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低級別膠質瘤的分子遺傳學研究進展

2016-01-15 03:34袁媛徐玉喬張志文張麗英石劍寬謝忠林王超葉菁
中華神經外科疾病研究雜志 2016年4期
關鍵詞:端粒酶端粒星形

袁媛 徐玉喬 張志文 張麗英 石劍寬 謝忠林 王超 葉菁

(第四軍醫(yī)大學:1病理學與病理生理學教研室; 2唐都醫(yī)院神經內科; 3西京醫(yī)院心血管內科,陜西 西安 710032)

·綜述·

低級別膠質瘤的分子遺傳學研究進展

袁媛1徐玉喬1張志文1張麗英1石劍寬2謝忠林3王超1葉菁1*

(第四軍醫(yī)大學:1病理學與病理生理學教研室;2唐都醫(yī)院神經內科;3西京醫(yī)院心血管內科,陜西 西安 710032)

低級別膠質瘤; 分子病理; 表觀遺傳學

腦膠質瘤是起源于腦部神經膠質細胞,是最常見的顱內腫瘤之一。近30年來,原發(fā)性惡性腦腫瘤發(fā)生率逐年遞增,年增長率約為1.2%,中老年人群尤為明顯。根據美國腦腫瘤注冊中心統(tǒng)計,惡性膠質瘤約占原發(fā)性惡性腦腫瘤的70%,年發(fā)病率約為5/100 000,每年新發(fā)病率超過14 000例,65歲以上人群發(fā)病率明顯升高[1]。盡管神經影像學及膠質瘤的治療均取得了一定的進展,但膠質瘤的預后遠不能使人滿意。低級別膠質瘤主要包括WHO I-II級的星形細胞腫瘤和WHO II級的少突膠質細胞瘤。近年來隨著腫瘤遺傳學研究的進展,對低級別腦膠質瘤的遺傳學認識越來越深入,也為膠質瘤的治療帶來了希望。

一、異檸檬酸脫氫酶突變

異檸檬酸脫氫酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)1、2和3均能夠催化異檸檬酸的氧化脫羧作用,將異檸檬酸轉變?yōu)棣?酮戊二酸(α-ketoglutarate,α-kG)。IDH1和IDH2在結構上有70%的同源性,IDH2位于線粒體,主要完成三羧酸循環(huán);而IDH1位于細胞質和過氧化物酶體,主要影響細胞脂肪和糖的代謝[2,3]。

由于在IDH1/2突變的腫瘤,只有一個拷貝的IDH基因發(fā)生突變,因此不可能出現(xiàn)功能缺失。IDH1/2突變后獲得一個新的功能,即將α-KG轉變?yōu)?-羥基戊二酸(2-hydroxylglutarate,2-HG)[4]。目前認為IDH1/2突變的膠質瘤中2-HG升高的水平高于正常的100~1000倍,并且2HG在結構上類似α-KG,因此能夠抑制α-KG依賴的酶促反應,影響細胞的表觀遺傳學變化,眾多研究認為2-HG與腫瘤的惡性過程相關,因此將2-HG稱為癌代謝物[5]。

腦膠質瘤IDH1/2突變是近年來發(fā)現(xiàn)的最重要的遺傳學改變。IDH1/2突變在WHO II-III級膠質瘤和繼發(fā)性膠質母細胞瘤(WHO IV級)中發(fā)生率非常高(gt;80%),但在原發(fā)性膠質母細胞瘤(WHO IV級)中突變率較低(約5%)。更多的研究顯示,具有IDH1/2突變的膠質瘤患者較為年輕,且預后明顯較野生型患者較好。在膠質瘤中,IDH1/2突變只是發(fā)生于一個等位基因上,即所有IDH1/2突變均是雜合狀態(tài),而且在膠質瘤中沒有發(fā)現(xiàn)IDH1和IDH2同時突變。其中IDH1的突變主要發(fā)生在編碼132位的第一和第二位堿基,IDH2突變主要位于第172位。目前,IDH1/2突變率已經成為膠質瘤患者診斷及預后判斷的重要指標。因此,研究IDH1/2突變在膠質瘤發(fā)生過程的作用與發(fā)生機制具有重要的理論和臨床意義。

二、ATRX

X染色體連鎖的α地中海貧血/精神發(fā)育遲滯綜合征(α-thalassemia/mental retardation syndrome X-lined,ATRX)的致病基因,該基因定位于X染色體長臂Xq21.1,由35個外顯子和34個內含子組成,全長281kb,編碼2492個氨基酸[6]。ATRX蛋白既是一種ATP依賴的解旋酶,也是重要的表觀遺傳調控因子之一,具有參與DNA的修復、轉錄調節(jié)和染色質重組等廣泛的生物學功能[7]。ATRX失活可激活端粒延伸替代途徑[8],引起端粒延長,與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關。ATRX能通過與組蛋白變異體H3.3結合,并整合到端粒,從而在染色體重塑中發(fā)揮了重要作用[9]。

ATRX的表達水平與神經元的分化程度正相關,表明其在神經細胞發(fā)育中可能起重要作用[10]。近年來通過基因測序發(fā)現(xiàn),約7%的成人膠質細胞腫瘤發(fā)現(xiàn)存在ATRX基因的突變,而ATRX基因突變往往導致ATRX蛋白失活[11]。在363例腦腫瘤的分析結果顯示,ATRX突變常發(fā)生于Ⅱ級彌漫型星形細胞瘤(67%,n=15)、Ⅲ級間變型星形細胞瘤(73%,n=40)、繼發(fā)性膠質母細胞瘤(57%,n=14)和少突星形膠質細胞瘤(68%,n=40)。但在Ⅰ級的毛細胞型星形細胞瘤中沒有發(fā)現(xiàn)ATRX 突變,而原發(fā)性膠質母細胞瘤(4%,n=94)和單純少突膠質細胞瘤(14%,n=50)的發(fā)生率也明顯降低。

三、腫瘤抑癌基因TP53突變

人類TP53基因位于染色體17p13.1,全長共有16~20 kb,由10個內含子和11個外顯子組成。野生型TP53是由393個氨基酸組成的與細胞分裂周期相關的核磷酸蛋白。當細胞DNA發(fā)生損傷時,野生型TP53可使細胞停留在細胞分裂G1期,使細胞有足夠的時間修復受損的DNA以恢復正常;當DNA損傷嚴重無法修復時,TP53能夠啟動凋亡過程使受損細胞發(fā)生死亡,因此TP53在預防細胞基因突變、防止腫瘤發(fā)生過程中起重要作用[12]。突變型TP53出現(xiàn)功能缺陷,不但喪失抑癌活性,甚至可促進細胞向惡性細胞發(fā)生轉變。眾多研究已表明TP53突變是人類腫瘤最常見的遺傳學改變之一,許多惡性腫瘤中可以發(fā)現(xiàn)TP53的缺失或突變。

TP53信號通路在神經膠質瘤發(fā)生發(fā)展中也發(fā)揮著非常關鍵的作用。已有研究表明,在 87%的膠質瘤中存在TP53信號通路的改變,在35%的神經膠質瘤中存在TP53自身突變和缺失。由于TP53失活直接使細胞基因組處于不穩(wěn)定狀態(tài),從而容易獲得更多的基因改變,伴隨著基因受累增多,星形細胞瘤發(fā)生惡性轉變,由低級別膠質瘤轉變?yōu)楦呒墑e膠質瘤[13]。有研究分析指出伴有IDH1突變的低級別膠質瘤往往獲得CpG島的甲基化表型,繼而伴隨發(fā)生TP53基因突變,最終則可能發(fā)展成為高級別膠質瘤[14]。

四、人端粒酶逆轉錄酶啟動子突變

人端粒酶逆轉錄酶(human telomerase reverse transcriptase,hTERT)是人類細胞端粒酶調控的限制成分。人端粒酶由作為合成端粒末端序列模板的RNA及具有逆轉錄酶催化活性的蛋白亞基所構成,TERT基因在大多數正常人體細胞中不表達。因此正常人體細胞缺乏端粒酶活性,端粒DNA長度隨細胞分裂次數增多逐漸縮短,最終引起細胞衰老[15]。在正常細胞中表達hTERT能夠重建端粒酶活性,促進細胞生長,延長細胞壽命,這些現(xiàn)象表明端粒酶在阻止細胞衰老的過程中發(fā)揮關鍵的作用。癌變過程可能造成 TERT重新表達,激活端粒酶穩(wěn)定端粒長度,從而賦予腫瘤細胞永生化生長能力[16]。近年越來越多研究揭示TERT在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過程中起重要作用,而其中,端粒酶的異?;罨徽J為是人類腫瘤形成的關鍵步驟,已被公認為是治療腫瘤的重要靶標之一。

近年來, TERT啟動子突變被認為是IDH突變之后又一個與膠質瘤密切相關的遺傳學改變。美國杜克大學醫(yī)學中心Killela的研究團隊對473例成人膠質瘤患者IDH和TERT啟動子突變與總生存率的關系進行分析,認為檢測此類基因突變可以作為膠質瘤組織病理學的輔助診斷。研究發(fā)現(xiàn),74.2%的膠母細胞瘤中存在TERT啟動子突變,而僅18.2%的Ⅱ~Ⅲ級星形細胞瘤中有TERT啟動子突變。相反,在78.4%的Ⅱ~Ⅲ級星形細胞瘤中存在IDH突變。然而在79%的少突膠質瘤中,同時存在TERT啟動子的突變和IDH突變[17]。此外,另有研究指出TERT啟動子突變幾乎不會見于兒童或青少年膠質瘤患者中,具體的原因及機制仍需進一步探索[18]。

五、1p/19q聯(lián)合缺失

少突膠質細胞腫瘤占腦膠質瘤的15%~20%[19,20],少突膠質細胞瘤在不同觀察者之間的具有一定的差異。1998年,1p/19q缺失的發(fā)現(xiàn)為少突膠質細胞瘤的最重要的遺傳學改變[21],其見于50%~90%的少突膠質細胞瘤,尤其是一些具有典型少突膠質瘤形態(tài)的。在低級別膠質瘤中,1p/19q缺失和TP53突變是相互排斥的,而TP53突變主要發(fā)生在星形細胞瘤中。但是,1p/19q聯(lián)合缺失預示著患者具有良好的預后,同時對一些治療更為敏感,如PCV方案(甲基芐肼,環(huán)己亞硝脲和長春新堿),替莫唑胺化療,以及放療敏感[22]。

六、主要遺傳學改變的相關性研究

由于腫瘤基因組測序的發(fā)展,腫瘤遺傳學變化被逐步應用到腫瘤的分類和預后分析,其中膠質瘤的遺傳學與其分類的研究較為深入。利用TCGA數據庫,我們分析了形態(tài)學診斷的78例星形細胞瘤和95例少突膠質細胞瘤的主要遺傳學改變,利用IGV軟件分析1p/19q聯(lián)合缺失和7號染色體的擴增情況。結果顯示,在形態(tài)學診斷為星形細胞瘤的膠質瘤中,IDH1/2突變率為68%,其中TP53突變占IDH1突變的星形細胞瘤的90%以上,而且ATRX的突變與IDH1/2和TP53突變具有明顯的相關性,但是極少發(fā)生1p/19q聯(lián)合缺失。另外,在沒有的IDH1/2突變的星形細胞瘤中更易出現(xiàn)7號染色體的擴增,這些表現(xiàn)更類似與膠質母細胞瘤,可能預示著其可能發(fā)展為繼發(fā)性膠質母細胞瘤。

在組織學為少突膠質瘤的腫瘤中,IDH1/2突變占88%,而且1p/19q缺失發(fā)生率為61%,且具有1p/19q缺失的少突膠質瘤中,均有IDH1/2突變。在形態(tài)學診斷的少突膠質瘤中,無1p/19q缺失但具有IDH1/2突變的腫瘤中,大多具有TP53和ATRX突變,這種遺傳學改變被認為主要出現(xiàn)于星形細胞瘤。

IDH1/2、TP53突變,以及1p/19q缺失是膠質瘤最為常見的遺傳學改變,大于90%的膠質瘤至少攜帶上述一種遺傳學改變。最近對TCGA數據的深入分析結果也顯示[14],對IDH1/2、TP53突變和1p/19q缺失狀態(tài)的分析比組織學分類更有利于患者的預后判斷。在具有IDH突變和1p/19q缺失的低級別膠質瘤患者臨床預后最好。在具有IDH突變但沒有1p/19q缺乏的膠質瘤患者中往往具有TP53突變(94%)和ATRX失活(86%)。大部分沒有IDH突變的低級別膠質瘤往往具有與原發(fā)膠質母細胞類似的遺傳學改變和臨床行為。通過對多個膠質瘤基因組數據的分析,以IDH突變、1p/19q缺失和TP53突變?yōu)榛A的分子分型,其比傳統(tǒng)組織學分型更具優(yōu)勢。

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1671-2897(2016)15-375-03

國家自然科學基金資助項目(81572471);陜西省自然科學基礎研究計劃資助項目(2016JM8100)

袁媛,碩士,E-mail:yy12103034@163.com

*通訊作者:葉菁,副教授,博士生導師,E-mail:yejing@fmmu.edu.cn

R 739

A

2015-09-27;

2016-01-20)

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