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N-乙酰基-5-甲氧基色胺光譜的密度泛函理論研究

2015-07-18 11:24蘇學軍張紀磊
新技術新工藝 2015年10期
關鍵詞:乙?;?/a>吡咯鍵長

蘇學軍,張紀磊

(海軍航空工程學院 基礎實驗部,山東 煙臺 264000)

N-乙酰基-5-甲氧基色胺光譜的密度泛函理論研究

蘇學軍,張紀磊

(海軍航空工程學院 基礎實驗部,山東 煙臺 264000)

在Gaussian 09W軟件的基礎上,采用密度泛函理論(Density Functional Theory,DFT)的B3LYP方法,在6-31G(d)基組水平上,優(yōu)化了N-乙?;?5-甲氧基色胺分子,得到了其最穩(wěn)定構型,并對其結構特點進行了分析研究。在優(yōu)化結構的基礎上,采用相同的理論方法計算了該分子的紅外振動光譜,繪制了紅外光譜圖,并按照形成光譜的分子振動模式的不同,對N-乙?;?5-甲氧基色胺的紅外光譜峰位進行了歸屬。

N-乙?;?5-甲氧基色胺;密度泛函;紅外光譜

N-乙?;?5-甲氧基色胺(N-(5-methoxy indol-3-yl)ethyl acetamide),又名松果體素,俗稱褪黑激素(Melatonin),主要是由哺乳動物和人類的松果體產(chǎn)生的一種胺類激素,分子結構式如圖1所示。

褪黑激素是人腦松果腺分泌的一種重要激素,最早是1959年,A. B. Lerner在牛松果體中分離出來的[1-2]。經(jīng)國內外研究發(fā)現(xiàn),褪黑激素具有促進睡眠、調節(jié)時差、抗衰老、調節(jié)免疫和抗腫瘤等多項生理功能,目前被廣泛應用于安眠藥品及保健品當中[3-4]。

圖1 N-乙?;?5-甲氧基色胺分子結構式

紅外光譜是鑒定分子結構的重要工具,本文應用Gaussian 09W程序,采用密度泛函理論,利用B3LYP/6-31G(d)方法計算得到N-乙?;?5-甲氧基色胺的最穩(wěn)定結構,用同樣方法計算該分子的振動頻率,繪制其紅外光譜圖,對該分子的結構特點及紅外光譜規(guī)律進行分析探討。

1 計算方法

首先采用Gaussian View和Chemoffice軟件構建標題分子的初始構型,然后基于Gaussian 09W程序,用密度泛函DFT-B3LYP方法,在6-31G(d)基組水平上,對初始構型進行幾何結構全優(yōu)化。在此基礎上,用同樣的理論方法計算標題分子的頻率,然后用Gaussian View軟件將頻率數(shù)據(jù)轉換為紅外光譜,并對其紅外光譜峰進行分析探討。頻率計算采用0.96的修正因子進行校正[5]。

2 結果與討論

2.1 N-乙?;?5-甲氧基色胺的結構特點

優(yōu)化后的N-乙酰基-5-甲氧基色胺分子穩(wěn)定構型如圖2所示。經(jīng)頻率計算,得到3個最小的振動頻率數(shù)據(jù)為22.00、40.05和50.24 Hz,其對應的振動強度分別為0.133 4、0.392 1和2.247 9。由此可見,計算過程中N-乙?;?5-甲氧基色胺分子的振動光譜沒有出現(xiàn)虛頻,說明該優(yōu)化構型合理。

圖2 N-乙?;?5-甲氧基色胺分子穩(wěn)定構型

N-乙?;?5-甲氧基色胺的分子結構參數(shù)見表1~表3。該分子的苯環(huán)中各鍵角為118°~124°(接近120°),并且苯環(huán)和含氮五元環(huán)各原子所成二面角都接近0°和180°,這說明該分子中苯并吡咯環(huán)各原子均處于同一平面。二面角∠C14-O13-C4-C3為179.96°,∠C14-O13-C4-C5為0.02°,∠C8-C20-C23-N26為178.70°,∠C20-C23-N26-C28為94.87°,可見20號和23號碳原子以及甲氧基與苯并吡咯環(huán)處于同一平面,而N-乙?;c該平面近似成直角,不在同一平面上。從表1中的鍵長數(shù)據(jù)看,苯環(huán)中各碳碳鍵長為0.139 6~0.142 7 nm,介于碳碳雙鍵(0.134 0 nm)和碳碳單鍵(0.154 0 nm)之間;吡咯環(huán)中C1-N18鍵長為0.139 1 nm,N18-C7鍵長為0.139 4 nm,較正常碳氮單鍵0.147 0 nm短;C7-C8雙鍵鍵長為0.137 9 nm,比正常碳碳雙鍵略長;C2-C8單鍵鍵長為0.145 0 nm,比正常碳碳單鍵短。這說明整個苯并吡咯環(huán)成一個共軛體系。與苯環(huán)相連的O13-C4鍵長為0.140 0 nm,比正常碳氧單鍵0.143 0 nm略短;C8-C20單鍵鍵長為0.150 4 nm,比正常碳碳單鍵略短;而C14-O13鍵長為0.144 8 nm,比正常碳氧單鍵長;C20-C23單鍵鍵長為0.154 1 nm,比正常碳碳單鍵略長。因此,13號氧原子和20號碳原子與苯并吡咯環(huán)共同構成共軛體系,而N-乙?;?4號碳不共軛。

表1 N-乙?;?5-甲氧基色胺的鍵長

表2 N-乙酰基-5-甲氧基色胺的鍵角

表3 N-乙?;?5-甲氧基色胺的二面角

2.2 N-乙?;?5-甲氧基色胺的紅外振動光譜及其歸屬

只有偶極矩發(fā)生變化的振動才能引起可觀測的紅外吸收,這種振動可分為伸縮振動和彎曲振動兩大類。伸縮振動是指原子沿鍵軸方向的往復運動,振動過程中鍵長發(fā)生變化,又分為對稱伸縮振動和反對稱伸縮振動。彎曲振動又稱變形振動,是指原子垂直于化學鍵方向的振動,又分為面內彎曲振動、面外彎曲振動、剪式彎曲振動、面內搖擺振動和扭曲振動[6]。用DFT/B3LYP方法計算出的位于中紅外區(qū)的N-乙?;?5-甲氧基色胺的紅外振動光譜如圖3所示。

分析發(fā)現(xiàn),在0~385 cm-1區(qū)域,N-乙酰基-5-甲氧基色胺的主要振動形式是苯環(huán)上的甲氧基和吡咯環(huán)上的N-乙?;膹澢駝?,這一區(qū)域的譜峰強度較弱,最強鋒出現(xiàn)在64.98 cm-1處;在400~485 cm-1區(qū)域,主要是苯并吡咯環(huán)的面內搖擺振動;在490~1 100 cm-1區(qū)域,主要是碳氫或氮氫的彎曲振動,這一區(qū)域的最強鋒和次強峰都是由N-H的面外彎曲振動引起的,其中最強峰出現(xiàn)在504.35 cm-1處,對應吡咯環(huán)上的N18-H19面外彎曲振動,次強峰出現(xiàn)在710.56 cm-1處,對應N26-H27面外彎曲振動;在1 100~1 800 cm-1區(qū)域,在1 713.62 cm-1處出現(xiàn)的最強峰是羰基伸縮振動,1 233.54 cm-1處的次強峰是甲基的碳氫彎曲振動峰,而與它強度相當?shù)恼駝臃宄霈F(xiàn)在1 397.46 cm-1處,是由碳氮的伸縮振動和碳氫的左右搖擺振動復合引起的;在3 000~4 000 cm-1區(qū)域,這一區(qū)域的譜峰整體強度是最弱的,其中出現(xiàn)在3 025.10和3 058.14 cm-1處的相對強峰,是由C14、C29所在甲基和C23所在亞甲基的對稱伸縮振動引起的,而3 092.47 cm-1處的相對強峰,是由C14所在甲基的不對稱伸縮振動引起的,3 703.00 cm-1處的相對強峰,對應N18-H19伸縮振動。

圖3 N-乙?;?5-甲氧基色胺分子的紅外振動光譜

3 結語

應用Gaussian 09W軟件,采用密度泛函理論DFT/B3LYP方法,在6-31G(d)基組水平上,計算得到了N-乙?;?5-甲氧基色胺分子的最穩(wěn)定幾何構型,分析探討了該分子的結構特點。結果表明:該分子中的苯并吡咯環(huán)與20號和23號碳原子以及甲氧基處于同一平面,而與N-乙?;辉谕黄矫嫔?;13號氧原子和20號碳原子與苯并吡咯環(huán)共同構成共軛體系,而N-乙?;?4號碳不共軛。用同樣的方法,計算了該分子的紅外振動光譜,對分子的紅外光譜分布規(guī)律進行了研究,并對其紅外光譜峰位進行了歸屬。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),分子的紅外光譜中,在0~385 cm-1區(qū)域,主要是苯環(huán)上的甲氧基和吡咯環(huán)上的N-乙?;膹澢駝?;在400~485 cm-1區(qū)域,主要是苯并吡咯環(huán)的面內搖擺振動;在490~1 100 cm-1區(qū)域,主要是碳氫或氮氫的彎曲振動;整個光譜的最強峰出現(xiàn)在1 713.62 cm-1處,是羰基伸縮振動;次強峰出現(xiàn)在1 233.54 cm-1處,是甲基的碳氫彎曲振動峰;與次強峰強度相當?shù)恼駝臃宄霈F(xiàn)在1 397.46 cm-1處,是由碳氮伸縮振動和碳氫的左右搖擺振動復合引起的。

[1] 威廉莫森,瑞杰森. 褪黑激素的奇跡[M].臺北:臺北科技出版社,1995.

[2] Szmuszkovicz J, Anthony W C. Synthesis of N-acetyl-5-methoxytryptamine[J]. J Org Chem Soc,1960,25:857-859.

[3] 甘永平,馬淳安,張文魁,等. N-乙?;?5-甲氧基色胺的合成研究[J]. 浙江工業(yè)大學學報,2001,29(1):9-13.

[4] 丁紹民,甘永平,宋華付. N-乙?;?5-甲氧基色胺的合成[J]. 北京理工大學學報,1999,19(1):95-97.

[5] 劉存海,張勇,柳葉,等. 鹽酸克倫特羅的密度泛函理論研究[J]. 計算機與應用化學,2014,3(2):223-225.

[6] 潘鐵英,張玉蘭,蘇克曼. 波譜解析法[M]. 上海:華東理工大學出版社,2009.

責任編輯鄭練

StudyonIRSpectrumofN-(5-methoxyindol-3-yl)ethylAcetamidebyDensityFunctionalTheory

SU Xuejun, ZHANG Jilei

(Department of Basic Experiment, Naval Aeronautical and Astronautical University, Yantai 264000, China)

On the basis of Gaussian 09W software, the geometry optimization of N-(5-methoxy indol-3-yl)ethyl acetamide molecule is performed by using density functional theory (DFT) method at B3LYP/6-31G(d) level. From the calculation we get the steady configuration of the title molecule. On the basis of the optimized configuration, the infra-red (IR) vibrational data is obtained by the same method, and the data is converted into IR spectrum by gaussview graphies software. Then the spectrum is analyzed and assigned.

N-(5-methoxy indol-3-yl)ethyl acetamide, density functional theory, IR spectrum

O 641

:A

蘇學軍(1967-),男,教授,碩士,主要從事功能材料制備表征等方面的研究。

2015-04-07

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