蔣選榮
摘 要 通過對涉及PCR擴增技術(shù)一道習(xí)題的分析,運用建構(gòu)模型、建立樹狀圖的方法推理解題過程,從課程標(biāo)準(zhǔn)的具體知識內(nèi)容、教學(xué)要求、教材內(nèi)容等方面進(jìn)行了教學(xué)反思。
關(guān)鍵詞 PCR擴增 樹狀圖 教學(xué)反思
中圖分類號 G633.91 文獻(xiàn)標(biāo)志碼 B
高三生物二輪復(fù)習(xí)過程中遇見一道有關(guān)通過PCR獲取目的基因的習(xí)題,感覺比較棘手,求教同事,不能解決。后仔細(xì)推敲,通過建模的方式獲得了正確答案。在解題過程中引發(fā)了一些思考:習(xí)題考查的知識點是什么?課程標(biāo)準(zhǔn)中具體要求是什么?該題是否超出學(xué)生能力范圍?如何清晰地向?qū)W生講授習(xí)題解題過程?現(xiàn)將習(xí)題及解題思路簡述如下。
圖1是需要擴增的p53基因在DNA中的位置示意圖,擴增過程需要 種引物。n次循環(huán)之后,只含目的基因的片段占所有擴增產(chǎn)物的比例為 。
1 通過建模的方式模擬PCR擴增DNA的過程
該題考查了基因工程中通過PCR(體外DNA擴增技術(shù))獲取目的基因的方法,通過建模的方式模擬PCR過程是解題的較好方法。首先,標(biāo)記模板DNA兩條鏈的3′游離羥基端和5′游離磷酸基團,同時依據(jù)DNA聚合酶在DNA復(fù)制過程中將游離脫氧核苷酸(事實上是dNTP,即脫氧核糖核苷三磷酸)為反應(yīng)原料,添加在引物3′端形成磷酸二酯鍵的特點,確定擴增過程需要2種引物(圖2)。
在圖2建構(gòu)模板DNA模型的基礎(chǔ)上,建構(gòu)完成模板DNA完成第一次復(fù)制的模型,具體過程見圖3。在圖3模型中,將模板DNA一條鏈復(fù)制成的子一代DNA標(biāo)記為a,以另一條鏈為模板復(fù)制成的子一代DNA標(biāo)記為a′。
在圖3的基礎(chǔ)上,繼續(xù)建構(gòu)第二次擴增圖解(圖4)。分析圖4模型,以第1次擴增形成的子一代DNA兩條鏈為模板,子鏈(互補鏈)延伸方向仍然是3′→5′,擴增形成的子二代DNA分別標(biāo)記為a、b、a′、b′。b、b′分別以第1次擴增產(chǎn)生的兩條DNA鏈為模板復(fù)制形成。
在第二次擴增基礎(chǔ)上,構(gòu)建了第三次DNA擴增模型。從圖5中可以看出,第三次復(fù)制完成后,擴增出了目的基因,即c、c′,經(jīng)過三次復(fù)制,形成8分子DNA片段,其中出現(xiàn)了2分子目的基因,占擴增產(chǎn)物的比例是1/4。
僅通過前四次模擬PCR建模并不能得出n次擴增后只含目的基因的片段比例規(guī)律(數(shù)學(xué)中定義為通項式)。繼續(xù)建構(gòu)第四次復(fù)制的模型圖解,分析其中的規(guī)律,嘗試作出n次擴增后只含目的基因的片段比例結(jié)論(圖6)。
結(jié)合模型圖解,分析第四次擴增產(chǎn)物,統(tǒng)計出只含有目的基因的片段數(shù)量是8(即c和c′),含有目的基因的的片段占所有擴增產(chǎn)物的比例為1/8。綜合分析前四次擴增結(jié)果如表1所示。
擴增n次后擴增產(chǎn)物數(shù)量的數(shù)學(xué)通項式是2n,含目的基因片段數(shù)量的數(shù)學(xué)通項式較難列出。數(shù)學(xué)樹狀圖可以反映出數(shù)列的遞推關(guān)系,從而有助于列出n次循環(huán)之后,含有目的基因片段的擴增產(chǎn)物數(shù)量的數(shù)學(xué)通項式。以第一次擴增產(chǎn)物出現(xiàn)的產(chǎn)物a和b為擴增模板,建構(gòu)了前五次擴增過程的樹狀圖(圖7)。
從數(shù)學(xué)數(shù)列角度分析樹狀圖,可以得出數(shù)列的遞推關(guān)系,從而推理出數(shù)列的數(shù)學(xué)通項式。依據(jù)上圖樹狀圖,推理得到以a為擴增模板,擴增n次后含有目的基因片段數(shù)量的數(shù)學(xué)通項式為2n-1-n,結(jié)合b為擴增模板,擴增n次后含有目的基因的總數(shù)量為2n-2n,只含目的基因的片段占所有擴增產(chǎn)物的比例為2n-2n/2n。
2 由該題引發(fā)的幾點教學(xué)反思
對該題卷面批閱情況進(jìn)行統(tǒng)計發(fā)現(xiàn)沒有學(xué)生答出“只含目的基因的片段占所有擴增產(chǎn)物的比例為 ”的正確答案,因而在備課過程中,力圖將該題的解題思路理清,在講解該題時通過建構(gòu)PCR擴增模型、繪制樹狀圖幫助學(xué)生進(jìn)行邏輯推理。同時,在解題過程中也引發(fā)了一些思考。
2.1 課程標(biāo)準(zhǔn)的具體要求
《生物課程標(biāo)準(zhǔn)》提出課程的基本理念包含倡導(dǎo)探究性學(xué)習(xí)、注重與現(xiàn)實生活的聯(lián)系,“倡導(dǎo)探究性學(xué)習(xí)”目的在于引導(dǎo)學(xué)生主動參與探究過程、勤于動手和動腦;“注重與現(xiàn)實生活的聯(lián)系”倡導(dǎo)學(xué)生在解決實際問題的過程中深入理解生物學(xué)核心概念。課程標(biāo)準(zhǔn)關(guān)于PCR的具體內(nèi)容要求是在選修1部分,具體表述為“嘗試PCR技術(shù)的基本操作和應(yīng)用”,屬于技能目標(biāo)范疇,要求較高,隸屬選修范疇。本題反映考查的知識性目標(biāo)是“體外DNA擴增技術(shù)(DNA多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))”,涉及到的生物學(xué)概念是“DNA復(fù)制”。從課程標(biāo)準(zhǔn)要求分析,本題考查內(nèi)容符合課標(biāo)要求。
2.2 教學(xué)要求和教材教學(xué)內(nèi)容
由于“嘗試PCR技術(shù)的基本操作和應(yīng)用”屬于選修內(nèi)容,《江蘇省普通高中生物課程標(biāo)準(zhǔn)教學(xué)要求》中并沒有將其納入教學(xué)內(nèi)容,但在“基因工程”主題部分,有“簡述基因工程基本操作程序,以及各步驟的一般方法、原理”的學(xué)習(xí)要求,結(jié)合“基因工程”教學(xué)內(nèi)容,獲取目的基因的方法之一是利用PCR技術(shù)擴增。查閱歷年《江蘇省普通高中學(xué)業(yè)水平測試(生物選修科目)說明》,發(fā)現(xiàn)沒有PCR技術(shù)的等級要求,只有“基因工程的原理及技術(shù)”的等級要求。人教版選修1和蘇教版選修1均編排了“聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)”教學(xué)內(nèi)容,屬于學(xué)生操作技術(shù)的選做內(nèi)容。人教版選修3在“專題1基因工程第二節(jié)基因工程的基本操作程序”內(nèi)容中編寫了“利用PCR技術(shù)擴增目的基因”的教學(xué)內(nèi)容,簡單介紹了PCR技術(shù)流程,即變性、復(fù)性、延伸等過程,屬于知識性內(nèi)容的介紹;蘇教版選修3在第一章簡短介紹了“通過PCR技術(shù)擴增目的基因”內(nèi)容,同樣屬于知識性內(nèi)容的簡單介紹。
2.3 對“PCR”教學(xué)內(nèi)容的教學(xué)安排
通過領(lǐng)會課程標(biāo)準(zhǔn)、教學(xué)要求,并結(jié)合教材選修1和選修3內(nèi)容安排,對“PCR”教學(xué)內(nèi)容的教學(xué)目標(biāo)確定為知識性目標(biāo),不設(shè)置技能性目標(biāo)。目前,“PCR技術(shù)的基本操作和應(yīng)用”內(nèi)容部分屬于選修,中學(xué)限于實驗條件等原因并不組織學(xué)生進(jìn)行操作。知識性目標(biāo)定位于了解水平,具體為“說出聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的原理;簡述PCR反應(yīng)操作步驟”。
2.4 對該題的教學(xué)處理
通過對解題過程的回顧、查閱課程標(biāo)準(zhǔn)具體內(nèi)容標(biāo)準(zhǔn)及相關(guān)教學(xué)要求,明確在教學(xué)中不設(shè)置技能性目標(biāo),確定了解水平的知識性目標(biāo)。教學(xué)評價(通過習(xí)題反饋)應(yīng)圍繞教學(xué)目標(biāo),習(xí)題編制或選擇應(yīng)圍繞PCR原理、PCR操作流程。如:PCR是利用DNA雙鏈復(fù)制的原理;PCR操作流程是:高溫變性(加熱至90~95℃)、退火(55~60℃,兩種引物分別與模板鏈結(jié)合)、延伸(70~75℃,需要耐高溫的DNA聚合酶催化dNTP從引物起始端進(jìn)行互補鏈的合成)。學(xué)生需要掌握的具體知識點是:PCR需要兩種引物、需要熱穩(wěn)定DNA聚合酶、半保留復(fù)制、目的基因的擴增產(chǎn)物呈指數(shù)增長。綜上所述,該題第一問屬于學(xué)生應(yīng)該知道的知識,第二問涉及到PCR具體過程和復(fù)雜的推理、計算過程,難度明顯超出教學(xué)要求,教師在課堂教學(xué)中可以舍棄不講,對學(xué)有余力的學(xué)生可以通過上述模型建構(gòu)過程、數(shù)列推理樹狀圖講解。
由一道習(xí)題引發(fā)的思考,不僅在于推理解題過程,更應(yīng)該聯(lián)系課程標(biāo)準(zhǔn)和教學(xué)要求,明確教學(xué)目標(biāo),對習(xí)題要甄別、篩選,要學(xué)會舍棄!