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核纖層蛋白及相關(guān)疾病研究進(jìn)展

2017-04-05 09:49馬玉清楊柳
山東醫(yī)藥 2017年22期
關(guān)鍵詞:染色質(zhì)細(xì)胞核B型

馬玉清,楊柳

(廣西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,廣西桂林 541004)

核纖層蛋白及相關(guān)疾病研究進(jìn)展

馬玉清,楊柳

(廣西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,廣西桂林 541004)

核纖層蛋白(lamin)是核纖層的主要成分,其在維持高等真核生物細(xì)胞核核膜結(jié)構(gòu)與功能完整性等方面具有重要作用。lamin的功能對(duì)人類健康至關(guān)重要,lamin A的編碼基因LMNA發(fā)生突變會(huì)引起很多種人類疾病,這些疾病被統(tǒng)稱為核纖層蛋白病。

核纖層蛋白;LMNA基因;核纖層蛋白病

真核生物的細(xì)胞核通常包含核孔復(fù)合體、核基質(zhì)和核纖層三個(gè)主要成分。核纖層是由核纖層蛋白(lamin)組成的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),位于內(nèi)核膜的核基質(zhì)表面。lamin為中間纖維蛋白家族的組成成員之一,是惟一一類存在于細(xì)胞核的中間纖維,其為核膜提供一個(gè)具有裝配功能和維持結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的框架。lamin可單獨(dú)或通過(guò)與其結(jié)合的蛋白質(zhì)和染色質(zhì)結(jié)合,從而決定染色質(zhì)在細(xì)胞核中的定位。lamin還可直接或間接地調(diào)節(jié)基因表達(dá)、分化、DNA修復(fù)和凋亡等細(xì)胞進(jìn)程。近年來(lái)的研究表明,LMNA基因突變與許多種人類疾病相關(guān),lamin對(duì)人類健康的重要性已經(jīng)變得越來(lái)越明顯。現(xiàn)就lamin的組成和結(jié)構(gòu)、功能及與lamin相關(guān)疾病的研究進(jìn)展進(jìn)行綜述。

1 lamin的組成與結(jié)構(gòu)

動(dòng)物細(xì)胞有A型和B型兩種類型的lamin,A型lamin在大多數(shù)終端分化細(xì)胞中表達(dá),B型lamin幾乎在所有體細(xì)胞中都表達(dá)。A型的lamin A、AΔ10和lamin C/C2由LMNA基因編碼并且由選擇性剪切產(chǎn)生,B型的lamin B1和B2/B3分別由LMNB1和LMNB2編碼,其中l(wèi)amin C2/B3僅存在于生殖細(xì)胞[1]。所有的lamin都具有N末端頭部、C末端尾部以及一個(gè)桿狀的α螺旋中心,其中C末端尾部區(qū)域呈線性結(jié)構(gòu),包含核膜定位位點(diǎn)、免疫球蛋白折疊區(qū)和法尼基化所必需的CAAX盒[2]。B型lamin是永久法尼基化的,而A型lamin不保留法尼基。法尼基化可以加強(qiáng)B型lamin與核內(nèi)膜的連接,當(dāng)lamin A和C缺乏這種修飾時(shí)其與核膜的連接會(huì)變得比較松散,而且占用核質(zhì)空間。兩個(gè)lamin通過(guò)中心的桿狀域相互作用形成螺旋二聚體,兩個(gè)螺旋二聚體頭尾相連形成極性的原纖維。這些原纖維再側(cè)向半交錯(cuò)連接,以反平行的方式形成非極性的四聚物,最終相互作用形成網(wǎng)狀的核纖層[3]。

2 lamin的功能

2.1 lamin在維持細(xì)胞核結(jié)構(gòu)與功能中的作用 核纖層通過(guò)細(xì)胞核骨架-細(xì)胞質(zhì)骨架連接復(fù)合物與細(xì)胞骨架相連,在機(jī)械轉(zhuǎn)導(dǎo)中起重要作用。lamin形成大分子量結(jié)構(gòu),高分辨率顯微鏡數(shù)據(jù)顯示A型和B型lamin相互作用形成一個(gè)獨(dú)特且相互依賴的纖維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。這些結(jié)構(gòu)可能在核纖層的組織和細(xì)胞核形狀的維持中起作用。然而又發(fā)現(xiàn),lamin A/C在調(diào)節(jié)核的剛度和彈性方面起著顯著的作用,在細(xì)胞核應(yīng)對(duì)機(jī)械外力時(shí),lamin A/C的減少會(huì)增加細(xì)胞核的可變性[4]。研究表明,lamin A/C在不同細(xì)胞類型中的差異表達(dá)導(dǎo)致lamin A/C與lamin B比率的變化。lamin A/C表達(dá)量高的組織細(xì)胞經(jīng)常發(fā)生機(jī)械扭轉(zhuǎn),例如肌肉組織和心臟。癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移也可能是由于lamin A/ C表達(dá)量的變化影響了癌細(xì)胞的細(xì)胞核穩(wěn)定性[5]。最近的一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)lamin A/C的構(gòu)象有依賴于機(jī)械力的變化,這表明lamin在細(xì)胞核受到外界壓力時(shí)具有調(diào)整細(xì)胞核形態(tài)的作用[6]。與lamin A/C突變相關(guān)的Emery-Dreifuss肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(EDMD)和擴(kuò)張型心肌病(DCM)的研究則更加證實(shí)了lamin A/C在維持細(xì)胞核結(jié)構(gòu)中的作用。在具有組織特異性的EDMD動(dòng)物模型中,肌細(xì)胞的結(jié)構(gòu)與功能可以通過(guò)負(fù)責(zé)蛋白質(zhì)異戊烯化的酶的基因失活而恢復(fù)正常[7]。需要指明的一點(diǎn)是,不是所有的LMNA基因突變都與EDMD或DMC相關(guān),也不是與家族性部分脂肪代謝障礙相關(guān)的突變都會(huì)導(dǎo)致核結(jié)構(gòu)異常,不同的LMNA突變對(duì)細(xì)胞核的結(jié)構(gòu)與功能產(chǎn)生不同的影響。

2.2 lamin在染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和染色體組空間定位中的作用 A型和B型lamin均具有DNA結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞核內(nèi)與染色質(zhì)相互作用,它們的數(shù)量和結(jié)構(gòu)的改變會(huì)影響染色體組的完整性。用體內(nèi)DNA標(biāo)記法分析染色質(zhì)與lamin的相互作用,證明了lamin與染色質(zhì)較大的區(qū)域有動(dòng)態(tài)的接觸,這些接觸區(qū)域被稱為核纖層相關(guān)結(jié)構(gòu)域。這些結(jié)構(gòu)域富含抑制性組蛋白標(biāo)記,表明核纖層相關(guān)結(jié)構(gòu)域是一個(gè)不利于染色質(zhì)聚集定位的區(qū)域,但lamin對(duì)核纖層相關(guān)結(jié)構(gòu)域的形成所起的具體作用仍不清楚[8]。甲基化酶鑒定法的研究表明lamin A/C相關(guān)的染色體結(jié)構(gòu)域與lamin B相關(guān)的染色體結(jié)構(gòu)域之間具有非常高的一致性。研究者利用染色質(zhì)免疫共沉淀方法確定了lamin A/C的一個(gè)亞群,該亞群與染色質(zhì)的活性區(qū)域相互作用,這點(diǎn)與lamin的互作因子LAP 2α相一致。這種相互作用可能發(fā)生在細(xì)胞核質(zhì)內(nèi)而不是在核纖層,因?yàn)長(zhǎng)AP 2α與lamin A/C共定位于細(xì)胞核內(nèi)部。lamin A突變蛋白progerin會(huì)導(dǎo)致LAP 2α和lamin A/C的表達(dá)顯著減少[9],這些變化能夠影響細(xì)胞增殖過(guò)程的關(guān)鍵步驟。lamin A/C和LAP 2α之間必須保持平衡才能維持正常的細(xì)胞功能,但目前仍不清楚這一平衡是如何實(shí)現(xiàn)的。lamin與核纖層的其他組分一起組成核包膜跨膜蛋白,并通過(guò)固定外周異染色質(zhì)到核纖層和細(xì)胞分化過(guò)程中核內(nèi)基因的重新定位來(lái)影響基因表達(dá)[10]。lamin A和突變progerin對(duì)染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定和空間定位影響顯著,在表達(dá)progerin的細(xì)胞中,外周異染色質(zhì)逐漸減少,而且異染色質(zhì)的幾個(gè)組蛋白標(biāo)記也全都消失[11]。

2.3 lamin在細(xì)胞衰老與細(xì)胞分化中的作用 許多研究已經(jīng)表明,lamin B1表達(dá)水平的變化是細(xì)胞衰老的標(biāo)志。細(xì)胞衰老是由許多應(yīng)激誘導(dǎo)的永久的細(xì)胞周期停滯狀態(tài),包括持續(xù)DNA損傷、氧化應(yīng)激和原癌基因激活。lamin B1表達(dá)的上調(diào)或下調(diào)會(huì)伴隨細(xì)胞衰老,lamin B1的沉默雖然導(dǎo)致細(xì)胞周期阻滯,但是它本身不會(huì)引起細(xì)胞衰老。lamin B1沉默時(shí)存在部分A型lamin的沉默,復(fù)制性衰老也伴隨著lamin A尾部的氧化,導(dǎo)致其功能失活[12]。此外,lamin B1與lamin A/C表達(dá)的比率也是很重要的,可能成為細(xì)胞老化的關(guān)鍵原因。lamin B在復(fù)制性衰老細(xì)胞中表達(dá)的降低可能使核膜上lamin B-LBR-染色質(zhì)復(fù)合物不穩(wěn)定,導(dǎo)致LBR在復(fù)制性衰老細(xì)胞中的擴(kuò)散性分布。lamin B-LBR-染色質(zhì)復(fù)合物在細(xì)胞核功能中有重要的作用,復(fù)合物的不穩(wěn)定將會(huì)損害細(xì)胞核功能,可能引起細(xì)胞衰老的發(fā)生。核膜蛋白的進(jìn)一步分析將為細(xì)胞衰老提供新的觀點(diǎn)[13]。在細(xì)胞衰老時(shí),LBR和lamin B1的下調(diào)是與核纖層結(jié)合的異染色質(zhì)的釋放所必需的,可以導(dǎo)致染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)的改變。lamin也參與細(xì)胞分化的過(guò)程,隨著祖細(xì)胞分化,根據(jù)細(xì)胞類型和它們被驅(qū)動(dòng)的譜系,在細(xì)胞內(nèi)發(fā)生一系列物理變化。這些生物物理變化延伸到細(xì)胞核,例如胚胎干細(xì)胞分化伴隨著染色質(zhì)凝聚的增加,進(jìn)而導(dǎo)致核硬度的增加[14]。lamin在細(xì)胞分化過(guò)程中也發(fā)生變化,小鼠ES細(xì)胞在細(xì)胞分化期間開始高水平的表達(dá)A型lamin,說(shuō)明其在分化狀態(tài)的維持中起作用[15]。

3 lamin相關(guān)疾病

3.1 DCM EDMD是一種伴隨著關(guān)節(jié)攣縮、肌肉持續(xù)性衰退和骨骼肌無(wú)力等癥狀的遺傳性疾病。許多EDMD患者亦患有DCM,經(jīng)常表現(xiàn)出電傳導(dǎo)異常。LMNA突變可引起EDMD的常染色體顯性遺傳和低頻率的隱性遺傳。LMNA突變約占家族性DCM的25%左右[16]。家系調(diào)查顯示LMNA突變也導(dǎo)致不伴隨骨骼肌疾病的DCM。在對(duì)患有常染色體顯性遺傳的DCM并伴隨傳導(dǎo)系統(tǒng)障礙的11個(gè)家族進(jìn)行評(píng)估后確定了新的LMNA突變,這些突變都會(huì)引起可遺傳的傳導(dǎo)系統(tǒng)疾病(房性心律失常、房室傳導(dǎo)阻滯或竇性心動(dòng)過(guò)緩)和DCM。受影響的家庭成員常表現(xiàn)出心力衰竭或猝死。然而,沒有家族成員表現(xiàn)出EDMD的臨床特征,如關(guān)節(jié)攣縮或骨骼肌病變等。

LMNA-/-小鼠是創(chuàng)建的第一個(gè)LMNA突變動(dòng)物模型,通過(guò)移除C末端區(qū)域自外顯子8到外顯子11的前半部分來(lái)建立。LMNA+/-雜交的后代中,LMNA-/-與雜合子和野生型均呈現(xiàn)正常的胚胎發(fā)育。然而,LMNA-/-在出生2~3周后生長(zhǎng)明顯變慢,最終在大約8周齡死亡,主要誘因是肌肉萎縮和心臟損傷,LMNA+/-小鼠在4~6周齡時(shí)顯示出中度嚴(yán)重性的心功能障礙和心肌細(xì)胞損傷。有趣的是,有研究顯示LMNA+/-小鼠在12個(gè)月齡時(shí)有嚴(yán)重的心臟異常,這類似于由LMNA引起的人的DCM[17]。LMNA心肌病小鼠模型可能為這種疾病的病理生理學(xué)提供一個(gè)重要的分子視角。

3.2 Hutchinson-Gilford早衰綜合征(HGPS) 早衰綜合征是一種罕見的兒童過(guò)早衰老性疾病,大多數(shù)HGPS病例的遺傳基礎(chǔ)是在LMNA的第11個(gè)外顯子中G608G發(fā)生了突變(GGC>GGT)[18],這導(dǎo)致一個(gè)新的隱蔽剪切位點(diǎn)的激活。該LMNA突變導(dǎo)致pre-lamin A羧基末端50個(gè)氨基酸的缺失,產(chǎn)生截?cái)嗟牡鞍踪|(zhì)progerin。progerin在HGPS核中的積累對(duì)細(xì)胞核形態(tài)、染色體組織、端粒長(zhǎng)度、DNA修復(fù)、核質(zhì)運(yùn)輸?shù)戎T多功能產(chǎn)生影響[19]。研究[20,21]表明,法尼基轉(zhuǎn)移酶抑制劑、雷帕霉素、西羅莫司脂化物等可以在HGPS患者治療中起到一定的效果,但是均會(huì)產(chǎn)生不同程度的不良反應(yīng),所以這些藥物均不能從根本上對(duì)HGPS起到治療作用。對(duì)于HGPS,需要研究出更加有效的治療藥物或治療方法。研究人員利用CRISPR基因編輯技術(shù)成功對(duì)DNA進(jìn)行定點(diǎn)改造,這為通過(guò)改造缺陷基因來(lái)治療遺傳疾病提供了可能性[22],也為核纖層蛋白病的治療提供了積極的指導(dǎo)作用。

3.3 癌癥 lamin表達(dá)的變化在多種癌癥中被報(bào)道,在癌組織中的異常定位或錯(cuò)誤表達(dá)可能使lamin成為癌癥的生物診斷標(biāo)志物之一。有研究[23]者發(fā)現(xiàn),A型lamin的表達(dá)與Ⅱ、Ⅲ期結(jié)腸癌患者的復(fù)發(fā)具有一定的相關(guān)性,低水平的lamin A/C表達(dá)與疾病的高復(fù)發(fā)率有很大的關(guān)聯(lián),并指出這些患者可能從化療中獲益。此外,在結(jié)直腸癌組織中鈣結(jié)合蛋白S100A6及其相互作用蛋白β-連環(huán)蛋白(Wnt通路效應(yīng)物)的作用研究中發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)移性與非轉(zhuǎn)移性人類結(jié)直腸癌細(xì)胞系都存在S100A6的高表達(dá)。S100A6蛋白也被確定為lamin A/C的一種新的互作蛋白,因此lamin A/C與結(jié)直腸癌的發(fā)生具有一定的潛在聯(lián)系[24]。這些研究結(jié)果都清楚地表明,lamin的異常調(diào)節(jié)會(huì)導(dǎo)致各種類型的胃腸道癌癥。lamin的多樣功能和廣泛的相互作用使其可能成為癌癥生物標(biāo)志物,預(yù)示腫瘤進(jìn)展。lamin在大多數(shù)癌癥中過(guò)表達(dá),有維持癌細(xì)胞穩(wěn)態(tài)的能力。在腫瘤中維持細(xì)胞的分化、增殖和遷移,這對(duì)侵襲性腫瘤至關(guān)重要。與癌癥確切的預(yù)后指標(biāo)相比,lamin可作為癌癥的潛在生物診斷標(biāo)記[25]。

在過(guò)去近十年里,關(guān)于lamin的研究與日俱增,在理解lamin的生物學(xué)性質(zhì)和與LMNA基因突變相關(guān)的疾病方面取得了巨大進(jìn)步,但仍然有很多未知的地方等待進(jìn)一步探索研究。例如在分化和發(fā)育期間,不同細(xì)胞類型中l(wèi)amin A/C對(duì)基因組動(dòng)態(tài)空間組織的相對(duì)作用;在組織轉(zhuǎn)錄和DNA損傷修復(fù)中具有哪些潛在作用;另外,對(duì)不影響pre-lamin A進(jìn)程的LMNA錯(cuò)義突變引起的組織特異性疾病的分子機(jī)制也知之甚少。在成肌分化過(guò)程中與肌營(yíng)養(yǎng)不良相關(guān)的LMNA錯(cuò)義突變破壞核纖層相關(guān)結(jié)構(gòu)域并改變異染色質(zhì)組織,這些發(fā)現(xiàn)加強(qiáng)了lamin A/C在細(xì)胞分化期間在染色質(zhì)的空間和結(jié)構(gòu)重塑中起作用這一觀點(diǎn)。迄今為止,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)數(shù)百個(gè)LMNA基因突變與組織特異性疾病相關(guān)。因此,可以推測(cè)這些突變中至少有一些突變通過(guò)影響細(xì)胞因子的定位和亞細(xì)胞分布引起組織特異性損傷,這些細(xì)胞因子在調(diào)節(jié)細(xì)胞類型特異性調(diào)控基因或細(xì)胞通路、協(xié)調(diào)細(xì)胞核的空間組織和功能中具有重要作用。此外,我們還要更深入地研究lamin B1和B2的功能,有證據(jù)表明B型lamin是DNA復(fù)制所必需的,現(xiàn)已確定在DNA復(fù)制的延伸階段中l(wèi)amin B1起特定作用。lamin B1和B2涉及到神經(jīng)元的遷移和存活,在lamin B1缺陷的皮層神經(jīng)元中可觀察到核孔復(fù)合物分布的改變[26]。預(yù)計(jì)在未來(lái)幾年內(nèi),對(duì)于B型lamin領(lǐng)域的研究將會(huì)進(jìn)一步拓展深入。

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直線相關(guān)與回歸分析的區(qū)別和聯(lián)系

區(qū)別:①資料要求不同:直線相關(guān)分析要求兩個(gè)變量都是正態(tài)分布;回歸分析要求因變量Y服從正態(tài)分布,而自變量X是能精確測(cè)量和嚴(yán)格控制的變量。② 統(tǒng)計(jì)意義不同:直線相關(guān)分析反映兩變量間的伴隨關(guān)系,這種關(guān)系是相互的、對(duì)等的,不一定有因果關(guān)系;回歸則分析反映兩變量間的依存關(guān)系,一般將“因”或較易測(cè)定、變異較小者定為自變量,這種依存關(guān)系可能是因果關(guān)系或從屬關(guān)系。③分析目不同:直線相關(guān)分析的目的是把兩變量間直線關(guān)系的密切程度及方向用一統(tǒng)計(jì)指標(biāo)表示出來(lái);回歸分析的目的則是把自變量與應(yīng)變量間的關(guān)系用函數(shù)公式定量表達(dá)出來(lái),回歸分析不僅可以揭示X對(duì)Y的影響大小,還可以由回歸方程進(jìn)行數(shù)量上的預(yù)測(cè)和控制。④變量的意義不同:在回歸分析中,因變量Y處在被解釋的特殊地位;在直線相關(guān)分析中,X與Y處于平等的地位。在直線相關(guān)分析中,X與Y都是隨機(jī)變量;在回歸分析中,Y是隨機(jī)變量,X可以是隨機(jī)變量,也可以是非隨機(jī)的,通常在回歸模型中,總是假定X是非隨機(jī)的。

聯(lián)系:①變量間關(guān)系的方向一致。②假設(shè)檢驗(yàn)等價(jià)對(duì)同一樣本。③r與b值可相互換算。④用回歸解釋相關(guān)系數(shù)的平方r2稱為決定系數(shù),是回歸平方和與總的離均差平方和之比,故回歸平方和是引入相關(guān)變量后總平方和減少的部分,其大小取決于r2。回歸平方和越接近總平方和,則r2越接近1,說(shuō)明引入相關(guān)的效果越好,反之,則說(shuō)明引入相關(guān)的效果不好或意義不大。

研究在專業(yè)上有一定聯(lián)系的兩個(gè)變量之間是否存在直線關(guān)系以及如何求得直線回歸方程等問題,需進(jìn)行直線相關(guān)和回歸分析。從研究的目的來(lái)說(shuō),若僅僅為了了解兩變量之間呈直線關(guān)系的密切程度和方向,宜選用線性相關(guān)分析;若僅僅為了建立由自變量推算因變量的直線回歸方程,宜選用直線回歸分析。從資料所具備的條件來(lái)說(shuō),作相關(guān)分析時(shí)要求兩變量都是隨機(jī)變量;作回歸分析時(shí)要求因變量是隨機(jī)變量,自變量可以是隨機(jī)的,也可以是一般變量。當(dāng)兩變量都是隨機(jī)變量時(shí),常需同時(shí)給出相關(guān)與回歸分析的結(jié)果。

國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31560319);廣西自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2015GXNSFCA139022);廣西師范大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練項(xiàng)目(201510602004)。

楊柳(E-mail: yangl@mailbox.gxnu.edu.cn)

10.3969/j.issn.1002-266X.2017.22.040

R735.2

A

1002-266X(2017)22-0109-04

2017-03-30)

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