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長鏈非編碼RNA調(diào)控乳腺癌侵襲與轉(zhuǎn)移的研究進(jìn)展

2018-02-11 22:05鄒子歸周晉星馬天時(shí)張智弘
關(guān)鍵詞:復(fù)合物進(jìn)程染色體

鄒子歸,周晉星,馬天時(shí),張智弘

(南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院 病理科, 江蘇 南京 210029)

乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤,也是女性癌癥死亡的主要因素,每年全球有超過100萬的女性被診斷患有乳腺癌,其中約有40萬人死亡。盡管早期篩查乳腺癌在中國已得到廣泛應(yīng)用,但乳腺癌的發(fā)病率和病死率仍呈現(xiàn)上升趨勢。微陣列技術(shù)和高通量測序等科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,豐富了人們對非編碼RNAs(non-coding RNAs,ncRNAs)的認(rèn)識,尤其是對長鏈非編碼RNAs (long non-coding RNAs,lncRNAs)的認(rèn)識。越來越多的研究顯示lncRNAs參與了包括乳腺癌在內(nèi)的多種惡性腫瘤的生物學(xué)進(jìn)程,尤其是惡性腫瘤的侵襲轉(zhuǎn)移。因此,探索lncRNAs介導(dǎo)的乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,對乳腺癌的診斷、治療及預(yù)后評估都有至關(guān)重要的作用。

1 lncRNAs的生物學(xué)特征

人類基因組序列中僅有<2%的序列編碼蛋白質(zhì),其余的超過98%的基因組則被轉(zhuǎn)錄成ncRNAs。過去,人們將ncRNAs視為“轉(zhuǎn)錄噪音”,然而隨著高

通量測序等技術(shù)的發(fā)展,ncRNAs在細(xì)胞及生物增殖分化和代謝等方面所發(fā)揮的重要作用越來越為人們所重視。其中,長度超過200 nt的ncRNAs被稱為lncRNAs,通常是由RNA聚合酶Ⅱ(RNA polymerase Ⅱ, RNA pol Ⅱ)轉(zhuǎn)錄生成[1]。lncRNAs參與選擇性剪接、蛋白質(zhì)活性調(diào)節(jié)和表觀遺傳控制(DNA甲基化、染色質(zhì)重塑、組蛋白修飾和基因沉默)等多種生物學(xué)進(jìn)程[2]。lncRNAs可以作為信號分子或microRNAs(miRNAs)靶位點(diǎn)的誘餌發(fā)揮作用;能與相應(yīng)的蛋白綁定,影響其下游序列的反應(yīng);可以指導(dǎo)靶基因募集染色質(zhì)修飾酶或其他蛋白,也可以為蛋白質(zhì)復(fù)合物形成一種特定的結(jié)構(gòu),使其能夠裝配兩種表面修飾酶,從而發(fā)揮其相應(yīng)作用[1]。

2 與乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移相關(guān)的lncRNAs

LncRNAs不僅參與了人體的生理進(jìn)程,也參與了腫瘤的發(fā)生發(fā)展。lncRNAs可以作為癌基因,也可以作為抑癌基因參與腫瘤的進(jìn)程。此外,某些lncRNAs在原發(fā)腫瘤和轉(zhuǎn)移灶中呈現(xiàn)不同的表達(dá)形式[1]。至今為止,大量研究顯示有許多l(xiāng)ncRNAs在乳腺癌中異常表達(dá),例如HOTAIR、MALAT- 1、BCAR4、CCAT2、H19、XIST和BC200等,它們參與乳腺癌細(xì)胞的增殖、凋亡,影響腫瘤生長和血管形成,調(diào)控乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移。

2.1 肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄物1(metastasis-associa-ted lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT- 1)高表達(dá)可作為潛在的生物標(biāo)志物

MALAT- 1 又稱核富集常染色體轉(zhuǎn)錄物2(nuclear-enriched abundant transcript 2,NEAT2),位于染色體11q13.1,其長度為8 708 bp。MALAT- 1在包括乳腺癌在內(nèi)的多種類型的腫瘤中表達(dá)升高,且與腫瘤的侵襲轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。MALAT- 1可與RNA結(jié)合蛋白HuR結(jié)合形成抑制性復(fù)合物,這種復(fù)合物通過與腫瘤干細(xì)胞標(biāo)志物CD133的啟動子結(jié)合,對CD133進(jìn)行負(fù)性調(diào)控,影響上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-to-mesenchymal transition,EMT)程序的進(jìn)行,從而影響乳腺癌的侵襲和轉(zhuǎn)移,且CD133在三陰性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)中的表達(dá)較雌激素受體(estrogen receptor,ER)陽性的乳腺癌高,因而TNBC中侵襲轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象更為多見[3]。MALAT- 1可競爭性結(jié)合miRNA- 1,使其表達(dá)水平降低,從而提高細(xì)胞分裂周期蛋白42(cell division cycle 42,cdc42)的表達(dá)水平,進(jìn)而促進(jìn)EMT的進(jìn)程,影響乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[4]。此外,MALAT1在多種類型的乳腺癌中高表達(dá),且MALAT- 1的表達(dá)與ER及其在乳腺癌中的靶基因相關(guān),并可以作為敏感性的內(nèi)分泌治療的潛在生物標(biāo)志物,具有重要的預(yù)后價(jià)值[5]。

2.2 BCAR4(breast cancer anti-estrogen resistance 4)與抗雌激素藥物的耐藥性密切相關(guān)

BCAR4位于染色體16p13.13,是在一次尋找乳腺癌內(nèi)分泌抵抗相關(guān)基因的探索中被首次發(fā)現(xiàn)的,且BCAR4與抗雌激素藥物的耐藥性密切相關(guān),并會促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移[6]。細(xì)胞外趨化因子CCL21將其信號傳遞至細(xì)胞中,間接募集BCAR4,使其與p300抑制劑Smad核相互作用蛋白1(Smad nuclear-interacting protein 1,SNIP1)結(jié)合,BCAR4與SNIP1的結(jié)合可使p300的組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferase,HAT)活性釋放,從而導(dǎo)致組蛋白乙酰化,其中組蛋白H3K18ac的乙?;菇z氨酸/蘇氨酸-蛋白磷酸酶1調(diào)節(jié)亞基1(serine/threonine-protein phosphatase 1 regulatory subunit 10,PPP1R10/PNUTS)對蛋白磷酸酶1(protein phosphatase 1,PP1)的活性抑制解除,促進(jìn)RNA聚合酶Ⅱ Ser5(Pol Ⅱ Ser5)去磷酸化,導(dǎo)致膠質(zhì)瘤相關(guān)致癌基因同源物2(glioma-associated oncogene homolog 2,GLI2)靶基因的轉(zhuǎn)錄,從而促進(jìn)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[6]。

2.3 HOX轉(zhuǎn)錄反義RNA (HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)對乳腺癌的預(yù)后有重要意義

HOTAIR是位于染色體12q13.13上,長度為2 158 nt的lncRNA。HOTAIR是最早被報(bào)道的參與腫瘤發(fā)生發(fā)展的lncRNAs之一,它在多種類型的腫瘤中高表達(dá)。體外實(shí)驗(yàn)證明HOTAIR可以促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移,并能抑制腫瘤細(xì)胞的凋亡。HOTAIR的5′末端與多梳抑制復(fù)合物2(polycomb repressive complex2,PRC2)結(jié)合,進(jìn)而影響復(fù)合物對組蛋白 H3第27位賴氨酸的三甲基化作用 (histone H3 tri-methylated at lysine 27,H3K27me3),從而沉默靶基因表達(dá),其3′末端與組蛋白去甲基化酶LSD1/CoREST/REST復(fù)合物結(jié)合,使組蛋白H3第4位賴氨酸去甲基化從而激活相應(yīng)基因的表達(dá)[7]。HOTAIR通過表觀沉默MiR- 568,減弱其對活化T細(xì)胞的核因子5(nuclear factor of activated T cells 5,NAFT5)的負(fù)調(diào)控,上調(diào)鈣結(jié)合蛋白 S100A4、血管內(nèi)皮細(xì)胞生長因子C(vascular endothelial growth factor C,VEGF-C),促進(jìn)EMT進(jìn)程和乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[8]。HOTAIR可抑制位于2號染色體上的HOXD基因的轉(zhuǎn)錄,被抑制的HOXD與miR- 7啟動子結(jié)合的能力減弱,miR- 7的表達(dá)水平降低,進(jìn)而使癌基因SETDB1的表達(dá)水平升高,STAT3通路激活,從而促進(jìn)EMT進(jìn)程和乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[9]。此外,HOTAIR與ER陽性的乳腺癌密切相關(guān),可作為ER陽性的乳腺癌的獨(dú)立預(yù)后因素,高表達(dá)的HOTAIR也預(yù)示乳腺癌細(xì)胞增殖和高侵襲轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)[10]。

2.4 H19通過MiR- 675影響乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移

H19在70%的乳腺癌中高表達(dá)。H19位于染色體11p15.5,僅表現(xiàn)母系印記特征,H19與其等位基因胰島素樣生長因子2(insulin-like growth factor 2,IGF2)共用增強(qiáng)子,IGF2則表現(xiàn)父系印記特征。過表達(dá)H19可使乳腺癌細(xì)胞MDA-MB- 231在軟瓊脂中形成比對照細(xì)胞更大更多的集落,注射H19轉(zhuǎn)染的細(xì)胞的裸鼠,其腫瘤進(jìn)展加快[11- 12],這說明高表達(dá)的H19對乳腺癌的發(fā)生發(fā)展存在一定影響。源自H19的保守性轉(zhuǎn)錄物MiR- 675可下調(diào)泛素連接酶E3家族成員c-CbI和CbI-b的水平,從而使表皮生長因子受體(epithelial growth factor receptor,EGFR)的表達(dá)水平升高,EGFR可通過Akt和Erk信號通路促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的增殖和侵襲轉(zhuǎn)移[13]。H19可以通過MiR- 675促進(jìn)Slug的表達(dá),從而下調(diào)E-鈣黏蛋白(E-cadherin),影響EMT進(jìn)程,進(jìn)而影響乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[14]。

此外,在H19 /IGF2基因座內(nèi),存在另一種lncRNA 91H,其對H19基因是反義的。91H在乳腺癌細(xì)胞中高表達(dá),并可以通過表觀遺傳學(xué)修飾上調(diào)H19/IGF2的水平從而影響乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[15]。

2.5 LincROR(long intergenic non-protein coding RNA,regulator of reprogramming,lincROR)發(fā)揮競爭性內(nèi)源RNA功能影響乳腺癌的進(jìn)程

LincROR位于染色體18q21.31,長度約2 600 bp,由4個(gè)外顯子組成。LincROR可以與miRNA核糖核蛋白復(fù)合物(microRNA ribonucleoprotein complex,miRNPs)相互作用并作為競爭性內(nèi)源RNA(compe-ting endogenous RNA,ceRNA)調(diào)節(jié)miR- 205的活性,抑制其下游靶基因ZEB2的降解,從而促進(jìn)EMT的進(jìn)程,促進(jìn)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[16]。LincROR在TNBC中高表達(dá),且LincROR可發(fā)揮ceRNA的功能,沉默miR- 145,使其下游重要的靶基因ADP核糖基化因子6(ADP-ribosylation factor 6,ARF6)水平升高,進(jìn)而改變E-cadherin的定位及細(xì)胞間連接,從而促進(jìn)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[17]。

2.6 結(jié)腸癌相關(guān)轉(zhuǎn)錄物2(colon cancer associated transcript 2,CCAT2)影響信號通路促進(jìn)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移

CCAT2位于染色體8q24,此區(qū)域高度保守。目前,CCAT2已被發(fā)現(xiàn)參與多種腫瘤的形成與發(fā)展,如胃癌、食管鱗癌和乳腺癌等[18- 19]。CCAT2在乳腺癌中的表達(dá)水平顯著升高,高表達(dá)的CCAT2可促進(jìn)乳腺癌中TGF-β、Smad2和 α-SMA的蛋白表達(dá)量,而TGF-β信號通路對EMT的進(jìn)程有重要的促進(jìn)作用,由此促進(jìn)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[19]。此外,CCAT2可影響Wnt/β-catenin信號通路的轉(zhuǎn)錄活性,并影響其下游靶基因CCND1和c-myc的水平,在乳腺癌的發(fā)生發(fā)展中具有重要作用[18]。

2.7 其他LncRNAs

除了上述lncRNAs之外,人們還發(fā)現(xiàn)了許多與乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移相關(guān)的新興lncRNAs,如MEG3、AK058003、肝細(xì)胞肝癌微血管浸潤相關(guān)長鏈非編碼RNA(LncRNA associated with microvascular invasion in hepatocellular carcinoma,MVIH)、LOC554202、LINC00628和抗分化非編碼RNA(anti-differentiation ncRNA,ANCR/DANCR)等。

AK058003在乳腺癌組織中的表達(dá)水平顯著升高,且AK058003可能通過影響γ突觸核蛋白基因(γ-synuclein gene,SNCG)的表達(dá)水平,從而促進(jìn)乳腺癌的增殖和侵襲轉(zhuǎn)移[20]。MVIH最早在肝細(xì)胞肝癌中被發(fā)現(xiàn),在乳腺癌組織中高表達(dá),MVIH的表達(dá)水平可影響細(xì)胞周期及細(xì)胞的增殖和凋亡,因此可能和乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移相關(guān)。此外,MVIH與乳腺癌的預(yù)后密切相關(guān),可以作為乳腺癌的一種新型生物標(biāo)志物和潛在治療靶點(diǎn)[21]。LOC554202在乳腺癌組織中高表達(dá),且與腫瘤大小和臨床分期相關(guān),高表達(dá)的LOC554202可促進(jìn)細(xì)胞增殖、抑制凋亡,影響細(xì)胞周期,并可促進(jìn)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移進(jìn)程[22]。

MEG3在乳腺癌組織和細(xì)胞系中低表達(dá),且低表達(dá)的MEG3通過減少M(fèi)DM2 mRNA的轉(zhuǎn)錄,間接引起P53蛋白的累積,累積的P53在沒有細(xì)胞應(yīng)激的狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄上調(diào)P21、Maspin和KAI1,從而抑制乳腺癌的侵襲[23]。LINC00628在乳腺癌組織和乳腺癌細(xì)胞系中低表達(dá),且過表達(dá)LINC00628可影響細(xì)胞周期,抑制乳腺癌細(xì)胞的侵襲轉(zhuǎn)移,并可通過Bcl-2/Bax/caspase-3信號通路促進(jìn)細(xì)胞凋亡[24]。ANCR在乳腺癌和乳腺癌細(xì)胞系中低表達(dá),ANCR與EMT的誘導(dǎo)者EZH2結(jié)合,促進(jìn)CDK1與EZH2的相互作用以促進(jìn)EZH2在Thr-345和Thr- 487的磷酸化,并且最終通過泛素-蛋白酶體途徑強(qiáng)化EZH2泛素化降解,從而抑制EMT的進(jìn)程,抑制乳腺癌細(xì)胞的侵襲轉(zhuǎn)移[25]。

3 小結(jié)與展望

隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展進(jìn)步,越來越多的與腫瘤相關(guān)的lncRNAs被發(fā)現(xiàn)。LncRNAs在乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移過程中同樣具有重要地位,現(xiàn)有的研究發(fā)現(xiàn),其介導(dǎo)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移涉及EMT、血管形成等多個(gè)方面,且部分lncRNAs(如本文提及的MALAT- 1、HOTAIR和MVIH等)已經(jīng)顯示出預(yù)測乳腺癌分期、存活率、乳腺癌轉(zhuǎn)移以及作為乳腺癌診斷的生物標(biāo)志物的潛能,然而理想的生物標(biāo)志物必須在生物體液(如血漿和尿液)中具有穩(wěn)定性,但lncRNAs的穩(wěn)定性在很大程度上是未知的。此外,lncRNAs作為生物標(biāo)志物仍然需要進(jìn)一步的分析和臨床實(shí)踐來驗(yàn)證。在治療方面,RNA治療乳腺癌仍然存在許多挑戰(zhàn),如最佳的給藥劑量方案、給藥途徑缺乏安全性、特異性和有效的載體等,因此將其應(yīng)用于臨床仍然存在一定的障礙。

然而對于大量的新興的、具有特征性的lncRNAs功能作用的研究和認(rèn)識,為乳腺癌的治療和生物標(biāo)志物的應(yīng)用提供了新的思路。除此之外,lncRNAs可與miRNA、mRNA和蛋白等相互作用,影響信號傳導(dǎo)通路和自噬的進(jìn)程,從而影響乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移,因此,對lncRNAs的研究不應(yīng)局限于lncRNAs本身,全面系統(tǒng)地研究lncRNAs調(diào)控乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移的機(jī)制以清晰地反映其在區(qū)分乳腺癌組織和正常組織及辨別乳腺癌分期的潛力、尋找具有高度特異性和敏感性的lncRNAs和進(jìn)一步完善RNA治療的效果,對乳腺癌的預(yù)防、診斷和治療均具有至關(guān)重要的作用,也是未來研究的重要目標(biāo)。

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