国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

赤霉素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及其調(diào)控植物生長發(fā)育的研究進(jìn)展

2018-08-18 01:44:14高秀華傅向東
生物技術(shù)通報 2018年7期
關(guān)鍵詞:復(fù)合體泛素突變體

高秀華 傅向東

(中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所 植物細(xì)胞與染色體工程國家重點實驗室,北京 100101)

赤 霉 素(gibberellins或 gibberellic acid,GA)是一類屬于雙萜類化合物的植物激素,在植物整個生命周期中都起著重要作用,能促進(jìn)細(xì)胞分裂和伸長、種子萌發(fā)、下胚軸和莖稈伸長、根的生長及開花等[1-3]。20世紀(jì)30年代,日本科學(xué)家發(fā)現(xiàn)GA能夠促進(jìn)植物生長。1926年,日本病理學(xué)家黑澤英一研究水稻“惡苗病”致病原因時,發(fā)現(xiàn)感染赤霉菌(Gibberella fujikuroi)的水稻植株會出現(xiàn)瘋長現(xiàn)象。將赤霉菌培養(yǎng)基的濾液噴施到健康水稻幼苗上,發(fā)現(xiàn)幼苗雖然沒有感染赤霉菌,但也會出現(xiàn)類似“惡苗病”的過度生長癥狀。1935年,日本藪田貞治郎和住木諭介從赤霉菌培養(yǎng)基的濾液中分離出這種活性物質(zhì),鑒定了它的化學(xué)結(jié)構(gòu),并將其命名為赤霉素。1956年,C.A.韋斯特和B.O.菲尼分別證明了高等植物中也普遍存在著類似的萜類化合物。迄今,已從不同維管植物、細(xì)菌及真菌中先后鑒定出了136種結(jié)構(gòu)明確的GAs,并按照時間順序?qū)⑺鼈兠麨镚A1-GA136。但是,只有部分GAs具有調(diào)節(jié)植物生長的生理效應(yīng),如 GA1、GA3、GA4和 GA7等[4-5]。遺傳學(xué)的證據(jù)表明,盡管植物中已分離鑒定出GA3,但是在許多植物中GA1和GA4是主要的活性GAs。此外,在擬南芥和水稻中,GA4的活性成分強(qiáng)于GA1[6-8]。赤霉素作為植物生長調(diào)節(jié)劑已被廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,在促進(jìn)種子萌發(fā)、莖稈伸長、果實發(fā)育以及提高植物耐逆性等方面發(fā)揮著重要作用。

植物需要產(chǎn)生和積累合適水平的活性GA以確保正常的生長發(fā)育。GA可以從合成位點轉(zhuǎn)運至生長發(fā)育過程中需要GA的組織或器官中[9]。近來的研究表明,GA轉(zhuǎn)運蛋白NPF(Nitrate transporter 1/peptide transporter family)家族及SWEET家族成員在GA的運輸過程中起了重要作用[10]。NPF3.1已被證明是植物中獨特的GA轉(zhuǎn)運體[11]。此外,GTR1(Glucosinolate transporter 1,即NPF2.10)也能夠轉(zhuǎn)運GA3[12]。目前,SWEET家族成員中僅SWEET13及SWEET14被報道為GA轉(zhuǎn)運蛋白[13]。有趣的是,SWEET13、SWEET14和NPF3的GA轉(zhuǎn)運活性并不局限于活性GA或特定的中間形式,而是可以運輸這兩種類型[11,13]。GA轉(zhuǎn)運蛋白的發(fā)現(xiàn)進(jìn)一步補(bǔ)充了GA可移動的證據(jù),表明植物體內(nèi)存在一種有效的調(diào)節(jié)機(jī)制來指導(dǎo)GA的分布和在植物中流動,以確保合適的GA信號。

自20世紀(jì)60年代起,“綠色革命”中半矮化育種的大規(guī)模推廣大幅度地提高了世界主要糧食作物的產(chǎn)量。水稻和小麥的“綠色革命”都與赤霉素密切相關(guān)。水稻“綠色革命”基因sd1(semi-dwarf 1)編碼赤霉素生物合成途徑的一個關(guān)鍵酶GA20ox2;小麥“綠色革命”基因Rht1(Reduced height 1)編碼赤霉素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的關(guān)鍵調(diào)控元件DELLA蛋白[14-16]。近年來,隨著植物分子生物學(xué)和功能基因組學(xué)的發(fā)展,有關(guān)赤霉素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)以及GA-DELLA與其它激素和環(huán)境因子互作調(diào)控植物生長發(fā)育等研究領(lǐng)域取得了突破性進(jìn)展。

1 赤霉素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑

植物體內(nèi)存在GA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的分子網(wǎng)絡(luò)。當(dāng)赤霉素受體感知GA信號后,激活信號傳遞通道,調(diào)控下游基因的表達(dá),從而影響植物生長發(fā)育和形態(tài)建成。近年來,隨著擬南芥和水稻功能基因組學(xué)、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)及系統(tǒng)生物學(xué)的發(fā)展,人們已經(jīng)鑒定了多個參與GA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的正/負(fù)調(diào)控因子,其中主要包括GA受體GID1蛋白、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的F-box蛋白及DELLA蛋白等[17-20],為GA介導(dǎo)DELLA蛋白降解的分子模型的建立和赤霉素作用分子機(jī)理的解析奠定了基礎(chǔ)。

1.1 GID1蛋白:可溶性的GA受體

植物是如何感知GA信號并將其傳遞下去,從而引發(fā)一系列的生理學(xué)效應(yīng)的?可溶性GA受體GID1蛋白的發(fā)現(xiàn)可謂是GA信號研究領(lǐng)域取得的突破性進(jìn)展。2005年,日本科學(xué)家Ueguchi-Tanaka等[18]證實水稻GID1蛋白是一種可溶性的赤霉素受體,它能與活性GA結(jié)合,感知并傳遞GA信號,從而誘發(fā)一系列下游反應(yīng)。GID1基因編碼一種類似于激素敏感相關(guān)的脂肪酶HSL(Hormone sensitive lipase)蛋白。雖然它含有保守的HSL基序(motif):HGG和GXSXG,但研究發(fā)現(xiàn)GID1蛋白本身并不具有水解酶活性。GID1蛋白能與水稻的DELLA蛋白SLR1(SLENDER RICE1)直接互作,而這種互作依賴于活性GA的存在[18]。GID1蛋白主要定位于細(xì)胞核及細(xì)胞質(zhì)中,目前并沒有發(fā)現(xiàn)GID1在細(xì)胞膜上的定位。因此,是否存在質(zhì)膜定位的GA受體還需進(jìn)一步研究。

Nakajima等[21-23]從擬南芥中克隆了水稻GID1的3個同源基因:分別是AtGID1a,AtGID1b和AtGID1c。它們對活性GA都具有較強(qiáng)的結(jié)合能力,同時在GA存在的條件下均能夠直接與DELLA蛋白相互作用。由于這3個基因在功能上存在冗余,因此單突變體沒有明顯的GA不敏感的表型,而三突變體則對GA信號完全喪失響應(yīng)且生長發(fā)育受到抑制。但是在不同的生長發(fā)育階段,3個功能基因的表達(dá)模式及作用不盡相同,例如,AtGID1a在座果形成中發(fā)揮重要作用,而AtGID1b和AtGID1c分別在種子發(fā)育和果莢伸長等方面具有重要功能[24]。

赤霉素受體GID1蛋白晶體結(jié)構(gòu)的闡述對揭示GID1生物學(xué)功能和GA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的分子機(jī)制提供了重要信息。2008年,日本兩個研究小組成功解析了水稻GID1-GA-DELLA復(fù)合體以及擬南芥GID1a-GA-DELLA復(fù)合體的晶體結(jié)構(gòu)[25-26]。對GID1蛋白晶體結(jié)構(gòu)的解析發(fā)現(xiàn)GID1是一個球狀的單體蛋白,其C端的核心結(jié)構(gòu)形成GA結(jié)合的口袋,N端延伸結(jié)構(gòu)形成了蓋住口袋的蓋子。GID1蛋白與活性GA結(jié)合后形成類似于HSL的結(jié)構(gòu):它們都是一種α/β水解酶折疊結(jié)構(gòu),由中心8條β折疊且β折疊兩側(cè)由α螺旋緊密連接組成,GA與GID1的結(jié)合位點與HSL的活性位點一致[27]。根據(jù)復(fù)合體的晶體結(jié)構(gòu),科學(xué)家們提出了GID1蛋白的“變構(gòu)學(xué)說”。活性GA和GID1蛋白C端的核心結(jié)構(gòu)結(jié)合后,促使GID1蛋白 N端蓋住GA結(jié)合的口袋,并將GA分子包在結(jié)合它的口袋中(類似于關(guān)閉蓋子),進(jìn)而誘導(dǎo)GID1蛋白構(gòu)象轉(zhuǎn)變,產(chǎn)生可與DELLA蛋白結(jié)合的疏水表面,促進(jìn)GID1-GA-DELLA蛋白復(fù)合體的形成[2]。

近來的研究表明,GID1蛋白能夠被E3泛素連接 酶 GARU(GA receptor RING E3 ubiquitin ligase)泛素化并經(jīng)由蛋白酶體途徑降解[28]。GID1能夠與GARU在體內(nèi)互作。染料木黃酮(Genistein)是酪氨酸激酶的抑制劑,染料木黃酮處理增強(qiáng)GID1A的泛素化,然而GA處理則抑制其泛素化。植物酪氨酸激酶TAGK2是染料木黃酮的靶標(biāo),能磷酸化GARU 321位的酪氨酸(Tyr321)進(jìn)而抑制GARUGID1A的相互作用。染料木黃酮誘導(dǎo)GID1的降解及DELLA蛋白的積累。相反,garu突變及過表達(dá)TAGK2則會促進(jìn)GID1穩(wěn)定及DELLA蛋白的降解。因此GA的響應(yīng)受GARU-依賴的GID1泛素化負(fù)調(diào)控,而TAGK2磷酸化GARU的酪氨酸則能正調(diào)控GA的響應(yīng)[28]。這些研究結(jié)果進(jìn)一步闡明了GID1蛋白的降解途徑。

1.2 DELLA蛋白:GA信號途徑中的調(diào)節(jié)子

通過遺傳篩選和生化研究,科學(xué)家們分離鑒定了GA信號通路中的關(guān)鍵組分DELLA蛋白,它主要起阻遏作用,其N端都含有保守的DELLA結(jié)構(gòu)域。已分離的DELLA蛋白主要有玉米的d8(dwarf 8)、小麥的Rht1、水稻的SLR1、大麥的SLN1(SLENDER1)、 葡 萄 的 VvGAI及 番 茄 中 的PROCERA[29-30]。擬南芥中含有5個DELLA蛋白:GAI(GA insensitive)、RGA(repressor of ga1-3)、RGLl(RGA-Like1)、RGL2 和 RGL3[31-35]。 此 外,GAI和RGA蛋白與擬南芥的SCR(SCARECROW)蛋白在C端同源性較高,屬植物特異的GRAS(GAI、RGA和SCR)蛋白家族成員[36]。

DELLA蛋白的基本結(jié)構(gòu)如圖1所示,其N端具有典型的DELLA和VHYNP結(jié)構(gòu)域,中間是多聚Ser/Thr/Val結(jié)構(gòu)域,C端則是GRAS結(jié)構(gòu)域。進(jìn)一步的研究表明,DELLA和VHYNP結(jié)構(gòu)域是GA信號響應(yīng)的功能域,主要介導(dǎo)DELLA與GID1蛋白的相互作用[31,37-38]。多聚 Ser/Thr/Val(多聚 S/T/V),通常作為磷酸化和糖基化的靶位點,是調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)域。C端的GRAS結(jié)構(gòu)域主要有兩個亮氨酸重復(fù)序列LHR(Leu heptad repeat)及一個核定位信號結(jié)構(gòu)域(nuclear localization signal,NLS)和3個保守的VHIID、PFYRE及SAW等結(jié)構(gòu)域。亮氨酸重復(fù)(LHR)介導(dǎo)蛋白-蛋白間相互作用;而VHIID、PFYRE及SAW等結(jié)構(gòu)域是阻遏結(jié)構(gòu)域,介導(dǎo)GID1與F-box蛋白的相互作用[38]。

圖1 DELLA蛋白結(jié)構(gòu)示意圖

DELLA結(jié)構(gòu)域是GRAS蛋白家族中DELLA亞家族蛋白獨有的,該結(jié)構(gòu)域的功能與GA響應(yīng)有關(guān)。擬南芥gai是一個對外源GA處理不敏感的半顯性矮化突變體[39],它是由于GAI基因的一個51 bp堿基缺失突變,導(dǎo)致DELLA結(jié)構(gòu)域中17個氨基酸丟失而造成。而RGA基因缺失相同的51 bp序列(rga-Δ17),其轉(zhuǎn)基因擬南芥植株也會產(chǎn)生GA不敏感的嚴(yán)重矮化表型[31]。這些研究表明DELLA結(jié)構(gòu)域的突變使gai(或者rga-Δ17)蛋白成為GA響應(yīng)的組成型抑制子,阻遏GA介導(dǎo)的植物生長發(fā)育。GA促進(jìn)植物的生長發(fā)育是通過解除DELLA蛋白的阻遏作用實現(xiàn)的,當(dāng)DELLA蛋白感知GA信號后,DELLA蛋白的阻遏作用被解除,植株表現(xiàn)出正常生長發(fā)育。如果DELLA蛋白的GA響應(yīng)功能域突變,使之不能感知GA信號,那么DELLA蛋白便組成性地阻遏植物生長發(fā)育,這類突變體表現(xiàn)為植株矮化、葉色深綠和晚花等類似GA缺失突變體表型,但對外源GA處理不敏感[34]。

1.3 DELLA蛋白降解依賴SCFSLY1/GID2/SNE

SCF(Skp1/cullin/F-box)復(fù)合體是26S蛋白酶體降解體系中的E3泛素連接酶,其中的F-box蛋白是SCF復(fù)合體的一個亞基,它決定了底物識別的特異性。在赤霉素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中,DELLA蛋白的降解依賴泛素-蛋白酶體降解途徑[40-41]。遺傳學(xué)研究表明,擬南芥中的SLY1及水稻中的同源基因GID2編碼F-box蛋白,是GA信號中的正調(diào)控因子[42]。

功能喪失的sly1突變體不能降解DELLA蛋白并且表現(xiàn)出GA不敏感的矮化表型[40]。DELLA蛋白能與SLY1蛋白在體內(nèi)直接互作,表明DELLA蛋白是SLY1蛋白的直接靶標(biāo)[42-43]。因此,SLY1蛋白作為SCFSLY1/GID2蛋白復(fù)合體組分之一,介導(dǎo)了GA誘導(dǎo)的DELLA蛋白的降解。當(dāng)GA處理或有GA信號時,SLY1能特異地與DELLA蛋白發(fā)生親和反應(yīng),通過26S蛋白酶體蛋白降解途徑降解DELLA蛋白,從而去除DELLA蛋白的阻遏作用,實現(xiàn)GA的應(yīng)答反應(yīng)。

近來的研究表明,E3類泛素化(small ubiquitinlike modifier,SUMO)連接酶AtSIZ1能夠與SLY1蛋白互作,并通過類泛素化SLY1進(jìn)而正調(diào)控SLY1介導(dǎo)的GA信號[44]。與野生型相比,atsiz1-2突變體中的SLY1蛋白減少而DELLA蛋白增多。此外,GA促進(jìn)SLY1的類泛素化,且類泛素化的SLY1與DELLA蛋白互作,調(diào)控DELLA蛋白的降解。這些研究表明SLY1的類泛素化對于GA介導(dǎo)的DELLA蛋白的降解也非常重要[44]。

擬南芥中SLY1的同源基因為SNEEZY(SNE)或 SLEEPY2(SLY2),全長的SLY1與SNE基因在DNA及氨基酸序列上分別有55%及33%的相似性[45]。與sly1突變體相比,sly1 sne雙突變體表現(xiàn)出嚴(yán)重矮化表型,且育性顯著降低,表明SNE也是GA信號通路中功能冗余的正調(diào)控子[46]。此外,過量表達(dá)SNE(SLY2)能部分恢復(fù)sly1突變體的矮化表型,表明 SNE 在功能上能夠替代 SLY1[43,47]。然而,在sly1突變體中過量表達(dá)SLY1能夠?qū)е翿GA及RGL2蛋白的降解,但是在sly1突變體中過量表達(dá)SNE,只能導(dǎo)致RGA蛋白水平的降低,RGL2蛋白水平并不改變,表明SNE與SLY1的功能并不完成相同[45]。盡管AtSIZ1能與SLY1互作,但是AtSIZ1不能與SLY2互作,表明AtSIZ1以SLY1依賴的方式介導(dǎo)GA的響應(yīng)[44]。

1.4 GID1介導(dǎo)DELLA蛋白降解的分子模型

近年來,隨著GID1、SLY1/GID2及DELLA蛋白功能研究的不斷深入,人們對GA作用機(jī)理及其信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑有了非常清晰的認(rèn)識。在GA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中,DELLA蛋白主要起阻遏作用并抑制植物生長發(fā)育,而GA促進(jìn)植物生長發(fā)育是通過降解DELLA蛋白實現(xiàn)的。水稻GID2、擬南芥SLY1和SNE蛋白是SCFSLY1/GID2/SNEE3泛素連接酶蛋白復(fù)合體中的F-Box蛋白,而植物感知GA信號則依賴于GA受體GID1蛋白。當(dāng)活性GA分子與受體GID1蛋白結(jié)合后,GA-GID1復(fù)合體與DELLA蛋白N端結(jié)合,導(dǎo)致DELLA蛋白構(gòu)象改變并允許DELLA蛋白C端與SCFSLY1/GID2/SNE相互作用,GID1-GA-DELLA蛋白復(fù)合體的形成增強(qiáng)了DELLA與SCFSLY1/GID2/SNE間的互作,導(dǎo)致DELLA蛋白被泛素化,并經(jīng)由26S蛋白酶復(fù)合體降解,進(jìn)而解除DELLA蛋白的阻遏作用(圖 2)[19-20,48]。

圖2 DELLA蛋白介導(dǎo)的GA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)模型

1.5 DELLA蛋白修飾在GA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用

盡管蛋白酶體依賴的DELLA蛋白降解途徑能夠解釋大多數(shù)的GA響應(yīng),但是與GA合成缺陷的ga1-3突變體及gid1突變體相比,sly1及gid2突變體積累了更多的DELLA蛋白但并未表現(xiàn)出更加嚴(yán)重的矮化表型。研究表明,當(dāng)存在有功能的DELLA結(jié)構(gòu)域時,單獨的GA和GID1蛋白就能去除DELLA蛋白的阻遏作用,而不需要SLY1/GID2介導(dǎo)的DELLA蛋白的降解[49]。過量表達(dá)GID1通過增加GA-GID1-DELLA復(fù)合體的形成進(jìn)而解除了sly1-2突變體的種子休眠表型[50]。因此,可能存在另外一條不依賴于蛋白酶體降解的途徑,這種途徑可能是通過直接的蛋白-蛋白相互作用或者非直接地轉(zhuǎn)錄后修飾完成的[49,51]。

近年來的研究表明,植物體內(nèi)還存在磷酸化、糖基化和類泛素化等其他蛋白修飾作用影響DELLA蛋白活性。在水稻中的研究發(fā)現(xiàn)EL1(EARLY FLOWERING1),編碼一種酪蛋白激酶,可以磷酸化SLR1,而SLR1中預(yù)測的磷酸化位點突變可以顯著改變其對GA的響應(yīng),表明磷酸化的DELLA蛋白對于其活性和生物學(xué)功能具有重要的作用[52]。此外,磷酸酶TOPP4作為GA信號中的正調(diào)控因子,通過直接去磷酸化DELLA蛋白,進(jìn)而促進(jìn)GA介導(dǎo)的DELLA蛋白的降解[53]。糖基化修飾也在GA信號通路中起重要作用。SPY(SPINDLY)是GA信號途徑負(fù)調(diào)控因子,SPY基因編碼O-連N-乙?;咸烟寝D(zhuǎn)移酶(O-linked N-acetylglucosamine(O-GlcNAc)transferases,OGTs), 能 O-GlcNAc 糖 基 化 修 飾DELLA蛋白[54-57]。擬南芥的O-連N-乙?;咸烟寝D(zhuǎn)移酶SECRET AGENT(SEC)也能夠修飾DELLA蛋白。遺傳學(xué)分析表明,SEC和SPY在調(diào)控GA信號中發(fā)揮的作用不同。SEC是GA響應(yīng)的正調(diào)控因子,而SPY是負(fù)調(diào)控因子。在煙草細(xì)胞瞬時表達(dá)體系中,DELLA蛋白能夠被SEC O-GlcNAc糖基化但不能被SPY O-GlcNAc糖基化。此外,O-GlcNAc糖基化的RGA抑制了其與互作蛋白PHYTOCHROMEINTERACTING FACTOR 3(PIF3)、PIF4、JA ZIM domain protein 1(JAZ1) 及 BRASSINAZOLERESISTANT 1(BZR1)的結(jié)合,表明O-GlcNAc糖基化修飾的DELLA蛋白能整合發(fā)育和環(huán)境信號精細(xì)調(diào)控GA響應(yīng)[58]。最近研究表明,SPY作為新的O-巖藻糖轉(zhuǎn)移酶(O-fucosyltransferase)可以O(shè)-巖藻糖基化修飾DELLA蛋白,這種O-巖藻糖基化修飾增強(qiáng)了DELLA蛋白的活性,促進(jìn)了DELLA蛋白與PIF3、PIF4及BZR1互作,然而SEC O-GlcNAc糖基化修飾DELLA蛋白抑制了這種互作[59]。DELLA蛋白的類泛素化修飾(sumoylation)對于其活性和穩(wěn)定性也起了重要作用。DELLA蛋白的羧基端能夠被類泛素化修飾,GID1也含有類泛素化-互作基序。類泛素化的DELLA蛋白能夠以GA非依賴的方式與GID1的類泛素化-互作基序互作,導(dǎo)致非類泛素化的DELLA蛋白積累,阻礙植物生長,以利于植物適應(yīng)逆境環(huán)境[60]。

綜上所述,磷酸化、糖基化和類泛素化等修飾作用對于DELLA蛋白的活性和穩(wěn)定性具有重要的影響,不同修飾的DELLA蛋白整合發(fā)育和環(huán)境信號精細(xì)調(diào)控GA響應(yīng)。

2 GA-DELLA整合其它激素和環(huán)境因子信號調(diào)控植物生長發(fā)育的機(jī)理

越來越多的研究表明,DELLA蛋白作為GA信號途徑中的調(diào)控因子,能夠整合多種激素和環(huán)境信號調(diào)控植物的生長發(fā)育。DELLA蛋白缺少DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,且也沒有直接的證據(jù)表明DELLA蛋白能夠直接結(jié)合DNA。因此,DELLA蛋白調(diào)控靶基因的表達(dá)可能通過以下方式:一是,DELLA蛋白與轉(zhuǎn)錄因子互作,抑制轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合活性,從而抑制靶基因的表達(dá);二是,DELLA蛋白與其它的轉(zhuǎn)錄因子互作,作為轉(zhuǎn)錄激活子,調(diào)控下游靶基因的表達(dá)(圖3)[61-62]。此外,DELLA蛋白還可以作為非轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,調(diào)控植物生長發(fā)育。

圖3 DELLA整合其它激素和環(huán)境因子信號調(diào)控植物生長發(fā)育

2.1 DELLA作為轉(zhuǎn)錄抑制子整合激素和環(huán)境信號調(diào)控植物的生長發(fā)育

光和GA調(diào)控植物生長發(fā)育的多個過程。光誘導(dǎo)光形態(tài)建成,抑制下胚軸的伸長,然而GA促進(jìn)黃化苗的生長及下胚軸的伸長。DELLA蛋白能夠與bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的PIF3和PIF4互作,通過結(jié)合到這些轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合區(qū)域,抑制PIFs靶基因的表達(dá)進(jìn)而抑制下胚軸的伸長[63-64]。GA誘導(dǎo)DELLA蛋白的降解,釋放出PIFs,促進(jìn)PIFs激活基因的表達(dá)。因此,DELLA與PIFs互作整合GA和光信號進(jìn)而調(diào)控植物的光形態(tài)建成(圖3)。

GA與油菜素內(nèi)酯BR(Brassinosteroide)在調(diào)控植物的生長發(fā)育中也存在互作。在擬南芥中,轉(zhuǎn)錄因子BZR1及BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE 1 EMS-SUPPRESSOR1(BES1)是BR信號途徑中的正調(diào)控因子。DELLA蛋白與BZR1的直接互作阻礙了BZR1結(jié)合到BR調(diào)控基因的啟動子區(qū),從而抑制靶基因的表達(dá),GA誘導(dǎo)DELLA蛋白降解后,釋放出BZR1,解除了這種抑制[65-67]。此外,DELLA及BZR1能夠與PIF4互作形成DELLA-BZR1-PIF4復(fù)合體,從而整合GA、BR及環(huán)境信號共同調(diào)控植物的生長發(fā)育[65,68]。進(jìn)一步研究表明,DELLA蛋白能夠與生長素響應(yīng)因子ARF6(Auxin response factor 6)互作,與BZR1及PIF4形成BZR1-ARF6-PIF-DELLA復(fù)合體,共同調(diào)控擬南芥下胚軸細(xì)胞的伸長[69](圖 3)。

GA與乙烯信號在調(diào)控擬南芥頂端彎鉤發(fā)育過程中也存在互作。乙烯通過促進(jìn)下游轉(zhuǎn)錄因子ETHYLENE INSENSITIVE3(EIN3)及 EIN3-like(EIL)的積累,從而激活乙烯的信號響應(yīng)。頂端彎鉤形成的重要調(diào)控元件HLS1(HOOKLESS 1)是乙烯信號元件EIN3的直接靶基因。DELLA蛋白通過與EIN3/EIL1互 作, 抑 制 HLS1及RAP2.3(RELATED TO APETALA2.3)的表達(dá)及頂端彎鉤的形成[70-71]。DELLA蛋白通過與EIN3/EIL1直接互作,抑制EIN3/EIL1的轉(zhuǎn)錄活性,從而拮抗乙烯的響應(yīng)。DELLAEIN3互作進(jìn)一步揭示GA與乙烯共同調(diào)控頂端彎鉤發(fā)育的作用機(jī)理(圖3)。

近來的研究表明,植物特異的轉(zhuǎn)錄因子TCP(TEOSINTE BRANCHED1/CYCLOIDEA/PROLIFERATING CELL FACTOR)參與獨腳金內(nèi)酯信號轉(zhuǎn)導(dǎo),能夠抑制植物分枝[72-75]。DELLA蛋白能夠與I類的TCP轉(zhuǎn)錄因子(如TCP14和TCP15)互作,通過結(jié)合到TCP的DNA識別區(qū)域而阻礙TCP的功能[76-77](圖 3)。在酵母中 DELLA 蛋白 SLR1能夠與獨腳金內(nèi)酯的受體D14(DWARF14)互作,表明GA信號與獨腳金內(nèi)酯也存在互作[78]。然而,DELLA-D14互作的功能還需要進(jìn)一步研究。

茉莉酸(Jasmonic acid,JA)也是重要的植物激素,調(diào)控植物的生長發(fā)育及脅迫響應(yīng)。研究表明GA和JA拮抗調(diào)控植物的生長發(fā)育及對生物及非生物脅迫的響應(yīng)。JAZ是茉莉酸信號中的關(guān)鍵抑制子,JAZ1在JA信號途徑中能與下游的關(guān)鍵正調(diào)控因子MYC2(JASMONATE INSENSITIVE1,JIN1/MYC2)相互作用,抑制MYC2對下游基因表達(dá)的調(diào)控作用。DELLA與JAZ互作抑制了JAZ的活性,增強(qiáng)了MYC2調(diào)控的JA介導(dǎo)的根的生長抑制及對病原菌Pst DC3000(Pseudomonas syringae pv tomato DC3000)的敏感性[79-81]。此外,DELLA和JAZ能夠與WD-repeat/bHLH/MYB復(fù)合體中的成員GL3/EGL3及GL1互作,協(xié)同GA與JA信號調(diào)控毛狀體的發(fā)育[82-84](圖 3)。

在調(diào)控擬南芥開花方面,DELLA蛋白能夠與轉(zhuǎn)錄因子SPL(SQUAMOSA PROMOTER BINDINGLIKE)互作,SPL通過激活miR172及MADS-box基因的表達(dá)進(jìn)而促進(jìn)開花。長日照條件下,DELLA蛋白與SPL蛋白互作干擾了SPL的轉(zhuǎn)錄活性,降低了葉中miR172的表達(dá)及頂端分生組織中MADS基因的表達(dá),使得開花延遲[85](圖3)。在擬南芥中GA通過激活開花決定基因比如LEAFY(LFY)及SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION CONSTANS1(SOC1)進(jìn)而促進(jìn)開花。DELLA蛋白通過抑制LFY及SOC1的表達(dá)進(jìn)而抑制短日照條件下的開花[86-89]。近來的研究表明,DELLA蛋白能夠與重要的開花激活子CONSTANS(CO)互作,通過抑制CO的表達(dá)進(jìn)而調(diào)控長日照條件下擬南芥的開花[90](圖3)。此外,DELLA蛋白能夠與bHLH48 及 bHLH60互作,調(diào)控長日照條件下的開花[91]。DELLA蛋白也能夠與WRKY12、WRKY13及WRKY75互作,調(diào)控擬南芥的開花時間[92-93]。其它DELLA互作蛋白包括BOTRYTIS SUSCEPTIBLE1 INTERACTOR(BOI),BOI-RELATED GENE1(BRG1),BRG2 及 BRG3,統(tǒng)稱為BOIs,屬于RING結(jié)構(gòu)域蛋白家族。DELLA能與BOIs互作形成復(fù)合體,結(jié)合到GA響應(yīng)基因的啟動子區(qū),抑制基因的響應(yīng),進(jìn)而調(diào)控種子萌發(fā)、營養(yǎng)生長到生殖生長的轉(zhuǎn)變及開花時間等[94]。

此外,在調(diào)控果實的發(fā)育方面,DELLA能夠與bHLH家族成員ALCATRAZ(ALC)互作,抑制ALC靶基因的表達(dá),調(diào)控離層的分化,進(jìn)而調(diào)節(jié)果實的著生形態(tài)[95]。另有報道指出DELLA蛋白可以與同屬于bHLH家族的SPT(SPATULA)相互作用,共同調(diào)控種子的萌發(fā)和子葉的擴(kuò)張[96,97](圖3)。

2.2 DELLA作為轉(zhuǎn)錄激活子整合激素和環(huán)境信號調(diào)控植物的生長發(fā)育

除了作為轉(zhuǎn)錄抑制子,DELLA蛋白也能夠作為轉(zhuǎn)錄激活子發(fā)揮作用。已有的研究表明,GA和ABA在調(diào)控種子的休眠和萌發(fā)中起拮抗作用?;钚訥A促進(jìn)種子的萌發(fā),而ABA卻維持種子的休眠[98]。遺傳學(xué)的研究表明,ABA信號途徑中的轉(zhuǎn)錄因子ABSCISIC ACID INSENSITIVE 3(ABI3)及 ABI5 負(fù)調(diào)控種子的萌發(fā)[99]。近來研究表明,含有C3H鋅指蛋白SOMNUS基因負(fù)調(diào)控種子的萌發(fā),DELLA蛋白能與ABI3和ABI5蛋白互作形成復(fù)合體,結(jié)合在SOMNUS等基因的啟動子區(qū),激活這些基因的表達(dá),從而調(diào)控逆境下種子的萌發(fā)[100]。DELLA蛋白與ABI3和ABI5互作揭示了GA與ABA互作調(diào)控種子萌發(fā)的機(jī)制(圖3)。

在擬南芥中SCL3(SCARECROW-LIKE 3)是GA信號中的正調(diào)控因子,SCL3的表達(dá)受DELLA的誘導(dǎo)但受GA的抑制。SCL3與DELLA蛋白互作通過拮抗DELLA蛋白的活性,進(jìn)而調(diào)控根的生長和種子的萌發(fā)[101-102]。擬南芥的基因組中含有16個含鋅指結(jié)構(gòu)域的INDETERMINATE DOMAIN(IDD)蛋白[103],其中 IDD1、IDD3、IDD5、IDD9、IDD10 及IDD的同源蛋白GAF1能夠與DELLA蛋白互作,調(diào)控GA響應(yīng)[104-107]。IDD1與DELLA蛋白互作調(diào)控種子的休眠[104];IDD3、IDD5、IDD9及 IDD10不僅與DELLA蛋白互作,也與SCL3互作。DELLA、SCL3及IDDs三個蛋白共同組成“共激活子/共抑制子調(diào)控系統(tǒng)”精細(xì)調(diào)控 GA 響應(yīng)[61,106](圖 3)。在該系統(tǒng)中,DELLA蛋白作為共激活子,DELLA與IDD互作增強(qiáng)了SCL3的表達(dá)。此外,積累的SCL3作為共抑制子,SCL3-IDD蛋白復(fù)合體的增加抑制了SCL3 自身的表達(dá)[61,106]。

GA與細(xì)胞分裂素在調(diào)控植物的多個發(fā)育進(jìn)程中發(fā)揮拮抗作用[108]。ARR1(Arabidopsis response regulator 1)是細(xì)胞分裂素信號通路中重要的轉(zhuǎn)錄因子,DELLA蛋白能夠與ARR1互作,激活響應(yīng)基因的表達(dá),調(diào)控根的生長及光形態(tài)建成[109-110](圖3)。DELLA/ARR異二聚體揭示了GA與細(xì)胞分裂素互作的新調(diào)控機(jī)制,這與DELLA/IDD復(fù)合體類似,能轉(zhuǎn)錄激活目標(biāo)基因的表達(dá)[106]。

2.3 DELLA作為非轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子調(diào)控植物生長發(fā)育

除了作為轉(zhuǎn)錄激活子或者轉(zhuǎn)錄抑制子外,DELLA 蛋白還可作為非轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子調(diào)控細(xì)胞的增殖。GA通過PFD(Prefoldin)復(fù)合體調(diào)控皮質(zhì)微管Cortical Microtubule(cMT)的排列。PFD3及PFD5是微管蛋白伴侶分子,作用在胞質(zhì)中協(xié)調(diào)細(xì)胞增殖過程中微管蛋白的組織及聚合[111]。PFD復(fù)合體在細(xì)胞核中不能發(fā)揮功能,但是可被轉(zhuǎn)運至胞質(zhì)中促進(jìn)微管蛋白的折疊(tubulin folding)。DELLA蛋白能夠與PFD3及PFD5互作,使PFD被限制在細(xì)胞核內(nèi)并導(dǎo)致其不能在胞質(zhì)中發(fā)揮功能。當(dāng)有活性GA存在時,DELLA蛋白被降解,PFDs釋放到胞質(zhì)中促進(jìn)微管蛋白二聚化[112]。因此,GA可以通過DELLA-PFD-tubulin folding-cMT聚合級聯(lián)調(diào)控皮質(zhì)微管的排列[113]。

除了調(diào)控微管蛋白的折疊外,DELLA蛋白作為非轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子還參與到蛋白轉(zhuǎn)運過程中。Salanenka等[114]的研究表明,GA能平衡蛋白質(zhì)在液泡降解途徑及返回細(xì)胞表面的轉(zhuǎn)運過程。低GA水平促進(jìn)轉(zhuǎn)運物(包括PIN蛋白)向液泡傳遞和降解,而高GA水平促進(jìn)它們再循環(huán)到質(zhì)膜。GA的這種效應(yīng)需要蛋白質(zhì)逆向運輸復(fù)合體(Retromer)組分,例如,Sorting Nexin 1(SNX1)及與它互作的微管相關(guān)蛋白CLASP1(the cytoplasmic linker-associated protein 1)。GA調(diào)控SNX1及CLASP1的亞細(xì)胞分布,且GA在蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運中的效應(yīng)需要完整的微管細(xì)胞骨架。如前所述,DELLA蛋白能夠與PFDs互作調(diào)控微管蛋白的折疊。因此,DELLA蛋白除了轉(zhuǎn)錄調(diào)控外,還可以通過其互作蛋白PFDs及下游的MT/CLASP1模塊,調(diào)控蛋白質(zhì)逆向運輸復(fù)合體的活性及蛋白質(zhì)從液泡途徑到質(zhì)膜的雙向轉(zhuǎn)運。通過這種機(jī)制,GA能夠調(diào)控諸多轉(zhuǎn)運蛋白和受體重新定位進(jìn)出細(xì)胞表面,從而調(diào)控一系列細(xì)胞過程,包括生長過程中細(xì)胞的增殖。

綜上所述,DELLA蛋白作為GA信號途徑中的關(guān)鍵調(diào)控因子,通過與其它不同信號途徑中的轉(zhuǎn)錄因子及非轉(zhuǎn)錄因子相互作用,影響下游基因的表達(dá),從而實現(xiàn)對根的生長、下胚軸伸長、頂端彎鉤的發(fā)育、開花、果實發(fā)育、植物光形態(tài)建成和防御反應(yīng)等多種植物發(fā)育階段和生理反應(yīng)的調(diào)控。目前人們對這個復(fù)雜而精細(xì)的調(diào)控過程的認(rèn)識還有待進(jìn)一步闡明。

3 總結(jié)與展望

GA-DELLA在調(diào)控植物的生長發(fā)育和脅迫反應(yīng)中扮演了重要的作用。近年來的研究已從分子水平上揭示了GA通過GID1介導(dǎo)的DELLA蛋白的降解來促進(jìn)植物的生長發(fā)育。盡管可溶性的GA受體GID1也存在細(xì)胞質(zhì)中,但是GA-GID1-DELLA蛋白復(fù)合體定位在細(xì)胞核中。在谷物的糊粉層細(xì)胞中,GA誘導(dǎo)的α-淀粉酶的產(chǎn)生可能需要質(zhì)膜定位的受體。因此,是否存在膜定位的依賴于GID1但是不依賴于DELLA蛋白的GA信號通路的共受體,還需進(jìn)一步研究。去阻遏調(diào)控機(jī)制表明GA促進(jìn)植物的生長發(fā)育是通過降解DELLA蛋白實現(xiàn)的。然而,對DELLA相關(guān)突變體的研究暗示,植物體內(nèi)可能存在不依賴于DELLA蛋白的GA信號傳遞過程[115]。在Maymon等[116]的研究中,GA能夠抵抗細(xì)胞分裂素對莖稈伸長的抑制作用,但是這個過程并不完全依賴于DELLA蛋白,因為DELLA缺失突變體global(缺失 GAI、RGA、RGL1、RGL2及RGL3)對細(xì)胞分裂素并沒有表現(xiàn)出完全不敏感的特點,暗示還有DELLA以外的因子參與該信號傳遞過程。此外,在研究global和ga1 global突變體時發(fā)現(xiàn)DELLA蛋白缺失并不等于GA作用完全飽和,global突變體仍然能夠響應(yīng)GA對單性結(jié)實果莢伸長的促進(jìn)作用[117]。另外研究表明,GA誘導(dǎo)的細(xì)胞質(zhì)中鈣離子([Ca2+]cyt)的增加不依賴于DELLA蛋白的降解,在DELLA蛋白不能降解的轉(zhuǎn)基因材料(RGAΔ17)及global突變體中,GA處理仍能快速增加細(xì)胞質(zhì)中鈣離子[118]。這些實驗現(xiàn)象揭示,在已知的GADELLA信號調(diào)控模式之外,還可能存在未知的不依賴DELLA蛋白的信號調(diào)控模式參與GA響應(yīng),目前這種不依賴于DELLA蛋白的GA信號組分還需鑒定。DELLA蛋白的磷酸化、糖基化及類泛素化修飾對于DELLA蛋白的穩(wěn)定性和活性至關(guān)重要,但是這些修飾的分子機(jī)制并不清楚。越來越多的證據(jù)表明,DELLA蛋白能夠與各種轉(zhuǎn)錄因子互作,通過GA誘導(dǎo)的DELLA蛋白的降解,整合發(fā)育和環(huán)境信號調(diào)控細(xì)胞的分裂和分化。然而,GA動態(tài)調(diào)控DELLA相關(guān)復(fù)合體響應(yīng)發(fā)育和環(huán)境信號的分子機(jī)制尚未可知,DELLA蛋白與其互作蛋白動態(tài)結(jié)合的調(diào)控機(jī)制仍需進(jìn)一步闡述。水稻“綠色革命”基因sd1是赤霉素生物合成途徑的一個關(guān)鍵酶,小麥“綠色革命”基因Rht1是赤霉素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的關(guān)鍵成員——DELLA蛋白本身。今后利用遺傳、生化及系統(tǒng)生物學(xué)的方法,進(jìn)一步鑒定GA-DELLA響應(yīng)的新組分及調(diào)控網(wǎng)絡(luò),加強(qiáng)對GA的生物學(xué)效應(yīng)與其信號傳遞途徑的分子機(jī)制研究,無論對于我們理解植物生長發(fā)育與GA的作用機(jī)理,還是對于赤霉素在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的應(yīng)用,都具有非常重要的意義。

猜你喜歡
復(fù)合體泛素突變體
CLIC1及其點突變體與Sedlin蛋白的共定位研究
擬南芥干旱敏感突變體篩選及其干旱脅迫響應(yīng)機(jī)制探究
蛋白泛素化和類泛素化修飾在植物開花時間調(diào)控中的作用
CoFe2O4/空心微球復(fù)合體的制備與吸波性能
泛RNA:miRNA是RNA的“泛素”
Survivin D53A突變體對宮頸癌細(xì)胞增殖和凋亡的影響
泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域與泛素化信號的識別
SCF E3泛素化連接酶的研究進(jìn)展
磷酸三酯酶突變體H23A的真核表達(dá)及性質(zhì)表征
3種多糖復(fù)合體外抗腫瘤協(xié)同增效作用
墨玉县| 延川县| 东城区| 满洲里市| 京山县| 金湖县| 峨山| 芦溪县| 江川县| 乌拉特中旗| 金坛市| 丰顺县| 宾川县| 北宁市| 陆河县| 甘孜县| 大同市| 高邮市| 睢宁县| 泰州市| 张家港市| 武陟县| 平陆县| 比如县| 崇信县| 红河县| 商水县| 吉水县| 宁城县| 富宁县| 潜山县| 东乌珠穆沁旗| 陇南市| 临海市| 江孜县| 新绛县| 扶沟县| 剑河县| 左贡县| 普宁市| 泸定县|