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新疆塔城牧區(qū)原料乳中酵母菌的分離鑒定

2019-01-03 09:04:20蘆文娟李寶坤盧士玲李開雄王曉雯杜紫萱
關(guān)鍵詞:乳制品酵母菌酵母

蘆文娟, 李寶坤, 盧士玲, 李開雄, 王曉雯, 杜紫萱

(石河子大學(xué) 食品學(xué)院,新疆 石河子832000)

原料乳營(yíng)養(yǎng)豐富,適宜人類食用,但其較高的水分含量和接近中性的pH值也非常適合細(xì)菌、酵母菌、霉菌等各種微生物的生長(zhǎng)和繁殖[1]。這些菌群有的可以使乳及乳制品產(chǎn)生理想風(fēng)味,有的則會(huì)引起乳及乳制品的腐敗變質(zhì),甚至使人類產(chǎn)生疾病[2]。其中當(dāng)屬乳源酵母菌最為典型。

原料乳中的酵母菌是乳制品中酵母菌的主要來(lái)源之一,很多乳制品均以原料乳為原料加工而成,其中的酵母菌賦予了產(chǎn)品特殊風(fēng)味和提高了產(chǎn)品的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值[3]。20世紀(jì)初,研究學(xué)者認(rèn)為酵母菌僅作為一種腐敗菌存在于原料乳中,使乳制品品質(zhì)下降如出現(xiàn)產(chǎn)氣、酵母味或其他異味、變色和引起質(zhì)構(gòu)變化等[4-6],故對(duì)原料乳中的酵母菌研究較少。近年來(lái),全球乳業(yè)迅速發(fā)展,科研人員把重點(diǎn)集中在酵母菌在乳制品中的有益作用方面,不斷發(fā)現(xiàn)酵母菌作為附屬發(fā)酵劑對(duì)乳制品風(fēng)味的影響、抑制有害菌及對(duì)人體的益生作用[7-8],如:預(yù)防和治療急性痢疾、降低膽固醇、抗輻射和抗氧化等[9]。因此,從原料乳中篩選出有益酵母菌,并應(yīng)用于乳制品中具有重要意義。

然而各種自然環(huán)境的差異使得微生物資源存在差異,作者將首次對(duì)塔城周邊游牧地區(qū)原料乳中的酵母菌進(jìn)行研究,運(yùn)用傳統(tǒng)培養(yǎng)方法分離篩選酵母菌,并進(jìn)行生理生化鑒定和5.8S rDNA-ITS分子生物學(xué)鑒定,對(duì)原料乳中酵母菌的分布和種類的多樣性進(jìn)行分析,為后人研究本地區(qū)原料乳中微生物菌群提供基礎(chǔ)資料,并對(duì)后續(xù)篩選具有潛在益生功能的酵母菌株奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)材料

1.1.1 樣品來(lái)源 新疆塔城地區(qū)原料乳:采自新疆塔城喀拉也木勒、烏宗布拉克、二道橋牧場(chǎng)等地。

1.1.2 培養(yǎng)基 菌種的分離使用馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA),純化和保存使用酵母膏胨葡萄糖瓊脂(YEPD)平板和斜面培養(yǎng)基。

鑒定使用Gorodkowa瓊脂培養(yǎng)基、氮源基礎(chǔ)培養(yǎng)基、碳源基礎(chǔ)培養(yǎng)基、糖發(fā)酵基礎(chǔ)培養(yǎng)基、產(chǎn)酸基礎(chǔ)培養(yǎng)基、產(chǎn)酯培養(yǎng)基、產(chǎn)類淀粉培養(yǎng)基。

1.1.3 主要試劑和儀器 酵母菌基因組DNA提取試劑盒(離心柱型),2xTaq PCR MasterMix:均由天根生化科技有限公司提供;GoldView核酸染色劑;引物ITS1和ITS4:由上海生工生物技術(shù)有限公司合成。

主要儀器:超凈工作臺(tái)、電熱恒溫培養(yǎng)箱(DNP-9272)、高速冷凍離心機(jī)(5417R)、立式電熱壓力蒸汽滅菌鍋 (LD2X-30KA)、普通光學(xué)顯微鏡(OLYMPUS COVER-015)、PCR 擴(kuò)增儀(TC-512)。

1.2 實(shí)驗(yàn)方法

1.2.1 酵母菌的分離與純化 取1 g樣品,溶于9 mL無(wú)菌水中,充分振蕩使其混勻后置于25℃培養(yǎng)箱,培養(yǎng)1 h后吸取1 mL接種于酵母浸出粉胨葡萄糖培養(yǎng)基(YPD)中進(jìn)行活化,25℃培養(yǎng)36 h?;罨缶瓴扇∠♂尫ㄍ坑赑DA培養(yǎng)基進(jìn)行分離,平板置于25℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng),觀察并記錄菌落特征并挑取不同形態(tài)單菌落,進(jìn)行簡(jiǎn)單染色,觀察細(xì)胞形態(tài),將類似酵母菌菌株接種于PDA培養(yǎng)基中培養(yǎng),重復(fù)幾次純化酵母菌,直至鏡檢結(jié)果為同一細(xì)胞形態(tài)后,將其接種于YEPD斜面培養(yǎng)基上,25℃培養(yǎng)36 h后,4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.2 酵母菌的形態(tài)結(jié)構(gòu)觀察 將上述純培養(yǎng)菌株接種于PDA培養(yǎng)基,25℃培養(yǎng)36 h后,挑選單個(gè)菌落觀察其形狀、色澤、光滑度、透明度、邊緣整齊度和隆起程度等特征;并選擇具有代表性的菌株,置于顯微鏡下觀察其菌體形態(tài)。

1.2.3 酵母菌的理化性質(zhì)鑒定 酵母菌分離株的生理生化特征主要是對(duì)其繁殖方式、子囊孢子、擲孢子、菌絲等進(jìn)行觀察、并通過(guò)糖發(fā)酵實(shí)驗(yàn)、碳源同化實(shí)驗(yàn)、氮源同化實(shí)驗(yàn)、類淀粉化合物生成實(shí)驗(yàn)、產(chǎn)酯實(shí)驗(yàn)、產(chǎn)酸實(shí)驗(yàn)等生理生化實(shí)驗(yàn)進(jìn)行鑒定[10-11]。

1.2.4 酵母菌的5.8S rDNA分析

1)酵母菌基因組DNA的提?。簩⑸鲜黾兓慕湍妇臃N于YPD液體培養(yǎng)基中25℃培養(yǎng)36 h,取1 mL活化菌懸液,按照酵母菌基因組DNA提取試劑盒(離心柱型)說(shuō)明書上方法進(jìn)行操作,將所提取的DNA于-20℃保存。

2)PCR 擴(kuò)增(5.8S rDNA-ITS 片段擴(kuò)增):將上述制備的基因組DNA作為PCR擴(kuò)增的模板,使用引物 ITS 1(5’-TCCGTAGGTGAACCTGCG G-3’)和ITS 4 (5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’)[12]對(duì)5.8S-ITS區(qū)域酵母菌DNA進(jìn)行擴(kuò)增;采用50 μL反應(yīng)體系:DNA 模板 2 μL,ITS 1(10 μmol/L) 2 μL,ITS 4 (10 μmol/L)2 μL,2xTaq PCR MasterMix 25 μL,加ddH2O 補(bǔ)至 50 μL。

PCR反應(yīng)循環(huán)條件:95℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,循環(huán)次數(shù)35次;72℃延伸10 min。

PCR產(chǎn)物經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠檢測(cè)。電泳后,用GoldView染色20 min,紫外燈下觀察,拍照。

3)擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序及系統(tǒng)發(fā)育分析:PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測(cè)合格后,送往上海生工生物工程技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序,測(cè)得的序列在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行同源序列搜索,從數(shù)據(jù)庫(kù)獲得相關(guān)種屬的5.8S rDNA基因序列,采用軟件Mega5.0中的Neighbor-Joining方法與標(biāo)準(zhǔn)菌株基因序列進(jìn)行比對(duì),進(jìn)行1 000次Bootstrap檢驗(yàn)后構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

2 結(jié)果與分析

2.1 酵母菌的分離結(jié)果

采用傳統(tǒng)分離培養(yǎng)的方法,從采集的7份原料乳樣品中,共得到33株酵母菌,結(jié)果見表1。

2.2 酵母菌的形態(tài)鑒定結(jié)果

酵母菌在經(jīng)YEPD培養(yǎng)基活化后,觀察菌落形態(tài)和在普通光學(xué)顯微鏡下觀察細(xì)胞形態(tài)。酵母菌菌落形態(tài)呈圓形或橢圓形,乳白色或淡黃色,表面光滑或干燥,邊緣整齊,表面凸起,呈現(xiàn)半透明狀或不透明。細(xì)胞形態(tài)為圓、橢圓、卵圓等,繁殖方式多為無(wú)性繁殖,且無(wú)菌絲或有假菌絲,細(xì)胞形態(tài)符合酵母菌特征。酵母菌的菌落形態(tài)結(jié)果見表2,細(xì)胞形態(tài)和繁殖方式見表3。

表1 采樣點(diǎn)及分離酵母菌株編號(hào)Table 1 Sample and Isolation of yeasts number

表2 酵母菌的菌落形態(tài)結(jié)果Table 2 Yeast colony morphology results

續(xù)表2

表3 酵母菌細(xì)胞形態(tài)和繁殖方式Table 3 Yeast cell morphology and reproductive modes

2.3 酵母菌的理化性質(zhì)鑒定結(jié)果

依據(jù)《酵母菌的特征與鑒定手冊(cè)》,對(duì)酵母菌進(jìn)行鑒定,結(jié)果發(fā)現(xiàn),大多數(shù)分離株均為芽殖,有些有假菌絲,在發(fā)酵實(shí)驗(yàn)中除葡萄糖發(fā)酵外不發(fā)酵其他被檢糖,在碳源同化實(shí)驗(yàn)中可同化乙醇和檸檬酸,氮源同化實(shí)驗(yàn)中不能同化硝酸鹽,屬于畢赤氏酵母屬;部分分離株如分離株5-3、5-4、6-5,葡萄糖發(fā)酵陽(yáng)性,硝酸鹽還原、類淀粉物質(zhì)的生成試驗(yàn)陰性,歸為梅奇酵母屬;還有部分菌株僅依據(jù)生理生化鑒定結(jié)果,無(wú)法對(duì)其種屬進(jìn)行判斷。酵母菌的理化性質(zhì)鑒定結(jié)果見表4,碳源、氮源同化鑒定結(jié)果見表5。

2.4 酵母菌的5.8S rDNA鑒定

2.4.1 酵母菌株5.8S rDNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR擴(kuò)增結(jié)果 對(duì)酵母菌菌株進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,在450~750 bp之間獲得特異性擴(kuò)增條帶,符合酵母菌5.8S rDNA區(qū)理論預(yù)期值,檢測(cè)結(jié)果見圖1。

表4 酵母菌的理化性質(zhì)鑒定結(jié)果Table 4 Physiological and biochemical properties of yeasts

表5 碳源、氮源同化鑒定結(jié)果Table 5 Carbon assimilation and nitrogen assimilation experiment results

續(xù)表5

圖1 酵母菌PCR產(chǎn)物電泳圖Fig.1 Agarose gel electrophoresis of PCR products from yeasts

2.4.2 基于5.8S rDNA基因序列的酵母菌株系統(tǒng)發(fā)育分析 酵母菌序列經(jīng)過(guò)在NCBI序列數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行序列搜索,比較分離出的酵母菌菌株與已知酵母菌菌株相應(yīng)序列的相似程度,總結(jié)33株分離酵母菌的分子生物學(xué)鑒定結(jié)果見表6。

表6 33株酵母菌的ITS序列鑒定結(jié)果Table 6 ITS sequence of 33 strains yeast identification results

從中挑選出生長(zhǎng)較為旺盛、生理生化特征典型、具有代表性的17個(gè)分離株的序列與標(biāo)準(zhǔn)菌株序列做系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,基于ITS區(qū)序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹,見圖2。

由圖2可知,分離株1-4與標(biāo)準(zhǔn)菌株的同源性為93%,根據(jù)酵母菌種類的劃分依據(jù),同源性低于98%的,不能歸為同一個(gè)種[13],因此對(duì)于菌株1-4的種類有待進(jìn)一步驗(yàn)證。其余所有分離菌株與之對(duì)應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)菌株的同源性均在98%及以上,并與之聚在一起,表明其具有較近的親緣性。

圖2 系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree

3 結(jié) 語(yǔ)

作者對(duì)新疆塔城地區(qū)原料乳中的酵母菌進(jìn)行分離鑒定,從采集的7份樣品中,經(jīng)過(guò)菌種的分離純化,共得到33株酵母菌,通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察、傳統(tǒng)生理生化試驗(yàn)和對(duì)5.8S ITS區(qū)間進(jìn)行PCR擴(kuò)增相結(jié)合的方法成功的將其鑒定到種。其中,菌株1-4單孢釀酒酵母(Kazachstania unispora);菌株 3-2、3-3 為發(fā)酵畢赤酵母(Pichia fermentans);菌株 3-5、3-6為乳酸克魯維酵母(Kluyveromyces lactis);菌株3-8、7-1為馬克思克魯維酵母(Kluyveromycesmarxianus);菌株 4-2、6-2 為膠紅酵母(Rhodotorula mucilaginosa); 菌株 5-3、5-4、6-5 為美極梅奇酵母(Metschnikowia pulcherrima);菌株 5-6 為葡萄有孢漢遜酵母(Hanseniaspora uvarum);其余全部為庫(kù)德畢赤酵母(Pichia kudriavzevii)。

綜上看來(lái),同一牧區(qū)不同牧民家庭的原料乳中分離得到的酵母菌的種類和數(shù)量存在一定差異性,如2號(hào)樣品和3號(hào)樣品,這可能是因?yàn)樵先榇嬖诘沫h(huán)境不同,因?yàn)槿樵唇湍复蠖鄶?shù)來(lái)自原料乳環(huán)境及加工設(shè)備與周圍環(huán)境[14]。但采集自不同牧區(qū)的原料乳樣品中,所含的優(yōu)勢(shì)菌群是相同的,均為庫(kù)德畢赤酵母(Pichia kudriavzevii),而根據(jù)他人研究,原料乳中的酵母菌主要是Candida catenulata、Candida pararugosa、Candida rugosa[15]等。 王冠群[16]等人對(duì)塔城部分地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中酵母菌進(jìn)行分離鑒定,結(jié)果表明,Issatchenkia orientalis為第二優(yōu)勢(shì)菌群,而根據(jù)Kurtzman等人[17]研究,已將Issatchenkia屬歸入Pichia屬,由于P.orientalis已經(jīng)存在,Iss.orientalis在歸入Pichia屬中后要一個(gè)新的種名,所以使用P.kudriavzevii來(lái)代替它,由此本研究與前人研究結(jié)果相符。但從目前許多對(duì)乳制品中酵母菌的研究來(lái)看,尚未發(fā)現(xiàn)對(duì)乳制品中庫(kù)德畢赤酵母(Pichia kudriavzevii)的詳盡報(bào)道。并且本研究分離得到的酵母菌的種類和數(shù)量關(guān)系與其他研究存在較大差異,可能是由于不同地區(qū)環(huán)境、氣候條件、溫度、濕度等存在差異,因而引起原料乳中的酵母菌含量和種類的不同。

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