潘靜嫻, 宋韻瓊, 張朝陽, 李蒙蒙, 崔麗潔*

(1.上海師范大學(xué) 生命與環(huán)境學(xué)院 植物種質(zhì)資源開發(fā)協(xié)同創(chuàng)新中心,上海 200234;2.上海市閔行區(qū)農(nóng)業(yè)技術(shù)服務(wù)中心,上海 201109)

園藝作物種質(zhì)資源管理及數(shù)據(jù)庫建設(shè)研究綜述

潘靜嫻1, 宋韻瓊2, 張朝陽1, 李蒙蒙1, 崔麗潔1*

(1.上海師范大學(xué) 生命與環(huán)境學(xué)院 植物種質(zhì)資源開發(fā)協(xié)同創(chuàng)新中心,上海 200234;2.上海市閔行區(qū)農(nóng)業(yè)技術(shù)服務(wù)中心,上海 201109)

簡述了國內(nèi)外園藝種質(zhì)數(shù)據(jù)庫的現(xiàn)狀,主要分析了數(shù)據(jù)庫建設(shè)中的關(guān)鍵技術(shù),尤其是數(shù)據(jù)采集標(biāo)準(zhǔn)的制定,并就未來數(shù)據(jù)庫的發(fā)展和存在問題進行了展望.認(rèn)為應(yīng)加快園藝種質(zhì)數(shù)據(jù)庫的建設(shè),增加作物收集的種類,并建立信息共享系統(tǒng).涉及作物更廣泛、共享性更強.

園藝作物; 種質(zhì)資源; 數(shù)據(jù)庫

種質(zhì)資源是指農(nóng)作物的特定材料或品種,前者包含了新育成的中間材料、遺傳材料以及野生近源種,而后者通常是指地方優(yōu)質(zhì)或推廣品種[1].收集、保存、更新、利用種質(zhì)資源,建立種質(zhì)資源庫是世界各國都非常重視的工作,是關(guān)系到食物和生態(tài)安全[2],也關(guān)系到人類生存和發(fā)展的國家戰(zhàn)略.

創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫來管理農(nóng)作物種質(zhì)資源是現(xiàn)代種質(zhì)資源管理的重要手段.目前,國內(nèi)外已建立了不少大型種質(zhì)實體庫和數(shù)據(jù)庫[2-3],如美國國家植物種質(zhì)資源系統(tǒng)(NPGS)就是一個包括了國家種子貯藏實驗室、地區(qū)引種站、國家種質(zhì)資源實驗室和植物探險家組成的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),已經(jīng)在全球范圍內(nèi)收集了44 000個植物種質(zhì)[4],并通過國家種質(zhì)資源實驗室實現(xiàn)種質(zhì)的不斷收集和交流[5].挪威諾亞方舟種子庫,利用天然環(huán)境保存了全球主要的農(nóng)作物種子,到目前已經(jīng)收集了1 700種農(nóng)作物種子,保存了700萬份樣本,其中150萬份為完全不同的樣本[6].中國國家作物種質(zhì)資源庫數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)(CGRIS)是世界第一大種質(zhì)庫,擁有種質(zhì)33.4萬份[1],實現(xiàn)了種質(zhì)數(shù)據(jù)采集,數(shù)據(jù)庫和信息系統(tǒng)創(chuàng)建的多平臺共享服務(wù).不僅如此,種質(zhì)庫的創(chuàng)建還向著挖掘遺傳數(shù)據(jù)方向發(fā)展,目前已創(chuàng)建了小麥[7]、水稻[8]等主要農(nóng)作物種質(zhì)的DNA指紋數(shù)據(jù)庫[9],瑞士還建立了葡萄SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)庫[10],隨著分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,未來建立的分子標(biāo)記數(shù)據(jù)庫的作物種類將不斷擴大.

園藝作物是農(nóng)作物的重要組成部分,相比其他農(nóng)作物種質(zhì),園藝作物種質(zhì)數(shù)量更多,變異更快,地方品種也更為豐富.如北京農(nóng)學(xué)院收集的國內(nèi)外百合種質(zhì)資源就有1 000種之多[11],上海師范大學(xué)宋韻瓊等[3]收集了普通白菜種質(zhì)1 350種左右,德國保存的葡萄種質(zhì)多達(dá)5 814份[12].而采用傳統(tǒng)紙質(zhì)保存這些種質(zhì),文件數(shù)量太多,快速查找也非常困難[1,13],因此,進行園藝作物種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫以及查詢管理系統(tǒng)的建設(shè),不僅有利于生存資料的保存,也有利于種質(zhì)的生產(chǎn)、利用和創(chuàng)新.本文作者基于建立普通白菜數(shù)據(jù)庫的經(jīng)驗,綜述了國內(nèi)外園藝作物種質(zhì)資源管理的概況,分析了種質(zhì)數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建的各種技術(shù)手段及其應(yīng)用等,以期為其他種質(zhì)資源的創(chuàng)新和數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)的建設(shè)提供借鑒.

1 國內(nèi)外園藝作物種質(zhì)資源管理概況

種質(zhì)資源不僅是人類賴以生存的生活資料,也是重要的基因資源,是新種質(zhì)創(chuàng)建不可缺少的基礎(chǔ)材料.擁有優(yōu)良的種質(zhì)資源就占領(lǐng)了生存和發(fā)展的主動權(quán),因此,具有發(fā)展前瞻眼光的國家和地區(qū)都在種質(zhì)資源收集、整理,數(shù)據(jù)庫建設(shè)、創(chuàng)新等方面投入不少人力和財力進行基礎(chǔ)性研究.中國在“十五”期間啟動了科技創(chuàng)新公共服務(wù)平臺建設(shè),制定了《國家中長期科學(xué)和技術(shù)發(fā)展綱要(2006-2020)》,明確提出了建立完備的植物、動物種質(zhì)資源,微生物菌種和人類遺傳資源,并建設(shè)科技資源信息化的數(shù)字科技平臺[14].種質(zhì)資源的擁有和管理系統(tǒng)的建設(shè)以及共享化利用,已在全球廣泛開展.

1.1國外園藝作物數(shù)據(jù)庫發(fā)展概況

在種質(zhì)資源信息化共享平臺建設(shè)中,國外及相關(guān)組織做了不少工作,但獨立的園藝作物種質(zhì)資源信息系統(tǒng)并不多,或是存在于大型種質(zhì)數(shù)據(jù)庫中,或是大型數(shù)據(jù)庫的子數(shù)據(jù)庫[15].20世紀(jì)70年代,美國、日本、法國等借助于發(fā)達(dá)的計算機技術(shù),建立了不少大型種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫,部分實現(xiàn)了全國或地區(qū)的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)[16].其中大型平臺有國際植物遺傳資源委員會(IBPGR),于1988年批準(zhǔn)的8種作物遺傳資源協(xié)作網(wǎng)的建設(shè),園藝作物包括香蕉和秋葵,隨后擴大到芭蕉屬植物、蘋果、柑橘類、菜豆類、櫻桃類、向日葵等多種園藝作物[15].而且該組織還收集了豐富的園藝作物種質(zhì),1974～1984年的10年間,收集了蔬菜種質(zhì)5 500份,包括葫蘆科和十字花科的主要蔬菜類型以及菠菜,熱帶水果和干果2 200份,溫帶水果和干果320份[17].美國是世界上種質(zhì)保存最先進的國家,早在1990年就建立了美國種質(zhì)中心網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)(GRIN),其中不少為園藝作物的分庫,如GRIN葡萄分類數(shù)據(jù)庫(www.ars-grin.gov/cgi-bin/npgs/html/tax_search.pl?vitaceae)[4,18],果樹品種數(shù)據(jù)庫包括5萬份信息.其他大型國際植物種質(zhì)資源網(wǎng)絡(luò)平臺[16]還有俄羅斯遺傳資源信息網(wǎng)、日本作物種質(zhì)資源信息系統(tǒng)(EXIS)、國際植物遺傳資源信息系統(tǒng)(SINGER)、國際作物信息系統(tǒng)(ICIS)[19],而園藝作物分庫大多存在于這些大型數(shù)據(jù)庫網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)中,如日本EXIS包括的果樹種質(zhì)信息有數(shù)千條.除大型種質(zhì)庫之外,各國也建立了一些園藝作物及品種的獨立數(shù)據(jù)庫,如歐洲葡萄數(shù)據(jù)庫、國際葡萄品種目錄、希臘葡萄數(shù)據(jù)庫等[18].總體來看,國際上種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫在實體庫建設(shè)的同時,非常注重大型數(shù)據(jù)庫網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)的創(chuàng)建,而園藝作物多屬于大型數(shù)據(jù)庫的成分,這可能與國外園藝作物種類及品種相對偏少有關(guān).

1.2中國園藝作物數(shù)據(jù)庫發(fā)展概況

中國是世界園林之母[20],除此之外,蔬菜、果樹種類及品種資源也極為豐富[21-22].面對如此豐富的園藝種質(zhì),如何科學(xué)地保存和快速地查詢相關(guān)數(shù)據(jù)是一個亟待解決的問題.中國在園藝植物種質(zhì)保存、繁育創(chuàng)新和種質(zhì)信息化共享平臺的建設(shè)上做了很多工作,取得了一定成績.從種質(zhì)實體庫來看,國家和地方層面的種質(zhì)圃建設(shè)成效顯著,不僅以種子和整株的形式進行保存,而且還采用各種離體方法來保存種質(zhì)[23].截至2007年8月,國家?guī)扉L期保存了33.3萬份種子,32個國家資源圃保存了3.8萬份種質(zhì),其中已有80%的蔬菜地方品種入庫保存[24].園藝作物種質(zhì)雖然大多含在大型種質(zhì)庫中,但也建立了種質(zhì)專業(yè)圃,如桃在鄭州、北京和南京建立了國家圃,梅、棗、蘋果、梨、李、核桃、葡萄、橄欖等隨后也建立了國家圃[25].不少蔬菜種質(zhì)也建立了專業(yè)圃,如武漢蔬菜所國家水生蔬菜資源圃保存的是無性繁殖的水生蔬菜種質(zhì)[22].

在種質(zhì)資源實體庫建設(shè)的同時,中國也在加緊建設(shè)種質(zhì)資源網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),以實現(xiàn)種質(zhì)資源大數(shù)據(jù)的管理,并且是國家和地方層面的網(wǎng)絡(luò)共建,但園藝作物,尤其是觀賞植物數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)絡(luò)建設(shè)相對較晚[26].同樣地,中國園藝作物種質(zhì)信息系統(tǒng)或是以子系統(tǒng)存在于國家作物信息系統(tǒng)中[2],或是以獨立數(shù)據(jù)庫存在,但各地根據(jù)自己的資源優(yōu)勢建立了不少園藝種質(zhì)的獨立數(shù)據(jù)庫.始建于1986年的國家農(nóng)作物種質(zhì)資源平臺(http://www.cgris.net),除主要糧油作物種質(zhì)庫外,還建立了白菜類、甘藍(lán)類、西甜瓜等各類蔬菜,以及蘋果、梨、杏、梨、核桃等多種果樹種質(zhì)的信息子系統(tǒng)[1],這些信息系統(tǒng)為各類需求提供了科學(xué)快捷共享的優(yōu)質(zhì)種源.此外,各地也在建設(shè)農(nóng)作物種質(zhì)資源信息平臺,園藝作物則以子系統(tǒng)或獨立系統(tǒng)存在[1].如廣東省于2004年建成了蔬菜種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫,涉及白菜、菜心等17種蔬菜1 642份種質(zhì)信息,還包括了圖片信息[27].甘肅省建立了13個主要油橄欖資源信息服務(wù)平臺[14],廣東省建成了中國唯一的包括80多份木菠蘿種質(zhì)的電子數(shù)據(jù)庫[27],其他省市及相關(guān)的科研院所也建立了不少園藝作物數(shù)據(jù)庫,如重慶[28]、廣西[29]、西藏[30]等建設(shè)的地方植物或作物種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫.此外,園藝作物數(shù)據(jù)庫作物種類也越來越多,三大園藝作物均有涉及,如花卉數(shù)據(jù)庫[31-32]、紅掌[33]、紅棗[34]、大蒜[35]等,未來可能還會開發(fā)出種質(zhì)資源少的園藝作物數(shù)據(jù)庫.

2 園藝作物種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫信息系統(tǒng)建設(shè)

種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫的實現(xiàn)涉及到資源收集、數(shù)據(jù)采集、數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)及功能設(shè)計、運行管理等多個環(huán)節(jié).

2.1資源收集與數(shù)據(jù)采集

種質(zhì)資源的收集是數(shù)據(jù)庫建設(shè)的基礎(chǔ).不同類型數(shù)據(jù)庫種質(zhì)的需求數(shù)量和質(zhì)量是不同的,大型數(shù)據(jù)庫包含的種質(zhì)類型多樣,有糧、棉、油,又有蔬菜、果樹、中藥材等[1-2,4,6].種質(zhì)來源,不僅來自管理者組建的考察隊在世界各地進行收集,也來自協(xié)議承擔(dān)國或國內(nèi)其他省市向種質(zhì)庫的輸送.如IBPGR在1974～1984年間先后資助了300多個考察隊在88個國家進行植物種質(zhì)資源收集,獲得了作物栽培品種和野生品種10萬份以上[17].中國農(nóng)科院國家種質(zhì)庫則承擔(dān)了全球油菜、大白菜、蘿卜和亞洲小麥的長期保存任務(wù)[15],這些工作為作物遺傳資源協(xié)作網(wǎng)的建設(shè)提供了大量真實的種質(zhì)材料.挪威諾亞方舟種子庫[6]的大量種質(zhì)來自美國致力于保護珍稀蔬菜的組織.此外,總部在敘利亞的世界干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究中心(ICARDA)幾乎將所有收集到的種質(zhì)送往了該種質(zhì)庫.中國國家農(nóng)作物種質(zhì)資源平臺的種質(zhì)收集則是種質(zhì)中期庫向長期庫提供新收集的種質(zhì),地方庫向國家?guī)焯峁┓N質(zhì)的模式[2].中國各省市或科研單位建立的糧、棉、油和園藝作物數(shù)據(jù)庫,尤其是園藝作物的獨立數(shù)據(jù)庫,其種質(zhì)來源則是建設(shè)者長期收集或與兄弟單位交流保存獲得,相對比較松散[3,33].因此,大型種質(zhì)數(shù)據(jù)庫種質(zhì)來源更多是協(xié)作成員的提供,小型數(shù)據(jù)庫則是建設(shè)者自身的長期收集和積累.

種質(zhì)信息的采集是數(shù)據(jù)庫建設(shè)的重要環(huán)節(jié),關(guān)系到數(shù)據(jù)庫能否有效地被利用和共享.每一種質(zhì)包含的信息非常多,選擇采集的信息比較困難.建于早期的數(shù)據(jù)庫,無論是國外的還是國內(nèi)的,種質(zhì)信息多是形態(tài)數(shù)據(jù),也包含了一些生態(tài)數(shù)據(jù);數(shù)據(jù)采集方法各國也不統(tǒng)一,缺乏規(guī)范性標(biāo)準(zhǔn),信息差異大.而后期建設(shè)的數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)信息不僅包括形態(tài)、生理數(shù)據(jù),還采集了遺傳信息[9,12,28],數(shù)據(jù)的形式不僅是文字和數(shù)字,還有多媒體數(shù)據(jù)[3],數(shù)據(jù)采集的方法也更規(guī)范.國際植物基因資源研究所(IPGRI)等組織自20世紀(jì)80年代以來,組織專家制定了蘋果、梨、桃、蔥等作物的描述符,使種質(zhì)性狀描述具有國際語言[36-37],中國也依據(jù)IPGRI標(biāo)準(zhǔn),建立了不少農(nóng)作物的描述標(biāo)準(zhǔn)[38-40],如陳靈芝等[41]建立的辣椒數(shù)據(jù)庫就是根據(jù)辣椒種質(zhì)資源規(guī)范化標(biāo)準(zhǔn),采集了34個信息,分屬于基本信息、性狀調(diào)查信息、抗性和圖片數(shù)據(jù).張娟等[42]依據(jù)IPGRI標(biāo)準(zhǔn)制定了高葶韭的描述符.由此可見,隨著更多農(nóng)作物種質(zhì)描述規(guī)范的制定,數(shù)據(jù)采集將更有依據(jù),但數(shù)據(jù)庫字段數(shù)量也更多,早期數(shù)據(jù)庫也可以根據(jù)規(guī)范進行更新.當(dāng)然,規(guī)范是推薦性的,若考慮數(shù)據(jù)庫在國際和國內(nèi)的信息共享,數(shù)據(jù)描述符應(yīng)統(tǒng)一[43].

2.2系統(tǒng)設(shè)計

2.2.1 系統(tǒng)結(jié)構(gòu)設(shè)計

無論大型還是小型種質(zhì)數(shù)據(jù)庫,在結(jié)構(gòu)上均采用模塊化結(jié)構(gòu)以實現(xiàn)系統(tǒng)不同的功能.對于一個種質(zhì)資源的獨立數(shù)據(jù)庫或大型數(shù)據(jù)庫的子數(shù)據(jù)庫,通常包括2個或以上的模塊,兩個模塊常由前臺和后臺系統(tǒng)組成[3],前臺系統(tǒng)為用戶提供各種種質(zhì)的檢索服務(wù),后臺系統(tǒng)則是管理者進行系統(tǒng)更新維護的模塊.多個模塊基本是將前臺系統(tǒng)的一些功能細(xì)化,分離出來成為獨立模塊,如王冉冉等[11]的百合數(shù)據(jù)庫包括了信息查詢檢索、信息交流和管理模塊,邊黎明等[44]設(shè)計的鵝掌楸屬植物數(shù)據(jù)庫則包括了4個模塊,而馮穎[12]建立的油橄欖數(shù)據(jù)庫包含了8個模塊.模塊化結(jié)構(gòu)設(shè)計避免了程序的冗長和混亂,實現(xiàn)了系統(tǒng)的功能獨立和高效維護.

2.2.2 系統(tǒng)實現(xiàn)技術(shù)

借助計算機網(wǎng)絡(luò)技術(shù),采用ORACLE、FoxPro、FoxBase、SQLServer等數(shù)據(jù)庫開發(fā)軟件[2],是實現(xiàn)基于Internet數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的重要手段.不同時期的種質(zhì)數(shù)據(jù)庫,受制于計算機技術(shù),開發(fā)工具也不同.在微軟推出Windows 95之前,操作系統(tǒng)仍然是MS-DOS系統(tǒng),因此,早于1995年前建立的種質(zhì)數(shù)據(jù)庫只能在MS-DOS系統(tǒng)下運行,而且是單機版軟件.如早期的中國國家作物資源數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)[2],數(shù)據(jù)庫開發(fā)語言也是只適合DOS系統(tǒng)的,如FoxBase.獨立操作系統(tǒng)Windows出現(xiàn)后,開發(fā)了基于Web平臺的種質(zhì)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),實現(xiàn)了網(wǎng)絡(luò)化應(yīng)用.開發(fā)軟件為FoxPro、SQLService等,而大型種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫則采用ORACLE開發(fā).國家作物資源數(shù)據(jù)庫采用的是WebGIS[1],普通白菜品種資源庫采用的ASP.NET開發(fā)工具[3],百合種質(zhì)數(shù)據(jù)庫[11]采用的是MySQL,是一個開放源碼的小型關(guān)聯(lián)式數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng).油橄欖數(shù)據(jù)庫[14]采用了Java、ASP等設(shè)計語言.總之,隨著計算機技術(shù)的不斷發(fā)展,種質(zhì)數(shù)據(jù)庫開發(fā)環(huán)境和工具將更為便捷和多樣.

2.3數(shù)據(jù)庫功能設(shè)計

園藝作物種質(zhì)數(shù)據(jù)庫功能多采用的是結(jié)構(gòu)化程序設(shè)計,即將系統(tǒng)功能集中為分層獨立的實現(xiàn)單元模塊.功能模塊通常有兩個或兩個以上.兩個功能模塊一般是由前臺和后臺功能組成[3,11,29,42],前臺模塊面向用戶,實現(xiàn)種質(zhì)資源的查詢、檢索、在線服務(wù)等,在線服務(wù)也可以放到后臺模塊.如普通白菜品種數(shù)據(jù)庫[3]前臺具有按產(chǎn)地、育種單位、生態(tài)特性、抗性等字段進行檢索的功能,用戶可方便找到需要的品種信息.而有的數(shù)據(jù)庫前臺功能比較強大[45],如中國森林種質(zhì)資源網(wǎng)(www.fgr.cn)包括了主頁、種質(zhì)在線、種質(zhì)查詢、會員注冊、種植專家、種苗標(biāo)本等11個子功能.后臺功能模塊多是面向管理者的操作平臺,一般實現(xiàn)種質(zhì)信息管理、在線服務(wù)、用戶信息管理等,管理者可以進行種質(zhì)信息增減、修改信息等,并與用戶進行互動,用QQ或其他交流工具,同時對用戶的使用情況進行統(tǒng)計分析[3].有些數(shù)據(jù)庫在后臺中也會給種質(zhì)發(fā)布者一個登錄通道[44].多于兩個的功能模塊設(shè)計主要是將前臺或后臺中的一些子功能分離出來,成為獨立模塊,或不分前臺、后臺,即不分層,而是直接形成多個獨立模塊[14,28,34].總體來看,模塊化的分層獨立設(shè)計是數(shù)據(jù)庫功能設(shè)計的主要方式,極大地提高了數(shù)據(jù)庫的兼容性和擴展性.

3 展 望

從世界范圍來看,各國都在不遺余力地建設(shè)農(nóng)作物種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫,并取得了重要成果.實現(xiàn)全球共享的種質(zhì)數(shù)據(jù)庫不斷出現(xiàn),尤其是種類繁多的園藝作物,更是數(shù)據(jù)庫建設(shè)的關(guān)注對象,并將與大數(shù)據(jù)相結(jié)合.然而,種質(zhì)數(shù)據(jù)庫的建設(shè)是一項長期的基礎(chǔ)性工作,涉及的環(huán)節(jié)非常多,從種質(zhì)收集、整理、鑒定,數(shù)據(jù)采集到數(shù)據(jù)庫的建設(shè)、應(yīng)用和更新維護,都需要投入龐大的人力和財力,短期內(nèi)也不可能有顯著的成果.還要注意,通過各種方式收集的種質(zhì),尤其是園藝作物,必須經(jīng)過田間或?qū)嶒炇诣b定,才能獲得遺傳學(xué)上的真實種質(zhì).園藝作物種類多,品種豐富,市場上種質(zhì)同名異種或同種異名或多名的現(xiàn)象普遍存在,因此,獲得的種質(zhì)鑒定后才能使用,這項工作十分繁瑣.而在種質(zhì)信息采集的描述規(guī)范上也存在問題,大型數(shù)據(jù)庫采用描述符規(guī)范,但各國間可能也會有所差異,而小型數(shù)據(jù)庫,對描述符標(biāo)準(zhǔn)的使用就不太規(guī)范,甚至不使用,還有一些小作物沒有描述規(guī)范.因此,不僅要規(guī)范使用描述符,而且要盡快制定缺乏規(guī)范作物的描述符,以實現(xiàn)種質(zhì)數(shù)據(jù)庫在全球范圍的真正共享.

國內(nèi)園藝作物數(shù)據(jù)庫建設(shè)應(yīng)有計劃進行,下一級建設(shè)者應(yīng)該為上一級的種質(zhì)庫提供基礎(chǔ)信息和服務(wù),應(yīng)避免重復(fù)建設(shè),使種質(zhì)得到有效保存、鑒定和利用.另外,數(shù)據(jù)庫上網(wǎng)共享也受到國家網(wǎng)絡(luò)安全規(guī)范的約束,因此,建立的小型庫如果不加入到大型種質(zhì)數(shù)據(jù)庫中,也只能留在個人電腦中,無法實現(xiàn)共享和服務(wù).而中國已出臺農(nóng)作物種質(zhì)共享平臺建設(shè),將為這些問題的解決提供可靠的政策和技術(shù)依據(jù).

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(責(zé)任編輯:顧浩然,馮珍珍)

Reviewonmanagementofhorticulturalplantgermplasmresourcesandconstructionofrelateddatabase

Pan Jingxian1, Song Yunqiong2, Zhang Chaoyang1, Li Mengmeng1, Cui Lijie1*

(1.Development Center of Plant Germplasm Resources,College of Life and Environmental Sciences,Shanghai Normal University,Shanghai 200234,China;2.Minhang District Shanghai Agricultural Technology Service Center,Shanghai 201109,China)

The advances of databases on horticulture germplasm resources from China and abroad was briefly reviewed and the key technologies were discussed in details,especially in descriptors of data collection of germplasm resources.The prospective and challenges of databases were also discussed.It was evident that there was an urgent need to develop the databases of horticulture germplasm resources,with increasing diversity of germplasm,more user friendly and systematically access to the databases.

horticulture crop; germplasm resources; database

S 6; S 32

A

1000-5137(2017)05-0762-07

2017-08-31

上海植物種質(zhì)資源工程技術(shù)研究中心項目(17DZ2252700)

潘靜嫻(1963-),女,博士,副教授,主要從事園藝作物種質(zhì)資源收集創(chuàng)新及園藝產(chǎn)品安全性研究.E-mail:panjingx@shnu.edu.cn

*

崔麗潔(1978-),女,博士,副教授,主要從事藥用植物分子生物學(xué)研究.E-mail cuilj@shnu.edu.cn