国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

DNA甲基化標(biāo)志物的無創(chuàng)性檢測(cè)在肺癌早期診斷中的應(yīng)用

2015-08-15 00:43:39周曉萌黃家強(qiáng)
生物技術(shù)世界 2015年7期
關(guān)鍵詞:創(chuàng)性甲基化敏感性

周曉萌 黃家強(qiáng)

(北京交通大學(xué) 北京 100044)

1 背景

肺癌已成為危害人類生命健康的一種主要疾病,且發(fā)病率呈逐年上升趨勢(shì)。肺癌患者5年生存率僅有15%。靈敏特異的無創(chuàng)性早期篩查手段有助于提高癌癥患者的生存率。近年來的研究呈現(xiàn)愈加繁雜的候選分子遺傳和表觀遺傳標(biāo)志物及其組合,為肺癌的早期診斷提供了新的契機(jī)與挑戰(zhàn)[1]。理想的早期診斷標(biāo)志物應(yīng)具有較高的組織特異性。而理想的早期診斷應(yīng)是運(yùn)用無創(chuàng)性方法取得標(biāo)本,通過檢測(cè)敏感且具有組織特異性的分子標(biāo)志物,提示人體內(nèi)早期可能存在的異常變化及潛在威脅。近年來DNA甲基化標(biāo)志物在肺癌的早期診斷發(fā)揮越來越重要的作用,為發(fā)展無創(chuàng)性方法研究特異性肺癌早期標(biāo)志物奠定了基礎(chǔ)[1,2]。

2 肺癌早期的無創(chuàng)性檢測(cè)

2.1 肺癌病人血液中DNA甲基化的檢測(cè)

腫瘤細(xì)胞可釋放DNA到血液循環(huán)系統(tǒng)內(nèi),在癌癥病人血清和血漿內(nèi)可以檢測(cè)到異常的較高濃度的循環(huán)DNA[3]。Usadel H等通過比較研究發(fā)現(xiàn),基因APC的啟動(dòng)子區(qū)DNA甲基化(以下簡(jiǎn)稱DNA甲基化)在肺癌組織與對(duì)應(yīng) 血清、血漿樣本中具有相似的改變模式[4],提示血液樣本內(nèi)相關(guān)基因的表觀遺傳學(xué)的變化可作為腫瘤早期篩選的標(biāo)志物。多項(xiàng)研究先后發(fā)現(xiàn)APC,AIM1,CDH1,CDH13,DAPK1,DCC,GSTP1,FHIT,MGMT,p16,RARβ2,RASSF1A和WIF1等基因在肺癌病人血液樣本中呈現(xiàn)高DNA甲基化,而在良性肺疾病患者或健康人血清中則很少甚至檢測(cè)不到[5-8]。但利用血液樣本中單個(gè)基因DNA甲基化狀態(tài)評(píng)估肺癌,存在著敏感性較低的問題,通過聯(lián)合檢測(cè)多個(gè)基因DNA甲基化狀態(tài)即表觀遺傳標(biāo)志物組合有望兼顧肺癌早期診斷的敏感性和特異性[6-8]。如肺癌病人血清內(nèi)單基因DCC的DNA甲基化用于肺癌檢測(cè),雖特異性高達(dá)100%,但敏感性僅有35.5%,而通過聯(lián)合評(píng)估5個(gè)基因APC,CDH1,MGMT,RASSF1A和AIM1的甲基化狀態(tài),可使檢測(cè)肺癌的敏感性提高到75%,特異性也可達(dá)到73%[7]。

目前鑒定血液中DNA甲基化作為檢測(cè)早期肺癌的標(biāo)志物亟待解決兩個(gè)關(guān)鍵問題。首先是能否有效收集到肺癌發(fā)生早期過程中血液循環(huán)DNA并檢測(cè)相關(guān)DNA甲基化變化。其次是待檢基因的組織特異性,因?yàn)檠簶?biāo)本不具有器官特異性,在血液中檢測(cè)出的DNA甲基化變化可能源于某個(gè)或多個(gè)組織,如在肺癌患者血液中檢測(cè)到基因APC和RUNX3 DNA甲基化變化,也可在其它癌癥中同時(shí)檢測(cè)到[4,9]。近年來組織特異差異甲基化區(qū)域(tissue-specific differentially methylated regions, T-DMRs)在決定基因特異性表達(dá)、細(xì)胞分化、個(gè)體發(fā)育中的調(diào)控作用逐漸引起關(guān)注[10,11],T-DMRs的異??赡軐?dǎo)致腫瘤相關(guān)基因的異常表達(dá)并可能呈現(xiàn)基因特異性,為解決DNA基因甲基化作為早期診斷標(biāo)志物的組織特異性問題提供了有利線索。

2.2 肺癌病人痰液中DNA甲基化的檢測(cè)

許多吸煙者和既往吸煙者支氣管分泌物增加,產(chǎn)生的痰液含有來自下呼吸道內(nèi)的脫落細(xì)胞,這使得痰液分子與細(xì)胞學(xué)發(fā)展成為生物標(biāo)志物研究的活躍領(lǐng)域之一[12]。如研究發(fā)現(xiàn)在肺癌病人痰液樣本和組織樣本內(nèi)均可檢測(cè)出基因p16異常高DNA甲基化,而在良性肺疾病患者或無癌健康人痰液樣本內(nèi)均未檢出[13]。雖然多項(xiàng)研究均報(bào)道多種腫瘤都伴有p16高DNA甲基化現(xiàn)象,但聯(lián)合檢測(cè)評(píng)估多個(gè)基因DNA甲基化同樣的有利兼顧肺癌診斷的靈敏性和特異性。如以p16、MGMT、DAPK、RASSF1A、PAX5和GATA5這6個(gè)基因DNA甲基化作為評(píng)價(jià)指標(biāo),其中3個(gè)基因DNA甲基化陽性的病患發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)增加6.5倍,用于高風(fēng)險(xiǎn)人群的肺癌發(fā)病率驗(yàn)證性篩查的敏感性和特異性達(dá)到65%[13]。

痰液作為肺癌的篩選工具有以下優(yōu)勢(shì):首先是痰液易于通過無創(chuàng)性方法獲得,其次痰液內(nèi)含有來自肺和下呼吸道的細(xì)胞,具有較高的肺組織特異性。然而不足之處就是痰液中的細(xì)胞主要來自肺中心部位,因此可能不適合檢測(cè)發(fā)生在肺周圍的腺癌,而對(duì)于發(fā)生在肺中心部位的鱗癌可能會(huì)有更高的診斷價(jià)值。

2.3 前景

DNA甲基化已成為癌癥早期診斷和預(yù)后的分子標(biāo)志物。通過人體體液無創(chuàng)性檢測(cè)肺癌內(nèi)異常DNA甲基化,有望成為一種優(yōu)于其它檢測(cè)方法的肺癌早期篩查手段,但是挑戰(zhàn)依然存在。首先是由于受試對(duì)象年齡,性別,吸煙史,所處的病理階段等的不同,研究者在不同群體所得到的甲基化率差異很大,需要建立系統(tǒng)完善的臨床調(diào)查體系,規(guī)范標(biāo)本及臨床信息收集與樣本檢測(cè);其次是嘗試用于肺癌早期診斷的基因DNA甲基化的改變無法確定肺組織特異性甚至相關(guān)性,采用大規(guī)模臨床標(biāo)本的進(jìn)一步篩查驗(yàn)證,存在時(shí)效與準(zhǔn)確性諸多問題;最后DNA甲基化尤其是T-DMRs調(diào)控基因的細(xì)胞組織特異性及其與肺癌特異的相關(guān)性研究甚少,系統(tǒng)比較正常與肺癌組織中T-DMRs,可能有助于克服上述存在的時(shí)效與準(zhǔn)確性等問題。

目前隨著高通量測(cè)序及微量檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展,使得系統(tǒng)繪制各種腫瘤的全基因組比較甲基化圖譜成為可能。組織,器官和個(gè)體特異性的甲基化標(biāo)志物有望被鑒定出來用于肺癌的早期診斷試劑盒的開發(fā)。最近一項(xiàng)研究表明,RASSF1A基因DNA甲基化用于肺癌病人痰液樣本檢測(cè),敏感性達(dá)45%,結(jié)合細(xì)胞學(xué)診斷 則可提高到52%,而且保持相似的特異性(94%)[14],提示通過充分結(jié)合肺癌早期病理變化特點(diǎn)與體液標(biāo)本的來源,優(yōu)化匹配相應(yīng)的甲基化標(biāo)志物組合,有助于提高肺癌早期診斷的特異性與敏感性,為表觀遺傳學(xué)應(yīng)用于肺癌的精準(zhǔn)醫(yī)療提供強(qiáng)有力工具。

[1]Langevin SM, et al. Epigenetics of lung cancer. Transl Res.2015; 165:74-90.

[2]Walter K, et al. Discovery and development of DNA methylation-based biomarkers for lung cancer. Epigenomics. 2014; 6:59-72.

[3]Johnson PJ, Lo YM. Plasma nucleic acids in the diagnosis and management of malignant disease. Clin Chem, 2002; 48:1186-93.

[4]Usadel H, et al. Quantitative adenomatous polyposis coli promoter methylation analysis in tumor tissue, serum, and plasma DNA of patients with lung cancer. Cancer Res; 2002; 62:371-5.

[5]Ulivi P, et al. p16INK4A and CDH13 hypermethylation in tumor and serum of non-small cell lung cancer patients. J Cell Physiol, 2006; 206:611-5.

[6]Liu Z, et al. CpG island methylator phenotype involving chromosome 3p confers an increased risk of non-small cell lung cancer. J Thorac Oncol, 2010; 5:790-7.

[7]Begum S, et al. An epigenetic marker panel for detection of lung cancer using cell-free serum DNA. Clinical Cancer Research,2011; 17:4494-503.

[8]Yang X, et al. Epigenetic markers for noninvasive early detection of nasopharyngeal carcinoma by methylation-sensitive high resolution melting. Int J Cancer. 2015;136:E127-35.

[9]Li QL, et al. Transcriptional silencing of the RUNX3 gene by CpG hypermethylation is associated with lung cancer. Biochemical and biophysical research communications, 2004; 314:223-8.

[10]Carr MS, et al. Allele-specific histone modifications regulate expression of the Dlk1-Gtl2 imprinted domain. Genomics, 2007;89:280-90.

[11]Carvalho RH, et al. Genomewide DNA methylation analysis identifies novel methylated genes in non-small-cell lung carcinomas. J Thorac Oncol, 2013, 8:562-73.

[12]Belinsky SA, et al. Promoter hypermethylation of multiple genes in sputum precedes lung cancer incidence in a high-risk cohort. Cancer Res, 2006, 66:3338-44.

[13]Hubers AJ, et al. DNA hypermethylation analysis in sputum for the diagnosis of lung cancer: training validation set approach. Br J Cancer. 2015; 112:1105-13.

[14]Hubers AJ, et al. Methylation analysis in spontaneous sputum for lung cancer diagnosis. Lung Cancer. 2014; 84:127-33.

猜你喜歡
創(chuàng)性甲基化敏感性
尿液外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)在糖尿病腎病無創(chuàng)性診斷中價(jià)值
早期血管老化無創(chuàng)性評(píng)估指標(biāo)研究進(jìn)展
釔對(duì)Mg-Zn-Y-Zr合金熱裂敏感性影響
AH70DB鋼焊接熱影響區(qū)組織及其冷裂敏感性
焊接(2016年1期)2016-02-27 12:55:37
如何培養(yǎng)和提高新聞敏感性
新聞傳播(2015年8期)2015-07-18 11:08:24
超聲造影時(shí)間強(qiáng)度曲線無創(chuàng)性定量分析代償期肝硬化的診斷效能
鼻咽癌組織中SYK基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化分析
胃癌DNA甲基化研究進(jìn)展
微小RNA與食管癌放射敏感性的相關(guān)研究
基因組DNA甲基化及組蛋白甲基化
遺傳(2014年3期)2014-02-28 20:58:49
长武县| 辽宁省| 盐源县| 共和县| 六盘水市| 怀集县| 临安市| 云林县| 恩平市| 柞水县| 苍南县| 米林县| 元江| 石门县| 申扎县| 乌鲁木齐市| 新邵县| 秭归县| 丰顺县| 巴楚县| 靖边县| 兴安县| 青州市| 苏尼特左旗| 六安市| 台安县| 礼泉县| 莱西市| 高清| 永善县| 禹城市| 视频| 汝城县| 景谷| 梅河口市| 茂名市| 台中县| 呼伦贝尔市| 宁德市| 唐河县| 明光市|