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一種可快速感受機(jī)械力的傳感器細(xì)胞的理論設(shè)計方案

2015-10-19 12:33:58張英昊
科技視界 2015年29期
關(guān)鍵詞:傳感器細(xì)胞

張英昊

【摘 要】本文利用了兩類可對細(xì)胞所受機(jī)械力進(jìn)行響應(yīng)并介導(dǎo)鈣離子從細(xì)胞外流入胞質(zhì)的鈣離子通道,從理論上設(shè)計一種可響應(yīng)所受機(jī)械力并迅速將機(jī)械力轉(zhuǎn)換成適當(dāng)頻率和強度的熒光信號的傳感器細(xì)胞?;诖朔N理論基礎(chǔ),研究了胞質(zhì)鈣離子異常升高誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡的兩條信號通路??梢郧玫突蚯贸}凋亡途徑中的相關(guān)分子,抑制機(jī)械力刺激產(chǎn)生的鈣離子內(nèi)流誘發(fā)的凋亡作用,從而可以使傳感器細(xì)胞穩(wěn)定傳代。

【關(guān)鍵詞】機(jī)械力;傳感器;細(xì)胞;融合蛋白

生物發(fā)酵工程中最常用的工程細(xì)胞是各種細(xì)菌,放線菌,真菌,酵母等微生物。但是生產(chǎn)一些具有較多轉(zhuǎn)錄后修飾的代謝物質(zhì),如干擾素,各種細(xì)胞因子,糖蛋白,激素等,則不能使用微生物,因為微生物缺乏相關(guān)的修飾功能,生產(chǎn)出的物質(zhì)往往沒有活性。因此必須使用動物細(xì)胞。而動物細(xì)胞由于對環(huán)境比較敏感,比較難在大型生物反應(yīng)器中培養(yǎng)。而難以在反應(yīng)器中培養(yǎng)的一個原因是缺乏能直接反映細(xì)胞生理狀態(tài)的參數(shù)的檢測。眾所周知,生物反應(yīng)器的標(biāo)準(zhǔn)檢測參數(shù)是溫度,ph,融氧,以及攪拌器轉(zhuǎn)速。但是以這些有限的物理、化學(xué)參數(shù)來對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜而眾多的生理狀態(tài),顯然是無法精確反應(yīng)實際情況的,尤其是對環(huán)境比較敏感的動物細(xì)胞,往往是當(dāng)細(xì)胞中眾多的實際生理狀態(tài)已經(jīng)發(fā)生了劇烈變化,使細(xì)胞生長不佳甚至大量死亡后,上述的物理,化學(xué)參數(shù)才會有變化。因此,發(fā)酵中僅靠參數(shù)本身往往不能精確判斷發(fā)酵狀態(tài),而是要依賴于操作者的經(jīng)驗。

為了能夠解決這個問題,筆者考慮設(shè)計一種起傳感器作用的細(xì)胞,它與用于合成代謝物質(zhì)的細(xì)胞一同在生物反應(yīng)器中培養(yǎng),享受相同的環(huán)境。但是這種傳感器細(xì)胞是經(jīng)過改造的,它們能夠?qū)⒂捎谕饨绛h(huán)境變化而導(dǎo)致自身內(nèi)部發(fā)生改變的生理信號,直接轉(zhuǎn)化成可被檢測裝置感受的特定的物理或化學(xué)信號,為生物反應(yīng)器上相應(yīng)的控制軟件提供精確信息,從而對影響細(xì)胞生理狀態(tài)的微環(huán)境進(jìn)行精確檢測,并利用即時的反饋調(diào)節(jié)對生物反應(yīng)器參數(shù)進(jìn)行精確控制。

而本論文研究的是機(jī)械力對動物細(xì)胞的影響。由于動物細(xì)胞沒有細(xì)胞壁,對機(jī)械力是非常敏感的。然而動物細(xì)胞的生長及代謝物的合成都依賴氧氣,在生物反應(yīng)器中為了實現(xiàn)供氧,必須依賴于培養(yǎng)基的不斷流動,翻滾,攪拌,這往往會產(chǎn)生變化劇烈的剪切力,損害細(xì)胞。因此,供氧和對剪切力的控制是一對矛盾體,必須平衡考慮。如果能培養(yǎng)出一種能感受所受機(jī)械力以及機(jī)械力對自身生理狀態(tài)的影響,并迅速將其轉(zhuǎn)變成特定頻率的光信號的傳感器細(xì)胞,必然對供氧和受力的控制這一過程提供很大幫助。

綜上所述,本論文根據(jù)已有的研究內(nèi)容,從理論上設(shè)計一種滿足如上要求的,可感受機(jī)械力的傳感器細(xì)胞,并提出每一步驟中筆者能想到的可能的處理方法。

1 鈣離子通道感受機(jī)械力的機(jī)制研究

哺乳動物體內(nèi)在生理條件下有很多種感受機(jī)械力的途徑,典型如細(xì)胞粘附與胞外基質(zhì),其粘附產(chǎn)生的力調(diào)控細(xì)胞的分化與凋亡;血管內(nèi)皮細(xì)胞與胞外基質(zhì)粘附,當(dāng)血液流速過快或血管腔過窄時(即高血壓狀態(tài)),內(nèi)皮細(xì)胞可感受力的狀態(tài),從而促使合成舒張血管的NO前列腺素等物質(zhì)[1]。經(jīng)過大量研究,人們公認(rèn)這些能感受機(jī)械力的細(xì)胞表面有能夠介導(dǎo)胞外鈣離子內(nèi)流的trp家族離子通道,這些鈣離子通道介導(dǎo)了機(jī)械刺激時胞質(zhì)內(nèi)鈣離子的升高。但是,需要進(jìn)一步研究trp家族感受機(jī)械力的具體機(jī)制。

研究表明,用含有RGD的磁珠處理細(xì)胞,再加磁場,使磁力作用于整合素上,發(fā)現(xiàn)力作用于整合素上時細(xì)胞膜顯示出了很大的剛性,即抵抗形變,同時細(xì)胞核的形狀發(fā)生了改變;相對的,用磁珠偶聯(lián)抗原肽,再加磁場,使力作用于MHC時,細(xì)胞膜顯示出了柔性,而且細(xì)胞核的形狀未發(fā)生改變。他們認(rèn)為機(jī)械力通過整合素,傳給了在胞內(nèi)與整合素相連的細(xì)胞骨架,再由細(xì)胞骨架傳遞給細(xì)胞核,從而引起細(xì)胞核形狀變化以及調(diào)控基因的表達(dá)。而MHC由于沒有與細(xì)胞骨架相連,故受力時細(xì)胞膜顯示出了柔性。同時,機(jī)械力刺激胞外基質(zhì)ECM,產(chǎn)生與直接力刺激整合素相同的效果。這些研究闡明了機(jī)械力傳導(dǎo)的一種基本模式,即:

機(jī)械力刺激——ECM——整合素——細(xì)胞骨架——調(diào)控生理狀態(tài)

另外一些研究顯示,用機(jī)械力刺激間充質(zhì)干細(xì)胞(刺激方式為使用光鑷為偶聯(lián)在整合素上的小珠施加力),會引起細(xì)胞質(zhì)內(nèi)鈣離子的明顯升高。胞質(zhì)升高的鈣離子有兩個來源,一個是從胞外流入的,一個是從胞內(nèi)的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)流出而進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)的(在胞外無鈣的環(huán)境中,向細(xì)胞處理內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的鈣離子通道抑制劑,發(fā)現(xiàn)對機(jī)械力刺激不會引起胞質(zhì)鈣離子上升)。該研究組發(fā)現(xiàn)位于細(xì)胞膜上的介導(dǎo)胞外鈣離子流入胞質(zhì)的是trp家族離子通道trpm7。他們研究了細(xì)胞骨架扮演的作用:在無IP3時,在胞外無鈣環(huán)境中,用細(xì)胞骨架解聚劑處理,發(fā)現(xiàn)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)無法釋放鈣離子到胞質(zhì);而抑制內(nèi)質(zhì)網(wǎng)鈣通道,在胞外有鈣環(huán)境中,解聚細(xì)胞骨架,發(fā)現(xiàn)胞外鈣離子也無法流入。這些研究說明了trpm7和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的IP3receptor鈣通道對機(jī)械力的響應(yīng)機(jī)制正式通過整合素和細(xì)胞骨架作用的。事實上,另有文獻(xiàn)表明IP3r是直接與細(xì)胞骨架相連的。他們研究了trpm7和IP3r響應(yīng)機(jī)械刺激所需的時間:在機(jī)械刺激細(xì)胞上的整合素后,胞外鈣離子流入胞內(nèi)的平均時間是機(jī)械刺激后20秒,而內(nèi)質(zhì)網(wǎng)釋放鈣離子的平均時間是機(jī)械刺激后100秒。對于這一反應(yīng)時間的差異,該研究小組認(rèn)為是機(jī)械力沿著細(xì)胞骨架向細(xì)胞深處的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)傳遞時,細(xì)胞骨架要通過一些方式重構(gòu)來積累足夠強度的力學(xué)信號,這導(dǎo)致了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的鈣離子延遲釋放。

綜上,細(xì)胞對機(jī)械力的感受可分為ECM整合素、細(xì)胞骨架依賴性的胞質(zhì)鈣離子上升和非依賴型的胞質(zhì)鈣離子上升。ECM依賴性的機(jī)械力傳導(dǎo)機(jī)制可制作傳感器細(xì)胞用于對錨定依賴性細(xì)胞的培養(yǎng),如作為血管內(nèi)皮細(xì)胞生產(chǎn)前列腺素這一生產(chǎn)體系的傳感器細(xì)胞,大致的策略就是適當(dāng)調(diào)整整合素和胞外基質(zhì)和trpm7離子通道的表達(dá)量,實現(xiàn)鈣離子濃度對機(jī)械力刺激的最佳響應(yīng)。不過由于胞內(nèi)鈣離子的上升分別來自胞外和內(nèi)質(zhì)網(wǎng),而內(nèi)質(zhì)網(wǎng)釋放鈣離子,響應(yīng)速度較慢且與細(xì)胞膜流入鈣離子的響應(yīng)時間差距較大(一個100秒一個20秒),所以從鈣離子信號即時性和整齊性的角度考慮,可以敲除或下調(diào)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的IP3r鈣離子通道。而ECM非依賴性的Yvc1p鈣離子通道,可用于可懸浮培養(yǎng)的動物細(xì)胞的生產(chǎn)體系,比如培養(yǎng)巨噬細(xì)胞生產(chǎn)干擾素以及白介素等細(xì)胞因子。

2 由胞質(zhì)鈣離子變化的生理信號向可檢測的光學(xué)信號的轉(zhuǎn)化

生物體中可檢測的光學(xué)信號最容易想到的就是熒光蛋白。比較容易想到的一類生理狀態(tài)轉(zhuǎn)化為光學(xué)信號的方式是通過一系列信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程調(diào)控?zé)晒獾鞍椎谋磉_(dá)量的變化,從而改變亮度。這些調(diào)控轉(zhuǎn)錄的途徑研究成果非常多,比如camp-creb途徑、CaM CaN NFAT途徑、Nf-kapa b途徑等等。但是改變熒光蛋白的表達(dá)量必須走轉(zhuǎn)錄翻譯過程,而這個過程無疑是很耗費時間的,通常情況下,在多種信號通路中,適當(dāng)?shù)男盘柎碳ひ鸬哪撤N分子的表達(dá)量的變化,至少也要五到六個小時才會有明顯差異。因此基因表達(dá)量調(diào)控的方式雖然適合開發(fā)藥物,但是與細(xì)胞傳感器即時性的要求是不符合的。故鈣離子向光信號轉(zhuǎn)化,只能依賴化學(xué)反應(yīng)。

鈣離子成像,最常用的是一種叫fura-am的染料,該染料是脂溶性的,能透過細(xì)胞膜,然后被酯酶分解形成不透膜的fura留于胞內(nèi),與鈣離子定量結(jié)合,發(fā)射熒光。但是這種染料必須人為加入細(xì)胞,而無法讓細(xì)胞自己產(chǎn)生。而在實際的生產(chǎn)系統(tǒng)中是不可能嚴(yán)格區(qū)分生產(chǎn)細(xì)胞和傳感細(xì)胞的,若統(tǒng)一加入染料,由生產(chǎn)細(xì)胞產(chǎn)生的胞內(nèi)鈣熒光,可以想象,會是一種強烈的背景干擾。因此,最好還是只對傳感細(xì)胞進(jìn)行改造。

根據(jù)前人的研究結(jié)果,可以使用一種融合的熒光蛋白。該熒光蛋白利用了熒光共振轉(zhuǎn)移(FRET)原理。事先已大量表達(dá)于細(xì)胞質(zhì)中,在為結(jié)合與結(jié)合鈣離子時會擁有不同的構(gòu)象,在未結(jié)合鈣離子時發(fā)青光,結(jié)合時發(fā)紅光。根據(jù)這兩種頻率光的強度的比值,可以精確探測出胞內(nèi)鈣離子的濃度。而且這種探測是幾乎即時的,因為不涉及轉(zhuǎn)錄翻譯,僅僅是由于鈣離子出現(xiàn)導(dǎo)致的構(gòu)象變化。

3 排除胞質(zhì)鈣離子濃度上升介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡的影響

細(xì)胞凋亡是一種相對比較溫和的過程,不發(fā)生炎癥反應(yīng)[2]。細(xì)胞凋亡上游的影響因素很多,涉及多種不同的信號級聯(lián)反應(yīng)。但它們有共同的下游途徑,即激活bax/bak蛋白二聚化,定位于線粒體膜,使線粒體膜通透性喪失,內(nèi)容物流出;然后凋亡又分為caspase 依賴和非依賴途徑,其中依賴途徑研究較清楚,即線粒體釋放的細(xì)胞色素c和apaf-1,與胞質(zhì)中caspase9,形成復(fù)合體,并激活caspase3,誘導(dǎo)凋亡。而非凋亡途徑則由線粒體釋放的凋亡誘導(dǎo)因子(aif)引發(fā),具體機(jī)制尚不清楚。凋亡的最終途徑是染色體斷裂成小碎片,與細(xì)胞器聚集在一起后,被表達(dá)有磷脂酰絲氨酸作吞噬信號的質(zhì)膜包裹成小球,被臨近細(xì)胞識別吞噬。由于細(xì)胞凋亡總伴隨著凋亡小體形成,因此可以用TUNNEL實驗,來定量化反應(yīng)細(xì)胞凋亡程度,這也是下面的文獻(xiàn)中的凋亡程度的評價方法。

而根據(jù)已有的研究[3],胞質(zhì)鈣離子的異常升高,是誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的一個重要因素。而我們的傳感器細(xì)胞感受機(jī)械力的原理就是胞質(zhì)鈣離子升高,因此必須對細(xì)胞感受鈣離子的凋亡通路進(jìn)行研究,并削弱這一通路。在正常細(xì)胞中,由腫瘤壞死因子結(jié)合死亡受體,激活caspas8,從而切割bid為t-bid(truncated bid),t-bid與線粒體上的bak/bax結(jié)合,在線粒體上形成孔道,促使線粒體內(nèi)容物釋放誘發(fā)凋亡。而在胞質(zhì)鈣離子升高時,鈣離子會激活鈣蛋白酶calpain,calpain可在bid的gly70和arg71之間切割形成t-bid(這里使用了gst-pull down方法,分離切割后的片段,在進(jìn)行末端測序得到切割位點),進(jìn)而促使細(xì)胞凋亡。

而另一條鈣離子介導(dǎo)的凋亡通路也被發(fā)現(xiàn),即正常時磷酸化的Bad蛋白與14-3-3蛋白結(jié)合維持細(xì)胞存活狀態(tài),這種bad的磷酸化是由多種上游信號通路介導(dǎo)的其中的兩個例子是mapk家族的mekk和蛋白激酶B(即akt)[4];鈣離子激活鈣調(diào)蛋白磷酸酶(CaN),使其去磷酸化,與14-3-3蛋白解離;解離后Bad與Bcl2-bak復(fù)合體作用,置換出游離的bak;游離的bak二聚化,暴露bak的N末端(該末端可作為抗原表位,能夠以熒光抗體的方法衡量bak的促凋亡活化程度),然后插入線粒體膜,形成孔道釋放內(nèi)容物,誘發(fā)凋亡。用calpain的抑制劑處理細(xì)胞,在測量二聚化的bax的量,發(fā)現(xiàn)bax的表達(dá)量不受影響,這進(jìn)一步證實了鈣離子引發(fā)的bid被切割誘發(fā)凋亡和bad被磷酸化誘導(dǎo)的凋亡分屬兩條不同的途徑。然而,后來又有研究表明,在缺失bak/bax,只有t-bid的存在不會使線粒體通透性喪失,而只有bak/bax沒有t-bid時bax能轉(zhuǎn)位與線粒體但沒有通透線粒體的作用,推測與bax同源的bak也有相同的效果。因此t-bid是bax/bak促凋亡的激活劑[4]。4 結(jié)論

根據(jù)上述文獻(xiàn)的結(jié)果進(jìn)行歸納總結(jié),可得出鈣離子介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡的通路如圖1:

因此,如果要制作傳感器細(xì)胞,可以考慮敲除bid 敲除bax/bak calpain CaN,或者可以用低效率的啟動子下調(diào)這些基因的表達(dá)。

如上便是可感受機(jī)械力的傳感器細(xì)胞的簡要設(shè)計方案。

相信隨著生物產(chǎn)業(yè)的發(fā)展以及對生物發(fā)酵產(chǎn)品的品質(zhì)要求不斷提高,適應(yīng)于動物細(xì)胞發(fā)酵條件的精確控制的傳感器細(xì)胞會大有用武之地。在必要的時候,可以考慮引入一些特定的支架分子,它們能夠?qū)⒓?xì)胞感受缺氧和營養(yǎng)缺乏的上游信號,不通過經(jīng)典的調(diào)控轉(zhuǎn)錄翻譯途徑,而是將其引向一種人為設(shè)計的或者與經(jīng)典途徑不相干的,可快速反應(yīng)的新途徑,即對細(xì)胞進(jìn)行信號通路的嫁接和改造。當(dāng)然,研發(fā)能夠快速感應(yīng)生理信號并將其轉(zhuǎn)變?yōu)樘囟蓹z測的物理化學(xué)信號的生物傳感分子(比如本文中使用的熒光探針)也是必不可少的。

【參考文獻(xiàn)】

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[責(zé)任編輯:侯天宇]

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