王霞 徐燦 吳秀園 孫雯婷 王英鋒 李中峰
摘?要?應(yīng)用核磁共振(NMR)代謝組學(xué)方法研究狼毒大戟根部毒性導(dǎo)致大鼠糞便代謝物的變化。將36 只SPF級(jí)雄性SD大鼠隨機(jī)分為3組,給藥組大鼠腹腔注射高低兩個(gè)劑量的狼毒大戟根部醇提物,對(duì)照組給予同體積含有3% 吐溫80的生理鹽水。每天給藥一次,連續(xù)給藥15天后停藥恢復(fù)15天,收集各組大鼠的糞便樣品。利用NMR技術(shù)檢測(cè)大鼠糞便中代謝物,對(duì)得到的1H-NMR數(shù)據(jù)進(jìn)行多元統(tǒng)計(jì)分析,獲取大鼠糞便中內(nèi)源性代謝產(chǎn)物的變化規(guī)律。通過Student t檢驗(yàn)進(jìn)一步確定具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的生物標(biāo)志物。大鼠糞便中鑒定出35種代謝物,狼毒大戟導(dǎo)致12種代謝物變化顯著,其中谷氨酸、天冬氨酸、亮氨酸、丙氨酸、賴氨酸、蛋氨酸、苯丙氨酸、二甲胺、三甲胺、尿嘧啶含量下降,葡萄糖、丁酸含量升高。這些與腸道菌群有關(guān)的代謝物變化表明,狼毒大戟毒性導(dǎo)致大鼠的腸道菌群紊亂,進(jìn)而造成了大鼠體內(nèi)氨基酸、短鏈脂肪酸和葡萄糖代謝異常,為進(jìn)一步揭示狼毒大戟的毒性提供了實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
關(guān)鍵詞?狼毒大戟; 代謝組學(xué); 糞便; 核磁共振
1?引 言
據(jù)《中藥大辭典》記載,狼毒大戟(Euphorbia fischeriana Steud)為大戟科大戟屬草本植物,主要分布在我國的河北、黑龍江、遼寧、內(nèi)蒙古、吉林等地。狼毒大戟以根入藥,具有抗癌、抗白血病、抗菌、抗病毒和抗痛風(fēng)、殺蟲、抗氧化等作用[1,2]。由于狼毒大戟具有多種藥效作用,尤其在抗腫瘤方面具有良好的活性而受到廣泛關(guān)注。然而,《本草綱目》中記載:狼毒(根)辛、平、有大毒。胡爽等[3]在狼毒大戟急性毒性實(shí)驗(yàn)研究中發(fā)現(xiàn),小鼠腹腔注射較高劑量的狼毒大戟根部提取物后,明顯出現(xiàn)活動(dòng)困難、呼吸急促、步態(tài)不穩(wěn)等現(xiàn)象,并有一定數(shù)量的小鼠死亡。狼毒大戟因?yàn)榫哂休^大的毒性,其應(yīng)用受到了限制。因此,充分認(rèn)識(shí)和了解狼毒大戟的毒性是其安全、合理使用的前提。
代謝組學(xué)是通過對(duì)生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析,研究機(jī)體代謝產(chǎn)物變化的方法。代謝組學(xué)可以反映機(jī)體在疾病侵襲、藥物干預(yù)等作用下,內(nèi)源性小分子代謝物種類、數(shù)量的變化情況[4],從而得到機(jī)體代謝變化的信息,已經(jīng)應(yīng)用于中藥毒性[5]、疾病診斷[6]、藥物作用機(jī)制[7]等領(lǐng)域。核磁共振(NMR)技術(shù)具有對(duì)樣品預(yù)處理簡單、無破壞性、實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)檢測(cè)和無偏向檢測(cè)等特點(diǎn)[4],通過對(duì)體液、組織或糞便等生物樣品進(jìn)行測(cè)定,得到體內(nèi)小分子代謝物的豐富信息,已成為代謝組學(xué)中強(qiáng)有力的研究工具[8]?;诤舜殴舱竦拇x組學(xué)技術(shù)可以最大程度揭示生物體所產(chǎn)生的整體性的代謝變化,已被廣泛應(yīng)用在中藥藥效評(píng)價(jià)[9]、中藥藥理[10]和中藥毒理機(jī)制[11]等方面。胡永勝等[13]采用核磁共振代謝組學(xué)方法研究了雷公藤紅素對(duì)大鼠糖尿病潰瘍促愈合作用的機(jī)制。糞便是腸道菌群和宿主的共代謝產(chǎn)物[13],糞便代謝作為研究機(jī)體代謝的一個(gè)重要方面,可以反映出腸道菌群對(duì)藥物、食物等的代謝情況[14,15],為藥物研究提供重要信息。
本研究利用NMR代謝組學(xué)方法研究狼毒大戟根部醇提物對(duì)大鼠糞便代謝物的變化,篩選造成腸道菌群紊亂的相關(guān)的潛在生物標(biāo)志物,初步從分子水平對(duì)狼毒大戟毒性作用機(jī)制進(jìn)行研究,為狼毒大戟的毒性及毒性機(jī)制的探討提供了實(shí)驗(yàn)依據(jù),并為研究腸道菌群和機(jī)體代謝的緊密關(guān)系提供新思路。
2?實(shí)驗(yàn)部分
2.1?儀器與試劑
Heraeus Multifuge X1R臺(tái)式離心機(jī)(美國Thermo公司); BSA124S-CW分析天平(德國Sartorius公司); 600 MHz Varian VNMRS核磁共振波譜儀(美國Varian公司); Rotavapor R-220中型旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(瑞士Buchi 公司)、Cascada Bio Mk2超純水機(jī)(美國PALL公司)。
狼毒大戟干燥根部(河北安國義全中藥有限公司)經(jīng)首都師范大學(xué)王英鋒教授鑒定為狼毒科(Euporbiaceae)大戟屬(Euphorbia )植物狼毒大戟(Euphorbia Fischeriana Steud )的根。NaH2PO4(99.5%)、K2HPO4(98%),購于美國Amresco公司; 吐溫80(化學(xué)純,天津市光復(fù)精細(xì)化工研究所); 重水(D2O,99.9%氘代,美國Cambridge Isotope Laboratories公司); 2,2,3,3-氘代三甲基硅烷丙酸鈉(TSP,98%氘代,美國Cambridge Isotope Laboratories公司); 疊氮化鈉(NaN3,分析純,天津福晨化學(xué)試劑廠)。
SPF級(jí)SD雄性大鼠購于斯貝福(北京)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科技有限公司。
2.2?狼毒大戟醇提物的制備
按照課題組前期提取方法,取1.5 kg狼毒大戟干燥根部,粉碎,按質(zhì)量體積比1∶9加入70%乙醇,浸泡過夜(>12 h),60℃加熱提取2次,每次1.5 h。藥液靜置,冷卻至室溫后減壓回收乙醇,水浴蒸干,真空冷凍干燥,得到狼毒大戟根部醇提物。取狼毒大戟根部醇提物溶解在含有3%(V/V)吐溫80的生理鹽水中,其中,吐溫80用于增大狼毒大戟醇提物的溶解度。將混合液超聲30 min,配制成相應(yīng)濃度的狼毒大戟醇提物溶液。
2.3?動(dòng)物實(shí)驗(yàn)
動(dòng)物飼養(yǎng)條件為室溫(25±5)℃,濕度60%±10%,12 h晝夜循環(huán)模擬自然光照,自由飲水?dāng)z食。實(shí)驗(yàn)劑量設(shè)置參考前期小鼠急性毒性實(shí)驗(yàn),小鼠給藥最高劑量為0.13 g/kg,換算到大鼠實(shí)驗(yàn)高劑量為0.10 g/kg。
36只SPF級(jí)SD雄性大鼠,體重280~320 g。隨機(jī)分為3組,其中高劑量組14只、低劑量組12只、對(duì)照組10只。每組劑量等比級(jí)數(shù)為1∶0.5,劑量設(shè)置為0.10和0.05 g/kg,對(duì)照組為含有3%吐溫80的生理鹽水。適應(yīng)性喂養(yǎng)1周后,在每次收集糞便時(shí),需在給藥前禁食不禁水12 h。每天8:00~9:00腹腔注射給藥一次,注射體積為0.5 mL/100 g體重。連續(xù)給藥15天,依據(jù)大鼠體重變化隨時(shí)調(diào)整藥量。第16天起停止給藥,恢復(fù)15天。給藥前一天記為第0天,給藥期間每隔一天收集9:00~15:00的大鼠糞便樣品,恢復(fù)期間每隔4天收集9:00~15:00的大鼠糞便樣品。即第0、1、3、5…15、20、25、29天收集糞便樣品,糞樣收集后立即以液氮速凍,于80℃保存。
2.4?樣品處理
稱取50 mg大鼠糞樣于2 mL離心管中,加入500 μL磷酸鹽緩沖液(NaH2PO4-K2HPO4,0.1 mol/L,pH=7.4),緩沖液使用50% D2O配制,其中含有0.002% (w/V) TSP和0.1% (w/V) NaN3,分別作為化學(xué)位移內(nèi)標(biāo)和防腐劑。渦旋充分混勻后, 用液氮反復(fù)凍融3次。凍融物進(jìn)行勻漿(20 Hz,90 s),勻漿液于4℃,10000 g離心10 min。取出上清液,剩余沉淀物用相同方法再提取2次,將3次操作所得到的所有上清液混合后再離心(4℃,16000 g,10 min),取上清液550 μL轉(zhuǎn)移至5 mm NMR樣品管中, 進(jìn)行NMR檢測(cè)。
2.5?核磁共振數(shù)據(jù)的采集
25℃下,在Varian VNMRS 600 MHz核磁共振波譜儀上采用預(yù)飽和的1D-?NOESY脈沖序列測(cè)定糞便水溶樣的1H-NMR譜,1H的共振頻率為599.808 MHz。實(shí)驗(yàn)參數(shù)為:譜寬12000 Hz,采樣點(diǎn)數(shù)64 K,信號(hào)累加128次,混合時(shí)間(tm)為100 ms,在弛豫延遲期間采用預(yù)飽和方式壓制水峰信號(hào)。為進(jìn)一步對(duì)1D譜中的信號(hào)進(jìn)行歸屬,選取具有代表性的樣品, 采集一系列的2D NMR譜,如1H-1H COSY、1H-1H TOCSY、1H-13C HSQC和1H-13C HMBC等。
2.6?數(shù)據(jù)處理
譜圖使用MestReNova軟件(Version 7.1.2,西班牙Mestrelab Research公司)進(jìn)行手動(dòng)相位、基線校正后,用內(nèi)標(biāo)TSP的單峰定標(biāo)(δ 0.00)。對(duì)δ 0.5~9.5區(qū)域的圖譜進(jìn)行分段積分,積分區(qū)間寬為0.002 ppm。為了消除殘余水峰信號(hào)的影響,剪掉譜圖中δ 4.7~5.2區(qū)間。對(duì)積分后的數(shù)據(jù)進(jìn)行總面積歸一化處理,然后導(dǎo)入SIMCA-P+(Version 12.0, 瑞典Umetrics公司)進(jìn)行多變量統(tǒng)計(jì)分析。主成分分析(PCA)使用中心化換算(Ctr)的數(shù)據(jù)標(biāo)度換算方式,它可以反映樣品整體的分布趨勢(shì),同時(shí)可以觀察到組內(nèi)有無異常點(diǎn),分析結(jié)果以得分圖(Scores plots)顯示。歸一化所得數(shù)據(jù)經(jīng)單位方差換算(UV)標(biāo)度化處理后,進(jìn)行偏最小二乘法判別分析(PLS-DA)和正交偏最小二乘法判別分析(OPLS-DA)。其中,PLS-DA用于分析NMR數(shù)據(jù)與分組變量之間的關(guān)系,同時(shí)得到變量投影重要性(VIP)>1的代謝物信息。用舍一法對(duì)模型進(jìn)行交叉驗(yàn)證,參數(shù)R2和Q2分別表示模型擬合情況和預(yù)測(cè)能力,然后通過排列實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證模型的有效性。最后以O(shè)PLS-DA最大化凸顯組別之間的差異,并利用MATLAB R2012a軟件(Version 7.1, 美國 Mathworks 公司)結(jié)合自編程序作出相關(guān)系數(shù)圖,圖中顏色沿著右側(cè)越接近紅色,表示相應(yīng)代謝物對(duì)組間差異的貢獻(xiàn)越大。根據(jù)兩組中較小的樣本數(shù),查閱皮爾森相關(guān)系數(shù)臨界值表,當(dāng)某代謝物信號(hào)的相關(guān)系數(shù)絕對(duì)值|r|>r臨界值時(shí),認(rèn)為該代謝物的變化對(duì)模型的區(qū)分有意義。本研究中,相關(guān)系數(shù)的臨界值分別為0.291(n=45,給藥15天)和0.532(n=13,恢復(fù)15天)。為進(jìn)一步驗(yàn)證差異代謝物的顯著性,對(duì)代謝物對(duì)應(yīng)的積分面積數(shù)據(jù)導(dǎo)入SPSS軟件(Version 17.0,美國SPSS公司)進(jìn)行獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),顯著性閾值設(shè)置為p<0.05。當(dāng)3個(gè)標(biāo)準(zhǔn)同時(shí)得到滿足時(shí),即VIP>1,P<0.05,|r|≥r臨界值,相應(yīng)的代謝物即可被選為差異代謝物。
3?結(jié)果與討論
3.1?糞便樣品代謝物譜圖分析
圖1為高劑量組(High)、低劑量組(Low)和對(duì)照組(Control)大鼠糞便樣品中具有代表性的1H-NMR譜。根據(jù)代謝物文獻(xiàn)[11,12,16~19]、已有的經(jīng)驗(yàn)及Chenomx NMR Suite 數(shù)據(jù)庫(Version 7.5,加拿大Chenomx公司)和代謝組學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(HMDB, http://www.hmdb.ca/),對(duì)譜圖的代謝物進(jìn)行準(zhǔn)確歸屬。結(jié)合相關(guān)二維譜圖(如1H-1H COSY、1H-1H TOCSY、1H-13C HSQC和1H-13C HMBC等)對(duì)歸屬的代謝物進(jìn)行確認(rèn)。本研究從圖譜中歸屬出35種代謝物。肉眼可分辨出一些特征性差異代謝物,如給藥組中具有較低濃度的尿嘧啶和較高濃度的葡萄糖等。
3.2?多元統(tǒng)計(jì)分析
為了觀察樣本的聚類情況以及排除異常點(diǎn),對(duì)連續(xù)給藥15天和停藥恢復(fù)15天后所有大鼠糞便樣品的NMR數(shù)據(jù)進(jìn)行PCA分析。連續(xù)給藥15天所有大鼠糞便樣品的PCA得分如圖2A所示,PC1=55.1%; PC2=16.2%,劑量組與對(duì)照組之間雖有部分重疊,但依然能看出分離趨勢(shì)。由圖2C中PLS-DA得分圖(R2Y=0.776; Q2=0.759)更清晰地顯示出組別之間的分離,其中高劑量組與對(duì)照組區(qū)分更明顯。表明了給藥后大鼠體內(nèi)環(huán)境出現(xiàn)顯著變化,且藥物對(duì)機(jī)體的影響與劑量呈正相關(guān)。圖2B和2D分別為停藥恢復(fù)后劑量組與對(duì)照組的PCA(PC1=52.2%; PC2=13.4%)和PLS-DA(R2Y=0.747; Q2=0.597)得分圖,圖中依然可以觀察到劑量組與對(duì)照組的區(qū)分,表明在停藥恢復(fù)15天后,給藥組與對(duì)照組大鼠仍存在代謝差異。
為了動(dòng)態(tài)觀察狼毒大戟對(duì)大鼠的影響隨時(shí)間的變化情況,對(duì)不同時(shí)間得到的大鼠糞便樣品進(jìn)行時(shí)間-軌跡分析(圖3),圖3中每個(gè)點(diǎn)代表一組大鼠在同一天的平均位置。在給藥初期,劑量組即與對(duì)照組存在明顯差異,此后均在一定范圍內(nèi)波動(dòng),且高劑量組與對(duì)照組的差異較低劑量組更為明顯。停藥恢復(fù)階段,兩劑量組的變化趨勢(shì)趨于一致,但仍與對(duì)照組保持一定差異。
采用PLS-DA對(duì)給藥期間和恢復(fù)期間高劑量組和對(duì)照組所有大鼠糞便樣品的NMR數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。圖4A為連續(xù)給藥15天高劑量組和對(duì)照組大鼠糞便樣品的1H-NMR譜得到的PLS-DA得分圖(R2Y=0.869; Q2=0.848),圖4C為停藥恢復(fù)15天高劑量組和對(duì)照組大鼠糞便樣品的1H-NMR譜得到的PLS-DA得分圖(R2Y=0.794; Q2=0.666)。模型的排列驗(yàn)證(200次)結(jié)果如圖4B和4D所示,Q2回歸線與y軸交點(diǎn)在負(fù)半軸,R2回歸線與y軸交點(diǎn)在正半軸,且R2和Q2的數(shù)值在最右端接近,表明建立的糞便樣品數(shù)據(jù)模型成立,即兩組大鼠糞便樣品中的代謝物存在顯著的差異。