徐小芳 梁趙良 曾睿智 呂曉丹 劉耿峰 呂小平
廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院(南寧530021)
炎癥性腸?。╥nflammatory bowel disease,IBD)主要分為潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis,UC)和克羅恩病(Crohn′s disease,CD)兩種類(lèi)型,其發(fā)病率在全球呈上升趨勢(shì),我國(guó)的發(fā)病率也正逐年上升[1]。IBD的病因尚不明確[2],普遍認(rèn)為是腸道的上皮細(xì)胞、共生的微生物群、黏膜免疫系統(tǒng)之間的三者關(guān)系失調(diào)導(dǎo)致慢性炎癥的發(fā)生,這三者又受到遺傳和環(huán)境因素的影響[3]。
目前已證實(shí)了200多個(gè)IBD易感性基因位點(diǎn)[4],其中大多數(shù)是在基因編碼區(qū)。LIBIOULLE等[5]發(fā)現(xiàn)5p13.1 基因多態(tài)性與CD的易感性有關(guān),它是一段1.25-MB的基因非編碼區(qū),與CD 相關(guān)的遺傳變異能上調(diào)PTGER4的表達(dá)水平,其中rs4495224和rs7720838 基因多態(tài)性與CD 關(guān)系較強(qiáng),對(duì)PTGER4表達(dá)的影響最為顯著,常將PTGER4基因作為CD的易感基因。另有學(xué)者發(fā)現(xiàn)PTGER4與早發(fā)型UC易感性有關(guān)[6]。PTGER4基因可以編碼產(chǎn)生EP4亞基[7],EP4 作為前列腺素E2(prostaglandin E2,PGE2)的受體與其結(jié)合導(dǎo)致了白細(xì)胞的募集和炎癥介質(zhì)的產(chǎn)生,參與了腸道炎癥的發(fā)生和緩解作用[8]。近年來(lái),非基因編碼區(qū)的疾病易感基因越來(lái)越受到關(guān)注,研究[9]表明非編碼RNA 在炎癥性腸病細(xì)胞免疫調(diào)節(jié)起重要作用。目前該基因多態(tài)性與IBD的研究國(guó)內(nèi)外報(bào)道尚不一致,GLAS等[10]、PRAGE等[11]發(fā)現(xiàn)rs4495224和rs7720838 基因多態(tài)性與法國(guó)、比利時(shí)、德國(guó)、北美人群CD的易感性有關(guān),與UC 無(wú)關(guān)。但在日本人群并未發(fā)現(xiàn)以上兩個(gè)位點(diǎn)與IBD 有關(guān)[12]。郭政等[13]通過(guò)Meta分析發(fā)現(xiàn)rs4495224 基因多態(tài)性與CD 無(wú)明顯關(guān)聯(lián)。我國(guó)尚無(wú)該基因多態(tài)性與IBD 相關(guān)的臨床研究報(bào)道,廣西是我國(guó)壯族人口最大的聚居地,壯族、漢族人群擁有不同的疾病遺傳性[14]。本研究目的是探討PTGER4rs4495224和rs7720838 多態(tài)性與廣西壯族、漢族人群IBD 以及臨床特征的相關(guān)性,為IBD的基因診斷及治療提供線索。
1.1 臨床資料收集2014年5月至2018年11月在廣西醫(yī)科大學(xué)第一、第二附屬醫(yī)院消化內(nèi)科門(mén)診、住院的廣西區(qū)域無(wú)血緣關(guān)系的IBD 患者212例(UC 組:壯族59例,漢族69例;CD 組:壯族40例,漢族44例)。IBD的診斷符合2018年制定的《炎癥性腸病診斷與治療的共識(shí)意見(jiàn)》的診斷標(biāo)準(zhǔn)[15],并排除患有其他自身免疫性疾病、感染性腸炎患者。另收集廣西區(qū)域無(wú)血緣關(guān)系的健康對(duì)照者190例(壯族90例,漢族100例)。納入對(duì)象為同期就診于廣西醫(yī)科大學(xué)第一、二附屬醫(yī)院,均已排除腫瘤、自身免疫性疾病及IBD 家族史的健康體檢者。IBD 組和正常對(duì)照組年齡及性別比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。標(biāo)本采集經(jīng)醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)和患者本人或家屬知情同意。
1.2 研究方法(1)DNA 提取:采用DNA 試劑盒提取腸黏膜DNA。(2)位點(diǎn)的選擇:從NCBI 獲取SNP 信息,選擇的SNP 最小等位基因頻率(MAF)>15%,結(jié)合文獻(xiàn)報(bào)道,所選SNP 可能與CD的并發(fā)癥有關(guān)。(3)PCR 擴(kuò)增:①引物設(shè)計(jì):根據(jù)NCBI 基因數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)rs4495224和rs7720838 位點(diǎn)引物,序列見(jiàn)表1。②PCR 反應(yīng)體系:DNA2 μL+上下游引物各1 μL + Master Mix 25 μL + RNase-free Water 21 μL。③反應(yīng)條件:變性94 ℃、30 s,退火50 ℃、30 s,延伸72 ℃、30 s,共30個(gè)循環(huán),72 ℃繼續(xù)延伸7 min。④基因測(cè)序:電泳鑒定目的片段,并將PCR產(chǎn)物送測(cè)序,用Chromas 軟件判讀基因型。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法采用SPSS 24.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行分析。統(tǒng)計(jì)rs4495224和rs7720838 位點(diǎn)的基因型及等位基因頻率,采用Hardy-Weinberg 遺傳平衡性檢驗(yàn),P>0.05 提示具有群體代表性。用χ2檢驗(yàn)或Fisher 確切概率法檢驗(yàn)比較組間各基因型和等位基因頻率以及分析基因多態(tài)性與臨床特征的差異,P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
表1 引物序列Tab.1 Primer sequence
2.1 rs4495224 基因多態(tài)性分析結(jié)果PCR 產(chǎn)物電泳條帶與目的片段大小一致。測(cè)序結(jié)果與Gen-Bank 基因庫(kù)上序列一致。共得到3種基因型:野生型純合子CC 型、突變型雜合子AC 型和突變型純合子AA 型。
基因型及等位基因頻率分布見(jiàn)表2、3。各組基因型及等位頻率分布符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律(P>0.05),具有群體代表性。漢族CD 組突變基因型(AA+AC)頻率、A 突變等位基因頻率明顯高于正常對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.002;P=0.001);壯族UC 組、CD 組、漢族UC 組分別與正常對(duì)照組比較、壯族CD 組與漢族CD 組比較、壯族CD 組與漢族CD 組比較基因型及等位基因頻率分布均差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);進(jìn)一步分析rs4495224 多態(tài)性與漢族CD 臨床特征(病變部位、疾病活動(dòng)性、有無(wú)并發(fā)癥)的關(guān)系,CD 病變部位分為:回腸末段(L1)、結(jié)腸(L2)、回結(jié)腸(L3);依據(jù)簡(jiǎn)化克羅恩活動(dòng)指數(shù)計(jì)算法將疾病活動(dòng)性分為:緩解期、活動(dòng)期;并發(fā)癥包括:瘺管、腹腔膿腫、腸腔狹窄和腸梗阻、肛周病變等[15]。在漢族CD的不同病變部位、疾病活動(dòng)性、有無(wú)并發(fā)癥其基因型和等位基因頻率的分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
2.2 rs7720838 基因多態(tài)性分析結(jié)果PCR 產(chǎn)物電泳條帶與目的片段大小一致。測(cè)序結(jié)果與Gen-Bank 基因庫(kù)上序列一致。共得到3種基因型:野生型GG 型、雜合子突變TG 型和純合子突變TT 型。
基因型頻率及等位基因頻率分布見(jiàn)表4、5。各組基因型及等位頻率分布符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律(P>0.05),具有群體代表性。漢族CD組突變基因型(TT + TG)頻率、T等位基因頻率明顯高于正常對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.015;P=0.006);漢族CD 組T等位基因頻率(29.5%)高于壯族CD 組(15%),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.028),二者的基因型頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。壯族UC 組、CD 組、漢族UC 組分別與正常組比較、壯族UC 組與漢族UC 比較基因型及等位基因頻率分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);在漢族CD 患者的不同病變部位、疾病活動(dòng)性、有無(wú)并發(fā)癥中基因型和等位基因頻率分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
表2 rs4495224 病例組與對(duì)照組基因型頻率和等位基因頻率Tab.2 rs4495224 genotype and allele frequency in case group and control group
表3 rs4495224 漢族CD 組基因-臨床特征分析Tab.3 rs4495224 gene-clinical characteristics analysis in Han CD group
PTGER4基因編碼產(chǎn)生PGE2的受體EP4 亞基,其廣泛表達(dá)于骨髓、結(jié)腸、小腸、胃等組織。PGE2 是花生四烯酸(arachidonicacid,AA)以環(huán)氧合酶(COX)為限速酶而產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物之一,它通過(guò)與四種受體亞型(EP1-EP4)結(jié)合,參與急性炎癥和炎癥性免疫疾病的發(fā)生和發(fā)展[8]。既往研究發(fā)現(xiàn)PGE2的促炎作用主要通過(guò)EP1和EP3受體介導(dǎo),EP4 通過(guò)激活抗凋亡和增殖信號(hào)通路,對(duì)結(jié)腸上皮細(xì)胞的存活和再生有重要作用[16],NAKASE等[17]發(fā)現(xiàn)EP4 激動(dòng)劑能抑制結(jié)腸炎發(fā)展并促進(jìn)粘膜愈合。但有研究發(fā)現(xiàn),PGE 2 可以通過(guò)EP2/Ep4 受體增加IL-12和IFN-γ信號(hào)通路促進(jìn)Th1細(xì)胞分化;通過(guò)IL-1β和IL-23 通路促進(jìn)體外Th17細(xì)胞增殖[8]。既往研究報(bào)道Th1、Th17 這兩種輔助性T 細(xì)胞和IBD的發(fā)生、發(fā)展有關(guān)[18]。另外,GLAS等[10]發(fā)現(xiàn)核轉(zhuǎn)錄因子(NF-κB)和X 盒結(jié)合蛋白1(X-box binding protein 1,XBP1)可能分別與5p13.1某基因組區(qū)域結(jié)合從而上調(diào)PTGER4表達(dá)進(jìn)而影響IBD的發(fā)病。其中轉(zhuǎn)錄因子NF-κB 參與多種炎癥信號(hào)通路[19],腸上皮細(xì)胞中XBP1的缺失導(dǎo)致自發(fā)性腸炎[20],二者都參與IBD的發(fā)病。近年來(lái)PTGER4基因被發(fā)現(xiàn)與多種其他自身免疫性疾病有關(guān),如強(qiáng)直性脊柱炎(rs7726237)[21]、多發(fā)性硬化癥(rs9292777)[22]、類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(rs76523431)[23]等,其發(fā)病機(jī)制可能是PGE2 在體內(nèi)通過(guò)EP4 受體促進(jìn)輔助性T 細(xì)胞的功能,促發(fā)免疫炎癥的發(fā)生。研究[24]表明使用EP4 選擇性拮抗劑可減少局部淋巴結(jié)中Th1和Th17 細(xì)胞的積累,并抑制實(shí)驗(yàn)性自身免疫性腦脊髓炎或接觸性過(guò)敏小鼠的疾病進(jìn)展。因此EP4 拮抗作用可能是治療難治性免疫疾病的良好藥物靶點(diǎn)。
表4 rs7720838 病例組與對(duì)照組基因型頻率和等位基因頻率Tab.4 rs7720838 gnotype and allele frequency in case group and control group
表5 rs7720838 漢族CD 組與基因-臨床特征分析Tab.5 rs7720838 gene-clinical characteristics analysis in Han CD group
本研究發(fā)現(xiàn)PTGER4基因rs4495224和rs7720838多態(tài)性與廣西漢族人群CD的易感性相關(guān),但與壯族CD、漢族和壯族UC 無(wú)關(guān)。rs4495224 A和rs7720838 T 危險(xiǎn)等位基因可能增加漢族CD 人群PTGER4的表達(dá),ER4 受體增加與PGE2 結(jié)合促進(jìn)Th1 細(xì)胞分化、Th17 細(xì)胞增殖,各種促炎因子如IFN-γ、TNF-α、IL-17等分泌增加參與CD的病理改變。本研究中漢族的研究結(jié)果與LIBIOULLE等[5]、GLAS等[10]、PRAGE等[11]的報(bào)道一致,但與日本人群的報(bào)道相悖。漢族與壯族CD 組的基因型和等位基因頻率對(duì)比,發(fā)現(xiàn)攜帶rs7720838 T等位基因的漢族人群患CD 風(fēng)險(xiǎn)比壯族高,但在rs4495224中并無(wú)此發(fā)現(xiàn)。中國(guó)是一個(gè)有56個(gè)民族的國(guó)家,相同種族不同民族IBD的發(fā)病率和患病率存在差異,唐源等[25]發(fā)現(xiàn)在云南省18個(gè)不同少數(shù)民族中,漢族人群的總患病率和UC 患病率均最高。本研究中漢族和壯族的結(jié)果不同可能是不同民族受個(gè)體遺傳背景影響,也可能與不同民族的經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平、居住環(huán)境和生活習(xí)慣不同有關(guān)。本研究基因-臨床特征分析顯示,rs4495224和rs7720838基因多態(tài)性與廣西漢族CD的病變部位、疾病活動(dòng)度、有無(wú)并發(fā)癥無(wú)關(guān)聯(lián),這一結(jié)果與GLAS等[10]、PRAGE等[11]關(guān)于基因-臨床特征、基因-基因的關(guān)系研究不一致。這些結(jié)論受到小樣本和地理區(qū)域的限制,還需要進(jìn)一步研究。本研究未發(fā)現(xiàn)rs4495224和rs7720838 與漢族UC 及壯族UC和CD發(fā)病相關(guān),因此沒(méi)有進(jìn)一步研究基因多態(tài)性與臨床特征的關(guān)系。
綜上,PTGER4基因rs4495224和rs7720838 多態(tài)性可能與廣西漢族人群CD 易感性有關(guān),可能與漢族CD的病變部位、疾病活動(dòng)性、有無(wú)并發(fā)癥無(wú)關(guān),可能與漢族UC、壯族CD 及UC 易感性無(wú)關(guān);攜帶rs7720838 T 突變等位基因的漢族人群患CD 風(fēng)險(xiǎn)可能比壯族高。然而本研究樣本量較少、所納入的臨床特征分組過(guò)少、漢族與壯族人群的結(jié)果不一致,尚不能得出可靠結(jié)論,還需更大規(guī)模的研究去證實(shí);由于CD 病因和發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,后續(xù)工作需進(jìn)一步研究PTGER4基因具體通過(guò)何種途徑參與CD 炎癥病理性改變。