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雙向電泳中不同樣品裂解液對(duì)水稻葉片疏水蛋白溶解效果比較

2017-11-18 12:03王琳范云峰粱建生
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年18期
關(guān)鍵詞:雙向電泳

王琳+范云峰+粱建生

摘要:為更好地溶解水稻葉片疏水蛋白,比較4種常用裂解液{分別含有4% 3-[(3-膽酰胺丙基)二甲胺]-1-丙磺酸(CHAPS)、2% CHAPS+2% SB3-10、4% ASB-14、4% TritonX-100去垢劑}配方對(duì)水稻葉片疏水蛋白溶解性的影響。結(jié)果表明,含有4% CHAPS去垢劑的裂解液對(duì)水稻葉片疏水蛋白的溶解效果最佳。

關(guān)鍵詞:雙向電泳;裂解液;疏水蛋白;溶解效果

中圖分類號(hào): S188;S511.01 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號(hào):1002-1302(2017)18-0054-02

收稿日期:2017-3-23

基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金(編號(hào):31271622);揚(yáng)州大學(xué)科技創(chuàng)新培育基金(編號(hào):2016CXJ087)。

作者簡(jiǎn)介:王 琳(1978—),女,江蘇徐州人,博士,講師,主要從事植物生理和生化研究。E-mail:wanglin@yzu.edu.cn。

通信作者:梁建生,博士,教授,主要從事植物逆境生理與分子生物學(xué)研究。Tel:(0514)87979054;E-mail:jssliang@163.com。 雙向電泳(2-DE)中樣品裂解液發(fā)展最大的限制來源于既要盡可能充分地溶解樣品,又要保證不影響等電聚焦(isoelectric-focusing,簡(jiǎn)稱IEF)。對(duì)于膜蛋白,用脲和硫脲組合作為離液劑已成共識(shí)[1-5],所以選擇恰當(dāng)?shù)娜ス竸┦歉倪M(jìn)裂解液配方的突破口。去垢劑主要有離子型、非離子型和兼性離子型3類。離子型去垢劑一般不用于IEF,以十二烷基硫酸鈉(SDS)為代表。傳統(tǒng)的非離子型去垢劑多以聚乙二醇辛基苯基醚(TritonX-100)和脂肪醇聚氧乙烯醚(NP-40)為代表,兼性離子型以3-[(3-膽酰胺丙基)二甲胺]-1-丙磺酸(CHAPS)為代表。CHAPS有較強(qiáng)的溶解疏水蛋白的能力,現(xiàn)在較為常用。此外,一些新的兼性離子去垢劑如SB3-10、氨基磺酸甜菜堿-14(ASB-14)也越來越多地被應(yīng)用到2-DE中。有研究認(rèn)為,SB3-10、ASB-14溶解膜蛋白的效果更好一些[6]。另外有研究發(fā)現(xiàn),ASB-14溶解膜蛋白的效果優(yōu)于SB3-10和CHAPS的組合[7]。但對(duì)于水稻葉片疏水蛋白的溶解效果,哪種去垢劑最好,目前的研究還沒有確定的答案。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

以水稻品種日本晴(Oryza sativa L. cv. Nipponbare)為試驗(yàn)材料。

1.2 試劑

雙向電泳系統(tǒng)(Bio-RAD)、線性固相pH梯度(immobilize pH gradients,簡(jiǎn)稱IPG)預(yù)制膠條(Bio-RAD),IPG緩沖液、覆蓋液、3-[(3-膽酰胺丙基)二甲胺]-1-丙磺酸購(gòu)自Amersham pharmacia公司;尿素、四甲基乙二胺(TEMED)、三羥甲基氨基甲烷(Tris)、二硫蘇糖醇(dethilthreitol,簡(jiǎn)稱DTT)、甘氨酸、過硫酸銨、甲叉雙丙烯酰胺均購(gòu)自Amresco公司;其他常用試劑為國(guó)產(chǎn)分析純;所有溶液和緩沖液均使用MilliQ系統(tǒng)提供的電阻不小18.2 MΩ的去離子水。

1.3 水稻葉片疏水蛋白的制備、沉淀與保存

取水稻鮮葉約10 g,凍干,用粉碎機(jī)粉碎凍干葉片,篩出葉片粉末,加入40 mmol/L Tris-HCl(pH值8.4),振蕩 10 min,超聲波處理1 min,4 ℃、21 697 r/min離心1 h,取上清,留沉淀,反復(fù)多次,直至Bradford法測(cè)得的上清液蛋白質(zhì)濃度為0,最終沉淀中所含的蛋白質(zhì)即為水稻葉片的疏水蛋白,將沉淀真空凍干,于-78 ℃保存。

在水稻葉片疏水蛋白凍干粉中加入250 μL 4種不同的裂解液A(含7 mol/L尿素,2 mol/L硫脲,4% CHAPS)、裂解液B(含7 mol/L尿素,2 mol/L 硫脲,2% CHAPS和2% SB3-10)、裂解液C(含7 mol/L尿素,2 mol/L硫脲,4% ASB-14)和裂解液D(含 7 mol/L 尿素,2 mol/L硫脲,4% TritonX-100),30 ℃水浴 1 h,其間充分振蕩,超聲波處理3次(50 s/次),20 ℃、14 953 r/min 離心15 min,取上清,用Bradford法測(cè)上清液的蛋白質(zhì)濃度。

1.4 雙向電泳

配制含150 μg蛋白質(zhì)的水化液,重水化pH值4~7的IPG膠條,等電聚焦35 000 Vh。平衡膠條。將膠條移至二向12.5%的十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)膠上,進(jìn)行二向電泳,電泳結(jié)束后剝膠,銀染法染色顯示蛋白質(zhì)點(diǎn)[8]。掃描儀掃描雙向電泳凝膠圖并進(jìn)行分析。

2 結(jié)果與分析

目前針對(duì)膜蛋白質(zhì)的溶解有多種方法,在不同情況下其溶解效果不同,但在特定情況下卻各有優(yōu)勢(shì)。在2-DE中,對(duì)膜蛋白的溶解用脲和硫脲的組合作為離液劑已成共識(shí),所以各種膜蛋白質(zhì)裂解液的最大不同來自于對(duì)不同的非離子型或兼性離子型去垢劑的使用。本試驗(yàn)比較了目前在2-DE膜蛋白質(zhì)溶解中應(yīng)用較為普遍的4種裂解液[9-12]的蛋白溶解效果。

從圖1可以看出,雖然是相同的上樣量 100 μg,但是A、B、C、D 4種裂解液的結(jié)果卻是有差別的。A和B要好于C和D,因?yàn)锳和B的2-DE圖譜上有更多蛋白質(zhì)點(diǎn)(接近1 500個(gè)),C和D只有1 200個(gè)左右的蛋白質(zhì)點(diǎn)。在本試驗(yàn)中 ASB-14會(huì)使分子量較低的蛋白質(zhì)在酸性端模糊難辨(圖1-C的Ⅰ區(qū)域)。這種結(jié)果不但使2-DE的覆蓋率大大降低,而且會(huì)影響到2-DE的重復(fù)性,從而增大了變異系數(shù)和分析難度,影響結(jié)果的準(zhǔn)確性。圖1-D的區(qū)域Ⅱ、Ⅲ與圖1-A和圖1-B中的相同區(qū)域相比,不但蛋白質(zhì)點(diǎn)數(shù)少,而且相同蛋白質(zhì)的灰度值也不及圖1-A和圖1-B,但是圖1-D的這2個(gè)區(qū)域與圖1-C相比,結(jié)果較好。因此認(rèn)為在2-DE中,用裂解液A和B溶解水稻葉片的疏水蛋白的效果要好于D,D的效果優(yōu)于C。endprint

2-DE是全面分析蛋白質(zhì)的技術(shù),比較A和B,雖然兩者都有高效溶解蛋白質(zhì)的能力,但是兩者對(duì)特定蛋白質(zhì)的溶解能力卻是不同的。在圖1-A、圖1-B中示意了對(duì)應(yīng)的區(qū)域1、2、3和4,在這些區(qū)域中可以發(fā)現(xiàn)A和B的溶解效力還是有細(xì)微差異的。如在區(qū)域1和4,A要優(yōu)于B;在區(qū)域3,B要優(yōu)于A;在區(qū)域2,兩者各自溶解了不同的蛋白質(zhì)??偟膩碚f,含有4%CHAPS去垢劑的裂解液對(duì)水稻葉片疏水蛋白的溶解效果最佳。

3 討論與結(jié)論

目前有研究認(rèn)為SB3-10、ASB-14溶解膜蛋白的效果較好[6],而ASB-14的溶解能力相對(duì)于SB3-10/CHAPS則更強(qiáng)[7]。本試驗(yàn)通過比較了幾種常用的裂解液對(duì)水稻葉片疏水蛋白的溶解效果后發(fā)現(xiàn),CHAPS(4%)的溶解效果最好,CHAPS(2%)和SB3-10(2%)的組合次之,TritonX-100(4%)溶解效果較差,而ASB-14(4%)由于易造成酸性端低分子量區(qū)域模糊,因此效果最差。

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