成太輝,楊 武
(1.廣州市番禺區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,廣東廣州 511450;2.廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院水稻研究所,廣東省水稻育種新技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東廣州 510640)
我國(guó)在世界上年產(chǎn)稻谷最多,高產(chǎn)一直是我國(guó)水稻育種的主要目標(biāo),而水稻品質(zhì)的改良卻不夠重視,導(dǎo)致我國(guó)很多水稻品種雖然高產(chǎn),卻不優(yōu)質(zhì)。隨著人民生活水平的日益改善,人們對(duì)稻谷品質(zhì)的需求也不斷提高,米質(zhì)已經(jīng)成為決定水稻品種特性最重要的指標(biāo)之一[1]。
稻米品質(zhì)主要包括外觀品質(zhì)和食用品質(zhì),外觀品質(zhì)包括粒型、堊白、透明度等,食用品質(zhì)包括直鏈淀粉含量(AC,amylose content)、膠稠度(GC,gel consistency)、糊化溫度(GT,gelatinization temperature)、蛋白質(zhì)含量、香味有無等。食用品質(zhì)主要由AC、GC和GT決定。食味品質(zhì)好的稻米,其AC往往較低,GC較高和GT較低,其中AC直接決定了米質(zhì)的優(yōu)劣[2]。優(yōu)質(zhì)秈稻米的AC一般應(yīng)低于22%[3]。
長(zhǎng)久以來,研究者做了大量工作來揭示稻米品質(zhì)的分子機(jī)制,通過對(duì)米質(zhì)性狀的QTL定位,基因克隆和基因功能的研究,來揭示其遺傳機(jī)制。顆粒結(jié)合型淀粉合成酶(GBSS,granule-bound starch synthase)包含GBSSⅠ和GBSSⅡ兩種同工酶,它們控制了直鏈淀粉的合成,能特異性的與淀粉粒結(jié)合,維持淀粉的穩(wěn)定性[4]。水稻蠟質(zhì)基因Wx編碼的GBSSⅠ控制了種子中直鏈淀粉的合成。GBSSⅡ與GBSSⅠ氨基酸序列的同源性很高,控制了非存儲(chǔ)器官中直鏈淀粉的合成[5,6]。因此,Wx基因決定了水稻胚乳中的AC,目前已在水稻中鑒定出多個(gè)Wx基因的等位變異類型,這些新基因的挖掘與利用是稻米品質(zhì)改良的重要基礎(chǔ)。
Wx基因于1990年被克隆,其第一內(nèi)含子5’端剪切處的第一個(gè)堿基決定了Wx基因的轉(zhuǎn)錄水平:若該位點(diǎn)為G,則Wx基因正常剪切,轉(zhuǎn)錄得到的mRNA含量高,最終生成的AC也較高;若該位點(diǎn)為T,則Wx基因無法正常剪切,轉(zhuǎn)錄得到的mRNA含量低,AC較低,該位點(diǎn)是水稻AC差異的最主要類型[7]。Wx基因同樣是水稻糯性的決定基因:糯稻W(wǎng)x基因的第2外顯子上有2個(gè)23 bp的重復(fù)序列,而非糯稻W(wǎng)x基因中只有1個(gè),該片段為糯稻W(wǎng)x基因特有[8]。此外,Wx基因第一內(nèi)含子上游處的CT重復(fù)序列也影響著稻米的AC[9]。對(duì)Wx基因的等位變異和特性總結(jié)如下:
除了糯稻基因Wx外,Wx基因的大多等位變異都存在于較少的水稻品種中,這些品種由于來源有限,配合力差等,很難作為水稻米質(zhì)改良的親本。目前,利用Wxb基因改良水稻AC是非常有效的一種方法。蔡秀玲等利用開發(fā)的PCR-AccI標(biāo)記鑒定了63份水稻品種Wx位點(diǎn)的G/T類型,并測(cè)定了這些品種的AC,發(fā)現(xiàn)T型水稻品種的AC低于18%,G型的都高于20%[21]。Mao等設(shè)計(jì)了擴(kuò)增G/T位點(diǎn)的PCR標(biāo)記,但該標(biāo)記在擴(kuò)增時(shí)需要將退火溫度提高至67℃[22]。高利軍開發(fā)的M-Wx標(biāo)記對(duì)水稻品種鑒定的基因型結(jié)果與測(cè)定的AC一致:在72份水稻品種中,G型水稻品種的AC都高于20.1%,T型的都低于15.6%[23]。孫華欽等開發(fā)了2個(gè)識(shí)別水稻糯性基因Wx的分子標(biāo)記,可以直接檢測(cè)糯性基因的有無[24]。
-:表示沒有突變
將Wxb基因應(yīng)用于米質(zhì)改良,已經(jīng)取得了較為理想的效果。利用分子標(biāo)記PCR-AccI,龍?zhí)馗驼渖?7導(dǎo)入Wxb基因后,新品種的AC顯著降低[25]。聶元元等利用分子育種技術(shù),對(duì)恢復(fù)系R225的AC進(jìn)行改良,經(jīng)過多次回交和標(biāo)記,成功將R225的AC降低到11.6%~23.5%[26]。劉巧泉等利用Wxb基因替換掉特青中的Wxa基因,將稻米的AC從28.5%降低到15%[27]。姚姝等將Wxmp和Wxmp分別滲入到多個(gè)粳稻品種中,選育出寧2704、南粳46等米質(zhì)優(yōu)良的水稻新品種[28]。Myint等利用Basmati370的Wxin基因,有效降低了水稻品種Manawthukha的AC,提高了該品種的生產(chǎn)價(jià)值[29]。此外,通過親本AC的差異,篩選出與Wx基因連鎖的SSR標(biāo)記對(duì)稻米品質(zhì)進(jìn)行改良,也是一種有效的途徑。韓義勝等利用與Wx基因緊密連鎖的標(biāo)記RM190,利用天豐B優(yōu)良米質(zhì)的特性,成功將龍?zhí)仄諦的AC從26.5%降低到15.9%[30]。
米質(zhì)的遺傳機(jī)制較為復(fù)雜,但總的來說,Wx基因主要是通過影響成熟mRNA含量或者SNP變異導(dǎo)致的氨基酸變異,使GBSS Ⅰ的活性、淀粉及糖原合成過程中與ADP-葡萄糖的結(jié)合能力改變等,最終影響了AC的合成[7,15-17]。此外,Wx基因的表達(dá)受到環(huán)境等因素的影響。因此,在利用Wx基因?qū)λ久踪|(zhì)進(jìn)行改良時(shí),需要同常規(guī)育種結(jié)合,選育綜合性狀優(yōu)良的水稻品種[14,31]。
目前雖然報(bào)道了多個(gè)Wx基因的等位變異類型,但水稻品種的AC變異豐富,直鏈淀粉的結(jié)構(gòu)也存在豐富的變異,因此,還有更多Wx基因的新等位變異有待挖掘。在這方面,尤其應(yīng)該擴(kuò)大野生稻種質(zhì)資源的研究,它們可能蘊(yùn)含著更為豐富的變異類型,例如廣東的野生稻資源非常豐富,有可能為水稻優(yōu)質(zhì)育種提供新的供體基因。
除了Wx基因主要控制稻米的AC外,SSII-3基因也影響著稻米的AC,同時(shí)決定了稻米的GT。此外,SSI、SSIII-2、PUL、AGPlar等基因微效調(diào)控AC,SBE3、ISAA等基因微效調(diào)控GC,SSIV-2、SBE3等基因微效調(diào)控GT[32-34]。因此,明確親本的米質(zhì)基因型,通過多個(gè)主-微效基因的聚合,可以更大程度的改良稻米品質(zhì)。
目前發(fā)現(xiàn)的Wx基因的等位變異類型大多都是由單個(gè)核苷酸的差異造成的,這些突變?yōu)楹螘?huì)改變Wx基因的表達(dá)水平?隨著米質(zhì)遺傳機(jī)制的不斷解析,結(jié)合現(xiàn)代分子技術(shù)例如CRISPR技術(shù)等,能夠?yàn)樗居N創(chuàng)造更多的便利。
由于Wx基因的遺傳機(jī)制,米質(zhì)改良不同于抗性改良。目前廣泛使用的抗病基因多為顯性基因,例如三系雜交稻中的親本,只需要不育系或者恢復(fù)系含有純合的抗性基因,雜交種即具有抗病性。對(duì)于米質(zhì),若不育系和恢復(fù)系中只有單個(gè)親本的米質(zhì)位點(diǎn)得到改良,其配組的雜交種米質(zhì)可能未能得到較好的改良。因此,在對(duì)雜交水稻的米質(zhì)進(jìn)行改良時(shí),親本的Wx位點(diǎn)都需要改良。雖然影響稻米品質(zhì)的位點(diǎn)較多,試圖利用主效位點(diǎn)來改良稻米品質(zhì)可能具有一定的局限性,但至少?gòu)姆肿佑N角度,為選育米質(zhì)優(yōu)良的水稻品種提供了可行的方向。
[1]包勁松.稻米淀粉品質(zhì)遺傳與改良研究進(jìn)展[J].分子植物育種,2007,5(s1):1-20.
[2]Martin C,Smith A M.Starch biosynthesis[J].Plant Cell,1995,7(7):971.
[3]新化.優(yōu)質(zhì)稻米品質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)[J].南京農(nóng)專學(xué)報(bào),2002,18(1):57.
[4]Nakamura T,Yamamori M,Hirano H,et al.Decrease of Waxy(Wx)protein in two common wheat cultivars with low amylose content[J].Plant Breeding,2010,111(2):99-105.
[5]Blakeney A B,Matheson N K.Some properties of the stem and pollen starches of rice[J].Starch - St?rke,2010,36(8):265-269.
[6]van der Leij FR,Visser RG,Ponstein AS,et al.Sequence of the structural gene for granule-bound starch synthase of potato(Solanum tuberosum L.)and evidence for a single point deletion in the amf allele[J].Molecular and General Genetics MGG,1991,228(1-2):240-248.
[7]Cai X,Wang Z Y,Xing Y Y,et al.Aberrant splicing of intron I leads to the heterogeneous 5′UTR and decreased expression of Waxy gene in rice cultivars of intermediate amylase content[J].1998,14(4):459-465.
[8]Isshiki M,Yamamoto Y,Satoh H,et al.Nonsense-mediated decay of mutant Waxy mRNA in rice[J].Plant physiology,2001,125(3):1388.
[9]舒慶堯,吳殿星.秈稻和粳稻中蠟質(zhì)基因座位上微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)性及其與直鏈淀粉含量的關(guān)系[J].Journal of Geneticss&sgenomics,1999,26(4):350-358.
[10]Sano Y.Differential regulation of Waxy gene expression in rice endosperm[J].Theoretical and Applied Genetics,1984,68(5):467-473.
[11]Sano Y,Katsumata M,Okuno K.Genetic studies of speciation in cultivated rice.5.Inter-and intraspecific differentiation in the Waxy gene expression of rice[J].Euphytica,1986,35(1):1-9.
[12]Sano Y,Maekawa M,Kikuchl H.Temperature effects on the Wx protein level and amylose content in the endosperm of rice[J].Heredity,1985,76(3):221-222.
[13]Dung L V,Mikami I,Amano E,et al.Study on the response of dull endosperm 2-2,du2-2,to two Wx alleles in rice[J].Breeding Science,2000,50(3):215-219.
[14]Mikami I,Dung L V,Hirano H Y,et al.Effects of the two most common Wx alleles on different genetic backgrounds in rice[J].Plant Breeding,2010,119(6):505-508.
[15]Mikami I,Uwatoko N,Ikeda Y,et al.Allelic diversification at the Wx locus in landraces of Asian rice[J].Theoretical &Applied Genetics,2008,116(7):979-989.
[16]Sato H,Suzuki Y,Sakai M,et al.Molecular characterization of Wx-mq,a novel mutant gene for low-amylose content in endosperm of rice(Oryza sativa L.)[J].Breeding Science,2002,52(2):131-135.
[17]Yang J,Wang J,F(xiàn)an F J,et al.Development of AS-PCR marker based on a key mutation confirmed by resequencing of Wx-mp,in Milky Princess and its application in japonica,soft rice(Oryza sativa,L.)breeding[J].Plant Breeding,2013,132(6):595-603.
[18]Liu L,Ma X,Liu S,et al.Identification and characterization of a novel Waxy allele from a Yunnan rice landrace[J].Plant Molecular Biology,2009,71(6):609-26.
[19]Inukai T,Sako A,Hirano H Y,et al.Analysis of intragenic recombination at Wx in rice:correlation between the molecular and genetic maps within the locus[J].Genome,2000,43(4):589-596.
[20]Wanchana S,Toojinda T,Tragoonrung S,et al.Duplicated coding sequence in the Waxy allele of tropical glutinous rice(Oryza sativa,L.)[J].Plant Science,2003,165(6):1193-1199.
[21]蔡秀玲,劉巧泉,湯述翥,等.用于篩選直鏈淀粉含量為中等的秈稻品種的分子標(biāo)記[J].植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報(bào),2002,28(2):137-144.
[22]Mao X X,Liu Y Z,Xiao X,et al.A one-step pcr method for detecting the first base of splice donor of Wx intron 1 in rice[J].水稻科學(xué)(英文版),2004,11(3):285-287.
[23]高利軍.水稻W(wǎng)x基因的功能標(biāo)記開發(fā)及有效性驗(yàn)證[J].分子植物育種,2013,11(1):1089-1093.
[24]孫華欽,潔田,科羅.一種通過特異性dna片段識(shí)別水稻糯性基因的分子標(biāo)記方法:CN,CN 100402664 C[P].2008.
[25]Liang J,Yan L,Shao Y F,et al.Molecular marker assisted selection for improvement of the eating,cooking and sensory quality of rice(Oryza sativa L.)[J].Journal of Cereal Science,2010,51(1):159-164.
[26] 聶元元,張珍,毛凌華,等.分子標(biāo)記輔助選擇改良三系雜交稻恢復(fù)系R225直鏈淀粉含量[J].中國(guó)稻米,2015,21(02):44-47.
[27]劉巧泉,蔡秀玲,李錢峰,等.分子標(biāo)記輔助選擇改良特青及其雜交稻米的蒸煮與食味品質(zhì)[J].作物學(xué)報(bào),2006,32(1):64-69.
[28]姚姝,陳濤,張亞東,等.分子標(biāo)記輔助選擇聚合水稻暗胚乳突變基因Wx-mq和抗條紋葉枯病基因Stvb~i[J].中國(guó)水稻科學(xué),2010,24(4):341-347.
[29]Yi M,Nwe K T,Vanavichit A,et al.Marker assisted backcross breeding to improve cooking quality traits in Myanmar rice cultivar Manawthukha[J].Field Crops Research,2009,113(2):178-186.
[30]韓義勝,符策強(qiáng),朱紅林,等.利用分子標(biāo)記輔助選擇對(duì)龍?zhí)仄諦米質(zhì)和白葉枯病抗性的改良[J].江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2014,42(7):69-71.
[31]Asaoka M,Okuno K,Konishi Y,et al.The effects of endosperm mutations and environmental temperature during development on the distribution of molecular weight of amylose in rice endosperms[J].Agricultural& Biological Chemistry,2006,51(12):3451-3453.
[32]Bao J S,Corke H,Sun M.Nucleotide diversity in starch synthase IIa and validation of single nucleotide polymorphisms in relation to starch gelatinization temperature and other physicochemical properties in rice(Oryza sativa L.)[J].Tag.theoretical & Applied Genetics.theoretische Und Angewandte Genetik,2006,113(7):1171-83.
[33]Tian Z,Qian Q,Liu Q,et al.Allelic diversities in rice starch biosynthesis lead to a diverse array of rice eating and cooking qualities[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2009,106(51):21760-21765.
[34]Wang Z,Zheng F,Shen G,et al.The amylose content in rice endosperm is related to the post‐transcriptional regulation of the Waxy gene[J].Plant Journal for Cell & Molecular Biology,1995,7(4):613-622.