張麗晗 羅 智 有文靜 李丹丹 吳 坤 徐異桓
(華中農(nóng)業(yè)大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院,動(dòng)物遺傳育種與繁殖教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 武漢 430070)
Wnt家族的基因最初是由Nusse和Varmus于1982年在鼠類乳腺癌病毒誘導(dǎo)的小鼠乳腺癌中克隆得到的, 并被命名為Int-1, 該基因由于與后來報(bào)道的果蠅無翅基因Wingless (Wg)同源, 故將兩者合并命名為Wnt[1]。自從Wnt家族在1982年被發(fā)現(xiàn)以來, 科學(xué)工作者已經(jīng)陸續(xù)在哺乳動(dòng)物基因組中發(fā)現(xiàn)了19種Wnt家族成員基因[2]。進(jìn)一步的研究證實(shí),Wnt基因家族與其他相關(guān)基因組成了一條復(fù)雜的信號(hào)傳導(dǎo)途徑——Wnt信號(hào)途徑(Wnt signaling pathway)。Wnts可以通過經(jīng)典的Wnt/β-catenin信號(hào)通路或者非經(jīng)典Wnt信號(hào)通路(包括Wnt/Ca2+信號(hào)通路和Wnt/PCP信號(hào)通路)調(diào)節(jié)靶基因的表達(dá), 在動(dòng)物胚胎發(fā)育、細(xì)胞分化和器官發(fā)育等多種生命過程中發(fā)揮作用[3—5]。
Wnt通路是機(jī)體重要的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路之一, 在細(xì)胞增殖、分化、胚胎發(fā)育和卵泡生成方面具有重要的調(diào)節(jié)作用[6,7]。因此, Wnt信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的錯(cuò)誤調(diào)節(jié)可導(dǎo)致包括卵巢發(fā)育失調(diào)在內(nèi)的多種病理變化[3,8]。研究已證實(shí), 以Wnt基因?yàn)榕潴w的Wnt信號(hào)通路在進(jìn)化中非常保守, 從低等的無脊椎動(dòng)物到高等的哺乳動(dòng)物都可以明顯檢測(cè)到該信號(hào)通路成員的表達(dá)[5]。在魚類, 目前僅在一些模式魚類克隆得到了Wnt家族部分成員的cDNA序列, 如斑馬魚(Danio rerio)[9,10]和青鳉(Oryzias latipe)[11]等。最近,曹梅等[12]基于斑點(diǎn)叉尾鮰(Ictalurus punctatus)的基因組數(shù)據(jù)庫, 通過與NCBI中存在的人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus) 和斑馬魚等Wnt蛋白氨基酸序列進(jìn)行比較, 發(fā)現(xiàn)斑點(diǎn)叉尾鮰Wnt基因家族成員共20種。然而, 在其他魚類, 還沒有有關(guān)Wnt家族成員cDNA序列克隆的報(bào)道, 也沒有關(guān)于這些基因mRNA組織表達(dá)的研究。
銅是包括魚類在內(nèi)的所有脊椎動(dòng)物必需的微量元素之一, 廣泛地參與體內(nèi)的許多生化過程, 然而, 過量的銅對(duì)生物體是有毒的[13]。與其他脊椎動(dòng)物不同, 魚類可以經(jīng)由鰓從水中吸收銅。我們前期研究發(fā)現(xiàn)水體銅暴露能影響黃顙魚的卵巢發(fā)育和激素分泌[14], 然而相關(guān)機(jī)制尚不清楚。對(duì)哺乳動(dòng)物的研究表明, Wnt介導(dǎo)的通路在卵巢發(fā)育和激素分泌過程中起著重要作用[15]。Wnt通路能通過激活βcatenin提高FSH的作用效果, 因而促進(jìn)腔前卵泡的生長, 然而, 過度活化β-catenin對(duì)LH激素誘導(dǎo)的排卵和黃體化產(chǎn)生不利的影響[16]。
鑒于Wnt家族基因和蛋白對(duì)卵巢發(fā)育的重要作用, 我們假設(shè)Wnt家族成員介導(dǎo)了銅影響黃顙魚卵巢發(fā)育和激素分泌的調(diào)控。所以, 作為深入解析這些成員功能的第一步, 本研究首先克隆了黃顙魚Wnt家族4個(gè)基因(Wnt5a、Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b)全長的cDNA序列, 探討了它們的組織表達(dá)模式; 在此基礎(chǔ)上研究了水體銅暴露對(duì)這些基因mRNA表達(dá)的影響, 為深入研究Wnt家族基因在銅影響魚類卵巢發(fā)育和激素分泌中所起的作用奠定基礎(chǔ), 并為解析魚類Wnt家族基因的功能提供科學(xué)依據(jù)。
本實(shí)驗(yàn)的黃顙魚為一齡黃顙魚, 均購自武漢市上涉湖養(yǎng)殖場(chǎng)(東經(jīng)114°15′, 北緯30°8′), 分為2組。第一組黃顙魚用于Wnt家族4個(gè)基因cDNA序列的克隆和組織表達(dá)水平的測(cè)定。用于基因克隆的黃顙魚組織樣品為肝臟和卵巢組織。用于基因表達(dá)譜測(cè)定的組織包括黃顙魚的腦、脾臟、腎、鰓、心臟、肌肉、脂肪、肝臟和卵巢組織。取樣參照本實(shí)驗(yàn)室的方法[17,18]。
第二組黃顙魚用于檢測(cè)水體銅暴露對(duì)Wnt家族4個(gè)基因表達(dá)水平的影響。實(shí)驗(yàn)策略參照[14]。簡單說來, 216尾規(guī)格均一的健康黃顙魚[平均體重:(10.2±0.2) g, 平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤]隨機(jī)放入9個(gè)300 L玻璃纖維缸中, 每缸24尾。分別暴露在銅濃度為0(對(duì)照)、30(低)和60(高) μg/L的水體中, 每個(gè)處理設(shè)3個(gè)重復(fù)(即3個(gè)缸), 每天換水1次。水中銅濃度通過電感耦合等離子體質(zhì)譜儀(ICP-MS)測(cè)定[14], 每周測(cè)定2次, 實(shí)測(cè)值分別為(3±1)、(31±2)和(62±3) μg Cu/L (平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤,n=16)。實(shí)驗(yàn)期間, 黃顙魚每天飽食投喂商業(yè)飼料2次[飼料Cu含量: (3.1±1) mg Cu/kg, 平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤,n=3], 每天換水1次。實(shí)驗(yàn)持續(xù)8周, 在28d和56d時(shí)進(jìn)行取樣, 每缸取6尾黃顙魚提RNA用于基因表達(dá)測(cè)定。
RNA提取試劑盒(Trizol Reagent)、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、3′-Full RACE Kit試劑盒、5′-Full RACE Kit試劑盒、熒光定量試劑盒、凝膠純化回收試劑盒、Taq酶、DNA Marker(2000)、dNTP等試劑購自大連寶生物公司(TaKaRa), 胰蛋白胨和酵母粉購自Sigma公司, 無水乙醇、氯仿、異丙醇等為中國國藥分析純產(chǎn)品。
參照本實(shí)驗(yàn)室已有的方法[17,18]。簡要步驟如下: 總RNA的提取參照Invitrogen公司的Trizol說明書進(jìn)行。總RNA的質(zhì)量通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè), 其濃度及A260/A280通過Nanodrop ND2000分光光度計(jì)測(cè)定。然后, 以提取的總RNA為模板, 用TaKaRa公司的反轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScriptTMII 1st Strand cDNA Synthesis Kit)合成第一鏈cDNA。
根據(jù)GenBank及Ensembl數(shù)據(jù)庫中已報(bào)道的魚類Wnt家族基因序列, 設(shè)計(jì)簡并引物(表 1), 以擴(kuò)增Wnt5a、Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b基因cDNA核心片段。PCR反應(yīng)程序如下: 94℃預(yù)變性4min; 94℃30s, 55℃ 30s, 72℃ 1min, 30個(gè)循環(huán); 72℃延伸5min。PCR體系包括500 ng cDNA template、0.2 μmol/L primer、5 μL 10×ExTaqBuffer、2.5 mmol/LdNTP和1.25 U ExTaqpolymerease (TaKaRa, 日本)。然后分別設(shè)計(jì)3′和5′ RACE特異性引物(表 1)進(jìn)行巢式PCR反應(yīng), Outer-PCR反應(yīng)參數(shù)為: 94℃預(yù)變性3min; 然后94℃ 30s, 55℃ 30s, 72℃ lmin, 共25個(gè)循環(huán); 最后72℃再延伸10min。Inner-PCR反應(yīng)參數(shù)為:94℃預(yù)變性3min; 然后94℃ 30s, 55℃ 30s, 72℃1min, 共30個(gè)循環(huán); 最后72℃終延伸10min。
用DNAStar軟件將擴(kuò)增得到的核心片段、3′和5′末端序列拼接, 從而獲得基因的cDNA全長序列。獲得的核苷酸序列經(jīng)NCBI進(jìn)行BLAST, 以確定該序列對(duì)應(yīng)的基因亞型(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)。同時(shí), 運(yùn)用DNAStar軟件找出開放閱讀框(ORF)并翻譯成氨基酸序列。序列比對(duì)和氨基酸同源性分析使用Clustal-W軟件。進(jìn)化樹用MEGA 5.0軟件采用鄰接法(NJ)構(gòu)建[19], 選擇的最適進(jìn)化模型為JTT+G[20], 每個(gè)節(jié)點(diǎn)的可信值進(jìn)行1000次重復(fù)計(jì)算。
參照文獻(xiàn)[17, 18]采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR (qPCR)方法檢測(cè), 熒光定量引物見表 2。qPCR反應(yīng)參數(shù)為: 95℃預(yù)變性30s; 95℃ 5s, 57℃ 30s, 72℃ 30s,共40個(gè)循環(huán)。相對(duì)表達(dá)水平采用2-ΔΔCt方法計(jì)算[21]。選用雙內(nèi)參(β-actin和gapdh)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。我們的預(yù)實(shí)驗(yàn)表明這2個(gè)內(nèi)參組合在黃顙魚不同組織及不同銅暴露濃度下的表達(dá)水平?jīng)]有顯著差異。
表 1 Wnt5a、Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b基因克隆的引物序列Tab. 1 Primers used for the cDNAs cloning of Wnt5a, Wnt5b,Wnt7a and Wnt9b genes
結(jié)果采用平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤(Mean±SEM) 進(jìn)行表示。統(tǒng)計(jì)分析之前, 采用Kolmogorov-Smirnov檢驗(yàn)所有數(shù)據(jù)的正態(tài)分布性。不同處理間方差的同質(zhì)性使用Bartlett檢驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)處理組之間進(jìn)行單因素方差分析和Duncan’s多重比較檢驗(yàn)。顯著性水平取0.05。采用SPSS 19.0軟件(SPSS, Michigan Avenue, Chicago, IL, USA) 進(jìn)行數(shù)據(jù)分析處理。
本研究通過RT-PCR和RACE方法獲取Wnt5a、Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b基因的cDNA全長序列, 長度分別為1984、2905、2158和1622 bp。序列分析顯示,它們的cDNA序列ORF長度分別為1124、1124、1049和1073 bp, 翻譯成蛋白所得到的氨基酸數(shù)分別為375、375、350和358。黃顙魚除WNT7A以外, WNT5A、WNT5B和WNT9B氨基酸序列都有信號(hào)肽酶切位點(diǎn)。黃顙魚WNT5A和WNT5B都有24個(gè)保守的半胱氨酸殘基, 4個(gè)保守的天冬酰胺殘基和1個(gè)酪氨酸硫酸化位點(diǎn)(圖 1)。黃顙魚WNT7A蛋白有24個(gè)保守的半胱氨酸殘基(圖 2)。黃顙魚WNT9B有23個(gè)保守的半胱氨酸殘基和1個(gè)N糖基化位點(diǎn)(圖 3)。
多肽序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)黃顙魚WNT5A、WNT5B、WNT7A和WNT9B氨基酸序列與其他魚類和哺乳類的同源性分別為78.6%—83.4%、76.3%—88.4%、85.9%—89.3%和58.9%—85.9%。
黃顙魚和其他脊椎動(dòng)物WNTs氨基酸的進(jìn)化樹見圖 4。在進(jìn)化樹中, 所有硬骨魚WNTs獨(dú)立聚集成一簇, 而兩棲類和哺乳類WNTs聚集成另外一簇。與其他硬骨魚類相比, 黃顙魚WNT5A與墨西哥麗脂鯉(Astyanax mexicanus) 比較接近, 黃顙魚WNT9B與青鳉(Oryzias latipe) 最近。黃顙魚WNT5B與 墨西哥麗脂鯉(Astyanax mexicanus) 和斑馬魚(Danio rerio)比較接近。硬骨魚類WNT7A先與青鳉(Oryzias latipes)和斑馬魚(Danio rerio) 聚成一簇, 再與黃顙魚WNT7A共同聚成一簇。
表 2 熒光定量引物Tab. 2 Primers used for real-time PCR
圖 1 黃顙魚(Pf: Pelteobagrus fulvidraco)WNT5A和WNT5B氨基酸序列與斑馬魚(Dr: Danio rerio)、墨西哥麗脂鯉(Am: Astyanax mexicanus)和人類(Hs: Homo sapiens)比對(duì)分析Fig. 1 Alignment of P. fulvidraco (Pf: Pelteobagrus fulvidraco) WNT5A and WNT5B amino acid sequences with other species (Dr: Danio rerio; Am: Astyanax mexicanus; Hs: Homo sapiens)
圖 2 黃顙魚(Pf: Pelteobagrus fulvidraco) WNT7A氨基酸序列與斑馬魚(Dr: Danio rerio)、青鳉(Ol: Oryzias latipes)和人類(Hs: Homo sapiens)和其他硬骨魚類比對(duì)分析Fig. 2 Alignment of P. fulvidraco (Pf: Pelteobagrus fulvidraco) WNT7A amino acid sequences with other species (Dr: Danio rerio; Ol:Oryzias latipes; Hs: Homo sapiens)
Wnt5a的mRNA在肌肉表達(dá)最高, 其次是脂肪組織, 而在其他組織(如腦、脾臟、腎臟、鰓、心臟、肝臟和卵巢)中無顯著差異(圖 5A);Wnt5b在脾臟中的表達(dá)最高, 而在其他組織中無顯著性差異(圖 5B);Wnt7a在肌肉中表達(dá)最高, 其次是腦、卵巢、脂肪和鰓, 而在其他組織中無顯著性差異(圖5C);Wnt9b在肌肉中表達(dá)最高, 而其他組織無顯著性差異(圖 5D)。
在暴露28d時(shí),Wnt7amRNA水平在30 μg Cu/L組最高, 其他2組差異不顯著 (圖 6A)。Wnt5a、Wnt5b和Wnt9b基因的mRNA表達(dá)各個(gè)處理組無顯著性差異。在暴露56d (圖 6B),Wnt5b在60 μg Cu/L組最低, 其他2個(gè)組差異不顯著;Wnt9bmRNA水平在30 μg Cu/L組最高, 其他2組差異不顯著。
本研究克隆得到了黃顙魚Wnt5a、Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b基因的cDNA全長序列。分析這4個(gè)基因的蛋白序列發(fā)現(xiàn), 它們具有一些保守的結(jié)構(gòu)域,如N-糖基化位點(diǎn)、信號(hào)肽酶切位點(diǎn)和保守的半胱氨酸殘基等[22—25]。本研究指出, WNT蛋白富含半胱氨酸, 這些半胱氨酸之間形成的二硫鍵對(duì)其正確折疊非常重要。N-糖基化是Wnt蛋白的一個(gè)重要修飾, 它們對(duì)Wnt的分泌和行使正常功能至關(guān)重要[26]。多肽序列比對(duì)發(fā)現(xiàn), 黃顙魚WNT5A、WNT5B、WNT7A和WNT9B氨基酸序列與其他魚類和哺乳類的同源性分別為78.6%—83.4%、76.3%—88.4%、85.9%—89.3%和58.9%—85.9%, 這與在哺乳動(dòng)物中的報(bào)道相近[22,23,27,28]。進(jìn)化樹分析進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),黃顙魚WNT5A、WNT5B、WNT7A和WNT9B多肽與其他魚類的親緣關(guān)系與物種的分類地位相符,與曹梅等[12]在斑點(diǎn)叉尾鮰中的研究結(jié)果相似。
圖 3 黃顙魚(Pf: Pelteobagrus fulvidraco) WNT9B氨基酸序列與斑馬魚(Dr: Danio rerio)、墨西哥麗脂鯉(Am: Astyanax mexicanus)和人類(Hs: Homo sapiens)比對(duì)分析Fig. 3 Alignment of P. fulvidraco (Pf: Pelteobagrus fulvidraco) WNT9B amino acid sequences with other species (Dr: Danio rerio; Am:Astyanax mexicanus; Hs: Homo sapiens)
研究基因的組織分布模式有助于我們初步了解這些基因的生理功能。Wnt家族成員作為一種信號(hào)分子普遍存在于生物體各個(gè)組織中, 并參與生物體多種組織細(xì)胞的生命過程。然而, 先于我們的研究, 目前在魚類還沒有有關(guān)這些基因mRNA組織表達(dá)模式的報(bào)道。我們的研究表明這4個(gè)Wnt基因在黃顙魚各組織中均有表達(dá), 但不同組織間的表達(dá)水平差異很大, 一方面表明Wnt家族的這4個(gè)基因在各個(gè)組織中起著廣泛的作用, 另一方面不同組織差異性的表達(dá)模式可能反映了不同組織特有的生物學(xué)作用。因此, 這種表達(dá)差異被認(rèn)為是Wnt基因功能的多樣性造成的。相似地, 周春婭等[25]指出海蜇Wnt5基因在不同的發(fā)育階段均有表達(dá), 但存在著明顯的發(fā)育表達(dá)差異。此外, 在卵巢中的表達(dá)表明這些基因可能在卵巢發(fā)育和成熟中起著重要的調(diào)控作用, 相似的結(jié)果在Sanchez等[15]的研究中得到了證實(shí)。
圖 4 脊索動(dòng)物Wnts系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig. 4 Phylogenetic tree based on the protein sequences of Wnts from P. fulvidraco (▲) and other chordate species using the neighborjoining (NJ) method with 1000 bootstrap replicates
在本研究中, 我們假設(shè)銅對(duì)黃顙魚卵巢發(fā)育和激素合成的影響與Wnt通路的變化有關(guān)。然而, 無論是在陸生(包括哺乳動(dòng)物)還是水生動(dòng)物, 目前還沒有關(guān)于銅影響這些基因表達(dá)水平的報(bào)道; 而且,目前僅見Wnt5a在哺乳動(dòng)物卵巢發(fā)育和激素分泌過程中所起生物學(xué)作用的研究, 沒有Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b生物學(xué)功能的類似報(bào)道, 因此要進(jìn)行深入的討論非常困難。我們的研究表明: 在28d時(shí), 黃顙魚卵巢中的Wnt7amRNA水平在30μg Cu/L組最高, 其他2組差異不顯著;Wnt5a、Wnt5b和Wnt9b基因的mRNA表達(dá)各個(gè)處理組無顯著性差異。而在56d,卵巢中的Wnt5b在60 μg Cu/L組最低, 其他2個(gè)組差異不顯著;Wnt9bmRNA水平在30 μg Cu/L組最高,其他2組差異不顯著。Wnt家族成員是一類富含半胱氨酸的分泌型糖脂蛋白, 可以通過經(jīng)典的Wnt/βcatenin信號(hào)通路或者非經(jīng)典Wnt信號(hào)通路 (包括Wnt/Ca2+信號(hào)通路和Wnt/PCP信號(hào)通路) 調(diào)控機(jī)體的生命活動(dòng)。有限的研究指出, Wnt5a是非經(jīng)典Wnt信號(hào)通路的配體, 在哺乳動(dòng)物雌性生殖系統(tǒng)發(fā)育過程中發(fā)揮了重要的作用。過表達(dá)Wnt5a能夠抑制顆粒細(xì)胞的β-catenin信號(hào)[29]。Wu等[7]在黑鯛(Acanthopagrus schlegeli)的研究表明,Wnt4基因的上調(diào)和cyp19a基因的下調(diào)伴隨著卵巢的生長, 說明Wnt信號(hào)通路參與并調(diào)控卵巢組織的生長與發(fā)育。本研究初步發(fā)現(xiàn)Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b可能介導(dǎo)了銅影響黃顙魚卵巢發(fā)育和激素合成的變化, 因此,深入闡明Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b在銅影響黃顙魚卵巢發(fā)育和激素合成中的作用機(jī)制, 有助于揭示銅影響黃顙魚卵巢發(fā)育和激素合成的機(jī)理, 這將為研究銅的繁殖營養(yǎng)和毒性效應(yīng)提供一個(gè)新的思路。
圖 5 黃顙魚Wnts組織特異性表達(dá)分析Fig. 5 The mRNA level of Wnts in the brain, spleen, kindey, gill, heart, muscle, fat, liver and ovary
圖 6 第28天和第56天銅暴露對(duì)黃顙魚卵巢中Wnts基因(Wnt5a、Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b)mRNA表達(dá)的影響Fig. 6 Effect of Cu exposure on the mRNA levels of genes (Wnt5a, Wnt5b, Wnt7a and Wnt9b) in the ovary of P. fulvidraco on days 28 and 56
本研究獲取了Wnt5a、Wnt5b、Wnt7a和Wnt9b基因的cDNA全長序列, 為深入解析它們的功能奠定了基礎(chǔ); 這些基因在檢測(cè)的9個(gè)組織中都有表達(dá),但表達(dá)水平相同, 表明它們會(huì)以信號(hào)分子的形式參與多種組織細(xì)胞的生命過程; 銅暴露差異性影響了Wnt家族4個(gè)基因的mRNA水平, 表明它們的基因功能發(fā)生了分化, 并可能介導(dǎo)了銅影響黃顙魚卵巢發(fā)育的調(diào)控。
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