羅沙柳,任鑫鑫,羅菲,梁迎春,馬超,劉坤,冉芳,施亞嬌,李玲,葉棋濃
1.貴州大學(xué) 醫(yī)學(xué)院,貴州 貴陽(yáng)550025;2.軍事科學(xué)院 軍事醫(yī)學(xué)研究院 生物工程研究所,北京100850;3.山西醫(yī)科大學(xué) 第二醫(yī)院,山西 太原030000;4.大連醫(yī)科大學(xué) 腫瘤干細(xì)胞研究院,遼寧 大連,116044;5.中部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院 衛(wèi)勤部科訓(xùn)科,湖北 武漢430072
Sirtuins(SIRT)家族中的沉默信息調(diào)節(jié)因子2(silent information regulator 2,Sir2)最早在酵母中被發(fā)現(xiàn)[1]。迄今,科學(xué)家們?cè)诓溉閯?dòng)物中已經(jīng)確定 了7種與Sir2 同 源的基因,即SIRT1~SIRT7[2]。人類(lèi)的SIRT6基因位于染色體19P13.3 區(qū)域,包括8個(gè)外顯子,編碼的蛋白全長(zhǎng)355個(gè)氨基酸殘基,相對(duì)分子質(zhì)量39×103,等電點(diǎn)9.12[3]。SIRT6 最初被認(rèn)為是單-ADP-核糖基轉(zhuǎn)移酶,可以通過(guò)分子內(nèi)機(jī)制完成放射性標(biāo)記的轉(zhuǎn)移,這表明SIRT6 可能利用ADP-核糖基化來(lái)自動(dòng)調(diào)節(jié)自身活性,但是其最主要作用還是作為組蛋白脫乙酰酶[4-9]。
目前研究證明,SIRT6在基因組穩(wěn)定性、代謝、染色質(zhì)調(diào)控、端粒完整性、基因轉(zhuǎn)錄和糖脂代謝等方面都起關(guān)鍵調(diào)控作用,調(diào)節(jié)糖尿病、心臟病、肥胖、癌癥及壽命、衰老等相關(guān)病理生理的發(fā)生發(fā)展[10-12]。SIRT6在體內(nèi)控制許多代謝途徑,包括糖酵解、糖異生、甘油三酯合成和LDL-膽固醇穩(wěn)態(tài),SIRT6 缺乏導(dǎo)致主要代謝缺陷[13-16]。對(duì)于癌癥,SIRT6 可以通過(guò)多種機(jī)制發(fā)揮抑癌作用,敲除SIRT6的小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(MEF)比野生型MEF細(xì)胞生長(zhǎng)增殖快,且敲除SIRT6 有促進(jìn)腫瘤發(fā)生的作用[13];敲除SIRT6基因的腫瘤細(xì)胞的乳酸生成、葡萄糖攝取等均增加[17]。對(duì)116例乳腺癌病人的組化分析顯示SIRT6 高表達(dá)的病人生存預(yù)后差,SIRT6 通過(guò)調(diào)控FOXO的表達(dá)降低腫瘤細(xì)胞對(duì)化療藥的敏感性;在前列腺腫瘤組織和前列腺癌細(xì)胞中SIRT6表達(dá)都高于正常或癌旁組織,且敲低SIRT6 降低細(xì)胞活力,增加藥物的敏感性等;這又從另外一個(gè)層面說(shuō)明SIRT6 發(fā)揮致癌作用[17-20]。有文獻(xiàn)報(bào)道SIRT6 能與缺氧誘導(dǎo)因子HIF1α相互作用[17],從而調(diào)控腫瘤的代謝重編程。
在本研究中,我們構(gòu)建了帶GST 標(biāo)簽的人SIRT6基因原核表達(dá)載體,表達(dá)純化獲得重組GST-SIRT6 蛋白,驗(yàn)證了SIRT6與HIF1α之間的關(guān)系,有助于進(jìn)一步探討SIRT6在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的調(diào)控機(jī)制。
大腸桿菌DH5α、BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞購(gòu)自北京博邁德科技發(fā)展有限公司;人乳腺文庫(kù)、帶GST 標(biāo)簽的pGEX-KG 原核表達(dá)載體為本室保存;PCR 試劑、限制性?xún)?nèi)切酶及DNA 連接酶購(gòu)自TaKaRa 公司;質(zhì)粒提取、膠回收試劑盒購(gòu)自Pro?mega 公司;GST-Sepharose 4B 珠購(gòu)自Pharmacia 公司;HRP 標(biāo)記的抗GST 單克隆抗體購(gòu)自GE Healthcare Life Sciences 公司;引物合成及測(cè)序由北京博邁德科技發(fā)展有限公司完成。
根據(jù)GenBank 中的人源SIRT6基因編碼序列設(shè)計(jì)上游引物5'-CGGGATCCATGTCGGTGAATT ACGCGGCGGGG-3'和下游引物,5'-CCGCTCGAG TCAGCTGGGGACCGCCTTGGCCT-3'。以本室保存的乳腺文庫(kù)為模板,用Primer Star DNA 聚合酶擴(kuò)增目的基因片段(PCR 程序:95℃預(yù)變性5 min,95℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸75 s,共35個(gè)循環(huán),72℃再延伸5 min)。瓊脂糖膠檢測(cè)PCR 產(chǎn)物,切出目的基因片段,用膠回收試劑盒回收目的片段。
將回收的目的基因片段及載體GST 分別用限制性?xún)?nèi)切酶BamHⅠ/XhoⅠ于37℃雙酶切4~6 h 或過(guò)夜,瓊脂糖凝膠電泳回收雙酶切后的PCR 產(chǎn)物及載體。將雙酶切的PCR 產(chǎn)物及載體用T4DNA連接酶于16℃連接6 h 以上后轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài),挑菌進(jìn)行菌液PCR 鑒定,將鑒定得到的陽(yáng)性克隆用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,雙酶切鑒定,并送北京博邁德生物公司測(cè)序。
將測(cè)序正確的GST-SIRT6 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21 感受態(tài)并涂于含氨芐青霉素的LB 板上,37℃恒溫箱中培養(yǎng)過(guò)夜,挑取單菌落于裝有5 mL 含氨芐青霉素的LB 培養(yǎng)基的10 mL 試管中,于37℃、200 r/min 搖床上振蕩培養(yǎng)過(guò)夜,按1∶50 將菌液稀釋?zhuān)?0℃培養(yǎng)至D600nm約為0.6,用終濃度1 mmol/L的IPTG 小量誘導(dǎo),調(diào)定溫度至20℃繼續(xù)振蕩培養(yǎng)4~6 h。收集誘導(dǎo)前、后的菌液,裂解后行Western 印跡,鑒定有無(wú)SIRT6 蛋白表達(dá)。
挑選出能誘導(dǎo)GST-SIRT6 蛋白的重組大腸桿菌BL21 接種于5 mL 含氨芐青霉素的LB 中,37℃培養(yǎng)過(guò)夜,將菌液轉(zhuǎn)移到300 mL 含氨芐青霉素的LB 中,30℃、200 r/min 振蕩培養(yǎng)4~6 h,直至菌液D600nm為1.0~1.5,再 按1∶10 000的比例 加 入IPTG,20℃、200 r/min 培養(yǎng)16~24 h。離心收集菌體沉淀,加入裂解液重懸,冰浴30 min 使菌體充分裂解,再用超聲波裂解細(xì)菌,收集上清液,加入GST-Sepharose 4B 純化珠,4℃旋轉(zhuǎn)結(jié)合4 h 或過(guò)夜,離心收集結(jié)合蛋白后的GST-Sepharose 4B 純化珠,緩沖液洗脫未結(jié)合的蛋白后得到純化的融合蛋白,行SDS-PAGE,考馬斯亮藍(lán)染色鑒定。
用5 μg MYC-HIF1α真核表達(dá)載體分別轉(zhuǎn)染2個(gè)6 cm 皿的293T細(xì)胞系,24~48 h后收細(xì)胞,超聲波裂解半小時(shí),4℃、12 000 r/min 離心5 min,取25 μL 上清,加入等量2×SDS 上樣緩沖液作為結(jié)合前的蛋白樣,將剩余上清與已純化的GST、GST-SIRT6 蛋白珠于4℃結(jié)合4~6 h,再用IP緩沖液洗滌蛋白珠,棄上清,加入2×SDS 上樣緩沖液,Western 印跡檢測(cè)。
以本實(shí)驗(yàn)室保存的人乳腺文庫(kù)為模板,PCR擴(kuò)增人SIRT6基因的編碼序列,獲得1059 bp的DNA片段,與預(yù)期大小一致(圖1)。將BamHⅠ/XhoⅠ酶切后的PCR 產(chǎn)物與GST 載體連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài),挑菌后進(jìn)行菌液PCR 鑒定,獲得與目的條帶1059 bp 大小接近(圖2)的克隆,初步認(rèn)定是帶有人源SIRT6基因的陽(yáng)性重組克隆。選取陽(yáng)性克隆提質(zhì)粒,酶切鑒定,可切出長(zhǎng)度分別約為5000和1059 bp的條帶,而相應(yīng)的空載體酶切后只見(jiàn)大條帶,與預(yù)期結(jié)果相符(圖3)。重組質(zhì)粒測(cè)序結(jié)果表明,插入的DNA片段序列與人SIRT6基因的編碼序列一致(序列略)。
分別用HRP 標(biāo)記的抗GST 單克隆進(jìn)行West?ern 印跡,結(jié)果見(jiàn)圖4。泳道4 相對(duì)分子質(zhì)量68×103左右有抗體特異結(jié)合條帶,即GST-SIRT6 融合蛋白(谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶GST 相對(duì)分子質(zhì)量26×103左右,SIRT6 為42×103左右)。泳道4 相對(duì)分子質(zhì)量26×103~42×103是蛋白降解帶。結(jié)果與預(yù)期一致,說(shuō)明GST-SIRT6 融合蛋白表達(dá)正確。
圖1 PCR 擴(kuò)增人SIRT6的編碼序列
圖2 重組質(zhì)粒GST-SIRT6的菌液PCR 結(jié)果電泳圖譜
圖3 重組質(zhì)粒GST-SIRT6的BamHⅠ/XhoⅠ雙酶切電泳圖譜
利用GST-Sepharose 4B 親和珠對(duì)GST-SIRT6進(jìn)行純化,行SDS-PAGE,考馬斯亮藍(lán)染色,泳道2可見(jiàn)相應(yīng)蛋白條帶出現(xiàn)(圖5)。
將MYC-HIF1α轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,所提取的蛋白和純化的GST、GST-SIRT6 蛋白珠結(jié)合,進(jìn)行SDS-PAGE,分別用MYC-HRP和GST-HRP 抗體檢測(cè),結(jié)果如圖6。結(jié)合后孵育MYC-HRP 抗體,泳道2 出現(xiàn)特異蛋白條帶,證明MYC-HIF1α與GSTSIRT6 融合蛋白有相互作用。
圖4 Western 印跡檢測(cè)融合蛋白的表達(dá)
圖5 重組蛋白GST-SIRT6的純化
目前研究發(fā)現(xiàn)SIRT6在腫瘤中的作用具有爭(zhēng)議。SIRT6 最近被證明是一種明顯的腫瘤抑制因子,在人類(lèi)多種癌癥中SIRT6 蛋白水平偏低,如在肝癌、胰腺癌、卵巢癌和結(jié)直腸癌等中都下調(diào)或突變[18-20]。在卵巢癌中,SIRT6 通過(guò)降低Notch3 抑制腫瘤增殖[21]。SIRT6 還通過(guò)控制Lin28b 抑制胰腺癌的發(fā)生發(fā)展。然而,SIRT6在前列腺癌、皮膚癌和乳腺癌等其他一些癌癥類(lèi)型中高表達(dá),并作為癌基因發(fā)揮作用,在小細(xì)胞肺癌中也有類(lèi)似的現(xiàn)象[22]。在癌癥發(fā)生發(fā)展中,增加蛋白質(zhì)合成對(duì)癌細(xì)胞的存活、增殖、發(fā)展和轉(zhuǎn)化至關(guān)重要[23-24]。Ravi 等發(fā)現(xiàn)SIRT6 可以通過(guò)與轉(zhuǎn)錄因子SP1 結(jié)合,一起轉(zhuǎn)錄調(diào)控mTOR 信號(hào)通路,從而調(diào)控蛋白質(zhì)合成來(lái)影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展[25]。另有報(bào)道,SIRT6通過(guò)ERK1/2/MMP9 通路調(diào)控骨肉瘤的遷移和侵襲[26]。SIRT6 通過(guò)抑制糖酵解相關(guān)基因的表達(dá)來(lái)調(diào)節(jié)葡萄糖代謝的穩(wěn)態(tài)。SIRT6 通過(guò)在HIF1α靶基因啟動(dòng)子上使H3K9 脫乙?;鸬紿IF1α轉(zhuǎn)錄活性的共抑制劑的作用,當(dāng)SIRT6 失活時(shí),HIF1α被激活,糖酵解基因啟動(dòng)子的乙?;c多個(gè)代謝基因的表達(dá)增加,并最終導(dǎo)致糖酵解的增加和線(xiàn)粒體呼吸的減少[17]。SIRT6與SIRT1 直接結(jié)合后可以去乙?;痟nRNPA1,從而抑制肝癌細(xì)胞糖酵解和增殖[27]。綜上所述,SIRT6在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中都起到了關(guān)鍵作用。
SIRT6 通過(guò)一些酶反應(yīng)尤其是去乙?;?,可以模擬染色質(zhì)在致密狀態(tài)(如SREBP1和PCSK9)來(lái)抑制基因表達(dá)[28]。有報(bào)道發(fā)現(xiàn)SIRT6 可以通過(guò)HIF1α來(lái)調(diào)控Pdk1、Ldha、Pfkl1 等糖酵解相關(guān)基因[13],從而調(diào)控腫瘤代謝重編程[17]。在此我們進(jìn)一步驗(yàn)證了SIRT6與HIF1α在體外有相互作用,為后續(xù)研究SIRT6與HIF1α在腫瘤中對(duì)腫瘤糖代謝的影響進(jìn)而影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。
圖6 GST-pulldown 驗(yàn)證GST-SIRT6與MYC-HIF1α的體外相互作用
本研究構(gòu)建了帶GST 標(biāo)簽的SIRT6 原核表達(dá)載體,并在IPTG誘導(dǎo)下表達(dá)了GST-SIRT6 融合蛋白,Western 印跡鑒定證實(shí)了目的蛋白的表達(dá)。該重組質(zhì)粒的構(gòu)建,為后續(xù)研究SIRT6在腫瘤中的發(fā)生發(fā)展制備了材料。