簡(jiǎn)東琴 曾令江 楊穎舫 楊春賢
摘要:【目的】克隆南方紅豆杉的2-C-甲基-D-赤蘚醇-4-磷酸胱氨酰轉(zhuǎn)移酶(MCT)基因(TcMCT),分析其功能,并檢測(cè)組織表達(dá)特異性,為深入研究TcMCT基因在紫杉醇生物合成中的作用機(jī)制提供理論依據(jù)?!痉椒ā坎捎胏DNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)獲得TcMCT基因的cDNA全長(zhǎng)序列,對(duì)其編碼蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析及亞細(xì)胞定位,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)檢測(cè)TcMCT基因的組織表達(dá)模式,并在大腸桿菌中超表達(dá)該基因以驗(yàn)證其功能。【結(jié)果】克隆獲得的TcMCT基因cDNA序列全長(zhǎng)為1293 bp,開(kāi)放閱讀框(ORF)為942 bp,編碼313個(gè)氨基酸。TcMCT蛋白與其他植物MCT蛋白中均含保守的MEP結(jié)合位點(diǎn)和CTP結(jié)合位點(diǎn),但在N端氨基酸序列保守性較差,其中與同為裸子植物銀杏GbMCT蛋白的親緣關(guān)系最近,氨基酸序列的相似性為59.3%。TcMCT蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)與AtMCT蛋白相似,均屬于同源二聚體。TcMCT蛋白N端含84個(gè)氨基酸殘基的質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽,且以Arg88作為切割位點(diǎn),定位于葉綠體中。TcMCT基因在南方紅豆杉不同組織中均有表達(dá),在綠色樹(shù)皮中的相對(duì)表達(dá)量顯著高于其他組織(P<0.05,下同),且在老葉和嫩葉中的相對(duì)表達(dá)量顯著高于莖和根,在莖和根中的表達(dá)量極少甚至不表達(dá)。大腸桿菌中超表達(dá)TcMCT基因可促進(jìn)β-胡蘿卜素大量積累?!窘Y(jié)論】不同物種MCT氨基酸序列具有較高的保守性,TcMCT基因具有明顯的組織表達(dá)特異性,可調(diào)控萜類物質(zhì)如β-胡蘿卜素等的生物合成,推測(cè)其在紫杉醇生物合成中發(fā)揮重要調(diào)控作用。
關(guān)鍵詞: 南方紅豆杉;2-C-甲基-D-赤蘚醇-4-磷酸胱氨酰轉(zhuǎn)移酶(MCT);生物信息學(xué)分析;功能驗(yàn)證;紫杉醇
0 引言
【研究意義】南方紅豆杉(Taxus chinensis)為我國(guó)特有種,其樹(shù)形美觀,木質(zhì)優(yōu)良,富含紫杉醇,是罕見(jiàn)的一樹(shù)三用樹(shù)種(吳繼剛,2015)。臨床研究發(fā)現(xiàn),紫杉醇在治療乳腺癌、卵巢癌和肺癌等方面療效顯著,是一種高效新型的抗癌藥物(Armstrong et al.,2006;Miller et al.,2007;Rezazadeh et al.,2016;Oudin et al.,2017)。此外,紫杉醇可提高植物抵抗真菌的能力(Soliman et al.,2015)。異戊烯焦磷酸(IPP)是紫杉醇、胡蘿卜素等萜類化合物生物合成的重要前體物質(zhì),而2-C-甲基-D-赤蘚醇-4-磷酸胱氨酰轉(zhuǎn)移酶(MCT)不僅是參與IPP合成的關(guān)鍵酶,還是萜類物質(zhì)生物合成MEP途徑中的關(guān)鍵酶之一(Rohdich et al.,1999;Croteau et al.,2006)。因此,克隆TcMCT基因,并分析其生物學(xué)功能,對(duì)提高紅豆杉紫杉醇含量具有重要意義,同時(shí)可為南方紅豆杉分子育種提供理論依據(jù)。【前人研究進(jìn)展】MCT參與4-二磷酸胞苷-2-C-甲基赤蘚糖醇(CDP-ME)的合成。Rohdich等(1999)將帶有14C標(biāo)記的CDP-ME轉(zhuǎn)入辣椒,結(jié)果發(fā)現(xiàn)帶有14C標(biāo)記的CDP-ME在辣椒質(zhì)體中參與類胡蘿卜素生物合成,說(shuō)明MCT在萜類化合物生物合成過(guò)程中發(fā)揮重要作用。迄今為止,已從擬南芥(Rohdich et al.,2000)、杜仲(劉攀峰,2012)、胡黃連(鄭玉娟等,2014)、雷公藤(董宇茹等,2015;宋雅迪等,2018)、青蒿(張曼等,2016)和卷葉貝母(張?zhí)鹛鸬龋?018)等被子植物中克隆獲得MCT基因,但關(guān)于其功能鑒定的研究報(bào)道較少。Rohdich等(2000)研究發(fā)現(xiàn),擬南芥AtMCT蛋白的N端含有質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽序列,與MEP途徑定位于質(zhì)體相吻合,通過(guò)抑制AtMCT基因的表達(dá)能下調(diào)貝殼杉烯的生物合成。董宇茹等(2015)、宋雅迪等(2018)研究發(fā)現(xiàn),雷公藤TwMCT基因?qū)儆贛CT基因家族成員,且受茉莉酸甲酯(MeJA)誘導(dǎo)表達(dá),通過(guò)RNAi技術(shù)抑制雷公藤TwMCT基因表達(dá)后,植株中的雷公藤甲素和雷公藤紅素含量顯著下降。張曼等(2016)從青蒿中克隆獲得AaMCT基因cDNA序列,該基因編碼蛋白定位于葉綠體中,且在青蒿分泌型腺體中特異性表達(dá),將其轉(zhuǎn)入擬南芥中超表達(dá)后能顯著促進(jìn)葉綠素a、葉綠素b和類胡蘿卜素等萜類化合物合成。由此可見(jiàn),在被子植物中,不同物種的MCT基因均對(duì)萜類化合物合成具有重要調(diào)控作用。目前,在裸子植物中僅銀杏MCT基因的相關(guān)研究被報(bào)道。Kim等(2006)首次從銀杏中克隆得到GbMCT基因,并通過(guò)煙草細(xì)胞葉綠體熒光染色試驗(yàn)證明GbMCT蛋白N端含88個(gè)氨基酸的質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽。【本研究切入點(diǎn)】至今,鮮見(jiàn)有關(guān)南方紅豆杉中紫杉醇生物合成途徑中關(guān)鍵酶基因MCT的研究報(bào)道?!緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】采用cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)從南方紅豆杉中克隆TcMCT基因的cDNA序列全長(zhǎng),對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)檢測(cè)其組織表達(dá)特性,并在大腸桿菌中超表達(dá)該基因以驗(yàn)證其功能,以期從分子水平探討MCT基因在萜類化合物合成中的作用,為紫杉醇生物合成研究提供候選功能基因。
1 材料與方法
1. 1 試驗(yàn)材料
供試的3株南方紅豆杉均由西南大學(xué)實(shí)驗(yàn)基地提供,樹(shù)齡為4年,長(zhǎng)勢(shì)基本一致,由西藏農(nóng)牧學(xué)院蘭小中教授鑒定為T. media Rehd. var. mairei Lemee et Levl。本氏煙草種子、大腸桿菌DH5α和XL1-Blue均由西南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院實(shí)驗(yàn)室保存提供。pAC-BETA和pTrc-AtIPI質(zhì)粒由馬里蘭大學(xué)的Francis X Cunningham博士惠贈(zèng)。主要試劑:植物RNA提取試劑盒和FastQuant cDNA第一鏈合成試劑盒均購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司,BD SMARTTM RACE cDNA Amplification Kit購(gòu)自美國(guó)CLONTECH公司;RNA PCR Kit(AMV) Ver.3.0、3'-Full RACE Core Set試劑盒和SYBR Premix Ex Taq II(Perfect Real Time)購(gòu)于日本TaKaRa公司。主要儀器設(shè)備:Centrifuge 5417R冷凍離心機(jī)(Eppendorf,德國(guó))、DYY-8C電泳儀(北京市六一儀器廠)、梯度PCR儀(Bio-Rad,美國(guó))和LSM700激光共聚焦顯微鏡(ZEISS,德國(guó))等。
1. 2 RNA提取及cDNA合成
將南方紅豆杉植株從土中連根拔出,收集主根中段部,剝?nèi)【G色樹(shù)皮,采集所有的新葉(當(dāng)年新生葉)和老葉(多年生葉),分別將這些組織置于液氮中速凍,用于提取總RNA。使用HITACHI3010分光光度計(jì)檢測(cè)RNA濃度,按照植物RNA提取試劑盒說(shuō)明提取南方紅豆杉各組織RNA,并參照RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0試劑盒說(shuō)明合成cDNA第一鏈。
1. 3 TcMCT基因cDNA全長(zhǎng)序列克隆
根據(jù)NCBI已公布的擬南芥(Arabidopsis thalia-na)、銀杏(Ginkgo biloba)等物種MCT基因的核苷酸序列,利用Vector NTI 8.0進(jìn)行多重序列比對(duì),選取最保守核苷酸序列設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物(表1)。以南方紅豆杉綠色樹(shù)皮cDNA為模板,PCR擴(kuò)增TcMCT基因的核心片段。反應(yīng)體系:10×PCR Buffer 5.0 μL,25 mmol/L MgCl2 3.0 μL,10 mmol/L dNTP 1.0 μL,10 μmol/L TCMCT-F和TCMCT-R游引物各1.0 μL,cDNA模板1.0 μL,2.5 U Taq DNA聚合酶0.5 μL,ddH2O補(bǔ)足至50.0 μL。擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃ 45 s,61 ℃(每個(gè)循環(huán)降低0.5 ℃)45 s,進(jìn)行20個(gè)循環(huán);94 ℃ 45 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,進(jìn)行25個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。
根據(jù)3'-Full RACE Core Set試劑盒說(shuō)明獲得3' RACE-Ready cDNA,并以此為模板PCR擴(kuò)增TcMCT基因的3'端序列。3'端序列第1次擴(kuò)增反應(yīng)體系:10×PCR Buffer 5.00 μL,25 mmol/L MgCl2 3.00 μL,10 mmol/L dNTP 1.00 μL,10 μmol/L TcMCT3-1和M13引物各1.00 μL,3'RACE-Ready cDNA 1.00 μL,Ex TaqTM HS 0.25 μL,ddH2O補(bǔ)足至50.00 μL。擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,進(jìn)行30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。3'端序列第2次擴(kuò)增反應(yīng)體系:10×PCR Buffer 5.00 μL,25 mmol/L MgCl2 3.00 μL,10 mmol/L dNTP 1.00 μL,10 μmol/L TcMCT3-2和 M13引物各0.50 μL,第1次擴(kuò)增產(chǎn)物50倍稀釋液1.00 μL,Ex TaqTM HS 0.25 μL,ddH2O補(bǔ)足至50.00 μL。第2次擴(kuò)增程序與第1次擴(kuò)增程序相同。根據(jù)BD SMARTTM RACE cDNA Amplification試劑盒說(shuō)明獲得5'RACE-Ready cDNA,并以此為模板PCR擴(kuò)增TcMCT基因的5'端序列。5'端序列第1次擴(kuò)增反應(yīng)體系:10×BD Advantage2 PCR Buffer 2.5 μL,50×BD Advantage2 Polymerase Mix 0.5 μL,10 mmol/L dNTP 0.5 μL,10 μmol/L TcMCT5-1引物1.0 μL,10 μmol/L UPM引物(Long和Short)2.5 μL,5'RACE-Ready cDNA 1.5 μL,PCR-Grade Water補(bǔ)足至25.0 μL。擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性1 min;94 ℃ 30 s,68 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,進(jìn)行30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸8 min。第2次擴(kuò)增反應(yīng)體系:10×BD Advantage2 PCR Buffer 5.0 μL,50×BD Advantage2 Polymerase Mix 1.0 μL,10 mmol/L dNTP 1.0 μL,10 μmol/L TcMCT5-2和NUP引物1.0 μL,第1次擴(kuò)增產(chǎn)物50倍稀釋液1.0 μL,PCR-Grade Water補(bǔ)足至50.0 μL。第2次擴(kuò)增程序與第1次擴(kuò)增程序相同。
TcMCT基因核心片段及3'端和5'端序列的PCR產(chǎn)物均用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),在凝膠成像系統(tǒng)下觀察分析并拍照記錄,切膠回收目的片段后分別連接至pMD18-T載體上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,菌液PCR驗(yàn)證后挑取陽(yáng)性克隆送至上海英駿生物技術(shù)有限公司測(cè)序。
將以上測(cè)序結(jié)果進(jìn)行拼接獲得TcMCT基因cDNA全長(zhǎng)序列,以此設(shè)計(jì)獲得TcMCT基因cDNA全長(zhǎng)序列的PCR特異性引物(TcMCT-F1和TcMCT-R1)(表1),并利用南方紅豆杉綠色樹(shù)皮cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系:10×PCR Buffer 5.0 μL,25 mmol/L MgCl2 3.0 μL,10 mmol/L dNTP 1.0 μL,10 μmol/L TcMCT-F1和TcMCT-R1引物各1.0 μL,cDNA模板1.0 μL,2.5 U Taq DNA聚合酶0.5 μL,ddH2O補(bǔ)足至50.0 μL。擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 90 s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸1 min。PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),在凝膠成像系統(tǒng)下觀察分析并拍照記錄,切膠回收目的片段后連接至pMD18-T載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,菌液PCR驗(yàn)證后挑取陽(yáng)性克隆送至上海英駿生物技術(shù)有限公司測(cè)序。
1. 4 生物信息學(xué)分析
使用Vector NTI 8.0分析TcMCT基因編碼區(qū)序列,并將其翻譯成氨基酸序列,利用NCBI中的BLASTp和CluxtalX進(jìn)行氨基酸序列多重比對(duì),利用ExPASy預(yù)測(cè)蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量和理論等電點(diǎn)(pI),利用SWISS-MODEL對(duì)蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行同源建模,利用MEGA 4.1的鄰位相聯(lián)法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)。
1. 5 亞細(xì)胞定位
使用ChloroP分析TcMCT蛋白的質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽序列(Xiao et al.,2009),根據(jù)編碼質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽的核苷酸序列(TP)設(shè)計(jì)其PCR擴(kuò)增特異性引物(TcMCT-SF和TcMCT-SR)(表1),將該序列與植物表達(dá)載體pCAMBIA1300-GFP連接以構(gòu)建重組質(zhì)粒pCAMBIA1300-TP-GFP。根據(jù)Yoo等(2007)的方法制備煙草原生質(zhì)體。在聚乙二醇(PEG)介導(dǎo)下分別將pCAMBIA1300-TP-GFP和pCAMBIA1300-GFP(陰性對(duì)照)轉(zhuǎn)至化煙草原生質(zhì)體中,使用LSM700激光共聚焦顯微鏡觀察綠色熒光蛋白(GFP)在細(xì)胞中的定位情況(Suire et al.,2000)。
1. 6 qRT-RCR檢測(cè)
按照植物RNA提取試劑盒說(shuō)明分別提取南方紅豆杉根、莖、老葉、嫩葉和綠色樹(shù)皮的總RNA,使用HITACHI3010分光光度計(jì)檢測(cè)其濃度,并用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其質(zhì)量。將質(zhì)量好的總RNA按FastQuant cDNA第一鏈合成試劑盒說(shuō)明去除gDNA并反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈。將cDNA用RNase-Free ddH2O稀釋20倍后用作模板,按照SYBR Premix Ex Taq II(Perfect Real Time)試劑盒說(shuō)明進(jìn)行qRT-PCR檢測(cè)。反應(yīng)體系:2×SYBR Premix Ex Taq II 10.0 μL,10 μmol/L qTcMCT-F和qTcMCT-R引物(表1)各1.0 μL,cDNA模板1.0 μL,RNase Free H2O補(bǔ)足至20.0 μL。擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性30 s;95 ℃ 15 s,55 ℃ 15 s,68 ℃ 15 s,進(jìn)行40個(gè)循環(huán)。以18S作為內(nèi)參基因,采用2-??Ct計(jì)算基因的相對(duì)表達(dá)量。其中,每個(gè)樣品重復(fù)3次,統(tǒng)計(jì)分析用 t 檢驗(yàn)。
1. 7 功能互補(bǔ)驗(yàn)證
大腸桿菌體內(nèi)的MEP途徑能提供β-胡蘿卜素前體分子IPP和二甲基烯丙基焦磷酸(DMAPP),但缺失從前體分子到β-胡蘿卜素合成途徑中的4個(gè)酶基因:香葉基香葉基焦磷酸酶(crtE)、八氫番茄紅素合成酶(crtB)、八氫番茄紅素脫飽和酶(crtI)和番茄紅素環(huán)化酶(crtY),因此,大腸桿菌不能合成β-胡蘿卜素。若將上述4個(gè)基因重組至pAC-BETA質(zhì)粒上,轉(zhuǎn)入大腸桿菌中即可在其體內(nèi)構(gòu)建β-胡蘿卜素途徑,但無(wú)法大量積累β-胡蘿卜素,因此,大腸桿菌菌落呈白色。將pTrc-AtIPI質(zhì)粒與pAC-BETA共轉(zhuǎn)化大腸桿菌,因大腸桿菌體內(nèi)超表達(dá)擬南芥IPI基因(AtIPI,IPI為IPP異構(gòu)酶)能促進(jìn)β-胡蘿卜素積累,故菌落呈現(xiàn)橘黃色(Gao et al.,2006)?;谏鲜鲈?,參照劉萬(wàn)宏(2008)的方法,設(shè)計(jì)擴(kuò)增TcMCT基因編碼區(qū)的引物(pTcMCT-F和pTcMCT-R),將PCR擴(kuò)增獲得的TcMCT基因編碼區(qū)序列替換pTrc-AtIPI質(zhì)粒上的AtIPI基因即可獲得pTrc-TcMCT重組質(zhì)粒。以pTrc-TcMCT與pAC-BETA共轉(zhuǎn)染大腸桿菌XL1-Blue后涂布于含氯霉素和氨芐霉素的LB固體培養(yǎng)基上培養(yǎng),篩選出陽(yáng)性克隆。此外,構(gòu)建擬南芥pTrc-AtMCT重組質(zhì)粒(構(gòu)建方法同上),將其與pAC-BETA共轉(zhuǎn)染大腸桿菌XL1-Blue后涂布于含氯霉素和氨芐霉素的LB固體培養(yǎng)基上,用作陽(yáng)性對(duì)照。以大腸桿菌XL1-Blue、pAC-BETA轉(zhuǎn)染大腸桿菌XL1-Blue、pTrc-TcMCT轉(zhuǎn)染大腸桿菌XL1-Blue及pTrc與pAC-BETA共轉(zhuǎn)染大腸桿菌為陰性對(duì)照。
2 結(jié)果與分析
2. 1 TcMCT基因cDNA全長(zhǎng)序列克隆及序列分析結(jié)果
PCR擴(kuò)增獲得的TcMCT基因(GenBank登錄號(hào)為KC110615.1)cDNA全長(zhǎng)序列為1293 bp(圖1),其中,5'端非翻譯區(qū)為58 bp,3'端非翻譯區(qū)為293 bp,開(kāi)放閱讀框(ORF)為942 bp,編碼313個(gè)氨基酸(圖2)。
2. 2 TcMCT蛋白的生物信息學(xué)分析結(jié)果
ExPASy預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,TcMCT蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量為34.3 kD,pI為8.96。將TcMCT(AGP04988.1)與銀杏GbMCT(AAZ80386.1)、青蒿AaMCT(KU 365210.1)、擬南芥AtMCT(NP_565286.1)和丹參SmMCT(AEZ55666.1)進(jìn)行氨基酸序列多重比對(duì)分析,結(jié)果(圖3)顯示,TcMCT蛋白與其他植物MCT蛋白中均含有保守的MEP結(jié)合位點(diǎn)和CTP結(jié)合位點(diǎn),但在N端氨基酸序列保守性較差。系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果(圖4)顯示,MCT蛋白可分為五大類群,即雙子葉植物、單子葉植物、裸子植物、藻類植物和菌類,各類群物種的MCT蛋白親緣關(guān)系最近,其中,TcMCT蛋白與同為裸子植物的銀杏GbMCT蛋白的親緣關(guān)系最近,氨基酸序列的相似性為59.3%。通過(guò)蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)的同源性建模發(fā)現(xiàn),TcMCT與AtMCT蛋白均屬于同源二聚體(圖5),且CTP結(jié)合位點(diǎn)位置相似,分別為Arg103~Lys110和Arg91~Lys98,MEP結(jié)合位點(diǎn)位置也相似,分別為Arg240~Lys296和Arg228~Lys284,表明二者可能具有相似的生物學(xué)功能。
2. 3 TcMCT蛋白的亞細(xì)胞定位結(jié)果
ChloroP預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,TcMCT蛋白的N端含有84個(gè)氨基酸殘基的質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽(圖2黑色下劃線),且以Arg88作為切割位點(diǎn),與AtMCT轉(zhuǎn)運(yùn)肽切割位點(diǎn)相同(Xiao et al.,2009)。將含TcMCT蛋白質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽編碼核苷酸序列(TP)的重組質(zhì)粒pCAMBIA1300-TP-GFP轉(zhuǎn)化至煙草原生質(zhì)體中,結(jié)果發(fā)現(xiàn),TcMCT蛋白的質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽和GFP融合蛋白在488 nm波長(zhǎng)激發(fā)光下發(fā)射綠色熒光(圖6-A),煙草葉綠體在555 nm波長(zhǎng)激發(fā)光下發(fā)射紅色熒光(圖6-B),且兩種熒光能完全重疊呈黃色熒光(圖6-C),表明TcMCT蛋白定位于葉綠體中。
2. 4 TcMCT基因的組織表達(dá)特性分析結(jié)果
從圖7可知,TcMCT基因在南方紅豆杉不同組織中均有表達(dá),但表達(dá)水平存在明顯差異,TcMCT基因在綠色樹(shù)皮中的相對(duì)表達(dá)量顯著高于其他組織(P<0.05,下同),且在老葉和嫩葉中的相對(duì)表達(dá)量顯著高于莖和根,在莖和根中的表達(dá)量極少甚至不表達(dá),說(shuō)明TcMCT基因在南方紅豆杉中的表達(dá)具有組織特異性。
2. 5 TcMCT基因功能驗(yàn)證結(jié)果
將pTrc-TcMCT與pAC-BETA共轉(zhuǎn)染大腸桿菌XL1-Blue后涂布于含氯霉素和氨芐霉素的LB固體培養(yǎng)基上,28 ℃培養(yǎng)2 d,陽(yáng)性克隆呈橘黃色,挑取陽(yáng)性克隆擴(kuò)大培養(yǎng)后涂布于含0.1 mmol/L IPTG、氯霉素和氨芐霉素的LB固體培養(yǎng)基上,28 ℃培養(yǎng)2 d后發(fā)現(xiàn)菌落仍呈橘黃色。該結(jié)果與陽(yáng)性對(duì)照(pTrc-AtMCT與pAC-BETA共轉(zhuǎn)染大腸桿菌XL1-Blue)中的結(jié)果一致。陰性對(duì)照中,僅pTrc和pAC-BETA共轉(zhuǎn)染的大腸桿菌能在雙抗LB固體培養(yǎng)基上生長(zhǎng),但菌體顏色呈白色,其原因是無(wú)MCT基因表達(dá)或表達(dá)量過(guò)低,無(wú)法合成β-胡蘿卜素??梢?jiàn),大腸桿菌中超表達(dá)TcMCT基因可促進(jìn)β-胡蘿卜素大量積累,推測(cè)TcMCT與AtMCT基因?qū)祁惢衔锏暮铣砂l(fā)揮相似的生物學(xué)功能(Rohdich et al.,2006)。
3 討論
本研究利用同源克隆技術(shù)從南方紅豆杉綠色樹(shù)皮中克隆獲得TcMCT基因cDNA全長(zhǎng)序列,其編碼蛋白N端含84個(gè)氨基酸殘基的質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)肽,以Arg88為切割位點(diǎn),與擬南芥AtMCT蛋白的切割位點(diǎn)相同(Rohdich et al.,2000;Xiao et al.,2009)。此外,TcMCT蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)與AtMCT蛋白相似,均為同源二聚體,且MEP結(jié)合位點(diǎn)和CTP結(jié)合位點(diǎn)位置也相似,推測(cè)TcMCT蛋白具有與AtMCT蛋白一樣的催化活性(Rohdich et al.,2000)。本研究亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示,TcMCT蛋白定位于葉綠體中,與同為裸子植物的銀杏GbMCT轉(zhuǎn)運(yùn)肽定位情況(Kim et al.,2006)一致,也與紫杉醇前體合成定位于質(zhì)體(Eisenreich et al.,1996)和MEP途徑定位于質(zhì)體(Botella-Pavia et al.,2004;Kim et al.,2006)的事實(shí)相符,暗示裸子植物MCT蛋白氨基酸序列的保守性較高,具有相似的生物學(xué)功能。
紫杉醇和青蒿素等萜烯物質(zhì)的生物合成途徑包括MEP途徑(Towler and Weathers,2007;陸錦池等,2009)。其中,青蒿素的生物合成及積累主要場(chǎng)所為青蒿分泌型腺毛(Olofsson et al.,2012)。張曼等(2016)也曾研究發(fā)現(xiàn),AaMCT基因在青蒿分泌型腺毛中高表達(dá),在其他組織中低表達(dá)。紫杉醇在紅豆杉屬植物樹(shù)皮中合成并積累(Ang et al.,2012;Zheng et al.,2016)。劉萬(wàn)宏(2008)研究發(fā)現(xiàn),曼地亞紅豆杉TmMECT基因在曼地亞紅豆杉綠色樹(shù)皮中的表達(dá)量較高,但在根和莖中的表達(dá)量較低。由此可見(jiàn),不同物種的MCT基因組織表達(dá)特異性與其萜烯生物合成部位相吻合。本研究也發(fā)現(xiàn),TcMCT基因在南方紅豆杉綠色樹(shù)皮中的表達(dá)量最高,說(shuō)明紫杉醇生物合成主要發(fā)生在南方紅豆杉綠色樹(shù)皮中。Liu等(2009)、王輝等(2018)研究發(fā)現(xiàn),大腸桿菌中超表達(dá)紫杉醇生物合成中MEP途徑的基因能促進(jìn)β-胡蘿卜素的積累,菌落呈橘黃色。本研究將pAC-BETA和pTrc-TcMCT共轉(zhuǎn)染大腸桿菌XL1-Blue后發(fā)現(xiàn),菌落也呈橘黃色,表明大腸桿菌中超表達(dá)TcMCT基因可促進(jìn)β-胡蘿卜素大量積累,與上述前人研究結(jié)果一致??梢?jiàn),TcMCT基因在宿主菌中高效表達(dá),推動(dòng)萜類代謝向β-胡蘿卜素合成方向的流動(dòng),促進(jìn)萜類化合物β-胡蘿卜素積累,進(jìn)一步證實(shí)MCT催化MEP和CDP合成CDP-ME的過(guò)程對(duì)于萜類物質(zhì)的生物合成至關(guān)重要。在今后可通過(guò)構(gòu)建TcMCT超表達(dá)載體獲得超表達(dá)TcMCT基因的南方紅豆杉轉(zhuǎn)基因株系,進(jìn)一步研究MCT在紫杉醇生物合成途徑中的分子機(jī)制,為探究紫杉醇生物合成調(diào)控提供新的候選基因。
4 結(jié)論
不同物種的MCT氨基酸序列具有較高保守性,TcMCT基因具有明顯的組織表達(dá)特異性,可調(diào)控萜類物質(zhì)如β-胡蘿卜素等的生物合成,推測(cè)TcMCT基因在紫杉醇生物合成中發(fā)揮重要調(diào)控作用。
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(責(zé)任編輯 陳 燕)