高迎春,張傳領(lǐng),牛麗麗,溫建勛,程國強(qiáng),肖 瑞(內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)分子病理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,呼和浩特 00059;內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院;共同第一作者;通訊作者,E-mail:xiaorui79@hotmail.com)
SNAPIN 蛋白(SNAP-associated protein,SNAPAP;BLOC1S7)又稱突觸小體相關(guān)蛋白,最初是在神經(jīng)細(xì)胞中作為與可溶性NSF附著蛋白受體(soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor,SNARE)復(fù)合物中的SNAP-25蛋白結(jié)合被發(fā)現(xiàn)的,在神經(jīng)元中表達(dá)量豐富,主要分布在突觸囊泡膜上[1],參與囊泡融合以及神經(jīng)遞質(zhì)的釋放。后有研究發(fā)現(xiàn)SNAPIN在神經(jīng)細(xì)胞和非神經(jīng)細(xì)胞的胞質(zhì)中均有表達(dá)。
SNAPIN是由136個氨基酸組成的相對分子質(zhì)量約為15 000的蛋白,其二級結(jié)構(gòu)大部分為α螺旋[2],N末端有一個疏水區(qū)(1-20aa),C末端有由兩個螺旋區(qū)H1和H2形成的卷曲螺旋(coiled-coil),該螺旋結(jié)構(gòu)域在許多囊泡融合蛋白中保守存在。研究發(fā)現(xiàn)SNAPIN蛋白功能的發(fā)揮主要通過卷曲螺旋與其他蛋白相互作用來實(shí)現(xiàn)。SNAPIN是一種廣泛表達(dá)的蛋白,在心臟、肝臟、腎臟中均有表達(dá)[3],提示該蛋白可能在不同組織中發(fā)揮不同的作用。SNAPIN除與SNAP25結(jié)合之外,還與雌激素受體結(jié)合位點(diǎn)相關(guān)抗原 9(EBAG9)[4],cypin[5],casein kinase 1-delta[6],a subunit of Exo70[7],經(jīng)典瞬時受體電位 6(TRPC6)[8],膜轉(zhuǎn)運(yùn)調(diào)控蛋白 1(EHD1)[9],腺苷酸環(huán)化酶Ⅵ(type Ⅳ adenylyl cyclase)[10],ryanodine receptor[11],受體酪氨酸激酶 c-MET[12],UT-A1 urea transporter[13]等蛋白相互作用。其中 c-MET酪氨酸激酶受體主要在上皮細(xì)胞中表達(dá),參與胚胎發(fā)育、創(chuàng)傷恢復(fù)、組織重生和形態(tài)分化等;在病理狀態(tài)下,c-MET和肝細(xì)胞因子(hepatocyte growth factor,HGF)可誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞的增殖、細(xì)胞擴(kuò)散、血管形成、細(xì)胞黏附、細(xì)胞侵襲、細(xì)胞運(yùn)動和抗凋亡等作用。
本實(shí)驗(yàn)通過實(shí)時定量PCR的方法在轉(zhuǎn)錄水平上來研究SNAPIN基因沉默和過表達(dá)后,其相互作用蛋白c-MET的表達(dá),觀察SNAPIN蛋白的表達(dá)及其對相關(guān)蛋白c-MET表達(dá)是否具有調(diào)控作用。
HEK 293T細(xì)胞(人胚腎上皮細(xì)胞系)購置于上海中科院細(xì)胞庫,質(zhì)粒pEGFP-C1(內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)師永紅饋贈),大腸桿菌DH5a(內(nèi)蒙古自治區(qū)分子病理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存),限制性內(nèi)切酶XhoⅠ和EcoRⅠ(Takara,Japan),分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)品(DL3000,天根生物),Stealth siRNA sets(Cat.1299001,Invitrogen,USA),Trizol(上海生工),反轉(zhuǎn)錄試劑盒(Takara,Japan),SYBR green熒光定量PCR試劑盒(Takara,Japan),質(zhì)粒提取試劑盒(天根生物),膠回收試劑盒(Qiagen,USA),PCR引物合成及重組質(zhì)粒測序(上海生工),DMEM培養(yǎng)基(Gibco,USA),胎牛血清(杭州四季青),LipofectamineTM2 000(Invitrogen,USA)。
1.2.1 重組載體構(gòu)建 以Trizol法提取HEK 293T細(xì)胞的總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,PCR擴(kuò)增獲取全長產(chǎn)物,上游引物:5'-ATC TCG AGC AGG ACA ATT CGT GAT GG-3'(含XhoI酶切位點(diǎn));下游引物:5'-GAA TTC TCA TCT GTT ATT TGC CTG GG-3'(含EcoRⅠ酶切位點(diǎn))。PCR產(chǎn)物大小約431 bp。擴(kuò)增條件:95℃預(yù)變性5 min,94℃ 30 s,59℃30 s,72 ℃ 30 s,循環(huán)35 次,72 ℃延伸5 min。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)酶切純化后與相同酶切處理的載體pEGFP-C1連接。通過電穿孔轉(zhuǎn)化到E.coli DH5α中,接種培養(yǎng)后,隨機(jī)挑選單克隆通過PCR,酶切反應(yīng)和測序鑒定。
1.2.2 細(xì)胞培養(yǎng)和轉(zhuǎn)染 HEK 293T細(xì)胞用含10%FBS的DMEM高糖培養(yǎng)液培養(yǎng),按2×105個細(xì)胞/孔接種于無菌6孔板中,次日待細(xì)胞生長至60%-70%融合度時進(jìn)行轉(zhuǎn)染。按LipofectamineTM2000脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑盒說明,將pEGFP-SNAPIN(過表達(dá)重組質(zhì)粒)或Stealth siRNA(RNA干擾片段)分別轉(zhuǎn)染至HEK 293T細(xì)胞中培養(yǎng)24-48 h,收集細(xì)胞進(jìn)行基因表達(dá)檢測。同時設(shè)立未轉(zhuǎn)染細(xì)胞對照組。以上各細(xì)胞為同代細(xì)胞,細(xì)胞計數(shù)和培養(yǎng)條件等均保持一致,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
1.2.3 RNA提取和實(shí)時定量PCR Trizol法提取總RNA,以2 μg總RNA為模板進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,以表1引物、SYBR Green熒光染料(Takara,Japan)相對定量PCR檢測,以GAPDH為內(nèi)參。反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性15 s,95℃變性15 s,退火15 s(退火溫度見表1),72℃延伸20 s,共40個循環(huán)。引物設(shè)計采用primer 5.0軟件,委托上海生工公司合成(見表1)。
表1 實(shí)時定量PCR實(shí)驗(yàn)的引物序列和相應(yīng)的退火溫度Table 1 Primer sequences and corresponding annealing temperature for real-time PCR
實(shí)時定量 PCR結(jié)果采用2-ΔΔCt法,其中 ΔΔCt=(Ct目標(biāo)基因-Ct內(nèi)參基因)樣本-(Ct目標(biāo)基因-Ct內(nèi)參基因)對照。數(shù)據(jù)以±s表示,采用SPSS 10.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行t檢驗(yàn)。各組間樣本均數(shù)進(jìn)行單因素方差分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
通過PCR擴(kuò)增獲得人的SNAPIN全長基因(431 bp,見圖 1)。
圖1 PCR擴(kuò)增獲得人全長SNAPIN基因Figure 1 The amplification of SNAPIN mRNA by PCR
隨機(jī)挑選6個轉(zhuǎn)化質(zhì)粒進(jìn)行PCR驗(yàn)證,瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果顯示6個質(zhì)粒中均可擴(kuò)增出全長SNAPIN基因,提示重組載體構(gòu)建成功(見圖2)。針對其中兩個轉(zhuǎn)化質(zhì)粒進(jìn)行XhoⅠ和EcoRⅠ酶切反應(yīng),驗(yàn)證重組載體構(gòu)建成功(見圖3)。將上述方法驗(yàn)證過的重組質(zhì)粒進(jìn)行雙向測序,測序結(jié)果(見圖4)經(jīng)BLAST比對后證實(shí)SNAPIN成功插入PEGFP載體中。以上三種驗(yàn)證方法證明成功構(gòu)建pEGFP-SNAPIN熒光蛋白表達(dá)重組載體。
圖2 PCR反應(yīng)擴(kuò)增SNAPIN驗(yàn)證重組質(zhì)粒Figure 2 The recombinant plasmids confirmed by PCR
轉(zhuǎn)染48 h后在熒光顯微鏡下觀察細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率(見圖5),結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染效率較高,可用于后續(xù)分析。
圖3 酶切反應(yīng)驗(yàn)證重組質(zhì)粒Figure 3 The identification of recombinant plasmids by double enzyme digestion
圖4 pEGFP-SNAPIN重組質(zhì)粒測序結(jié)果原始圖譜Figure 4 The partial sequencing result of pEGFP-SNAPIN
圖5 轉(zhuǎn)染pEGFP-SNAPIN后的HEK 293T細(xì)胞Figure 5 The pEGFP-SNAPIN transfected HEK 293T cells
分別用構(gòu)建好的pEGFP-SNAPIN表達(dá)載體和合成的siRNA SNAPIN干擾片段轉(zhuǎn)染到HEK 293T細(xì)胞后用ABI的7500fast熒光定量PCR儀進(jìn)行定量PCR實(shí)驗(yàn),檢測 SNAPIN表達(dá)的改變。SNAPIN、c-MET和GAPDH的擴(kuò)增曲線良好,說明反應(yīng)正常進(jìn)行。融解曲線呈單峰,說明引物擴(kuò)增特異性強(qiáng)(見圖6)。
圖6 SNAPIN,GAPDH,c-MET的融解曲線Figure 6 The melting curves of SNAPIN,GAPDH and c-MET gene
實(shí)時定量PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染了表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-SNAPIN后的HEK 293T細(xì)胞中SNAPIN的表達(dá)量顯著上調(diào)(P<0.05,見表2),在siRNA沉默SNAPIN基因后,轉(zhuǎn)錄水平上SNAPIN的表達(dá)下調(diào)(P<0.05)。在 SNAPIN過表達(dá)的細(xì)胞中,c-MET的表達(dá)隨之顯著上調(diào) 1.75倍(P<0.05);反之SNAPIN基因沉默后,分析發(fā)現(xiàn)c-MET的表達(dá)也隨之下調(diào),是正常細(xì)胞表達(dá)水平的 0.73倍(P<0.05)。
表2 SNAPIN、c-MET和GAPDH實(shí)時定量PCR中相對表達(dá)結(jié)果Table 2 The relative expression of SNAPIN,c-MET and GAPDH by real-time quantitative PCR
SNAPIN蛋白在神經(jīng)細(xì)胞和非神經(jīng)細(xì)胞中表達(dá),在人全身各組織中均有表達(dá),提示該蛋白具有廣泛的生物學(xué)功能。由Kunt&AliceWallenberg基金支持近期開展的Human Protein Atlas項(xiàng)目中發(fā)現(xiàn)SNAPIN除了在正常組織中表達(dá)外,還在多種腫瘤組織中表達(dá),尤其是結(jié)直腸癌、乳腺癌、甲狀腺癌、卵巢癌、惡性黑色素瘤、子宮內(nèi)膜癌等中高表達(dá)(http://www.proteinatlas.org/ENSG00000143553-SNAPIN/cancer)。SNAPIN也可以與很多不同生理過程中的蛋白相互作用,說明SNAPIN是一個多功能蛋白,最新研究發(fā)現(xiàn),SNAPIN和體外放射治療緩解期的非轉(zhuǎn)移性前列腺癌男性的疲勞惡化相關(guān)[14]。
在Christian等[15]2004年的研究中發(fā)現(xiàn)SNAPIN可與原癌基因編碼的蛋白產(chǎn)物c-MET相互作用,該蛋白是肝細(xì)胞生長因子受體酪氨酸激酶,其與多種癌基因產(chǎn)物和調(diào)節(jié)蛋白相互作用,參與細(xì)胞信息傳導(dǎo)、胚胎發(fā)育、細(xì)胞骨架重排的調(diào)控以及腫瘤發(fā)生過程,是細(xì)胞增殖和分化重要因素。c-MET在多種腫瘤中,如胃腫瘤、彌散型星形細(xì)胞瘤、乳腺癌、前列腺癌高表達(dá),可增加蛋白轉(zhuǎn)錄而減少基因擴(kuò)增,且c-MET的高表達(dá)與耐藥性相關(guān)[16]。
SNAPIN是c-MET的相互作用蛋白,而SNAPIN的另一個相互作用蛋白SNAP-25可以與肝細(xì)胞生長因子調(diào)控的酪氨酸激酶作用底物HRS發(fā)生作用,該蛋白通過將c-MET定位至溶酶體而參與c-MET的降解過程。而本研究發(fā)現(xiàn)c-MET在HEK 293T細(xì)胞的表達(dá)受到SNAPIN的調(diào)控,提示在HEK 293T細(xì)胞中SNAPIN可能通過與c-MET結(jié)合來調(diào)控c-MET的表達(dá),提示SNAPIN很可能與這些蛋白做為一個蛋白復(fù)合體而存在,或者參與調(diào)控該生理過程。由于在不同細(xì)胞、不同分化階段作用的底物不同,c-MET在不同的條件下表現(xiàn)出多種不同的功能,如促進(jìn)肝細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞和黑色素細(xì)胞的分裂;引起上皮細(xì)胞的分散,在胚胎發(fā)育過程中控制細(xì)胞的移動;誘導(dǎo)細(xì)胞形態(tài)變化等。以上研究提示我們,SNAPIN可能調(diào)節(jié)c-MET參與細(xì)胞生理過程,但具體作用機(jī)制仍需進(jìn)一步研究,本研究對于揭示SNAPIN蛋白在其他生理途徑中的功能是非常有意義的。
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