孫海柏,張麗霞,秦中華,郭明日,張東,白虹
(1.天津市醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,天津300070;2.天津市海河醫(yī)院,天津300350)
利福平耐藥實(shí)時(shí)熒光定量核酸擴(kuò)增技術(shù)(Xpert M TB/R I F)快速診斷淋巴結(jié)核及其耐藥性
孫海柏1,張麗霞2,秦中華2,郭明日2,張東2,白虹1
(1.天津市醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,天津300070;2.天津市海河醫(yī)院,天津300350)
目的探討Xpert MTB/RIF試驗(yàn)在診斷淋巴結(jié)核及其對(duì)利福平耐藥的意義。方法選取156例疑似膿腫性淋巴結(jié)核患者的膿液分別進(jìn)行960液體變色培養(yǎng)基培養(yǎng)、涂片鏡檢、傳統(tǒng)比例法藥敏試驗(yàn)以及Xpert MTB/RIF試驗(yàn)檢測(cè),分析Xpert MTB/RIF試驗(yàn)檢測(cè)MTB及其耐藥性的敏感性和特異性。結(jié)果以液體變色培養(yǎng)基培養(yǎng)試驗(yàn)作為金標(biāo)準(zhǔn),Xpert MTB/RIF試驗(yàn)檢測(cè)淋巴結(jié)核的敏感性和特異性分別為(95.42%,84.00%),Kappa值為0.77,兩者一致性較好。以傳統(tǒng)比例法藥敏試驗(yàn)為金標(biāo)準(zhǔn),Xpert MTB/RIF試驗(yàn)檢測(cè)利福平耐藥的敏感性和特異性分別為(70.0%,98.42%)兩種方法檢測(cè)結(jié)果比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論Xpert MTB/RIF試驗(yàn)檢測(cè)淋巴結(jié)核及其耐藥性與傳統(tǒng)的檢測(cè)方法比較具有較高的敏感性和特異性,并且檢測(cè)時(shí)間短、及時(shí)的優(yōu)點(diǎn)。
淋巴結(jié)核;利福平耐藥;敏感性;特異性;Xpert MTB/RIF
頸部淋巴結(jié)核是結(jié)核分枝桿菌侵入頸部淋巴結(jié)所致的一種淋巴結(jié)病變,按病程可分為結(jié)節(jié)型、浸潤(rùn)型、膿腫型及潰瘍型[1]。以膿腫性淋巴結(jié)核最為常見,治療不及時(shí)或不理想結(jié)核桿菌還要破壞掉病變處大量組織甚至骨組織,留下功能障礙,所以尋找及時(shí)準(zhǔn)確快速的實(shí)驗(yàn)室診斷方法至關(guān)重要。利福平耐藥實(shí)時(shí)熒光定量核酸擴(kuò)增技術(shù)(Xpert mycobacterium tuberculosis/rifampicin,Xpert MTB/RIF)檢測(cè)痰標(biāo)本中結(jié)核分枝桿菌與TB培養(yǎng)法有較高一致性[2]。本文利用目前快速檢測(cè)結(jié)核菌的方法Xpert MTB/RIF對(duì)患者的膿液直接進(jìn)行檢測(cè),并對(duì)其敏感性和特異性進(jìn)行分析。
1.1 一般資料
選取2013年8月-2016年10月于天津市海河醫(yī)院確診淋巴結(jié)核的住院患者156例:?jiǎn)渭冾i部淋巴結(jié)結(jié)核例58例,淋巴結(jié)結(jié)核合并肺結(jié)核89例,腋窩淋巴結(jié)結(jié)核合并肺結(jié)核2例,腹股溝淋巴結(jié)結(jié)核合并肺結(jié)核7例。納入標(biāo)準(zhǔn):淺表淋巴結(jié)經(jīng)B超檢查提示淋巴結(jié)有液化、壞死,或肉眼見膿腫和(或)竇道形成未進(jìn)行過(guò)抗結(jié)核治療的首診患者;其中,男性41例,女性115例;年齡17~80歲。
1.2 儀器與試劑
PLR-線性探針雜交酶顯色法診斷試劑盒(Geno Type MTBDR pIus,德國(guó)Hain Life-science公司),Hotstar Taq酶(德國(guó)Qiagen公司),MGIT960液體培養(yǎng)基及藥敏管(美國(guó)BD公司);Hain GT Blot-48全自動(dòng)雜交儀(德國(guó)Hain Lifescience公司),聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)儀(Polymerase chain reaction,PCR)(德國(guó)Hain Lifescience公司),Eppen-dorf 5804R高速冷凍離心機(jī)(德國(guó)Eppendorf公司),生物安全柜(山東省青島市海爾公司)。
1.3 試驗(yàn)方法
BACTEC MGIT960液體培養(yǎng)及耐藥性檢測(cè)、痰抗酸染色均按照結(jié)核病診斷細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)規(guī)程進(jìn)行操作,線性探針?lè)z測(cè)淋巴結(jié)核及其對(duì)利福平耐藥性,按照試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行操作。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
數(shù)據(jù)分析采用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件,配對(duì)計(jì)數(shù)資料χ2檢驗(yàn),行×列表資料χ2檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,Kappa一致性系數(shù),敏感性及特異性分析。
2.1 患者M(jìn) G I T960液體培養(yǎng)、Xpert M TB/R I F檢測(cè)以及抗酸染色淋巴結(jié)核膿標(biāo)本情況
3種方法所需檢測(cè)時(shí)間分別為(4~8周、2h及2h),陽(yáng)性率分別為(83.90%,82.80%和69.23%),χ2=12.39,P<0.01以MGIT960液體培養(yǎng)為金標(biāo)準(zhǔn),Xpert MTB/RIF檢測(cè)的敏感性與特異性分別為(95.42%和84.00%),Kappa值為0.77,一致性較好(見表1)。
表1156 例患者M(jìn) G I T960培養(yǎng)檢測(cè)及Xpert M TB/R I F陰陽(yáng)性比較例
2.2 Xpert M TB/R I F法等級(jí)與抗酸染色陽(yáng)性等級(jí)
采用行×列表資料χ2檢驗(yàn),χ2=72.66,P<0.01,故兩種檢測(cè)的方法等級(jí)比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,其中Xpert MTB/RIF“極低”級(jí)中5例抗酸染色為陰性的情況,Xpert MTB/RIF低組“低”級(jí)中6例抗酸染色為陰性的情況,Xpert MTB/RIF“中”級(jí)以及“高”級(jí)中未出現(xiàn)抗酸染色陰性的例數(shù)(見表2)。
表2156 例標(biāo)本抗酸染色法陽(yáng)性級(jí)別與Xpert M TB/R I F法檢測(cè)結(jié)果比較例
2.3 Xpert M TB/R I F技術(shù)與傳統(tǒng)比例法藥敏試驗(yàn)?zāi)退幮詸z測(cè)結(jié)果
156例檢測(cè)標(biāo)本以藥敏試驗(yàn)檢測(cè)結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),采用Xpert MTB/RIF技術(shù)檢測(cè)156例菌株的RFP耐藥性,其中有19例標(biāo)本在檢測(cè)中未檢測(cè)出來(lái),137例標(biāo)本檢測(cè)后敏感性、特異性分別為(70.00%和98.42%),檢測(cè)結(jié)果(χ2=0.50)(見表3)。
表3137 例菌株比例法藥敏試驗(yàn)利福平耐藥性與Xpert M TB/R I F方法利福平耐藥性檢測(cè)比較例
2.4 Xpert M TB/R I F法對(duì)利福平耐藥基因突變位點(diǎn)檢測(cè)
分析線性探針?lè)z測(cè)為陽(yáng)性的9例標(biāo)本耐藥基因突變位點(diǎn)分析結(jié)構(gòu)圖(見表4)。
表4 Xpert M TB/R I F耐藥基因突變位點(diǎn)分析及構(gòu)成比
本研究選取肺外結(jié)核中的淋巴結(jié)核病為例,用Xpert MTB/RIF與金標(biāo)準(zhǔn)的檢測(cè)方法MGIT960培養(yǎng)法、抗酸染色法進(jìn)行比較分析,本實(shí)驗(yàn)中抗酸染色的的陽(yáng)性率僅為69.23%較低,傳統(tǒng)結(jié)核菌培養(yǎng)法雖然敏感性及特異性較高,結(jié)核分枝桿菌(結(jié)核桿菌)生長(zhǎng)營(yíng)養(yǎng)要求高,繁殖速度慢所以其檢測(cè)時(shí)間較長(zhǎng),需4~8周,不能及時(shí)為臨床提供治療依據(jù),痰涂片對(duì)標(biāo)本含菌量要求高,導(dǎo)致其診斷結(jié)核病的敏感性較低,在MTB培養(yǎng)陽(yáng)性標(biāo)本中敏感性僅為45%~48%[3-6]Xpert MTB/RIF利福平耐藥性遺傳學(xué)基礎(chǔ)是rpoB基因內(nèi)81bp利福平耐藥決定區(qū)(RIF)的突變[7]。Xpert MTB/RIF技術(shù)是利用MTB耐藥性與基因突變有關(guān)的分子機(jī)制,以rpoB基因?yàn)榘谢?,設(shè)計(jì)引物探針選擇性覆蓋rpoB基因利福平耐藥決定區(qū)81 bp核心區(qū),以檢測(cè)標(biāo)本是否含有結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群以及利福平是否耐藥[8]。整個(gè)實(shí)驗(yàn)僅需要2 h,儀器自動(dòng)檢測(cè)是否為結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群(MTB)及是否對(duì)利福平耐藥。因此,該方法適合于各種標(biāo)本類型進(jìn)行檢測(cè),所以對(duì)肺外結(jié)核病的早期診斷及其耐藥性的檢測(cè)占很大優(yōu)勢(shì)。
研究結(jié)果顯示,Xpert MTB/RIF與MGIT960培養(yǎng)法對(duì)于MTB的檢測(cè)率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,MGIT 960培養(yǎng)和藥敏結(jié)果為參照,Xpert MTB/RIF診斷淋巴結(jié)核的敏感性與特異性分別為(95.42%和84.00%)較高Kappa值為0.77,一致性較好,Xpert MTB/RIF對(duì)利福平檢測(cè)的敏感性/特異性分別為70.00%和98.42%,Kappa值2.54。表明兩種方法對(duì)利福平耐藥性的檢測(cè)具有極好的一致性。與國(guó)內(nèi)穆成等[9]報(bào)道的關(guān)于結(jié)核分支桿菌的檢測(cè)的敏感性90.6%稍微偏低,特異性98.7%相近。
本研究中Xpert MTB/RIF檢測(cè)中與痰抗酸染色比較分析有11例標(biāo)本痰涂片為陰性而Xpert MTB/ RIF檢測(cè)為陽(yáng)性可能與留取的標(biāo)本中捕獲到的結(jié)核菌量較少有關(guān)系。Xpert MTB/RIF檢測(cè)利福平耐藥性與MGIT960藥敏不一致的情況,可能是由于rpoB區(qū)內(nèi)其他突變所致或者由于其他基因突變導(dǎo)致,理論上標(biāo)本中含有一種以上的MTB混合培養(yǎng)或污染時(shí),若其中一種具有突變探針未涵蓋的突變,將出現(xiàn)野生型帶型[10],所以不能完全排除部分突變?yōu)闊o(wú)義突變的原因。
[1]伏志杰,劉麗.對(duì)36例膿腫型頸淋巴結(jié)核治療的觀察[J].中國(guó)實(shí)用醫(yī)藥,2016,11(21):40-41.
[2]鄒遠(yuǎn)嫵,劉尚武,朱蕾,等.檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌及其耐藥性在結(jié)核病輔助診斷中的臨床價(jià)值[J].臨床肺科雜志,2015,20(3):568-570.
[3]VAN RIE A,PAGE-SHIPP L,SCOTT L,et al.Xpert MTB/RIF for point-of care diagnosis of TB in high-HIV burden,resourelimited countries:hype or hope[J].Expert Review of Molecular Diagnostics,2014,10(7):937-946(10).
[4]劉家云,郝曉柯.結(jié)核病實(shí)驗(yàn)室診斷方法新進(jìn)展[J].臨床檢驗(yàn)雜志, 2013,32(2):115-117.
[5]全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查技術(shù)指導(dǎo)組,第四次全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查報(bào)告[J].中華結(jié)核和呼吸雜志,2002,25(1):3-7.
[6]BEHR M A,WARVEN S A,SALAMON H,et al.Transmission of Mycobacterium tuberculosis from patioents smear-negative for acidfast bacilli[J].Lancet,1999,353(9151):444-449.
[7]KIM B J,LEE K H,YUN Y J,et al.Simultaneous identification of rifampin-resistant mycobacterium tuberculosis and nontuberculousmycobacteriaby polymerasechainreaction-singlestrand conformation polymorphism and sequence analysis of the RNA polymerasegene(rpoB)[J].Journal of MicrobiologicalMethods, 2004,58(1):111-118.
[8]BOEHME C C,NABETA P,HILLEMANN D,et al.Rapid molecular detectionof tuberculosis and rifampin resistance[J].New England Journal of Medicine,2010,363(11):1005-1015.
[9]穆成,王志銳,趙慧,等.GenoType MTBDRplus從涂陽(yáng)痰標(biāo)本中檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌耐藥性的效果評(píng)價(jià)[J].中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志,2013, 23(26):1601-1602.
[10]郭明日,王冰冰,張麗霞,等.PCR一線性探針雜交酶顯色法在結(jié)核病診斷與耐藥性檢測(cè)中的應(yīng)用研究[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2016,26(7):1483-1485.
R522
B
10.3969/j.issn.1005-8982.2017.08.028
1005-8982(2017)08-0137-03
2016-11-01
白虹,E-mail:hongbai25@163.com