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埃博拉病毒(Ebola virus)是引起人類與靈長類動物產(chǎn)生埃博拉出血熱的烈性病毒,因其極高的致死率而被世界衛(wèi)生組織(WHO)列為對人類危害最嚴重的病毒之一。自2013年12月首例埃博拉感染病例在幾內亞南部地區(qū)出現(xiàn)以來,這場史上最糟糕的熱帶病嚴重破壞了衛(wèi)生服務系統(tǒng),并使疫情最嚴重的非洲國家經(jīng)濟搖搖欲墜[1]。2014年,WHO宣布西非地區(qū)埃博拉病毒疫情成為“全球關注的突發(fā)公共衛(wèi)生事件”[2]。該機構于2016年1月14日宣布西非地區(qū)埃博拉疫情終結,但15日塞拉利昂又現(xiàn)埃博拉致死病例[3]。據(jù)WHO發(fā)布的最新數(shù)據(jù)統(tǒng)計,截至2016年3月13日,全球已發(fā)現(xiàn)確診及疑似感染埃博拉病例28 639例,其中死亡人數(shù)達到11 316例[4]。埃博拉疫情的反復提醒我們,面對嚴峻的疫情形勢時應保持警醒。本文通過對國內外埃博拉病毒相關文獻進行統(tǒng)計分析,了解埃博拉病毒的研究熱點與發(fā)展趨勢,為我國傳染病預防工作提供參考。
在Web of science核心合集中進行檢索,檢索策略為TS=(Ebola virus) OR TS=(Ebola disease) OR TS=(Ebola virus disease) OR TS=(Ebola hemorrhagic fever),文獻類型為(ARTICLE OR PROCEEDINGS PAPER OR REVIEW OR MEETING ABSTRACT),語種為(ENGLISH),不限定出版時間,截至2016年1月21日共檢索到英文文獻2 641篇。同時,在中國知網(wǎng)(CNKI)中進行檢索,檢索策略:KY =‘埃博拉病毒’OR KY=‘埃博拉病’OR KY=‘埃博拉出血熱’,文獻類型限定為期刊文獻,學科領域選擇醫(yī)藥衛(wèi)生科技,不限定出版時間,截至2016年1月21日共檢索相關中文文獻1 205篇。
為簡化統(tǒng)計過程和減少低頻詞的干擾,采用Egghe提出的g指數(shù)計算方法(CNKI數(shù)據(jù)不具備文獻引用數(shù)據(jù),因此運用詞頻g指數(shù)計算方法[5])截取中英文文獻的高頻詞并進行對比分析。運用Bicomb 2.0統(tǒng)計出英文關鍵詞共3 260個,中文關鍵詞共4 186個。經(jīng)過詞頻g指數(shù)運算后,得到到英文高頻詞41個、中文高頻詞46個。同時利用Bicomb 2.0對中英文高頻詞匯建立詞篇矩陣,并導入SPSS 22.0進行系統(tǒng)聚類分析。通過采取“組間聯(lián)接”聚類方法,“Ochiai”相似系數(shù),獲得高頻關鍵詞的聚類樹狀圖。
使用Citespace 4.0.R5的突變詞(Frequency Burst)檢測功能,通過觀察中英文關鍵詞頻次的時間分布,檢測題目、摘要、作者和關鍵詞等字段中權重與詞頻變化率較高的術語,從而展現(xiàn)該領域的發(fā)展脈絡與趨勢。同時結合Bicomb 2.0、SPSS 22.0處理后的關鍵詞系統(tǒng)聚類結果,了解該領域的重要研究方向或領域分支。
運用Bicomb 2.0和Excel 2010對中文文獻的作者與研究機構數(shù)據(jù)進行處理、統(tǒng)計分析,運用Web of science對英文文獻的作者、研究機構與國家地區(qū)進行統(tǒng)計分析。同時結合CitespaceⅢ可視化知識圖譜,獲取作者、機構和國家之間合作網(wǎng)絡關系,進一步展現(xiàn)該領域的研究熱點與核心群體。
經(jīng)統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)國內作者發(fā)表埃博拉病毒相關文獻1 205篇,主要集中在1995-2015年(圖1)。從圖1可知,國內該領域的研究呈現(xiàn)逐年遞增趨勢,2003-2004年出現(xiàn)小幅上升,2014-2015年呈現(xiàn)大幅遞增的趨勢。這可能是因為自2003年我國SARS疫情肆虐后,我國研究者對埃博拉出血熱等急性傳染病給予了較多關注。2014年國內埃博拉文獻數(shù)量的幾何倍數(shù)增長,正與非洲埃博拉疫情爆發(fā)緊密相關。
國外作者1992-2016年發(fā)表埃博拉病毒相關英文文獻共2 641篇,年代分布如圖2所示。從圖2可知,國外對埃博拉病毒的研究較國內更早一些,文獻發(fā)表數(shù)量逐年增長,2014年呈現(xiàn)大幅遞增趨勢。這與2014年西非地區(qū)的埃博拉疫情爆發(fā)密切相關。這場全球公共衛(wèi)生突發(fā)事件已成為國外各傳染病研究機構和研究人員關注的焦點。
圖1 國內埃博拉病毒研究文獻年代分布
圖2 國外埃博拉病毒研究文獻年代分布
目前高頻詞界值的確定尚未有統(tǒng)一的方法,常用的方法有經(jīng)驗法、二八定律、齊普夫第二定律、g指數(shù)、高頻低頻詞界分公式等[6]。經(jīng)過系統(tǒng)聚類分析后,獲取中、英文文獻的高頻關鍵詞聚類樹狀圖(圖3、圖4),并根據(jù)樹圖劃分出7個類團(表1、表2)。通過對各類團文獻的查閱,總結出國內埃博拉病毒的研究集中于突發(fā)傳染病風險評估與防治、埃博拉出血熱流行病學調查、抗病毒疫苗研制進展、國際疫情現(xiàn)狀與疫情防控對策、我國參與抗擊埃博拉病例報道等方向,國外埃博拉病毒的研究集中于病毒入侵機制、埃博拉出血熱發(fā)病機制、機體免疫反應、傳染病流行病學調查、抗病毒疫苗與抗病毒藥物研制、國際疫情形勢、埃博拉病毒感染診斷與治療、全球公共衛(wèi)生防控措施等方向。
圖3 國內埃博拉病毒研究高頻關鍵詞-詞篇矩陣聚類樹狀圖
圖4 國外埃博拉病毒研究高頻關鍵詞-詞篇矩陣聚類樹狀圖
序號 類 團 成 員 類 團 解 析1突發(fā)公共衛(wèi)生事件;風險評估突發(fā)公共衛(wèi)生事件、傳染病風險評估2埃博拉;出血熱;流行病學;傳染病埃博拉出血熱流行病學研究埃博拉病毒病3疫苗埃博拉病毒疫苗研究進展4馬爾堡出血熱;馬爾堡病毒;腎綜合征出血熱;沙拉熱馬爾堡病毒流行病學研究傳染病學傳染病學研究5萊姆病;病原微生物傳染病現(xiàn)狀與實施對策動物宿主;人獸共患病;傳染病流行;傳染病控制;埃博拉相關傳染病調查、防治與監(jiān)測新發(fā)傳染病;傳染病防治;傳染病監(jiān)測埃博拉病毒感染現(xiàn)狀6天花病毒;艾滋病病毒;埃博拉病;禽流感病毒病毒性傳染病發(fā)展動態(tài)7靈長類動物;烈性傳染病;致死率;生物安全致死性烈性傳染病的防治疫情防控;急性傳染急性傳染病疫情防控流行病學調查;衛(wèi)生部門;疑似病例;接觸者;絲狀病毒科;埃博拉出血熱疫情防控自然宿主;埃博拉病毒;埃博拉出血熱;公共衛(wèi)生世衛(wèi)組織;國際社會埃博拉國際形勢、我國參與抗擊埃博拉流感病毒;病毒感染;疫苗接種埃博拉病毒流行病學調查、疫苗研制
表2 國外埃博拉病毒研究高頻關鍵詞-詞篇矩陣聚類類團
Citespace是一款具有“信息可視化”功能的文獻計量分析軟件。通過對圖像信息的分析,提取該研究領域最有價值的文獻信息,從而幫助我們在最短時間內了解和預測前沿科技動態(tài)[7]。結合CitespaceⅢ生成的中、英文關鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡進行Frequency Burst檢測(圖5、圖6),依據(jù)突變權重降序排列出前10位突變關鍵詞(表3、表4)。
圖5 國內埃博拉病毒研究突變關鍵詞-熱點時區(qū)視
圖6 國外埃博拉病毒研究突變關鍵詞-熱點時區(qū)視
序號突變詞突變率頻次突變時間1新發(fā)傳染病8.03412004-20132世衛(wèi)組織7.82272011-20153馬爾堡出血熱7.82232005-20094天花病毒6.38192002-20035萊姆病5.44281996-20066西尼羅河病毒5.18132003-20067傳染病流行5.13342003-20098接觸者4.78151995-19989傳染病4.65482004-200610禽流感病毒4.38172004-2009
表4 國外埃博拉病毒研究突變關鍵詞
通過閱讀分析中文突變關鍵詞的來源文獻,可知1995年5月在扎伊爾的基奎特市出現(xiàn)了由埃博拉病毒引起的傳染病,1996年7月在西非加蓬埃博拉出血熱疫情爆發(fā),此后有關埃博拉出血熱的科普文章以及國際疫情分析報道文獻不斷出現(xiàn)。2003年我國SARS和剛果共和國埃博拉出血熱爆發(fā)后,研究者把目光投向埃博拉病毒,探討如何應對新發(fā)傳染病爆發(fā),并結合國情對埃博拉相關疾病防治措施提出建議。隨后,埃博拉研究領域不斷拓展延伸,有關埃博拉出血熱類似疾病馬爾堡出血熱的綜述研究與防控方案衍生出來。2014年西非國家發(fā)生大規(guī)模埃博拉病毒疫情,更多有關國際疫情形勢與發(fā)展動態(tài)、流行病學調查研究、病毒檢測診斷技術和疫情防治措施的文獻不斷涌出。
對英文突變關鍵詞的來源文獻進行分析發(fā)現(xiàn),1992年開始有研究者利用猴子等靈長動物模型研究埃博拉及馬爾堡絲狀病毒的入侵傳播機制,并從基因角度分析病毒核蛋白、RNA序列與病毒轉錄復制過程。20世紀90年代末期至21世紀初,研究者通過對病毒包膜糖蛋白、基質蛋白VP40、基質蛋白VP35的分析了解病毒蛋白結構,埃博拉病毒通過抑制機體免疫反應、使內皮細胞被破壞的致病原理也逐漸被破譯。2009年開始,有研究者對VP35與dsRNA結合協(xié)助病毒入侵進行研究,并在機體免疫與靶向抑制劑等方面取得了進展。部分學者通過對埃博拉國際疫情形勢的綜述以及對流行病學的調查,提出了一系列應對埃博拉病毒感染的公共衛(wèi)生防控措施。自2014年西非國家發(fā)生大規(guī)模埃博拉病毒疫情以后,埃博拉病毒糖蛋白與C型尼曼-匹克蛋白1(NPC1)受體結合的病毒入侵人體的機制逐漸被解析。
依據(jù)中、英文文獻作者發(fā)文量降序排列,分別對發(fā)文量排名前10的國內、外作者進行分析(表5、表6),同時利用CitespaceⅢ生成作者合作網(wǎng)絡圖譜(圖7、圖8)。從表5可以看出,我國發(fā)文最多的作者為王永怡,他在1995年根據(jù)當年5月發(fā)生在扎伊爾的埃博拉疫情發(fā)表了埃博拉疫情動態(tài)與概述埃博拉病毒相關知識的文獻,隨后又相繼發(fā)表多篇文獻,重點關注國際疫情形勢與傳染病疫情防控。從圖7可看出,來自同一機構的洪志恒、孟玲等多位作者共同參與發(fā)表11篇文獻,2014年9月-2015年9月深入持續(xù)報道了全國突發(fā)公共衛(wèi)生事件,并對埃博拉出血熱等傳染病進行了風險評估。
表6顯示,國外發(fā)文最多且論文影響力較高的作者為Feldmann H,他自1995年埃博拉疫情爆發(fā)后發(fā)表了多篇有關絲狀病毒引發(fā)傳染病的文獻,之后又多次發(fā)表有關埃博拉致病機理、病毒入侵機制、抗埃博拉藥物治療與疫苗研制的論著。從圖8可看出,該作者分別與Geisbert TW,Becker S和Kawaoka Y等其他作者合作發(fā)表文獻數(shù)十篇。Bavari S發(fā)表文獻85篇,其中題為“MB-003的雞尾酒單抗可有效治療埃博拉病毒感染”和“病毒樣顆粒干擾素通路預防埃博拉病毒暴露后預防”的文獻[8-9]無論從疫苗開發(fā)還是從生物安全防范方面看,均有參考價值。此外,發(fā)文量排在前10名的研究者合作網(wǎng)絡中,Rollin PE,Nichol ST與Hensley LE和Jahrling PB均建立了合作關系,并形成了各自的合作網(wǎng)絡。
表5 國內埃博拉病毒研究發(fā)文量排名前10位的作者
表6 國外埃博拉病毒研究發(fā)文量排名前10位的作者
圖7 國內埃博拉病毒研究作者合作網(wǎng)絡
圖8 國外埃博拉病毒研究作者合作網(wǎng)絡
依據(jù)中、英文文獻機構發(fā)文量降序排列,分別選取發(fā)文量位于前10位的國內、外研究機構進行分析(表7、表8),同時利用CitespaceⅢ生成國外機構合作網(wǎng)絡圖譜(圖9)。從表7可看出,我國相關領域研究機構中,解放軍第302醫(yī)院發(fā)表文獻數(shù)量最多,多次發(fā)表埃博拉綜述研究文獻,重點關注國際埃博拉病毒感染疫情形勢與疫情防控措施。中國疾病預防控制中心共發(fā)表文獻76篇,這些文獻同樣是集中在闡述國際疫情形勢、傳染病防控防治與埃博拉流行病學調查等方面。軍事醫(yī)學科學院微生物流行病研究所發(fā)文28篇,在關注疫情與撰寫綜述研究的同時,還發(fā)表了有關埃博拉病毒PCR核酸檢測技術的文獻。
表8顯示,國外相關領域的研究機構中,美國國立衛(wèi)生研究院過敏及感染性疾病研究所的發(fā)文數(shù)量領先于其他研究機構,發(fā)表的文獻研究性較強,主要涉及研究埃博拉病毒轉錄翻譯過程、入侵機制、傳染病診斷檢測技術、研究動物模型或人體免疫反應和抗病毒DNA疫苗藥物研制等內容。而從被引次數(shù)與H指數(shù)來看,美國疾病預防與控制中心所發(fā)表的文獻質量較高,并對非洲幾內亞塞拉利昂等地區(qū)的疫情持續(xù)保持高度關注,重在從全球公共衛(wèi)生角度對埃博拉致命傳染病進行流行病學調查研究。結合從圖9中各機構之間連線可以看出,國外埃博拉病毒領域的核心機構包括美國國立衛(wèi)生研究院過敏及感染性疾病研究所、德國馬爾堡菲利普大學與加拿大公共衛(wèi)生研究所,他們均與多家研究機構建立了合作關系。將英文文獻中所有國家的發(fā)文量降序排列,選取位于前10位的國家地區(qū)進行分析(表9),同時利用CitespaceⅢ生成國家合作網(wǎng)絡圖譜(圖10)。從表9可看出,埃博拉研究地區(qū)主要集中在美國、加拿大和歐洲等地區(qū),從發(fā)文數(shù)量、被引次數(shù)和H指數(shù)來看,美國所發(fā)表文獻的數(shù)量與質量均遠高于其他國家,研究水平處于全球領先地位;德國發(fā)文量僅次于美國,自2014年下半年德國出現(xiàn)埃博拉感染病例以來,整個國家實施全面防控措施,這也引發(fā)德國研究者對埃博拉病毒感染的高度關注。從圖10可看出,美國和德國與其他多個國家建立了合作關系,是參與埃博拉病毒研究的核心地區(qū)。中國與國外研究機構合作發(fā)表相關文獻105篇,這些文獻多發(fā)表于2015年。
表7 國內埃博拉病毒研究發(fā)文量排名前10位的機構
表8 國外埃博拉病毒研究發(fā)文量排名前10位的機構
表9 世界埃博拉病毒研究發(fā)文量排名前10位的國家
圖9國外埃博拉病毒研究機構合作網(wǎng)絡
圖10 世界埃博拉病毒研究國家合作網(wǎng)絡
從文獻數(shù)量來看,2014年埃博拉疫情的爆發(fā)導致了短期內國內外研究論文的較大產(chǎn)出,說明埃博拉病毒引發(fā)的高致病率、高致死率急性傳染病正在引起全球科學家們的高度關注,并從基礎科學研究、公共衛(wèi)生事件或是生物安全防范等角度開展了深入研究。
從研究領域來看,國內外埃博拉研究均逐漸傾向于病毒入侵機制、機體免疫反應和抗病毒疫苗研制等基礎科研與臨床應用方向,說明目前該領域正向更加細致、更深層次的方向發(fā)展,國內外相關機構的科研能力與試驗水準也在飛速提升。這對其他傳染病的科研工作也將大有裨益。
從作者分析結果來看,國外作者之間的聯(lián)系十分緊密,發(fā)表文獻數(shù)量多且學術水準很高,為國內外埃博拉研究做出了巨大貢獻。相比之下,我國學者的合作網(wǎng)絡尚未成熟,發(fā)表的文獻更多為國際疫情形勢、傳染病防控等綜述研究,仍需在加強合作的基礎上,提高我國埃博拉研究的深度與廣度。
從研究機構來看,國內外軍方醫(yī)療機構和政府組織的研究實力較強,這可能與政府軍方資金支持、組建援非醫(yī)療隊深入當?shù)亻_展救助等因素相關,可見傳染病研究離不開國家的大力關注和支持??蒲谢鸬牟粩嗤度肟蔀檠芯砍晒耐黄苿?chuàng)新提供巨大動力,不斷滿足國家科技和社會經(jīng)濟的發(fā)展需求。目前,我國國家自然科學基金中涉及埃博拉病毒生物特性與致病機制的研究項目有8項,科研經(jīng)費投入高達3 740萬元,說明我國已逐漸意識到埃博拉研究的重要性。
從國家分布來看,埃博拉研究領域多集中在歐美地區(qū),其中美國和德國處于全球領先地位。各國均在不同程度上建立了合作關系,我國也與國外研究機構共同發(fā)表了百余篇英文論著,其中不乏高質量的學術成果,可見加強國內外研究機構的科研聯(lián)系,可提升我國埃博拉研究實力。
國外埃博拉研究呈現(xiàn)逐漸上升趨勢,尤其是美國、歐洲等地區(qū)的研究機構,對非洲疫情和全球公共衛(wèi)生事件一直保持高度警惕性。目前,國外埃博拉相關權威指南涉及病毒檢測、實驗樣品存儲與運輸、臨床護理、醫(yī)務人員預防以及進出境傳染病防控等方面。我國僅發(fā)布了埃博拉出血熱醫(yī)院防控技術指南,尚無詳盡的治療指南或專家共識。故希望國內外能在現(xiàn)有的成果基礎上,盡早制定出具有指導意義的埃博拉病毒病診治指南。
我國埃博拉科研項目受到病例稀缺的限制,開展相關試驗的條件尚未成熟。由于我國與西非等國家一直保持著醫(yī)療援助合作關系,在提供醫(yī)療人力與物資救助的同時,應與非洲友好國家締結更加緊密的科研合作關系,在疫情前線第一時間搜集有力的研究資料。這對破除埃博拉病例數(shù)量稀少的限制、豐富科研成果、加快我國埃博拉病研究進程具有一定的推動作用。
我國埃博拉研究起步較晚,發(fā)表的文獻多傾向于流行病學研究、疫苗研制進展、國際疫情現(xiàn)狀以及傳染病防控等方面[10]。最近我國研究者也發(fā)表了多篇有關埃博拉病毒致病機制、檢測診斷技術與抗病毒疫苗研制的中英文研究性論著,其中部分論著的研究成果很有價值。如我國中國科學院微生物研究所、中國疾病預防控制中心高福院士研究團隊發(fā)表在Cell上的文章“Ebola Viral Glycoprotein Bound to Its EndosomalReceptor Niemann-Pick C1”[11]從分子水平闡釋了一種新的病毒膜融合激發(fā)機制,為破解埃博拉病毒指明了新方向;江蘇省疾控中心研究者朱鳳才發(fā)表在Lancet上的文獻[12]顯示疫苗是安全的且能夠引發(fā)受試者免疫應答,為進一步研制抗埃博拉疫苗增添信心。雖然上述論著多是在國外研究基礎之上或是與國外研究機構合作完成的,但說明我國對埃博拉研究的投入越來越多。希望我國能夠繼續(xù)維持這種良性合作關系,加強與國外前沿研究機構及學者的交流合作,不斷完善試驗技術與硬件設施,進一步加快抗埃博拉疫苗與抗病毒治療方面的研究進度,以產(chǎn)出更多高質量的研究成果。
埃博拉疫情多集中爆發(fā)在非洲、美國與歐洲等地區(qū),看似離我們相去甚遠,但現(xiàn)今人口流動快,埃博拉這種高致死率傳染病很有可能隨時傳入我國,對我國公眾健康和生命安全造成威脅。因此,我們應當隨時對其保持著高度關注與警惕,進一步完善健全醫(yī)療設施與制度,改善社會衛(wèi)生習慣,加強相關知識的普及傳播力度,以客觀科學的態(tài)度積極面對,從疾病快速篩查診斷、預防與控制等急性傳染病應對措施角度著手,及時杜絕埃博拉的入侵。
由于中文數(shù)據(jù)字段缺乏和軟件對數(shù)據(jù)分析計算等方面的局限性,本文對國內外埃博拉研究的文獻計量與可視化分析還有欠缺。除可以從引文分析角度進一步深度挖掘該領域的發(fā)展趨勢及預測前沿以外,還可以通過擴大數(shù)據(jù)資源查找范圍來囊括更多類型的中英文文獻信息,以更全面地掌握國內外埃博拉病毒研究現(xiàn)狀。