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長鏈非編碼RNA在乳腺癌中診斷效能的Meta分析研究

2018-10-23 09:54王秀珍王丹韓春生姜熙
實驗與檢驗醫(yī)學(xué) 2018年5期
關(guān)鍵詞:異質(zhì)性閾值效能

王秀珍 ,王丹 ,韓春生 ,姜熙

(1、鄭州市第一人民醫(yī)院檢驗科,河南 鄭州450004;2、鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院骨科,河南 鄭州 450052;3、鄭州市第一人民醫(yī)院腫瘤血液科,河南 鄭州450004)

最新癌癥統(tǒng)計顯示,乳腺癌 (breast cancer,BC)在國內(nèi)女性中發(fā)病率占所有腫瘤的第一位,死亡率占四位[1]。早期診斷是提高BC患者預(yù)后的重要手段之一。近年研究表明,長鏈非編碼RNA(long-noncoding RNA,lncRNA)在BC的臨床診斷中具有很高的價值和潛在的應(yīng)用前景[2-8]。然而,由于單項研究的各種局限性,研究結(jié)果間存在較大差異性。本研究擬通過綜合定量的Meta分析,系統(tǒng)性評價已報道的lncRNA分子在BC中的綜合診斷效能,為后期更好地研究lncRNA在BC中發(fā)揮的作用提供循證醫(yī)學(xué)證據(jù)。

1 材料與方法

1.1 文獻(xiàn)檢索 Meta分析按“系統(tǒng)評價和薈萃分析優(yōu)先報告的條目”(PRISMA 聲明,2009版)進(jìn)行[9]。系統(tǒng)性檢索 PubMed、Web of Science、EBSCO、知網(wǎng)和萬方數(shù)據(jù)庫中的相關(guān)中英文文獻(xiàn)。主要檢索詞包括:“乳腺癌/乳腺腫瘤/breast carcinoma/breast cancer/breast tumor/breast neoplasm/tumor of breast”、 “長鏈非編碼RNA/long non-coding RNA/lncRNA”、“診斷/敏感性/特異度/AUC/ROC/曲線下面積/sensitivity/specificity/diagnosis/AUC/area under curve”等。

1.2 研究的納入與排除 納入標(biāo)準(zhǔn):⑴文獻(xiàn)內(nèi)容為lncRNA在BC中診斷的應(yīng)用或評價;⑵研究需提供足夠的診斷指標(biāo)滿足資料提取和統(tǒng)計分析;⑶研究中對照組的類型明確,為健康者或乳腺良性疾病。排除標(biāo)準(zhǔn):⑴研究的對照組類型界定不明確或?qū)φ绽龜?shù)未知;⑵提取的數(shù)據(jù)不能滿足生成2×2四格表;⑶基礎(chǔ)研究、動物實驗、綜述、Meta分析、讀者來信、述評、會議摘要等。

1.3 數(shù)據(jù)提取和文獻(xiàn)質(zhì)量評價 資料提取由兩位作者獨立完成。提取內(nèi)容主要包括:論文作者、發(fā)表日期、研究人群、病例數(shù)、對照例數(shù)及類型、樣本類型、檢測方法、敏感度、特異度、AUC、cut-off值等。通過“診斷性研究的質(zhì)量表(QUADAS)”評價納入研究的質(zhì)量[10],共含有14個條目,每個條目可評價為“是(1 分)”,“否(0 分)”或“未知(0 分)”。資料提取和文獻(xiàn)質(zhì)量評價中存在的分歧或不一致意見通過共同討論解決。

1.4 統(tǒng)計分析 通過Meta-disc 14.0和Stata 12.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析。采用雙變量Meta分析模型進(jìn)行統(tǒng)計量的合并,包括敏感度 (SEN)、特異度(SPE)、診斷的優(yōu)勢比(DOR)、陽性似然比(PLR)、陰性似然比(NLR)、合并的ROC曲線及曲線下面積(AUC)。通過Spearman相關(guān)系數(shù)評估閾值效應(yīng),P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義;通過Cochran’Q檢驗和I2檢驗評估非閾值效應(yīng),顯著差異設(shè)定為P<0.01或 I2>50%[11]。 研究間存在顯著異質(zhì)性時,選用隨機效應(yīng)模型合并統(tǒng)計量。通過敏感性分析和Meta回歸探討異質(zhì)性來源[12]。論文發(fā)表偏移的評估采用Deek’s漏斗圖檢驗。

2 結(jié)果

2.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果和研究特征 如圖1所示,通過系統(tǒng)性檢索在線數(shù)據(jù)庫,排除重復(fù)文獻(xiàn)后共得到698篇文章。根據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn),最終納入7篇文獻(xiàn)(含有11個獨立組間研究)。納入的7項研究發(fā)表于2015年-2017年,均來自中國,共包括BC患者512例,非BC對照者446例;樣本類型包括血清和血漿;LncRNA表達(dá)譜包括H19、HOTAIR、MALAT1、ANRIL、HIFA-AS2、UCA1 和 RP11-445H22.4共7種lncRNA。LncRNA的檢測方法均為RT-qPCR,內(nèi)參照基因包括GAPDH、U6和βactin。

2.2 質(zhì)量評價和異質(zhì)性分析 通過QUADAS量表對納入7項研究的質(zhì)量進(jìn)行評價,結(jié)果如圖2所示:所有7篇文獻(xiàn)存在的偏移及風(fēng)險整體較低,提示納入研究的質(zhì)量較可靠。異質(zhì)性檢驗結(jié)果顯示,整體合并效應(yīng)量的Spearman相關(guān)系數(shù)P=0.018,提示研究存在由閾值效應(yīng)引起的異質(zhì)性。同時,Cochran’Q和I2檢驗顯示,整體合并效應(yīng)量的P=0.2334,I2=22.1%,提示研究不存在非閾值效應(yīng)引起的異質(zhì)性。

2.3 合并診斷效能 LncRNA檢測診斷BC整體合并 的 SEN、SPE、PLR、NLR 和 DOR 分 別 為 0.75(95%CI:0.72~0.78)、0.80(95%CI:0.77~0.83)、3.63(95%CI:2.9~4.53)、0.32(95%CI:0.27~0.38)和 12.93(95%CI:9.38~17.82),AUC 為 0.85(SROC 曲線見圖3)。

表1 納入文獻(xiàn)的資料特征

圖1 文獻(xiàn)的納入和排除流程

圖2 納入文獻(xiàn)的QUADAS質(zhì)量評價

2.4 亞組分析 亞組分析顯示,基于血漿的lncRNA檢測的診斷效能優(yōu)于血清,SEN、SPE和AUC分別為 0.71(95%CI:0.66~0.77)vs 0.78(95%CI:0.74~0.82)、0.88(95%CI:0.83~0.91)vs 0.76(95%CI:0.70~0.81)和0.86 vs 0.84。此外,單項lncRNA檢測中,以lncRNA-HORTAIR檢測診斷的AUC最高(0.86),均高于 lncRNA-MALAT1(AUC=0.81)和-H19(AUC=0.80)。

圖3 LncRNA用于BC診斷的SROC曲線及AUC

圖4 Deek’s漏斗圖檢驗評估研究間的發(fā)表偏倚

2.5 敏感性分析和Meta回歸分析 敏感性分析顯示,所有納入研究分布均在允許限范圍內(nèi),提示研究間的同質(zhì)性較好。Meta回歸分析進(jìn)一步對研究質(zhì)量、標(biāo)本類型、參考基因、cut-off值設(shè)定、病例數(shù)和對照組數(shù)等因素進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)上述因素中,不同的cut-off值設(shè)定(P=0.0466)和對照組樣本例數(shù)(P=0.0323)可能是研究異質(zhì)性的來源之一。2.6 發(fā)表偏移 整體合并效應(yīng)量的Deek’s漏斗圖分析顯示,所有研究基本呈對稱分布,其斜率對應(yīng)P值為0.063,提示研究間不存在發(fā)表偏移(圖4)。

3 討論

乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率呈逐年上升趨勢[1]。早期診斷對BC的治療至關(guān)重要。研究顯示,早期BC患者治療的5年生存率可達(dá)90%以上,充分說明早期診斷是BC患者獲得較好預(yù)后的關(guān)鍵[13]。盡管如此,腫瘤的早期診斷對仍是當(dāng)今面臨的一項重大挑戰(zhàn),臨床仍缺少高靈敏度和特異度的診斷指標(biāo)。LncRNA屬于非編碼RNA家族的主要類型之一。近年來,多項研究發(fā)現(xiàn)異常表達(dá)的lncRNA分子可作為BC診斷的較好指標(biāo)[2-8]。

本研究顯示,7種lncRNA表達(dá)譜對BC具有較高的診斷價值,其診斷的SEN、SPE分別為0.75和0.80,相應(yīng)曲線下面積(AUC)達(dá)0.85。診斷的比值比(DOR,即真陽性與假陽性之比)是評價檢驗效能的另一項重要指標(biāo),當(dāng)DOR的值小于1時,提示一項檢測的診斷效能很低[14]。本研究中,lncRNA用于診斷BC的DOR為12.93,提示該檢測具有很高的診斷效能。另外,lncRNA用于診斷BC的陽性似然比為3.63,這說明BC患者7種lncRNA分子表達(dá)檢測陽性的概率約是對照組的4倍。合并的陰性似然比為0.32,說明在lncRNA檢測的陰性結(jié)果中,僅存在32%的假陰性。以上數(shù)據(jù)充分證明lncRNA表達(dá)檢測可很好用于BC的診斷。

本研究進(jìn)一步根據(jù)樣本類型和lncRNA單項檢測等因素進(jìn)行亞組分析。基于樣本類型的分析結(jié)果顯示,以血漿為檢測基質(zhì)的lncRNA檢測在BC中的診斷效能優(yōu)于血清,其SEN、SPE、PLR、NLR 和 DOR 分 別 為 0.71、0.88、5.25、0.34 和16.97,這提示血漿可作為檢測BC中l(wèi)ncRNA的較合適的樣本類型。盡管如此,因劃分亞組分后其樣本量減小,異質(zhì)性增大,在一定程度上增加了合并結(jié)果的不準(zhǔn)性。目前也有研究證實BC患者尿液中的lncRNA也對該疾病具有很好的診斷價值[8]。因此,血漿能否作為BC患者lncRNA檢測的較為合適樣本類型,有待進(jìn)一步被證實。另外,基于單項lncRNA檢測的結(jié)果中以lncRNA-HORTAIR檢測的診斷效能最高,AUC達(dá)0.86,高于lncRNA-H19和-MALAT1。目前已有多項關(guān)于lncRNA-HORTAIR,-H19和-MALAT1在腫瘤診斷、預(yù)后中的報道,其功能因不同的腫瘤類型而異[15-17],因此有必要對這些lncRNA分子在不同腫瘤中發(fā)揮的作用進(jìn)行深入研究,為臨床開發(fā)新的腫瘤診斷、預(yù)后指標(biāo)及藥物靶點提供依據(jù)。

研究間的異質(zhì)性是所有meta分析實施過程中面臨的一個共性問題[18]。Spearman相關(guān)系數(shù)分析顯示,本研究產(chǎn)生的異質(zhì)性主要來源于閾值效應(yīng)。閾值效應(yīng)主要由不同研究設(shè)置的不同界值或cut-off值引起[19]。本研究納入的所有文獻(xiàn)中用于檢測lncRNA的cut-off值均不相同,且有些研究未提及cut-off值的設(shè)定,故本研究未設(shè)置亞組分析評估不同cut-off值設(shè)置對合并統(tǒng)計量的影響,因此可能導(dǎo)致整體合并效應(yīng)的異質(zhì)性增大。本研究通過Meta回歸進(jìn)一步對研究質(zhì)量、標(biāo)本類型、參考基因、cut-off值設(shè)定、病例數(shù)和對照組數(shù)等因素進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)不同的cut-off值設(shè)定是研究異質(zhì)性的來源之一(P=0.0466),從而進(jìn)一步佐證了Spearman相關(guān)系數(shù)分析的結(jié)果。另外,納入的對照組例數(shù)不均一也是研究異質(zhì)性的來源之一。盡管如此,Cochran’Q和I2檢驗顯示本研究整體合并的效應(yīng)量及亞組分析中不存在由非閾值引起的異質(zhì)性,同時敏感性分析未檢測到離群研究,提示研究間結(jié)果的同質(zhì)性較好,研究結(jié)論整體相對穩(wěn)定、可靠。

本研究證實,lncRNA的表達(dá)檢測對BC的診斷有很高的應(yīng)用價值,可作為BC臨床診斷的輔助指標(biāo)。然而,本研究存在納入樣本例數(shù)較少及研究的異質(zhì)性大等諸多缺陷,在一定程度上降低了研究結(jié)論的可靠性。后期有必要對單項lncRNA在BC中的應(yīng)用作深入探討。

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