程 斌, 辛智海, 高 旭, 隋建樞, 曹 寧, 丁延慶, 何慶才, 張立異
(1.貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院旱糧研究所, 貴陽550006; 2.貴州大學(xué)生命科學(xué)院, 貴陽550025)
在水稻、玉米和高梁等谷類作物中都存在由自然變異形成的糯性類型,并有糯性品種(系)應(yīng)用于生產(chǎn)。然而,同為谷類作物的普通小麥,迄今為止自然界尚未發(fā)現(xiàn)其糯性類型。1993年日本學(xué)者發(fā)現(xiàn),在控制小麥的籽粒直鏈淀粉合成中,有一種酶起著主要作用,這種酶就是顆粒結(jié)合淀粉合成酶(Granule-bound starch synthase I,簡稱GBSSI),也稱 Waxy蛋白。直鏈淀粉含量較高的小麥存在Waxy蛋白,而直鏈淀粉含量很低的小麥缺少甚至沒有 Waxy蛋白,Waxy蛋白的存在與否決定著谷物的糯性和非糯性,編碼Waxy蛋白的等位基因被命名為Wx基因。普通六倍體小麥(Triticum aestivumL.,AABBDD)含有3種Wx 蛋白亞基:Wx-A 1、Wx-B 1和 Wx-D 1,分別位于染色體7 AS、4AL和7DS上,它們相應(yīng)的表達(dá)型等位基因為Wx-A1a、Wx-B1a、Wx-D1a,相應(yīng)的缺失型為 Wx-A1b、Wx-B1b、Wx-D1b[1]。任一種蛋白亞基的缺失或失活可導(dǎo)致直鏈淀粉含量降低,一方面可能是更多物質(zhì)參與支鏈淀粉合成,導(dǎo)致直鏈淀粉合成的絕對量下降;另一方面可能是直鏈淀粉含量下降,支鏈淀粉含量不變,導(dǎo)致直鏈淀粉相對量的減少。3個蛋白亞基均存在天然缺失,如日本小麥品種關(guān)東107缺失Wx-A 1和Wx-B 1蛋白亞基,中國地方品種白火麥缺失 Wx-D 1蛋白亞基,其相應(yīng)基因被分別命名為Wx-A1b、Wx-B1b和Wx-D1b。Nakamura等[2]在關(guān)東107小麥和白火麥雜交后代中選育出了世界上第一個直鏈淀粉含量在0.6%~0.7%之間的糯小麥。
糯小麥的低直鏈淀粉含量這一特性使其在面條加工業(yè)、淀粉加工業(yè)及其它工業(yè)上有著重要的用途。比如可以提高面條的品質(zhì);低直鏈淀粉品種穗不易發(fā)芽,避免收獲前的產(chǎn)量損失,還能避免加工中α-淀粉酶活性升高造成的面粉質(zhì)量下降;糯小麥的面粉可以用于配粉,提高面條的品質(zhì),改善饅頭的白度,延長速凍食品的貨架壽命;糯小麥還可以用于生產(chǎn)環(huán)保塑料、糯米紙類食品包裝紙、硬紙板、濃縮劑、漿糊、涂料原料、紡織業(yè)的打漿劑等;特別是糯小麥在釀酒方面具有較大利用價值。趙國君等研究表明,在酒廠生產(chǎn)條件下,糯小麥白酒有相對較高的出酒率和雜醇類物質(zhì)含量、適中的酸類和酯類物質(zhì)含量、較低的醛類物質(zhì)含量,糯小麥白酒在氣味和口感方面優(yōu)于其它試驗組白酒[3]。貴州是白酒的主產(chǎn)區(qū),對釀酒原料需求大,選育出適應(yīng)貴州種植的酒用糯小麥,在改善貴州白酒品質(zhì)的同時,還可以增加農(nóng)民收益,實現(xiàn)雙贏的局面。
分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)(Marker Assisted Selection,MAS)是利用與目標(biāo)性狀緊密連鎖的DNA分子標(biāo)記對作物目標(biāo)性狀進(jìn)行間接選擇,在早代就能夠?qū)δ繕?biāo)基因的轉(zhuǎn)移進(jìn)行準(zhǔn)確、穩(wěn)定的選擇,而且克服隱性基因再度利用時識別的困難,從而加速育種進(jìn)程,提高育種效率,選育抗病、優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)的新品種。MAS技術(shù)在小麥的分子育種中得到了廣泛應(yīng)用。在糯小麥的 MAS中,舒守貴等[4]以中國春糯性位點全套近等基因系為研究材料,用小麥Wx基因的6個STS標(biāo)記和1個CAPS標(biāo)記進(jìn)行了篩選;張晶等[5]對173份小麥的蛋白質(zhì)亞基進(jìn)行分子標(biāo)記掃描并構(gòu)建了多重 PCR;王亮等[6]利用 Wx-A 1、Wx-B 1和 Wx-D 1位點的3個STS標(biāo)記對250份新疆小麥品種Wx基因的組成進(jìn)行了鑒定,同時測試了185份冬、春小麥品種的淀粉糊化特性。
為了提高適應(yīng)貴州生產(chǎn)的抗病糯小麥的育種效率,本實驗采用 Wx-B1、Wx-A1、Wx-D1基因的分子標(biāo)記[7-8],對本地優(yōu)良品系與糯小麥的雜交后代進(jìn)行Wx基因鑒定與篩選,評估分子標(biāo)記在糯質(zhì)小麥MAS育種中的應(yīng)用,為加快糯性小麥新品種的選育奠定基礎(chǔ)。
本實驗采用小麥品系俞糯麥、自育品系0117以及雜交F2代的56個單株為試驗材料。俞糯麥為不攜帶任何3個Wx基因的全糯質(zhì)小麥材料,由重慶地區(qū)農(nóng)科所提供。自育品系0117是一個綜合性狀較好并具有良好抗性的完全非糯質(zhì)小麥品系,由貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院旱糧研究所選育并提供。
實驗中使用的3對Wx基因分子標(biāo)記中,與等位基因Wx-A1a/b和Wx-D1a/b連鎖的標(biāo)記是SSR標(biāo)記,而與Wx-B1a/b連鎖的標(biāo)記是STS標(biāo)記。它們名稱、序列信息及擴(kuò)增片段大小如表1所示。
親本及群體種子發(fā)芽,幼苗培養(yǎng)至一葉一心,基因組DNA的提取采用CTAB法[9],略做改動,將DNA樣品稀釋到50ng/μL備用。
PCR 擴(kuò)增SSR 引物根據(jù)http://www.graingenes.org公布的引物序列,由上海捷瑞生物工程有限公司合成。在 MJ Research PTC-200型PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)。PCR反應(yīng)體系(15μL):DNA 模板5.0 μL;10×Buffer 2.0μL;MgCl21.2μL;2.5mmol/L dNTP 0.4μL;10mmol/L 引物各0.8μL;2.5U/μL Taq酶0.2μL;ddH2O 4.6μL。
基本反應(yīng)條件:94℃3min;94℃2min,58℃/61℃1min(視引物退火溫度而定),72℃2min,35個循環(huán);72℃延伸10min;10℃保存。取3μL擴(kuò)增產(chǎn)物在6%非變性連續(xù)PAGE上恒壓(130~150V),電泳2~2.5h,銀染,凝膠自動成像系統(tǒng)觀察、照相?;蛘呷?2.5μL擴(kuò)增產(chǎn)物在0.8%的瓊脂糖膠上100V,電泳30min,EB染色,凝膠自動成像系統(tǒng)觀察、照相。
表1 Wx基因的分子標(biāo)記
本研究利用Excel軟件對實驗數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計和卡方驗證分析??ǚ津炞C是將實際比數(shù)與理論比數(shù)進(jìn)行比較,以確定二者的符合程度,從而確定某一分離比例是否能用某種遺傳規(guī)律去解釋。計算公式為:
卡方值(X2)=(觀測值-理論值)2/理論值。
自育品系0117是完全非糯質(zhì)小麥,其基因型為Wx-A1a、 Wx-A1a/Wx-B1a、 Wx-B1a/Wx-D1a、Wx-D1a,而俞糯麥?zhǔn)侨促|(zhì)小麥,其基因型Wx-A1b、Wx-A1b/Wx-B1b、Wx-B1b/Wx-D1b、Wx-D1b。利用與3個糯質(zhì)基因Wx-A1、Wx-B1和Wx-D1緊密連鎖的分子標(biāo)記 Mag 264、BDFL/BRD和 Mag 269掃描2個親本以及56個F2代的單株,結(jié)果如圖1所示。
Mag 264為共顯性標(biāo)記(SSR),獲得2個擴(kuò)增片段分別為336bp和317bp,其中317bp片段與糯質(zhì)等位基因位點Wx-A1b連鎖。56個F2后代中,10個單株攜帶非糯質(zhì)的等位基因位點Wx-A1a,基因型為Wax-A1a、Wax-A1a,為非糯質(zhì)小麥;14個單株攜帶糯質(zhì)的等位基因位點Wax-A1b,基因型為Wax-A1b、Wax-A1b,為糯質(zhì)小麥;其余25個單株是雜合體,基因型為Wax-A1a、Wax-A1b,為非糯質(zhì)小麥,另外有7個單株未檢測到條帶。利用卡方檢驗,在顯著水平p>0.05時,X2=0.714,說明該位點在F2代群體分離比符合AA∶Aa∶aa=1∶2∶1的分離比(圖1,表2)。
BDFL/BR為顯性標(biāo)記(STS),PCR擴(kuò)增產(chǎn)生一個425bp片段,與非糯質(zhì)的等位基因Wx-B1a緊密連鎖。56個F2后代中,32個單株攜帶此片段,說明它們的 基因型 為Wx-B1a、Wx-B1a 或Wx-B1a、Wx-B1b,應(yīng)為非糯性小麥;24個單株沒有此位點,說明其基因型為Wx-B1b、Wx-B1b,為糯性小麥。利用卡方檢驗,在p>0.05時,X2=0.002,說明F2代分離比符合(BB+Bb)∶bb=3∶1(圖2,表2)。
Mag 269為共顯性標(biāo)記(SSR),但是在PCR擴(kuò)增產(chǎn)物結(jié)果中卻表現(xiàn)為顯性標(biāo)記,可能是Wx-D1基因3’端大片段缺失的雜合體DNA結(jié)構(gòu)會影響PCR的擴(kuò)增[8],PCR 擴(kuò)增獲得2個片段分別為1 400bp和800bp,其中800bp片段與糯質(zhì)基因Wx-D1b連鎖。56個F2后代中,22個單株攜帶非糯質(zhì)的等位基因位點Wx-D1a,為非糯質(zhì)小麥;34個單株攜帶糯質(zhì)的等位基因位點Wx-D1b。該位點在F2代的分離符合DD∶(Dd+dd)=1∶3的分離比(X2=0.136,p>0.05)(圖3,表2)。
圖1 標(biāo)記Mag 264在品系0117和俞糯麥的F2代群體部分單株的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物
圖2 標(biāo)記BDFL/BR在品系0117和俞糯麥的F2代群體部分單株的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物
圖3 標(biāo)記Mag269在品系0117和俞糯麥的F2代群體部分單株的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物
表2 F2后代Wx基因位點掃描結(jié)果
續(xù)表2
對3個標(biāo)記的掃描結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn),在56個F2代分離群體中,3個基因位點都存在的材料有4株(7.14%);單缺失 Wx-A1a 或 Wx-B1a 或 Wx-D1a基因位點的材料編號分別為5(8.93%)、8(14.29%)和19(33.93%);Wx-A1a 和Wx-B1a 基因位點同時缺失的材料為5株(8.93%);Wx-A1a 和 Wx-D1a 基因 位點 同 時 缺 失 的 材 料 為 4 株 (7.14%);Wx-B1a 和Wx-D1a基因位點同時缺失材料為11株(19.64%);3個基因位點都缺失的全糯質(zhì)單株未發(fā)現(xiàn)。
貴州釀酒的歷史悠久,糯小麥具有良好的釀酒特性,但是貴州省內(nèi)缺乏具有推廣價值的糯性小麥,省外引進(jìn)的糯質(zhì)小麥品種易感條銹病、白粉病和赤霉病等病害,無法適應(yīng)貴州的生態(tài)氣候環(huán)境,因此選育綜合性狀優(yōu)良、產(chǎn)量高的糯性小麥新材料擁有巨大市場前景和科研價值。糯性小麥鑒定方法很多,比如利用半粒種子可以進(jìn)行碘染色檢測,但只能鑒定糯與非糯,無法鑒定部分糯小麥類型。改良的Waxy蛋白SDS-PAGE電泳方法雖簡化了步驟,降低了成本,但Wx-B1和Wx-D1遷移率非常接近,仍難以區(qū)分,且該方法需要破壞種子,在大量篩選和分離后代檢測中的應(yīng)用也受到限制。Wx-A1b、Wx-B1b和Wx-D1b都是隱性基因,利用傳統(tǒng)育種通常需要較長的育種年限;并且當(dāng)只有1~2個隱性基因存在時,即使純合體也很難根據(jù)表型對其進(jìn)行直接選擇。因此,分子標(biāo)記輔助選擇是培育不同支鏈淀粉含量小麥品種的最有效方法。
近年來,根據(jù)Wx基因的已知序列,相繼開發(fā)出了3個位點的分子標(biāo)記[7-11]和這些分子標(biāo)記在基因型鑒定中具有快速、準(zhǔn)確和簡單等諸多優(yōu)點,在植株整個發(fā)育時期和任何部位均可取材檢測。段軍[12]利用糯質(zhì)基因分子標(biāo)記鑒定出12個株系的全糯藍(lán)粒小麥;馬紅勃[13]以揚麥17(紅皮)和揚麥01-2(白皮)2個背景的wx基因近等基因系,對不同遺傳背景和栽培環(huán)境下材料的品質(zhì)特性進(jìn)行了研究;許立奎等[14]利用多重PCR技術(shù)鑒定F2代群體內(nèi)的糯質(zhì)基因;楊芳萍等[15]利用糯質(zhì)基因分子標(biāo)記對甘肅小麥糯質(zhì)蛋白分布進(jìn)行研究,結(jié)果表明Wx-B1b基因從西向東南部逐漸降低;普布卓瑪[16]通過雜交、回交以及自交等方法將3個糯蛋白缺失基因聚合在一個小麥遺傳背景中。
本研究利用糯質(zhì)基因特異分子標(biāo)記,在F2代分離群體內(nèi)發(fā)現(xiàn)單個缺失Wx基因材料的數(shù)目依次為Wx-D1a最 多、Wx-B1a 其 次、Wx-A1a 最 少,但 是 未能發(fā)現(xiàn)同時缺失3個Wx基因的全糯質(zhì)小麥株系,這應(yīng)該與分離群體較小有關(guān)。根據(jù)孟德爾分離定律,位于不同染色體上3個等位基因(Aa/Bb/Dd)的分離情況中,3個隱形等位基因同時出現(xiàn)的頻率為1.56%(1/64)。由于F2代分離群體只有56個,3個隱形基因同時出現(xiàn)的理論值應(yīng)該等于0.875,所以在群體中沒有檢測到同時缺失3個Wx基因的株系也屬正常。理論上1 000個F2代群體只能獲得16株全糯小麥,如果還需要考慮抗病和高產(chǎn)等其他性狀,F(xiàn)2代群體還需要進(jìn)一步增加。因此,為了選育具有較好綜合性狀的抗病全糯質(zhì)小麥,需要擴(kuò)大候選群體大?。ǎ? 000),或者利用部分糯性小麥品系間的雜交,比如F2代群體內(nèi)單缺失wx-A1a的5個單株與缺失wx-B1a+wx-D1a的11個單株雜家,再利用回交、聚合雜交等方法提高全糯質(zhì)小麥的選育效率。
本次實驗采用自育品系0117和俞糯麥作為親本,對他們的雜交后代利用Wx基因分子標(biāo)記篩選糯質(zhì)小麥。在顯著水平p>0.05時,3個糯質(zhì)基因在F2代中的分離比例符合預(yù)期比例,并檢出了不同Wx基因組合的小麥單株,但是未能檢測出3個基因都缺失的全糯質(zhì)小麥單株。本研究結(jié)果表明,在生產(chǎn)實踐中利用標(biāo)記輔助選擇技術(shù),結(jié)合傳統(tǒng)的育種經(jīng)驗,可以加快貴州省高產(chǎn)、糯質(zhì)小麥的創(chuàng)新及應(yīng)用。
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