zhuǎn)基因陽性擬南芥。所用引物見表1。
將上述的pEGAD/HcGAPDH 轉(zhuǎn)基因陽性擬南芥植株,在含有抗生素的培養(yǎng)基上培育7d后,挑取陽性植株置于含3%葡萄糖的MS培養(yǎng)基處理12 h后,放置載玻片上,用熒光共聚焦顯微鏡觀測。圖像由FV10-ASW 1.7A 軟件(Olympus Corp.,http://www.olympusamerica.com/)處理。
表1 引物序列表Table 1 Table of primer pairs
根據(jù)抑制差減文庫中分離的基因EST 序列[8],通過RACE技術(shù)克隆獲得1 381bp的HcGAPDH全長cDNA 序列,其ORF 編碼314個氨基酸。利用Clustalw 序 列 比 對 軟 件(http://www.ebi.a(chǎn)c.uk/Tools/msa/clustalw2/)預測該基因氨基酸序列與已報告的GADPH 家族成員具有高度保守性,故將該基因命名為HcGAPDH(圖1,A)。根據(jù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu) 域 在 線 分 析 軟 件(http://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin motif_scan)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)HcGAPDH 具有2個不同的結(jié)構(gòu)域:位于N 端包含有煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)結(jié)合位點的結(jié)構(gòu)域(4~154);位于C 端包含有2 個甘油醛-3-磷酸(Glyceraldehyde 3-phosphate)結(jié)合位點的結(jié)構(gòu)域(156~314),這2個結(jié)構(gòu)域均與GAPDH 作為水解酶的活性具有相關(guān)性(圖1,B)。因此,本實驗所克隆的HcGAPDH可被認為是GAPDH 基因家族成員之一。
圖1 HcGAPDH 與其他物種GAPDH 蛋白序列比對(A)及其保守結(jié)構(gòu)域分析(B)Fig.1 Alignment of full-length deduced amino acid sequences of HcGAPDH and GAPDH orthologues from different phylogenetic origins(A)and the structure of the conserved regions(B)of HcGAPDH protein.
為研究HcGAPDH 表達是否受鹽脅迫和植物抗逆激素ABA的影響,通過實時定量RT-PCR技術(shù),檢測4周齡鹽穗木在鹽脅迫和激素ABA 處理下Hc-GAPDH 的表達。結(jié)果表明,內(nèi)參基因HcRd22[17]的基因表達量隨著鹽脅迫或ABA 處理時間的延長呈上調(diào)趨 勢(圖2)。在ABA 脅 迫 處 理3 和6h 時,HcRd22轉(zhuǎn)錄水平有下降趨勢,但與對照組相比差異不顯著;在ABA 脅迫處理12h時,HcRd22表達量達到最大值,且與對照組相比差異顯著。相比之下,HcGAPDH 表達在鹽脅迫6h時達到最高峰,隨后降低。50μmol/L ABA處理使得HcGAPDH 表達在脅迫12h內(nèi)呈現(xiàn)逐漸上升趨勢,在12h時達到最高值(圖2)??傊?,這些結(jié)果表明HcGAPDH 基因的轉(zhuǎn)錄水平受鹽脅迫和ABA 處理調(diào)節(jié)。
圖2 鹽脅迫(A)和ABA(B)處理下HcGAPDH 表達*和**分別表示0.05和0.01水平顯著性差異Fig.2 qPCR analysis of the expression of HcGAPDH with NaCl(A)or ABA(B)treatments*and** mean significant differences at 0.05and 0.01levels,respectively.
圖3 鹽脅迫下HcGAPDH 在轉(zhuǎn)基因植株根部組織的亞細胞定位Fig.3 Subcellular-localization of HcGAPDH in the root of transgenic seedlings under salt stress
圖4 糖缺乏下HcGAPDH 在轉(zhuǎn)基因植株根部組織細胞的亞細胞定位Fig.4 Subcellular-localization of HcGAPDH in the root of transgenic seedlings under sugar starvation
動物GAPDH 在不同生理狀況下具有不同亞細胞定位[3,5]。為檢測HcGAPDH 在鹽脅迫下是否具有亞細胞定位的改變,將在MS 培養(yǎng)基生長7d的HcGAPDH-GFP 和GFP 轉(zhuǎn) 基 因 植 株,分 別 用200mmol/L NaCl處理24h后,進行GFP 熒光觀測(圖3)。結(jié)果顯示,在正常生長狀況下,GFP-Hc-GAPDH 蛋白熒光信號主要集中在轉(zhuǎn)基因植株根部細胞的細胞質(zhì)中。當用200mmol/L NaCl處理12 h后,對照組GFP 蛋白主要分布于細胞周質(zhì)中,而GFP-HcGAPDH 蛋白則明顯地聚集在轉(zhuǎn)基因細胞的細胞核中,而在細胞質(zhì)分布較少,表明鹽脅迫可促使HcGAPDH 蛋白在植物細胞核中富集。
為檢測碳水化合物的匱乏是否是鹽脅迫下植物GAPDH 改變亞細胞定位至細胞核的誘因之一,將7d大的HcGAPDH-GFP 轉(zhuǎn)基因植株置于有3%葡萄糖的MS培養(yǎng)基上處理12h后,在共聚焦顯微鏡下觀測其亞細胞定位。結(jié)果(圖4)顯示,與含有葡萄糖的培養(yǎng)基上生長的幼苗相比,在糖缺乏培養(yǎng)基上幼苗的GFP熒光信號明顯下降,而且熒光信號仍集中分布于細胞質(zhì)中,在細胞核上沒有發(fā)現(xiàn)明顯的熒光信號累積。這些結(jié)果暗示了糖信號介導Hc-GAPDH 蛋白自身的周期控制,該過程不同于鹽脅迫應答過程的HcGAPDH 亞細胞定位改變。
GAPDH 作為糖酵解途徑中的一種關(guān)鍵酶之一,長期以來被認為是在同種細胞或組織中恒定表達且只存在于細胞質(zhì)中的管家基因產(chǎn)物。然而最近研究表明在動物細胞中,GAPDH 的mRNA 和蛋白質(zhì)水平會隨著各種環(huán)境因素的影響而發(fā)生變化[4,21],且可以定位于除細胞質(zhì)之外的質(zhì)膜、細胞核、多聚體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)與高爾基體上[22-25]。而在植物細胞中,鹽脅迫處理的鹽生植物西伯利亞蓼(Polygonum sibiricum)中PsGAPDH 也發(fā)現(xiàn)同樣的上調(diào)表達[26]。在本研究中,鹽脅迫和ABA 處理同樣也可誘導鹽生植物鹽穗木HcGAPDH 的基因表達上調(diào)。此外,鎘脅迫[13]處理可誘導擬南芥AtGAPDH蛋白定位于細胞核,而在本研究中發(fā)現(xiàn)了鹽脅迫也可促使HcGAPDH 在轉(zhuǎn)基因植株根部細胞中由細胞質(zhì)轉(zhuǎn)移至細胞核,暗示了逆境脅迫下不同生物體內(nèi)(主要是動物和植物細胞內(nèi))的GAPDH 也許具有相似的生理功能。
糖酵解是動植物以及微生物細胞中葡萄糖分解產(chǎn)生能量的共同代謝途徑。研究表明糖酵解過程中產(chǎn)生的能量和一些代謝物質(zhì)可用于其它生物反應過程,這對植物在逆境中的存活至關(guān)重要[9,10]。人源HsGAPDH 已被證實通過與核轉(zhuǎn)錄復合物Oct-1-OCA-S結(jié)合將細胞內(nèi)的代謝平衡與細胞核中組蛋白的轉(zhuǎn)錄和DNA 復制結(jié)合在一起[3]。因此,提出植物GAPDH 作為糖酵解中酶類物質(zhì)之一,也可通過作為細胞內(nèi)代謝狀況的感應元件參與植物鹽脅迫應答這一假說。然而在糖饑餓的轉(zhuǎn)基因植物細胞中,HcGAPDH-GFP融合蛋白并沒有在細胞核處發(fā)生明顯的熒光信號聚集現(xiàn)象,而是HcGAPDH-GFP融合蛋白的熒光信號明顯降低,本研究結(jié)果與Cotelle等[27]報道相一致,糖饑餓促使糖酵解相關(guān)酶蛋白發(fā)生降解。同時,這一結(jié)果也暗示了碳水化合物水平的改變并不是鹽脅迫下GAPDH 功能發(fā)生改變的原因,但這仍需要進一步實驗驗證。在動物體系 中,GAPDH 的 細 胞 核 定 位 與 基 因 轉(zhuǎn) 錄[5,28]具 有相關(guān)性,但這尚未在植物中有相關(guān)報道。因此植物GAPDH 通過胞內(nèi)定位的改變對植物抗逆能力的影響機制還有待于進一步探討。
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