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水稻HD-ZipⅢ家族成員OsHox10的功能分析

2018-10-24 02:26:46靳亞軍孔曉聰邳瑞雪石雨鷺欒維江
關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)基因家族激素

楊 波 ,羅 倩 ,靳亞軍 ,熊 煒 ,孔曉聰 ,王 荃 ,邳瑞雪 ,石雨鷺 ,欒維江

(1.天津師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,天津300387;2.天津師范大學(xué)天津市動(dòng)植物抗性重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津300387)

亮氨酸拉鏈蛋白(Homeodomain-leucine zipper protein,HD-Zip)是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,保守性較高,通常含有1個(gè)同源異型域(Homeodomain,HD),屬于同源異型域轉(zhuǎn)錄因子超家族.HD-Zip的異型域由60或61個(gè)保守氨基酸殘基組成,在空間上形成1個(gè)三股螺旋結(jié)構(gòu),并被1個(gè)環(huán)和1個(gè)轉(zhuǎn)角分開(kāi).三股螺旋結(jié)構(gòu)與特異DNA分子的雙螺旋大溝相結(jié)合,擔(dān)任該轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合域,調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程[1-2].根據(jù)結(jié)構(gòu)域的保守性、空間結(jié)構(gòu)的差異性、與DNA結(jié)合的特異性和生物學(xué)功能,可以將眾多的HD-Zip蛋白分為4個(gè)亞家族,即HD-ZipⅠ、HD-ZipⅡ、HD-ZipⅢ和HD-ZipⅣ[3].

HD-Zip家族基因的表達(dá)常受低溫、激素、光照、逆境等因素的誘導(dǎo),主要參與光信號(hào)和激素信號(hào)的介導(dǎo)途徑,對(duì)植物胚胎形態(tài)發(fā)生、分生組織形成、側(cè)生器官發(fā)生和維管系統(tǒng)發(fā)育等多個(gè)過(guò)程都起到重要調(diào)控作用[4].HD-ZipⅢ家族主要參與調(diào)控植物胚胎形態(tài)發(fā)生、分生組織形成等過(guò)程.如擬南芥的基因組中含有5個(gè)HD-ZipⅢ基因,分別為PHB、PHV、REV、ATHB8及ATHB15.其中PHB、PHV和REV在功能上存在冗余,它們?cè)趥?cè)生分生組織以及花器官的分化過(guò)程中發(fā)揮重要作用,同時(shí)還影響葉片的極性,當(dāng)REV的功能缺失時(shí),植物形成畸形的葉和花器官,當(dāng)PHB和PHV過(guò)量表達(dá)時(shí),植物的葉片沿近軸面生長(zhǎng),最終也形成畸形葉;而ATHB8和ATHB15在功能上與PHB、PHV、和REV拮抗,能夠抑制rev、phv雙突變體植株在生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的缺陷[5].在陸生植物中HD-ZipⅢ家族成員是高度保守的,但是由于進(jìn)化,在不同的物種中,彼此同源的成員在功能上也已經(jīng)有所分化[6].

單子葉植物水稻(Oryza sativa)的HD-ZipⅢ亞家族中也存在 5個(gè)基因,分別為 OsHox9、OsHox10、OsHox29、OsHox32、OsHox33,目前對(duì)該家族的研究已取得一定進(jìn)展.Ai等[7]發(fā)現(xiàn)OsHox9的RNAi干擾植株表現(xiàn)出株高變矮、分蘗數(shù)減少的表型.Li等[8]研究發(fā)現(xiàn)過(guò)量表達(dá)OsHox32會(huì)使植株產(chǎn)生向近軸面卷曲的窄葉,此外由于葉夾角減小導(dǎo)致株型直立,株高變矮.Itoh等[9]發(fā)現(xiàn)異位表達(dá)microRNA166-resistance的OsHB3(即OsHox33),植株表現(xiàn)出嚴(yán)重的缺陷,包括產(chǎn)生異位的葉緣、芽和輻射狀的葉片.Luan等[10]研究發(fā)現(xiàn)干擾OsHox33的表達(dá)能夠加速水稻葉片衰老.本研究采用反向遺傳學(xué)方法初步探索了水稻HD-ZipⅢ亞家族成員OsHox10的功能,明確了該基因的表達(dá)模式和亞細(xì)胞定位,并初步了解該成員與植物激素和干旱脅迫的關(guān)系.

1 材料與方法

1.1 材料

本研究以粳稻品種中花11(Oryza sativa L.ssp.japonica cv.Zhonghua 11)及其轉(zhuǎn)基因植株為實(shí)驗(yàn)材料.所有材料種植于天津市農(nóng)業(yè)科學(xué)院試驗(yàn)田和海南陵水南繁育種基地,田間保持常規(guī)管理.

1.2 儀器與試劑

1.2.1 儀器

Veriti 9902 PCR儀、7500實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng),美國(guó)ABI公司;凝膠成像分析儀,北京Bio-Rad公司;BG-Power 600電泳儀,美國(guó)Baygene公司;DM5000B正置熒光顯微鏡,德國(guó)Leica公司.

1.2.2 試劑

PCR試劑、Real-time PCR試劑、反轉(zhuǎn)錄試劑盒、T4連接酶等,南京諾唯贊生物科技有限公司;限制性內(nèi)切酶、DNA Marker,日本Takara公司;DNA凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒小提試劑盒,北京康為世紀(jì)生物有限公司;引物合成及DNA測(cè)序由武漢金開(kāi)瑞生物科技有限公司完成.

1.3 過(guò)表達(dá)載體構(gòu)建和水稻遺傳轉(zhuǎn)化

從生長(zhǎng)30d的水稻幼苗中提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄后,以cDNA為模板擴(kuò)增OsHox10的全長(zhǎng)ORF,所用引物為:OsHox10-F(5′-TACggtaccATTTGGCTTTGGCGAGGTAG-3′)和 OsHox10-R(5′-TACgagctcTGGGATGGTCACACAAAGGA-3′)(小寫(xiě)字母為載體中相應(yīng)的酶切位點(diǎn)).將擴(kuò)增的片段酶切回收后,連入pUBI1460空載體中,獲得重組載體pUBI1460-OsHox10,通過(guò)酶切鑒定及測(cè)序確認(rèn)無(wú)誤后轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌中,用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化法導(dǎo)入野生型中花11中,獲得過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株.

1.4 Real-time PCR分析

收集水稻新鮮的幼根、幼嫩葉片、莖頂端分生組織、成熟葉鞘及4~13 cm長(zhǎng)的幼穗,用Trizol試劑提取這些組織器官的總RNA.用DNase I去除基因組DNA污染后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA作為Realtime PCR反應(yīng)的模板,OsHox10表達(dá)檢測(cè)所用的引物為 OsHox10-F2(5′-AACTTCCCTTGTCGCCTTAC-3′)和OsHox10-R2(5′-GTGAACATTGCTATCCTCGG-3′),以O(shè)sActin1作為內(nèi)參進(jìn)行相對(duì)定量,引物為ActinF(5′-GACTCTGGTGATGGTGTCAGC-3′)和 ActinR(5′-GGCTGGAAGAGGACCTCAGG-3′).Real-time PCR 反應(yīng)按照 SYBR Green PCR master mix(Vazyme,南京)試劑盒說(shuō)明操作,在ABI 7500型實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),并用2-ΔΔCt方法進(jìn)行相對(duì)定量分析,每個(gè)反應(yīng)重復(fù)3次.

1.5 OsHox10的亞細(xì)胞定位

從生長(zhǎng)30 d的水稻幼苗中提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄后,以cDNA為模板擴(kuò)增OsHox10的全長(zhǎng)ORF(去除終止密碼子).所用引物為GFP-Hox10-F(5′-TCA-gagctcATTTGGCTTTGGCGAGGTAG-3′)和 GFP-Hox10-R(5′-TACgtcgacCACAAAGGACCAGTTGACGA-3′).將擴(kuò)增得到的目的片段經(jīng)酶切回收后與空載體pCAMBIA35S::GFP進(jìn)行連接,使OsHox10與GFP融合.測(cè)序鑒定正確后,分別將含有融合載體pCAMBIA35S::OsHox10-GFP和空載體的農(nóng)桿菌注射進(jìn)煙草(Nicotiana tabacum)葉片,室溫下正常培養(yǎng)2 d后,在正置熒光顯微鏡下觀察熒光表達(dá)情況.

1.6 植物激素及干旱脅迫處理

激素處理中,分別用0.1 mmol/L的乙烯合成前體1-氨基環(huán)丙烷羧酸(ACC)、脫落酸(ABA)及茉莉酸(JA)處理生長(zhǎng)40 d的野生型水稻幼苗,然后在預(yù)定的時(shí)間點(diǎn)收集葉片,提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行Realtime PCR分析.干旱脅迫處理中,水稻幼苗生長(zhǎng)于土培周轉(zhuǎn)箱中,排水后不再澆水,在處理0、2、3、4、5、7 d后分別取樣,提取葉片總RNA,反轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行Real-time PCR分析.

2 結(jié)果與分析

2.1 HD-ZipⅢ家族成員序列分析

分析植物HD-ZipⅢ家族成員的序列,結(jié)果如圖1所示.

HD-Zip家族成員都含有同源異型結(jié)構(gòu)域HD和亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)域 LZ(Leucine-zipper domain)[7],HD區(qū)域是由60或61個(gè)保守氨基酸構(gòu)成的,在空間上形成三股螺旋結(jié)構(gòu),能夠識(shí)別靶基因啟動(dòng)子5′上游區(qū)的特定核苷酸序列,LZ區(qū)位于HD區(qū)的羧基端,是1個(gè)一側(cè)富含疏水氨基酸的雙ɑ螺旋,在該區(qū)域中每隔7個(gè)氨基酸就分布著1個(gè)亮氨酸殘基,在ɑ螺旋的疏水表面排成一條直線.HD-ZipⅢ家族的成員除了含有HD及LZ保守結(jié)構(gòu)域外,還包含2個(gè)附加結(jié)構(gòu)域(START和 MEKHLA)(圖1a).START是類固醇敏感的脂質(zhì)調(diào)節(jié)蛋白結(jié)構(gòu)域,MEKHLA可能與植物接收光信號(hào)調(diào)控有關(guān)[8].

為了比較不同植物HD-ZipⅢ家族成員間的差異,從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)檢索了6種不同植物的HD-ZipⅢ家族蛋白質(zhì)序列信息.小立碗蘚(Physcomitrella patens):PpHB11(ABG73236)、PpHB12(ABG73237)、PpHB13(ABG73238)、PpHB14(ABG73239);白云杉(Piceaglauca):PgHB3(ADV04322)、PgHB4(ADV04323)、PgHB5(ADV04324)、PgHB6(ADV04325);擬 南 芥(Arabidopsis thaliana):REV(AED97367)、PHV(O04292)、PHB(AEC09012)、 AtHB15(AEE32762)、AtHB8(AEE86138);水稻(Oryza sativa):OsHox10(A2XBL9)、OsHox9(A2Z8L4)、OsHox32(A2XK30)、OsHox33(A2ZMN9);毛果楊(Populus trichocarpa):PtrHB1(AAX19050)、PtrHB2(AAX19051)、PtrHB3(AAX19052)、PtrHB4(AAX19053)、PtrHB5(AAX19054)、PtrHB6(AAX19055)、PtrHB7(AAX19056)、PtrHB8(AAX19057);玉米(Zea mays):rld1(NP_001296150)、rld2(XP_0086 65074).聚類分析發(fā)現(xiàn),在系統(tǒng)發(fā)育中,OsHox9和OsHox10在結(jié)構(gòu)上更相似,而OsHox32和OsHox33相似(圖1b、1c),因此它們?cè)诠δ苌峡赡苡腥哂?在植物演化上,OsHox9和OsHox10與玉米的rld1和rld2關(guān)系更近,OsHox32和OsHox33則與擬南芥的PHB和PHV關(guān)系更近.它們和毛果楊及小立碗蘚關(guān)系較遠(yuǎn),小立碗蘚中的HD-ZipⅢ成員自成一類.表明HD-ZipⅢ成員在植物進(jìn)化過(guò)程中已有了一定的分化.

2.2 OsHox10的表達(dá)特異性分析

為了研究OsHox10在水稻不同組織中的表達(dá)情況,分別提取野生型水稻不同組織器官的總RNA,用Realtime-PCR的方法檢測(cè)OsHox10的表達(dá),結(jié)果如圖2所示.

圖2 OsHox10的組織特異性表達(dá)分析Fig.2 Tissue-specific expression analysis of OsHox10

由圖2可以看出,OsHox10在不同組織器官中均有表達(dá),在莖頂端分生組織(YM)和幼穗(P3、P2、P1)中表達(dá)量較高,在根、莖、葉及葉鞘中表達(dá)較低,表明OsHox10在分裂旺盛部位有較高表達(dá).

2.3 植物激素及干旱脅迫處理對(duì)OsHox10表達(dá)的影響

分別用ACC、ABA和JA處理同一時(shí)期的野生型水稻,取樣后,用Realtime-PCR分析OsHox10的表達(dá),結(jié)果如圖3所示.

圖3 激素和干旱脅迫對(duì)OsHox10表達(dá)的影響Fig.3 Expression of OsHox10 under the treatment of phytohormones and drought stress

由圖3可以看出,3種激素處理后,OsHox10的表達(dá)量較野生型相比都有所升高.ACC處理2 h后,OsHox10的表達(dá)量達(dá)到峰值,之后又下降;JA處理12h后,OsHox10的表達(dá)量是對(duì)照的3倍;ABA處理4 h后,OsHox10的表達(dá)量達(dá)到峰值.另外,分析干旱脅迫處理下OsHox10的表達(dá),結(jié)果表明處理的前3 d對(duì)OsHox10的表達(dá)沒(méi)有明顯影響,處理4 d之后,表達(dá)量明顯上升,表明干旱脅迫誘導(dǎo)了OsHox10的表達(dá)(圖3d).因此,推測(cè)OsHox10可能與外界不良環(huán)境刺激及激素信號(hào)有關(guān).

2.4 OsHox10的亞細(xì)胞定位

為了進(jìn)一步明確OsHox10的表達(dá)模式,構(gòu)建目的基因與GFP蛋白融合的表達(dá)載體(p35S::OsHox10-GFP),對(duì)目的基因進(jìn)行亞細(xì)胞定位,以確定OsHox10轉(zhuǎn)錄因子在細(xì)胞中存在或發(fā)揮作用的位置.分別將含有目的基因的融合表達(dá)載體和空質(zhì)粒載體在煙草中進(jìn)行瞬時(shí)表達(dá),結(jié)果如圖4所示.

圖4 OsHox10的亞細(xì)胞定位Fig.4 Subcellular localization of OsHox10

由圖4可以看出,OsHox10-GFP融合蛋白在細(xì)胞周邊有強(qiáng)烈表達(dá).在成熟的植物表皮細(xì)胞中,由于液泡的存在,細(xì)胞質(zhì)主要存在于細(xì)胞周邊,因此OsHox10可能定位于細(xì)胞質(zhì)中或細(xì)胞質(zhì)膜上.空載體對(duì)照中,整個(gè)細(xì)胞中(如細(xì)胞膜、細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì))都能檢測(cè)到強(qiáng)烈的熒光,沒(méi)有特異性定位.

2.5 OsHox10過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株表型分析

為了揭示OsHox10在水稻生長(zhǎng)發(fā)育中的功能,構(gòu)建了1個(gè)OsHox10的過(guò)表達(dá)載體,并通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化法,將過(guò)表達(dá)載體導(dǎo)入野生型水稻的愈傷組織中,再經(jīng)過(guò)分化獲得轉(zhuǎn)基因幼苗,最終獲得了7個(gè)獨(dú)立株系的T0代過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株,共計(jì)73株.用載體中特異的NPTII基因引物對(duì)T0代植株的基因組DNA進(jìn)行PCR檢測(cè),結(jié)果如圖5(a)所示.過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株中有51株(5個(gè)株系)為轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性,陽(yáng)性率約為70%.種植3個(gè)T0代轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性獨(dú)立株系及對(duì)照,獲得T1代植株,Real-time PCR分析表明轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性株系中OsHox10明顯過(guò)量表達(dá),如圖5(d)所示.觀察田間表型發(fā)現(xiàn),每個(gè)株系的過(guò)表達(dá)植株葉片表現(xiàn)出不同程度的皺縮、卷曲,尤其是靠近葉鞘部分卷曲明顯呈鋸齒狀,如圖5(b)和5(c)所示,表明過(guò)量表達(dá)OsHox10會(huì)影響水稻葉片的發(fā)育及株型建成.

圖5 過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株的表型Fig.5 Phenotype of overexpressing transgenic plants

3 討論與結(jié)論

本研究通過(guò)反向遺傳學(xué)方法對(duì)水稻HD-ZipⅢ家族成員OsHox10的功能進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)過(guò)量表達(dá)OsHox10能使水稻葉片形態(tài)異常,表明其對(duì)水稻株型建成具有重要作用.在擬南芥中,HD-ZipⅢ家族基因PHB、PHV和REV在功能上存在冗余,影響葉片極性,當(dāng)REV的功能缺失時(shí),植物形成畸形葉,當(dāng)PHB和PHV過(guò)量表達(dá)時(shí),植物的葉片沿近軸面生長(zhǎng),最終也形成畸形葉[5].在水稻中,Itoh等[9]發(fā)現(xiàn)過(guò)量表達(dá)HD-ZipⅢ家族基因 OsHB3、OsHB5(OsHox33)、OsHox29 會(huì)導(dǎo)致葉片畸形,形成卷葉或絲狀葉;Li等[8]在對(duì)OsHox32的研究中也發(fā)現(xiàn)過(guò)量表達(dá)該基因會(huì)導(dǎo)致形成狹窄卷曲的畸形葉.這些研究與過(guò)量表達(dá)OsHox10的結(jié)果相互印證,表明水稻HD-ZipⅢ家族基因功能相對(duì)保守但又不盡相同.此外,組織特異性分析顯示,OsHox10在分裂旺盛的部位表達(dá)量較高,表明其可能與器官發(fā)生分化有關(guān),這與HD-ZipⅢ家族參與分生組織形成、側(cè)生器官發(fā)生等多個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程的情況相吻合.

擬南芥HD-ZipⅢ的一個(gè)成員AtHB8的轉(zhuǎn)錄受生長(zhǎng)素的誘導(dǎo)[11].Itoh等[9]發(fā)現(xiàn),給水稻施加外源生長(zhǎng)素能導(dǎo)致HD-ZipⅢ家族基因的表達(dá)量上升.此外,有研究[3]發(fā)現(xiàn),干旱脅迫和外源施加脫落酸(ABA)也能誘導(dǎo)擬南芥HD-Zip家族基因ATHB6、ATHB7和ATHB12的表達(dá).本研究結(jié)果表明植物激素及干旱脅迫能誘導(dǎo)OsHox10的表達(dá),說(shuō)明OsHox10可能與逆境脅迫和激素相關(guān).

細(xì)胞核內(nèi)蛋白質(zhì)的N端有特殊的核定位信號(hào)(Nuclear localization signal,NLS),能夠指導(dǎo)蛋白質(zhì)進(jìn)入細(xì)胞核,一般NLS是由8~10個(gè)富含精氨酸、賴氨酸及脯氨酸等帶正電荷的氨基酸殘基組成,以短肽的形式存在于N端,大多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子具有NLS,定位于細(xì)胞核中,但不是所有的轉(zhuǎn)錄因子都如此[12].在小麥NAC類轉(zhuǎn)錄因子家族中,TaNTL1與GFP融合蛋白就定位在細(xì)胞膜上,當(dāng)TaNTL1的跨膜域缺失后會(huì)特異地定位在細(xì)胞核中,因此TaNTL1是作為跨膜轉(zhuǎn)錄因子行使功能的,此外還發(fā)現(xiàn)TaNTL2和TaNTL3也是跨膜轉(zhuǎn)錄因子[13].本研究結(jié)果表明,OsHox10定位于細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞膜上,分析其N端可能是核定位信號(hào)的氨基酸序列,但N端NLS的特點(diǎn)不明顯,結(jié)合定位結(jié)果,推測(cè)它可能是具有細(xì)胞質(zhì)特性的轉(zhuǎn)錄因子.OsHox10的精確功能還有待進(jìn)行更深入細(xì)致的研究.

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