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馬鈴薯的細(xì)胞質(zhì)遺傳多樣性初步檢測研究

2018-11-07 06:46:34黃強鄭敏劉小龍歐陽滿黃磊
生物化工 2018年5期
關(guān)鍵詞:細(xì)胞質(zhì)瓊脂糖條帶

黃強,鄭敏,劉小龍,歐陽滿,黃磊

(江西醫(yī)學(xué)高等專科學(xué)校,江西上饒 334000)

馬鈴薯cpDNA和mtDNA是核外遺傳系統(tǒng)的主要組成部分[1-2],與核基因組(nDNA)一起共同控制諸多農(nóng)藝性狀及生理特征[3],線粒體DNA也編碼一些重要的生物性狀,諸如植物細(xì)胞質(zhì)雄性不育等。相對nDNA而言,馬鈴薯cpDNA和mtDNA結(jié)構(gòu)簡單、進(jìn)化保守,cpDNA呈絕對的單親母系遺傳,mtDNA大多為單親母系遺傳[4]。因此,cpDNA和mtDNA的多態(tài)性是揭示馬鈴薯細(xì)胞質(zhì)遺傳背景,追溯母系祖先,研究馬鈴薯起源與演化的分子基礎(chǔ)[5]。

研究表明,馬鈴薯具有5種類型的cpDNA(T、W、A、C、S)和6種類型的mtDNA(α、β、γ、δ、ε和D),常用cpDNA/mtDNA的不同組合形式(如T/β、W/α、W/γ、A/ε等)和D型mtDNA表示不同的細(xì)胞質(zhì)遺傳背景[6]。T/β是普通栽培種(S.tuberosum L. ssp. tuberosum, 2n=4x=48)細(xì)胞質(zhì)的代表類型[9];D為墨西哥六倍體野生種(S. demissum)細(xì)胞質(zhì)類型[7];W/α、W/γ在野生種(Wild species)普遍存在,常用來表示野生種(除S. demissum外)細(xì)胞質(zhì)的代表類型;同樣,A/ε常用來表示安第斯栽培類群(Andigenum Group)的細(xì)胞質(zhì)類型。mtDNA雖不像cpDNA能反應(yīng)馬鈴薯種間親緣關(guān)系,但在體細(xì)胞融合再生植株中易發(fā)生重排或重組,常常導(dǎo)致再生植株擁有與親本不同的性狀[8]。因此,mtDNA多態(tài)性對子代的篩選有重大應(yīng)用價值[9]。

1 試驗材料

1.1 植物材料

所用的馬鈴薯品種均取自于云南師范大學(xué)薯類作物研究所保存的二倍體自交系群體。

1.2 主要試劑及儀器

試劑:新型植物基因組提取試劑盒(天根生化科技有限公司),Taq PCR Mastermix(天根生化科技有限公司),引物T、Alm4/5、D。

儀器:DY-600型電泳儀、My CyclerTM Thermal Cycler型PCR儀;XXPCR儀;BIO-PRO 200E型凝膠成像系統(tǒng):WFZ UV-2800AH型紫外分光光度儀。

2 實驗方法

2.1 植物DNA的提取

鮮葉片100 mg,參照說明書用新型植物基因組提取試劑盒提取總DNA。

2.2 幾種引物的PCR擴增

2.2.1 引物

試驗中利用的引物有T(葉綠體標(biāo)記)、alm(線粒體標(biāo)記)、D(線粒體標(biāo)記)序列信息見表1。

2.2.2 PCR反應(yīng)體系及擴增條件

引物alm擴增反應(yīng)體系(25 μL):

引物D擴增反應(yīng)體系(20 μL):

引物T擴增反應(yīng)體系(20 μL):

各引物PCR反應(yīng)條件的設(shè)置見表2。

2.2.3 瓊脂糖凝膠電泳

準(zhǔn)確稱取瓊脂糖,制備1%瓊脂糖凝膠。

3 結(jié)果與分析

3.1 提取DNA的電泳結(jié)果

加2μL提取物于0.8%的瓊脂糖凝膠上電泳,提取的DNA電泳條帶清晰,無拖尾、彌散,滿足試驗要求,結(jié)果如圖1所示。

圖1 提取DNA電泳結(jié)果

表1 引物序列信息

表2 PCR反應(yīng)體條件

3.2 基因PCR檢測結(jié)果

分子標(biāo)記檢測結(jié)果如表3所示。在引物alm4/5的體系中,有 5、14、16、18、20、21、23、57、67和72的樣品中未見擴增產(chǎn)物,其他樣品中均有擴增產(chǎn)物。在引物T1/2的體系中,所有樣品中均有擴增產(chǎn)物。在引物D的體系中均未見擴增產(chǎn)物。

4 小結(jié)

本實驗通過對葉綠體和線粒體DNA的多態(tài)性分析,揭示了來自c品系的96份馬鈴薯的細(xì)胞質(zhì)遺傳多樣性,初步分析相同品系間的細(xì)胞質(zhì)遺傳共性和差異。結(jié)果表明,該品均說明擴增出T型條帶,96份材料均和普通栽培種有親緣關(guān)系,86份材料中擴增出A型條帶,所占比例為89.6%,說明大部分材料和安第斯栽培種存在著親緣關(guān)系;檢測的D型條帶在96份材料中均無擴增條帶的出現(xiàn),說明該系列的品種和野生品種無親緣關(guān)系。

表3 分子標(biāo)記檢測結(jié)果

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