趙良娟,李宗夢,王淞,張宏偉,鄭文杰
(天津出入境檢驗(yàn)檢疫局,天津300461)
近年來,食品質(zhì)量與安全問題成為我國及國際社會(huì)普遍關(guān)注的熱點(diǎn)問題。由于經(jīng)濟(jì)利益的驅(qū)動(dòng),一些不法分子為牟取暴利,在畜肉和禽肉制品中攙雜使假、以假亂真,以價(jià)格低廉的畜禽肉代替價(jià)格高的畜禽肉,市場亂象令人堪憂[1-5]。尤其是2013年初,影響歐洲16個(gè)國家的“馬肉丑聞”事件[6]中,造假者使用來源于退役的賽馬肉冒充牛肉,多家企業(yè)召回?cái)?shù)以百萬計(jì)“牛肉”漢堡。該食品安全事件引發(fā)了公眾對食品安全的擔(dān)憂以及各國政府的高度關(guān)注。
國內(nèi)外的學(xué)者應(yīng)用PCR及實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)對食品中牛、羊、馬、豬、雞、鴨等動(dòng)物源成分進(jìn)行了有效鑒別[7-12],我國于2008年發(fā)布了食品中牛成分檢測的實(shí)時(shí)熒光PCR方法的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)[13],標(biāo)準(zhǔn)中采用商品化硅膠柱層析法試劑盒提取食品DNA,再采用商品化實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒對牛成分進(jìn)行檢測。
硅膠層析柱法商品化試劑盒多步離心操作耗時(shí)長,不利于自動(dòng)化操作,尤其對于深加工食品核酸提取純度低,耗時(shí)長。免疫磁分離技術(shù)給深加工食品DNA提取帶來了新的方法,該方法提取DNA無需使用有機(jī)溶劑對蛋白進(jìn)行抽提變性,省去了離心步驟,綠色環(huán)保,且易于實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)具有高效、快速的優(yōu)點(diǎn),但是需要大型儀器設(shè)備和進(jìn)口試劑,價(jià)格昂貴,且對操作人員有較高的技術(shù)要求。當(dāng)食品安全事件發(fā)生時(shí),往往需要將樣品送到具備檢測能力的實(shí)驗(yàn)室花費(fèi)數(shù)天時(shí)間進(jìn)行檢測,為食品安全現(xiàn)場監(jiān)管和迅速響應(yīng)帶來了困難。
因此,開發(fā)高效的核酸前處理和低成本、易操作、具有較高的靈敏度、準(zhǔn)確度的現(xiàn)場快速檢測的方法用于樣品初篩,不僅能夠降低成本、解決依賴大型設(shè)備等問題,而且可以滿足食品摻假問題控制與監(jiān)管的需要,具有重要意義。
膠體金免疫層析法(goldimmunochromagraphy assay)是20世紀(jì)80年代末發(fā)展起來的一種快速的免疫學(xué)測定方法[14],是膠體金標(biāo)記技術(shù)和免疫層析技術(shù)相結(jié)合的產(chǎn)物,基本原理是利用微孔濾膜的滲濾濃縮和毛細(xì)管作用,使抗原抗體發(fā)生反應(yīng),在檢測線位置,陽性反應(yīng)在試紙條上出現(xiàn)紅色條帶,陰性反應(yīng)不顯色。
PCR與通用核酸檢測免疫金標(biāo)層析試紙條相結(jié)合的方法具有快速、高效、成本低等優(yōu)勢,通過核酸引物兩端修飾相應(yīng)標(biāo)記物(如生物素、熒光素),同時(shí)試紙條上相應(yīng)位置標(biāo)記對應(yīng)抗體,就可以實(shí)現(xiàn)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的試紙條檢測。目前該技術(shù)已應(yīng)用于食品中致病菌的檢測[15-16]。
本研究應(yīng)用免疫磁分離方法提取食品中的核酸,根據(jù)牛線粒體基因組特異性基因片段設(shè)計(jì)引物,建立免疫磁分離結(jié)合PCR-試紙條快速檢測食品中牛成分的方法,為檢測和鑒別食品中牛成分提供一種快速、簡便的分子生物學(xué)初篩方法。
試驗(yàn)所用雞、鴨、鵝、鵪鶉、貓、狗、鼠、豬、馬、牛 、水牛、羊、驢、鹿、駱駝、兔、貂、狐貍、胡蘿卜、白菜為天津出入境檢驗(yàn)檢疫局提供,所有樣品經(jīng)基因組測序和比對確認(rèn)為相應(yīng)物種。市售樣品包括鮮牛肉、冷凍牛肉、醬牛肉、番茄牛排、牛肉干、牛肉醬,均購自超市。
磁珠法基因組DNA提取試劑、RNase酶(4 mg/mL)dNTP Mixture、10X PCRbuffer(Mg2+Plus)、Taq DNA polymerase(TaKaRa-TagTM):Promega生物技術(shù)公司;瓊脂糖:sigma公司;Loading buffer,DNA分子量標(biāo)準(zhǔn):天根生化科技有限公司;核酸通用試紙條及展開液:北京華大蛋白研發(fā)中心有限公司。
PCR 擴(kuò)增儀(T00)、凝膠成像儀(XR+):Bio-Rad公司;離心機(jī)(5417R):Eppendorf公司;電泳儀(P25):Biometra公司。
以牛肉為陽性樣品,以駱駝肉模擬摻假樣品,將牛肉與駱駝肉切片,60℃烘干,研磨成粉末,過18目篩篩取粉末,制備牛肉/駱駝肉的混合模擬樣品,以牛肉肉粉的質(zhì)量百分比為100%、50%、25%、10%、5%、1%、0.1%、0.01%、0.001%比例混勻,制備不同質(zhì)量百分比的牛肉模擬摻假樣品。
稱取500 mg樣品放入EP管中,加入500 μL Lysis buffer A,5 μL RNase酶;加入 250 μL Lysis buffer B,振蕩,室溫10 min;加入750 μL沉淀劑,劇烈振蕩,13 000 r/min離心10 min;取上清液于另一EP管中,加入50 μL磁性微球(約0.1 g/mL),加入0.8倍體積異丙醇,室溫5 min,翻轉(zhuǎn)混勻,磁分離后除去液體;加入250 μL Lysis buffer B,磁分離后除去液體;加入70%乙醇1 mL洗滌,共洗3次,除去乙醇,室溫晾干;加入100 μL TE,65℃水浴5 min。磁分離后,收集洗脫液。
根據(jù)NCBI中已經(jīng)發(fā)表的牛線粒體基因組序列為依據(jù),以牛線粒體基因組Cytb區(qū)域?yàn)榘袠?biāo),應(yīng)用Geneious 6.1序列分析軟件進(jìn)行引物設(shè)計(jì),設(shè)計(jì)了一對牛線粒體DNA Cytb區(qū)的引物,上游引物為F1,下游引物為R1,目的片段561 bp。試紙條檢測用的上下游引物分別用異硫氰酸熒光素(FITC)和生物素(biotin)標(biāo)記,上游引物為F2,下游引物為R2,引物由上海生工生物有限公司合成。
1.2.4.1 PCR反應(yīng)體系
模板 DNA 1.0 μL,PrimerF1/R1 或 F2/R2 0.8 μL,dNTP mixture 2.0 μL,10X PCRbuffer(Mg2+Plus)2.0 μL,ExTaqHotStart(TaKaRaTaqTM)0.2μL,ddH2O13.2μL,總體積20 μL。反應(yīng)條件為94℃預(yù)變性5 min;94℃變性 30 s,55℃退火 30 s,72℃延伸 30 s,30 個(gè)循環(huán)后進(jìn)入72℃5 min。
1.2.4.2 電泳檢測
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,電壓100 V,電流110 A,時(shí)間40 min,檢測有無目的條帶。
1.2.4.3 試紙條檢測
取5 μL PCR產(chǎn)物點(diǎn)于核酸試紙條樣品墊,再滴加95 μL展開液進(jìn)行檢測,5分鐘后觀察結(jié)果。試紙條質(zhì)控帶出現(xiàn)紅色為有效結(jié)果,檢測帶出現(xiàn)紅色為可疑陽性,檢測帶未出現(xiàn)紅色為陰性,可疑陽性樣品需進(jìn)行測序或熒光PCR方法驗(yàn)證[13]。
1.2.4.4 測序
PCR擴(kuò)增后的產(chǎn)物經(jīng)純化后送去上海生工進(jìn)行測序。
1.2.5.1 引物的特異性檢測
以?;蚪MDNA為陽性對照品,選擇雞、鴨、鵝、鵪鶉、貓、狗、鼠、豬、馬、水牛、羊、驢、鹿、駱駝、兔、貂、狐貍及胡蘿卜、白菜等的基因組DNA為陰性對照,以無菌水為空白對照,用建立的PCR-試紙條方法進(jìn)行檢測,以鑒定引物的特異性。
1.2.5.2 方法的靈敏度檢測
以牛肉為陽性樣品,100%、50%、25%、10%、5%、1%、0.1%、0.01%、0.001%等不同質(zhì)量百分比的牛肉/駱駝肉混合模擬樣品,提取基因組DNA,用建立的PCR-試紙條方法進(jìn)行檢測,并與電泳檢測結(jié)果進(jìn)行比較,以驗(yàn)證方法的靈敏度。
1.2.5.3 方法的穩(wěn)定性檢測
用建立的PCR-試紙條法對0.01%牛肉和駱駝肉混合樣品的DNA進(jìn)行低限穩(wěn)定性檢測,重復(fù)檢測20次,以牛肉、駱駝肉的DNA為陽性對照和陰性對照。
1.2.6.1 售樣品磁珠法提取核酸
以購自超市的生鮮牛肉、冷凍牛肉、醬牛肉、番茄牛排、牛肉干、牛肉醬等不用加工方式處理的深加工牛肉制品為樣品,應(yīng)用磁珠法提取核酸,檢測核酸的純度。
1.2.6.2 市售樣品的PCR-試紙條方法檢測
對購自超市的生鮮牛肉、冷凍牛肉、醬牛肉、番茄牛排、牛肉干、牛肉醬等36份樣品,應(yīng)用所建立的免疫磁珠分離結(jié)合PCR-試紙條方法檢測牛源性成分。
利用所設(shè)計(jì)的引物,以1.2.4PCR-試紙條反應(yīng)體系及程序進(jìn)行特異性檢測,試紙條結(jié)果如圖1所示。
圖1 牛源性成分特異性引物PCR-試紙條檢測結(jié)果Fig.1 Species specificity of PCR immune-lateral flowstrips with bovine primers
陽性樣品PCR擴(kuò)增產(chǎn)物試紙條檢測帶和質(zhì)控帶均為紅色,結(jié)果為可疑陽性,而其他動(dòng)植物樣品均只有質(zhì)控帶變紅色,檢測帶無色,結(jié)果陰性。
將引物F1,R1擴(kuò)增的牛擴(kuò)增產(chǎn)物送去測序,測序結(jié)果如下,經(jīng)比對,符合率為99%。
AATAGCCACAGCATTTATAGGATACGTCCTACCATGAGGACAAATATCATTCTGAGGAGCAACAGTCATCACCAACCTCTTATCAGCAATCCCATACATCGGCACAAATTTAGTCGAATGAATCTGAGGCGGATTCTCAGTAGACAAAGCAACCCTTACCCGATTCTTCGCTTTCCATTTTATCCTTCCATTTATCATCATAGCAATTGCCATAGTCCACCTACTATTCCTCCACGAAACAGGCTCCAACAACCCAACAGGAATTTCCTCAGACGTAGACAAAATCCCATTCCACCCCTACTATACCATTAAGGACATCTTAGGGGCCCTCTTACTAATTCTAGCTCTAATACTACTAGTACTATTCGCACCCGACCTCCTCGGAGACCCAGATAACTACACCCCAGCCAATCCACTCAACACACCCCCTCACATCAAACCCGAGTGATACTTCTTATTTGCATACGCAATCTTACGATCAATCCCCAACAAACTAGGAGGAGTACTAGCCCTAGCCTTCTCTATCCTAATTCTTGC
以不同質(zhì)量百分比的牛肉/駱駝肉模擬摻假樣品為研究對象,應(yīng)用磁珠法提取DNA后,采用建立的PCR-試紙條反應(yīng)體系進(jìn)行靈敏度檢測,試紙條檢測結(jié)果如圖2A所示,當(dāng)牛肉在混合肉品中的比例為100%、50%、25%、10%、5%、1%、0.1%、0.01%時(shí),試紙條質(zhì)控帶和檢測帶均能顯示紅色條帶,最低檢測限可達(dá)0.01%,比電泳(見圖2B)靈敏度高10倍。
圖2 牛源性成分靈敏度電泳及PCR-試紙條檢測結(jié)果Fig.2 Sensitivity of bovine specific PCR in meat mixture
用建立的PCR-試紙條法對0.01%的牛肉和駱駝肉混合樣品的DNA進(jìn)行20次低限穩(wěn)定性檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)0.01%牛肉/駱駝肉樣品,20次試紙條檢測檢測線均變紅,說明檢測低限的穩(wěn)定性好。
應(yīng)用免疫磁珠法提取市售樣品包括鮮牛肉、冷凍牛肉、醬牛肉、番茄牛排、牛肉干、牛肉醬的DNA,經(jīng)紫外分光光度計(jì)檢測,6份市售樣品的A260/A280和A260/A230的比值均在1.8~2.0之間,說明磁珠法提取牛肉樣品,尤其是加工肉制品DNA的純度高,去除蛋白及雜質(zhì)的效果好。
應(yīng)用所建立的PCR-試紙條方法對市售樣品包括鮮牛肉、冷凍牛肉、醬牛肉、番茄牛排、牛肉干、牛肉醬各6份,共36份樣品進(jìn)行牛源性成分檢測,32份樣品檢出牛成分,4份樣品未檢出牛源成分,檢測結(jié)果與現(xiàn)行行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)檢測結(jié)果一致,說明所建立的免疫磁珠結(jié)合PCR-試紙條方法能夠快速檢測加工食品中牛源性成分。
核酸前處理是分子生物學(xué)的基礎(chǔ),獲得高純度的DNA模板是基因水平檢測的關(guān)鍵。實(shí)際加工食品中成分較復(fù)雜,且受到各種加工處理,在對物種進(jìn)行真?zhèn)舞b定的初期,建立尋找合適的核酸前處理方法非常有必要,DNA的斷裂、提取中存在的PCR抑制劑都對后續(xù)研究產(chǎn)生重要的影響,在對食品進(jìn)行真?zhèn)舞b定之前,DNA提取技術(shù)的選擇非常重要。
傳統(tǒng)的DNA提取方法主要有十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法和十二烷基磺酸鈉(SDS)法,提取過程中包括多次有機(jī)溶劑抽提、醇沉淀和離心等步驟,操作繁瑣,污染環(huán)境,費(fèi)時(shí)費(fèi)力。商品化的硅膠層析柱法試劑盒需要多步離心操作不僅耗時(shí)長,而且不利于自動(dòng)化操作。
本研究應(yīng)用免疫磁珠法提取市售樣品的DNA,經(jīng)紫外分光光度計(jì)檢測,6份市售樣品的A260/A280和A260/A230的比值均在1.8~2.0之間,說明磁珠法提取牛肉樣品,尤其是加工肉制品的DNA純度高,去除蛋白及雜質(zhì)的效果好。
采用的磁珠法提取核酸操作簡便、步驟簡單、快速,提取的DNA純度高,不需有機(jī)溶劑提取,可配合高通量自動(dòng)化磁珠提取儀,進(jìn)行高通量檢測,尤其適合深加工食品核酸的提取。
另外,加工食品可能富含鹽、糖、植物色素和發(fā)酵產(chǎn)生的有色物質(zhì)等,會(huì)影響下游試驗(yàn)操作,應(yīng)通過洗滌方式的盡量去除樣品中的鹽、糖和色素,再進(jìn)行DNA的提取操作。
高等動(dòng)物的所有組織細(xì)胞中均含有大量的線粒體,線粒體DNA在不同的物種間具有高度的變異性。不同種類的動(dòng)物線粒體基因組序列雖然高度同源,存在高度保守區(qū)域,但也存在一定的變異區(qū)域。在以線粒體DNA序列進(jìn)行物種的種屬鑒別時(shí),常用的區(qū)域包括編碼細(xì)胞色素B的Cytochrome b基因(cytB)、核糖體小亞基12S RNA編碼序列(12S ribosomal RNA)、細(xì)胞色素C亞基I(cytochrome C oxidase subunit I)的編碼基因coxI、編碼ATP8及ATP6的atp8及atp6基因以及控制區(qū)D-loop片段。這些區(qū)域的序列變異適中,既在種內(nèi)有一定的保守性,又體現(xiàn)出一定的種間差異。線粒體DNA是一個(gè)比較理想的用于檢測的靶基因。
本文以牛線粒體基因組序列為依據(jù),設(shè)計(jì)其Cytb基因區(qū)間的物種特異性引物,并在兩端標(biāo)記異硫氰酸鹽(Fluorescein 5-isothiocyanate,F(xiàn)ITC) 和生物素(Biotin),用含有金標(biāo)記的抗異硫氰酸鹽的兔多克隆抗體和固定有鏈親和素的通用核酸檢測試紙條對PCR產(chǎn)物進(jìn)行篩選檢測,從而建立了食品中牛成分快速檢測的PCR-試紙條方法。
一種好的分子生物學(xué)方法應(yīng)具有較高的特異性、靈敏度與穩(wěn)定性。本試驗(yàn)中引物特異性試紙條試驗(yàn)結(jié)果表明,只有含牛成分的樣品檢測線和質(zhì)控線均變紅,檢測結(jié)果為可疑陽性,而其它常見動(dòng)植物樣品雞、鴨、鵝、鵪鶉、豬、馬、鼠、水牛、綿羊、驢、鹿、駱駝、胡蘿卜、白菜等試紙條檢測線均未變紅色??梢申栃訮CR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)測序,比對,與牛同源性為99%,說明所設(shè)計(jì)的牛特異性引物具有較好的物種特異性。從靈敏度試驗(yàn)結(jié)果來看,該試驗(yàn)PCR-試紙條檢測靈敏度達(dá)到0.01%,比電泳檢測靈敏度高10倍。用建立的PCR-試紙條法對0.01%牛肉和駱駝肉混合樣品的DNA進(jìn)行20次低限穩(wěn)定性檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)0.01%牛肉/駱駝肉樣品,20次試紙條檢測質(zhì)控帶和檢測帶均變紅,說明所建立的PCR-試紙條方法穩(wěn)定性好。
對市售36份樣品的檢測,32份樣品檢出牛成分,4份樣品未檢出牛源成分,檢測結(jié)果與現(xiàn)行行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)檢測結(jié)果一致,說明所建立的免疫磁珠結(jié)合PCR-試紙條方法能夠有效的檢測加工食品中牛源性成分。檢測結(jié)果也說明市售加工牛肉制品存在不同程度的摻假,與標(biāo)簽成分不符合現(xiàn)象。
本實(shí)驗(yàn)中所應(yīng)用的免疫磁珠分離結(jié)合PCR-通用核酸檢測免疫金標(biāo)層析試紙條的檢測方法與已有的牛成分檢測的PCR電泳和熒光PCR方法相比,核酸提取省時(shí)、高效、環(huán)保而且不需要電泳儀、凝膠成像儀和熒光PCR等儀器,應(yīng)用成本大大降低。所使用的PCR產(chǎn)物檢測試紙條是通用型試紙條,大大簡化核酸擴(kuò)增后的檢測程序,縮短檢測時(shí)間。該方法充分利用PCR檢測的高靈敏度、特異性強(qiáng)的特點(diǎn),又結(jié)合了免疫金標(biāo)試紙條簡便、快捷、成本低的優(yōu)勢,為檢測和鑒別食品中動(dòng)物源性成分提供一種快速、簡便、低成本的分子生物學(xué)初篩方法,能夠?qū)崿F(xiàn)食品中動(dòng)物源性成分的現(xiàn)場快速檢測,進(jìn)而為食品安全監(jiān)管提供技術(shù)支持與保障。
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