張俊文 趙喬佳杰 楊 霞 馬 雯 黃秉仁 劉福生
Ⅲ型干擾素(interferon λs,IFN-λs)是重要抗病毒、抗腫瘤細(xì)胞因子[1]。IFN-λs的受體是由白介素10受體2(interleukin 10 receptor 2, IL-10R2)和干擾素λ受體1(IFN receptors, IFN-λR1)組成的異源四聚體[2],雖然Ⅲ型干擾素與Ⅰ型干擾素結(jié)合的受體不同,但是它們均是通過(guò)激活Janus激酶(Janus kinase, Jak)-信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子(signal transducers and activators of transcription, STAT)來(lái)傳遞信號(hào),因此Ⅲ型干擾素表現(xiàn)出與Ⅰ型干擾素類似的生物活性。典型的Jak-STAT信號(hào)通路依賴于STAT的磷酸化,干擾素結(jié)合其受體后引起Jak以及下游的STAT1和STAT2的磷酸化,與干擾素調(diào)節(jié)蛋白9(interferon regulatory factor 9, IRF9)組成復(fù)合體,形成干擾素刺激因子3(IFN-stimulated gene factor 3, ISGF3),進(jìn)入細(xì)胞核啟動(dòng)基因的轉(zhuǎn)錄,發(fā)揮其抗病毒、抗增殖及抗微生物等活性[3, 4]。關(guān)于干擾素λ信號(hào)通路同干擾素α信號(hào)通路比較的區(qū)別,首先IFN-λR1不是普遍表達(dá)的,尤其在免疫細(xì)胞中其表達(dá)有明顯的差別,所以免疫細(xì)胞對(duì)IFN-λ1更加敏感。此外,IFN-λ和IFN-λR結(jié)合親和力與IFN-α的結(jié)合親和力比較差異很大。最后,以單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotide polymorphisms,SNP)形式出現(xiàn)的遺傳變異與參與IFN-λ信號(hào)通路的級(jí)聯(lián)反應(yīng)有關(guān),這與乙肝和丙肝病毒感染的臨床進(jìn)程和治療關(guān)系密切[5]。
與Ⅰ型干擾素不同的是,IFN-λs還能誘導(dǎo)除STAT1以外的其他STAT的磷酸化,如STAT3和STAT5[6]。這就意味著IFN-λ信號(hào)途徑比其他的IFN途徑要復(fù)雜的多。前期研究發(fā)現(xiàn)在肝癌細(xì)胞系中IFN-λ1能夠引起STAT5的磷酸化[7]。由此筆者推測(cè)IFN-λ1的受體IFN-λR1可能參與STAT5的相互作用。同時(shí)前期研究中筆者也發(fā)現(xiàn)IFN-λR1能與RAN蛋白在微管組織中心的結(jié)合蛋白(ran binding protein in the microtubule-organizing center, RanBPM又被稱為RanBP9)相互作用,增強(qiáng)了干擾素刺激反應(yīng)原件(IFN-stimulated response elements, ISRE)的活性,調(diào)控干擾素λ途徑[8]。但是,RanBPM是否能與STAT5相互結(jié)合,進(jìn)而調(diào)控其活性影響干擾素λ途徑尚不清楚。本研究中筆者將以STAT5A為研究對(duì)象,明確RanBPM能否與其相互作用,以及相互作用后對(duì)IFN-λ信號(hào)途徑的影響。
1.材料:人胚腎細(xì)胞株HEK293T、肝癌細(xì)胞株Huh7、Hep3B由本實(shí)驗(yàn)室保存。表達(dá)質(zhì)粒pCMV-Myc、pFlag-CMV2、pFlag-IFN-λR1及其截短體質(zhì)粒,pHA-RanBPM及其截短體質(zhì)粒,pMyc-STAT5A,報(bào)告基因質(zhì)粒pGL3-basic、pSTAT5-luc、pRL-SV40由本實(shí)驗(yàn)室保存或構(gòu)建。胎牛血清、DMEM、PBS、0.05%胰酶、青霉素/鏈霉素和轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine 3000購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司;重組人干擾素lambda1(rhIFN-λ1)由本實(shí)驗(yàn)室純化;雙熒光素報(bào)告基因試劑購(gòu)自美國(guó)Promega公司;蛋白酶抑制劑購(gòu)自瑞士Roche公司;Protein A/G-瓊脂糖介質(zhì)購(gòu)自美國(guó)GE公司;anti-Flag和anti-HA、抗體購(gòu)自美國(guó)Sigma公司,anti-Myc抗體購(gòu)自美國(guó)Santa Cruz公司。
2.細(xì)胞培養(yǎng):HEK 293T、Huh 7或Hep 3B細(xì)胞培養(yǎng)于DMEM培養(yǎng)基中(含10%胎牛血清、100U/ml青霉素、100μg/ml鏈霉素),在含5%CO2的37℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)。細(xì)胞用含0.05%胰蛋白酶消化、傳代,待細(xì)胞增殖旺盛、狀態(tài)良好時(shí)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。
3.細(xì)胞轉(zhuǎn)染和rhIFN-λ1處理細(xì)胞:消化細(xì)胞,將細(xì)胞傳到6孔板或96孔板后,細(xì)胞匯合度達(dá)到80%左右,可以進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染。細(xì)胞轉(zhuǎn)染前2h,將培養(yǎng)基更換為含3%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,然后按照Lipofectamine 3000說(shuō)明書(shū)進(jìn)行轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染6h后將培養(yǎng)基更換含10%胎牛血清的常規(guī)培養(yǎng)基。細(xì)胞轉(zhuǎn)染24h之后,棄掉舊培養(yǎng)基,細(xì)胞用PBS洗3次。然后再細(xì)胞中加入含3%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,放置到37℃恒溫培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)2~4h,然后加入rhIFN-λ1(終濃度為200ng/ml)處理相應(yīng)的時(shí)間。
4.細(xì)胞裂解和免疫共沉淀:細(xì)胞轉(zhuǎn)染24h后,觀察細(xì)胞狀態(tài)以及細(xì)胞數(shù)量。配置新鮮的細(xì)胞裂解液(含150mmol/L NaCl,50mmol/L Tris-HCl pH值為7.6,1% NP-40,10% glycerol,蛋白酶抑制劑)。棄掉細(xì)胞培養(yǎng)基,然后用PBS洗細(xì)胞,加入適量的細(xì)胞裂解液。用細(xì)胞刮棒將細(xì)胞刮下,將細(xì)胞放置在冰上15min,然后12000r/min離心10min。取離心上清液,測(cè)量蛋白濃度。取1/10裂解液體積作為參照物(input),用于檢測(cè)細(xì)胞裂解液中各個(gè)目的基因的表達(dá)情況。取400μg總蛋白,首先用與免疫共沉淀抗體同屬種的IgG進(jìn)行預(yù)處理1h,然后再加入1μg免疫共沉淀的抗體,放置到4℃混勻儀上過(guò)夜。然后加入40μl protein A/G-Sephorose 介質(zhì),4℃繼續(xù)孵育1h。然后3000r/min離心2min,棄上清,用細(xì)胞裂解液洗滌介質(zhì),15分/次,洗滌2次;加入上樣緩沖液,混勻后在沸水中使蛋白變性。根據(jù)目的蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量,配置不同濃度的SDS-PAGE分離蛋白,Western blot法檢測(cè)目的蛋白的表達(dá)。
表1 雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)中各組每孔轉(zhuǎn)染質(zhì)粒量(μg)
1.IFN-λR1中含有兩個(gè)STAT5的結(jié)合位點(diǎn):生物信息學(xué)分析顯示IFN-λR1中有兩個(gè)STAT5A的結(jié)合位點(diǎn),分別是位于343~346的“YIEP”氨基酸殘基和位于406~409的“YLAE”氨基酸殘基(圖1A)。IFN-λR1中227~249氨基酸為其跨膜結(jié)構(gòu)域,根據(jù)STAT5結(jié)合位點(diǎn)所在的位置將IFN-λR1膜內(nèi)區(qū)IFN-λR1-ICD分成IFN-λR1-ICDΔ1和IFN-λR1-ICDΔ2。
STAT5A與IFN-λR1、IFN-λR1-ICD、IFN-λR1-ICDΔ1和IFN-λR1-ICDΔ2的免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示STAT5A與IFN-λR1中的兩個(gè)截短體IFN-λR1-ICDΔ1和IFN-λR1-ICDΔ2都能相互作用,IFN-λR1含有兩個(gè)STAT5A的結(jié)合位點(diǎn)(圖1B)。
圖1 IFN-λR1中含有兩個(gè)與STAT5A相互作用的位點(diǎn)
A.IFN-λR1截短體示意圖,227~249IFN-λR1為跨膜結(jié)構(gòu)域,343~346IFN-λR1和406~409IFN-λR1為預(yù)測(cè)的STAT5結(jié)合位點(diǎn);B.STAT5A與IFN-λR1截短體的相互作用
2.RanBPM與STAT5A相互作用的鑒定:采用免疫共沉淀的方法檢驗(yàn)了RanBPM與STAT5A的相互作用(圖2A)。然后對(duì)RanBPM的結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)RanBPM中也有兩個(gè)STAT5A的結(jié)合位點(diǎn),分別是位于177~180的“YIGL”氨基酸殘基和位于526~529的“YCHS”氨基酸殘基,其中“YIGL”位于氨基端的脯氨酸富集區(qū)結(jié)構(gòu)域(pro-rich domain),“YCHS”位于CTLH結(jié)構(gòu)域和CRA結(jié)構(gòu)域中間(圖2B)。STAT5A與RanBPM的截短體質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染后,免疫共沉淀結(jié)果顯示含有STAT5A結(jié)合位點(diǎn)的截短體RanBPM-N和RanBPM-C與STAT5A相互作用(圖2C)。
圖2 RanBPM中與STAT5A 相互作用結(jié)構(gòu)域的鑒定
A.STAT5A和RanBPM的相互作用;B.RanBPM截短體示意圖,RanBPM中含有5個(gè)結(jié)構(gòu)域,177~180RanBPM和526~529RanBPM是預(yù)測(cè)的STAT5的結(jié)合位點(diǎn);C.STAT5A和RanBPM各個(gè)截短體的相互作用
3.RanBPM影響IFN-λR1與STAT5A的相互作用:IFN-λR1、STAT5A和RanBPM能形成一個(gè)蛋白復(fù)合體,但尚不清楚IFN-λR1的配體IFN-λ1對(duì)這個(gè)蛋白復(fù)合體的形成有何作用。IFN-λR1、STAT5A和RanBPM共轉(zhuǎn)染的情況下,加入IFN-λ1處理12h后,免疫共沉淀與IFN-λR1結(jié)合的蛋白。RanBPM增強(qiáng)IFN-λR1與STAT5A的結(jié)合;加入IFN-λ1刺激后,IFN-λR1與RanBPM,以及IFN-λR1與STAT5A之間的相互作用都明顯增強(qiáng),但是轉(zhuǎn)染RanBPM組的相互作用更強(qiáng)(圖3)。
圖3 RanBPM增強(qiáng)了IFN-λR1和STAT5的相互作用
4.RanBPM影響STAT5A報(bào)告基因活:為了檢測(cè)STAT5A和RanBPM相互作用后對(duì)STAT5A轉(zhuǎn)錄能力的影響,采用雙熒光素報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)檢測(cè)了STAT5A的轉(zhuǎn)錄能力。在兩株肝癌細(xì)胞Huh 7和Hep 3B細(xì)胞中,在轉(zhuǎn)染RanBPM后,增強(qiáng)了STAT5A的雙熒光素酶報(bào)告基因活性;同時(shí),在加入IFN-λ1刺激后STAT5A雙熒光素酶報(bào)告基因活性明顯增強(qiáng),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖4,P<0.05)。
干擾素根據(jù)其受體的特征,可將干擾素分為Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ 3種類型。Ⅰ型干擾素如IFN-α已在在臨床上廣泛用于黑色素瘤、腎癌、毛細(xì)胞性白血病、慢性骨髓性白血病、淋巴瘤和卡波西肉瘤等多種腫瘤的治療[9]。
圖4 RanBPM增強(qiáng)了STAT5A報(bào)告基因活性
A.在huh7細(xì)胞利用雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)檢測(cè)RanBPM對(duì)STAT5A報(bào)告基因活性的影響;B.在Hep3B細(xì)胞中利用雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)檢測(cè)RanBPM對(duì)STAT5A報(bào)告基因活性的影響。*P<0.05
IFNλ包括3個(gè)家族成員IL-28a(IFN-λ2)、IL-28b(IFN-λ3)以及IL-29(IFN-λ1),他們具有類似的結(jié)構(gòu)[10]。相對(duì)于Ⅰ型干擾素,上皮細(xì)胞中更容易表達(dá)IFN-λ1,因此上皮細(xì)胞中IFN-λ1的特異性受體IFN-λR1也是高表達(dá)的,因此IFN-λ1被認(rèn)為是上皮來(lái)源的細(xì)胞因子[11]。IFN-λ1在體內(nèi)外表現(xiàn)出抗病毒,抑制腫瘤增殖以及免疫調(diào)節(jié)的能力。同時(shí),IFN-λR1的表達(dá)與Ⅰ型干擾素受體不同,具有組織特異性,其在骨髓造血細(xì)胞及腦、脊髓中樞神經(jīng)細(xì)胞表達(dá)量很低,與目前臨床上普遍應(yīng)用的IFN-α比較,在發(fā)揮生物活性的同時(shí)有效地減少發(fā)熱、抑郁及骨髓抑制等不良反應(yīng)[12]。這也使得IFN-λ可望成為一種新型的免疫生物制劑。因此,深入研究IFN-λ信號(hào)通路中除了活化JAK-STATs等已知的信號(hào)途徑外,是否還有其他的信號(hào)分子參與調(diào)控干擾素的生物學(xué)活性或其信號(hào)途徑,對(duì)于指導(dǎo)其臨床應(yīng)用具有重要的指導(dǎo)作用。
實(shí)驗(yàn)室前期研究發(fā)現(xiàn)IFN-λR1能夠與RanBPM相互作用,RanBPM參與調(diào)控IFN-λ信號(hào)途徑,是新的調(diào)控干擾素途徑的蛋白。本研究通過(guò)生物信息學(xué)的分析發(fā)現(xiàn)IFN-λR1中含有兩個(gè)與STAT5A結(jié)合的位點(diǎn),通過(guò)免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)含有結(jié)合位點(diǎn)的截短體參與STAT5A的相互作用;通過(guò)分析RanBPM的結(jié)構(gòu)域發(fā)現(xiàn),存在兩個(gè)與STAT5A相互作用的位點(diǎn),分別位于氨基端的脯氨酸富集區(qū)以及CTLH結(jié)構(gòu)域和CRA結(jié)構(gòu)域中間;免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)證實(shí)RanBPM與STAT5A相互作用。
RanBPM在細(xì)胞中廣泛表達(dá),是細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核之間的穿梭蛋白,具有核定位和出核序列,更有利于RanBPM在細(xì)胞質(zhì)-細(xì)胞核穿梭,但是其功能尚不完全清楚[13]?,F(xiàn)在普遍認(rèn)為RanBPM是一個(gè)腳手架蛋白,介導(dǎo)細(xì)胞中多個(gè)蛋白的相互作用[14]。RanBPM由4個(gè)結(jié)構(gòu)域組成,分別是氨基端富含脯氨酸的結(jié)合SH3的結(jié)構(gòu)域,中間的SPRY結(jié)構(gòu)域和LiSH/CTLH結(jié)構(gòu)域,以及羧基端的CRA結(jié)構(gòu)域。SPRY和CRA兩個(gè)結(jié)構(gòu)域介導(dǎo)了與多個(gè)蛋白的相互作用,其中包含多個(gè)受體如雄激素受體、糖皮質(zhì)激素受體和甲狀腺受體等[15]。同時(shí)RanBPM還能與轉(zhuǎn)錄因子相互作用,調(diào)控其轉(zhuǎn)錄活性,如艾巴病毒早期蛋白R(shí)ta和Zta、TIP60等[16,17]。本研究發(fā)現(xiàn),RanBPM中含有兩個(gè)STAT5結(jié)合位點(diǎn),這兩個(gè)位點(diǎn)在SPRY和CRA結(jié)構(gòu)域之外。這就豐富了RanBPM與轉(zhuǎn)錄因子相互作用位點(diǎn),為RanBPM的轉(zhuǎn)錄共激活功能提供結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
本研究發(fā)現(xiàn),在IFN-λ1刺激下,IFN-λR1、RanBPM和STAT5A之間的相互作用會(huì)增強(qiáng);雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)也證明了相互作用增強(qiáng)后,STAT5A的轉(zhuǎn)錄活性也會(huì)增強(qiáng)。哺乳動(dòng)物中有7類STAT分子,分別是STAT1、STAT2、STAT3、STAT4、STAT5A、STAT5B和STAT6,其中STAT5A和STAT5B蛋白的相似度約為91%[18]。STAT5A和STAT5B可被催乳素、生長(zhǎng)因子、白介素、GMCSF等多種因子激活[19]。STAT5參與多個(gè)細(xì)胞功能調(diào)控過(guò)程,如細(xì)胞增殖、細(xì)胞分化等。STAT5參與調(diào)控NK(natural killer)細(xì)胞的成熟化過(guò)程,發(fā)揮免疫調(diào)節(jié)的功能[20]。同時(shí)STAT5A的異常激活會(huì)利于腫瘤細(xì)胞的存活和腫瘤的惡性進(jìn)展,參與化療抵抗過(guò)程。因此,IFN-λ治療腫瘤的研究中,應(yīng)考慮細(xì)胞中RanBPM對(duì)IFN-λ信號(hào)的調(diào)控作用以及對(duì)STAT5A作用,避免因其過(guò)度激活帶來(lái)的不良反應(yīng)。