胡英考
(首都師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 北京 100048)
生物的遺傳信息都貯存在各自的基因組中,而組成基因組的堿基只有4種: ATGC(RNA中U替代了T),即4種堿基的不同排列組合形成了不同的基因和基因組。遺傳密碼共有64個(gè)密碼子,其中還包括終止密碼子和簡并密碼子,所以,實(shí)際編碼20種氨基酸的密碼子不到64種。在漫長的生物進(jìn)化過程中,這4種堿基的排列組合有變化,但沒有更多堿基的參與,自然界的生物均是如此,概莫能外。
僅憑4種堿基、64個(gè)密碼子、20種氨基酸就能形成地球上那么多形形色色的生命,如果再增加一個(gè)堿基對(duì),則可以有6×6×6=216個(gè)密碼子,扣除原有的64個(gè)密碼子,理論上還有152種可以編碼氨基酸的新的密碼子,編碼的氨基酸總數(shù)可以達(dá)到172種,這樣形成的生命形式會(huì)有無限種可能。
早在20世紀(jì)70年代,一些學(xué)者就嘗試著挑戰(zhàn)自然,擴(kuò)展遺傳密碼,但一直沒有成功。直到1990年,瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的化學(xué)家Steven Benner領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì),才初步證明這一想法是可行的。他們將胞嘧啶和鳥嘌呤堿基進(jìn)行人工改造,首次合成出包含人工改造后的非天然堿基的DNA分子,同時(shí)這些新的DNA分子還能在試管中自我復(fù)制,并制造RNA和蛋白質(zhì)[1]。不過,當(dāng)時(shí)人工制造的這些DNA分子僅在試管中有活性,在活細(xì)胞內(nèi)就失活了。
要想在活細(xì)胞中發(fā)揮作用,外源堿基對(duì)要與自然堿基對(duì)一樣能夠進(jìn)行配對(duì),這樣就不會(huì)破壞DNA的形態(tài)和基本的功能,使DNA可以被忠實(shí)地復(fù)制和轉(zhuǎn)錄。2014年,來自美國加州的Floyd Romesberg實(shí)驗(yàn)室報(bào)告了一項(xiàng)突破性的進(jìn)展,他們成功地將人工合成的人造堿基對(duì)植入了大腸桿菌的基因組,且能夠在大腸桿菌中自我復(fù)制和轉(zhuǎn)錄。但最初這些人工合成的堿基會(huì)嚴(yán)重阻礙大腸桿菌的生長,而且隨著時(shí)間的推移,這些外源的堿基會(huì)丟失;另外,這種新的堿基尚不能指導(dǎo)蛋白的合成[2]。此后,Romesberg實(shí)驗(yàn)室對(duì)這一對(duì)堿基進(jìn)行了系統(tǒng)的修飾,并成功地合成出了不會(huì)被大腸桿菌排斥的人造堿基,能夠長期穩(wěn)定存在于大腸桿菌體內(nèi)。但它們?nèi)耘f不能指導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成,因?yàn)榧?xì)胞中沒有能夠識(shí)別新堿基的tRNA,也沒有能與人造堿基相對(duì)應(yīng)的氨基酸的參與。
為解決不能合成蛋白質(zhì)的問題,Romesberg實(shí)驗(yàn)室創(chuàng)造了一種改良過的、能識(shí)別人造堿基的tRNA以及相應(yīng)的氨基酸,該tRNA能夠?qū)⑷斯ず铣傻陌被徇\(yùn)輸?shù)胶颂求w中,這些氨基酸被整合進(jìn)了大腸桿菌所表達(dá)的蛋白質(zhì)中。同時(shí),研究人員還運(yùn)用多種檢測技術(shù)證明了,這種蛋白質(zhì)中的確存在人工合成的氨基酸。最近,該研究團(tuán)隊(duì)首次用實(shí)驗(yàn)室合成的、自然界中不存在的X-Y堿基對(duì)和相應(yīng)的氨基酸,成功地在實(shí)驗(yàn)室創(chuàng)造了包含ATGCXY 6種堿基的全新生命體[3]。目前已成功地將人工合成的堿基對(duì)插入到對(duì)抗生素耐藥細(xì)菌基因的關(guān)鍵位點(diǎn)上,使表達(dá)這種堿基的細(xì)菌對(duì)于青霉素類抗生素異常敏感。
該研究表明,人工合成的堿基對(duì)也能完成信息的儲(chǔ)存和提取,意味著人類成功地?cái)U(kuò)展了遺傳密碼。在可預(yù)見的未來,將會(huì)有更多的人工堿基對(duì)添加到遺傳密碼表中;一些非天然的氨基酸將通過人造密碼加入到蛋白質(zhì)中,用來設(shè)計(jì)更容易被細(xì)胞吸收的,或者毒性更低、分解更快的藥物,應(yīng)用前景十分廣闊。