李秀梅郭 瓊王 崠陳 艷李 卉諶宏鳴*李惠武(. 新 疆醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院新疆 烏魯木齊 8300;. 新疆武警總隊醫(yī)院新疆 烏魯木齊 8300)
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miR-143、MMP-2 和TIMP-1在哈薩克族食管癌組織中的表達及其臨床病理意義
李秀梅1,郭 瓊1,王 崠2,陳 艷1,李 卉1,諶宏鳴1,*,李惠武1
(1. 新 疆醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院,新疆 烏魯木齊 830011;2. 新疆武警總隊醫(yī)院,新疆 烏魯木齊 830011)
【摘要】目的: 探討在新疆哈薩克族食管癌組織中miR-143、基質(zhì)金屬蛋白酶-2(MMP-2) 和基質(zhì)金屬蛋白酶抑制劑-1(TIMP-1)的表達及其臨床意義。方法:根據(jù)前期芯片檢測結果,通過靶點預測軟件PicTar, TargetScan和miRanda預測miR-143可能與腫瘤相關的靶基因。并采用實時熒光定量PCR方法檢測30例哈薩克族食管癌組織及相應癌旁組織中miR-143、MMP-2和TIMP-1的表達水平,分析其與臨床病理特征的關系。結果:miR-143在哈薩克族食管癌組織中表達較遠端癌旁組織中明顯降低,差異有統(tǒng)計學意義(P=0.000); miR-143低表達與分化程度、淋巴結轉(zhuǎn)移、臨床分期相關(P依次為0.042、0.039、0.007);MMP-2、TIMP-1在哈薩克族食管癌組織中表達均較遠端癌旁組織中增高,差異均有統(tǒng)計學意義(P=0.026和P=0.021);MMP-2高表達與淋巴結轉(zhuǎn)移正相關(r=0.367, P=0.037);miR-143與MMP-2、TIMP-1的表達均呈負相關(r依次為-0.442、-0.410,P均<0.05),MMP-2與TIMP-1的表達呈正相關(r=0.794,P=0.000)。結論:miR-143與MMP-2、TIMP-1表達失調(diào)共同參與哈薩克族食管癌的發(fā)生發(fā)展過程,MMP-2和TIMP-1可能是miR-143的靶基因。
【關鍵詞】食管癌;miR-143;基質(zhì)金屬蛋白酶-2;基質(zhì)金屬蛋白酶抑制劑-1
作者信息: 李秀梅,Tel:13899818077,E-mail:dr.lxm@163.com。*通信作者,諶宏鳴,E-mail:chenhongming5709@163.com
Expression and significance of miR-143, MMP-2 and TIMP-1 in esophageal
cancer in Kazaks
LI Xiumei1,GUO Qiong1,WANG Dong2,CHEN Yan1,LI Hui1,CHEN Hongming1,*,LI Huiwu1
(1. School of Basic Medicine, Xinjiang Medical University, Urumqi 830011; 2. Xinjiang Armed Police Hospital, Urumqi 830011, Xinjiang, China)
【ABSTRACT】OBJECTIVE: To study expressions of miR-143,matrix metalloproteinase-2(MMP-2) and tissue inhibitor of metalloproteinase-1(TIMP-1) in esophageal cancer tissue and normal tissue among Kazaks and to investigate the relationship between their expressions and clinical pathological features. METHODS: Using real time-PCR to detect the expression of miR-143,MMP-2 and TIMP-1 in 30 esophageal cancer specimens. RESULTS:The expression levels of miR-143 in cancer tissue were lower than those of normal tissues(P=0.000).The lower expression of miR-143 was significantly related to the cellular differentiation, lymph node metastasis and clinical stage (P=0.042,0.039,0.007).The expression levels of MMP-2,TIMP-1 in cancer tissue were higher than those of normal tissues(P=0.026,0.021).Enhanced expression of MMP-2 was significantly related to lymph node metastasis(r=0.367,P=0.037).The expression of miR-143 in the Kazak’s esophageal cancer was negatively related to the expressions of MMP-2 and TIMP-1 (r=-0.442,-0.410; P=0.001,0.003).The expression of MMP-2 positively related to that of TIMP-1(r=0.794,P= 0.000). CONCLUSION:The under-expression of miR-143 and over-expressions of MMP-2 and TIMP-1 may have important roles in carcinogenesis of esophageal cancer in Kazaks.
【KEY WORDS】esophageal cancer;miR-143;matrix m etalloproteinase-2;tissue i nhibitor o f m etalloproteinase-1
食管癌(esophageal cancer,EC)是世界上6大常見惡性腫瘤之一,食管癌患病率因地區(qū)變化而顯著不同,在新疆哈薩克族食管癌發(fā)病率最高(155.9/10萬)[1]。microRNA是一類具有組織特異性或發(fā)育階段特異性、非編碼調(diào)控的小RNA,近幾年的研究發(fā)現(xiàn)在腫瘤組織及外周血中microRNA的表達與腫瘤的發(fā)生和發(fā)展密切相關[2]。我們前期實驗采用芯片篩查出35個在哈薩克族食管癌組織中差異顯著的microRNA,提示哈薩克族食管癌組織microRNA表達譜發(fā)生了明顯改變,其中miR-143表達下調(diào)2倍。本文根據(jù)芯片的數(shù)據(jù)結果首先采用熒光定量PCR技術檢測30例新疆哈薩克族食管癌組織及其遠端癌旁組織中miR-143的表達情況,驗證芯片結果的準確性,然后通過軟件預測基質(zhì)金屬蛋白酶-2 (matrix metalloproteinase-2,MMP-2)和基質(zhì)金屬蛋白酶抑制劑-1 ( tissue i nhibitor o f m etalloproteinase-1,TIMP-1)可能是miR-143的靶基因,結合前期試驗結果MMP-2、TIMP-1與哈薩克族食管癌侵襲轉(zhuǎn)移密切相關[3]。因此,本文中我們分析了miR-143與MMP-2、TIMP-1表達的相關性,旨在探討三者在哈薩克族食管癌發(fā)生發(fā)展中的作用及其臨床病理意義。
1.1 靶基因的預測
根據(jù)芯片檢測結果,通過靶點預測軟件PicTar,TargetScan和miRanda(委托北京博奧晶典生物技術有限公司檢測)預測miR-143可能與腫瘤相關的靶基因。
1.2 臨床資料
30例新疆哈薩克族食管癌組織及遠端癌旁對照正常組織(距離癌組織5 cm以上)均取自2008—2013年新疆醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院手術切除標本,患者術前均未接受放化療,手術中取材后迅速將標本置于液氮中,置于-80 ℃ 冰箱保存。癌組織病理切片均診斷為鱗狀上皮細胞癌。男15例,女15例;年齡36~65歲,中位年齡54歲;腫瘤臨床分期按國際TNM分期(UICC,2 009年),其中I期3例、Ⅱ期11例、Ⅲ期16例;有淋巴結轉(zhuǎn)移14例,無淋巴結轉(zhuǎn)移16例;低分化16例,高分化14例。
1.3 引物與主要試劑
miScript II RT Kit、miScript SYBR Green PCR Kit、引物,均購自Qiagen公司;RNA提取試劑Trizol購自Promega公司。引物序列如下:miR-143,上游5'-AT GCCCTTTCATCATTGC-3',下游5'-GAGCTACAGTGCT TC-3';U6,上游5'-CTCGCTTCGGCAGCACA-3',下游5'-AACGCTTCACGAATTTGCGT-3';MMP-2,上游5'-AGATCTTCTTCTTCAAGGACC-3',下游5'-GGCTGG TCAGTGGCTTGGGG-3';TIMP-1,上游5'-GATCCAG CGCCCAGAGAGACA-3',下游5'-AGCTTCCACTCCGG GCAGGAT-3'。
1.4 組織總RNA提取、逆轉(zhuǎn)錄及實時熒光定量PCR
采用Trizol試劑一步法提取總RNA,紫外分光光度計測定其純度。以提取的總RNA為模板,按miScript II RT Kit說明書進行逆轉(zhuǎn)錄。以得到的cDNA為模板進行實時熒光定量PCR擴增。PCR擴增反應體積為25 μL,反應條件:94 ℃、2 min;94 ℃、20 s,61 ℃、30 s,72 ℃、30 s,40個循環(huán);72 ℃、5 min。
1.5 統(tǒng)計學分析
應用SPSS 16.0軟件包,數(shù)據(jù)采用2-ΔΔCT法
進行分析,基因在哈薩克族食管癌組織和遠端癌旁組織中表達量的比較采用t檢驗,各基因與哈薩克族食管癌臨床病理因素的關系采用Spearman雙變量相關性分析,以α=0.05為檢驗水準。
2.1 miR-143靶基因預測結果
見表1。為了減少假陽性率,挑選至少出現(xiàn)在2個軟件中的基因作為其可能的靶基因。最終我們選擇了MMP-2和TIMP-1基因。
表1 miR-143腫瘤相關靶基因的預測
2.2 腫瘤組織中miR-143、MMP-2和TIMP-1 的表達
熒光定量PCR檢測結果顯示,30例哈薩克族食管癌組織及癌旁組織中,miR-143在腫瘤組織中的表達下調(diào),與癌旁組織相比,其相對表達水平(0.23± 0.08)下調(diào)了近3倍,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。在腫瘤組織中MMP-2和TIMP-1的相對表達量(1.83±0.17、2.21±0.22)均明顯高于癌旁組織,差異具有統(tǒng)計學意義(P均<0.05)。見圖1。
圖1 腫瘤組織中miR-143、MMP-2、TIMP-1的表達
2.3 哈薩克族食管癌組織中miR-143、MMP-2、TIMP-1表達與病理因素的關系
結果顯示:miR-143的表達在低分化組顯著低于中、高分化組,淋巴結轉(zhuǎn)移組顯著低于無淋巴轉(zhuǎn)移組(P均<0.05),臨床分期Ⅱb~Ⅲ期組miR-143表達顯著下調(diào),差異均有統(tǒng)計學意義(P均<0.05)。且miR-143低表達與分化程度(r=-0.586,P=0.008)、淋巴結轉(zhuǎn)移(r= -0.378,P=0.013)和臨床分期均呈負相關(r=-0.524,P=0.003)。有淋巴結轉(zhuǎn)移的腫瘤組織中MMP-2的表達顯著高于淋巴結未轉(zhuǎn)移的腫瘤組織,MMP-2的高表達與淋巴結轉(zhuǎn)移呈正相關(r= 0.367,P=0.002)。TIMP-1的表達與分化程度、臨床分期及淋巴結轉(zhuǎn)移均無明顯相關關系。見表2。
2.4 基因相關性分析
Spearman相關分析顯示在哈薩克族食管癌組織中miR-143與MMP-2表達量負相關(r=-0.442, P= 0.001),miR-143與TIMP-1表達量負相關(r=-0.410,P=0.003),TIMP-1與MMP-2表達量呈正相關(r=0.794,P=0.000)。見表3。
表2 食管癌組織中miR-143、MMP-2和TIMP-1的表達與病理資料的關系
表3 miR-143與MMP-2和TIMP-1相關性的分析(CT值)
食管癌是我國最常見的惡性腫瘤之一,在我國食管癌的發(fā)病率具有明顯的地域性,在新疆哈薩克族食管癌發(fā)病率最高,目前早發(fā)現(xiàn)、早治療是提高食管癌患者5年生存率的有效方法,因此,尋找食管癌早期診斷和預后標志物有重要意義。近年來microRNA的研究是分子腫瘤學研究的熱點之一,生物信息學數(shù)據(jù)表明,microRNA在細胞生長和發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用,microRNA參與體內(nèi)許多重要腫瘤相關基因的表達,調(diào)控著細胞分化、凋亡及增殖,microRNA表達失調(diào)與腫瘤發(fā)生密切相關[4-5]。我們前期microRNA芯片結果顯示在哈薩克族食管癌發(fā)生發(fā)展過程中miR-143表達發(fā)生了改變,因此我們隨機選用30 例哈薩克族食管癌組織及癌旁組織,采用熒光定量PCR檢測miR-143的表達以驗證microRNA芯片的準確性,并分析其臨床病理意義。
miR-143是人類細胞中存在較為廣泛的一種microRNA,目前報道在直腸癌、膀胱癌、宮頸癌[6-8]等人類眾多惡性腫瘤標本及腫瘤細胞系中miR-143低表達,其低表達可以促進腫瘤的發(fā)生。王勇等[9]研究發(fā)現(xiàn)在肝外膽管癌中miR-143呈低表達,miR-143質(zhì)粒轉(zhuǎn)染膽管癌細胞株QBC939后發(fā)現(xiàn)膽管癌細胞阻滯于G1期、細胞凋亡增加、細胞生長受到抑制,提示miR-143可能與膽管癌發(fā)生相關。本研究結果與此基本相符,在哈薩克族食管癌組織中miR-143表達明顯下調(diào),與遠端癌旁組織相比,其表達水平僅為癌旁組織水平的1/3,且其表達與分化程度、臨床分期、淋巴轉(zhuǎn)移相關,在低分化、有淋巴結轉(zhuǎn)移的腫瘤組織中miR-143表達顯著低于高分化、無淋巴轉(zhuǎn)移的癌組織,隨著臨床病程的進展,miR-143表達呈現(xiàn)下調(diào)趨勢,以上實驗結果提示miR-143表達下調(diào)參與了哈薩克族食管癌的分化及侵襲轉(zhuǎn)移的生物學進程。
MicroRNA通過對靶基因的表達調(diào)控而發(fā)揮作用,因此我們對顯著下調(diào)的miR-143進行靶點預測,以求進一步認識其與哈薩克族食管癌發(fā)生的關系。結果表明,miR-143的靶基因包括凋亡相關基因BCL-2、腫瘤轉(zhuǎn)移相關基因TIMP-1、MMP-2等。MMPs是一類結構具有同源性、活性依賴鋅離子的蛋白水解酶,由纖維母細胞、中性粒細胞、巨噬細胞及腫瘤細胞分泌,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中MMPs降解細胞外基質(zhì)成分,調(diào)控腫瘤新生血管形成,影響細胞黏附分子的功能以及腫瘤細胞的生長[10-11]?;|(zhì)金屬蛋白酶抑制因子(TIMPs)是一類多基因家族的編碼蛋白,是MMPs的天然抑制劑,目前已知的TIMPs主要有4種,分別為TIMP-1~TIMP-4[12-13]。在30例哈薩克族食管癌標本中我們檢測了MMP-2和TIMP-1的表達,結果顯示在腫瘤組織中MMP-2和TIMP-1的表達均顯著高于正常組織,而TIMP-1高表達與MMP-2表達正相關,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),提示MMP-2和TIMP-1表達上調(diào)共同參與了哈薩克族食管癌的發(fā)生發(fā)展過程。 在30例癌組織中,MMP-2 的表達與淋巴結轉(zhuǎn)移顯著相關(P< 0.05),在有淋巴結轉(zhuǎn)移的腫瘤組織中MMP-2 的表達顯著高于淋巴結未轉(zhuǎn)移的腫瘤組織,提示MMP-2可能是哈薩克族食管癌發(fā)生侵襲、轉(zhuǎn)移的主導因素。MMP-2 過度表達有利于細胞外基質(zhì)的分解,使腫瘤向深層浸潤并突破血管和淋巴管,促進血管生成,造成血行和淋巴轉(zhuǎn)移。在本試驗中TIMP-1在哈薩克族食管癌組織中表達上調(diào),但TIMP-1表達與腫瘤分化、轉(zhuǎn)移及臨床分期均無明顯相關性,而TIMP-1高表達與MMP-2表達高度相關,推測在哈薩克族食管癌發(fā)病過程中,隨著MMPs表達失調(diào),TIMP-I表達上調(diào)可能發(fā)揮保護作用即抑制腫瘤細胞的侵襲和轉(zhuǎn)移。相關性分析顯示,在30例哈薩克族食管癌組織中miR-143與MMP-2、TIMP-I的表達負相關,提示miR-143表達下調(diào)與MMP-2和TIMP-1表達上調(diào)具有關聯(lián),MMP-2和TIMP-1作為miR-143預測靶基因,其具體的調(diào)控機制有待于我們在今后的試驗中進一步探討。
綜上所述,在哈薩克族食管癌組織中miR-143表達下調(diào),與前期芯片實驗結果相符。且miR-143低表達與MMP-2和TIMP-1高表達負相關,提示miR-143與MMP-2和TIMP-1表達失調(diào)共同發(fā)揮作用,參與食管癌發(fā)生發(fā)展過程。系統(tǒng)篩查micoRNA表達譜、鑒定micoRNA靶基因?qū)μ剿鱩icoRNA在腫瘤發(fā)生發(fā)展中所發(fā)揮的重要作用,揭示micoRNA在基因表達調(diào)控網(wǎng)絡中的功能具有重要意義。
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基金項目:新疆維吾爾自治區(qū)科技廳地方病分子生物學實驗室開放課題(XJDX0208-2012-02)
收稿日期:2014-11-29;
修訂日期:2015-10-23
中圖分類號:R734.2
文獻標志碼:A
文章編號:1004-616X(2016)01-0032-05
doi:1 0.3969/j.issn.1004-616x.2016.01.007