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革蘭陽性球菌對(duì)利奈唑胺耐藥機(jī)制的研究*

2016-01-11 09:23許宏濤陳東科賴惠英北京醫(yī)院檢驗(yàn)科國家老年醫(yī)學(xué)研究中心北京100730
關(guān)鍵詞:糞腸革蘭球菌

許宏濤,陳東科,賴惠英(北京醫(yī)院檢驗(yàn)科 國家老年醫(yī)學(xué)研究中心,北京 100730)

利奈唑胺(linezolid,LZD)是一種新型惡唑烷酮類抗生素,2000年在美國上市,主要應(yīng)用于萬古霉素耐藥腸球菌(VRE)、甲氧西林耐藥金黃色葡萄球菌(MRSA)、青霉素耐藥鏈球菌等多重耐藥革蘭陽性球菌的治療。因?yàn)樽匀唤缰腥狈μ烊荒退幓驇?,理論上不易出現(xiàn)利奈唑胺耐藥;但事實(shí)并非如此,2001年美國哈弗大學(xué)醫(yī)學(xué)院報(bào)道了第一株利奈唑胺耐藥的MRSA[1]。而后,多個(gè)國家出現(xiàn)了利奈唑胺耐藥葡萄球菌的暴發(fā)性流行。我們收集了2012年1月~2014年12月我院臨床標(biāo)本中出現(xiàn)的6株利奈唑胺耐藥革蘭陽性球菌,對(duì)分子流行病學(xué)及其主要耐藥分子機(jī)制進(jìn)行了初步研究。

1 材料與方法

1.1 菌株來源 收集2012年1月~2014年12月我院臨床標(biāo)本中對(duì)利奈唑胺耐藥的革蘭陽性球菌6株,經(jīng)過VITEK2 COMPACT鑒定5株為柯氏葡萄球菌、1株為糞腸球菌。

1.2 試劑 KB法藥敏紙片為英國Oxoid公司產(chǎn)品;MH培養(yǎng)基干粉及E-test藥敏條為法國生物梅里埃公司產(chǎn)品;Vitek-2 Compact全自動(dòng)細(xì)菌鑒定儀購自法國生物梅里埃公司;ABI-2400 PCR儀購自美國ABI公司;細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒購自凱捷公司;TaqDNA聚合酶、dNTP和DNA分子量Marker購自日本TaKaRa公司。PCR引物合成由北京賽百盛公司完成。

1.3 藥敏試驗(yàn) 采用E-test法檢測利奈唑胺、青霉素、苯唑西林、頭孢西丁、萬古霉素、替考拉寧、環(huán)丙沙星、紅霉素、四環(huán)素、氯霉素的MIC;藥敏方法和折點(diǎn)判斷參照CLSI 2012,以ATCC29213作為質(zhì)控菌株。

1.4 利奈唑胺耐藥基因及相關(guān)突變檢測 細(xì)菌基因組DNA提取應(yīng)用凱捷公司的基因組提取試劑盒,23Sr DNA V區(qū)域引物及4個(gè)拷貝基因片段引物[2],L3和L4[3],cfr[4]基因擴(kuò)增條件及引物序列參照文獻(xiàn)進(jìn)行,引物序列見表1;PCR擴(kuò)增產(chǎn)物序列測定由上海生工公司完成。

1.5 柯氏葡萄球菌PFGE分析 5株柯氏葡萄球菌進(jìn)行了脈沖場凝膠電泳(PFGE),染色體DNA制備及電泳條件參照Murchan等[11]的文獻(xiàn)進(jìn)行,條帶分析應(yīng)用軟件BioNumerics software package (version 5.10, Applied Maths Inc.,Austin,TX,USA)完成。

2 結(jié)果

2.1 抗生素敏感試驗(yàn) 見表2。5株柯氏葡萄球菌利奈唑胺MIC介于16~64 mg/L,青霉素、苯唑西林及頭孢西丁均耐藥,萬古霉素及替考拉寧敏感;糞腸球菌利奈唑胺MIC為8 mg/L,萬古霉素及替考拉寧顯示敏感。

2.2 利奈唑胺耐藥基因及相關(guān)突變檢測結(jié)果 5株柯氏葡萄球菌均表現(xiàn)為cfr基因陽性(圖1),23Sr RNA及L4無突變,L3存在兩對(duì)氨基酸突變,具體見表1;糞腸球菌cfr基因擴(kuò)增陰性,存在23SrRNA點(diǎn)突變(表2)。

表1 本研究所應(yīng)用引物序列

表2 6株革蘭陽性球菌主要耐藥機(jī)制及抗生素敏感性

注:MIC,最低抑菌濃度;LZD,利奈唑胺;PEN,青霉素;OXA,苯甲異噁唑青霉素;FOX,頭孢西?。籚AN,萬古霉素;TEC,替考拉寧;CIP,環(huán)丙沙星;ERY,紅霉素;TET,四環(huán)素;CHL,氯霉素;S:絲氨酸;Y:酪氨酸;D:天冬氨酸;F:苯丙氨酸。

M:分子量Marker;ATCC29213:陰性對(duì)照。

2.3 柯氏葡萄球菌PFGE分型結(jié)果 見圖2。5株柯氏葡萄球菌PFGE分型共分為2型,分別定義為A型和B型,菌株432和485為A型,437,438和470為B型。

3討論利奈唑胺2007年在中國上市,主要用于治療多重耐藥革蘭陽性球菌;耐藥監(jiān)測數(shù)據(jù)顯示,我國第一株利奈唑胺耐藥革蘭陽性球菌出現(xiàn)在2009年[5]。利奈唑胺通過與50S核糖體亞基23Sr RNA的V功能區(qū)結(jié)合,阻止50S與30S亞基組合成70S核糖體,抑制細(xì)菌蛋白質(zhì)合成從而發(fā)揮抗菌作用?,F(xiàn)在已知的利奈唑胺耐藥機(jī)制包括:23SrRNA V結(jié)構(gòu)區(qū)的點(diǎn)突變,以G2576T為主,還包括U2500A,G2505A,G2512T,T2504C,C2610G,T2505A及G2766T等,這些突變影響利奈唑胺與靶位的結(jié)合從而減弱利奈唑胺抗菌活性[6];此外,有學(xué)者報(bào)道[7]核糖體蛋白L3或L4突變與利奈唑胺抗菌活性下降相關(guān),菌株通過核苷酸片段的缺失、序列改變、替換以及插入修飾編碼核糖體蛋白L4,L3的rpl/D,rpl/C基因序列,從而影響肽酰轉(zhuǎn)移酶的空間構(gòu)象,降低抑制利奈唑胺的抗菌活性,從而達(dá)到耐藥,這種突變多發(fā)生于細(xì)菌染色體上,故不易造成細(xì)菌間耐藥性的橫向傳播;第三種已知耐藥機(jī)制是菌株通過獲得cfr耐藥基因而達(dá)到耐藥[8],首次報(bào)道于臨床分離的MRSA菌株中。cfr基因可甲基化轉(zhuǎn)錄后的rRNA(A2503),從而使其構(gòu)象改變以影響利奈唑胺與抗菌靶位的結(jié)合而引起耐藥,大量文獻(xiàn)顯示:cfr耐藥基因可通過質(zhì)粒在不同種屬細(xì)菌間進(jìn)行水平傳播,而引起醫(yī)院內(nèi)的暴發(fā)流行[9]。此外,cfr耐藥基因還可介導(dǎo)對(duì)氯霉素及林可霉素的交叉耐藥,由此可見cfr基因是利奈唑胺耐藥菌株醫(yī)院內(nèi)暴發(fā)流行的潛在危險(xiǎn)因素。

注:菌株485,432:PFGE A型;菌株470,438,437:PFGE B型。

我們的研究中利奈唑胺耐藥凝固酶陰性葡萄球菌經(jīng)鑒定全部為柯氏葡萄球菌,其它凝固酶陰性葡萄球菌中未發(fā)現(xiàn)利奈唑胺耐藥,5株菌均來自患者無菌部位并伴隨感染癥狀,鑒定其均為感染菌;5株柯氏葡萄球菌耐藥分子機(jī)制均表現(xiàn)為cfr基因陽性伴隨L3的158位及159位突變,未見23SrRNA突變及L4的突變;cfr基因多見于質(zhì)粒,容易引起醫(yī)院內(nèi)播散;L3突變最近報(bào)道較多,但在利奈唑胺耐藥中cfr基因及L3突變同時(shí)存在時(shí)其分別所起的作用及程度還需要在以后研究中明確,這也是我們下一步研究的目標(biāo)。而利奈唑胺耐藥糞腸球菌分離自患者尿標(biāo)本,耐藥由23SrRNA的G2576T點(diǎn)突變引起,以往研究顯示:糞腸球菌中,編碼23S rRNA的基因有4個(gè)相同的片段(拷貝),其突變的數(shù)量與耐藥水平呈量效關(guān)系,糞腸球菌(菌株號(hào)501)的23SrRNA第5功能區(qū)的PCR擴(kuò)增片段測序2576位為單一峰,顯示其為一致性的G到T的點(diǎn)突變,此株糞腸球菌未檢測出cfr基因及L3和L4的突變。

在分子流行病學(xué)研究中我們應(yīng)用PFGE技術(shù)對(duì)5株柯氏葡萄球菌進(jìn)行了親緣性研究,結(jié)果顯示:菌株432和485為同一分子克隆(A型),它們來自同一病房(ICU)的病人,且485被分離前病人未應(yīng)用過利奈唑胺抗生素,提示菌株有播散的可能;另外三株菌(437,438和470)為PFGE分型的B型,病人在分離出利奈唑胺耐藥菌株前均應(yīng)用過利奈唑胺藥物,分子遺傳背景相同提示其存在院內(nèi)傳播可能。

近年利奈唑胺耐藥的革蘭陽性球菌已在國內(nèi)多家醫(yī)院臨床標(biāo)本中檢測出[10],其為革蘭陽性球菌的有效抗感染治療帶來了困難;臨床微生物室應(yīng)加強(qiáng)利奈唑胺耐藥革蘭陽性球菌的監(jiān)測,加強(qiáng)合理應(yīng)用抗生素的宣教,以減少多重耐藥菌的出現(xiàn)。

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