許婷婷 ,王躍嗣
(1.濰坊護理職業(yè)學(xué)院,山東 青州 262500;2.濱州醫(yī)學(xué)院醫(yī)藥研究中心,山東 煙臺 264003)
隨著社會老齡化進程的加劇,各種神經(jīng)退行性疾病的發(fā)病人數(shù)也逐年增加。神經(jīng)退行性疾病和神經(jīng)系統(tǒng)損傷(如腦缺血、腦中風(fēng)、脊髓損傷等)嚴重威脅著人類的身體健康。帕金森病、阿爾茨海默病、腦中風(fēng)等均是由于分化成熟的神經(jīng)細胞受到損傷不能分裂增殖以彌補損傷或死亡細胞所造成的,因此尋找新的神經(jīng)元細胞對治療神經(jīng)退行性疾病具有重要意義。雖然胚胎干細胞(Embryonic Stem Cell,ESC)、誘導(dǎo)多能性干細胞(induced Pluripotent Stem Ccell,iPSC)能夠在體外分化形成神經(jīng)細胞,但其應(yīng)用于臨床前受到分化效率低、易形成腫瘤危害等限制。自2006年Takahashi等[1]發(fā)現(xiàn)細胞重編程技術(shù)以來,細胞重編程技術(shù)越來越受到國內(nèi)外學(xué)者的青睞。將體細胞作為靶細胞,重編程形成神經(jīng)細胞,使治療神經(jīng)系統(tǒng)疾病成為可能。
把體細胞重編程為iPSC是一項具有革命性的技術(shù)[2]。2006年 Takahashi和 Yamanaka[1]第一次把 Oct4、Sox2、Klf和 c-Myc 4個轉(zhuǎn)錄因子通過逆轉(zhuǎn)錄病毒轉(zhuǎn)染方式在小鼠成纖維細胞上過表達形成iPSC,這些細胞與小鼠ESC具有相似的生長特性和形態(tài)。因為c-Myc是原癌基因,形成的iPSC具有癌變可能,自從iPSC產(chǎn)生以來就存在癌變的潛在危險,如果無法解決癌變可能,iPSC就無法在臨床上應(yīng)用。因此,研究人員開展了多種替代研究,企圖實現(xiàn)同時具有iPSC功能,又不具有癌變潛能的新的重編程分子。后來研究人員又整合了包括Nanog、Esrrb、Nr5a2等多種不同基因重編程為成纖維細胞和其他不同類型的體細胞,但是Oct4卻不能被其他因子所替代,這表明在細胞重編程中它起到特定的作用。
為提高細胞重編程的效率,研究人員試用了各種不同的小分子和特定的miRNA。在細胞重編程轉(zhuǎn)染Oct4、Klf4和Sox2(OKS)的同時,想用miRNA替代c-Myc,結(jié)果發(fā)現(xiàn)[3],瞬時轉(zhuǎn)染miR-291-3p、miR-294或miR-295可以形成iPSC,且能增加iPSC形成數(shù)目。跟c-Myc不同,在去分化的早期階段,miR-294不會誘導(dǎo)小鼠成纖維細胞增殖,與外源性的c-Myc相比,miR-294能產(chǎn)生同源的iPSC克隆。
目前已有研究表明[4-5],只用miRNA就可以誘導(dǎo)細胞發(fā)揮多能性。在沒有轉(zhuǎn)錄因子的情況下,只用逆轉(zhuǎn)錄病毒過表達miR-302/367能誘導(dǎo)小鼠和人的成纖維細胞形成iPSCs[4],這些細胞注入囊胚后可形成畸胎瘤,并且過度表達miR-302/367能加速細胞重編程,提高編程效率,但在不表達miR-367的條件下,培養(yǎng)3周后仍然沒有獲得iPSCs的克隆,這就暗示miR-302/367介導(dǎo)的重編程中需要有miR-367的表達。實驗發(fā)現(xiàn)[5],瞬時轉(zhuǎn)染miR-200c、miR-302和miR-367這一組合可以重編程小鼠和人的體細胞。盡管到目前為止,miRNA介導(dǎo)的重編程還沒被廣泛用于實驗,但是研究人員已經(jīng)開始重視miRNA的作用。用經(jīng)典的四因子重編程小鼠成纖維細胞時,加入miR-302家族和miR-290家族能輕微提高細胞重編程效率,但在沒有其他轉(zhuǎn)錄因子的情況下,這兩個家族的miRNA不能完成誘導(dǎo)。
另一研究[6]表明了miRNA在細胞重編程中的重要作用,成纖維細胞在缺失所有成熟miRNA的情況下不能形成iPSCs。因此,miRNA不僅在多能細胞的分化中是必須的,還在纖維細胞的去分化過程中起著重要作用。
在細胞重編程的最初階段,許多miRNA家族被認定為上皮-間充質(zhì)之間轉(zhuǎn)化(MET)的介質(zhì),而MET存在于體細胞重編程的起始階段。其中,研究較詳細的是miR-205和miR-200家族,它們都是由BMP誘導(dǎo)而成,并且參與維持細胞的多能性。miR-200家族可以通過抑制E-cadherin的抑制因子Zeb1和Zeb2,還有Snail和Slug來促進MET[7]。除了miR-200家族,還有許多其他的miRNA家族能夠提高細胞重編程效率。表達分析在mESCs重編程起始階段中高表達的miRNA家族,顯示在重編程的前 4 天,miR-17/92、miR-106b/25、miR-106a/363 和miR-302b/367會有表達[8]。通過促進MET,miR-106b/25家族能增強iPSC的誘導(dǎo)。轉(zhuǎn)染miR-93和miR-106b可以增加iPSCs克隆的數(shù)目,而抑制這兩種miRNA可以減少克隆的數(shù)目。在人成纖維細胞重編程過程中,轉(zhuǎn)染OSKC的第二天和第七天轉(zhuǎn)染miR-302b和miR-372可以增加克隆的數(shù)目[9]。miR-302b、miR-372和miR-294具有相同的種子序列,能夠阻止在人類永生化表皮細胞中TGF-β誘導(dǎo)上皮-間充質(zhì)之間的轉(zhuǎn)化(ETM)。并且,經(jīng)過改良的具有突變種子序列的miR-294不能抑制TGF-β誘導(dǎo)ETM,這就表明了種子序列在這些miRNAs中的重要性。
miR-21和miR-29a可以干擾iPSC的形成[10],這兩種miRNA都在小鼠成纖維細胞中大量表達,缺失這兩種miRNA可以通過調(diào)節(jié)p53和ERK1/2通路來提高重編程效率。所有的研究都表明,miRNA不僅在維持未分化細胞的狀態(tài)中起作用,也能影響已分化細胞的命運。
miRNA在神經(jīng)發(fā)育過程中的神經(jīng)元、神經(jīng)祖細胞及神經(jīng)膠質(zhì)細胞中有特定表達。近年來,miRNA在干細胞及其分化中的作用開始受到關(guān)注。研究發(fā)現(xiàn),某些miRNA,如miR-29和miR-126主要在星形膠質(zhì)細胞中表達;而miR-138、miR-124主要在中樞神經(jīng)系統(tǒng)中表達。在中樞神經(jīng)系統(tǒng)中,部分miRNA的表達具有短暫性和區(qū)域性[11]。部分miRNA的表達模式與其發(fā)育階段存在一定關(guān)聯(lián)。miR-126可以負調(diào)控神經(jīng)管發(fā)育中血管內(nèi)皮生長因子A的表達,從而對神經(jīng)系統(tǒng)血管網(wǎng)絡(luò)的形成起間接的調(diào)控作用[12],也有協(xié)同調(diào)節(jié)神經(jīng)管發(fā)育過程中類胰島素生長因子、Shh通路和神經(jīng)營養(yǎng)蛋白通路的作用[13]。
在腦組織中表達最豐富的一類miRNA—miR-124,主要在已分化成熟的神經(jīng)元中表達。若將miR-124轉(zhuǎn)染到多種細胞中,可以抑制一系列非神經(jīng)元轉(zhuǎn)錄物的表達,并且誘導(dǎo)這些細胞基因組向神經(jīng)方向轉(zhuǎn)化[14]。研究發(fā)現(xiàn)[15],成纖維細胞可以在miR-124的參與下重編程,誘導(dǎo)分化為神經(jīng)細胞。在功能上,miRNA可以通過引發(fā)靶mRNA的降解和翻譯抑制來介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄后基因的沉默,參與蛋白質(zhì)表達的調(diào)節(jié),在神經(jīng)系統(tǒng)分化、發(fā)育及神經(jīng)系統(tǒng)疾病的發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮著重要作用[16]。有研究顯示[17],miR-124-9-9*不僅能夠使成纖維細胞重編程為神經(jīng)細胞,而且還可以提高米勒神經(jīng)膠質(zhì)細胞編程為視網(wǎng)膜神經(jīng)元的概率。在已知的miRNA中,大約70%在哺乳動物大腦中有表達。很多miRNA參與了神經(jīng)系統(tǒng)不同信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的基因表達調(diào)控且有不同的生理過程,比如神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)生和發(fā)育、神經(jīng)干細胞的分化、樹突棘形成、神經(jīng)保護等[16]。有一些miRNA可以參與調(diào)節(jié)神經(jīng)干細胞的分化和命運[18]。miRNA參與了很多神經(jīng)系統(tǒng)疾病的病理生理過程,如帕金森病、腦腫瘤、精神分裂癥等引起的神經(jīng)系統(tǒng)損傷[19-20]。
3.2.1 miRNA參與重編程為神經(jīng)前體細胞及神經(jīng)干細胞2011年3月,Janghwan Kim等[21]把小鼠成纖維細胞重編程為神經(jīng)前體細胞,他們以病毒為載體將Oct4、Sox2、Klf4、c-Myc 4個轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)入成纖維細胞中,將這些細胞誘導(dǎo)分化為Pax+、Sox1+、Sox17+、T+的神經(jīng)前體細胞(Neural stem/Progenitor Cells,NPCs)。2011年12月,Ernesto Lujan等[22]將小鼠成纖維細胞誘導(dǎo)分化為NPCs,基因嵌入Sox2-IRES-EGFP的小鼠中原代培養(yǎng)獲得MEF,再將11種轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)染成纖維細胞,培養(yǎng)24天后,檢測誘導(dǎo)形成的細胞為NPCs。 2012年2月,Dong Wook Han等[23]通過指定的轉(zhuǎn)錄因子將成纖維細胞重編程為神經(jīng)干細胞,實驗中,他們將相結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子誘導(dǎo)小鼠成纖維細胞而獲得iNSCs,此類細胞表現(xiàn)出的細胞形態(tài)、基因表達的表觀遺傳特征、分化電位和自我更新能力與野生型的神經(jīng)干細胞相似。2012年3月,Marc Their等[24]將成纖維細胞誘導(dǎo)分化穩(wěn)定增殖的神經(jīng)干細胞,通過組成性誘導(dǎo)Sox2、Klf4、c-Myc,同時在重編程的初始階段嚴格限制Oct4的活性,分化形成了可以傳代>50代的神經(jīng)干細胞iNSCs,iNSCs有巢蛋白、Pax6、Olig2的表達,此外,還可以分化成神經(jīng)元、星形膠質(zhì)細胞和少突膠質(zhì)細胞。又有研究者用單個轉(zhuǎn)錄因子Oct4重編程人的血細胞誘導(dǎo)分化為神經(jīng)祖細胞。在細胞重編程形成神經(jīng)細胞的過程中,體細胞往往先形成多潛能干細胞再分化為神經(jīng)細胞,但這一重編程效率很低,并且多數(shù)不能傳代生長,還由于缺少再活化的重編程因子,多潛能干細胞往往可能會形成畸胎瘤,用于臨床治療,我們必須考慮形成腫瘤的風(fēng)險和細胞在體外可自我再生。miRNA在iNSC重編程中的作用可以借鑒對iPSC的研究,有實驗顯示,小鼠和人的iPSC可以通過miRNA的組合和轉(zhuǎn)錄因子的重編程形成。組合的miRNA和轉(zhuǎn)錄因子可以使人成纖維細胞完成神經(jīng)細胞的轉(zhuǎn)化,并且可以往特定神經(jīng)細胞類型分化。過表達miR-146可以促進神經(jīng)干細胞增殖,促進膠質(zhì)細胞分化。小鼠ESC 特異的 miRNA、miR-291-3p、miR-294、miR-295可以提高Klf4、Oct4、Sox2的誘導(dǎo)多能性,因此,可以篩選和研究NSC特異的miRNA來推動iNSC的形成。
3.2.2 miRNA參與重編程為神經(jīng)元 2011年 5月,Ulrich Pfisterer等[25]將人成纖維細胞重編程成多巴胺神經(jīng)元,通過過表達轉(zhuǎn)錄因子Ascl1、Brn2、Myt1Ⅰ,人成纖維細胞可以高效轉(zhuǎn)化為功能型神經(jīng)元。2011年7月,《Cell》上刊登了Esther YSon等[26]的實驗,他們將小鼠和人的成纖維細胞重編程為功能性的運動神經(jīng)元;同時,也報道了Rajesh Ambasudhan等[27]在一定的條件下,把人成纖維細胞重編程為功能型神經(jīng)元,miR-124和兩個轉(zhuǎn)錄因子(MYT1L、BRN2)的組合可以把中胚層人成纖維細胞重編程為外胚層功能型神經(jīng)元。研究報道[28],在人成纖維細胞中過表達miR-302/367家族和兩種神經(jīng)元特異性的miRNA(miR-9/9*、miR-124),可將其重編程為神經(jīng)元,并且這些細胞可以在裸鼠腦中被觀測到,這推進了細胞重編程的研究,并對神經(jīng)系統(tǒng)疾病的治療提供了理論支持。
3.2.3 miRNA參與重編程為神經(jīng)膠質(zhì)細胞 神經(jīng)膠質(zhì)細胞的再生過程中,許多miRNA也參與其中。miR-125b可以調(diào)節(jié)少突膠質(zhì)細胞的增殖和星形膠質(zhì)細胞的再生。星形膠質(zhì)細胞在生理和病理的中樞神經(jīng)系統(tǒng)中起重要作用,它可以參與突觸形成、影響神經(jīng)遞質(zhì)吸收等。在大腦發(fā)育過程中,星形膠質(zhì)細胞中miR-29的表達比在神經(jīng)元中的表達強烈,并且實驗表明[29],在細胞培養(yǎng)過程中,miR-29a在星形膠質(zhì)細胞中表達非常強烈。有研究表明[30],可以用miR-302/367再加VPA(組蛋白去乙酰基酶抑制劑)重編程人和鼠的星形膠質(zhì)細胞誘導(dǎo)為神經(jīng)細胞來治療神經(jīng)疾病。
近年來,細胞替代治療和基因治療為人類征服多種疾病提供了希望。miRNA作為新的研究熱點,在細胞重編程中越來越受到人們的重視。目前已有不少研究證實miRNA在體細胞重編程中起著重要作用,對于miRNA把體細胞重編程為神經(jīng)細胞的研究也取得了一些進展,但在神經(jīng)細胞重編程中,miRNA的作用機制仍然需要繼續(xù)深入研究。這些研究必將加速促進體細胞重編程為神經(jīng)細胞在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。iNSC細胞的重編程給細胞命運、藥物發(fā)現(xiàn)和細胞移植研究提供了新的方法。隨著研究的深入,iNSC的重編程可以進一步推動重編程的研究及探索。
[1]Takahashi K,Yamanaka S.Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast culture by defined factors[J].Cell,2006(4):663-676.
[2]Woltjen K,Kim SI,Nagy A.The piggyBac Transposon as a Platform Technology for Somatic Cell Reprogramming Studies in Mouse[J].Methods Mol Biol,2016(1357):1-22.
[3]RLJudson,JEBabiarz,M Venere,et al.Embryonic stem cell specific micro-RNAs promote induced pluripotency[J].NatBiotechnol,2009(27):59-61.
[4]FAnokye Danso,CMTrivedi,DJuhr,et al.Highly efficient miRNAmediated reprogramming of mouse and human somatic cells to pluripotency[J].Cell Stem Cell,2011(8):376-388.
[5]NMiyoshi,H Ishii,H Nagano,et al.Reprogramming of mouse and human cells to pluripotency using mature microRNAs[J].Cell Stem Cell,2011(8):633-638.
[6]BMKim,MCThier,SOh,et al.MicroRNA are indispensable for reprogramming mouse embryonic fibroblasts into induced stem celllike cells[J].PLOS One,2012(7):39239.
[7]Korpal M,Lee ES,Hu GH,et al.The miR-200 family inhibits epithelial mesenchymal transition and cancer cell migration by direct targeting of Ecadherin transcripfional repressors ZEB1 and ZEB2[J].J Biol Chem,2008,283(22):14910-14914.
[8]ZLi,CSYang,KNakashima,et al.Small RNA-mediated regulation of iPS cell generation[J].EMBO J,2011(30):823-834.
[9]D Subramanyam,S Lamouille,R LJudson,et al.Multiple targets of miR-302 and miR-372 promote reprogramming of human fibroblasts to induced pluripotent stem cells[J].NatBiotechnol,2011(29):443-448.
[10]CSYang,ZLi,TMRana.MicroRNA modulate iPS cell generation[J].RNA,2011(17):1451-1460.
[11]Landgraf P,Rusu M,Sheridan R,et al.A mammalian microRNA expression atlas based on small RNA library sequencing[J].Cell,2007(7):1401-1414.
[12]James J M,Gewolb C,Bautch VL.Neurovasular development uses VEGF-A signaling to regulate blood vessel ingression into neural tube[J].Develpoment,2009,136(5):833-841.
[13]Shen W F,Hu Y L,Uttarwar L,et al.MicroRNA-126 regulates HOXA9 by binding to the homeobox[J].Mol Cell Biol,2008,28 (14):4609-4619.
[14]Cheng L C,Pastrana E,Tavazoie M,et al.miR-124 regulates adult neurogenesis in the subventricular zone stem cell niche[J].Nat Neurosci,2009,12(4):399-408.
[15]Yoo AS,Sun AX,Li L,et al.MicroRNA-mediated conversion of human fibroblasts to neurons[J].Nature,2011,476(7359):228-231.
[16]Filipowicz W,Bhattacharyya SN,Sonenberg N.Mechanisms of posttranscriptional regulation by microRNAs:are the answers in sight[J].Nat Rev Genet,2008,9(2):102-114.
[17]Wohl SG,Reh TA.miR-124-9-9*potentiates Ascl1-induced reprogramming of cultured Muller glia[J].Glia,2016,64(5):743-762.
[18]Stevavato L,Hicks C,Sinden JD.Differentiation of a Human Neural Stem Cell Line on Three Dimensional Cultures,Analysis of MicroRNA and Putative Target Genes[J].Journal of visualized experiments,2015(98):112-114.
[19]Gao FB.Posttranscriptional control of neuronal development by miceoRNA networks[J].Trends Neurosci,2008,31(1):20-26.
[20]Jeyaseelan K,Lim KY,Armugam A.MicroRNA expression in the blood and brain of rats subjected to transient focal ischemia by middle cerebral artery occlusion[J].Stroke,2008,39(3):959-966.
[21]Janghwan Kim,Jem AEfe,Saiyong Zhu,et al.Direct reprogramming of mouse fibroblasts to neural progenitors[J].2011,108(19):7838-7843.
[22]Ernesto Lujan,Soham Chanda,Henrik Ahlenius,et al.Direct conversion of mouse fibroblasts to self-renewing,tripotent neural precursor cells[J].PNAS,2011,109(7):2527-2532.
[23]Dong Wook Han,Natalia Tapia,Andreas Hermann,et al.Direct Reprogramming of Fibroblasts into Neural Stem Cells by Defined Factors[J].Cell,2012(10):1-8.
[24]Marc Their,Yenal BLakes,Raphaela,et al.Direct Conversion of Fibro blasts into Stably Expandable Neural Stem Cells[J].Cell,2012(10):473-479.
[25]Ulrich Pfisterer,Agnete Kirkeby,Olof Torper,et al.Direct conversion of human fibroblasts to dopaminergic neurons[J].PNAS,2011,108(25):10343-10348.
[26]Esther YSon,Justin KIchida,Brian JWainger,et al.Conversion of Mouse and Human Fibroblasts into Functional Spinal Motor Neurons[J].Cell,2011(9):205-218.
[27]Rajesh Ambasudhan,Maria Talantova,Ronald Coleman,et al.Direct Reprogramming of Adult Human Fibroblasts to Functional Neurons under Defined Conditions[J].Cell,2011(9):113-118.
[28]Zhou C,Gu H,F(xiàn)an R,et al.MicroRNA 302/367 Cluster Effectively Facilitates Direct Reprogramming from Human Fibroblasts into Functional Neurons[J].Stem Cells Dev,2015,24(23):2746-2755.
[29]Ouyang YB,Xu L,Yue S,et al.Neuroprotection by astrocytes in brain ischemia;importance of microRNAs[J].Neuroscience letters,2014(565):53-58.
[30]Ghasemi-Kasman M,Hajikaram M,Baharvand H,et al.MiroRNA-Mediated In Vitro and In Vivo Direct Conversion of Astrocytes to Astrocytes to Neuroblasts[J].Plos one,2015,10(6):127.