鐵寶霞 楊波 桑偉 孫曉月孫鵬進(jìn) 閆柯 高峰
作者單位:730050 蘭州 1甘肅中醫(yī)藥大學(xué) 甘肅省干細(xì)胞與基因藥物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;2蘭州軍區(qū)總醫(yī)院結(jié)直腸肛門外科
結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)是世界范圍內(nèi)癌癥相關(guān)死亡第2大常見(jiàn)原因[1],在我國(guó)位居惡性腫瘤病死率第 5 位[2],發(fā)病率在發(fā)展中國(guó)家呈上升趨勢(shì)[1,3]。CRC發(fā)生發(fā)展是多因素、多步驟的過(guò)程,美國(guó)通過(guò)有效地篩查和切除癌前病變,CRC發(fā)生率每年下降2%,但早期CRC檢出率仍不足5%[1],因此探索CRC篩查和早期診斷方法仍是該領(lǐng)域?qū)W者共同努力的方向。糞便DNA檢測(cè)作為一種新興的非侵入性篩查方法,在CRC篩查中具有較大應(yīng)用前景。本文就近年糞便DNA檢測(cè)在CRC篩查和早期診斷中的研究進(jìn)展作一綜述。
結(jié)直腸黏膜表面細(xì)胞不斷脫落到腸腔,脫落后的癌細(xì)胞比正常結(jié)直腸黏膜上皮細(xì)胞有生存優(yōu)勢(shì),正常結(jié)直腸黏膜上皮細(xì)胞在原位發(fā)生凋亡,或從基底膜分離時(shí)迅速退化,然后被巨噬細(xì)胞吞噬;而結(jié)直腸癌細(xì)胞通??傻挚共⑻用撌С驳蛲龆3滞暾沙掷m(xù)從結(jié)直腸黏膜脫落[4]。脫落的癌細(xì)胞排出體外期間可暫時(shí)存在于黏液層而進(jìn)一步得到保護(hù)[5]。但難以從右側(cè)結(jié)腸腫瘤患者收集完整的結(jié)腸細(xì)胞[6]。因此,檢測(cè)發(fā)育不良的癌細(xì)胞成分比全細(xì)胞檢出率更高。同時(shí)腫瘤大量發(fā)育異常細(xì)胞及其成分脫落進(jìn)入腸腔,亦為糞便檢測(cè)提供了分析標(biāo)本。結(jié)直腸屬于堿性環(huán)境,DNA能在糞便內(nèi)穩(wěn)定存在[7],且保持完整,較片段化DNA更易檢測(cè)[8]。此外,可從糞便標(biāo)本中分離DNA進(jìn)行生物標(biāo)志物分析,用于CRC或腺瘤早期檢測(cè)。腫瘤最常見(jiàn)的表觀遺傳學(xué)改變是DNA異常甲基化,而DNA甲基化常發(fā)生在結(jié)直腸癌早期,易在患者糞便中檢測(cè)。
腺瘤性結(jié)腸息肉病基因(adenomatous polyposis coli gene,APC)位于染色體 5q21-22,長(zhǎng)約 108 kb,屬于抑癌基因,負(fù)責(zé)調(diào)控Wnt信號(hào)通路中生長(zhǎng)促進(jìn)基因誘導(dǎo)因子β-連環(huán)蛋白(β-catenin)。APC基因突變發(fā)生在CRC早期階段,突變的APC蛋白不能下調(diào)和抑制Wnt信號(hào)通路中的β-catenin,但可能導(dǎo)致其免于降解,使游離的β-catenin在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)集聚并進(jìn)入細(xì)胞核,從而激活下游相關(guān)靶癌基因,導(dǎo)致腫瘤發(fā)生[9]。有研究報(bào)道,APC基因突變可引發(fā)結(jié)直腸腺瘤性息肉,也可直接導(dǎo)致家族性腺瘤性息肉病(familial adenomatous polyposis,F(xiàn)AP)發(fā)生[10]。Traverso 等[11]檢測(cè) 28例非轉(zhuǎn)移性CRC患者及18例腫瘤直徑>1 cm腺瘤患者糞便樣本中APC基因突變情況,結(jié)果26例被檢出APC突變(敏感性為57%),而對(duì)照組均未檢出。以上研究提示,APC基因突變與CRC早期事件發(fā)生關(guān)系密切,檢測(cè)APC基因可能有助于CRC篩查。
p53基因位于染色體17p,全長(zhǎng)16~20 kb,是目前發(fā)現(xiàn)的與人類腫瘤相關(guān)性最強(qiáng)的抑癌基因。在CRC中,p53基因突變主要發(fā)生在進(jìn)展期腺瘤向癌轉(zhuǎn)變階段,亦是此過(guò)程的關(guān)鍵因素。鐘選芳等[12]在CRC篩查中發(fā)現(xiàn)p53基因在CRC和結(jié)直腸腺瘤中的突變率達(dá)65.2%和25.0%,而正常組不存在突變。劉三紅等[13]從20例CRC手術(shù)切除腫瘤組織和術(shù)前糞便中分別提取DNA,發(fā)現(xiàn)癌組織均有p53外顯子5~8特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,其中發(fā)生突變12例;糞便標(biāo)本80%有p53特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,8例檢測(cè)到相同的基因突變,p53突變的檢出敏感性為66.7%。提示CRC患者或CRC癌前病變患者糞便中均可能存在p53基因突變,其在CRC患者糞便和腫瘤組織中亦存在。因此,糞便中突變的p53基因或可作為早期發(fā)現(xiàn)CRC或CRC癌前病變的重要生物標(biāo)志物,對(duì)其檢測(cè)可作為結(jié)直腸癌篩查的重要輔助手段。
K-Ras基因?qū)儆赗as基因家族,位于染色體12p,編碼蛋白屬三磷酸鳥(niǎo)苷(guanosine triphosphate,GTP)結(jié)合蛋白類,主要參與細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。K-Ras基因突變使GTP蛋白穩(wěn)定處于活化狀態(tài)并持續(xù)信號(hào)傳遞,導(dǎo)致細(xì)胞無(wú)控制增生并惡性轉(zhuǎn)化。在K-Ras基因突變中,主要是密碼子12、13和61突變。吳偉等[14]觀察散發(fā)性CRC K-Ras基因12、13密碼子位點(diǎn)突變情況,發(fā)現(xiàn)12和13密碼子均可發(fā)生突變,12密碼子突變發(fā)生率最高,且易出現(xiàn)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。Li等[15]鑒定CRC和結(jié)直腸晚期腺瘤患者糞便中K-Ras基因的突變情況,突變率分別為82.4%和80.0%,且糞便樣本(45.0%)和參考組織樣本(55.0%)的突變檢測(cè)率高度一致。綜上,目前K-Ras基因已應(yīng)用于臨床,但僅限于血液和腫瘤組織檢測(cè),對(duì)結(jié)直腸癌篩查有一定價(jià)值,在糞便DNA檢測(cè)中的應(yīng)用僅在研究階段,未應(yīng)用于臨床。
痙攣性截癱-20 基因(spastic paraplegia 20,SPG20)定位于13q13.3染色體,編碼Spartin多功能蛋白。研究證實(shí)SPG20基因甲基化與CRC密切相關(guān)。Lind等[16]研究顯示,在CRC或腺瘤細(xì)胞中SPG20基因啟動(dòng)子區(qū)域呈異常高甲基化狀態(tài),而正常黏膜中沒(méi)有SPG20高甲基化。Zhang等[17]收集96例CRC患者癌組織和糞便樣本以及30份健康者糞便樣本,結(jié)果顯示,在組織樣本中,85.4%發(fā)生SPG20超甲基化;在CRC患者糞便樣本中,80.2%發(fā)生SPG20超甲基化,特異性為100%,糞便SPG20基因甲基化檢測(cè)結(jié)果與組織檢測(cè)結(jié)果基本一致。提示糞便SPG20基因甲基化或可代替結(jié)直腸癌組織作為CRC診斷的非侵入性生物標(biāo)志物。
分泌型卷曲相關(guān)蛋白2基因(secreted frizzled-re lated protein,SFRP2)是分泌性糖蛋白家族的重要成員,亦是腫瘤Wnt/β-catenin信號(hào)通路的拮抗因子之一。有研究報(bào)道,當(dāng)SFRP2基因發(fā)生甲基化而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄沉默時(shí),其對(duì)Wnt信號(hào)的拮抗作用減弱或消失,從而導(dǎo)致腫瘤發(fā)生[18]。Zhang等[19]分析 48 例 CRC 患者、35例腺瘤患者、32例增生性息肉和30名正常人糞便樣本中SFRP2基因啟動(dòng)子的甲基化狀態(tài),結(jié)果發(fā)現(xiàn)56.3%的CRC患者、51.4%的腺瘤患者和12.5%的增生性息肉患者檢測(cè)到高甲基化的SFRP2。有報(bào)道[20]SFRP2啟動(dòng)子甲基化是非常敏感的糞便DNA檢測(cè)單一標(biāo)志物。Kriegsh?user等[21]應(yīng)用甲基化特異性反向雜交法(methylation-specific reverse hybridization,MSRH)檢測(cè)18例CRC患者和22名健康志愿者SFRP2基因啟動(dòng)子甲基化狀況,以熒光定量法作為參照,兩種測(cè)定方法均顯示CRC患者SFRP2基因啟動(dòng)子被甲基化,檢測(cè)結(jié)果一致。綜上認(rèn)為,糞便DNA中高甲基化的SFRP2是一種新型的分子生物標(biāo)志物,對(duì)診斷早期CRC有較好應(yīng)用前景。
磷酸酶肌動(dòng)蛋白調(diào)節(jié)因子3(PHACTR3)定位于20q13.32-q13.33染色體,全長(zhǎng)281.3 kb。Rasmussen等[22]系統(tǒng)評(píng)價(jià)了31篇涉及糞便樣本的文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)在糞便樣本中,超甲基化的PHACTR3與早期CRC相關(guān)。Bosch等[23]研究發(fā)現(xiàn),與正常結(jié)腸黏膜相比,晚期腫瘤的PHACTR3基因甲基化水平增加了70倍以上,糞便PHACTR3基因甲基化診斷CRC的敏感性達(dá)66%,特異性為100%,診斷進(jìn)展性腺瘤的敏感性為32%。PHACTR3基因是一個(gè)新發(fā)現(xiàn)的CRC高甲基化基因,在CRC篩查中亦有一定應(yīng)用前景。
早期關(guān)于CRC糞便DNA的研究多限于單基因突變檢測(cè),但其靈敏度并不理想。近年,學(xué)者致力于糞便多基因多靶點(diǎn)聯(lián)合檢測(cè)研究,以尋求最佳敏感性和特異性組合。
Binefa等[24]分析了26例CRC患者糞便中的K-Ras和p53基因,發(fā)現(xiàn)多靶點(diǎn)檢測(cè)可提高糞便DNA的敏感性和特異性。Yang等[25]采用L-DNA分析K-Ras、p53和APC基因突變和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性標(biāo)記BAT-26,其聯(lián)合檢測(cè)CRC的敏感性為91%,特異性為93%。Oh等[26]在對(duì)4 000多例受試者的大型多中心研究中,發(fā)生結(jié)直腸浸潤(rùn)性癌糞便DNA檢測(cè)的敏感性是糞便隱血試驗(yàn)的4倍(51.6%vs 12.9%,P=0.003),是高度異型增生腺瘤敏感性的2倍以上(40.8%vs 14.1%,P<0.001),提示糞便DNA較糞便隱血試驗(yàn)?zāi)芨舾械貦z測(cè)早期CRC。Kalimutho等[27]使用定量變性高效液相色譜法檢測(cè)K-Ras、APC、p53和 BRAF基因量化糞便DNA完整性狀態(tài),結(jié)果顯示,4個(gè)基因擴(kuò)增分析提高了對(duì)單基因擴(kuò)增、鈣衛(wèi)蛋白評(píng)估或免疫法糞便隱血試驗(yàn)(immune fecal occultbloodtest,IFOBT)的敏感性。
張虎等[28]研究發(fā)現(xiàn)糞便中 SFRP1、SFRP2、SFRP5和WIF-1基因在CRC及腺瘤中均被甲基化,在CRC中的甲基化率分別為68.8%、56.3%、45.8%和60.4%,高于腺瘤和增生性息肉。聯(lián)合檢測(cè)4種糞便基因甲基化,CRC和腺瘤的檢出率提高,敏感性高達(dá)81.8%,特異性為93.3%,明顯高于糞便隱血試驗(yàn)。Aguilera等[29]研究發(fā)現(xiàn),在整個(gè)CRC發(fā)生過(guò)程中出現(xiàn)SFRP1、SFRP2和WIF-1基因甲基化相關(guān)沉默,提示糞便中Wnt拮抗基因甲基化可能成為篩查早期結(jié)直腸癌非侵入性的生物學(xué)標(biāo)志物。
有研究聯(lián)合檢測(cè) NDRG4、BMP3、TFPI2和vimentin 4個(gè)甲基化基因,CRC的檢出率為85%,腫瘤直徑≥1 cm的腺瘤患者檢出率為54%,特異性為90%[30]。Imperiale 等[31]應(yīng)用高甲基化 NDRG4、BMP3與K-Ras突變,發(fā)現(xiàn)糞便DNA檢測(cè)CRC的敏感性為92.3%,特異性為86.6%,在檢測(cè)晚期癌前病變方面優(yōu)于IFOBT,但特異性較低。Park等[32]研究發(fā)現(xiàn),甲基化的NDRG4、BMP3、TFPI2和SFRP2啟動(dòng)子在CRC樣本中檢測(cè)率分別為68.8%、40.0%、31.4%和60.0%,高于腺癌樣本中的檢出率,4個(gè)標(biāo)志物聯(lián)合檢測(cè)CRC和腺癌的敏感性分別為94.3%和72.2%,但特異性較低。提示 NDRG4、BMP3、TFPI2 和 vimentin 或 SFRP2 基因聯(lián)合檢測(cè),敏感性較高,但3個(gè)或4個(gè)甲基化標(biāo)志物檢測(cè)尚不足以用于人群CRC篩查,需進(jìn)一步驗(yàn)證人群中這些標(biāo)志物的甲基化,為CRC尋找新的標(biāo)志物。
Johnson 等[33]研究 SFRP2、TMEFF2 和 MGMT 基因在CRC患者糞便樣本中的甲基化狀況,發(fā)現(xiàn)超甲基化的TMEFF2和單獨(dú)MGMT僅顯示中等敏感性和特異性,加入SFRP2分析后,診斷CRC和癌前病變的敏感性增加到93.7%。有研究發(fā)現(xiàn),超甲基化的SFRP2診斷高度發(fā)育不良腺瘤的敏感性為46.0%~66.7%,亦提示其在CRC早期發(fā)展中的作用[34]。由此認(rèn)為,聯(lián)合檢測(cè)TMEFF2、MGMT和SFRP2基因可能對(duì) CRC及其癌前病變?cè)\斷具有重要作用。
CRC發(fā)病是結(jié)直腸細(xì)胞DNA中遺傳和表觀遺傳學(xué)改變的逐漸積累,單基因突變或分子標(biāo)志物改變常被用于CRC篩查,糞便DNA檢測(cè)具有非侵入性、患者依從性好、高敏感性和高特異性等優(yōu)點(diǎn),但單基因檢測(cè)的敏感性和特異性并不理想,多基因聯(lián)合檢測(cè)成為研究熱點(diǎn)。然而,目前糞便DNA檢測(cè)費(fèi)用較高,檢測(cè)技術(shù)亦尚不成熟,如何選擇合理聯(lián)合檢測(cè)基因以提高CRC檢測(cè)敏感性及特異性是面臨的難題和挑戰(zhàn)。相信隨著該領(lǐng)域?qū)W者不懈努力以及分子生物技術(shù)不斷發(fā)展,糞便DNA檢測(cè)技術(shù)有望成為CRC早期診斷及篩查的重要輔助手段。