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miR-181a靶向作用CARF基因抑制胰腺癌細(xì)胞凋亡

2019-04-17 08:21:32李軍建陳鋼朱千東余正平
關(guān)鍵詞:拮抗劑激動(dòng)劑熒光素酶

李軍建,陳鋼,朱千東,余正平

(溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院 肝膽外科,浙江 溫州 325015)

胰腺癌的惡性程度高,現(xiàn)有治療手段未能有突破性進(jìn)展[1-3]。研究發(fā)現(xiàn),微小RNA(miRNA)在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用,如白血病、乳腺癌、肝癌、胃癌等領(lǐng)域相繼發(fā)現(xiàn)相關(guān)異常表達(dá)的miRNA及其靶基因[4-6]。有研究表明,一些miRNA在胰腺癌中同樣存在異常表達(dá)[7],但目前為止尚未明確發(fā)現(xiàn)其相應(yīng)的靶基因以及如何影響胰腺癌的發(fā)生發(fā)展。miR-181a是人類細(xì)胞中存在較為廣泛的一類miRNA,對(duì)維持胸腺細(xì)胞分化狀態(tài)發(fā)揮著關(guān)鍵作用[8-9]。胰腺癌miRNA表達(dá)譜研究顯示,miR-181a在胰腺癌組織中呈現(xiàn)顯著高表達(dá),提示miR-181a可能參與調(diào)控胰腺癌細(xì)胞的增殖凋亡[10]。miRNA數(shù)據(jù)庫(kù)靶基因預(yù)測(cè)提示ADP核糖基化輔助因子(collaborator of ADP-ribosylation factor,CARF)基因是miR-181a可能的作用靶點(diǎn),該基因可通過多條途徑發(fā)揮上調(diào)p53的作用,而p53通路是胰腺癌發(fā)病機(jī)制的重要組成部分[11-12]。本研究觀察miR-181a與CARF基因的相互作用,探討兩者之間是否存靶向關(guān)系及其在胰腺癌的發(fā)生發(fā)展中的作用。

1 材料和方法

1.1 材料 胰腺癌細(xì)胞株(Panc I)、正常胰腺細(xì)胞株(CCC-HPE-2)由浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院肝膽胰外科重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室惠贈(zèng);胰腺癌及正常胰腺組織標(biāo)本均取自于溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院肝膽胰外科臨床手術(shù)切除標(biāo)本;雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)(Dual-LuciferaseReporter Assay System),包括質(zhì)粒pGL-3/Control、pRL-TK,各種內(nèi)切酶及連接酶,脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑盒等均購(gòu)自美國(guó)Promega公司。細(xì)胞培養(yǎng)基及相關(guān)試劑:DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清、RPMI1640培養(yǎng)基、100×青鏈霉素(雙抗)溶液等均購(gòu)自美國(guó)Gibico公司。MTT試劑盒購(gòu)自美國(guó)Sigma公司。DNA純化試劑盒和質(zhì)粒抽提試劑盒購(gòu)自美國(guó)Qiagen公司,PCR相關(guān)引物合成和基因測(cè)序均委托上海生工公司協(xié)助完成。miR-181a拮抗劑(miR-181a inhibitor)和激動(dòng)劑(hsa-miR-181a)及空白對(duì)照(miRNA Neg-tive Control)委托上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司合成。本研究經(jīng)過本院倫理委員會(huì)審核批準(zhǔn)。

1.2 方法

1.2.1 miRNA的提取及miRNA-181a的定量檢測(cè):采用mirVanaTMmiRNA Isolation Kit提取正常胰腺細(xì)胞株CCC-HPE-2和胰腺癌細(xì)胞株P(guān)anc I(各8個(gè)樣本),及正常胰腺組織和胰腺癌組織(各20例)中的總RNA(富集miRNA),依照Tiangen試劑盒說明進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)miR-181a,以U6為內(nèi)參,其引物序列代號(hào)MS00007497,hsa-miR-181a引物序列代號(hào)MS00003213(均購(gòu)自美國(guó)Ambion公司)。反應(yīng)條件為95 ℃、30 s預(yù)變性,95 ℃、5 s,60 ℃、34 s,40個(gè)循環(huán),95 ℃、15 s,60 ℃、1 min,95 ℃、15 s。PCR產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳,凝膠成像后做定量分析。

1.2.2 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染及分組:常規(guī)培養(yǎng)Panc I細(xì)胞,轉(zhuǎn)染前24 h將細(xì)胞接種于24孔板[(3~5)×105個(gè)細(xì)胞/孔],更換孔板中培養(yǎng)基為無血清培養(yǎng)基,當(dāng)細(xì)胞匯集度約80%時(shí)開始轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染完成4 h后再更換成含胎牛血清的培養(yǎng)基,測(cè)定轉(zhuǎn)染效率。分為3組:按照通過Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染miR-181a inhibitor拮抗劑(PMI組),miRNA Negative Control陰性對(duì)照(PMNC組)和單純質(zhì)粒的空白對(duì)照(NC組)。胰腺癌組織標(biāo)本為C組,正常胰腺組織為N組,CCCHPE-2細(xì)胞為CCC-HPE-2組。

1.2.3 MTT法檢測(cè)細(xì)胞增殖能力:將處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的3組細(xì)胞:NC組、PMNC組、PMI組置于37 ℃、飽和濕度、5% CO2條件下,以每孔細(xì)胞數(shù)約為5×104的量接種于相應(yīng)的96孔板。常規(guī)培養(yǎng)24、48、72 h后,每孔分別加入20 μL 5 mg/mL MTT試劑,同樣條件再孵育4 h,每孔加入100 μL DMSO,利用酶標(biāo)儀測(cè)定490 nm處吸光度值,上述實(shí)驗(yàn)分別重復(fù)3次。

1.2.4 制備含有CARF 3’-UTR片段的pGL-3轉(zhuǎn)染質(zhì)粒:采用上游引物P1(5’-ATCATACGCGTTGAATAAACCA CATCAAAGGAAAGG-3’)以及下游引物P2(5’-TGTAAGAT CTTTACGGGCAACATTTTTAAAACC-3’),用PCR法從全基因組DNA中擴(kuò)增完整的CARF 3’-UTR片段P2,將純化的PCR產(chǎn)物與TAKARA pMD18-T vector連接。將包含CARF 3’-UTR片段的pGL-3質(zhì)粒和PMD-18T載體質(zhì)粒分別進(jìn)行雙酶切反應(yīng),然后混勻,離心后37 ℃常溫環(huán)境下酶切過夜。所得酶切產(chǎn)物在2%瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳(電壓為5 V/cm),電泳完成后將凝膠上的目的片段切下,凝膠DNA回收。所得純化pGL-3質(zhì)粒片段(60 ng/μL)和CARF 3’-UTR片段(30 ng/μL)通過T4連接酶連接。

1.2.5 熒光素酶檢測(cè)miR-181a拮抗劑和激動(dòng)劑對(duì)miR-181a水平的影響:采用Trans Fast脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑盒將質(zhì)粒轉(zhuǎn)染入胰腺癌細(xì)胞Panc I,以不包含CARF 3’-UTR序列的PGL3-control質(zhì)粒作為陰性對(duì)照,單純脂質(zhì)體為空白對(duì)照,具體分組情況如下:Panc I A:PGL3-control;Panc I B:PGL3-CARF 3’-UTR;Panc I C:PGL3-CARF 3’-UTR+10 nmol/L拮抗劑(miR-181a inhibitor);Panc I D:PGL3-CARF 3’-UTR+10 nmol/L激動(dòng)劑(hsa-miR-181a);Panc I E:PGL3-CARF 3’-UTR+30 nmol/L激動(dòng)劑(hsa-miR-181a)。

上述每種處理分別設(shè)6個(gè)重復(fù)孔,通過雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng),檢測(cè)各組細(xì)胞的熒光素酶活性,結(jié)果以相對(duì)于內(nèi)對(duì)照質(zhì)粒pRL-TK的百分比表示。

1.2.6 激動(dòng)劑及拮抗劑對(duì)胰腺癌細(xì)胞中miR-181a表達(dá)水平的影響:設(shè)定3個(gè)實(shí)驗(yàn)組:PM組細(xì)胞(轉(zhuǎn)染10 nmol/L激動(dòng)劑hsa-miR-181a上調(diào)miR-181a水平),PMI組細(xì)胞(轉(zhuǎn)染10 nmol/L抑制劑miR-181a inhibitor下調(diào)miR-181a水平)和對(duì)照組PNC組細(xì)胞(未處理),應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)轉(zhuǎn)染后各實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞中miR-181a的表達(dá)情況,檢測(cè)方法及條件參照1.2.1。

1.2.7 Western blot檢測(cè)miR-181a對(duì)CARF蛋白表達(dá)水平的影響:應(yīng)用Western blot檢測(cè)3組采用不同干預(yù)手段的細(xì)胞內(nèi)CARF基因的蛋白表達(dá)水平:PM組、PMI和PNC組。消化收集上述各組細(xì)胞,細(xì)胞裂解液提取總蛋白,制膠后總蛋白上樣50 mg,電泳跑膠(濃縮膠80 mA、20 min,分離膠120 mA、1 h),結(jié)束后取出凝膠,300 mA電轉(zhuǎn)約2 h,轉(zhuǎn)移蛋白至PVDF上,脫脂奶粉封閉轉(zhuǎn)移膜l h后加一抗,4 ℃過夜,TBST漂洗4次,然后加二抗,室溫孵育1.5 h,再次TBST洗膜4次,完成后電化學(xué)發(fā)光顯影。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理方法 采用SPSS18.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。2組間比較用t檢驗(yàn);3組間不同時(shí)間點(diǎn)比較用重復(fù)測(cè)量方差分析,兩兩比較用S-N-K法。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 胰腺癌中miR-181a的表達(dá)水平 C組中的miR-181a的表達(dá)量明顯高于N組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(0.015±0.010 vs. 0.003±0.002,P<0.05)。胰腺癌Panc I細(xì)胞中的miR-181a表達(dá)水平明顯高于CCCHPE-2組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(0.016±0.004 vs.0.006±0.002,P<0.05)。

2.2 Panc I細(xì)胞質(zhì)粒轉(zhuǎn)染效率 轉(zhuǎn)染72 h后超過80%的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞表達(dá)綠色熒光蛋白,可見綠色熒光,轉(zhuǎn)染效果較佳,見圖1。

2.3 拮抗劑miR-181a inhibitor下調(diào)胰腺癌細(xì)胞的增殖水平 PMNC組各時(shí)間點(diǎn)間的細(xì)胞生長(zhǎng)抑制率差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);PMI組的Panc I細(xì)胞在24、48、72 h等3個(gè)不同的時(shí)間點(diǎn)生長(zhǎng)均受到明顯抑制,與PMNC組和NC組比較各時(shí)間點(diǎn)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見圖2。

圖1 脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染Panc I細(xì)胞后顯示綠色熒光(×100)

圖2 轉(zhuǎn)染后3組各時(shí)間點(diǎn)Panc I細(xì)胞生長(zhǎng)情況比較

2.4 miR-181a對(duì)重組質(zhì)粒PGL3-CARF 3’-UTR熒光素酶活性的影響 Panc I A組細(xì)胞轉(zhuǎn)染空白對(duì)照質(zhì)粒PGL3-control后不影響熒光素酶活性而使其正常表達(dá)。Panc I B組細(xì)胞轉(zhuǎn)染PGL3-CARF3’-UTR與Panc I A組比熒光素酶活性差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。Panc I C組細(xì)胞同時(shí)加入拮抗劑miR-181a inhibitor,細(xì)胞內(nèi)miR-181a受抑制,熒光素酶活性差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。與Panc I A組比,Panc I D加入10 nmol/L激動(dòng)劑hsa-miR-181a,細(xì)胞內(nèi)miR-181a水平上升,熒光素酶活性明顯下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);與Panc I A組比,Panc I E加入30 nmol/L激動(dòng)劑hsa-miR-181a,細(xì)胞內(nèi)miR-181a水平上升,熒光素酶活性明顯下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。Panc I D與Panc I E 2組轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒和不同劑量的激動(dòng)劑hsa-miR-181a,隨著激動(dòng)劑劑量的增加miR-181a也隨之上升,熒光素酶活性明顯下降,兩者呈負(fù)相關(guān)(r=-0.92,P<0.05)。見圖3。

2.5 激動(dòng)劑及拮抗劑對(duì)胰腺癌細(xì)胞中miR-181a表達(dá)水平的影響 PM組細(xì)胞miR-181a表達(dá)水平較PNC組顯著升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(0.039±0.004 vs.0.015±0.004,P<0.05);而PMI組細(xì)胞miR-181a表達(dá)水平較PNC組顯著降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(0.008±0.002 vs. 0.015±0.004,P<0.05)。

圖3 miR-181a對(duì)重組質(zhì)粒PGL3-CARF3’-UTR熒光素酶活性的影響

2.6 miR-181a水平對(duì)CARF蛋白表達(dá)的影響 與PNC組比,PM組CARF蛋白表達(dá)明顯減少,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);與PNC組比,PMI組CARF蛋白表達(dá)明顯加強(qiáng),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見圖4。

圖4 miR-181a對(duì)CARF蛋白表達(dá)水平的影響

3 討論

本研究證實(shí)胰腺癌組織/細(xì)胞中miR-181a的表達(dá)明顯高于正常胰腺組織/細(xì)胞;以往研究表明大多數(shù)miRNA通過改變腫瘤細(xì)胞的增殖凋亡情況,從而影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展[13],結(jié)合miR-181a在胰腺癌中的高表達(dá),采用miR-181a的拮抗劑miR-181a inhibitor轉(zhuǎn)染胰腺癌細(xì)胞后,腫瘤細(xì)胞的增殖活性得到明顯抑制。miR-181a inhibitor的序列與miR-181a互補(bǔ),可以與細(xì)胞內(nèi)成熟miR-181a序列結(jié)合,競(jìng)爭(zhēng)靶點(diǎn),從而阻斷miR-181a下調(diào)其靶基因發(fā)揮相應(yīng)功能。MTT結(jié)果表明轉(zhuǎn)染miR-181a inhibitor后,胰腺癌細(xì)胞增殖能力顯著下降,轉(zhuǎn)染后24、48、72 h等3個(gè)時(shí)間點(diǎn),PMI組的細(xì)胞生長(zhǎng)抑制率與對(duì)照組相比差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

由此考慮miR-181a可能通過靶向作用于某種抑癌基因,抑制其表達(dá),從而發(fā)揮提高胰腺癌細(xì)胞增殖能力的作用。當(dāng)胰腺癌細(xì)胞中miR-181a水平下調(diào),其相關(guān)抑癌基因得到釋放并明顯抑制腫瘤細(xì)胞的增殖。本研究結(jié)果證實(shí)上述猜想,miR-181a受抑制的PMI組胰腺癌細(xì)胞在不同時(shí)點(diǎn)其增殖能力均明顯下降。組內(nèi)各時(shí)間點(diǎn)的抑制率變化趨勢(shì)提示PMI組的抑制率與作用時(shí)間呈正相關(guān),48 h內(nèi)抑制效果增加較為顯著,但隨后趨勢(shì)有所減緩。由此推測(cè)miR-181a inhibitor的拮抗效果隨時(shí)間的推移持續(xù)加強(qiáng),但增速48 h后有所減緩。這一現(xiàn)象的出現(xiàn),可能與轉(zhuǎn)染的miR-181a拮抗劑濃度不夠,或者胰腺癌細(xì)胞本身存在某種代償機(jī)制,抑或miR-181a拮抗劑的轉(zhuǎn)染存在一定的時(shí)效性,難以長(zhǎng)期穩(wěn)定地在細(xì)胞中發(fā)揮作用有關(guān),有待于進(jìn)一步深入探討。

雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)的作用原理是:構(gòu)建一個(gè)將靶啟動(dòng)子的特定片段插入到熒光素酶表達(dá)序列前方的報(bào)告基因質(zhì)粒,將要檢測(cè)的轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)質(zhì)粒與報(bào)告基因質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染相關(guān)的細(xì)胞系,如果此轉(zhuǎn)錄因子能夠激活靶啟動(dòng)子,則熒光素酶基因就會(huì)表達(dá),熒光素酶的表達(dá)量與轉(zhuǎn)錄因子的作用強(qiáng)度成正比。加入特定的熒光素酶底物,熒光素酶與底物反應(yīng)產(chǎn)生熒光,通過檢測(cè)熒光的強(qiáng)度可以測(cè)定熒光素酶的活性,從而判斷轉(zhuǎn)錄因子是否能與此靶啟動(dòng)子片段有作用[14]。將CARF基因3’-UTR片段克隆在熒光素酶報(bào)告基因的下游,若該片段序列內(nèi)確實(shí)存在miR-181a的作用靶點(diǎn),兩者結(jié)合可降低熒光素酶活性,否則熒光素酶活性將不受影響。而作為內(nèi)對(duì)照的海馬腎熒光報(bào)告質(zhì)粒pRL-TK不受上述反應(yīng)的影響,始終能夠穩(wěn)定表達(dá)。在生物信息學(xué)靶基因預(yù)測(cè)的基礎(chǔ)上,采用雙熒光素酶報(bào)告基因技術(shù)證實(shí)CARF基因3’-UTR是否存在miR-181a的作用靶點(diǎn)。本研究中轉(zhuǎn)染空白對(duì)照質(zhì)粒PGL3-control的Panc I A組細(xì)胞不影響熒光素酶活性。Panc I B組細(xì)胞轉(zhuǎn)染PGL3-CARF3’-UTR后,因Panc I胰腺癌細(xì)胞本身存在miR-181a表達(dá),其與質(zhì)粒相互作用后導(dǎo)致熒光素酶活性有所下降。當(dāng)Panc I C組細(xì)胞加入拮抗劑miR-181a inhibitor,因細(xì)胞本身的miR-181a被抑制,熒光素酶活性明顯上升;Panc I D與Panc I E兩組細(xì)胞加入激動(dòng)劑hsa-miR-181a,提高了胰腺癌細(xì)胞中的miR-181a水平,熒光素酶活性隨之受到明顯抑制。上述研究結(jié)果表明miR-181a和CARF基因確實(shí)存在靶向關(guān)系,即CARF基因3’-UTR片段中包含miR-181a的作用靶點(diǎn)。接著還通過研究miR-181a對(duì)CARF蛋白表達(dá)水平的調(diào)控情況,進(jìn)一步證實(shí)上述靶向關(guān)系。通過轉(zhuǎn)染miR-181a激動(dòng)劑和拮抗劑改變胰腺癌細(xì)胞中miR-181a的水平,Western blot檢測(cè)相應(yīng)細(xì)胞組CARF蛋白表達(dá)水平的變化,實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示細(xì)胞中miR-181a的水平與CARF蛋白表達(dá)水平呈顯著負(fù)相關(guān)。

本研究在明確miR-181a在胰腺癌中存在顯著高表達(dá)的基礎(chǔ)上預(yù)測(cè)了miR-181a和CARF的靶向關(guān)系,在獲得miR-181a與CARF基因相關(guān)性的初步證據(jù)的前提下,提出“miR-181a-CARF-p53-胰腺癌”調(diào)控途徑的猜想,并從多個(gè)角度對(duì)該假設(shè)進(jìn)行驗(yàn)證。隨著miRNA重要性的逐步體現(xiàn),通過外源性干預(yù)措施改變惡性腫瘤細(xì)胞中各種miRNA水平,影響其相關(guān)靶基因的表達(dá)情況,從而抑制腫瘤的發(fā)生發(fā)展應(yīng)該被考慮作為一個(gè)比較有前景的治療策略[15-17]。能否利用miR-181a和CARF的靶向關(guān)系尋找治療胰腺癌的新途徑,還有待于通過動(dòng)物體內(nèi)實(shí)驗(yàn)等相關(guān)研究進(jìn)一步驗(yàn)證。

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