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銅綠假單胞菌環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測方法在實(shí)驗(yàn)小鼠微生物控制中的應(yīng)用

2019-02-15 05:09向欽王會娟劉陽伍悅曹敏賴國旗何明忠
四川動物 2019年1期
關(guān)鍵詞:銅綠單胞菌引物

向欽, 王會娟, , 劉陽, 伍悅, 曹敏, 賴國旗, 何明忠*

(1.重慶醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗(yàn)動物中心,重慶400016; 2. 浙江大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,杭州310058;3. 重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院肝膽外科,重慶400010)

銅綠假單胞菌Pseudomonasaeruginosa通常被稱為綠膿桿菌(Silbyetal.,2011),為臨床上較常見的人獸共患致病菌,在人體的各個部位都可能存在,一般出現(xiàn)在動物的鼻咽部和下消化道。銅綠假單胞菌感染后滲出液等呈綠色,能夠引起化膿性病變,嚴(yán)重影響人和動物的健康以及動物實(shí)驗(yàn)的結(jié)果(Gordonetal.,1955;蔣觀成,浦野徹,1991;Baker,1998)??焖佟?zhǔn)確地檢出銅綠假單胞菌,對控制該病原菌的感染具有重要意義。目前,銅綠假單胞菌的檢測方法主要有細(xì)菌分離鑒定、免疫學(xué)、PCR等。其中,細(xì)菌分離鑒定法準(zhǔn)確性高,但耗時費(fèi)力、檢出率低、易漏檢;免疫學(xué)法檢測過程繁雜、周期長、靈敏度低(王燕等,2010);盡管PCR法靈敏度較高,但對儀器設(shè)備要求嚴(yán),很難在基層單位推廣應(yīng)用(Lodengetal.,2006;Deschaghtetal.,2009;Schwartzetal.,2010)。因此,探索準(zhǔn)確、高效的銅綠假單胞菌檢測方法,對人和實(shí)驗(yàn)動物感染的預(yù)防和控制都極其重要。

環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)(Notomietal.,2000;Yoneyamaetal.,2007)具有操作簡單、結(jié)果直觀、特異性強(qiáng)及比普通PCR靈敏度高等突出優(yōu)點(diǎn),已被廣泛應(yīng)用于一些病原微生物的檢測(Iwamotoetal.,2003;Horisakaetal.,2004;Songetal.,2005),包括銅綠假單胞菌(Gotoetal.,2010;Diribeetal.,2015;Kimetal.,2016)。由于LAMP的引物是擴(kuò)增技術(shù)的關(guān)鍵所在,不同區(qū)域的引物對目的基因的擴(kuò)增效果有重要影響。根據(jù)LAMP的基本原理,針對銅綠假單胞菌oprL基因序列的新區(qū)域,設(shè)計(jì)了相應(yīng)的LAMP特異性引物,通過優(yōu)化,達(dá)到高效、特異、靈敏的結(jié)果,并以《GB/T 14926.17-2001 實(shí)驗(yàn)動物 綠膿桿菌檢測方法》和PCR法為對照,通過實(shí)驗(yàn)小鼠血清樣本對建立方法進(jìn)行驗(yàn)證,以期為豐富銅綠假單胞菌的檢測手段提供重要依據(jù)。

1 材料

1.1 菌株及實(shí)驗(yàn)動物準(zhǔn)備

銅綠假單胞菌(菌株編號:ATCC27853)由重慶市疾病預(yù)防控制中心饋贈;甲型副傷寒沙門桿菌SalmonellaparatyphoidA(菌株編號:CMCC50093)、鼠傷寒沙門氏菌Salmonellatyphimurium(菌株編號:CMCC50115)、肺炎克雷伯桿菌Klebsiellapneumoniae(菌株編號:CMCC46117)、嗜肺巴斯德桿菌Pasteurellapneumotropica(菌株編號:ATCC35149)、金黃色葡萄球菌Staphylococcusaureus(菌株編號:ATCC-25923、CMC6003)均由廣東省實(shí)驗(yàn)動物監(jiān)測所饋贈;87只實(shí)驗(yàn)小鼠(24只C57BL/6J小鼠、24只KM小鼠、16只BALB/c小鼠、23只各品系轉(zhuǎn)基因小鼠)及其血清樣本隨機(jī)抽取于重慶市實(shí)驗(yàn)動物質(zhì)量檢測中心[實(shí)驗(yàn)動物生產(chǎn)許可證號:SCXK(渝)2012-0001、-0003、-0005、-0006;實(shí)驗(yàn)動物使用許可證號:SYXK(渝)2012-0001]。

1.2 試劑及儀器

Bst酶3.0購自New England Biolabs;Taq DNA聚合酶、dNTPs、基因組DNA提取試劑盒(DP304)購自天根生化科技(北京)有限公司;NAC(naldixic acid cetrimide)液體/固體培養(yǎng)基購自北京三藥科技開發(fā)有限公司;腸桿菌科細(xì)菌編碼(杭州)購自杭州微生物試劑廠;低溫離心機(jī)、紫外可見核酸蛋白分析儀Bio Mate 3S購自Thermo Fisher Scientific;LAMP實(shí)時濁度儀(LA-320)和擴(kuò)增試劑盒(4X004)購自日本榮研化學(xué)株式會社;SYBR Green Ⅰ購自InvitrogenTMThermo Fisher Scientific;PowerPac3000電泳儀、GelDocXR+凝膠成像分析儀及PCR熱循環(huán)儀(S1000TMThermal Cyclers)購自Bio-Rad(上海)有限公司;恒溫培養(yǎng)振蕩器購自上海智誠分析儀器制造有限公司。

2 方法

2.1 DNA模板準(zhǔn)備

NAC固體培養(yǎng)基上接種銅綠假單胞菌菌株,37 ℃培育20 h左右,挑單菌落在相同條件下用NAC液體培養(yǎng)基進(jìn)行培育。菌液DNA提取步驟為:取菌液12 000 r·min-1離心5 min,加10 mmol·L-1Tris-EDTA(pH7.5)緩沖液50L,100 ℃ 10 min,-20 ℃ 2 min,12 000 r·min-1離心10 min,分離上清,-20 ℃儲存。

2.2 引物設(shè)計(jì)與合成

根據(jù)銅綠假單胞菌oprL基因序列,在新區(qū)域內(nèi)用PrimerExploer V4分別設(shè)計(jì)包含內(nèi)引物(FIP、BIP)、外引物(F3、B3c)和環(huán)引物(LFc、LB)在內(nèi)的3對LAMP特異性引物;根據(jù)參考文獻(xiàn)(de Vosetal.,1997;邢進(jìn)等,2012)合成2套PCR引物[oprL(F1、R1),16SrRNA(F2、R2)](圖1,表1),引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

圖1 環(huán)介異等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)引物在oprL基因的位置(GenBank登錄號: Z50191.1)Fig. 1 The position of loop-mediated isothermal amplification primers in oprL gene (GenBank accession number: Z50191.1)

注: B3c、F1c、B2c、LFc分別為B3、F1、B2、LF的互補(bǔ)序列

Note: B3c, F1c, B2c and LFc are complementary sequence of B3, F1, B2 and LF, respectively

2.3 反應(yīng)條件優(yōu)化

2.3.1溫度優(yōu)化根據(jù)Bst酶最佳溫度范圍:60~66 ℃,設(shè)置8個溫度梯度進(jìn)行反應(yīng):59 ℃、60 ℃、61 ℃、62 ℃、63 ℃、64 ℃、65 ℃、66 ℃。最佳反應(yīng)溫度判斷標(biāo)準(zhǔn)為:LAMP開始擴(kuò)增的時間較早、最大擴(kuò)增效率高且用時較短。

2.3.2內(nèi)引物濃度優(yōu)化設(shè)置8個濃度梯度的內(nèi)引物(FIP/BIP):20 μmol·L-1、30 μmol·L-1、40 μmol·L-1、50 μmol·L-1、60 μmol·L-1、70 μmol·L-1、80 μmol·L-1、90 μmol·L-1(即以40 μmol·L-10.5 μL FIP和40 μmol·L-10.5 μL BIP為起點(diǎn),按0.25 μL梯度等差遞增體積等量加至2.25 μL),再分別加入5 μmol·L-1F3/B3c、20 μmol·L-1LFc/LB和Bst酶各1 μL,模板DNA 1 μL,2×RM緩沖液12.5 μL,無酶水補(bǔ)齊25 μL,混勻,在最佳反應(yīng)溫度下反應(yīng)。最佳的內(nèi)引物濃度判斷標(biāo)準(zhǔn)為:擴(kuò)增開始時間較早、最大擴(kuò)增效率較大且用時較短。

2.3.3環(huán)引物濃度優(yōu)化設(shè)置6個濃度梯度的環(huán)引物(LFc/LB):10 μmol·L-1、15 μmol·L-1、20 μmol·L-1、25 μmol·L-1、30 μmol·L-1、35 μmol·L-1(即以20 μmol·L-10.5 μL LFc和20 μmol·L-10.5 μL LB為起點(diǎn),按0.25 μL梯度等差遞增體積等量加至1.75 μL),再分別加入70 μmol·L-1FIP/BIP、5 μmol·L-1F3/B3c、Bst酶各1 μL,2×RM緩沖液11.5 μL,模板DNA 1 μL,無酶水補(bǔ)齊25 μL,混勻,在最佳反應(yīng)溫度下反應(yīng)。最佳的環(huán)引物濃度判斷標(biāo)準(zhǔn)為:擴(kuò)增開始時間較早、最大擴(kuò)增效率較大且用時較短。

2.4 特異性試驗(yàn)

按照上述新建立的LAMP體系,檢測其對包括銅綠假單胞菌在內(nèi)的7株菌株(ATCC27853、CMCC50115、CMCC50093、ATCC35149、CMCC46117、ATCC25923、CMC6003)的鑒別能力,樣本擴(kuò)增后加入1 μL SYBR Green Ⅰ后,使用LAMP實(shí)時濁度儀觀察顏色變化,產(chǎn)物1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

2.5 穩(wěn)定性試驗(yàn)

取6份不同批次銅綠假單胞菌菌液提取DNA,用新建立的LAMP體系進(jìn)行檢測。

2.6 重復(fù)性試驗(yàn)

取6份同批次銅綠假單胞菌菌液提取的DNA,用新建立的LAMP體系進(jìn)行檢測。

2.7 靈敏度試驗(yàn)

紫外可見核酸蛋白分析儀測定菌液DNA濃度,取已知濃度的銅綠假單胞菌DNA,將銅綠假單胞菌DNA起始濃度設(shè)為2.9 μg·mL-1,按10倍濃度梯度進(jìn)行稀釋至10-8或10-9,分別用已建立的LAMP方法及文獻(xiàn)報道的PCR方法(de Vosetal.,1997;邢進(jìn)等,2012)進(jìn)行擴(kuò)增,測定二者對銅綠假單胞菌的檢測限。

2.8 臨床樣本的檢測

隨機(jī)抽取重慶市實(shí)驗(yàn)動物檢測中心87只小鼠,每只小鼠同時收集血清及回盲部內(nèi)容物,利用DNA試劑盒提取血清DNA樣本,進(jìn)行LAMP擴(kuò)增,隨后每個樣本中加入1 μL SYBR Green Ⅰ觀察顏色變化;同時,按照《GB/T 14926.17-2001 實(shí)驗(yàn)動物 綠膿桿菌檢測方法》檢測,即采取回盲部內(nèi)容物接種NAC液體培養(yǎng)基,置于(36±1) ℃培養(yǎng)18~24 h后觀察生長情況,對未產(chǎn)生綠色色素者轉(zhuǎn)種NAC瓊脂平皿,(36±1) ℃培養(yǎng)18~24 h,對生長特性及菌落特征與銅綠假單胞菌一致的菌落進(jìn)一步進(jìn)行生化鑒定;LAMP或《GB/T 14926.17-2001 實(shí)驗(yàn)動物 綠膿桿菌檢測方法》檢測結(jié)果為陽性的樣本,進(jìn)一步用PCR方法驗(yàn)證。

3 結(jié)果

3.1 反應(yīng)體系的建立

3.1.1溫度優(yōu)化比較8個溫度梯度擴(kuò)增結(jié)果,滿足擴(kuò)增效率最大且用時最短的溫度為66 ℃,即確定66 ℃為最佳反應(yīng)溫度(圖2)。

圖2 溫度優(yōu)化Fig. 2 Optimization of temperature

3.1.2內(nèi)引物濃度優(yōu)化在內(nèi)引物濃度為70 μmol·L-1時,反應(yīng)體系在15 min左右開始擴(kuò)增,此時的最大擴(kuò)增效率較高,并且達(dá)到最大擴(kuò)增效率用時相對較短,因此將70 μmol·L-1判定為反應(yīng)的最佳內(nèi)引物濃度(圖3)。

3.1.3環(huán)引物濃度優(yōu)化在環(huán)引物濃度為30 μmol·L-1時,反應(yīng)體系在12 min左右開始擴(kuò)增,此時的最大擴(kuò)增效率較高,并且達(dá)到最大擴(kuò)增效率用時較短,故將30 μmol·L-1判定為反應(yīng)的最佳環(huán)引物濃度(圖4)。

圖3 內(nèi)引物濃度優(yōu)化Fig. 3 Optimization of inner primers concentration

A.不同內(nèi)引物濃度下環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的擴(kuò)增效率, CH1~CH8為20~90 μmol·L-1的8個內(nèi)引物濃度梯度; B. 不同濃度內(nèi)引物下的擴(kuò)增時間和最大擴(kuò)增效率

A.amplification efficiency of loop-mediated isothermal amplification under different concentrations of inner primers, CH1-CH8 indicate different concentration gradients of inner primers from 20 μmol·L-1to 90 μmol·L-1; B. amplification time and maximum amplification rate under different concentrations of inner primers

3.1.4最終反應(yīng)體系的建立通過優(yōu)化反應(yīng)條件最終確定:66 ℃為最佳反應(yīng)溫度,反應(yīng)體系(25 μL)如下:2×RM緩沖液12.5 μL,70 μmol·L-1FIP、70 μmol·L-1BIP、5 μmol·L-1F3、5 μmol·L-1B3c、30 μmol·L-1LFc、30 μmol·L-1LB、Bst酶和模板DNA各1 μL,無酶水4.5 μL。

3.2 特異性

結(jié)果僅顯示銅綠假單胞菌的DNA樣本為陽性(圖5:A);其余6株菌株(鼠傷寒沙門氏菌、甲型副傷寒沙門桿菌、嗜肺巴斯德桿菌、肺炎克雷伯桿菌、2株金黃色葡萄球菌)的DNA樣本均為陰性。向擴(kuò)增后的產(chǎn)物中加1 μL SYBR Green Ⅰ觀察顏色,發(fā)現(xiàn)只有銅綠假單胞菌的DNA樣本能看到翠綠色(圖5:B);瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果可知僅銅綠假單胞菌DNA樣本擴(kuò)增出清晰的條帶(圖5:C)。

圖4 環(huán)引物濃度優(yōu)化Fig. 4 Optimization of loop primers concentration

A.不同環(huán)引物濃度下環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的擴(kuò)增效率, CH1~CH6為10~35 μmol·L-1的6個環(huán)引物濃度梯度; B. 不同濃度環(huán)引物下的擴(kuò)增時間和最大擴(kuò)增效率

A.amplification efficiency of loop-mediated isothermal amplification under different concentrations of loop primers, CH1-CH6 indicate different concentration gradients of loop primers from 10 μmol·L-1to 35 μmol·L-1; B. amplification time and maximum amplification rate under different concentrations of loop primers

3.3 穩(wěn)定性

用新建立的LAMP體系對不同批次不同時間提取的6份DNA檢測結(jié)果均為陽性(圖6),樣品管的擴(kuò)增效率、濁度之間的差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),表明該檢測方法較穩(wěn)定。

3.4 重復(fù)性

用新建立的LAMP體系對6份同批次DNA檢測結(jié)果均為陽性,且擴(kuò)增效率和濁度2條曲線的重合率極高(圖7),表明該檢測方法的重復(fù)性較好。

3.5 靈敏度

梯度稀釋后的銅綠假單胞菌DNA用LAMP和PCR方法檢測,其最低檢測濃度分 別 為 2.9×10-7μg·mL-1(圖8:A~C)和2.9×10-4μg·mL-1(圖8:D、E)。

3.6 臨床樣本檢測

用新建立的LAMP體系擴(kuò)增87份小鼠血清樣本,有10份顯示為銅綠假單胞菌陽性,檢出率為11.5%(10/87),擴(kuò)增產(chǎn)物加入SYBR Green Ⅰ 后,觀察顏色變化(圖9:A)。按照《GB/T 14926.17-2001 實(shí)驗(yàn)動物 綠膿桿菌檢測方法》對同批次87只小鼠回盲部內(nèi)容物進(jìn)行檢測的結(jié)果均為陰性。用PCR方法擴(kuò)增LAMP檢測的10份陽性樣本DNA,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂凝膠電泳,均在1 519 bp和504 bp處可見陽性條帶(圖9:B、C)。

圖5 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)檢測的特異性Fig. 5 Specificity of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay

A. 不同菌株的LAMP鑒定, B. 熒光鑒定圖, C. 瓊脂糖電泳圖; 1. 銅綠假單胞菌DNA, 2~7分別為鼠傷寒沙門氏菌、甲型副傷寒沙門桿菌、嗜肺巴斯德桿菌、肺炎克雷伯桿菌、金黃色葡萄球菌ATCC25923和CMC6003的DNA, 8. 空白對照, M. DL2000 DNA Marker

A.product identification by LAMP, B. sample fluorescence, C. agarose gel electrophoresis of reaction products; lane 1.PseudomonascaeruginosaDNA product, lanes 2-7.Salmonellatyphimurium,SalmonellaparatyphoidA,Pasteurellapneumotropica,Klebsiellapneumoniae,StaphylococcusaureusATCC25923 and CMC6003 DNA products, 8. control, M. DL2000 DNA Marker

4 討論

與傳統(tǒng)的檢測方法相比,LAMP最大的優(yōu)點(diǎn)在于反應(yīng)全程均可在恒溫條件下進(jìn)行,避免了溫度循環(huán)的時間消耗,擴(kuò)增的反應(yīng)結(jié)果肉眼可見(陽性結(jié)果呈白色渾濁),達(dá)到快速檢測的目的,LAMP的引物是擴(kuò)增技術(shù)的關(guān)鍵(Notomietal.,2000;Yoneyamaetal.,2007)。本研究根據(jù)銅綠假單胞菌(Z50191)的oprL基因序列針對8個不同區(qū)域所設(shè)計(jì)的6條特異性引物(Iwamotoetal.,2003;Enomotoetal.,2005;Yamazakietal.,2008)。與GenBank中的銅綠假單胞菌基因序列比對,該引物還包含其他基因序列,如EU28653、JF901474、JN628780、JN628781、JN628782、JN628828、JN717231、KP056547,顯示出了引物的高度保守性和特異性。此外,對溫度、內(nèi)引物濃度、環(huán)引物濃度的梯度進(jìn)行優(yōu)化,最終確立最優(yōu)方案如下:溫度66 ℃,內(nèi)引物濃度70 μmol·L-1,環(huán)引物濃度30 μmol·L-1。

圖6 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)檢測的穩(wěn)定性Fig. 6 Stability of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay

A. 樣本的鑒定, B. LAMP擴(kuò)增效率, C. 樣本濁度; 1~6為不同批次不同時間提取的銅綠假單胞菌的DNA樣本, 7、8為空白對照

A.product identification, B. LAMP amplification efficiency, C. sample turbidity; 1-6 indicate the different batches at different times ofPseudomonasaeruginosaDNA product, 7 and 8 represent the negative control

圖7 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)檢測的重復(fù)性Fig. 7 Repeatability of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay

A.樣本的鑒定, B. LAMP 擴(kuò)增效率, C. 樣本濁度; 1~6為同批次的銅綠假單胞菌的DNA樣本, 7為空白對照, 8為空信號通道

A.product identification, B. LAMP amplification efficiency, C. sample turbidity; 1-6 indicate the same batch at different times ofPseudormonasaeruginnosaDNA product, 7 represents the negative control, 8. null

用新建立的LAMP體系分別檢測實(shí)驗(yàn)小鼠體內(nèi)常見的6種病原微生物和不同批次及同一批次的不同時間段的銅綠假單胞菌DNA樣本,結(jié)果都顯示了較高的特異性、重復(fù)性和穩(wěn)定性;再運(yùn)用標(biāo)準(zhǔn)銅綠假單胞菌DNA比較新建立的LAMP體系與PCR方法檢測結(jié)果的差異,結(jié)果表明,新檢測體系能檢出的銅綠假單胞菌最低檢測限為2.9×10-7μg·mL-1,比普通PCR (2.9×10-4μg·mL-1)的靈敏度高出103倍,與已報道方法(Zhaoetal.,2011)(比普通PCR方法高102倍)比較,其靈敏度更高。

為了評價新建立的LAMP方法在實(shí)驗(yàn)動物銅綠假單胞菌檢測中的應(yīng)用價值,對87份小鼠血清樣本進(jìn)行了檢測,檢出率為11.5%(10/87),而利用《GB/T 14926.17-2001 實(shí)驗(yàn)動物 綠膿桿菌檢測方法》的檢出率為0%(0/87),同時,16SrRNA和oprL利用PCR方法進(jìn)行陽性樣本驗(yàn)證時,其結(jié)果與LAMP方法檢測結(jié)果完全一致(10/10);實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,LAMP檢測方法比傳統(tǒng)分離培養(yǎng)檢測方法的檢出率高。在檢測手段上,《GB/T 14926.17-2001 實(shí)驗(yàn)動物 綠膿桿菌檢測方法》需要各種不同的培養(yǎng)基(如:NAC液體/固體培養(yǎng)基、普通營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基、糖發(fā)酵培養(yǎng)基等),還需要肉眼選擇可疑菌落進(jìn)行生化試驗(yàn),檢測時間長,不可控因素也較多。盡管與傳統(tǒng)PCR方法檢測結(jié)果一致,但新LAMP檢測體系不需要特殊儀器,操作簡單,非常適合基層單位,能夠有效地應(yīng)用于人和動物的銅綠假單胞菌檢測,對保證人及動物安全具有重要意義;也為實(shí)驗(yàn)動物銅綠假單胞菌的質(zhì)量控制提供了新的、可靠的檢測方法。

圖8 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)檢測的靈敏度Fig. 8 Sensitivity of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay

A. 樣本的鑒定, 1~8分別為按照100~10-7稀釋的銅綠假單胞菌DNA; B. 樣本的鑒定, 1為稀釋10-8的銅綠假單胞菌DNA, 2為空白對照, 3~8為空信號通道; C. LAMP凝膠電泳圖(M為DL2000 DNA Marker, 2~9分別為按照100~10-8稀釋的銅綠假單胞菌DNA, N為陰性對照); D. 16SrRNAPCR凝膠電泳圖(M為DL2000 DNA Marker, 2~10分別為按照100~10-9稀釋的銅綠假單胞菌DNA, N為陰性對照); E.oprLPCR凝膠電泳圖(M為DL2000 DNA Marker, 2~10分別為按照100~10-9稀釋的銅綠假單胞菌DNA, N為陰性對照)

A. product identification, dilutedPseudomonasaeruginosaDNA according to 100-10-7from lanes 1-8; B. product identification, lane 1. diluted 10-8P.aeruginosaDNA, lane 2. control, lane 3-8. null; C. agarose gel electrophoresis of LAMP reaction products (M. DL2000 DNA Marker, lanes 2-9. 10-fold serial dilutions ofP.aeruginosaDNA, lane N. negative control); D. agarose gel electrophoresis of 16SrRNAPCR amplification (M. DL2000 DNA Marker, lanes 2-10. 10-fold serial dilutions ofP.aeruginosaDNA, lane N. negative control); E. agarose gel electrophoresis ofoprLPCR amplification (M. DL2000 DNA Marker, lanes 2-10, 10-fold serial dilutions ofP.aeruginosaDNA, lane N. negative control)

圖9 小鼠血清樣本檢測結(jié)果
Fig. 9 Detection results of mouse serum samples

A. 環(huán)介異等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)反應(yīng)陽性結(jié)果(1~10為陽性樣本); B. 16SrRNAPCR凝膠電泳圖(M為DL2000 DNA Marker, N為陰性對照);C.oprLPCR凝膠電泳圖(M為DL2000 DNA Marker, 1~10為陽性樣本, N為陰性對照)

A. fluorescence result of loop-mediated is othermal amplification (lanes 1-10. positive samples); B. agarose gel electrophoresis of 16SrRNAPCR amplification (M. DL2000 DNA Marker, lanes 1-10. positive samples, lane N. negative control); C. agarose gel electrophoresis ofoprLPCR amplification (M. DL2000 DNA Marker, lanes 1-10. positive samples, lane N. negative control)

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