唐 虹,徐仲蘭,孔 科,唐海燕,范正楊,焦新安,黃金林
胎兒彎曲菌(Campylobacterfetus,C.fetus) 屬于彎曲菌屬,包括胎兒彎曲菌胎兒亞種(C.fetussubsp.fetus),胎兒彎曲菌性病亞種(C.fetussubsp.venerealis)和胎兒彎曲菌龜亞種(C.fetussubsp.testudinum) 3個(gè)亞種[1]。C.fetus呈弧形或S形,有鞭毛,革蘭染色陰性,是一種可導(dǎo)致人類腸外感染(如菌血癥、腦膜炎、關(guān)節(jié)炎、蜂窩組織炎等),牛羊等牲畜流產(chǎn)、不育和生殖道炎癥等疾病的人獸共患病原菌,主要通過污染的水源、精液、流產(chǎn)的胎兒、糞便等進(jìn)行傳播,給人的健康安全帶來巨大威脅,同時(shí)也對(duì)畜牧業(yè)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失[2]。
在人的腸道彎曲菌病中,90%是由空腸彎曲菌和結(jié)腸彎曲菌導(dǎo)致的,由C.fetus感染導(dǎo)致的案例較少[3]。但是Iraola G等人的最新研究表明人適應(yīng)性C.fetus在人體內(nèi)作為一種腸道致病菌能夠無癥狀攜帶,這大大增加了其在人與人之間傳播的可能性[4]。相反,在人彎曲菌菌血癥案例中,19%~53%是由C.fetus感染導(dǎo)致的,而且據(jù)報(bào)道其死亡率高達(dá)14%[5-7]。在國外C.fetus感染案例屢見不鮮,已然構(gòu)成一個(gè)公共衛(wèi)生問題,然而在國內(nèi)有關(guān)C.fetus感染病例的報(bào)道極少,其流行傳播未能得到重視。C.fetus培養(yǎng)條件嚴(yán)苛,需要在微需氧環(huán)境(5% O2,10% CO2,85% N2)下才能生長,由于其培養(yǎng)和鑒定的特殊性導(dǎo)致日常工作中容易被忽視或錯(cuò)誤鑒定。傳統(tǒng)的C.fetus鑒定方法是通過觀察形態(tài)、培養(yǎng)特性及生理生化特性等生物學(xué)特征,用以區(qū)分C.fetus與其他細(xì)菌。該方法耗時(shí)較長,難以適應(yīng)現(xiàn)代診斷和研究需求,且傳統(tǒng)鑒定方法中能區(qū)分C.fetus與其他彎曲菌的特異性試驗(yàn)較少,主要通過1%甘氨酸生長試驗(yàn)、25 ℃和42 ℃溫度生長試驗(yàn)、3.5% NaCl生長試驗(yàn)、萘啶酮酸和頭孢霉素藥敏試驗(yàn)、馬尿酸水解試驗(yàn)以及氧化酶試驗(yàn)等來區(qū)分C.fetus與其他彎曲菌,從分離培養(yǎng)到鑒定完成至少需要6~8 d,對(duì)于某些需要增菌處理的樣品,還需多耗費(fèi)1~2 d[8]。由于彎曲菌種類繁多,生物學(xué)特性各異,難以將C.fetus與其他彎曲菌區(qū)分開,此外C.fetus生化變型中間種的存在,更是增加了其區(qū)分難度[9-10]。因此,本研究旨在建立一種特異性檢測C.fetus的PCR方法,為C.fetus感染的快速診斷、防控及深入研究奠定基礎(chǔ)。
1.1菌種 實(shí)驗(yàn)菌株C.fetus標(biāo)準(zhǔn)株(NCTC10842)購自ATCC菌種庫,空腸彎曲菌(NCTC11168)由遵義醫(yī)學(xué)院孫萬邦教授惠贈(zèng),結(jié)腸彎曲菌、唾液彎曲菌、豚腸彎曲菌、鼠傷寒沙門菌、雞白痢沙門菌、惡臭假單孢桿菌、大腸桿菌、單核細(xì)胞增生李斯特菌、糞腸球菌、屎腸球菌、副干酪乳酸桿菌、干酪乳酸桿菌、嗜低溫弓形菌、乳酸乳球菌、福氏志賀菌、副溶血弧菌、小腸腸球菌、格氏乳球菌、腸鏈球菌、金黃色葡萄球菌由本室保存。
1.2主要試劑 2 Taq Master mix(南京Vazyme公司);DNA marker(大連TaKaRa公司);厭氧罐、微需氧產(chǎn)氣袋(日本MGC公司);Carry-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基(中國科學(xué)院上海昆蟲科技開發(fā)公司);彎曲菌CCDA瓊脂和Bolton肉湯(英國OXOID公司);無菌脫纖維綿羊血(北京Solarbio公司);抗生素甲氧芐氨嘧啶、放線菌酮(日本W(wǎng)ako公司);兩性霉素B(上海Uniche公司);多粘菌素B(美國Amresco公司);萘啶酮酸(青島海博公司);525份臨床檢測樣品中,400份奶牛肛門擦拭樣品采自某奶牛養(yǎng)殖場,125份產(chǎn)婦陰道擦拭樣采自某婦幼保健院。
1.3.1引物設(shè)計(jì) 從GenBank中獲得C.fetus特異性基因sapB2序列(登錄號(hào):AF048699),應(yīng)用軟件Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)特異性引物(見表1),經(jīng)比對(duì)得知引物覆蓋區(qū)域與NCBI庫中已有的C.fetus菌株的同源性均為100%。引物由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。
表1 PCR引物序列
Tab.1 Primers used for PCR
GenesPrimersPrimer sequences(5′-3′)Amplicon size/bpGene locationsapB2CFFACCGTCTTTGGCGTAT-TCGT7892509-2532CFRAACCCATCAACCTCAC-CCTT2943-2926
1.3.2細(xì)菌基因組DNA的提取C.fetus的DNA模板參照黃金林等方法制備[10]。將菌株接種于CCDA培養(yǎng)基上,37 ℃微需氧條件下培養(yǎng)36~48 h后挑取3~5個(gè)菌落,加到100 μL SW中用移液槍吹勻,沸水煮15 min,取出立即置于冰上,8 000 r/min離心5 min,吸取上清轉(zhuǎn)移至-20 ℃保存?zhèn)溆?。同時(shí)提取菌株基因組DNA用于特異性及靈敏度試驗(yàn)。
1.3.3PCR擴(kuò)增條件優(yōu)化 PCR擴(kuò)增體系(25 μL)如下:DNA模板2 μL,2×Taq Master mix 12 μL,上下游引物(10 mmol/L)各1 μL,滅菌去離子三蒸水9 μL。配好體系瞬時(shí)離心10 s,使反應(yīng)物集中于PCR管底部后再進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR循環(huán)參數(shù)為:95 ℃ 7 min,95 ℃ 30 s,最佳退火溫度下45 s,72 ℃ 1 min,30個(gè)循環(huán);72 ℃ 7 min;4 ℃保存?zhèn)溆?。? μL PCR擴(kuò)增產(chǎn)物點(diǎn)樣,用1.0%的瓊脂糖凝膠(含0.5 mg/L溴化乙錠),以PCR Marker DL2000作對(duì)照,100 V電泳45 min。凝膠在紫外燈下觀察,GelDoc 2000凝膠成像系統(tǒng)成像并保存圖片。利用建立的PCR方法,在53 ℃~60 ℃退火溫度范圍進(jìn)行PCR反應(yīng),經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測擴(kuò)增效果,確定最佳退火溫度。
1.3.4特異性試驗(yàn) 用引物CFF/CFR對(duì)C.fetus、空腸彎曲菌、結(jié)腸彎曲菌、唾液彎曲菌、豚腸彎曲菌以及鼠傷寒沙門菌、雞白痢沙門菌、惡臭假單孢桿菌等22種細(xì)菌進(jìn)行PCR檢測,并通過電泳觀察PCR擴(kuò)增結(jié)果。
1.3.5靈敏度試驗(yàn) 用分光光度計(jì)測定C.fetusDNA模板的濃度后,分別作10倍梯度稀釋,每個(gè)梯度各取2 μL進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并通過電泳觀察比較條帶亮度,直至不出現(xiàn)條帶。
1.3.6模擬污染試驗(yàn) 收獲新鮮培養(yǎng)的C.fetus,用PBS作10倍梯度稀釋,同時(shí)每個(gè)梯度做菌落計(jì)數(shù),然后將每個(gè)稀釋度各取10 μL菌液分別加入到10 mL污水、10 g奶牛糞便樣品中,向模擬污染樣品中加入90 mL增菌培養(yǎng)基,微氧條件下置于搖床上37 ℃ 120 r/min培養(yǎng)48 h。將菌液梯度稀釋后轉(zhuǎn)接至CCDA培養(yǎng)基上培養(yǎng)36~48 h后,挑取典型菌落3~5個(gè),按上述煮沸法提取DNA模板,再用該P(yáng)CR方法對(duì)可疑菌落進(jìn)行鑒定,鑒定正確后對(duì)培養(yǎng)基上的陽性菌落進(jìn)行計(jì)數(shù)。根據(jù)計(jì)數(shù)結(jié)果以及10 mL污水和10 g奶牛糞便樣品中C.fetus的污染量,計(jì)算該P(yáng)CR檢測方法在兩類樣品中C.fetus檢測限。
1.3.7臨床樣品檢測 將本研究建立的PCR檢測方法應(yīng)用于檢驗(yàn)檢疫實(shí)際工作中。從某奶牛養(yǎng)殖場采集400份奶牛肛門擦拭樣品,同時(shí)連續(xù)10 d從某婦幼保健院共采集125份產(chǎn)婦陰道擦拭樣品,在兩類樣品采集過程中各隨機(jī)選取10個(gè)個(gè)體采集雙份樣品用于設(shè)置分離過程陽性對(duì)照組,樣品均用Carry-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基暫時(shí)保存,并于24 h內(nèi)送至實(shí)驗(yàn)室檢測。將棉拭子頭剪下置于無菌采樣袋中,實(shí)驗(yàn)組直接加入10 mL增菌培養(yǎng)基進(jìn)行增菌,對(duì)照組額外加入50 CFU的C.fetus,微氧條件下置于搖床上37 ℃ 120 r/min培養(yǎng)48 h。取菌液0.5 mL,8 000 r/min 離心5 min,棄上清液,加入100 μL滅菌去離子三蒸水,混勻后煮沸15 min,10 000 r/min離心5 min,吸出上清液作為DNA模板,用本研究建立的PCR方法進(jìn)行C.fetus病原學(xué)檢測。同時(shí)對(duì)增菌產(chǎn)物以彎曲菌傳統(tǒng)的平板分離方法進(jìn)行平行檢驗(yàn)。
2.1PCR反應(yīng)條件優(yōu)化結(jié)果 在53 ℃~60 ℃退火溫度范圍對(duì)相同C.fetusDNA模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增效果經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測如圖1所示,確定59 ℃時(shí)擴(kuò)增效果最佳,即為最優(yōu)退火溫度。PCR擴(kuò)增的目的片段約789 bp,與預(yù)期結(jié)果(789 bp)相符。
M: DL2000 DNA Marker; 1-8: Annealing temperature of 53.0 ℃, 53.5 ℃, 54.3 ℃, 55.7 ℃, 57.3 ℃, 58.6 ℃, 59.5 ℃ and 60.0 ℃, respectively; 9: Negative control圖1 C.fetus溫度梯度PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 Results of PCR amplification by temperature gradient of Campylobacter fetus
2.2特異性試驗(yàn) 電泳結(jié)果顯示,僅C.fetus在789 bp處出現(xiàn)屬特異性條帶,而空腸彎曲菌、結(jié)腸彎曲菌、唾液彎曲菌和豚腸彎曲菌均沒有條帶,其他17株參考菌株如沙門菌、大腸桿菌也均不能擴(kuò)增出條帶(圖2)。
M: DL2000 DNA Marker; 1: C.fetus, 2: C.jejuni, 3: C.coli, 4: C.sputorrum, 5: C.hyointestinalis, 6: S.typhimurium, 7: S.pullorum, 8: P.putida, 9: E.coli, 10: L.monocytogenes, 11: E.faecalis, 12: E.faecium, 13: L.paracasei, 14: L.casei, 15: A.Cryaerophilus, 16: L.lactis, 17: S.flexneri, 18: V.parahaemolyticus, 19: E.hirae, 20: L.garvieae, 21: S.entericus, 22: S.aureus圖2 C.fetus PCR檢測方法的特異性Fig.2 Specificity test of PCR for the detection of C.fetus
2.3靈敏度試驗(yàn) 用分光光度計(jì)測得C.fetus純培養(yǎng)物DNA模板濃度為227.23 ng/μL,對(duì)不同稀釋度的模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,最低在10-6稀釋度時(shí)能檢測到目的條帶。由此可知該P(yáng)CR檢測方法最低可檢出0.23 pg/μL的C.fetusDNA(圖3)。
M: DL2000 DNA Marker; 1-7: 227.23×100 ng/μL-227.23×10-6 ng/μL圖3 C.fetus PCR檢測方法的敏感性Fig.3 Sensitivity test of PCR for the detection of C.fetus amplification
2.4模擬污染試驗(yàn) 經(jīng)人工模擬污染的污水、奶牛糞便樣品,通過增菌、平板選擇性培養(yǎng)以及PCR檢測,得知污水中C.fetus檢測限為0.9 CFU/mL,牛糞便樣品為20 CFU/g。
2.5臨床樣品檢測 用本研究建立的PCR方法對(duì)525份臨床樣品進(jìn)行檢測,結(jié)果顯示525份臨床樣品均為C.fetus陰性,其中400份奶牛肛門擦拭樣品對(duì)應(yīng)的10份對(duì)照組PCR檢測結(jié)果均為C.fetus陽性,125份產(chǎn)婦陰道擦拭樣品對(duì)應(yīng)的10份對(duì)照組也均為C.fetus陽性。彎曲菌傳統(tǒng)平板分離方法同步檢測結(jié)果顯示,400份奶牛肛門擦拭樣品中檢出7份空腸彎曲菌陽性,2份唾液彎曲菌陽性,1份豚腸彎曲菌陽性,未檢測到C.fetus,10份對(duì)照組中,8份為C.fetus陽性,2份C.fetus陰性;125份產(chǎn)婦陰道擦拭樣品用傳統(tǒng)平板分離方法檢出1份空腸彎曲菌陽性,未檢出C.fetus,其10份對(duì)照組均為C.fetus陽性。實(shí)驗(yàn)組中兩種檢測方法結(jié)果一致,均為C.fetus陰性;對(duì)照組中兩類樣品的PCR方法的回收率均為100%,奶牛肛門擦拭樣品平板分離法回收率為80%產(chǎn)婦陰道擦拭樣品平板分離法回收率為100%。PCR方法整個(gè)檢測過程僅需2 d,而傳統(tǒng)方法耗時(shí)7 d。
當(dāng)今社會(huì),隨著寵物家庭數(shù)量增加,人與動(dòng)物親密接觸機(jī)會(huì)增多,此外人類食用多種生的或半熟肉制品,都大大增加了人感染人獸共患病的風(fēng)險(xiǎn)。C.fetus作為一種常見的人獸共患病原菌,其引起的感染常因其生長緩慢,培養(yǎng)條件特殊等特性以及傳統(tǒng)檢測技術(shù)耗時(shí)費(fèi)力、診斷不準(zhǔn)確而導(dǎo)致誤診或延誤治療。因此開發(fā)C.fetus快速檢測方法,以識(shí)別該病原菌的暴發(fā)流行,及時(shí)診斷和控制胎兒彎曲菌病顯得非常迫切和重要。
隨著核酸檢測技術(shù)的發(fā)展,越來越多的研究者將這項(xiàng)技術(shù)應(yīng)用到診斷領(lǐng)域。本研究以C.fetus表面蛋白基因sapB2為靶基因,設(shè)計(jì)特異性引物,建立C.fetusPCR檢測方法。同源性比對(duì)結(jié)果顯示,sapB2基因在C.fetus不同亞種中的一致性均在82%以上,具有很高的保守性。試驗(yàn)結(jié)果也證明,當(dāng)以空腸彎曲菌、結(jié)腸彎曲菌、唾液彎曲菌和豚腸彎曲菌這4個(gè)不同的彎曲菌種,以及17種其他細(xì)菌如大腸桿菌、屎腸球菌等作為參考菌株時(shí),僅C.fetus能被擴(kuò)增,說明該P(yáng)CR方法具有較強(qiáng)的特異性。用本研究建立的PCR方法對(duì)C.fetus純培養(yǎng)物進(jìn)行檢測,最低可檢出0.23 pg/μL的DNA,該結(jié)果與國內(nèi)其他細(xì)菌PCR檢測方法結(jié)果相似[11-12]。對(duì)模擬污染樣品的檢測結(jié)果顯示,污水中C.fetus的最低檢測限為0.9 CFU/mL,奶牛糞便樣品中為20 CFU/g。該檢測結(jié)果與何蕊等人的結(jié)果基本一致,均具有較高的靈敏度[13]。
臨床樣品檢測過程中,400份奶牛肛門擦拭樣品PCR檢測結(jié)果均為C.fetus陰性,同樣傳統(tǒng)平板分離方法同步檢測結(jié)果也均為C.fetus陰性,兩者檢測結(jié)果相符,顯示該P(yáng)CR方法具有良好的實(shí)用性。傳統(tǒng)平板分離方法同步檢測到空腸彎曲菌、唾液彎曲菌和豚腸彎曲菌的存在,但該P(yáng)CR方法檢測結(jié)果中未產(chǎn)生非特異性條帶,再次表明其具有較好的特異性。400份樣品均未分離出C.fetus,這可能與該地區(qū)C.fetus的分布和流行情況有關(guān)。目前國內(nèi)未有報(bào)道說該地區(qū)暴發(fā)過C.fetus感染[14]。10份對(duì)照組中,PCR檢測結(jié)果均為C.fetus陽性,平板分離法8份為C.fetus陽性,可能原因與樣品的增菌過程有關(guān),肛門擦拭樣中含有多種腸道細(xì)菌如大腸桿菌、屎腸球菌等,這些細(xì)菌均為兼性厭氧菌,在營養(yǎng)豐富的彎曲菌增菌培養(yǎng)液中生長旺盛,增殖活躍,繁殖周期短,使得生長緩慢的彎曲菌失去生長優(yōu)勢而被掩蓋,難以被傳統(tǒng)的平板分離法檢出,而靈敏度較高的PCR方法則只需微量的DNA就能將C.fetus檢出[15]。
綜上所述,本研究建立的C.fetusPCR檢測方法具有特異性強(qiáng)、敏感度高、簡便快速等特點(diǎn),適用于食品和環(huán)境中彎曲菌的檢測,克服了傳統(tǒng)鑒定方法的不足,為C.fetus的快速檢測提供技術(shù)支持,對(duì)于識(shí)別該菌株的暴發(fā)流行,相關(guān)疾病的診斷、控制以及C.fetus分子流行病學(xué)研究具有重要意義。
利益沖突:無