王苗苗,張玲玲,張 峣,冉旭華,聞曉波
(黑龍江八一農(nóng)墾大學動物科技學院,黑龍江 大慶 163319)
牛副流感病毒3型(Bovine parainfluenza virus type 3,BPIV3)為副黏病毒科、呼吸道病毒屬成員,與牛病毒性腹瀉病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)、牛傳染性鼻氣管炎病毒(Infectious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)、牛呼吸道合胞體病毒(Bovine respiratory syncytial virus,BRSV)共同構成了引發(fā)牛呼吸道疾病綜合征(Bovine respiratory disease complex,BRDC)的主要病毒性病原,常導致持續(xù)性感染,是目前引發(fā)反芻動物急性呼吸道疾病的主要病原,也是引起世界范圍內(nèi)的舍飼牛發(fā)病及死亡的主要原因之一,對世界養(yǎng)牛業(yè)造成的經(jīng)濟損失較大[1-4]。自1959年Reisinger等首次從犢牛腎臟中分離到BPIV3,之后世界上許多國家也相繼報道分離出BPIV3,目前該病毒已呈現(xiàn)世界性廣泛分布的趨勢[5-10]。我國于2008年由劉鵬等在黑龍江省分離出該病毒[11],此后在多地也分離到該病毒[3,12]。經(jīng)血清學調(diào)查表明,養(yǎng)牛業(yè)發(fā)達的地區(qū)感染該病毒情況較重,已在我國廣泛性分布[13]。
BPIV3具有核衣殼結構和囊膜[14],與仙臺病毒等其他副粘病毒相似。目前為止,已發(fā)現(xiàn)BPIV3有A、B、C 3種基因型[15]。編碼M蛋白、磷蛋白P、F蛋白、N蛋白、NP蛋白、L蛋白及D、V、C 3種非結構蛋白[14,16]。NP蛋白為BPIV3的核衣殼蛋白,保守性較高[16],因此本研究擬選取NP基因構建融合蛋白表達載體,建立間接ELISA方法來檢測BPIV3抗體水平,為牛副流感3型提供高效便捷的檢測方法。
1.1 質(zhì)粒、菌種、病毒、血清 原核表達質(zhì)粒pET-28a、 菌 株 E.coli BL21(DE3)及 E.coli DH5α、BPIV3c NX49分離株、BPIV3陽性血清及陰性血清、BVDV陽性血清、BHV-I陽性血清均由黑龍江八一農(nóng)墾大學預防實驗室保存。
1.2 主要試劑 TRIzol、Ni-NTA Purification System( 美 國 Invitrogen); RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit、蛋白質(zhì)Marker、限制性內(nèi)切酶Nde I、BamH I、Sac I、HindⅢ(美國Thermo Fisher Scientific); Wizard?SV Gel and PCR Clean-Up System、GoTaq? Green Master Mix(美國Promega);辣根過氧化物酶(HRP)標記的兔抗牛IgG(Sigma);PrimeSTARTMHS DNA Poymerase及DNA Marker(日本TaKaRa);其他試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.3 抗原表位區(qū)域的篩選 利用DNASTAR中Protean程序?qū)X49株NP基因進行抗原表位分析,所選區(qū)域命名為 NP-N(8~156 aa)及 NP-C(368~507 aa)并設計2對特異性引物進行擴增,引物由北京六合華大基因科技股份有限公司合成。引物序列如表1所示。
表 1 引物序列Table 1 Sequences of primer
1.4 目的基因的擴增及純化 參照TRIzol使用說明書提取BPIV3 RNA,參照Thermo反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書進行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA,以cDNA為模板進行PCR擴增,并以ddH2O為陰性對照,反應體系如下:5×PrimeSTAR?Buffer 10 μL,dNTPs 5 μL,Prime-STAR?HS 0.5 μL,上、下游引物各1 μL,cDNA 3 μL,補加ddH2O至50 μL。PCR反應條件:98℃預變性3 min;98℃變性10 s,60℃退火10 s,72℃延伸1 min,共35個循環(huán);72℃最終延伸10 min,PCR產(chǎn)物以1%瓊脂糖凝膠進行電泳,并通過Wizard?SV Gel and PCR Clean-Up System試劑盒進行回收純化。
1.5 重組質(zhì)粒ppEETT--2288aa--NNPP--NN--CC的構建 將NP-N純化產(chǎn)物及載體pET-28a分別經(jīng)NdeI、BamH I雙酶切,回收并純化酶切產(chǎn)物,以T4 DNA連接酶16℃連接12 h,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至感受態(tài)E.coli DH5α,于37℃培養(yǎng)12 h,挑取單菌落接種至2 mL含35 μg/mL卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng),以NP-N-F/R、NP-C-F/R、T7 Promoter/Terminator為引物對重組菌進行鑒定,以ddH2O為陰性對照。通過堿裂解法提取重組菌質(zhì)粒,并以NdeI、BamH I雙酶切做進一步鑒定。將NP-C純化產(chǎn)物與重組質(zhì)粒pET-28a-NP-N分別經(jīng)SacI、HindⅢ雙酶切,以T4 DNA連接酶連接、轉(zhuǎn)化、鑒定方法同上。將鑒定正確的重組菌送往北京六合華大基因科技股份有限公司測序,將測序正確的重組質(zhì)粒命名為pET-28a-NP-N-C。
1.6 重組蛋白的誘導表達及可溶性分析 將重組質(zhì)粒pET-28a-NP-N-C及空載體pET-28a分別轉(zhuǎn)化至E.coliBL21(DE3)感受態(tài)中,并將重組菌1%轉(zhuǎn)接至含有35 μg/mL的LB培養(yǎng)液中,37℃培養(yǎng)至對數(shù)生長期,加入終濃度為1 mM的IPTG,誘導4 h,收集菌體并以PBS洗滌,Bug Baster?Master Mix裂解菌體,分別收集裂解后上清及沉淀,經(jīng)SDS-PAGE電泳分析重組蛋白的表達形式。
1.7 重組蛋白的純化及鑒定 收集2 L誘導表達后的重組菌,超聲裂解菌體,轉(zhuǎn)化至E.coliBL21(DE3)感受態(tài)中收集裂解沉淀,采用Ni-NTA Purification System純化重組蛋白,具體方法參照說明書,對純化后的目的蛋白進行復性處理。重組蛋白以SDS-PAGE電泳后,轉(zhuǎn)膜并以脫脂乳封閉,加入BPIV3陽性血清(1:80倍稀釋),4℃孵育過夜。加入HRP標記的兔抗牛IgG(1:5 000倍稀釋),37℃孵育1 h。加入DAB顯色3 min,以ddH2O終止反應。
1.8 間接EELLIISSAA方法的優(yōu)化 將融合蛋白NP-N-C以CBS倍比稀釋至0.5~8 μg/mL,包被ELISA板,100 μL/孔。對BPIV3陰、陽性血清也分別倍比稀釋至1:40~1:320,采用棋盤滴定試驗,確定最佳抗原包被濃度及血清最佳稀釋度。設置4℃包被過夜,37℃包被1 h,37℃包被2 h,37℃包被1 h后4℃過夜,共4組不同的包被條件,確定抗原最佳包被條件。分別以2.5%、5%、10%3個濃度脫脂乳作為封閉液,37℃封閉,封閉時間設置為30、60、90和120 min,對封閉液最佳濃度及時間進行優(yōu)化。分別以1:3 000、1:5 000、1:7 000 3個不同的稀釋度對HRP標記的兔抗牛IgG進行稀釋,37℃孵育,孵育時間設置為30、45和60 min,對二抗最佳稀釋倍數(shù)及孵育時間進行優(yōu)化。以TMB顯色液顯色,顯色時間分別設置為5、10、15和20 min,對顯色時間進行優(yōu)化。測定陽性血清、陰性血清的OD450并計算P/N值,以P/N值最大且陽性血清OD450≥1.0、陰性血清OD450<0.2作為間接ELISA優(yōu)化條件的判定標準。
1.9 陰、陽性臨界值的確立 隨機選取85份BPIV3陽性血清及79份BPIV3陰性血清,以已建立的ELISA方法分別進行檢測,測定OD450值。將測得的OD450值進行統(tǒng)計學分析。通過非參數(shù)法構建ROC曲線,以Youden指數(shù)最大的切點作為陰陽性判斷的臨界點,并確定該方法的特異性及敏感性。
1.10 重復性試驗 取一塊同批次包被的酶標板,用其檢測4份不同效價的陽性血清和2份陰性血清,每份血清做3個平行重復,以ELISA方法篩選出的最優(yōu)條件來對稀釋后血清進行檢測,統(tǒng)計學分析OD450并計算批內(nèi)重復試驗變異系數(shù),統(tǒng)計學分析試驗結果。
用不同時間抗原包被的ELISA板,對4份不同效價的陽性血清和2份陰性血清進行3次批間重復檢測,以ELISA篩選出的最優(yōu)條件來對稀釋后血清進行檢測,統(tǒng)計學分析OD450并計算批間重復試驗變異系數(shù),評價該方法的批間重復性。
2.1 目的基因NNPP--NN及NNPP--CC的擴增 PCR擴增目的基因NP-N及NP-C,擴增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,得到447 bp及420 bp 2條特異性條帶,與預期片段大小(如圖1)。
2.2 原核表達重組質(zhì)粒的鑒定 菌液PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,擴增出片段大小為447 bp(NPN)、420 bp(NP-C)、1 146 bp(NP-N-C)的特異性條帶,與預期相符(如圖2)。測序結果表明,重組質(zhì)粒中的目的基因與NX49株基因組序列素編碼的核苷酸、氨基酸的同源性均為100%,可用于原核表達。
2.3 重組蛋白的誘導表達形式的鑒定 誘導表達產(chǎn)物裂解后上清及沉淀經(jīng)Glycine-SDS-PAGE分析,得到大小為42 kDa的條帶,與預期大小相符(如圖3),并以包涵體的形式表達。同時于約35 kDa處出現(xiàn)一條帶,需進一步鑒定。
2.4 重組蛋白的純化 重組蛋白經(jīng)Ni-NTA系統(tǒng)純化后于42 kDa及35 kDa位置均出現(xiàn)條帶(如圖4)。純化的重組蛋白濃度約為123 μg/mL。
2.5 重組蛋白的Western BBlloott鑒定 以BPIV3 NX49株為陽性對照,Western Blot結果表明重組蛋白在42 kDa及35 kDa處條帶均能與BPIV3陽性血清發(fā)生特異性反應,全病毒蛋白對照組也在42 kDa及35 kDa位置處出現(xiàn)了2條特異性條帶(如圖5),說明表達的目的蛋白以2種形式存在,而且均具有良好的反應活性。
圖 1 NP基因片段的RT-PCR擴增Fig.1 Amplifiation ofNPfragment by PCR
圖 2 目的基因的擴增Fig.2 Amplifiation of target genes
M:蛋白Marker;1:對照組誘導后裂解上清;2:對照組誘導后裂解沉淀;3:重組菌誘導后裂解上清;4:重組菌誘導后裂解沉淀
圖 4 純化后重組蛋白的Glycine-SDS-PAGE分析Fig.4 The Glycine-SDS-PAGE of purified recombinant protein
2.6 間接EELLSSIIAA方法反應條件的優(yōu)化結果 對BPIV3間接ELISA反應條件的優(yōu)化結果見表2。
2.7 間接EELLIISSAA臨界值的確定 通過對隨機選取的85份BPIV3陽性血清及79份BPIV3陰性血清檢測,統(tǒng)計學分析OD450值,得到特異性與敏感性相關的ROC曲線(如圖6),本研究中Youden指數(shù)最大為0.927,所對應的臨界值為0.267,此時該方法的特異性為97.4%,靈敏性為95.3%。
M:蛋白質(zhì);1:對照組誘導后裂解沉淀與BPIV3陽性血清的反應;2:重組蛋白與BPIV3陽性血清的反應;3:NX49株與BPIV3陽性血清的反應
2.8 重復性試驗 通過對4份陽性血清及2份陰性血清進行的同批次及不同批次的重復性試驗,分析統(tǒng)計試驗結果,結果見表3,分別計算OD450平均值、標準差、變異系數(shù),結果顯示批內(nèi)批間重復性試驗變異系數(shù)均小于10%,證明了該間接ELISA方法重復性較好。
圖 6 ROC曲線Fig.6 Receiver-operator characteristic curve
表 2 間接ELISA方法反應條件的優(yōu)化Table 2 The optimized coditions of indirect ELISA
表 3 重復性試驗結果Table 3 The result of repeatability test
2.9 臨床樣品的檢測 對279份來自不同地區(qū)的血清采用本試驗建立的間接ELSIA方法進行檢測,檢出BPIV3陽性血清223份,陰性血清56份,血清BPIV3抗體陽性率為79.9%,如表4所示。
表 4 BPIV3抗體血清學調(diào)查Table 4 Serological survey of antibodies against BPIV3 in 3 provinces of China
BPIV3等病毒引起的BRDC發(fā)病率較高,常與其他病原體混合感染或繼發(fā)感染,臨床診斷較難,危害舍飼牛的健康,嚴重影響?zhàn)B牛業(yè)的經(jīng)濟效益,而我國針對BPIV3的檢測方法的研究尚不成熟,尚無商品化的檢測試劑盒[17-19]。在養(yǎng)牛業(yè)的發(fā)達國家,BPIV3的感染率及抗體陽性率同樣處于較高水平。有研究指出20世紀80年代,墨西哥及阿根廷的BPIV3陽性率分別為85.6%和77.3%,歐美的健康牛血清中BPIV3普遍存在抗體[20-21]。澳洲僅出口牛中BPIV3的感染率及抗體陽性率達到了46%和87%[22]。國內(nèi)也進行了一些BPIV3感染的流行病學調(diào)查,我國BPIV3血清陽性抗體率高達77.96%,感染率與抗體陽性率在逐漸增加[23]。因此建立針對BPIV3的診斷技術對BPIV3防控至關重要。
ELISA方法具有檢測快速、操作便捷等特點,適用于流行病學調(diào)查及牛場大規(guī)模檢測時的血清檢測。傳統(tǒng)的間接ELISA檢測方法一般以全病毒或病毒的某個蛋白作為包被抗原,全病毒抗原難以純化且成本較高。本研究選取NP基因中的抗原表位區(qū)域構建了pET-28a-NP-N-C原核表達載體,轉(zhuǎn)化至E.coli BL21(DE3)感受態(tài)中,以純化的重組蛋白作為抗原與待檢BPIV3抗體相結合,建立的間接ELISA方法重復性好、特異性強和敏感性高,可用于BPIV3抗體的檢測,為BPIV3檢測試劑盒的開發(fā)鋪設了條件。
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