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環(huán)狀RNA ciRS-7在三陰性乳腺癌中的表達(dá)及其對細(xì)胞侵襲和遷移的影響

2019-04-03 06:02:24孟令嬌丁平安巨英超劉思樺常勝韓若琦潘爍劉飛谷麗娜桑梅香
腫瘤防治研究 2019年3期
關(guān)鍵詞:環(huán)狀細(xì)胞系引物

孟令嬌,丁平安,巨英超,劉思樺,常勝,韓若琦,潘爍,劉飛,谷麗娜,桑梅香

0 引言

乳腺癌是全球范圍內(nèi)女性發(fā)病率最高的一種惡性腫瘤,在女性癌癥相關(guān)死因中居第二位[1]。中國乳腺癌的發(fā)病率占世界總發(fā)病率的12.2%,死亡率高達(dá)9.6%,嚴(yán)重危害我國女性的身體健康和生活質(zhì)量[2]。三陰性乳腺癌(triple negative breast cancer, TNBC)是指雌激素受體(ER)、孕激素受體(PR)和人類表皮生長因子受體2(HER2)均呈陰性表達(dá)的乳腺癌,惡性程度高,容易發(fā)生轉(zhuǎn)移[3-4]。雖然目前對乳腺癌的診斷及治療已取得一定成效,但三陰性乳腺癌的患者在1~3年內(nèi)極易復(fù)發(fā),并且大多于治療后的5年內(nèi)死亡[5]。針對以上問題,快速、準(zhǔn)確地找到TNBC更有效的生物靶標(biāo)成為關(guān)鍵所在。

環(huán)狀RNA(circRNA)是生物體內(nèi)廣泛存在的一類具有調(diào)節(jié)功能的非編碼RNA[6]。它們一般頭尾連接形成環(huán)狀結(jié)構(gòu),因?yàn)椴缓?'末端帽和3'末端poly (A)尾而表達(dá)穩(wěn)定[7-8]。第一個(gè)環(huán)狀RNA ciRS-7 (CDR1as)由 Hansen等首次發(fā)現(xiàn),其可作為miR-7海綿在大腦中穩(wěn)定表達(dá)并發(fā)揮重要的基因調(diào)控功能[9]。最近有研究發(fā)現(xiàn),ciRS-7敲除后的體內(nèi)動(dòng)物模型出現(xiàn)了miR-7和miR-671表達(dá)失調(diào),最終影響哺乳動(dòng)物的大腦發(fā)育功能[10]。ciRS-7主要通過miRNA海綿的方式調(diào)節(jié)miR-7的表達(dá),進(jìn)而影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程[9]。越來越多的研究發(fā)現(xiàn)環(huán)狀RNA可調(diào)節(jié)人類多種腫瘤的進(jìn)展。三陰性乳腺癌作為一類高度惡性的腫瘤,其潛在的分子機(jī)制仍有待闡明,而且環(huán)狀RNA對其發(fā)病的調(diào)控作用尚未見報(bào)道。

本研究旨在探討環(huán)狀RNA ciRS-7在三陰性乳腺癌(TNBC)中的表達(dá)及其對細(xì)胞侵襲和遷移的影響,為尋找TNBC新型腫瘤生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo)奠定基礎(chǔ)。

表1 PCR引物序列及反應(yīng)條件Table1 PCR primer sequences and reaction requirement

1 資料與方法

1.1 臨床資料

選取2016年9月—2017年10月在河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院接受手術(shù)治療的乳腺癌患者132例,其中Luminal型89例、TNBC25例和HER2過表達(dá)型18例。所有患者均未接受術(shù)前化療和放療。所有腫瘤組織均由經(jīng)驗(yàn)豐富的病理學(xué)專家證實(shí)。所有患者均簽署了知情同意書,研究方案征得醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。

1.2 細(xì)胞株及主要試劑

人乳腺癌細(xì)胞株MDA-MB-231、MDAMB-453、BT-549和MCF-7購自美國ATCC細(xì)胞庫。RPMI 1640培養(yǎng)基、胰蛋白酶購自美國Gibco公司,胎牛血清購自上海依科賽生物制品有限公司。TRIzol購自美國Invitrogen公司,Platinum SYBR Super Mix試劑、Fu GENE HD轉(zhuǎn)染試劑及反轉(zhuǎn)錄試劑盒均購自美國Promega公司,PCR引物購自英濰捷基貿(mào)易有限公司。Transwell小室(孔徑3.0 μm)購自美國Corning公司,Matrigel基質(zhì)膠購自美國BD公司。ciRS-7 siRNA購自廣州銳博生物科技公司。

1.3 qRT-PCR法檢測ciRS-7在乳腺癌組織和細(xì)胞中的表達(dá)

乳腺癌組織和細(xì)胞用TRIzol裂解后提取總RNA,按照Promega反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書制備cDNA,然后進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增,以GAPDH為內(nèi)參,環(huán)狀RNA ciRS-7來源于CDR1as,于是本實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)兩種引物,一種為發(fā)散引物,可擴(kuò)增出環(huán)狀轉(zhuǎn)錄本ciRS-7,另一種為聚合引物,能擴(kuò)增CDR1as的線性轉(zhuǎn)錄本。然后以任意兩例TNBC組織和兩種TNBC細(xì)胞系(MDA-MB-231和BT-549)的cDNA和基因組DNA(gDNA)為模板,進(jìn)行普通PCR反應(yīng)。目的基因的引物序列及反應(yīng)條件見表1。利用各實(shí)驗(yàn)組目的基因及內(nèi)參基因的Ct值,按照公式ΔCt=Ct目的基因-Ct內(nèi)參基因,以2-ΔΔCt法計(jì)算目的基因的相對表達(dá)量。

1.4 RT-PCR法檢測ciRS-7在TNBC 細(xì)胞中的表達(dá)

如1.3提取細(xì)胞總RNA后反轉(zhuǎn)錄為cDNA,PCR擴(kuò)增,GAPDH為內(nèi)參,目的基因的引物序列及反應(yīng)條件,見表1。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳分離后進(jìn)行核酸顯色。

1.5 細(xì)胞轉(zhuǎn)染

人TNBC細(xì)胞株MDA-MB-231和BT-549用含10%胎牛血清、100 u/ml青霉素和100 μg/ml鏈霉素的RPMI 1640培養(yǎng)液培養(yǎng),于37℃、5%CO2體積分?jǐn)?shù)的培養(yǎng)箱中。按Fu GENE HD轉(zhuǎn)染試劑說明書方法將ciRS-7 siRNA轉(zhuǎn)染至MDA-MB-231和BT-549細(xì)胞中,并在兩種細(xì)胞中分別轉(zhuǎn)染control siRNA作為對照。

圖1 環(huán)狀RNA ciRS-7在乳腺癌組織和細(xì)胞中的表達(dá)Figure1 Expression of circular RNA ciRS-7 in breast cancer tissues and cell lines

1.6 劃痕實(shí)驗(yàn)檢測敲低ciRS-7后的細(xì)胞遷移能力

收集對數(shù)期的MDA-MB-231和BT-549細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞密度為5×105個(gè)每毫升,取2 ml接種于6孔板,并在6孔板背面劃5條平行線做標(biāo)記,24 h后用200 μl槍頭在細(xì)胞中劃2條垂直于背面平行線的直線,PBS沖洗2次,加入2 ml無胎牛血清的RPMI 1640培養(yǎng)液,于0、24 h在倒置顯微鏡下觀察細(xì)胞向劃痕中間遷移的距離并拍照,每組實(shí)驗(yàn)設(shè)3個(gè)平行孔。

1.7 Transwell小室檢測敲低ciRS-7后的細(xì)胞遷移和侵襲能力

取對數(shù)期生長的細(xì)胞懸液,加入Transwell小室的上室(2×105個(gè)/小室),小室上鋪膠檢測侵襲能力,不鋪膠者檢測遷移能力;下室加入600 μl含10%胎牛血清的RPMI 1640培養(yǎng)液,常規(guī)培養(yǎng)48 h,用棉簽擦凈上室細(xì)胞,PBS清洗后,結(jié)晶紫染色,倒置相差顯微鏡下(×200)觀察并拍照,隨機(jī)選取5個(gè)視野,計(jì)數(shù)穿膜細(xì)胞數(shù)。

1.8 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)

所有動(dòng)物實(shí)驗(yàn)均經(jīng)河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院動(dòng)物保護(hù)委員會(huì)批準(zhǔn)。選用4周齡BALB/c裸鼠,隨機(jī)分為2組(每組8只)。用si ciRS-7或?qū)φ誷iRNA轉(zhuǎn)染的MDA-MB-231細(xì)胞(每只小鼠5×106個(gè)細(xì)胞)分別經(jīng)尾靜脈注射BALB/ c裸鼠中。 然后將50 OD膽固醇修飾的siciRS-7或?qū)φ誷iRNA經(jīng)尾靜脈注射到BALB/c裸鼠中(每周2次)。2月后處死裸鼠,解剖肺組織。肉眼檢查肺的外觀,然后進(jìn)行HE染色,并在顯微鏡下觀察每個(gè)視野肺組織切片的轉(zhuǎn)移克隆數(shù)。

上述實(shí)驗(yàn)均重復(fù)3次。

1.9 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

本實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)應(yīng)用SPSS21.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)(±s)表示,兩組之間均數(shù)比較采用t檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 環(huán)狀RNA ciRS-7在TNBC組織和細(xì)胞中穩(wěn)定高表達(dá)

結(jié)果顯示,環(huán)狀轉(zhuǎn)錄本ciRS-7只能用發(fā)散引物在cDNA中檢測到,gDNA中未見擴(kuò)增產(chǎn)物;但是線性形式的CDR1as在cDNA和gDNA中均出現(xiàn)了擴(kuò)增產(chǎn)物,見圖1A、B。這說明本研究使用的環(huán)狀RNA ciRS-7引物的有效性,并進(jìn)一步驗(yàn)證了其在TNBC中具有一定的表達(dá)豐度。qRT-PCR檢測結(jié)果顯示,TNBC樣本中ciRS-7的相對表達(dá)量為(6.52±0.38),顯著高于Luminal型(1.56±0.17)(P<0.001)和HER2過表達(dá)型乳腺癌組織(2.27±0.66)(P<0.001)以及癌旁正常組織(0.83±0.09)(P<0.001),見圖1C。ciRS-7在TNBC細(xì)胞系MDA-MB-231和BT-549中高表達(dá),但在Lunimal型MCF-7細(xì)胞和HER2過表達(dá)型MDA-MB-453細(xì)胞中低表達(dá),見圖1D。qRT-PCR方法進(jìn)一步證實(shí)ciRS-7對RNase R的抗性,MDA-MB-231和BT-549細(xì)胞經(jīng)RNase R處理后CDR1線性基因表達(dá)明顯下降,而環(huán)狀形式的ciRS-7無明顯變化,見圖1E。綜上表明,環(huán)狀RNA ciRS-7在TNBC組織和細(xì)胞中穩(wěn)定高表達(dá)。

2.2 環(huán)狀RNA ciRS-7與乳腺癌患者臨床病理特征的關(guān)系

為方便分析數(shù)據(jù),將所有乳腺癌組織分類為ciRS-7高表達(dá)組和低表達(dá)組,使用132例乳腺癌患者組織中ciRS-7的平均相對表達(dá)量(4.82)作為所有乳腺癌患者的臨界閾值。132例乳腺癌患者中ciRS-7高表達(dá)組32例,低表達(dá)組100例;ciRS-7表達(dá)與患者年齡、腫瘤直徑和病理分級無關(guān)(均P>0.05),而與分子分型、腫瘤浸潤和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移明顯相關(guān)(均P<0.05),見表2。由此推斷ciRS-7可能與乳腺癌患者的病情進(jìn)展密切相關(guān),于是本實(shí)驗(yàn)重點(diǎn)研究高表達(dá)ciRS-7且惡性度高的TNBC型乳腺癌。

2.3 敲低ciRS-7可能抑制TNBC細(xì)胞的遷移能力

劃痕實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示siRNA介導(dǎo)的ciRS-7敲低組MDA-MB-231和BT-549細(xì)胞的遷移能力明顯被抑制,見圖2A;轉(zhuǎn)染ciRS-7 siRNA后兩株細(xì)胞的ciRS-7表達(dá)明顯降低 (均P=0.000),見圖2B,證明本研究中針對環(huán)狀RNA ciRS-7 siRNA干擾有效;實(shí)驗(yàn)組和對照組兩株細(xì)胞遷移面積變化百分率差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,見圖2C (均P=0.000)。綜上表明siRNA介導(dǎo)的ciRS-7敲低可能抑制TNBC細(xì)胞的遷移能力。

表2 ciRS-7表達(dá)與132例乳腺癌患者臨床病理學(xué)指標(biāo)的相關(guān)性Table2 Correlation between ciRS-7 expression and clinicopathological parameters of 132 breast cancer patients

2.4 敲低ciRS-7可能抑制TNBC細(xì)胞的遷移和侵襲能力

與si ctrl組相比,si ciRS-7處理組MDAMB-231和BT-549細(xì)胞的穿膜數(shù)目明顯減少,見圖3A。MDA-MB-231和BT-549中對照組和實(shí)驗(yàn)組的遷移和侵襲細(xì)胞數(shù)差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P=0.000),見圖3B、C。

圖2 沉默ciRS-7對MDA-MB-231和BT-549細(xì)胞遷移的影響Figure2 Effect of silencing ciRS-7 on migration of MDA-MB-231 and BT-549 cells

2.5 敲低ciRS-7可能抑制裸鼠體內(nèi)TNBC的肺轉(zhuǎn)移

通過尾靜脈注射建立MDA-MB-231細(xì)胞裸鼠肺轉(zhuǎn)移模型。與si ctrl組相比,si ciRS-7組裸鼠的肺轉(zhuǎn)移能力明顯較弱,見圖4A。顯微鏡下觀察si ciRS-7轉(zhuǎn)染組的裸鼠形成的肺轉(zhuǎn)移克隆數(shù)比si ctrl轉(zhuǎn)染組的明顯減少(P=0.000067),見圖4B。表明敲低ciRS-7可能抑制裸鼠體內(nèi)TNBC的肺轉(zhuǎn)移能力。

圖3 沉默ciRS-7對MDA-MB-231和BT-549細(xì)胞遷移和侵襲的影響Figure3 Effect of silencing ciRS-7 on migration and invasion of MDAMB-231 and BT-549 cells

圖4 沉默ciRS-7對裸鼠體內(nèi)TNBC的肺轉(zhuǎn)移的影響Figure4 Effect of silencing ciRS-7 on lung metastasis of TNBC in nude mice

3 討論

本課題組檢測了132例乳腺癌患者病理組織標(biāo)本及配對癌旁正常組織中ciRS-7的表達(dá)水平,分析ciRS-7與乳腺癌患者臨床病理特征之間的關(guān)系。另外檢測了乳腺癌細(xì)胞系中ciRS-7的表達(dá)水平,通過體外細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)檢測ciRS-7對TNBC細(xì)胞遷移和侵襲能力的影響,體內(nèi)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)探究敲低ciRS-7后TNBC發(fā)生肺轉(zhuǎn)移的變化,為尋找TNBC的新型腫瘤生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo)奠定基礎(chǔ)。

由于當(dāng)時(shí)研究技術(shù)的局限性,環(huán)狀RNA在發(fā)現(xiàn)之初被認(rèn)為是錯(cuò)誤剪接或內(nèi)含子套索過程中形成的副產(chǎn)物[11-13]。近年來隨著RNA測序(RNA-seq)技術(shù)的不斷發(fā)展,大量環(huán)狀RNA在小鼠、線蟲及人類細(xì)胞中被檢測到[14-15]。circRNA的功能包括與AGO蛋白結(jié)合調(diào)控mRNA的轉(zhuǎn)錄翻譯過程[6],與RNA結(jié)合蛋白相互作用參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控[16]。還有一類位于細(xì)胞核內(nèi)的環(huán)狀RNA通過抑制內(nèi)含子環(huán)化正向調(diào)控其宿主基因的表達(dá)[17]。但目前研究最為深入的還是其作為miRNA分子“海綿”發(fā)揮生物學(xué)功能。

有報(bào)道稱ciRS-7可作為miR-7的分子海綿參與多種癌癥相關(guān)通路影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展[18]。胃癌中ciRS-7表達(dá)上調(diào),進(jìn)而影響miR-7下游的PTEN/PI3K/AKT信號通路,促進(jìn)癌癥的發(fā)生發(fā)展[19]。食管鱗狀細(xì)胞癌中過表達(dá)的ciRS-7可通過靶向miR-876-5p,解除其對腫瘤相關(guān)抗原MAGE-A家族的抑制作用從而加速ESCC進(jìn)程[20]。結(jié)腸癌中ciRS-7可直接結(jié)合miR-7影響其下游的EGFR-RAF1信號通路,發(fā)揮關(guān)鍵的促癌作用[21]。ciRS-7還可通過充當(dāng)miRNA分子海綿在非小細(xì)胞肺癌和膀胱癌的進(jìn)展中發(fā)揮重要作用[22-23]。

然而,ciRS-7在乳腺癌中的研究未見報(bào)道。三陰性乳腺癌作為乳腺癌中具有高度轉(zhuǎn)移潛能的分子類型,其調(diào)控機(jī)制至今尚未闡明。本研究采用qRT-PCR技術(shù)檢測了4種乳腺癌細(xì)胞系中ciRS-7的表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)三陰性乳腺癌細(xì)胞系中ciRS-7的表達(dá)明顯高于其他類型的乳腺癌細(xì)胞系,這提示ciRS-7可能與TNBC的高侵襲轉(zhuǎn)移能力相關(guān)。

為此本課題組設(shè)計(jì)了細(xì)胞遷移和侵襲試驗(yàn)及裸鼠轉(zhuǎn)移瘤實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步探究ciRS-7對TNBC的侵襲和轉(zhuǎn)移能力的影響。結(jié)果表明環(huán)狀RNA ciRS-7在體內(nèi)和體外實(shí)驗(yàn)中均可促進(jìn)TNBC細(xì)胞的侵襲遷移水平。但其具體的分子機(jī)制尚未研究透徹,猜測其很可能通過miRNA分子海綿機(jī)制發(fā)揮調(diào)控作用,這有待在今后的研究中得到證實(shí)。

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