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苯磺酰胺類(lèi)IDO1抑制劑的設(shè)計(jì)、合成和生物活性

2018-03-20 06:40金雙龍郭文潔賴(lài)宜生
關(guān)鍵詞:芐基苯基甲氧基

金雙龍,王 芳,鄒 毅,王 燕,胡 月,郭文潔,徐 強(qiáng)*,賴(lài)宜生**

(1中國(guó)藥科大學(xué)新藥研究中心,江蘇省代謝性疾病藥物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南京 210009;2南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,醫(yī)藥生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南京 210093)

吲哚胺2,3-雙加氧酶1(IDO1)是人體肝臟外催化色氨酸沿犬尿氨酸途徑代謝的起始和限速酶。研究表明,IDO1通過(guò)催化色氨酸代謝從而對(duì)機(jī)體的固有免疫和適應(yīng)性免疫起重要的調(diào)節(jié)作用[1]。在腫瘤微環(huán)境中,腫瘤細(xì)胞可以通過(guò)誘導(dǎo)IDO1的過(guò)度表達(dá),造成局部色氨酸耗竭和犬尿氨酸等代謝物的聚積,從而通過(guò)激活GCN2和AHR信號(hào)通路抑制T細(xì)胞的增殖及誘導(dǎo)其凋亡,并且刺激初始T細(xì)胞分化成調(diào)節(jié)性T細(xì)胞,進(jìn)而介導(dǎo)腫瘤免疫逃逸[2]。因此,IDO1已成為目前腫瘤免疫治療小分子藥物研發(fā)的熱門(mén)靶點(diǎn)。

近年來(lái),科研人員通過(guò)天然產(chǎn)物、高通量篩選和虛擬篩選等途徑陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了醌類(lèi)、吲哚類(lèi)、咪唑類(lèi)、呋咱羥脒類(lèi)等結(jié)構(gòu)類(lèi)型的IDO1抑制劑。其中,Ueng課題組[3]于2014年報(bào)道了一系列苯磺酰肼類(lèi)IDO1抑制劑,化合物U-3i對(duì)IDO1的抑制活性最強(qiáng),在基于HeLa細(xì)胞的酶活測(cè)試中其EC50為172 nmol/L。分子對(duì)接結(jié)果表明,除了疏水和氫鍵相互作用以外,化合物U-3i結(jié)構(gòu)中磺?;囊粋€(gè)氧原子還與血紅素鐵離子形成絡(luò)合作用。

為了尋找新型IDO1抑制劑,本研究在化合物U-3i的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上,考慮到肼類(lèi)化合物潛在的毒性[4],通過(guò)生物電子等排原理,結(jié)合計(jì)算機(jī)模擬分子對(duì)接技術(shù),設(shè)計(jì)并合成了一系列苯磺酰胺類(lèi)目標(biāo)化合物(圖1),在考察中間連接鏈的基礎(chǔ)上,側(cè)重探索了伸向IDO1活性口袋A和B的兩個(gè)苯環(huán)上取代基對(duì)活性的影響。體外活性測(cè)試結(jié)果表明,化合物3b和3e對(duì)基于HeLa細(xì)胞的IDO1活性顯示出了較好的抑制作用。進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)表明,化合物3b和3e能夠促進(jìn)T細(xì)胞的增殖,誘導(dǎo)γ干擾素(IFN-γ)的生成,并且能夠抑制調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的分化,因此具有進(jìn)一步研究的價(jià)值。

Figure1 Design of target compounds

1 合成路線(xiàn)

各種取代的苯磺酰氯與取代苯胺或芐胺進(jìn)行縮合反應(yīng)生成相應(yīng)的苯磺酰胺3a~3h。其中,4-乙酰胺基苯磺酰胺衍生物(3b~3d)在濃鹽酸的存在下經(jīng)脫乙?;玫?-胺基苯磺酰胺鹽酸鹽,最后經(jīng)碳酸鉀中和即制得4-胺基苯磺酰胺衍生物4a~4c(路線(xiàn)1)。所有目標(biāo)化合物的結(jié)構(gòu)均經(jīng)MS和1H NMR確證。

Scheme1 Reagents and conditions:(i) TEA,DCM,r.t.,5 h;(ii) HCl,ethanol,reflux,12 h;(iii) K2CO3

2 實(shí)驗(yàn)部分

2.1 儀器和試劑

熔點(diǎn)采用RY-1型熔點(diǎn)儀測(cè)定,溫度計(jì)未經(jīng)校正;1H NMR使用ACF-300 MHz型核磁共振儀測(cè)定,TMS為內(nèi)標(biāo);MS使用Agilent 1100 Series LC/MSD Trap(SL)質(zhì)譜儀測(cè)定。所有試劑未經(jīng)特別說(shuō)明均為市售化學(xué)純或分析純產(chǎn)品。

2.2 化學(xué)合成

N-(4-(N-(4-氰芐基)氨磺酰)苯基)乙酰胺(3a)的合成 將4-氰基苯乙胺(1.00 g,7.57 mmol)溶于無(wú)水二氯甲烷(15 mL)中,加入三乙胺(1.26 mL,8.75 mmol),冰浴下滴入含4-乙酰氨基苯磺酰氯(1.93 g,8.32 mmol)的無(wú)水二氯甲烷溶液5 mL,滴畢于冰浴中攪拌30 min,撤去冰浴,室溫反應(yīng)4 h,加水25 mL,二氯甲烷萃取,無(wú)水硫酸鎂干燥,柱色譜(EA-PE,1∶5)純化得到白色固體2.18 g,收率87%,mp 212~213 ℃。1H NMR(300 MHz,DMSO-d6)δ:10.31(1H,s,CONH),8.18(1H,s,NH),7.71(6H,q,J=9.8,8.8 Hz,Ar-H),7.44(2H,dd,J=8.3,4.3 Hz,Ar-H),4.05(2H,d,J=7.0 Hz,CH2),2.25~1.99(3H,m,CH3);ESI-MS:m/z328.0[M-H]-。

用類(lèi)似的方法制備得到目標(biāo)化合物3b~3h。

N-(4-(N-(4-甲氧基芐基)氨磺酰)苯基)乙酰胺(3b) 白色固體,收率80%,mp 188~190 ℃。1H NMR(300 MHz,DMSO-d6)δ:10.38(1H,s,CONH),7.96(1H,s,NH),7.76~7.68(4H,m,Ar-H),7.13(2H,d,J=8.3 Hz,Ar-H),6.83(2H,d,J=8.3 Hz,Ar-H),3.86(2H,s,CH2),3.71(3H,s,OCH3),2.09(3H,s,CH3);ESI-MS:m/z333.0[M-H]-。

N-(4-(N-(4-甲氧基苯基)氨磺酰)苯基)乙酰胺(3c) 白色固體,收率88%,mp 206~208 ℃。1H NMR(300 MHz,DMSO-d6)δ:10.29(1H,s,CONH),9.77(1H,s,NH),7.78~7.49(4H,m,Ar-H),6.95(2H,dq,J=8.2,3.2 Hz,Ar-H),6.86~6.70(2H,m,Ar-H),3.66(3H,q,J=2.2 Hz,OCH3),2.06(3H,q,J=3.5 Hz,CH3);ESI-MS:m/z319.0[M-H]-。

N-(4-(N-(4-氟苯基)氨磺酰)苯基)乙酰胺(3d) 白色固體,收率91%,mp 190~192 ℃。1H NMR(300 MHz,DMSO-d6)δ:10.32(1H,d,J=5.5 Hz,CONH),10.13(1H,s,NH),7.78~7.56(4H,m,Ar-H),7.20~6.97(4H,m,Ar-H),2.06(3H,d,J=5.2 Hz,CH3);ESI-MS:m/z307.0[M-H]-。

N-(4-氰芐基)-3-硝基苯磺酰胺(3e) 紅色固體,收率90%,mp 153~155 ℃。1H NMR(300 MHz,DMSO-d6)δ:8.85~8.32(3H,m,Ar-H),8.14(1H,s,NH),7.99~7.61(3H,m,Ar-H),7.39(2H,s,Ar-H),4.16(2H,s,CH2);ESI-MS:m/z316.0[M-H]-。

N-(4-甲氧基芐基)-3-硝基苯磺酰胺(3f) 紅色固體,收率80%,mp 103~105 ℃。1H NMR(300 MHz,DMSO-d6)δ:8.45(1H,s,NH),8.37(1H,ddd,J=8.3,2.3,1.0 Hz,Ar-H),8.30(1H,t,J=2.0 Hz,Ar-H),8.10(1H,ddd,J=7.9,1.8,1.0 Hz,Ar-H),7.79(1H,t,J=8.0 Hz,Ar-H),7.09~7.00(2H,m,Ar-H),6.76~6.65(2H,m,Ar-H),3.98(2H,s,CH2),3.64(3H,s,CH3);ESI-MS:m/z321.0[M-H]-。

N-(4-甲氧基苯基)-3-硝基苯磺酰胺(3g) 紅色固體,收率86%,mp 130~132 ℃。1H NMR(300 MHz,CHCl3-d)δ:8.61(1H,t,J=2.0 Hz,Ar-H),8.43(1H,ddd,J=8.3,2.2,1.1 Hz,Ar-H),7.99(1H,ddd,J=7.8,1.8,1.1 Hz,Ar-H),7.68(1H,t,J=8.0 Hz,Ar-H),7.06~6.98(2H,m,Ar-H),6.87~6.71(2H,m,Ar-H),6.52(1H,s,NH),3.80(3H,s,CH3);ESI-MS:m/z307.0[M-H]-。

4-氰基-N-(4-甲氧基芐基)苯磺酰胺(3h) 白色固體,收率75%,mp 137~139 ℃。1H NMR(300 MHz,CHCl3-d)δ:7.99~7.90(2H,m,Ar-H),7.85~7.75(2H,m,Ar-H),7.15~7.04(2H,m,Ar-H),6.86~6.75(2H,m,Ar-H),4.94(1H,t,J=5.9 Hz,NH),4.16(2H,d,J=5.9 Hz,CH2),3.80(3H,s,CH3);ESI-MS:m/z301.0[M-H]-。

4-氨基-N-(4-甲氧基苯基)苯磺酰胺(4a) 將3c(0.50 g,1.56 mmol)溶于乙醇(10 mL)中,加入濃鹽酸(3 mL),回流12 h,冷卻至室溫,加入飽和碳酸鉀溶液將反應(yīng)液pH調(diào)到9。減壓除去乙醇,乙酸乙酯萃取,無(wú)水硫酸鎂干燥,減壓蒸除溶劑,得到白色固體0.42 g,收率97%,mp 131~133 ℃。1H NMR(300 MHz,DMSO-d6)δ:9.48(1H,s,NH),7.40~7.19(2H,m,Ar-H),7.06~6.86(2H,m,Ar-H),6.84~6.70(2H,m,Ar-H),6.59~6.42(2H,m,Ar-H),5.95(2H,s,NH2),3.66(3H,d,J=2.3 Hz,CH3);ESI-MS:m/z277.0[M-H]-。

用類(lèi)似的方法制備得到目標(biāo)化合物4b~4c。

4-氨基-N-(4-氟苯基)苯磺酰胺(4b) 白色固體,收率78%,mp 151~153 ℃。1H NMR(300 MHz,DMSO-d6)δ:9.81(1H,s,NH),7.38~7.29(2H,m,Ar-H),7.06(4H,dd,J=7.0,3.2 Hz,Ar-H),6.52(2H,dd,J=8.9,3.1 Hz,Ar-H),5.99(2H,s,NH2);ESI-MS:m/z265.0[M-H]-。

4-氨基-N-(4-甲氧基芐基)苯磺酰胺(4c) 白色固體,收率75%,mp 94~96 ℃。1H NMR(300 MHz,DMSO-d6)δ:7.54(1H,s,NH),7.43(2H,d,J=8.3 Hz,Ar-H),7.19~7.09(2H,m,Ar-H),6.91-6.79(2H,m,Ar-H),6.65~6.54(2H,m,Ar-H),5.94(2H,s,NH2),3.79(2H,s,CH2),3.72(3H,s,CH3);ESI-MS:m/z291.0[M-H]-。

2.3 生物活性評(píng)價(jià)

2.3.1 基于HeLa細(xì)胞的酶活性評(píng)價(jià) 按每孔5×103個(gè)細(xì)胞的密度將HeLa細(xì)胞接種在96孔培養(yǎng)板中,貼壁后加入IFN-γ(100 ng/mL)處理24 h,吸去上清液,加入L-色氨酸(15 μg/mL)、IFN-γ(100 ng/mL)、受試物至200 μL體系,設(shè)置空白對(duì)照、模型組和藥物處理組(以GDC-0919[5]為陽(yáng)性對(duì)照),培養(yǎng)24 h,收集上清液140 μL,加入6.1 mol/L三氯乙酸10 μL,50 ℃溫育30 min,離心去除沉淀物。將各孔上清液100 μL移至另一96孔板中,與等體積20 mg/mL對(duì)-二甲氨基苯甲醛的乙酸溶液混合。使用酶標(biāo)儀在480 nm處檢測(cè)吸收度,計(jì)算化合物的IC50。

2.3.2 T細(xì)胞轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn) 將處理過(guò)的B16F1細(xì)胞(每孔8×104個(gè)細(xì)胞)、小鼠脾臟淋巴細(xì)胞(每孔1×106個(gè)細(xì)胞,使用5 μg/mL ConA刺激)加入24孔板中,加入對(duì)應(yīng)濃度的化合物后置于37 ℃、濕度95%、5% CO2的培養(yǎng)箱中孵育48 h。一方面,加入MTT(終濃度4 mg/mL)20 μL培養(yǎng)箱中繼續(xù)孵育4 h,酶標(biāo)儀測(cè)定570 nm波長(zhǎng)處吸收度,計(jì)算T細(xì)胞增殖率;另一方面,收集上清液使用ELISA檢測(cè)細(xì)胞因子IFN-γ含量,同時(shí)使用抗CD4、抗CD25、抗FOCP3抗體染色,在流式細(xì)胞儀中檢測(cè)T細(xì)胞的分化。

2.4 分子模擬

利用Schr?dinger軟件包(2009)中的Protein and Ligand Preparation模塊在基于OPLS-2005的力場(chǎng)條件下對(duì)蛋白加氫、加電荷和質(zhì)子化處理,并進(jìn)行能量?jī)?yōu)化;小分子使用Ligprep模塊進(jìn)行配體準(zhǔn)備。利用Gold進(jìn)行分子對(duì)接,采用含血紅素參數(shù)的GoldScore打分函數(shù),此參數(shù)是由PDB數(shù)據(jù)庫(kù)經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析得到[6]。以血紅素亞鐵離子為中心,其10 ?半徑內(nèi)氨基酸殘基作為對(duì)接的活性位點(diǎn)。在對(duì)接中使用遺傳算法,運(yùn)行10次。范德華和氫鍵參數(shù)的截?cái)嘀捣謩e設(shè)為4.0和2.5 ?。保留打分最高的結(jié)合模式作為最終對(duì)接結(jié)果用于分析。

3 結(jié)果與討論

體外基于HeLa細(xì)胞的酶活性檢測(cè)結(jié)果如表1所示,大部分化合物對(duì)IDO1都顯示出一定的抑制活性,其中化合物3b和3e的活性較強(qiáng),其IC50分別為5.88和10.25 μmol/L。

Table1 Inhibitory activity of the target compounds against IDO1

CompdR1R2nIC50/(μmol/L)3ap?CH3CONHp?CN154083bp?CH3CONHp?OCH315883cp?CH3CONHp?OCH3057283dp?CH3CONHp?F0>1003em?NO2p?CN110253fm?NO2p?OCH3133753gm?NO2p?OCH3042613hp?CNp?OCH3137934ap?NH2p?OCH3038624bp?NH2p?F0>1004cp?NH2p?OCH31>100GDC?0919035

為了了解化合物3b和3e對(duì)T細(xì)胞增殖和調(diào)節(jié)性T細(xì)胞分化的影響情況,本研究利用高表達(dá)IDO1的B16F1細(xì)胞與小鼠脾臟淋巴細(xì)胞共培養(yǎng)體系開(kāi)展了T細(xì)胞轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),結(jié)果如圖2所示。一方面,在混合細(xì)胞體系中,B16F1細(xì)胞會(huì)對(duì)T細(xì)胞的增殖產(chǎn)生抑制作用,而化合物3b和3e能在一定程度上增加T細(xì)胞的增殖,其中,化合物3e能使T細(xì)胞的增殖率提高35%(圖2-A),而且化合物3b和3e能夠促進(jìn)IFN-γ的生成(圖2-B)。另一方面,從圖2-C和圖2-D可以看出,當(dāng)初始T細(xì)胞與B16F1細(xì)胞共培養(yǎng)時(shí),調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的數(shù)量與對(duì)照組相比增加了4倍多,而化合物3b和3e與陽(yáng)性藥GDC-0919一樣都能明顯抑制調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的分化。這些實(shí)驗(yàn)結(jié)果提示,化合物3b和3e能夠通過(guò)抑制IDO1來(lái)逆轉(zhuǎn)其介導(dǎo)的免疫抑制。

初步構(gòu)效關(guān)系分析表明,從中間連接鏈來(lái)看,與苯胺衍生物(3c,3d,3f)相比,芐胺衍生物(3a,3b,3g)展現(xiàn)出更強(qiáng)的活性,尤其是化合物3b(IC50:5.88 μmol/L)的活性比化合物3c(IC50:57.28 μmol/L)提高近10倍,說(shuō)明芐胺相對(duì)于苯胺更有利于活性的提高(4a和4c除外)。從伸向B口袋的苯環(huán)上的取代基來(lái)看,含有供電子基的化合物活性普遍強(qiáng)于相應(yīng)的吸電子基(3b優(yōu)于3a,3c優(yōu)于3d,4a優(yōu)于4b,但3f不如3e)。有趣的是,從A口袋的苯環(huán)上的取代基來(lái)看,如果將4-乙酰胺基水解成胺基時(shí)活性明顯下降(4a除外),而且從含有硝基和氰基的3e~3h來(lái)看,它們都具有較好的活性,提示A口袋苯環(huán)上的吸電子基比強(qiáng)供電子基(胺基)可能更有利于活性的提高。

*P< 0.05vsT+B16F1 group

為了進(jìn)一步說(shuō)明化合物的構(gòu)效關(guān)系,本研究使用分子對(duì)接方法研究了化合物3b在IDO1活性位點(diǎn)中的結(jié)合模式。從圖3可以看出,苯磺酰胺片段能很好地深入口袋A內(nèi)部,并與Phe163產(chǎn)生π-π相互作用,而芐胺片段則伸向由Phe163,Phe226,Arg231,Leu234和Ile354形成的B口袋。此外,磺?;械囊粋€(gè)氧原子與血紅素亞鐵產(chǎn)生絡(luò)合作用,而另一個(gè)氧原子則與loop區(qū)Ala264 NH形成氫鍵作用。這些信息為本研究后續(xù)開(kāi)展結(jié)構(gòu)優(yōu)化提供了理論指導(dǎo)。

Figure3 Proposed binding mode of compound3bdocked into the crystal structure of human IDO1(PDB ID:4PK5)

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