李 蒙,陳芳霞,呂 寧,陳 鵬
(西北農(nóng)林科技大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,陜西楊陵712100)
苦蕎(Fagopyrum tataricum)作為一種健康食 品資源正風(fēng)靡世界,主要在于其含有高生物價(jià)的蛋白質(zhì)和豐富的維生素 ,近年來(lái)的研究表明,黃酮類化合物是苦蕎中重要的營(yíng)養(yǎng)保健功能因子,蘆丁、兒茶素、花青素作為主要黃酮類化合物,具有抗氧化[2]、抗癌[3-4]、降血脂[5]等一系列藥理功效。
在植物類黃酮代謝途徑中,無(wú)色花青素是花青素、兒茶素以及原花色素的共同前體。二氫黃酮醇4-還原 酶(dihydroflavonol 4-reductase,DFR)可 將二氫黃酮醇還原為無(wú)色花青素,是調(diào)控植物體內(nèi)類黃酮代謝物積累的關(guān)鍵功能基因和重要的限速酶之一,催化立體結(jié)構(gòu)專一的三種黃酮醇(二氫山奈酚、二氫槲皮素和二氫楊梅素)生成花色素的前體物[6],進(jìn)而通過(guò)花色素合成酶(ANS)和類黃酮糖基轉(zhuǎn)移酶(3-GT 或5-GT)形成各種花青素苷[7]。由于它的重要性,研究發(fā)現(xiàn)不同物種的DFR 對(duì)3種底物的偏愛(ài)性也存在差異,但DFR 氨基酸序列在很多區(qū)域有較高的同源性,而且在植物的進(jìn)化過(guò)程中DFR 的功能沒(méi)有變化[8]。研究釀酒葡萄DFR 三維結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),底物特異性結(jié)合區(qū)域由26個(gè)氨基酸組成,其中任何一個(gè)氨基酸的突變都會(huì)改變酶對(duì)底物的特異性[6],根據(jù)特異區(qū)133位氨基酸的不同,可分為Asn型、Asp型和非Asn/Asp型[9]。
目前已基本探明類黃酮花青素的生物合成途徑,由于DFR 編碼基因是花色改良和提高生物脅迫的關(guān)鍵基因之一,該基因已經(jīng)在不同種得到分離,在擬南芥、大麥、金魚(yú)草、葡萄、水稻、番茄中以單拷貝存在,毛果楊、非洲菊,苜蓿是以功能特性不同的多拷貝存在[10-11]。毛果楊DFR 雙基因轉(zhuǎn)化的煙草中發(fā)現(xiàn),DFR1可以通過(guò)積累花青素而改變花的顏色,而DFR2只積累濃縮的丹寧(原花青素)[11]。因此,高等植物在適應(yīng)環(huán)境的過(guò)程中,DFR 同工酶分別由不同的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控,在促進(jìn)植物進(jìn)化中起著關(guān)鍵作用[12]。植物DFR 的過(guò)量表達(dá)都會(huì)提高黃酮的含量和生物的抗氧化能力[13-15]。
作為類黃酮代謝中關(guān)鍵酶,DFR 對(duì)植物體內(nèi)花青素合成積累起到關(guān)鍵調(diào)節(jié)作用。李小華等[16]對(duì)不同苦蕎品種間與花青素合成相關(guān)的5個(gè)酶表達(dá)差異的分析表明,DFR 編碼基因的表達(dá)量與苦蕎黃酮類化合物積累相關(guān)。目前,關(guān)于苦蕎DFR 的研究主要集中于轉(zhuǎn)錄水平[17],而關(guān)于翻譯后DFR 蛋白質(zhì)的研究未見(jiàn)報(bào)道。本文利用RT-PCR 方法,克隆獲得苦蕎DFR 編碼基因,成功將它導(dǎo)入大腸桿菌中,在優(yōu)化表達(dá)基礎(chǔ)上分離純化苦蕎DFR 重組蛋白,進(jìn)行多克隆抗體的制備。為從翻譯水平分析DFR 的表達(dá)與苦蕎黃酮類化合物累積的關(guān)系奠定基礎(chǔ)。
苦蕎品種榆6-21(榆林農(nóng)業(yè)學(xué)校提供),于大田種植,開(kāi)花3d后采集灌漿期樣品,樣品采集后立即分裝,液氮速凍后于-80 ℃冰箱保存。原核表達(dá)載體pET47b、大腸桿菌菌株BL21(DE3)和TOP10均由本實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2.1 苦蕎總RNA 的提取及cDNA合成 苦蕎種子灌漿期總RNA 的提取參照陳鵬等[18]的方法進(jìn)行,以提取所得總RNA 為模板,Oligo(dT)18為引物,按照RevertAid First Strand cDNA Synthes Kit(Thermo Scientific公司)操作說(shuō)明書(shū)合成cDNA。
1.2.2 DFR 表達(dá)載體構(gòu)建 據(jù)GenBank 中苦蕎DFR 編碼基因(GU169468.1)mRNA 全長(zhǎng)信息,針對(duì)其ORF 設(shè)計(jì)了1 對(duì)特異引物:上游引物下劃線為SacⅡ酶切位點(diǎn)),下游引物下劃線為XhoⅠ酶切位點(diǎn)),以合成的cDNA 為模板 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增條 件:98 ℃預(yù)變性1min,98℃變性10s,59℃退火20s,72℃延伸1min,30個(gè)循環(huán),擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)、純化(北京百泰克生物科技有限公司回收試劑盒)和雙酶切,酶切產(chǎn)物經(jīng)T4DNA Ligase連接到表達(dá)載體pET47b 后,KCM 方法轉(zhuǎn)化大腸桿菌TOP10,陽(yáng)性克隆菌經(jīng)PCR 和測(cè)序(北京奧科鼎盛公司)鑒定。
1.2.3 序列比對(duì)與分析 在NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)中BLAST(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast)進(jìn)行核苷酸序列比對(duì)。應(yīng)用DNAMAN 軟件對(duì)推導(dǎo)的氨基酸進(jìn)行多序列比對(duì)。利用ExPASy 在線軟件對(duì)其進(jìn)行等電點(diǎn)及分子量預(yù)測(cè)(http://www.expasy.org/)。
1.2.4 重組蛋白的表達(dá) KCM 方法將測(cè)序正確的重組表達(dá)載體pET47b-DFR 轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3),挑取陽(yáng)性克隆單菌落接種到Kana(50μg/mL)的LB培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)至OD600值達(dá)0.6~0.8時(shí),加入IPTG 至終濃度1mmol/L,37 ℃誘導(dǎo)3 h,收集1.5mL菌體,加入1×SDS-PAGE上樣緩沖液懸浮菌體,沸水保溫10min后進(jìn)行SDS-PAGE。
1.2.5 重組蛋白的可溶性分析 參照文獻(xiàn)[19]的方法優(yōu)化表達(dá)條件,鑒定的重組表達(dá)單菌落接種到Kana(50μg/mL)的LB 培 養(yǎng) 基 中,37 ℃培 養(yǎng) 至OD600值達(dá)0.6~0.8時(shí),分別加入IPTG 至終濃度為0.15 mmol/L、0.25 mmol/L、0.5 mmol/L 和1 mmol/L,置于22 ℃、30 ℃和37 ℃搖床中震蕩培養(yǎng),每4h、8h和12h取樣,用SDS-PAGE 檢測(cè)重組蛋白表達(dá)情況,參照文獻(xiàn)[20]進(jìn)行可溶性分析,收集剩余菌體后加入超聲裂解緩沖液(pH 7.5,20 mmol/L Tris-HCl,50 mmol/L NaCl),超聲破碎,12 000r/min,4 ℃離心10min后,上清和沉淀分別進(jìn)行SDS-PAGE分析。
1.2.6 鈷離子螯合層析純化目的蛋白 收集誘導(dǎo)菌體超聲破碎后,12 000r/min,4℃離心10min,上清與等體積的2×PBS(pH 7.5,0.1 mmol磷酸二氫鈉,0.6 mol/L NaCl)混合,緩慢上樣經(jīng)1×PBS平衡的Talon resin柱上,先1×PBS 洗脫雜蛋白,然后用含20mmol/L咪唑[21]的PBS再次洗脫雜蛋白,最后用含150mmol/L 咪唑的PBS洗脫目標(biāo)蛋白。目 標(biāo) 蛋 白 經(jīng)pH 7.5 的 透 析 液(20 mmol/L Tris-HCl,50mmol/L NaCl)透析后,再通過(guò)PEG-6000濃縮,電泳檢測(cè),-20 ℃保存。
1.2.7 重組蛋白抗體的制備 將濃縮后的蛋白與2×SDS-PAGE 上 樣 緩 沖 液 混 合,100 ℃煮 沸10 min,進(jìn)行電泳,將凝膠用考馬斯亮藍(lán)R250 染色。滅菌水洗滌后,切取目的條帶置于研缽中,加入液氮充分研磨成粉末狀。加入1 mL 1×PBS(pH 7.5)充分溶解[22]、混勻后,將制備好的抗原與等體積弗氏完全佐劑(Sigma)充分乳化后,皮下多點(diǎn)注射免疫2只大耳朵雄兔,每只兔抗原劑量1mg[23],初次免疫后2 周,抗原與弗氏不完全佐劑(Sigma)等體積充分混勻,免疫劑量減至500μg,皮下多點(diǎn)注射。之后每隔2周加強(qiáng)免疫1次,劑量如二免。3 次加強(qiáng)免疫后測(cè)抗血清效價(jià),當(dāng)達(dá)到滿意值后,兔心臟穿刺取血,所取血液37℃靜置1h,之后室溫靜置至抗血清析出,收集血清,即得到DFR 的多克隆抗體,-20 ℃凍存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.8 抗體的Western blotting檢測(cè) 取1g灌漿期的苦蕎種子,參考李玉萍等[20]加入2mL 可溶蛋白提取液(pH 7.5,10mmol/L Tris-HCl,25mmol/L NaCl),研缽中充分研磨、混勻后置于4 ℃過(guò)夜,10 000r/min,4 ℃離心10min,上清即為種子總蛋白,-20℃保存。參考文獻(xiàn)[24]方法Western blotting分析,苦蕎總蛋白和原核表達(dá)蛋白經(jīng)SDSPAGE分離后轉(zhuǎn)移至0.15μm 的NC 膜上,50mA電流下轉(zhuǎn)移1h,辣根過(guò)氧化酶(HRP)標(biāo)記的山羊抗兔IgG 為二抗(1∶1 000,北京博奧森生物科技有限公司)進(jìn)行蛋白質(zhì)印跡分析,印跡信號(hào)采用化學(xué)發(fā)光顯色試劑盒(北京康為世紀(jì)生物科技有限公司)進(jìn)行顯色,并利用化學(xué)發(fā)光成像儀(ChemiDocXRS System,Bio-Rad)記錄結(jié)果。
用設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行DFR 編碼基因PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物通過(guò)1%(W/V)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),顯示一條1 026bp的特異性擴(kuò)增片段(圖1),與預(yù)期大小一致。測(cè)序結(jié)果表明,本研究擴(kuò)增獲得的苦蕎二氫黃酮醇4-還原酶基因全長(zhǎng)1 026bp,編碼341個(gè)氨基酸,利用在線軟件預(yù)測(cè)該蛋白分子量為38.53 kD,等電點(diǎn)為5.78,重組蛋白分子量為39.65kD,等電點(diǎn)為6.21。
圖1 DFR 編碼基因的PCR 擴(kuò)增M.DL2000;1、2.DFR 編碼基因的PCR 擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 PCR amplification of the coding sequence of DFR M.DL2000;1,2.PCR product of DFR
圖2 DFR 的質(zhì)粒PCR 擴(kuò)增M.DL2000;1~5.DFR 的質(zhì)粒PCR 擴(kuò)增Fig.2 Screening of positive recombinant plasmid by plasmid PCR M.DL2000;1-5.Plasmid PCR of five recombinant plasmids
圖3 DFR 誘導(dǎo)表達(dá)的SDS-PAGE分析M.蛋白marker;1、3.誘導(dǎo)前對(duì)照菌;2、4.誘導(dǎo)表達(dá)菌體Fig.3 SDS-PAGE analysis of the expression of DFR M.Protein marker;1,3.Uninduced cells containing pET47b-DFR;2,4.Induced cells containing pET47b-DFR
圖4 目的蛋白的可溶性表達(dá)分析M.蛋白marker;1.未誘導(dǎo)的菌體蛋白;2.誘導(dǎo)的菌體蛋白;3.誘導(dǎo)菌株超聲波裂解后的沉淀;4.誘導(dǎo)菌株超聲波裂解后的上清Fig.4 The solubility analysis of recombinant M.Protein marker;1.Uninduced cells containing pET47b-DFR;2.Induced cells containing pET47b-DFR;3.Insoluble protein from induced cell containing pET47b-DFR;4.Soluble protein from induced cell containing pET47b-DFR
圖5 純化蛋白的SDS-PAGE分析M.蛋白marker;1~3.純化的目的蛋白Fig.5 SDS-PAGE analysis of purified DFR M.Protein marker;1-3.Purified protein
圖6 DFR 的Western blotting分析1.誘導(dǎo)后的目的蛋白;2.未重組表達(dá)載體的菌體蛋白;3.苦蕎種子灌漿期中總蛋白Fig.6 Western blotting analysis of DFR 1.Total protein from induced cell containing pET47b-DFR;2.Induced cells containing pET47b;3.Total protein of seed filling period of buckwheat
將構(gòu)建好的重組載體進(jìn)行PCR 鑒定,瓊脂糖電泳結(jié)果(圖2)顯示PCR擴(kuò)增的片段與預(yù)期大小一致,測(cè)序結(jié)果也證實(shí)DFR 的原核表達(dá)載體構(gòu)建成功。重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)化到表達(dá)菌BL21(DE3),誘導(dǎo)后經(jīng)SDS-PAGE分析,在35~45kD 之間有明顯的誘導(dǎo)表達(dá)條帶,其大小與預(yù)測(cè)的重組蛋白分子量大小相符(圖3),說(shuō)明重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)成功。為了獲得最大可溶性目的蛋白產(chǎn)量,獲得pET47b-DFR表達(dá)菌株最佳誘導(dǎo)條件,誘導(dǎo)溫度22 ℃、誘導(dǎo)時(shí)間10h、IPTG 濃度0.15mmol/L,SDS-PAGE 分析目的蛋白在大腸桿菌BL21(DE3)中分別以上清與包涵體形式存在(圖4)。
將含重組蛋白的上清經(jīng)過(guò)鈷離子螯合層析柱純化后,SDS-PAGE檢測(cè)結(jié)果表明鈷柱Talon resin實(shí)現(xiàn)了該重組蛋白的高效純化(圖5)。為徹底除去目的蛋白中可能存在的微量雜蛋白,將純化的目的蛋白SDS-PAGE(20cm×20cm)電泳,考馬斯亮藍(lán)染色后切取目標(biāo)條帶,滅菌水洗滌后進(jìn)行兔抗苦蕎DFR 多克隆抗體制備。
利用Western blotting 檢測(cè)制備抗體的特異性,結(jié)果顯示原核表達(dá)的融合蛋白、苦蕎種子灌漿期總蛋白與抗血清雜交顯示單一條帶,而未重組表達(dá)載體的菌體蛋白沒(méi)有雜交出任何條帶(圖6),說(shuō)明該抗體具有較高的特異性,且在灌漿期的苦蕎種子中含有大量的DFR 蛋白。由于重組蛋白DFR 含有組氨酸標(biāo)簽,Western blotting中灌漿期苦蕎種子雜交的蛋白條帶較原核表達(dá)的蛋白分子量略小。
苦蕎種子富含氨基酸均衡的蛋白質(zhì)和高生物活性的黃酮類物質(zhì),是典型的藥糧兼用作物。灌漿期是苦蕎營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)累積與合成的關(guān)鍵時(shí)期,研究該時(shí)期籽粒中各種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)累積及次生代謝相關(guān)基因的表達(dá)規(guī)律對(duì)于提高苦蕎的營(yíng)養(yǎng)保健價(jià)值具有重要理論和應(yīng)用價(jià)值[18]。二氫黃酮醇4-還原酶是苦蕎次生代謝途徑中的關(guān)鍵酶和一個(gè)重要的調(diào)控位點(diǎn),不但參與黃酮類化合物的累積[15,25],而且參與顯花植物雄性能育過(guò)程[26]。植物DFR 與哺乳動(dòng)物3β-羥基類固醇脫氫酶通過(guò)蛋白序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)它們由同一個(gè)祖先演化而來(lái)[27],至今人們從多種植物分離并鑒定出DFR 編碼基因,研究結(jié)果顯示,DFR 同源基因都具有一個(gè)典型的NADP結(jié)合位點(diǎn)和26個(gè)氨基酸組成的底物特異性結(jié)構(gòu)域[28]。祝婷等[29]首次克隆了苦蕎DFR 編碼基因,到目前關(guān)于其蛋白質(zhì)相關(guān)的研究還未有報(bào)道,本研究從苦蕎灌漿期種子中克隆得到DFR 編碼基因,利用DNAMAN 軟件分析,發(fā)現(xiàn)其具有DFR 同源基因的典型特征和關(guān)鍵結(jié)構(gòu)域,推測(cè)苦蕎DFR 編碼基因編碼蛋白具有催化活性,相關(guān)文獻(xiàn)表明大腸桿菌和酵母中表達(dá)的DFR 也都具有酶活和底物偏愛(ài)性[19,30-31]。由于目前對(duì)大腸桿菌的遺傳背景和生理特性研究了解得比較清楚,無(wú)未知干擾蛋白的產(chǎn)生,為獲得高純度融合蛋白提供有力工具。因此,本研究通過(guò)構(gòu)建DFR 原核重組表達(dá)載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3),實(shí)現(xiàn)了該基因的原核表達(dá),但原核高效的表達(dá)系統(tǒng),使部分蛋白不能有效正確折疊形成了包涵體,通過(guò)優(yōu)化表達(dá)條件,找到了獲得大量可溶性蛋白的途徑:首先菌體的活化過(guò)程,嚴(yán)格控制菌液OD600值達(dá)0.6~0.8進(jìn)行誘導(dǎo),誘導(dǎo)溫度22 ℃、誘導(dǎo)時(shí)間10h、IPTG 濃度0.15mmol/L,使用固定化鈷離子結(jié)合HIS標(biāo)簽純化蛋白,適宜濃度咪唑洗脫,最終獲得高純度DFR融合蛋白,為深入研究苦蕎DFR 的反應(yīng)動(dòng)力學(xué)、催化特性奠定了基礎(chǔ)。
真核生物次生代謝相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控包含轉(zhuǎn)錄水平和翻譯水平等多個(gè)層次,目前關(guān)于DFR 編碼基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制的研究在許多植物中都已經(jīng)取得了突破,通過(guò)轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控結(jié)構(gòu)基因的表達(dá),進(jìn)而影響植物次生代謝物的合成和累積[12,32]。而探討苦蕎次生代謝物的累積與DFR 表達(dá)的關(guān)系,從翻譯水平入手更具現(xiàn)實(shí)意義,免疫學(xué)技術(shù)是研究蛋白質(zhì)表達(dá)水平的有效方法,本研究通過(guò)原核表達(dá)獲得大量的目的蛋白,通過(guò)親和層析,得到高純度目的蛋白作為抗原,免疫兔后獲得DFR 多克隆抗體,Western blotting顯示獲得的抗體特異性好,背景低,可以為進(jìn)一步開(kāi)展DFR 蛋白酶在不同苦蕎品種、不同生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期和不同組織內(nèi)的蛋白表達(dá)譜以及蛋白定位等方向的研究提供有利工具。
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