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花生根際多功能固氮菌的分離及其耐鹽堿特性研究

2019-05-17 09:36姜煥煥祁佩時(shí)王通遲曉元陳明娜
生物技術(shù)通報(bào) 2019年3期
關(guān)鍵詞:固氮菌脫氨酶鹽堿

姜煥煥 祁佩時(shí) 王通 遲曉元 陳明娜

(1. 山東省花生研究所,青島 266100;2. 哈爾濱工業(yè)大學(xué)環(huán)境學(xué)院,哈爾濱 150001)

土壤鹽堿化是影響農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的重要環(huán)境因素之一。鹽堿土壤中無(wú)機(jī)鹽含量豐富,有機(jī)質(zhì)含量低,不適宜施用無(wú)機(jī)肥;而且由于鹽離子的存在,會(huì)限制植物對(duì)氮、磷、鉀等營(yíng)養(yǎng)元素的吸收,這進(jìn)一步造成鹽堿土壤中植物可利用營(yíng)養(yǎng)元素的缺失[1]?;ㄉˋrachis hypogaeaL.)是重要的油料和經(jīng)濟(jì)作物,主要生長(zhǎng)在干旱和半干旱地區(qū)[2]?;ㄉ鷮儆谥卸饶望}的植物,鹽分脅迫對(duì)花生生長(zhǎng)發(fā)育的各個(gè)方面都會(huì)產(chǎn)生不利影響[3]。因而,提高鹽堿地花生營(yíng)養(yǎng)元素的獲得,進(jìn)而提高花生的耐鹽堿性,增加鹽堿地花生產(chǎn)量是很有必要的。

根際促生菌(PGPR)是一類生存于植物根際土壤,同時(shí)兼具固氮、溶磷和分泌生長(zhǎng)素的能力,能夠提高植物抗逆性,促進(jìn)植物生長(zhǎng)的功能菌群[4]。此外,根際促生菌能夠作為微生物肥料,提高土壤肥力,改善土壤生態(tài)環(huán)境[5-6]。根際促生菌與植物根系的相互作用是一個(gè)復(fù)雜的動(dòng)態(tài)過程,受土壤類型和植物根系分泌物等多種因素影響[7]。Arora等[8]研究發(fā)現(xiàn),分離自鹽堿土壤中的PGPR,具有較強(qiáng)的定值能力及鹽堿耐受性,能夠促進(jìn)鹽堿環(huán)境條件下植物的生長(zhǎng)。近年來,鹽堿地中多種植物根際促生菌的分離與應(yīng)用相繼被報(bào)道[9-10]。目前,不同土壤環(huán)境中的花生根際促生菌得到了分離。如姜瑛等[11]從灰潮土中的花生根際中鑒定出具有固氮解磷功能的促生菌。劉曄等[12]從砂質(zhì)潮土中的根際中篩選出具有固氮、解磷、解鉀的促生菌,并成功促進(jìn)了花生在砂質(zhì)潮土中的生長(zhǎng)。但是,關(guān)于鹽堿地花生根際多功能固氮菌鮮有報(bào)道。

鹽堿地的特殊理化性質(zhì)導(dǎo)致非土著功能菌的定值能力、鹽堿耐受能力及功能活性下降。因此分離自鹽堿地花生根際的促生菌能夠最大化發(fā)揮其促進(jìn)鹽堿條件下花生的生長(zhǎng)作用。本實(shí)驗(yàn)首次選取黃河三角洲沿海地區(qū)花生根際土壤為研究對(duì)象,篩選鑒定出具有固氮、溶磷及分泌IAA能力的功能菌株,并對(duì)其鹽堿耐受性能進(jìn)行了測(cè)定。該結(jié)果豐富了微生物肥料生產(chǎn)的菌種庫(kù),對(duì)通過微生物改良鹽堿地,提高花生產(chǎn)量具有重要意義。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 土壤樣品 土壤樣品采自山東省東營(yíng)市黃河三角洲區(qū)域的鹽堿地花生根際(北緯37°05'-37°40',東經(jīng) 118°03'-118°38'),定 10 個(gè)取樣點(diǎn),每個(gè)取樣點(diǎn)間隔1 m,刮去土壤表層的根茬殘?bào)w等,用滅菌土鉆采集0-20 cm 的土樣,混勻,放入無(wú)菌密封袋內(nèi),帶回實(shí)驗(yàn)室后4℃,保存?zhèn)溆谩?/p>

1.1.2 培養(yǎng)基 阿須貝固氮菌培養(yǎng)基(Ashby):KH2PO40.2 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,NaCl 0.2 g,CaCO35.0 g,甘露醇 10 g,CaSO4·2H2O 0.1 g,蒸餾水 1 000 mL,pH 值 7.0-7.5。

無(wú)機(jī)磷培養(yǎng)基(TPM):葡萄糖10 g,(NH4)2SO40.5 g,NaCl 0.3 g,KCl 0.3 g,MgSO4·7H2O 0.3 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.03 g,MnSO4·H2O 0.03 g,Ca3(PO4)25.0 g,定容至 1 000 mL,pH 值 7.0-7.5。分別以FePO4和ALPO3代替Ca3(PO4)2不溶性P源。

有機(jī)磷培養(yǎng)基(YM):以0.5 g的卵磷脂代替無(wú)機(jī)磷培養(yǎng)基中的Ca3(PO4)2。

牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(LB):牛肉膏10 g,蛋白 胨 10 g,NaCl 5 g, 定 容 至 1 000 mL,pH 值7.0-7.5。

無(wú) 氮 培 養(yǎng) 基: 蔗 糖 10 g,NaCl 0.12 g,K2HPO4·3H2O 0.5 g,CaCO31 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,蒸餾水定容至1 000 mL,pH值7.0-7.2。

DF培養(yǎng)基:葡萄糖2.0 g,葡萄糖酸鈉 2.0 g, 檸 檬 酸 2.0 g,KH2PO44.0 g,Na2HPO46.0 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,(NH4)2SO42.0 g,組分一、組分二溶液各0.1 mL,蒸餾水定容至1 000 mL,pH值7.0-7.2;其中組分一:H3BO310 mg,MnSO4·H2O 11.19 mg,ZnSO4·7H2O 124.6 mg,CuSO4·5H2O 78.22 mg,10 mg,滅菌蒸餾水 100 mL;組分二:FeSO4·7H2O 100 mg 溶于10 mL滅菌蒸餾水中。

ADF培養(yǎng)基:ACC溶于滅菌蒸餾水,0.22 um濾膜過濾除菌,然后加到不含(NH4)2SO4的DF培養(yǎng)基內(nèi),使其終濃度為3.0 mmol/L。

1.2 方法

1.2.1 菌株的分離純化 采用Ashby培養(yǎng)基進(jìn)行固氮菌的分離,稱取5 g土樣,加入裝有45 mL的無(wú)菌水的三角瓶中震蕩30 min,取1 mL上清液,加入到裝有9 mL無(wú)菌水的試管中,逐級(jí)稀釋至10-6濃度。取10-3-10-5的濃度梯度0.1 mL涂布于Ashby平板培養(yǎng)基上,30℃倒置培養(yǎng)3 d直至出現(xiàn)單菌落,然后進(jìn)行分離純化,直至得到純菌落。將所得純菌落接種于LB斜面培養(yǎng)基,4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.2 16S rDNA 的擴(kuò)增與測(cè)序 將固氮菌接種于LB液體培養(yǎng)基中,震蕩培養(yǎng)(28℃,180 r/min)培養(yǎng)24 h,按照細(xì)菌DNA提取試劑盒步驟,提取固氮菌的DNA,利用細(xì)菌通用引物16s-F27(5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') 和 16s-R1387(5'-GGGCGGWGTGTACAAGGC-3')為引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物膠回收后,上海生工測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果提交NCBI進(jìn)行同源序列的比對(duì)。

1.2.3 固氮酶活性測(cè)定 利用氣相色譜結(jié)合乙炔還原法測(cè)定固氮酶活性。將待測(cè)菌株接種于Ashby 培養(yǎng)基中培養(yǎng)48 h,取1 mL 接種于的含10 mL Ashby液體培養(yǎng)基的60 mL 磨口小口瓶中,再培養(yǎng)24 h,然后抽出5 mL氣體,再注入5 mL 乙炔氣體,繼續(xù)培養(yǎng)24 h,上機(jī)檢測(cè)。

1.2.4 1-氨基-環(huán)丙烷-1-羧酸(ACC)脫氨酶 將保存在-80℃的固氮菌株活化,按1%(V/V)的比例將活化后的菌液接種于無(wú)氮培養(yǎng)基中,28℃條件下過夜培養(yǎng),離心(1 200 r/min,10 min),收集菌體,用5 mL的DF培養(yǎng)基洗滌菌體2次,將菌體重懸于5 mL的ADF培養(yǎng)基中,28℃條件下過夜培養(yǎng),離心(1 200 r/min,10 min),收集菌體。0.1 mol/L的Tris-HCl(pH 7.6)緩沖液洗沖洗菌體2次,再次將菌體重懸于600 μL的 0.1 mol/L的Tris-HCl(pH 8.5)緩沖液,加入30 μL的甲苯。取200 μL提取液與20 μL的0.5 mol/L的ACC溶液混合,30℃條件下孵育15 min,然后加300 μL的0.2% 的2,4-二硝基苯肼,30℃條件下孵育30 min,最后,加入2 mL的2 mol/L NaOH 溶液,利用紫外分光光度計(jì)測(cè)吸光率(OD=540 nm)。以牛血清蛋白為標(biāo)準(zhǔn),以每分鐘形成1 μmol α-酮丁酸鹽為一個(gè)酶活單位。

1.2.5 解磷特性的測(cè)定 挑取保存在LB斜面的固氮菌株,接種于LB液體培養(yǎng)基中,28℃培養(yǎng)24 h。調(diào)節(jié)菌懸液濃度至1×108CFU/mL,按1%(V/V)的比例將待測(cè)菌株分別接種于含有不同P源無(wú)機(jī)磷培養(yǎng)基(TPM)和有機(jī)磷培養(yǎng)基(YM)的三角瓶中,振蕩培養(yǎng)(28℃,180 r/min)3 d,每株菌設(shè)3 次重復(fù),以不接菌作為空白對(duì)照。采用鉬銻抗比色法測(cè)定發(fā)酵液中可溶性磷含量(OD=600 nm)。pH計(jì)測(cè)定培養(yǎng)基pH值的變化[13]。

1.2.6 分泌IAA量測(cè)定 將待測(cè)菌株接種于含有200 μg/mL色氨酸的LB培養(yǎng)基中,在28℃條件下180 r/min,培養(yǎng) 3 d。離心(1 200 r/min,10 min),得到上清液,取5 mL的上清液加入到10 mL的試管中,然后加入等體積的salkowski比色液(0.5 mol/L的氯化鐵10 mL加入到35%的高氯酸中,總體積500 mL)避光靜止30 min顯色,測(cè)其分光光度,以空白組作為對(duì)照(OD=530 nm)。

1.2.7 耐鹽堿水平測(cè)定 分別配制含不同NaCl濃度(0、0.5、1、1.2和1.5 mol/L)和不同起始pH 值(7、8、9和10)的LB液體培養(yǎng)基中,各濃度設(shè)3次重復(fù)。將供試菌株接種到LB液體培養(yǎng)基中,30℃,過夜培養(yǎng),調(diào)節(jié)菌懸液濃度為1× 108CFU/mL,制成接種液,按1% 的接種量(100 mL 培養(yǎng)基接種1 mL接種液),分別轉(zhuǎn)接至含不同NaCl濃度及不同pH值的LB液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)(28℃,180 r/min)培養(yǎng)3 d,紫外分光光度計(jì)下測(cè)定其OD值(OD=600 nm),以O(shè)D值的大小表示其在各水平下的生長(zhǎng)繁殖情況。

2 結(jié)果

2.1 菌株篩選鑒定

對(duì)土壤樣品稀釋后進(jìn)行涂布實(shí)驗(yàn),初步得到菌株58株,利用乙炔還原法測(cè)定所分離的固氮菌株的固氮酶活,其中具有固氮能力的共22株,其固氮酶活性在 125.82-346.32 nmol C2H4/(h·mL)(表1),以16s-F27和16s-R1387為引物對(duì)菌株擴(kuò)增及16S rDNA 正向測(cè)序,得到的序列通過BLAST與GenBank 數(shù)據(jù)庫(kù)中序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果如圖1所示。這些菌株屬于4個(gè)菌屬,其中,13株菌株屬于Stenotrophomonasspp.,占總數(shù)的59%,為優(yōu)勢(shì)菌群;6株菌株屬于Enterobacterspp.,2株菌株屬于Pseudomonassp.,1 株屬于Aeromonassp.。

2.2 IAA含量

利用比色法對(duì)分離得到的22株菌株分泌IAA特性進(jìn)行測(cè)定,培養(yǎng)基各菌株的顯色反應(yīng)與分泌IAA的量成正相關(guān),即顏色反應(yīng)越明顯,其產(chǎn)生IAA的量越大。結(jié)果(表1)顯示,10株可以分泌IAA,分泌量在1.36-17.80 μg/mL,占供試菌株的54%。CNJ-1的分泌量最小,其分泌量為1.36 μg/mL;濃度大于10 μg/mL的菌株只有2株,分別是GNJ-2(12.90 μg/mL)和 GNJ-32(10.23 μg/mL)。

圖1 基于16S DNA 基因序列構(gòu)建固氮菌進(jìn)化樹

表1 固氮菌株的固氮酶活及分泌IAA量

2.3 產(chǎn)ACC脫氨酶特性

ACC脫氨酶活性測(cè)定結(jié)果(圖2)顯示,所有菌株均具有產(chǎn)ACC脫氨酶的能力,其產(chǎn)量為0.12-1.26 U/mg。其中,ACC脫氨酶活性最大的菌株為GNJ27(1.26 U/mg), 其 次 為 GNJ32(1.12 U/mg),這兩株菌均屬于Stenotrophomonasspp.。ACC脫氨酶活性最小的為Aeromonassp. GNJ1,其產(chǎn)量為0.12 U/mg。

圖2 菌株ACC脫氨酶活性測(cè)定

2.4 溶磷特性

液體培養(yǎng)測(cè)定菌株的溶磷性,結(jié)果如圖3所示。所篩選的菌株均具有溶解磷酸三鈣的能力,其溶磷量1.45-53.58 mg/L之間。其中,編號(hào)GNJ-4,GNJ-13,GNJ-14,GNJ-16,GNJ-18,GNJ-20,GNJ-27,GNJ-32,GNJ-51溶磷酸三鈣的能力相對(duì)較高,培養(yǎng)基內(nèi)可溶性磷含量都在10 mg/L以上,而其他的菌株溶磷量大多在1-10 mg/L左右,相對(duì)較少。而且隨著培養(yǎng)基可溶性磷含量的增加,培養(yǎng)基的pH有所下降,其下降范圍由初始的7下降到3.14。以磷酸鐵為不溶性P源時(shí),培養(yǎng)基內(nèi)可溶性磷含量為1.45-8.27 mg/L。其中編號(hào)GNJ-4,GNJ-16,GNJ-20,GNJ-27,GNJ-28,GNJ-40的能力較高,溶磷含量在5 mg/L以上,而其余菌株大多在2-4 mg/L左右波動(dòng)。當(dāng)以磷酸鋁為不溶性磷源時(shí),培養(yǎng)基內(nèi)可溶性磷含量1.1-22.82 mg/L,其中編號(hào)GNJ-2,GNJ-27,GNJ-51的溶磷能力相對(duì)較高,其余菌株大多在6 mg/L左右。所有培養(yǎng)基的pH均隨著培養(yǎng)基內(nèi)可溶性磷含量增加而下降。這說明,固氮菌在溶磷的過程中其可以釋放某些酸性物質(zhì),進(jìn)而降低培養(yǎng)基的pH。

圖3 固氮菌株溶解難溶性磷

2.5 耐鹽堿特性

選取10株具有固氮、溶磷及分泌IAA特性的多功能菌株進(jìn)行耐鹽堿實(shí)驗(yàn)。結(jié)果(圖4)表明,不同菌種的鹽耐受能力不同。大部分固氮菌株隨著NaCl濃度的增加,菌體生長(zhǎng)受到抑制,生物量下降;其中固GNJ-27和GNJ-40最適生長(zhǎng)NaCl 濃度為0.5 mol/L ;GNJ-2,GNJ-15,GNJ-40在 1.5 mol/L NaCl 條件下仍可生存,其耐鹽性最強(qiáng)。所有菌株的耐受pH值范圍為7-9(圖5)。其中GNJ-1,GNJ-20,GNJ-27的最適生長(zhǎng)pH值為7;GNJ-2,GNJ-5,GNJ-13,GNJ-14,GNJ-32的最適生長(zhǎng)pH值為8;GNJ-15和GNJ-40的最適適生長(zhǎng)pH值為9。

圖4 固氮菌株的NaCl耐受性

圖5 固氮菌株的pH耐受性

3 討論

鹽堿地植物根系分布著很多耐鹽堿根際促生菌,這些菌株能夠增植物的耐堿性,促進(jìn)植物生長(zhǎng)。目前,鹽堿地中多種植物根際促生菌已成功篩選出來[9-10]。本實(shí)驗(yàn)利用Ashby培養(yǎng)基首次從鹽堿地花生根際分離具有固氮能力的土著菌株,篩選出具有固氮能力的菌株22株,分屬Aeromonasspp.,Pseudomonasspp.,Enterobacterspp.,和Stenotropho-monasspp.,4個(gè)種群。Stenotrophomonasspp.占總數(shù)的54%,為優(yōu)勢(shì)種群。這4個(gè)種群在黃瓜、小麥、水稻中均有相關(guān)報(bào)道,可以緩解鹽脅迫損傷[14-15]。

氮是植物生長(zhǎng)所必需的大量營(yíng)養(yǎng)元素之一,微生物能夠固定大氣中的氮?dú)?,為植物提供氮素營(yíng)養(yǎng),進(jìn)而促進(jìn)植物生長(zhǎng)。王超群等[16]從大豆根際分離的4 株固氮菌,最大固氮酶活為263. 40 nmol C2H4/(h·mL),最小固氮酶活為183.09 nmol C2H4/(h·mL)。本實(shí)驗(yàn)分離得到菌株的固氮酶活性最高為346.32 nmol C2H4/(h·mL),最低為125.82 nmol C2H4/(h·mL)。可見,本實(shí)驗(yàn)所分離的促生菌株具有較高的固氮酶活性。有研究表明,固氮菌不但可以固定空氣中的氮?dú)?,同時(shí)一些固氮菌還兼具產(chǎn)ACC脫氨酶,溶磷及分泌IAA的特性[17]。

ACC脫氨酶是許多植物根際促生細(xì)菌共有的一個(gè)特征性酶,在植物抵抗高溫、高鹽、寒冷及病害等逆境脅迫中發(fā)揮中重要作用。乙烯是植物生長(zhǎng)發(fā)育的代謝產(chǎn)物,鹽堿條件下,植物體內(nèi)的乙烯水平會(huì)顯著上升,進(jìn)而影響植物生長(zhǎng)。ACC脫氨酶是一種抑制乙烯生物合成的胞內(nèi)酶,具有分泌ACC脫氨酶活性的微生物接種在植物根際時(shí),能夠降低植物由于鹽脅迫產(chǎn)生的過量乙烯濃度,促進(jìn)植物生長(zhǎng)。許芳芳等[18]研究表明接種具有ACC脫氨酶活性的腸桿菌(Enterobactersp.),顯著提高了鹽脅迫下小麥的生長(zhǎng)性狀,葉綠素含量19%,生物量提高54%,根長(zhǎng)增加了46%。ACC脫氨酶活性是評(píng)價(jià)菌株是否可被制作成微生物肥料的指標(biāo)之一。本實(shí)驗(yàn)所篩選的固氮菌株均具有ACC脫氨酶活性。趙龍飛等[19]研究表明具有固氮酶活性的腸桿菌屬(Enterobacter)、寡養(yǎng)單胞菌屬(Stenotrophomonas),同時(shí)具有產(chǎn)ACC脫氨酶的活性。

本實(shí)驗(yàn)所篩選的促生菌株中,所有菌株均具有溶磷性能,其中GNJ-18的最大溶磷量為53.58 mg/L。這與Sharma等[20]分離自花生根部的PGPR研究結(jié)果基本一致。而在分泌IAA特性方面,不同菌株的差異較大。鄭娜等[21]從鹽堿土壤中分離4株 菌(Pseudomonas protegens、Achromobactersp.、Variovoraxsp. 和P. protegens),其中3株具有分泌IAA的能力,產(chǎn)量最高達(dá)到160.55 μg/mL,但最低的只有0.10 μg/mL。本實(shí)驗(yàn)中,有45%的促生菌株具有分泌IAA的能力,濃度為1.36-12.9 μg/ml。Liu等[22]分離自菊芋根際的耐鹽堿固氮菌中僅有一株具有產(chǎn)IAA能力,且分泌量?jī)H為1.1 μg/ml,接種該菌株成功的促進(jìn)了菊芋生長(zhǎng)。IAA不但可以促進(jìn)細(xì)胞生長(zhǎng),增加細(xì)胞體積和重量,直接促進(jìn)植物生長(zhǎng)。而且,通過接種分泌IAA的菌株,能夠增加植物根表面積和長(zhǎng)度,從而使植物能夠獲得更多營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)[23]。這表明分離的促生菌具有應(yīng)用于鹽堿土壤中增加可利用營(yíng)養(yǎng)元素含量的潛力。

本實(shí)驗(yàn)探究多功能菌株在不同NaCl及pH下的生長(zhǎng)情況,發(fā)現(xiàn)所有菌株對(duì)NaCl具有較好的適應(yīng)性,其中GNJ-2,GNJ-20和GNJ-27在NaCl濃度為1.5 mol/L條件下能夠生長(zhǎng),遠(yuǎn)高于孫建光等[24]篩選自玉米固氮菌株的NaCl耐受性。牛艷芳等[25]篩選自非鹽堿土壤中的固氮菌株的最適生長(zhǎng)pH 值均集中在6-8。而本實(shí)驗(yàn)所篩選的固氮菌株的最適生長(zhǎng)pH值范圍為7-9。這說明,分離自鹽堿地植物根際的微生物對(duì)鹽堿環(huán)境耐受性較好。薛婷婷等[26]對(duì)黃河三角洲鹽堿地固氮菌的pH耐受性研究也證實(shí)了這一觀點(diǎn)。因此,本研究所篩選的促生菌能夠更好的適應(yīng)鹽堿環(huán)境,在制備鹽堿地微生物菌肥方面具有較大的應(yīng)用潛力。

4 結(jié)論

根際促生菌能夠通過固氮、產(chǎn)ACC脫氨酶,溶磷及分泌IAA等機(jī)制緩解植物鹽脅迫損傷,改良鹽堿土壤。本實(shí)驗(yàn)以黃河三角洲鹽堿地花生根際土壤為研究對(duì)象,經(jīng)固氮酶活的測(cè)定及16S rDNA鑒定,篩選得到22株具有固氮能力的菌株。所有菌株均具有產(chǎn)ACC脫氨酶及溶解難溶性無(wú)機(jī)磷源活性,有10株固氮菌株可以分泌IAA。這10株菌株具有良好的鹽堿耐受性,在鹽堿地微生物菌肥方面具有較大的開發(fā)潛力。

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